3PM6A

Crystal structure of a putative fructose-1,6-biphosphate aldolase from coccidioides immitis solved by combined sad mr
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
293
structure length
287
Chain Sequence
LKSNRALPLLTFARTHSFAIPAICVYNLEGILAIIRAAEHKRSPAMILLFPWAIQYADSLLVRTAASACRAASVPITLHLDHAQDPEIIKRAADLSPGFDSIMVDMSHFSKEENLRLTRELVAYCNARGIATEAEPGRIEGGEDGVQDTVDLEGVLTTPEESEEFVATGINWLAPAFGNVHGNYGPRGVQLDYERLQRINEAVGERVGLVLHGADPFTKEIFEKCIERGVAKVNVNRAVNNEYVKVMREKAGSLPITRLHEEVTNAMQAAVEKIMDMIDSTGKAEFM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Putative fructose-bisphosphate aldolase
publication title SAD phasing using iodide ions in a high-throughput structural genomics environment.
pubmed doi rcsb
source organism Coccidioides immitis
total genus 114
structure length 287
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2010-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3pm6A00
1TREA 2V82A 4WD0A 1C9DA 1LTDA 1H7WA 1TQXA 3BGGA 2J88A 3A9IA 4LVFA 1IIGA 4QIUA 3PVFA 1NF0A 4ML9A 1VCVA 3TV8A 2NX1A 5A8GA 4ALDA 2ZRUA 3RU6A 1AW2A 1HO4A 1F05A 1H50A 3T7VA 2YDAA 3QFEA 4CQ8A 3G1DA 4XBSA 3MMTA 3PG8A 4OWGA 2RDWA 5K7JA 5K3VA 1OFPA 2YW4A 5LKYA 3GXTA 3HJZA 3FKKA 1JR1A 2Y70A 4Y9AA 3G3DA 1J4EA 2ZA3A 3S0CA 3KX6A 3S1XA 1M6JA 2C16A 3THQA 4NX0A 3DGRA 3QSTA 5CSSA 2CLHA 5D2VA 4ADSA 3L66A 2GUUA 2X1UA 5A5WA 4Z1AA 1SZGA 2R94A 4KFOA 2A2IA 1G4EA 3MI3A 3MHFA 1VLWA 4IQLA 3LHTA 1XBYA 5IM51 3INPA 4RLIA 1XUZA 1W54A 2EKCA 1PVNA 4U28A 4M19A 5HJLA 1T99A 2VEIA 4YCPA 1EP3A 3U8GA 2P10A 1I2NA 2Q3OA 4JTJA 5LGZA 3H53A 1H7PA 1I2PA 4OBTA 3TU9A 3W86A 3DHFA 1LOQA 1ZJIA 1QMLA 3MHUA 4RX0A 4DELA 4LOCA 1GG0A 1RD5A 2WNZA 2E68A 3M5YA 3PWAA 2YGYA 3CHVA 4P61A 3B8DA 4Y96A 5HWNA 3R8RA 2WO5A 5BMXA 3TE9A 1WX0A 2Z0IA 5DCEA 4JTLA 5KZMA 5CZJA 3HF3A 1LDCA 3GXPA 3PF3A 1EA0A 3CU2A 3S8HA 1TJRA 4FX8A 4C1KA 5KINA 2PURA 3QPYA 3L5AA 1OFQA 4JTIA 3GNDA 4PL2A 1EUAA 1AMKA 4FX6M 1LZOA 2GQ9A 1MEIA 4OV4A 1GYLA 3W7LA 3NG3A 3L21A 2HTMA 2V2CA 2YXGA 1B57A 4UR7A 3R89A 4OHQA 1L6SA 3UY8A 3TAOA 1MXSA 3PS7A 5D33A 4X2RA 3HGJA 3RF9A 4LS2A 1IXQA 1TJPA 1SSDA 5EL1A 4ZL1A 3W2LA 1EIXA 3NPWA 3L2IA 2E1DA 3W74A 3LLDA 2ZDRA 3GDMA 1W56A 5G1TA 1QNVA 4JD4A 1QPNA 3L0NA 3UWYA 4RKAA 3QW3A 4O1BA 1MEHA 3G1SA 3K30A 3LBMA 1K3UA 4I7WA 1B9BA 3GDKA 4FX7A 1KA9F 3N9RA 3C2RA 5AHIA 3W83A 4AWUA 3PAJA 1IGSA 3FOKA 4FNQA 1KTBA 2VEPA 4R33A 2YW3A 3LRMA 3B0VC 4MYAA 3M6YA 2BTMA 1YTKA 3FS2A 3MO7A 1W31A 4XUGA 3M5XA 1OFDA 1OFBA 3I6RA 2Y7EA 4NQ1A 4UMBA 1WOAA 2XN0A 5AHLA 2E5CA 1P5BA 3PSWA 4BI6A 4DO5A 1VJIA 1GYNA 3A24A 1NAL1 4Z1CA 3PBWA 1ZFJA 4MPQA 4QAIA 5K2ZA 1YPFA 3VE7A 4OGZA 3UXDA 3QW4B 3E0IA 1TPC1 3W73A 2EPHA 3EKLA 4O0ZA 1RZMA 4IJBA 3UWVA 1LBFA 4UFIA 1KFEA 3BLIA 4FNRA 1FXPA 1SW3A 1F5ZA 5KZEA 3P5YA 4NNBA 3JR2A 3AJXA 2H6RA 3GB6A 1Z44A 4K8HA 4XKYA 4IUOA 4O12A 2HS8A 3CWOX 3QH2A 3W2UA 1THFD 2ISWA 4JX5A 1VCGA 4MZ1A 4C1LA 2V30A 3LXBA 2ZZ4A 3G0XA 2CLFA 1DQXA 3W7GA 4NT0A 2WV8A 3DFNA 5AC6A 2R8WA 2NX3A 5FI8A 2CZ5A 2NUYA 3UWQA 4IPJA 1R47A 4JYEA 1VZWA 4GE8A 4LNYA 5TQLA 5E93A 3E9AA 2WOQA 3NQFA 3UZ5A 3M7WA 4IMGA 4LV4A 1KLZA 1A5BA 3DXIA 5LNVA 3A5VA 2FTPA 4YL2A 3IIXA 1VCFA 4JS3A 3TQVA 4TMCA 3MYOA 2VFDA 3LCHA 4K39A 3W1XA 3W23A 5KSWA 1VPXA 4UC5A 2JKEA 1I2RA 2CLKA 1XCFA 4XZ9A 5G5IA 2NX9A 3GYEA 3P60A 2ZTKA 3TA6A 4E2DA 1T96A 4RZ5A 2FLIA 2QR6A 1G7UA 5LSMA 4DXVA 3ELFA 5KITA 1JQXA 1LRNA 1TTQA 4GUGA 3O06A 4WXYA 2CLOA 5LNSA 3NDOA 3NO5A 1GTEA 1EWDA 1SFLA 1PHQA 3LHZA 4JX4A 1QPRA 1MSSA 4K6AA 2YZRA 5FESA 3HPZA 3DHDA 4QM1A 1JQVA 1EPXA 2FB2A 5D30A 3GIYA 1GG1A 1ZNNA 3KVJA 2A0NA 1OYBA 3RMJA 4JTKA 1H7NA 2D73A 3W2JA 5L9FA 4O54A 2ZRXA 5D2TA 4ADTA 3IRDA 4PTNA 1LLZA 3SSJA 5CKSA 1WXJA 1H60A 2CLLA 4O16A 3NM1A 3OVRA 1K7FA 5GVJA 3QQ1A 3GR8A 5FF4A 5D02A 4GBUA 2ZZ5A 3THAA 2NUXA 3W71A 5FF3A 1Q6OA 3LX9A 1BWKA 1DHPA 4N9BA 3I7SA 3BLFA 3W87A 2Y62A 1VRDA 2FFCA 2A6LA 1KM2A 1ZAIA 1YXYA 4UR8A 3CM4A 3OA3A 2BZNA 3ABQA 4NNAA 3TFXA 1TO3A 4PFMA 1X6UA 5HUOA 1HFBA 2NLIA 2CU0A 4IWWA 3BK0A 3KRUA 3GX9A 3G1VA 2GVGA 3NQ8A 1H61A 3PULA 4WZHA 5TBOA 3LRLA 4O28A 1TSIA 3C2FA 1PS9A 1XUUA 3QMTA 2QJIA 3C2OA 3DH7A 1H51A 1Q6RA 1LORA 3O8AA 3HG4A 3ZS4A 2E5BA 1UCWA 3HPXA 4LTSA 5CPMA 4NU7A 5HULA 1ME9A 5AHNA 3S1WA 5AB3A 4NZFA 1OX5A 4X22A 1K02A 3TXVA 4QSHA 3L67A 3IIVA 3DAQA 1M5WA 2I9EA 1F76A 1XBXA 1W5QA 4K37A 3UY7A 4D2JA 3GXNA 3CQ0A 3TKFA 3FYOA 4AXKA 1UUOA 4NUWA 1G4TA 5C6MA 5G1YA 1GTHA 3W7KA 3FEMA 3W7EA 2OT1A 2V8ZA 4Z1BA 4GJ1A 2YR1A 4H6KA 4UTIA 4ZQPA 5KZDA 4QNWA 5HWJA 1QO2A 4JX6A 3DBPA 3LCWA 3PBUA 5BRBA 4BFAA 4NX5A 3W76A 5T26A 2GJLA 4LVGA 1VLIA 1FCVA 1KM1A 2LLEA 1BTMA 3BG3A 1CW2A 3W1NA 2Y63A 3HQ1A 5MHBA 4N2YA 1CI1A 2ABAA 3A5FA 2AAMA 3SECA 4O17A 4B5NA 4TIMA 2VFEA 1YYAA 2BX7A 5H91A 3W7DA 3W72A 1LP6A 3EB2A 3N3MA 4BWLC 3T78A 2H3DA 2V5BA 4RZ6A 3GDLA 4R53A 5BMWA 3N14A 1Z48A 2ZZ2A 4LS1A 2V81A 2X2GA 4UFHA 4Q33A 4YWIA 4JTFA 1FBAA 4LC8A 4N9DA 4AHPA 3IGXA 3P80A 4FB7A 5IBXA 4XQ6A 3LRKA 3BW4A 1NEYA 3QQ0A 3CC1A 3NL3A 4GRSA 1GQNA 3W1RA 1ALDA 4UUIA 2VFHA 1FWNA 1SZNA 3N73A 3EXTA 4MLJA 1DORA 5F1UA 4XTIA 5AOUA 1N55A 1WQ5A 3HG5A 3F03K 3H55A 2DZXA 3MJYA 1KFCA 5HMSA 5I3JA 1A5SA 1Q45A 4JXCA 1TPVA 1KLYA 2TRSA 3I65A 2OJPA 1ML1A 4WOZA 3MP3A 3C2EA 4UMCA 3DFOA 4JIQA 5F4XA 3PM6A 4N4PA 3ZR4A 1XFBA 3TROA 5K9XA 2FIQA 4UTKA 1W3TA 1VHNA 3DKLA 4J9JA 4RK8A 4CCDA 5AYXA 4HNVA 1XBZA 1I2OA 4WY0A 3G1XA 3NVTA 2A85A 3S5NA 3S5OA 2QCDB 3OHIA 2BSLA 4TU1A 5KMYA 3P67A 1JUEA 3BPWA 1QAPA 3M41A 2W6RA 1AW1A 4HHPA 4OE7A 5G4EA 3VI2A 3U6WA 3O6DA 3QRHA 3B4UA 4IMFA 2VELA 3L0KA 5EA9A 3Q37A 4AWSA 4NVTA 4DF1A 3QPZA 3NEVA 3HG2A 3LM7A 2VEMA 3NQVA 1XM3A 1XI3A 1EUNA 4S2CA 4TO8A 4EF9A 3DFSA 2C6QA 4JTTA 1VC4A 3PG9A 4MJZA 4O57A 2VOMA 2QJHA 1VHCA 4WY0B 4JY8A 2E77A 1EEPA 1IIHA 2DORA 4XWUA 1LBLA 2PCQA 3B04A 4MZYA 3EX2A 2QAPA 1UBSA 1W5PA 4UTMA 1AK5A 3KVMA 4Y8FA 1GT8A 1QPQA 1JJKA 2TMDA 1FWRA 1D3GA 1F2JA 1YLVA 1K8YA 1O5XA 1SW7A 2J6XA 4JTUA 3B05A 4GUIA 3TW6A 5HR6A 3E12A 4MIMA 1IXPA 1O4UA 3CTLA 3UPBA 1DBTA 4ADUA 1KTNA 4S2BA 3KXQA 4DBDA 3EX4A 3ZWTA 3FYPA 4JTGA 1O94A 1EB3A 1G67A 1BWLA 5HR7A 1YTEA 5E1QA 2Y7DA 1W5NA 2QCEA 2ALDA 1BEUA 1M7PA 2O7QA 3TDFA 1PV8A 2Y85A 4FXRA 3OVQA 3FLUA 3IGUA 3L5MA 4IMEA 1P4CA 3P81A 2EF9A 4IX2A 3LB0A 4UMAA 1K8XA 4HNTA 3W7NA 2PC4A 3G1AA 1RQBA 2NZLA 5C54A 1VH7A 2R91A 4BR1A 2O7SA 3CIXA 4O13A 4EVZA 2CW6A 3FJLA 3LDVA 4MVAA 4P2VA 3I68A 6ALDA 3UXAA 1LOLA 1LRQA 2JGYA 4HSNA 1QPOA 3GAKA 1H7RA 3V75A 1ADOA 1QDSA 4CCEA 1U5JA 4KWWA 4NJIA 1A5CA 1T8XA 1B3OA 2Y89A 3CPRA 2YFNA 3GDRA 4UTWA 2NWRA 1JRBA 1Z41A 3N9SA 2A1YA 2CFFA 4FF7A 1EP2A 1AL7A 3HGRA 4DPQA 4LWWA 2J27A 2OMAA 2A7NA 4MYXA 3YPIA 3B0PA 2J24A 3M9YA 2CZDA 5LNWA 1JRCA 2QDGA 1VQTA 1HL2A 1NSJA 2RKXA 3PUEA 1QR7A 1ZENA 2A4AA 4WXZA 1FCQA 1YDVA 5C55A 1KFJA 3C2VA 1IXNA 1GOXA 1J2WA 2WJZA 1OK4A 2F84A 3FJ6A 1SO4A 4IPIA 3SIZA 4UTTA 3UPWA 2PE4A 4QISA 4O0KA 3P5ZA 2TPSA 2GVLA 1TCDA 3W7QA 1YTDA 4QNEA 2NWSA 5U7SA 1OFRA 4E38A 1C29A 1JCXA 3IIOA 1QO5A 1YDOA 2HS6A 4FIRA 1QWGA 1LYXA 3AO0A 1TPUA 3PBVA 4N4QA 3CT7A 3FFSA 8TIMA 1W1ZA 2DJXA 2X30A 3WJWA 4YCOA 3W75A 3I7RA 1G7VA 1VYSX 3SGUA 5LHFA 3C61A 2Z6JA 2E6YA 2C1HA 3SFKA 1WYIA 3CWNA 1GJPA 3LV6A 3LBCA 1XDLA 3G1HA 1RQEA 1DVJA 1NF7A 1ONRA 1DKWA 5CZSA 1LLWA 1ZAJA 2A7RA 1EP1A 1H7XA 3ATYA 1ZHAA 1DQWA 4A2RA 3C52A 4JTHA 3LCFA 1KBIA 3W7IA 3LHWA 1XDMA 1TTIA 1V5XA 2H8XA 5F4SA 2AQWA 4N9CA 1PL9A 3G8RA 2QCGA 2DZTA 5G2IA 4AWTA 3EEGA 5E0KA 4MY8A 3ZWSA 3HBLA 5D32A 3DI1A 3QJAA 3W07A 3LXCA 5DXXA 5LGXA 3P61A 3O07A 3BGJA 3EWBX 4PA8A 2JBMA 5F4WA 4DF0A 5DLCA 4O11A 3PUDA 1ME8A 3Q2DA 3Q58A 1B4EA 1JUBA 3TIMA 3LHVA 3W9ZA 2Q8ZA 1LBMA 4JGDA 1W8SA 4MY1A 1SUXA 3R12A 4POCA 5AFDA 3RNDA 3CIWA 2WPBA 4M6VA 5AHMA 2WNQA 3HG3A 3KHJA 4ZMGA 2RDUA 4LUIA 3W7PA 2HMCA 1GVOA 3DENA 3P82A 2H90A 4KWVA 2BLEA 4QQ3A 3R5EA 4XTDA 4QJ1A 2E6AA 3OG3A 1OF8A 2XFWA 1SO5A 1J5TA 2WSYA 3GVGA 4OU1A 5CPLA 1TV8A 1X8FA 3G18A 3FKRA 3M1ZA 1UB3A 2CWNA 3IIPA 3LHYA 5AC8A 3OBKA 3IGSA 3SR7A 3ATZA 4DBEA 3V1PA 4RZ4A 3ZFHA 3DFQA 2FPYA 4YXGA 4BK9A 1L6WA 5HUPA 3G24A 4CQ9A 3QSRA 3VKJA 3CB8A 2OT0A 1LRTA 1MEWA 2ZTJA 4K38A 3ABOA 3LI0A 3F4WA 5CPOA 5K4XA 3KOFA 4GXMA 3W2NA 3M47A 2CLMA 1C8VA 4N02A 3N19B 4ORIA 4QITA 1VGAA 5FEPA 4LRTA 2ABBA 3A21A 3LTSA 3UWZA 2GQ8A 3NYZA 4IGHA 2PRMA 4GNJA 3DFPA 2QDHA 4O18A 1SO6A 5K9CA 5I3KA 1RVGA 6TIMA 2FDSA 4N6FA 1FWTA 5F2MA 1OYAA 3NM3A 2TYSA 4UTLA 4IMDA 1H62A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3QFW A;  3SAZ A;  1C9D A;  5FAC A;  4AD1 A;  3BGG A;  5B7Y A;  2J88 A;  3A9I A;  4LVF A;  2FZB A;  4ML9 A;  1VCV A;  2PDM A;  3SCQ A;  4GI8 A;  4AYS A;  2NX1 A;  4ALD A;  4PZV A;  2ZRU A;  4F2T A;  1AW2 A;  1HO4 A;  1H50 A;  1XCW A;  2YDA A;  3QFE A;  3UJF A;  4CQ8 A;  3G1D A;  4ZTY A;  1CNV A;  3DEC A;  1KFW A;  4DJD C;  3MMT A;  5H8U A;  5K3V A;  2D1Z A;  2BBF A;  1UWT A;  3O7U A;  1WO2 A;  2YW4 A;  3ME3 A;  3W81 A;  1GZJ A;  2W92 A;  2PP0 A;  5HMD A;  4Y9A A;  4F48 A;  5A6B D;  3S0C A;  3W37 A;  3FEQ A;  1M6J A;  2C16 A;  3DGR A;  3EA3 A;  4EKJ A;  2CLH A;  4L64 A;  2PDN A;  4LF2 A;  1DJY A;  4ML4 A;  1VFS A;  2A2I A;  1Q13 A;  5LYR A;  4DNM A;  3MHF A;  2J7G A;  3AZS A;  1VLW A;  4IQL A;  4D6I A;  3LHT A;  1JF5 A;  2J7B A;  2VQU A;  3PZ9 A;  3UF9 A;  5IM5 1;  2QGY A;  5REQ B;  3PJW A;  1AQF A;  4U28 A;  1W3L A;  2VEI A;  1EP3 A;  1KO0 A;  3IJL A;  5DO8 A;  2P10 A;  2HE8 A;  5C9U A;  1PKL A;  1Q6G A;  2Q3O A;  1VFL A;  3FGC B;  2W63 A;  1H7P A;  3H53 A;  5CXP A;  1U5H A;  1Q6E A;  3BH4 A; 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