3OHIA

Structure of giardia fructose-1,6-biphosphate aldolase in complex with 3-hydroxy-2-pyridone
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
322
structure length
319
Chain Sequence
PLCTLRQMLGEARKHKYGVGAFNVNNMEQIQGIMKAVVQLKSPVILQCSRGALKYSDMIYLKKLCEAALEKHPDIPICIHLDHGDTLESVKMAIDLGFSSVMIDASHHPFDENVRITKEVVAYAHARSVSVEAELGTLGGIEQNTVQLTEPQDAKKFVELTGVDALAVAIGTSHGAYKFKSESDIRLAIDRVKTISDLTGIPLVMHGSSSVPKDVKDMINKYGGKMPDAVGVPIESIVHAIGEGVCKINVDSDSRMAMTGAIRKVFVEHPEKFDPRDYLGPGRDAITEMLIPKIKAFGSAGHAGDYKVVSLEEAKAWYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Rational design, synthesis and evaluation of first generation inhibitors of the Giardia lamblia fructose-1,6-biphosphate aldolase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Giardia intestinalis
molecule keywords Putative fructose-1,6-bisphosphate aldolase
total genus 112
structure length 319
sequence length 322
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2010-08-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ohiA00
2DZSA 3SECA 3RLUA 2RFGA 4Q4KA 3LX9A 1EP2A 2Z0IA 1LROA 4Y90A 1RR2A 4CQAA 3PR2A 4IMDA 2PRLA 1SO5A 4LRSA 2LLEA 2PC4A 1S5TA 1B9BA 2ZRXA 4I9AA 4FX8A 3HGRA 5LNWA 1VZWA 3SSJA 3OVRA 3IVUA 4PA8A 4K8HA 1I2OA 1UCWA 3W1QA 5AYZA 4J9JA 4XBKA 1FWTA 5LGZA 1WX0A 3EX1A 1L6SA 1FCQA 3RFAA 2XN0A 3PBWA 2CZDA 1SPQA 1WXJA 5AYXA 2H6RA 1FWRA 2QDHA 1H7XA 2H90A 4IJBA 4TMCA 3QC3A 3BGGA 1LRQA 2JGQA 1TPWA 2Y6ZA 5DCDA 1KLZA 1O94A 4UFJA 2XN1A 4M6VA 4E0CA 5AOUA 1VPXA 5AHFA 2FFCA 1OX4A 3DFNA 4O17A 1K3UA 3UWQA 1R2SA 1WBHA 3W7JA 4IMGA 2B4GA 4O18A 3STFA 1DJQA 1OX4B 5LZLA 1LLZA 2Z6JA 1L6WA 1RQEA 4MZYA 3RLVA 3TFXA 5BOOA 4HNNA 1TTQA 5K4XA 1ZAIA 1HO1A 3LGEA 3W88A 5BW6A 1EA0A 1OYCA 1T99A 1FQ0A 1I2NA 2CLEA 3W1MA 3CWOX 3QSRA 4EIVA 3T55A 1H7PA 4FNTA 5IBXC 1RD5A 2ZTJA 3T78A 5K4ZA 4HPXA 2CW6A 1WBJA 3GZ3A 3PUDA 2Q8ZA 1W54A 1H62A 2ABAA 4N02A 2Y7EA 4XQ6A 1QPOA 2AGKA 5GVJA 3KAOA 5F2GA 3O6YX 1SSDA 1JUEA 1PCKA 3N34A 4KKXA 1H51A 4Z1DA 3W85A 4O1CA 1H7RA 3Q2DA 3TQ0A 4NNBA 1RV8A 2W6RA 3LCFA 3NQ2A 3UY7A 4MVAA 1OFDA 4U28A 1W5MA 3FIGA 3B04A 5FEXA 5K3VA 3QMTA 4OV4A 1Q45A 2DZUA 3W7NA 2WV8A 3HB9A 3MI6A 5D04C 1MEWA 4BF9A 3LTYA 1W1ZA 3KRUA 3HG2A 1F6PA 1H1YA 1GPWA 1T96A 5DELA 2Q8LA 5KZMA 4MY9A 1OVDA 4FEZA 4Y8FA 4A2RA 2QAFA 4AMAA 3B0PA 3M5YA 1N7KA 3DGRA 3MP4A 4N6EA 1Z48A 1PE1A 4FXSA 3W1AA 1MEHA 1NVMA 1WOAA 3THQA 4JTJA 2C16A 3TNOA 1KM5A 1A53A 1P0NA 5K9DA 4PH6A 3P74A 3EXRA 3N14A 5CZ0A 2RDUA 4QSHA 3G0SA 4ADUA 4IXHA 2YYUA 1W56A 4ALDA 4ZL1A 1X8FA 2E1DA 1W5OA 3W1RA 1O4UA 2QKFA 5FF7A 1YTEA 1GVSA 3BW3A 3GAKA 2PRHA 5C55A 2RDWA 1RZMA 3DH7A 2C15A 4OE7A 3DBPA 4JY8A 4UTLA 4LVBA 3LXCA 1BEUA 3HPSA 4PODA 2O7SA 1GVFA 4UUIA 1OX6A 4UMBA 5AHEA 2YR1A 4GC4A 5CSRA 4RX0A 3EWWA 3KRSA 2C0AA 3CIWA 1IIGA 3M1ZA 2CLMA 4TX9A 1VYSX 3M5ZA 2WKJA 1KM1A 2YX0A 3IIVA 2A6LA 2OX1A 1TIMA 4HN4A 1G4PA 3C56A 4RJEA 3TX9A 3FS2A 4O57A 4N9BA 4UR8A 3TC6A 3TFCA 4AWUA 3R8RA 4TIMA 5EY5A 3MJYA 4A22A 3S1VA 4QAIA 3TH6A 1A5SA 3NZ1A 5G2WA 3HBLA 2PURA 4AF0B 4LU0A 1K7XA 4RR4A 3GDMA 2VFFA 3NPVA 3BGJA 4NNAA 3A24A 1JRCA 1DQWA 2CLLA 4DXVA 3LRLA 4UTIA 1VYPX 3CTLA 1XBZA 4O14A 3W72A 4R53A 3EWUA 4WY0F 1GZGA 4WZHA 4O13A 1V7YA 3EX3A 4A29A 1OG0A 4S2CA 3IVTA 1XDMA 4X22A 4JTEA 2ZZ3A 3DI0A 3TK7A 2I9EA 4LVGA 1BKSA 3NQ6A 1G7VA 1YXYA 1G4EA 3C6CA 1JRBA 3ATZA 4I7WA 3IIOA 4Z0JA 1IIHA 3LCGA 3R5EA 2B7OA 2NUYA 1G4SA 4A21A 5BMXA 2V5LA 3L5LA 4LUIA 2E6YA 2R91A 1E51A 1OFOA 3CM4A 3BLEA 1TTIA 1QOPA 3O1NA 1D3HA 2C18A 1EUNA 2X1TA 3M5VA 1SW7A 1Q6LA 4A2SA 5D33A 3C61A 2YXGA 3W2KA 2Z1BA 1QAPA 5K9XA 3NZRA 4ORMA 3P81A 2OCZA 4ZQMA 3PUOA 4DQWA 2VFDA 5TQLA 3Q94A 2JGYA 4PL1A 3H55A 1PIIA 4JTLA 2H3DA 5A5WA 4FX6M 2PE4A 1VYRA 1TRIA 3KHJA 4GNJA 4ML9A 1ADOA 1EWEA 5E93A 3H54A 1OF6A 4O0KA 3MHUA 3BPWA 3NR0A 4D2JA 1Q6QA 1L6YA 3G1FA 4FXRA 5HULA 4ORIA 4JN6A 3N9RA 3HG4A 1F74A 2OT1A 3KVKA 1QO5A 2QCLA 4O4WA 1GQNA 1KM3A 3MBDA 1YXDA 5ABTA 4N9EA 4GUIA 1QPRA 2RHGA 4MFEA 4GXMA 1UBSA 3B0VC 1O60A 1XKYA 3NL3A 1QNVA 4TU1A 2EAWA 3NQAA 1DORA 3INPA 2QCEA 5LHEA 4UCGA 4NZJA 3OEXA 3T44A 4ADTA 4M5PA 4N4QA 3M41A 3TJXA 2X2GA 3BW2A 3W7PA 1Q6RA 5F4XA 4CLMA 1A5AA 1ME7A 2XFWA 3LV6A 2WJZA 3E0IA 5K9CA 1GWJA 3KXQA 3KVMA 4HNUA 5F1UA 1KTNA 2F7FA 3FFSA 2QEZA 4TMBA 5FESA 1OYBA 1WV2A 3IEBA 1NF0A 3Q58A 5G1TA 1FDJA 3JR2A 3C3NA 1WQ5A 3STGA 1UASA 1HUVA 5CGQA 2CZEA 4HPJA 1BWLA 4IWWA 3FYOA 3NPWA 2Q3OA 2YGYA 4HSOA 3P60A 3DU0A 3I7QA 1W3NA 1K7EA 1BWKA 2P1FA 3W1LA 4JDYA 5G4EA 2BLEA 2OZ0A 2KZHA 3P8IA 4N9CA 3EWZA 3PF3A 4EF9A 2ISSA 2TPSA 4JDBA 5DCEA 2HSAA 2ZRYA 1ZENA 1IF2A 3TROA 3JRKA 2NUWA 3LTPA 4KFPA 2V81A 1VCVA 4JS3A 3HGJA 1FBAA 2DP3A 1JVNA 3TSDA 3IV3A 4M6QA 1O5KA 3DFQA 2CWNA 2TYSA 2D73A 3U6WA 3DZ1A 1W8SA 1HFBA 1H7WA 3I7RA 4NJGA 1KFKA 2B0MA 1YLVA 1GYLA 1CI1A 4PFMA 4CNNA 5DXXA 3W86A 3M16A 3LBMA 2V2HA 2HTMA 3NOEA 2Y63A 2A2IA 3EWYA 3VNDA 1F76A 2NX3A 3R12A 3W84A 1LBLA 1MEIA 2WNZA 2QCDB 1KA9F 3M5XA 3W7DA 1EWDA 3IIPA 3T7VA 3HGOA 3TA6A 1VS1A 4IXXA 4POCA 3EXSA 1ICPA 2YYTA 3MBFA 1KM0A 2G5WA 1YXCA 4DF2A 3W73A 3ZWSA 4FHAA 3C2OA 2A4AA 4E38A 3OHIA 1P4CA 5AC8A 3LHUA 2ABBA 1K02A 2Y7FA 3DAQA 3E9AA 1ZJIA 4UIOA 3CWNA 2DZPA 2HS6A 3LLDA 4RZ6A 3TE9A 1M6JA 4JX4A 4BWLA 3PB2A 4AVFA 3QFEA 1K8XA 1Q6OA 1XI3A 2J9ZA 3A5VA 5EPDA 3LERA 3W70A 4PC8A 3CLMA 5DY2A 3F4WA 1D3GA 4O52A 1QDSA 4MUZA 3TSBA 3EX4A 3ZWTA 1PS9A 1OHLA 3UZJA 3S6DA 4O1AA 1TV8A 2YFNA 2E68A 4I7VA 2VEKA 4LVDA 5DBUA 1EB3A 3ZR4A 3LM7A 2GQ8A 1JJKA 4NQ1A 2E6AA 4UFIA 5KINA 3PBUA 2IQTA 1B4KA 2OJPA 2GQ9A 1HTIA 3S9YA 1L9WA 2YSWA 1X1ZA 5EKYA 3TUUA 4LVAA 2AAMA 2A5HA 3WJWA 3GKAA 5HR7A 1ZY9A 1XM3A 1LZOA 3S1UA 3IRDA 2X1RA 1H7OA 1K8ZA 3BO9A 1H7NA 3DHFA 3W7QA 1PHWA 2WO5A 2AQWA 2NX1A 4HKPA 5G2IA 3HO8A 3W23A 3N2XA 1EX5A 1TJPA 3NAVA 2DZXA 3FEMA 4MYXA 4JGDA 4PTNA 1OFEA 1LCOA 3QMRA 3HG3A 2UV8G 1SFLA 5D05A 2V5BA 1WYIA 4MZ8A 3K30A 3LXAA 1OFQA 1GOXA 1J5TA 4GUGA 5DBTA 1NSJA 3DFPA 4MYAA 1QWGA 3W2LA 4ICNA 3NL2A 3OIXA 1TPUA 3PBVA 2YW3A 3W9ZA 1KLYA 1H61A 4WX2A 3LDVA 1JCNA 3G1SA 2PRMA 2NX9A 3NO5A 2ZA1A 4K39A 4YXGA 5KTLA 4FNRA 1ZALA 1QMLA 3UD6A 4DBDA 2ISWA 1SU5A 3IVSA 2DU2A 1KBJA 1FWNA 2A7PA 1VQTA 4LV9A 3QSTA 2J9XA 4H3DA 1ZCOA 3W1XA 3TW6A 2VFIA 1PVNA 1JUKA 1W0MA 5SWUA 5D2WA 3FOKA 3FJLA 3NM1A 3UXAA 4N4PA 2CLIA 3QEZA 3BARA 1XC4A 2VC6A 3G18A 4DBEA 3W7CA 4OHQA 2C14A 1BTMA 3TMQA 5E1QA 4RZ4A 3TAOA 2V82A 1VLWA 2RDTA 1OFRA 3HIJA 4UTTA 4JX6A 1TV7A 3W71A 1G4TA 4O54A 1IXQA 3NPXA 4CNOA 4K7VA 1JCMP 1JR1A 5DLCA 1G7UA 4NU7A 5C6MA 2HMCA 2Y62A 3SR7A 5L9FA 3B0UX 3G1DA 4MY1A 4JY9A 3M44A 2J9YA 2Z6IA 2NV1A 3P62A 3W87A 3VKJA 1GTHA 4I7UA 2C1HA 4JIQA 4O50A 4G1KA 1HL2A 3L67A 4Z1CA 3I68A 3C2FA 3P80A 2NUXA 4FX7A 4M6PA 2CZFA 1TQXA 4JTIA 4IMFA 2FQIA 1A5CA 2WNQA 3PB0A 4IPJA 2EGZA 3UZ5A 4GE8A 3GDLA 4OQVA 3ZS4A 1TRDA 3TCEA 3RNDA 4M7SA 4AWSA 3L2IA 3NQDA 3ANYA 4RXFA 4UTWA 4CQ9A 4EVZA 4EF8A 4LW7A 1C9DA 3MI2A 2FB3A 1VJIA 1MXSA 5FI8A 3S5YA 3TV8A 4WY0A 5I3JA 5LHFA 2X1SA 1KBIA 1UUMA 4AEOA 2VOMA 3KVLA 1TPEA 2WOQA 1SW3A 4FIRA 4ZVJA 2ZCGA 3VE9A 3LTSA 4JTFA 4AAJA 4WY0B 1LTDA 3LV5A 3A9IA 3MYPA 5HWJA 3S1WA 4EWND 1YPFA 3DENA 4O12A 1SZFA 1XBVA 2YZRA 2P10A 3NDOA 4WJEA 4BI6A 1SO4A 4E2DA 1SZNA 1TMHA 3I6RA 2A7RA 1FUYA 5HJLA 1U83A 2PCQA 3ZFHA 4X9SA 1QCWA 4QNWA 1LYXA 4OU1A 1DJNA 4GRSA 1Z42A 3S8HA 1LOSA 5I3FA 2GPTA 5L6UA 1FDZA 1NFBA 1YADA 2E5BA 4WXZA 5AYYA 4AF0A 3LXBA 5U4NA 1T8XA 2GOUA 3W22A 1SZEA 1SFJA 1G6CA 1JQXA 3UPBA 3E12A 1JCXA 1QPQA 1XFBA 4WD0A 1QR7A 2QCHA 4FNQA 1TPVA 3QRHA 4JYFA 2R14A 1RPXA 4RV8A 4UXDA 1M7OA 1TO3A 4FO4A 4NUWA 4LV4A 1LRNA 1YPIA 3QQ1A 3G3DA 1B4EA 2TRSA 4IX0A 8TIMA 2A1YA 1ZAJA 1GG1A 1DV7A 1HO4A 4DPQA 3W7HA 3N2MA 2QCMA 5HUPA 3M0ZA 4NXKA 2V30A 1R2RA 5IM51 2ZRUA 3LCIA 4YMZA 3PY2A 3EWBX 1T0OA 1ONRA 1AL7A 3F03K 3T4CA 5CZSA 1GTEA 4K6AA 1W31A 3QPZA 4DF0A 1X1OA 4MPQA 3P82A 1KFLA 4ZQCA 5CPMA 1H60A 1OF8A 4LY8A 2ATSA 5G5IA 5G4WA 3MHFA 3W76A 3UPWA 2ZTKA 3I7SA 3ATYA 3UXDA 2W79A 1TPH1 1JUBA 1TTJA 3SJ3A 1H1ZA 3MI3A 1VH7A 1C8VA 1FCUA 2R8WA 2E6FA 1AG1O 5AFDA 1VHNA 5LSMA 3C8FA 2ZZ7A 3G1AA 3HG5A 4K38A 3GYEA 4UNLA 2YPIA 3NQGA 5D37A 4IGHA 5TBOA 1MZHA 1A50A 1S5WA 3EKZA 3W3OA 1LDCA 4AHOA 3QW4B 2QUVA 2H8ZA 3G0UA 4IOTA 2G95A 2ZQ0A 4Z1BA 4Q33A 2QJIA 2BSLA 5H2ZA 2Q3RA 3W2NA 1SR9A 3RMJA 3D0CA 5KSWA 1UUOA 3F1QA 3UYCA 1B3OA 1XL9A 3CIXA 3L9CA 3W7KA 4K36A 2ZZ4A 4QIUA 5FF0A 3YPIA 1DOSA 2X1UA 4R34A 4NVTA 2Y7DA 4MKNA 4O8RA 4IMCA 2EPHA 2NXHA 3M7WA 4LS0A 3S0CA 4LTSA 1A5BA 3EX6A 4RKAA 4MZ1A 5H91A 3WK3A 2VEPA 3C0JA 2ZZ2A 2HS8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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