3OHIA

Structure of giardia fructose-1,6-biphosphate aldolase in complex with 3-hydroxy-2-pyridone
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
322
structure length
319
Chain Sequence
PLCTLRQMLGEARKHKYGVGAFNVNNMEQIQGIMKAVVQLKSPVILQCSRGALKYSDMIYLKKLCEAALEKHPDIPICIHLDHGDTLESVKMAIDLGFSSVMIDASHHPFDENVRITKEVVAYAHARSVSVEAELGTLGGIEQNTVQLTEPQDAKKFVELTGVDALAVAIGTSHGAYKFKSESDIRLAIDRVKTISDLTGIPLVMHGSSSVPKDVKDMINKYGGKMPDAVGVPIESIVHAIGEGVCKINVDSDSRMAMTGAIRKVFVEHPEKFDPRDYLGPGRDAITEMLIPKIKAFGSAGHAGDYKVVSLEEAKAWYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Putative fructose-1,6-bisphosphate aldolase
publication title Rational design, synthesis and evaluation of first generation inhibitors of the Giardia lamblia fructose-1,6-biphosphate aldolase.
pubmed doi rcsb
source organism Giardia intestinalis
total genus 112
structure length 319
sequence length 322
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2010-08-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ohiA00
1FDZA 1F6KA 1D9EA 4GFSA 1S5WA 3M41A 4UC5A 1OFEA 4OV9A 3LOTA 4E2DA 1OYAA 4GUIA 5D2XA 5KTLA 5LNSA 1RQBA 5EYWA 3MHFA 4E2BA 5FF2A 3W1QA 1VRDA 2J27A 1LP6A 1H7XA 5GVJA 4ZQRA 2FB3A 1WQ5A 2GVLA 5HNRA 1Q6RA 1OG0A 1SW0A 1OX4A 3QFEA 2VELA 5I3GA 1OHLA 5CPNA 3A5VA 3ABRA 4JXCA 4IWWA 2CLIA 3PR2A 4JGDA 1SW7A 5G2HA 3I7QA 2BXVA 4AB4A 1TRDA 5KINA 4TIMA 4XTIA 4IXXA 4KWVA 3B0VC 5LKYA 3C4UA 1Z41A 4N9EA 5AHLA 4O50A 2XN2A 2QCMA 5D37A 1O94A 3QQ0A 1P5BA 3SSJA 3C2RA 2Z0IA 3LCWA 4LU0A 1LDCA 4R33A 3O6CA 2C19A 3OEXA 2I14A 1H50A 3W87A 1HG3A 3ATYA 3S9YA 1FDYA 3MP5A 2Z1BA 1IXPA 4OGZA 1SZGA 4PFMA 1TPVA 2VFDA 3QRHA 3TCEA 3G1FA 3NL3A 4JYEA 2TRSA 1BWLA 3OVPA 3AO0A 3K30A 2QEZA 4O54A 3YPIA 2AQWA 3KHJA 4RJEA 3TSBA 2FDSA 3LX9A 1GVQA 4HT3A 3DHFA 4DQWA 1VYPX 3HO8A 3KRZA 4FHAA 1RV8A 2ZZ7A 4UCGA 4JR5A 3W1MA 3B8DA 3W3OA 3S5OA 1NF7A 4WX2A 3TUUA 5LNWA 2QCEA 3BVJA 5DCBA 3QW4B 3OHIA 4P2VA 3FOKA 3A9IA 4IMFA 1XI3A 3LRLA 3BG9A 3W2LA 5HR7A 1GTEA 3LCHA 4LRTA 3W6YA 1VH7A 1TYGA 5C54A 2I1OA 5DY3A 2ZA3A 1WBHA 1WDWA 3L0GA 1FWTA 2GJLA 1W0MA 2HMCA 2Q3OA 5AYXA 3UZ5A 1FQ0A 3D0CA 2YPIA 1KM6A 3W1UA 4O8RA 2JKEA 3HIJA 1XDLA 3TU9A 4A22A 3W76A 5HR6A 3W22A 2OJPA 1YXDA 4FNRA 1VJIA 4TMCA 3KVLA 1TMHA 1YDVA 3GLCA 1OFDA 5HMSA 1FWRA 1MSSA 1A5AA 3LB0A 3QQ1A 2B7OA 2JGYA 3F4NA 2FTPA 2X16A 3CT7A 1SW3A 1ML1A 3N2XA 5D02A 3M9YA 1IIHA 3TQ0A 2PURA 3LV5A 3B05A 4NT0A 2RH9A 3P80A 2NUWA 3CPRA 2ZRXA 4UR8A 2E6DA 2NXIA 3G1VA 5I3HA 1BEUA 2QJIA 4GUGA 3TDFA 3TFCA 1EP1A 1MEIA 5K7JA 2HTMA 4UTKA 4XQ6A 2QCLA 4LVAA 1TPUA 3NQ8A 2H8ZA 4JIPA 3A21A 3OG3A 1T0OA 3FKKA 1OK6A 1RR2A 3L5LA 3FFSA 3M16A 1EWEA 4RK8A 4KFPA 4WQ6A 4DF0A 4GC4A 1F5ZA 1XCFA 5D32A 3B0PA 5DBUA 2OZ0A 4QNWA 3MYPA 3EWYA 1TV7A 1X8FA 2A0NA 1SZEA 2EAWA 3P8IA 5AN7A 3TA6A 1LYXA 4HNVA 4X9SA 2DZSA 3ZS4A 1G4TA 4Z0JA 4IXHA 1O5XA 3TAOA 4UTWA 3B06A 3LLDA 3PBWA 2E5CA 4IGHA 1YTDA 2OX1A 5KITA 4CNOA 4D2JA 4YCPA 3DZ1A 4BI6A 1MZHA 3CIWA 3PUOA 3ABOA 4A21A 1TREA 3F1QA 4PODA 2CLMA 4NZJA 4YL2A 1SO6A 4M6PA 1O5KA 2FPVA 5HUOA 1I2RA 1GTHA 1PIIA 3L68A 3PUEA 4FO4A 5CZSA 3DFQA 3I65A 4WXYA 3O05A 1THFD 4M7TA 4LVDA 2QKFA 4JTLA 5F2MA 1DJQA 1FBAA 4PL2A 1JQVA 3DAQA 4DF1A 1M6JA 3T55A 2VFFA 4EF9A 2VFEA 4UTMA 3PG9A 1JCXA 1A5BA 1XBYA 4XZ9A 1L2UA 2W79A 2ZZ6A 3L5MA 2QCNA 3UY7A 1G7UA 1C29A 1FWWA 5C5YA 5K3VA 1ICQA 5EPDA 1OX4B 3BO9A 3UWUA 1LROA 3FJ6A 2C15A 4YLWA 2W6RA 4JYDA 3W23A 3HOJA 3MW7A 2B4GA 2V5LA 3O07A 1PE1A 1K02A 1KLZA 1FCVA 3NQAA 1AW2A 4O12A 1VCVA 1W37A 5LNUA 2WSYA 3OBKA 2E77A 3STFA 1ZJIA 1OFQA 4PC8A 2EHHA 1R47A 2ZZ5A 4ZVJA 3E49A 3FLUA 3SR7A 5J5DA 3LLFA 1UUOA 5LNRA 2QCCA 5H2ZA 1NFBA 4IMCA 3HGOA 4K7VA 1K7XA 3TX9A 2QAFA 4U28A 2P10A 4UR7A 2VKZG 2WSQA 2J24A 3PY2A 4GE8A 4CLMA 2RKXA 1S5VA 1TSIA 3S1VA 5BNKA 2QDHA 1SFLA 4JIQA 3HG3A 3KVMA 4RZ5A 3TNOA 3TQVA 3QZEA 4K8HA 5FESA 3W75A 1SO5A 5DCEA 3NQMA 3HGSA 2NXHA 5F2LA 5F2GA 4R53A 1HO4A 1FXPA 1W5MA 4FNQA 3RMJA 5A5WA 3W1PA 2JKPA 1OVDA 5F1UA 2JK2A 4EF8A 1DKWA 1SR9A 2GQ8A 3OVQA 1G7VA 2O7SA 3GNDA 4AWTA 4DXVA 1YDOA 4WD0A 2YXGA 2GUUA 3BG5A 1F6PA 3MI6A 1KTBA 2RDTA 1XFBA 3GDLA 5G4WA 3IV3A 1SPQA 4JTSA 2ISSA 2VFGA 1WYIA 2WNNA 2ZA1A 4RXFA 3JRKA 4AHOA 1K7FA 1OABA 3MUXA 3QMRA 2E6AA 3TMQA 4ZQMA 3A5FA 3UNDA 3TJXA 4QM1A 3C2EA 2ZRZA 2E68A 2EKCA 3AJXA 2TSYA 3EWXA 3BW4A 1AG1O 5F2IA 3TFXA 1S5TA 1IF2A 3PWAA 3LDVA 2YYUA 1I2OA 2PCQA 5D30A 3ELFA 5AC8A 4HNTA 1T96A 2CLHA 1FXQA 3O6YX 3UD6A 2F7FA 1LOSA 1AW1A 4ADSA 1O4UA 2WNZA 1I45A 4QQ3A 3F03K 1H7WA 1OFAA 3A22A 3QEZA 1TRIA 1L6SA 3UYCA 3IVTA 1KFBA 4AHQA 5K9CA 1HUVA 3BGJA 4N9BA 4UIOA 3W2MA 4CNNA 2FQIA 3A24A 5E0KA 3QMSA 7TIMA 1TPEA 2NUYA 3LHYA 3HG5A 4KKXA 5AHNA 3TSMA 3NQ7A 4K8EA 5D09A 2BZNA 3IRDA 1W3NA 2QJGA 4K7YA 4YCOA 4DO6A 4GNJA 3HPSA 3LXBA 1W5NA 3HPXA 3C2OA 1H7OA 4BWLC 4MIMA 1I2PA 3QC3A 2QUVA 4MLRA 2BWGA 1LLWA 4A3UA 3NQ2A 1X1ZA 1C8VA 1KBIA 2ZCGA 1TPB1 2F84A 4A29A 3BPWA 1GEQA 2GVJA 2ZRVA 4JYFA 3PBYA 5FEPA 1DL3A 1W5QA 5G2IA 2E5BA 3TC6A 3DI0A 5AB3A 1DVJA 2X1TA 5G4EA 2YCEA 4MZ1A 4QITA 1QOQA 4H6KA 5FEWA 3DXIA 4XWUA 3PBUA 4XBSA 3UWZA 4WOZA 1E51A 1TCDA 2X1UA 2FIQA 1Q45A 4JDBA 1KM5A 3W2NA 4LY8A 2P0OA 2OCZA 1W3IA 2J88A 3LGEA 5E93A 1H1ZA 1JCNA 2VEIA 5I3KA 4MZYA 1TPFA 4NZFA 2E6YA 3DFTA 1GT8A 3EXRA 3KVKA 3GXTA 1R46A 1P1XA 1FDJA 2ISVA 5ABTA 1UUMA 6ALDA 4PL1A 1DORA 4P61A 4IQLA 1ICSA 3RLVA 4RX0A 1K3UA 3BW2A 1K8YA 2GQAA 4PH6A 1VYSX 3FIGA 5TBOA 5BOOA 2FFCA 4HPJA 4Z1CA 3STEA 3DU0A 1TB3A 4LS2A 4NU7A 4ZQNA 4NXKA 4JTGA 1Z48A 4MYXA 3KRUA 4JNMA 3GX9A 3MI2A 2XN1A 3OVRA 3FS2A 3W84A 5CPMA 4DPPA 4UUIA 2CWNA 3LCIA 2ZDRA 2BSLA 3LHVA 2VC6A 1FWNA 3W1AA 1P4CA 1K03A 4ZZ9A 1LOQA 4S1FA 5CSSA 1MO0A 4CQ9A 3SY5A 1K7EA 2A1YA 1EP3A 1KW1A 1DBTA 2GQ9A 2NX3A 4M19A 3RNDA 1XBVA 1K8ZA 3O6DA 1G6CA 4O14A 5D2YA 1JUBA 3W1TA 1GVFA 3NR0A 3VE7A 1KM0A 2PE4A 1RZMA 3EEGA 3HGRA 3PS7A 4FNSA 1SFJA 4JTHA 1PHWA 2ZBTA 3LI0A 5U4NA 4AXKA 2DU2A 4MY8A 3W7JA 4M6QA 3KXQA 1ICPA 1EIXA 4TX9A 1ZFJA 4CQ8A 3PVFA 4Z0SA 4E0CA 3E12A 4O0KA 3NGJA 2X1RA 1IXQA 3B4UA 2X1SA 1ME8A 3ZWTA 4ICNA 2FJKA 5DXXA 3PB0A 3KOFA 4WXZA 2V2HA 2ZYFA 3G18A 1N7KA 5BMWA 1I8JA 1ZCOA 3NQFA 4MKNA 2RDWA 1P0KA 2P1FA 3NQVA 4YWIA 1VS1A 3QH2A 2R91A 3GXPA 1D3GA 4B5NA 1F76A 1EP2A 1JR1A 4UFIA 4BFAA 2ABBA 3DH7A 2X2GA 3LERA 1OJXA 3GB6A 4QAIA 3NAVA 2YYTA 4UMCA 3NG3A 5DCDA 2Y62A 3W83A 3M44A 3IIPA 4KFNA 1YDNA 2Q8LA 1UB3A 3W7RA 1QNVA 1A53A 4IOTA 1VR6A 1SU5A 4OBTA 3LXCA 4QJ1A 1RD5A 5KSWA 4N6EA 3G8EA 1QPQA 2A21A 4UFLA 3GVGA 5D2VA 4O11A 3TQKA 4LVGA 2ZZ2A 5G2WA 1QDSA 3LTYA 4H3DA 3TW6A 4MUZA 2GPTA 3PB2A 4YXGA 3EX3A 1G4EA 5DXYA 3GR7A 3LCLA 3I7SA 5F4XA 3BG3A 4FNPA 3FYPA 4Z08A 3TW7A 2PRHA 3MWAA 3FKRA 3GDTA 3BLFA 5U7SA 4PCFA 3R5EA 1EX5A 4S2CA 2NUXA 1YPFA 4I7VA 3T4CA 4O4VA 4EVZA 1M7OA 4ZQPA 1TPDA 3W71A 1ZALA 5FI8A 3W74A 1DOSA 2CLOA 2Q3RA 3NM3A 5DBTA 2YFNA 1WOAA 4XUGA 1KA9F 4IMDA 2CLKA 1GWJA 3M6YA 1QOPA 3I7RA 1TJRA 2E1DA 3ANYA 3WK2A 1JRCA 4LOCA 4O1DA 5G1TA 4GXMA 5D2TA 3NO5A 5KZMA 5DY2A 2C1HA 2CW6A 3W73A 1GVOA 4WOQA 1LLZA 3HBLA 2Y61A 5G1YA 2JKAA 4O13A 1UJPA 3SJ3A 4JTJA 1LORA 5EL1A 5CG7A 3TR2A 1GOXA 4Y6GA 1P0NA 5F4SA 2Y7FA 3R8RA 3IIVA 3L21A 2W0UA 5EKYA 1KM1A 4WY0B 2CZFA 4R34A 2A6NA 5L9FA 1OFRA 1AW5A 3UZJA 1VPXA 1HL2A 3W7KA 1OK4A 1JCMP 2CU0A 1UASA 3DKJA 3WJZA 4AVFA 1KM2A 2A7RA 3G1AA 4KFOA 3VCRA 4JS3A 4UXDA 1WX0A 4O19A 4TMBA 2TYSA 4O10A 3P81A 4O18A 3KVJA 2QF7A 3W1XA 2QR6A 4LV9A 4NNAA 3C0JA 3NVTA 3CTLA 3EWZA 3WJSA 4EWND 1DQWA 3W7CA 4LC6A 3UXAA 2A6LA 3HF3A 4BI7A 4Z1BA 2V0TA 1X1OA 4UMAA 1QR7A 4X22A 3BLEA 4XBKA 3W7LA 4HSOA 4QNEA 4JX5A 5AFDA 1LRQA 2HS8A 4M5PA 1FCBA 1QPOA 1OYBA 2C18A 2C16A 4UTTC 4K36A 1SSDA 3KX6A 1ZENA 4O16A 2WO5A 4JTIA 1FCUA 2B0MA 4W9TA 2G95A 4FXSA 1KM3A 5D33A 3USBA 4GBUA 3TH6A 1KTCA 3LI1A 3RK8A 2NZLA 5IM51 2WSRA 5HWMA 3S5YA 4OQVA 5EBUA 3NQEA 1IGSA 1KFJA 2Y89A 1ME7A 5D2WA 3UWWA 1Q6LA 4MY9A 1BTMA 2ZQ0A 3W7NA 1BWKA 3GR8A 2Y7DA 1OF6A 3UPWA 5CPLA 3KRSA 1GJPA 3I68A 3HB9A 3NPXA 1B57A 1SQ7A 4R7JA 3CEUA 3MYOA 3LXAA 1TTIA 4MY1A 4K39A 3JR2A 2V30A 1H7NA 1G4SA 1N8FA 4UTIA 3MBDA 3NQ6A 3PM6A 5CGQA 4WJEA 3BGGA 5IBXC 3WK3A 2C0AA 1EB3A 4U4MA 3ABSA 4JTTA 3NZ1A 3SFKA 1JQXA 3S6DA 1YLVA 3LCGA 2GVGA 1EUNA 2V82A 4NNCA 3KFTA 4FEZA 3WK0A 4CCEA 3W70A 3WJWA 3CWOX 4I7WA 3STCA 5BMXA 3U2OA 3GKFA 3W86A 4ADTA 1TO3A 4YMZA 4NVTA 5FF3A 3FA5A 2QDGA 1NF0A 2DJXA 1OF8A 2A7NA 4LTSA 4HHPA 4OHQA 3W7OA 4JTFA 3G24A 4DO5A 4RKAA 3Q2DA 3H53A 3TXVA 3P60A 1JUEA 2XFWA 3W7EA 4S2BA 5AOUA 3UPBA 3P62A 5SWUA 4LVFA 2ATSA 4LC8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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