3OZPA

Crystal structure of insect beta-n-acetyl-d-hexosaminidase ofhex1 complexed with pugnac
Total Genus 190

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
572
structure length
572
Chain Sequence
EDVVWRWSCDNGKCVKLKNDPRSSEPALSLEACKMFCNEYGLLWPRPTGEADLGNFLSKINLNSIEVKILKKGATDDLMEAAAKRFKEQVSLAIPRGSTPKLTGKAVDVYLVNENPNEKAFSLEMDESYGLRVSPSGADRVNATITANSFFGMRHGLETLSQLFVFDDIRDHLLMVRDVNISDKPVYPYRGILLDTARNYYSIESIKRTIEAMAAVKLNTFHWHITDSQSFPFVTTKRPNLYKFGALSPQKVYTKAAIREVVRFGLERGVRVLPEFDAPAHVGEGWQDTDLTVCFKAEPWKSYCVEPPCGQLNPTKDELYQYLEDIYSDMAEVFDTTDIFHMGGDEVSEACWNSSDSIQNFMMQNRWDLDKESFLKLWNYFQQKAQDKAYKAFGKKLPLILWTSTLTNYKHIDDYLNKDDYIIQVWTTGVDPQIKGLLEKGYRLIMSNYDALYFDCGYGAWVGAGNNWCSPYIGWQKVYDNSPAVIALEHRDQVLGGEAALWSEQSDTSTLDGRLWPRAAALAERLWAEPATSWQDAEYRMLHIRERLVRMGIQAESLQPEWCYQNEGYCYS

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Ostrinia furnacalis
publication title Active-pocket size differentiating insectile from bacterial chitinolytic beta-N-acetyl-D-hexosaminidases
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-acetylglucosaminidase
total genus 190
structure length 572
sequence length 572
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2010-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF14845 Glycohydro_20b2 beta-acetyl hexosaminidase like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ozpA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3ozpA01
2RGMA 3W29A 4GQRA 3WMBA 1EXPA 1MW1A 3N18A 2FHCA 3B9EA 3WFZA 4W85A 4JFTA 2WWCA 5CSYA 1BYAA 2YOCA 1AQHA 4QLKA 7A3HA 4AZHA 1VFOA 2D22A 2VJXA 4TVCA 2J7GA 1W3KA 1ZJAA 2FH8A 1B90A 3ARYA 4KH2A 4QCEA 1JL8A 2VQUA 4H8UA 3EBVA 2ESCA 1GQLA 2YKKA 3VIIA 2G3IA 3VKKA 1ISZA 2VVSA 4JKKA 3ZO9A 1PEZA 2WC7A 3GBEA 1DHKA 2O9RA 3WELA 4GI6A 3NCOA 2W66A 2XVPA 1V3MA 3VILA 1UWUA 1LG2A 1QPKA 4FF5A 1GOOA 3CZEA 1UKOA 3BLKA 3EDKA 3VDHA 1WKYA 5BROA 2QV4A 2CXGA 5CPTA 3T0BA 3G6LA 3I3BA 3DHPA 5HDRA 4WF7A 3KE0A 2J47A 5I3DA 1HKKA 1ODUA 5DT5A 4AIUA 2J25A 2ZUWA 1LQ0A 2E9BA 3GH4A 1R7OA 4M82A 4E8DA 4AD3A 3AIQA 3HN3A 4GO8A 1VENA 3VIMA 1W3JA 1VEPA 1E73M 3CO4A 3RJYA 2QLYA 4D6FA 1W91A 4JCLA 1H49A 4IPLA 1OGBA 2WB5A 2WVVB 1FA2A 1QNPA 4V2XA 1Q6EA 1X6NA 1UG6A 4OJYA 1BPLB 4D71A 3VGFA 3OLDA 1W9XA 3PBGA 4HA3A 3A4AA 4F66A 4PTVA 3WH6A 3SIMA 2XGBA 1V6XA 3T0AA 4YHGA 2VVNA 5A69A 4QAWA 4H2CA 1JFHA 3SCNA 3TTYA 3T2PA 2DT3A 3QR3A 4CCEA 1E56A 5CJ5A 3WDJA 3CHDA 2VX5A 2WHKA 4GI9A 4HMCA 1H4PA 4M24A 4XV0A 1JZ6A 4MNLA 4UOZA 3WDRA 1SFSA 4UFLA 4AZ5A 1HVXA 1QNQA 1UR0A 5A8QA 1AMYA 2CHOA 2WAGA 3VGHA 2YA0A 3GH7A 4LXFA 4CCCA 4R5EA 2PB1A 4TVDA 4J3WA 4GIAA 2ZXQA 1XD1A 1CGTA 3WDPP 3WY1A 4PMRA 1QOXA 4PMNA 2WSKA 4PUDA 4PTWA 1CWYA 3CZJA 3GXDA 2GJPA 1PX3A 3T2QA 2JEPA 3FHAA 4JL1A 1WNOA 5I24A 3PHAA 1L8NA 1ECEA 1GOKA 5E6YA 1KR0A 3WEZA 1WE5A 1W9BM 2O92A 3VGBA 2EXOA 3F5LA 1UR1A 3PZTA 1MW0A 3W6MA 4N0RA 2X8RA 5GNXA 3VNZA 2O9PA 4L4PA 1OGGA 2CERA 4P7LA 1EQPA 1HJSA 1TMQA 3RMEA 1ISWA 3T08A 2XPKA 4GZJA 3WNMA 2YDRA 2ZWYA 4J3TA 2NW0A 4BQ3A 1UR4A 5EBAA 1WZMA 3PZUA 2VOTA 2BNJA 3CZKA 3FAXA 4X0NA 3WF1A 1NP0A 1U2YA 3S2CA 5AC4A 1E6PA 2DGAA 1J0IA 3BAKA 1IT0A 3OGSA 3IJ8A 3VD5A 3II1A 4H04A 2DT2A 1B9ZA 5HNNA 3SCQA 1KR1A 5LA2A 2CBJA 2CYGA 3VVGA 3A4WA 1O7AA 4U33A 5LYRA 1MQRA 4DWSC 1A47A 1E1FA 3BAYA 3W28A 2Y8KA 1V3HA 5D8ZA 4J3VA 3LMYA 1VEMA 5ABEA 3WMCA 4GINA 1OINA 2J7HA 1B3XA 2YDQA 4NI3A 4HOZA 1KXVA 5KEZA 1VFMA 1TE1A 1CXFA 4P7QA 1E4LA 3NUKA 5TD4A 1WZKA 4AD4A 5D9MA 1EH9A 3MMDA 5GPRA 1TVNA 3E1F1 3EDDA 1W9UA 4OBRA 2WNWA 4KWUA 3T09A 4HMEA 4UQBA 1VBUA 4UFJA 1M04A 3SUWA 2PC8A 1UD3A 1R85A 1BQCA 2V38A 2EPNA 3CUIA 2VX4A 4DWSA 2OSWA 2Y4SA 4HTYA 2DH3A 5E09A 4BA0A 4LGXA 5A2CA 1GHRA 3EDFA 2PF0A 2YDSA 1NQ6A 1UR2A 3RILA 3VINA 2DDXA 1UR9A 1H1NA 4LQ1A 1JXJA 4D1JA 1C92A 3SCOA 1Q6DA 5A95A 2D23A 2GJXA 5EFFA 3WSUA 2YL6A 3K46A 3B8SA 1HL8A 1LWHA 1CXKA 4FK9A 4HU0A 3WF4A 4NF7A 3VGEA 2O9OA 1UZ1A 1OIMA 2XWDA 3VIJA 4CN6A 2Y8VA 1G1YA 2GDVA 2J7FA 1V3IA 3AYRA 3W82A 3WUEA 1ZBCA 4P7NA 2BY0A 1JNDA 4S3JA 3KZSA 5EB8A 1B3WA 1JFXA 1PPIA 2DPEA 3BSHA 2OYMA 2YA2A 4MNJA 1S46A 1TFVA 3AXIA 1QBBA 2XVNA 1G01A 4Z2KA 4ACZA 3FHQA 4P8VA 2ZXDA 1PZ2A 1EHAA 4P8WA 4MDPA 1V6WA 1K9DA 1JYVA 1HN1A 3RIKA 1ESWA 2UY2A 3AROA 3RJXA 3CH9A 2WCSA 1US3A 2WWDA 1GOIA 5FL0A 5F7UA 5I23A 3VNYA 5IFTA 3A47A 2W91A 3TP4A 1UH2A 3QHOA 4BQ4A 4IISA 1OWQA 4OKDA 4P8UA 3O6AA 2PWGA 1J0ZA 3ARQA 2X0YA 1H11A 4H41A 4AZBA 5A8PA 5AC5A 4BCEA 3VM5A 4OZOA 3CUFA 2VQTA 1QHOA 1FOBA 4TX8A 1E5JA 3QHMA 4WKAA 3ZMRA 1K9TA 2YLLA 5A6BD 1A3HA 2HVMA 4PRWA 3WD0A 3WD4A 1NWSA 1H3GA 4B15A 5FL1A 1JDAA 4S3KA 1H09A 1EOKA 1J01A 3W26A 4AEEA 4AEFA 3VIPA 4DUXA 3B9DA 4CD8A 3U7BA 3NSXA 4GXPA 1SMAA 3A6OA 4CVWA 1BYDA 2CEQA 4KGLA 3VX0A 4B3LA 4TTUA 1RPKA 3WF3A 1DTUA 1EQCA 1W1PA 3EMQA 2WZHA 1FHLA 1G5AA 1NH6A 2EEXA 4UQ9A 1QW8A 2DSKA 1E70M 2IXVA 3KL3A 4B9YA 1UH3A 5HOSA 1L0PA 3EDEA 1JI2A 2A3EA 1JYNA 1W2PA 3FW6A 4TOQA 2CKRA 3ZT6A 1I1WA 1H0IA 5A6SA 1WDRA 4W86A 4LYPA 3W27A 2E4TA 3AIBA 1V0MA 4H8HA 1B3YA 1HIZA 3AIVA 3ZM8A 1OB0A 2V5CA 3AIWA 3PZMA 5ABFA 5FD0A 5A6MA 4UQEA 3UEQA 1AQ0A 3WD1A 1JZ2A 4EAMA 2VR4A 3WF0A 4CU8A 1HJWA 4WJXA 4JKMA 4U2ZA 2YA1A 1KQYA 5CSUA 3K4DA 2FH6A 1BVNP 4AZCA 1PAMA 1MQPA 2ZUMA 2GVYA 2VCCA 5ABGA 5BYWA 5LA0A 2FDMA 4W7VA 2E8ZA 2VZTA 5A6KA 1MXGA 3VD7A 3T2OA 3GH5A 2J7BA 3FN9A 3CZLA 4UNIA 1BYBA 3HJEA 1GCYA 3VOCA 1JG9A 1LG1A 4AD2A 3MANA 1SR0A 4AD1A 4M8UA 1UKTA 1CXEA 5A8MA 1GZJA 5CG0A 2GK1A 4D6JA 1J0YA 3AQUA 3W81A 4UQAA 3WBEA 1V6UA 4M56A 2VZVA 3VIKA 3NDYA 3SCWA 1CECA 1UHVA 5BXSA 3WH8A 4QDMA 2CBIA 4AIOA 4HOWA 2GDUA 3WQ6A 2NT0A 2ZUVA 1CXLA 4P7RA 1CYGA 3KL0A 5M17A 1WDSA 4XX6A 3EDJA 2MANA 2YIHA 4GQQA 3WL1A 3WQWA 4FLOA 2WKLA 1KQZA 3VIOA 4AMCA 3EYPA 3NJ3A 4C7DA 1X1NA 2VURA 1CGXA 2XFFA 4CUCA 4DUVA 4HA4A 1BG9A 3F5KA 3GNRA 1JD9A 3DC0A 2W67A 1W9DM 1NOUA 1GVYA 4JL2A 3ZSSA 3VDAA 4AXNA 3L2LA 5C8BB 2JF7A 4HZ8A 4CN1A 3PZNA 1JZ5A 3UG5A 2XFYA 4B3KA 5D4YA 3W0KA 2BVDA 2E0PA 1E15A 1W1YA 2Z1SA 3W24A 4CD5A 4JFUA 1V0KA 1XHGA 1HJXA 3PZGA 1AVAA 2CKSA 2VT0A 4RL3A 1C90A 2UY4A 2V3GA 4EK7A 4BQ5A 4GKLA 4E8CA 2XSAA 1E3ZA 5JIPA 1WDQA 4N42A 2PWHA 3RM8A 3WUGA 4P7OA 2UWFA 3AHVA 1DP0A 4B9ZA 4PSPA 2EPLX 2PWFA 2XM1A 2DT0A 2Y2WA 4Y7EA 1VIWA 3THCA 2VRJA 1XV8A 3VM7A 4FLSA 3M7SA 1J11A 2DH2A 4UTFA 2WHMA 2DQXA 3TTOA 3N12A 3QGVA 4WLCA 3APGA 3IAQA 6TAAA 3OZOA 1E4IA 3IJ9A 1DEDA 3A3HA 4AYSA 4NRRA 2Q8XA 3WDQA 5E9AA 4D6DA 4MAVA 1BF2A 1XSKA 1YHTA 3IAPA 3T0DA 4FLQA 4UOQA 3K1DA 3UESA 1FHDA 1WDPA 4NZCA 2ZOXA 3TA9A 4ZEPA 1UA7A 2IXUA 4HMDA 4AZ6A 3RO8A 3UCQA 3W25A 5I79A 3JUGA 3GNOA 1G0CA 2WVUA 3WNNA 2QMKA 1BAGA 1FH8A 1EDTA 2J4GA 1UD4A 2DSVA 2F2HA 2WMKA 3F5JA 1J0JA 3ARZA 4D6HA 3GXIA 1WO2A 1TR1A 3BGAA 3WNLA 1C93A 1Q6GA 3AICA 2JF6A 4PMQA 2WSPA 3BAIA 1GOWA 3SCSA 1HKIA 4J27A 1UYQA 3AS1A 4YHEA 2WCAA 1CENA 4EANA 4LYQA 3CLWA 1OIFA 1P6WA 4MPKA 4GO9A 3ARSA 2WKGA 2VI0A 2J8FA 2D0GA 3VIGA 4PBGA 2F8QA 3BAWA 2FHBA 3SUVA 1VRXA 2WZIA 4WKHA 2Y24A 5I5RA 1XCXA 1GONA 1UQYA 1W9PA 1XC6A 1ZJBA 1E55A 3AJ7A 5BWFA 2W62A 5M5DA 2PBOA 2BXYA 1E1EA 4WIWA 2BFGA 4CGTA 3SUUA 2VNCA 2J75A 1BHGA 5D9PA 2QHAA 4JFWA 4V27A 2QPSA 1R87A 2XUCA 1MW2A 3MMWA 3SCVA 3SUSA 3MU7A 1PJ9A 1JDDA 3S6TA 1E6SM 4Q22A 1KXTA 5E70A 3RDKA 4D6EA 1TA3A 1V02A 4QP0A 1V3JA 1UWRA 4URIA 3PZIA 1GVIA 4UZUA 4EKJA 1QI4A 1XCWA 1FP9A 2V5DA 5CQ1A 3F4VA 3B9AA 1UUQA 4DWSB 1MYRA 2DSZA 2XYLA 4JCMA 1XYFA 4ATLA 4XUYA 3AI0A 1PIGA 1UKQA 2D0HA 1RP8A 5A6BA 3SCPA 3ZT5A 1WB0A 4K68A 3VD9A 2PWEA 3J7HA 2A3CA 2WMIB 1FH7A 1Y7VA 1V03A 3WQ8A 3VDCA 2GJXB 1WZLA 5DO8A 3BXWA 3SCUA 3NSNA 4J3UA 3WL0A 1EDGA 3WFLA 9CGTA 1VEOA 1M7XA 3UERA 3SUTA 2B31A 2ZUNA 2OWXA 2GUYA 5D9NA 1JF5A 3OZPA 1TG7A 1C7TA 2DIJA 4W7UA 1CZ1A 3WUFA 4A3HA 1OCQA 3EMCA 2CBVA 4F9JA 3ZOAA 1GJUA 2WK2A 4FLRA 2WMIA 3ALFA 2BY2A 1F4HA 3CZ8A 2C8NA 1Q4NX 1QI3A 4D72A 2C0HA 1GUVA 1PZ3A 4ACZB 3ZR5A 5A6LA 3U57A 1J9YA 1V6YA 2WVSA 4OOZA 2VO5A 1I75A 1E0WA 4C90A 4Z2HA 2ZICA 1BTCA 3CZGA 4CD7A 2YBUA 2GFTA 5JBEA 3ZIZA 1DWAM 1CNVA 3TOPA 3AHZA 3CMGA 4XB3A 2WMFA 4DM1A 5C70A 1KGWA 3ARXA 1UA3A 1PBGA 2AOSA 1UWIA 1UH4A 1KWGA 1ZBVA 1C8XA 1GOMA 4UQDA 4WSJA 4D6CA 2BHYA 2X1IA 4C91A 1NM9A 1VB9A 3VMPA 2W4XA 4YPJA 3KWXA 2OWCA 5ABHA 4AWEA 1JAKA 1JZ3A 2OSXA 2BVYA 3POHA 1HF6A 3M07A 1KXQA 1AQMA 4W8AA 1OSEA 1QI2A 1W3LA 4MJ4A 3MUY1 4ZXOA 4ACYA 3G6MA 2QPUA 4PCSA 1EDQA 3WKZA 3FNDA 3BLPX 1JGIA 4HZ7A 3ZR6A 1UOKA 4WKFA 3W6LA 4M81A 3ZJKA 1JZ7A 2J7DA 5JBFA 2BHUA 1M53A 2A3AA 1BYCA 1VFFA 4JFSA 3A4XA 1ZBWA 3PTKA 1HJUA 1EO5A 1Z32X 1W3HA 5A8NA 3AHYA 3L4WA 4C7GA 2J74A 1LLOA 4A4AA 1NOFA 1UWQA 3PZ9A 4U5IA 3N15A 1OD0A 4XZWA 2YL8A 3WIJA 1J0HA 3N04A 2W63A 4J28A 4CKQA 4XZBA 3D3AA 1DWGM 3GDBA 1KCLA 1CGUA 3AHTA 1JZ8A 2XJ7A 4JHOA 4E2OA 3WDHA 1WP6A 1V3KA 3I3DA 4CD6A 2ZIDA 3VX1A 2CITA 2EPKX 2VX6A 4PMXA 4AZIA 2CESA 4CVUA 1ISVA 5CLTA 3U5YA 1JYXA 2X2YA 3BMVA 1CDGA 4Z2GA 4W84A 3L4TA 1DWFM 1VF8A 4M80A 2EBNA 4MB5A 1V6VA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2RGM A;  3W29 A;  4GQR A;  3WMB A;  1EXP A;  1MW1 A;  3N18 A;  2FHC A;  3B9E A;  3WFZ A;  4W85 A;  4JFT A;  2WWC A;  5CSY A;  1BYA A;  2YOC A;  1AQH A;  4QLK A;  7A3H A;  4AZH A;  1VFO A;  2D22 A;  2VJX A;  4TVC A;  2J7G A;  1W3K A;  1ZJA A;  2FH8 A;  1B90 A;  3ARY A;  4KH2 A;  4QCE A;  1JL8 A;  2VQU A;  4H8U A;  3EBV A;  2ESC A;  1GQL A;  2YKK A;  3VII A;  2G3I A;  3VKK A;  1ISZ A;  2VVS A;  4JKK A;  3ZO9 A;  1PEZ A;  2WC7 A;  3GBE A;  1DHK A;  2O9R A;  3WEL A;  4GI6 A;  3NCO A;  2W66 A;  2XVP A;  1V3M A;  3VIL A;  1UWU A;  1LG2 A;  1QPK A;  4FF5 A;  1GOO A;  3CZE A;  1UKO A;  3BLK A;  3EDK A;  3VDH A;  1WKY A;  5BRO A;  2QV4 A;  2CXG A;  5CPT A;  3T0B A;  3G6L A;  3I3B A;  3DHP A;  5HDR A;  4WF7 A;  3KE0 A;  2J47 A;  5I3D A;  1HKK A;  1ODU A;  5DT5 A;  4AIU A;  2J25 A;  2ZUW A;  1LQ0 A;  2E9B A;  3GH4 A;  1R7O A;  4M82 A;  4E8D A;  4AD3 A;  3AIQ A;  3HN3 A;  4GO8 A;  1VEN A;  3VIM A;  1W3J A;  1VEP A;  1E73 M;  3CO4 A;  3RJY A;  2QLY A;  4D6F A;  1W91 A;  4JCL A;  1H49 A;  4IPL A;  1OGB A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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