3PM6A

Crystal structure of a putative fructose-1,6-biphosphate aldolase from coccidioides immitis solved by combined sad mr
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
293
structure length
287
Chain Sequence
LKSNRALPLLTFARTHSFAIPAICVYNLEGILAIIRAAEHKRSPAMILLFPWAIQYADSLLVRTAASACRAASVPITLHLDHAQDPEIIKRAADLSPGFDSIMVDMSHFSKEENLRLTRELVAYCNARGIATEAEPGRIEGGEDGVQDTVDLEGVLTTPEESEEFVATGINWLAPAFGNVHGNYGPRGVQLDYERLQRINEAVGERVGLVLHGADPFTKEIFEKCIERGVAKVNVNRAVNNEYVKVMREKAGSLPITRLHEEVTNAMQAAVEKIMDMIDSTGKAEFM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title SAD phasing using iodide ions in a high-throughput structural genomics environment.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Coccidioides immitis
molecule keywords Putative fructose-bisphosphate aldolase
total genus 114
structure length 287
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2010-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3pm6A00
1YXYA 2NX9A 1YADA 4WXYA 3MMTA 1K7FA 1FUYA 1PIIA 3G0XA 5F4XA 5DY2A 3GXNA 4JXCA 4E0CA 3GDKA 4K7VA 3KX6A 4WD0A 5DELA 4AB4A 2XFWA 3A22A 3KHJA 3P80A 4O14A 4R34A 1TPWA 4UMAA 1GOXA 2OT0A 1TTIA 1KTBA 4J9JA 4MY1A 5DBTA 2C14A 3GNDA 5H2ZA 2FPVA 1TMHA 3LGEA 5DY3A 5CSRA 1UUMA 1XBYA 1Q6RA 1OFEA 3N2MA 1EIXA 3WJYA 4FO4A 3V75A 1ADOA 3LHTA 3N14A 4NX0A 4BR1A 2A7RA 1EUNA 1TTJA 4G1KA 1RR2A 1K7EA 4GUHA 4JTIA 1I2NA 4PL2A 3U8GA 2XN0A 4NQ1A 2TRSA 1GPWA 1ICPA 1K7XA 1LOSA 4NT0A 4YXGA 2NWSA 1UJPA 3NQMA 3G8EA 4IWWA 4JX5A 4CCEA 3TU9A 3GXPA 3S1VA 2ZZ6A 5DBUA 3DFQA 3W85A 2CLFA 3PUEA 1HG3A 1M6JA 3UWZA 3W76A 5FF0A 5D38A 2RDUA 5LNWA 4UFIA 4ZVJA 4Q32A 3A5FA 1TRIA 2Y7DA 1A5SA 4UTUA 1XBZA 4WY0A 3YPIA 1Q6OA 5TIMA 4EVZA 1SUXA 1IGSA 1A5BA 3EWZA 4LVFA 1DL3A 1OK4A 3B8DA 4R7JA 2JKPA 3W7DA 3WJZA 3NG3A 2ZFAA 5K9CA 1VHNA 1RZMA 3BGGA 2CZDA 2FPYA 2Z6IA 3G0UA 4YCOA 3GKFA 3W7CA 4A2RA 3LHYA 3TQKA 4O18A 3B05A 3BGJA 3GR7A 3RFAA 4LRSA 1RVGA 4YL2A 4UTTA 2BTMA 3I6RA 3W7OA 1TV7A 2JGYA 2ABBA 4LW7A 4ICNA 2DJXA 3E49A 3LCLA 3HGOA 4RXFA 4AMAA 3MP3A 2ZRYA 3W86A 3HOJA 2QCNA 2Z6JA 1G4SA 4TMCA 5D05A 1IXPA 3GDLA 4JD4A 3DU0A 1LTDA 1HUVA 3P67A 3O6DA 3S5NA 4RV8A 4P61A 4O13A 3NQEA 1FWRA 2NV1A 4POCA 1EEPA 5EY5A 2QUVA 2CU0A 4JN6A 4NJJA 4E2DA 3T78A 1F6PA 1L6WA 1TREA 2WSQA 3PSWA 3S9YA 4HNNA 1EX5A 3S1XA 2V9DA 3TC7A 5KZMA 1SW7A 3QFEA 4IXHA 2EKCA 3W1TA 3TROA 4LUJA 3UPWA 1OJXA 5EYWA 3TE9A 3GDMA 4HHPA 1SFJA 3LXAA 4TIMA 2ZTJA 3I7QA 5EPDA 3SZ8A 4YLWA 3B4UA 2ZDRA 4XUGA 3HGJA 3VE9A 4GUGA 3TDFA 4MJMA 3O6CA 3MBDA 3MBFA 3TKFA 3LRMA 4XTDA 1W5NA 3G1VA 6TIMA 1PHWA 4LOCA 2VC6A 1IXNA 4ZQRA 1TB3A 4L4LA 2I9EA 1WDWA 2GQ9A 4X22A 2G96A 3ZR4A 4IMFA 2A1YA 3LRLA 5F4SA 1KLZA 2DZPA 3H53A 3LLFA 5EL1A 1WBHA 3NQ7A 4RXGA 4I7VA 3N73A 1GVSA 4S2CA 1ME7A 3LBMA 1YTDA 4DF2A 3W84A 2R94A 1K03A 3R89A 1B4EA 4UNLA 4XZ9A 1CX9A 5FF7A 4Y96A 2NXHA 1JCLA 3O1NA 3HQ1A 3NL3A 2Y63A 1FXPA 2P0OA 4UTWC 1VYRA 3BARA 2R8WA 1Y0EA 5LSMA 4CNOA 3W1MA 1OFAA 3FYPA 2C18A 3M9YA 4AHQA 3DENA 3BW3A 1TO3A 1OFQA 3EX3A 4E2BA 1XKYA 2P10A 1DJQA 4UXDA 4TMBA 1WBJA 4JTSA 3GKAA 1MO0A 3N34A 3PY2A 4M7TA 3M44A 1JJKA 3CEUA 4RK8A 2WNQA 1PHQA 2X1TA 2YX0A 3HJZA 2E6AA 4MOZA 1KW1A 2CZ5A 3DI1A 5LGXA 1GJPA 4QJ1A 3CIXA 1JRCA 2QCDB 3HB9A 1TPFA 3UZJA 2X1SA 3O63A 2ZZ5A 3V1PA 4Z1AA 3BW4A 1SFLA 3TK7A 3W1PA 1JQVA 3W7MA 1H7NA 3TXVA 2OCZA 5K3VA 3B03A 2ZCGA 4MY9A 4X3ZA 1KM4A 3K30A 3G1SA 3QW3A 3L2IA 4W9TA 3N9RA 3QJAA 1VRDA 1I2RA 3U6WA 4TR9A 3KVJA 1LM1A 4O57A 3KVLA 3DFNA 5EKYA 3W1UA 2ATSA 2KZHA 3BLFA 4I7UA 2NUYA 4NX5A 4NNCA 4MZ8A 3MHUA 3MYOA 3GDTA 1KTNA 3M5VA 5I3JA 4ZQNA 1ZAJA 4Z0JA 1AW1A 1P1XA 1W5MA 1TPVA 4O19A 1YYAA 3GDRA 1X8FA 4QM1A 3G24A 1DVJA 3IRDA 5HINA 3LM7A 3FYOA 2V30A 3QH2A 2YZRA 3RLUA 1TPDA 1BTMA 3NZ1A 2QCDA 3R12A 4UTJA 1YPIA 3T55A 3BVJA 3Q94A 4IMCA 2GOUA 3DGRA 3MWAA 1AL7A 5D2TA 3LXBA 1W5OA 1OABA 1SR9A 3NQCA 4OBTA 1TPH1 2YR1A 2JBMA 3QMRA 1OG0A 3HGSA 4JTHA 3W7RA 1LLWA 3FOKA 2Y88A 3O06A 3RK8A 2X16A 4LRTA 2ISVA 4I7WA 4MPQA 5F2LA 2ZBTA 3HGRA 3CB8A 1VC4A 1FX6A 1HL2A 3CQ0A 5D37A 1EUAA 1K8ZA 4MJZA 5F4WA 5D30A 3P5YA 1EA0A 4RR4A 4N2YA 2QKFA 5HJLA 2FPTA 2ZYFA 1JCYA 2H6RA 3QSRA 1BWKA 3TC6A 1G4EA 4FX7A 3HPSA 2YW3A 4IPJA 3UY8A 2NX1A 3TV8A 1R2RA 2YW4A 5AYXA 5AC7A 1DV7A 4HNUA 1OFBA 3VFLA 4Z0SA 1V5XA 4Y90A 2Y6ZA 3ZFHA 1TJPA 3VI2A 4UTHA 1UCWA 2V82A 2DJLA 1A53A 3STGA 1W3IA 1Z42A 4UFLA 2JKEA 2DORA 5G1TA 1KLYA 1N55A 1XBXA 3GLCA 3SECA 1P0KA 2YYUA 1SSDA 2GQ8A 5BMWA 6ALDA 1FWTA 1RD5A 5H91A 2TYSA 3PBYA 4LUIA 1FDYA 3QF0A 1Z44A 1W3NA 4ALDA 1ONRA 1LOLA 1X6UA 3PF3A 2O7SA 3GVGA 3C0JA 2WOQA 3FJ6A 2ZA1A 2QUTA 4O53A 1W5QA 2YDAA 1KFBA 1OYAA 3UNDA 2ZZ3A 1QPNA 1F7BA 4UTLA 1FWSA 5CPLA 5F2MA 1IIHA 3FS2A 2CFFA 3W7KA 5MHBA 3VE7A 3PUDA 1OYBA 4NNAA 3IVTA 3W88A 3EX1A 2QDHA 3DBPA 2FTPA 3LV5A 4GXMA 1DJNA 5DN1A 1T0OA 5SWUA 4UFMA 2YGYA 4WZHA 3TMLA 2I1OA 3U2OA 3NQFA 1P4CA 2LLEA 2Q3OA 4L4MA 1AW2A 4Y6GA 3BG5A 3ZWSA 2PURA 1EP2A 3LTPA 4AWUA 1G69A 2VEIA 3PAJA 2ZQ0A 4O1DA 1LOQA 2X2GA 1ICSA 3UWQA 2Y7FA 3TW6A 1I2QA 4C1KA 4K7YA 2C19A 3UD6A 1SPQA 5LNUA 4MLJA 2ZZ2A 5AB3A 3NOEA 3IGSA 3LB0A 4GFSA 4PL1A 3W1RA 4YWIA 3QZEA 3RMJA 2YSWA 4QSHA 3L5LA 1K8YA 2W6RA 4AH7A 3NVTA 4DXVA 1WV2A 2WO5A 3FLUA 4MFEA 4O50A 4HN4A 4UFHA 3UXAA 4UIOA 4Z1DA 1R2SA 3TJXA 4K6AA 1ZCOA 2ISWA 3IGXA 5D33A 1TPB1 2YFNA 4AWTA 4DO6A 2A6NA 5FEWA 1JCJA 2QDGA 5F2IA 1VYSX 5LHEA 1KM0A 1R2TA 3IGUA 5HWMA 1OK6A 3STFA 3KVMA 3DKJA 3MHGA 3P5ZA 2QCGA 3M5XA 1TPC1 3W1XA 5LNSA 4M6QA 3W7NA 2NUWA 4UC5A 4KKXA 4N6FA 2DZSA 3A21A 5BNKA 3TR2A 5LKYA 3SR7A 3A23A 1F74A 1SQ7A 3MYPA 1KV8A 4I9AA 3M41A 2WV8A 4LVBA 4O15A 4DO5A 5EBUA 3C3NA 3W2JA 3RNDA 3R8RA 4JX6A 3QRHA 1YTKA 1GEQA 4FNUA 5A5WA 5CZTA 1X1OA 5G2WA 1D3HA 1TV5A 3TAKA 1KM2A 2WJZA 3W7LA 4BI6A 2VXNA 3MI3A 1E51A 1FY6A 1B57A 5BOOA 3M47A 1H60A 2ISSA 4MZ1A 1B3OA 1VYPX 3KVKA 4MFDA 1GTEA 4WXZA 2ZZ4A 1TTPA 4QNWA 2E09A 2HTMA 4BI7A 3GIYA 3T44A 1F73A 2VEPA 3TW7A 4AWSA 5DCEA 4NJKA 4WY0F 4K36A 3W7JA 3GNNA 3F03K 1G7VA 4N9BA 4CNNA 5I3IA 1YDOA 1A50A 3LHUA 1GVRA 4JTEA 4O28A 4RCXA 3IIZA 1OX6A 3ANYA 1O4UA 1QFEA 1HO1A 3OHIA 2C6QA 2GJNA 2Z2UA 3NM3A 4XBSA 2W0UA 1SZEA 1XDLA 3G1AA 1T96A 3EWYA 5AYYA 1H7OA 5LNRA 2TMDA 3R13A 1VCGA 1H62A 3EWWA 1ZJIA 3CLMA 5AHMA 3G18A 2J9ZA 5FEPA 3W1AA 2VELA 4N02A 3E96A 2NZLA 4AF0B 3S5OA 3MP5A 2BZNA 3C52A 3LHVA 4JIPA 1XCFA 3TNOA 2X1UA 4BFAA 1WX0A 5DLCA 3LTSA 4FNPA 1AMKA 5AHLA 3KRUA 1Q6LA 3R2GA 1LRTA 3S5ZA 2OT1A 2G95A 5FESA 2TSYA 2J9XA 1H7WA 2HS6A 1S3HA 1TCDA 4OE7A 4LTSA 4C1LA 3DAQA 4IMEA 1VCVA 2DZTA 4JYFA 2RDTA 1Z41A 4A22A 1NSJA 1XC4A 2HMCA 4R33A 4EWND 4O54A 4GBUA 1J5TA 3LOTA 1KFEA 3C4UA 2TPSA 3C61A 3DFOA 4B5NA 1XDMA 2R14A 3GXTA 2E1DA 3DFTA 3QQ0A 4AF0A 4Y9AA 3IIVA 1LZOA 2H3DA 3KRSA 3MHFA 4CCCA 3VCRA 4QITA 4RKAA 1QCWA 3NQGA 4QISA 1BEUA 3TQVA 4MZYA 1WOAA 2R91A 3EWBX 2VFHA 1KM6A 3MP4A 5D2VA 5J5DA 2UV8G 5DXYA 2A85A 8TIMA 2Z0IA 3ABOA 2CLHA 3CC1A 3NO5A 4XBKA 2ZRUA 3W2MA 4RZ6A 3OA3A 2BLEA 3P7YA 3FIGA 2BWGA 1PCWA 4UTIA 1F5ZA 1GG0A 2Y7EA 3LCXA 4WOZA 3NQ2A 2HS8A 2YYTA 1F05A 3BG9A 4MIMA 2V81A 2VEMA 2B0MA 3N2XA 4GJ1A 4PFMA 4UUIA 1SU5A 2AQWA 5HNRA 2BXVA 2EGZA 1TSIA 4HT3A 3O05A 1CW2A 1YDVA 3UWWA 4ADTA 2YXGA 2NUXA 4JTGA 1OF6A 4GE8A 4ADUA 3IEBA 3FKRA 4CLMA 3C8FA 1VHCA 2FIQA 4MKNA 3NR0A 2CW6A 3FJLA 3M43A 3W2UA 3B0VC 2AGKA 2F7FA 5EMUA 3T7VA 1TRDA 3IVUA 1M7OA 3USBA 2A7NA 5G1YA 1RQHA 3IIPA 4ML9A 2DU2A 1ZAHA 4UTWA 3P84A 3LCWA 4ZQMA 3W22A 3HG4A 3WFAA 1C29A 1KBIA 5FI8A 3THAA 5FEXA 4IX0A 1S5VA 3PG9A 1DKWA 1R30A 3LCFA 3HG3A 2GQAA 2WSRA 2FQIA 1L2UA 2OMAA 3NGJA 5BW6A 3HO8A 1FCVA 2W79A 4JY8A 4LS0A 1VLWA 3NQDA 1SW3A 3INPA 3UPBA 3BO9A 3W7PA 1QAPA 4H4IA 4LU0A 3ZWTA 4XQ6A 4K8EA 1S5TA 3LTYA 4ZQOA 3DHFA 4LV9A 3PR2A 1C8VA 4LY8A 3S0CA 5AYZA 3C56A 3TUUA 1G6CA 2B7QA 2D73A 1BWLA 2QCEA 4WQ6A 1I2PA 2FB2A 4DQWA 1H50A 1AW5A 3MI2A 1QO2A 3RLVA 1KM3A 4A21A 1L6YA 2RKXA 3SIZA 2RFGA 3W23A 3HBLA 4E38A 3G1XA 4JIQA 1DOSA 1IXQA 1H1YA 4JTUA 1XBVA 3LCIA 3PC0A 3M5ZA 1ME9A 3PSVA 4RLIA 3UWVA 3W7HA 2V2DA 1GYLA 4S2BA 2PRMA 5D09A 4JYDA 2ZZ7A 1G4PA 1QNVA 5KMYA 5D2YA 1N7KA 5TBOA 3NXFA 2Y85A 1SO6A 1LBMA 5J5RA 1YLVA 1QO5A 4D2JA 1TPUA 4HPXA 4PH6A 4XWUA 2QJGA 1Q45A 3T40A 1HTIA 2J6XA 1JQXA 4O52A 3GK0A 1LBLA 1TIMA 5U7SA 3RU6A 5AC6A 3R5EA 3I7SA 3W1LA 3L66A 5G2IA 2WKJA 1JUEA 5G2HA 1M7PA 1TQJA 3C6CA 1QPOA 4LVDA 1NF0A 2H8ZA 3N19B 5I3GA 1P0NA 1JCNA 2V2CA 2VFGA 3I68A 4PTNA 2NX3A 2QJHA 3DFPA 5HWNA 1HO4A 3GR8A 4LVGA 3G0SA 2B7NA 3DI0A 4CQAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1W3H A;  2VL4 A;  1QW8 A;  2DEP A;  3ZR5 A;  3GSM A;  1K7F A;  1PII A;  4YVP A;  4KRZ A;  1RK6 A;  2VMF A;  5F7U A;  2IW0 A;  1Q4W A;  1RP9 A;  3KX6 A;  3SN4 A;  1U1H A;  4R34 A;  4C5Y A;  3EPM A;  2OT0 A;  2E8Y A;  1KFW A;  3SCW A;  4J9J A;  2C14 A;  2NT1 A;  1MXD A;  3GND A;  4PB3 A;  4REQ A;  1TMH A;  4W89 A;  5CSR A;  3EB4 A;  4ZEP A;  4FR6 A;  5BOF A;  2XGI A;  2GGG A;  2A7R A;  1LLO A;  4H8H A;  2OWX A;  4GUH A;  4JTI A;  4PL2 A;  2PDK A;  1GPW A;  1BQG A;  1K7X A;  4O8A A;  4YXG A;  2J78 A;  2GDV A;  3S46 A;  1E4L A;  2XSB A;  4IWW A;  3VX0 A;  3S1V A;  3APT A;  2CLF A;  1A4L A;  3W76 A;  3NCO A;  2WZI A;  5DAN A;  3WEO A;  2NVC A;  1CGV A;  2X7V A;  3O0K A;  4NAF B;  1UC5 A;  3A5F A;  1K9T A;  2Y7D A;  3OQ8 A;  4UTU A;  1PAM A;  5G4H C;  4HK5 A;  5ABF B;  2W62 A;  1Q6O A;  2NQH A;  2ZDS A;  2ZX9 A;  4J35 A;  3S2C A;  3EWZ A;  3PTM A;  5JBF A;  3L23 A;  3NG3 A;  2P8C A;  1ZBV A;  5K9C A;  1PXG A;  1RZM A;  3BGG A;  1UUQ A;  3TA9 A;  2YCK X;  1E6N A;  4QDM A;  2OWW A;  5I02 A;  3GR7 A; 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