3PWAA

Structure of c126a mutant of plasmodium falciparum triosephosphate isomerase
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
246
structure length
246
Chain Sequence
RKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYTGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHFERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVAFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIGTGKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Probing the role of the fully conserved Cys126 in triosephosphate isomerase by site-specific mutagenesis--distal effects on dimer stability.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 87
structure length 246
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2010-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3pwaA00
4QIUA 5EMUA 3VNDA 5LGXA 3RLUA 4LS1A 1VS1A 5HQEA 1TSIA 1QCWA 5AYZA 3NQ8A 1W1ZA 2J9XA 2TPSA 2G95A 2O7QA 1KM4A 4Y8FA 4X3ZA 5D2VA 4NUWA 4JIPA 3MBFA 2D73A 3TH6A 1TRIA 3UPWA 4AB4A 3UY7A 2LLEA 1AL7A 4CCCA 3BV4A 5U4NA 2E5CA 3HGJA 1KFBA 2BTMA 3W1LA 3W6YA 4GFSA 4OHQA 5TIMA 5IBXA 4YWIA 4LVFA 1PCKA 4XKYB 1UBSA 4DO4A 4LT9A 1TTIA 3F1QA 4MY9A 3MYOA 3UY8A 1GTHA 3O6CA 2R91A 5DLCA 3W7PA 3O63A 1SW0A 4TX9A 5CPMA 2Y7GA 2WQPA 3GIYA 3NNTA 3NPVA 3SGZA 4UXDA 5I3GA 1SO3A 4Z1AA 4H4IA 4K6AA 3YPIA 1G4TA 2WJZA 2H8ZA 3BLEA 1SUXA 1HG3A 1OF8A 1DOSA 3A21A 1PV8A 3W7RA 5AHMA 2H6RA 3NQFA 1XI3A 1XC4A 3GKFA 3E02A 1ME7A 1WBJA 2E6FA 1VRDA 1G7UA 3LHZA 4LS0A 4GUIA 2DZXA 4JTIA 1FWWA 5BOOA 2V2DA 4TMCA 4UTMA 1TPEA 1YXYA 3G24A 1VR6A 2Y7DA 1OFDA 3M9YA 2NV2A 1DORA 4UFKA 5KZDA 1I2NA 1DHPA 1YADA 3M6YA 4O12A 3M47A 3GXTA 4D2JA 1TTPA 1LZOA 3EX6A 3W7QA 3W7DA 1O5XA 3B0UX 1SPQA 3FIGA 3AJXA 2QCDA 1GG0A 4A2RA 4IMGA 4XQ6A 2P0OA 1QR7A 1T96A 2BSLA 3W84A 1Q6OA 1KTBA 1W5QA 3O06A 2YFOA 1OK4A 5AHNA 2NXIA 4I9AA 3UWVA 3TUUA 3W9ZA 1KFKA 3KVLA 2J6XA 2HSAA 2CW6A 4N02A 4GE8A 3NDOA 4ONVA 1WAUA 4L4LA 1AG1O 3MI3A 3G22A 3G3MA 4JS3A 4R7JA 3G0XA 5KSWA 3PAJA 4FXSA 3SR7A 2GOUA 3R5EA 5FF3A 2ISWA 3BG9A 2Q8LA 5CPOA 3DI1A 4ORIA 4AHQA 2VEKA 4IX0A 4IXXA 2WSYA 4NNCA 3I7QA 1NSJA 5HJLA 1UASA 5K4XA 3MW7A 2OT0A 3STFA 3TSMA 4N9BA 4O0ZA 2A5HA 3DFQA 1YYAA 4PFMA 3NQDA 4GWEA 4HSOA 4U4MA 4BK9A 2H90A 2QCNA 3NL3A 3L5AA 1YLVA 2I14A 5HWMA 4IXHA 1ME9A 4O53A 1VLIA 5HR6A 2ZRYA 3DXIA 3C4UA 4NNAA 1TO3A 4RV8A 3V75A 4JTLA 4QSHA 2JKAA 2KZHA 5ABTA 5DBUA 4O18A 2Y88A 2QAPA 3B0VC 3QPZA 5LHFA 3NL2A 3LDVA 1Q6RA 4EVZA 3PUDA 3W7HA 4FB7A 1DJNA 1FBAA 1TTQA 5D37A 2E6YA 2Z1BA 3B06A 3W88A 2BLEA 5F4XA 3S1VA 3W7GA 1KV5A 3GZ3A 4GUGA 4ALDA 4JX6A 2R8WA 2A6NA 4Z08A 1H7NA 3O6DA 3E0IA 4UTWA 3W1NA 3MI6A 1TPH1 3EWXA 3INPA 4NZFA 3GDRA 1EPXA 1SO6A 3P81A 2IQTA 1W5NA 1OX5A 4M7SA 2FPVA 1M6JA 4MY1A 5FF4A 1VLWA 2RDWA 3UNDA 1VGAA 4DPQA 3G1SA 4RCXA 1SZEA 1WXJA 3MP4A 3C2OA 2E5DA 4AWSA 1HL2A 3TC7A 2PCQA 1XFBA 3BW4A 2EHHA 3I7SA 5GVJA 3T44A 5EBUA 1YTDA 5LKYA 3QSTA 5FEZA 2C13A 1OFPA 3TW7A 5LSMA 1G4EA 5T26A 3LRMA 3W7IA 1O5KA 3I7RA 3UZ5A 3N3MA 1XBYA 2FLIA 3P74A 2EAWA 3KRUA 2DZVA 1ME8A 4HPJA 3GDMA 1THFD 2VFIA 2V5BA 3KOFA 2YGYA 3W7KA 3TMLA 1UB3A 5AC7A 1OFAA 2C18A 3HBLA 4POCA 2B7QA 2QCHA 3M5VA 5A8GA 3W7MA 3DFNA 1W5MA 2QCFA 1SW3A 5HUPA 3TX9A 3ZWTA 1QPNA 1X1ZA 3TDFA 3QMRA 3U8GA 3W07A 3ABQA 3UWWA 3TQ0A 1MEHA 4X2RA 1NFBA 1YDOA 2GJLA 3P84A 1G7VA 1FXPA 1L6YA 3TIMA 2ZZ4A 5AFDA 1LROA 3M5XA 1XXXA 1IIHA 3G1DA 1RZMA 4UNLA 4K8HA 4LVAA 2H3DA 4UTIA 2CWNA 1W0MA 3O6YX 2ATSA 4E2DA 5I3FA 1M5WA 1VYRA 3EWYA 4PC8A 4UTKA 4NJGA 1OG0A 4HHPA 5F1UA 3TFCA 1Y0EA 2CLKA 1KV8A 4A21A 1G4SA 5I3JA 1VC4A 4QNEA 3DH7A 1VHNA 3IVUA 3TSDA 2ZYFA 3GKAA 3S5ZA 2ZZ3A 1H7OA 1LBMA 2WKJA 3IGUA 1VCFA 1JR1A 1LCOA 5DY3A 4XBKA 2W0UA 5EL1A 3IIVA 5CZTA 3CEPA 5KZEA 3PB0A 1GTEA 3TAOA 4MYXA 1TQXA 3S5NA 5IBXC 2XN2A 2RHGA 1K02A 1QO2A 5C5YA 4K37A 3ZWSA 4PA8A 3I68A 1GVOA 3LB0A 3HG3A 2A21A 2WNNA 2UV8G 3H53A 5DCEA 3G1AA 3VCRA 1LLWA 1DQXA 5TQLA 1F76A 1VQTA 1TMHA 3BG5A 4JR5A 1K8XA 1WBHA 1QPRA 3IRDA 3L0NA 2QUUA 3SW6A 3NAVA 4MYAA 4S1FA 3MBDA 1MSSA 1KW1A 4R53A 1OYAA 4KWVA 1LOSA 3L65A 4HNTA 3QRHA 2OZ0A 2QF7A 3MYPA 3NPWA 3OIXA 2CZ5A 5BW6A 5LNRA 4JIQA 3FLUA 3O07A 3C56A 3E49A 1VJIA 2GQ9A 1EA0A 3VKJA 3TROA 1LRNA 3KVKA 2VELA 1EUAA 1A53A 1YDNA 1NAL1 1QOPA 2HS6A 4B5NA 4DEFA 4RJEA 4N9EA 2JGYA 5D32A 1LYXA 2Q3OA 5FESA 1UCWA 1LRTA 1RQHA 1XBVA 5CZJA 4IMCA 3M41A 4TMBA 1W5OA 3LHTA 4CNPA 2FB3A 2PURA 2NUXA 3CHVA 1LM1A 5G1TA 3MO7A 3JRKA 1K7FA 3UXDA 2G97A 5CG7A 2ZZ7A 3DFSA 3EWZA 3QJAA 2I9EA 5AC6A 3C8FA 4LS2A 3V1PA 4JTFA 3BW3A 2GVGA 2WV8A 1SR9A 3LOTA 4FNQA 1G69A 3M16A 5LNWA 1ZFJA 3NL6A 4CLMA 2W6RA 3C2FA 1OX6A 3OG3A 3PUEA 5D2YA 4FIRA 2QCLA 2G96A 4R34A 4XWUA 1SW7A 1TCDA 3OVQA 2YFNA 5CPLA 1VH7A 1ZAJA 3FKRA 3C3NA 2XFWA 5HMSA 1OYBA 2JK2A 3GNDA 3PBVA 2WNQA 4FX6M 2VFDA 3LHUA 3L67A 3OA3A 1I4NA 3HB9A 4JTSA 4EF9A 3LTPA 2A2IA 4E38A 3NQ7A 4UTJA 4PL2A 2QR6A 4N6FA 1FDZA 3EB2A 1F7BA 4QITA 4Q4KA 4UR8A 3W1UA 3HGOA 1PVNA 3G0UA 4JEQA 5F4SA 3QM3A 3T4CA 2AAMA 1TPUA 2Z6IA 1C8VA 3TA6A 4MLJA 3UYCA 4JYFA 3LXCA 3Q94A 4NX5A 4RX0A 3WK2A 2DJXA 2C16A 3G1HA 3LCWA 1JCNA 3IIPA 1EB3A 4MIMA 2V0TA 2ZZ5A 1IIGA 4HSNA 5E93A 2VEPA 2OMAA 4HNNA 3RU6A 1X7FA 1MO0A 1SFLA 3EXTA 2DZPA 3TNOA 1ZNNA 2X30A 3P60A 4HN4A 2ZRWA 3FJLA 3W85A 2GQAA 4UTTA 5G1YA 4LC8A 3G1XA 1TV7A 1JCMP 5D2TA 2A0NA 3CQ0A 1JCLA 4YXGA 1QAPA 1N7KA 3TKFA 1T0OA 1AL8A 4O4WA 1BTMA 4BI7A 1A5SA 5FF2A 4JTGA 4O17A 2BXVA 2TMDA 5LNSA 3FKKA 1H1YA 2NXHA 1HFBA 3LCGA 1S5TA 2F84A 1LOLA 3W7NA 3KX6A 2NUYA 1OHLA 3L66A 5G2IA 1W37A 1B57A 3EEGA 4TU1A 4S2BA 1P5BA 1TIMA 3BGJA 4GUHA 4FEZA 2VFGA 3HO8A 4IGHA 3B05A 2JKEA 3LM7A 2YYTA 3VE9A 2NLIA 2HMCA 4PCFA 1VCVA 4WY0B 5AC8A 3N9RA 5AHIA 1SU5A 3L9CA 4HNUA 1JCJA 2FQIA 3O1NA 1FWNA 2ZTKA 4TO8A 3QMTA 2CLEA 2J9YA 1QWGA 5E1QA 4CCEA 1XCFA 4QNWA 2E09A 1KM2A 2CZDA 2VC6A 4DQWA 4WY0F 3RF9A 4M6PA 3HPXA 1YTKA 4AF0B 4UTWC 2ZDRA 3DGRA 2ZA2A 3LHVA 5K9CA 3IV3A 3MHUA 4Y9AA 3THQA 2NXGA 2RKXA 1KLZA 4GUJA 2A7PA 2X16A 4FNTA 4GXMA 2ALDA 3BG3A 5D38A 1R30A 1IGSA 1M7OA 4WQ6A 4K38A 1FUYA 2XN1A 2V9DA 3LTSA 3WK1A 2JKPA 3CPRA 3EX4A 3WFAA 2Y6ZA 4GRSA 3NQAA 3LCLA 3QYQA 4LUIA 4DF2A 1ML1A 3ABRA 4LRTA 2V81A 3N14A 3NQGA 4MPQA 5D09A 3FFSA 4R33A 2YSWA 4H6KA 4I7WA 3UD6A 4ZVJA 4X9SA 1P0NA 2CLFA 3R12A 5HULA 6ALDA 3Q37A 3E96A 2CLOA 4BF9A 4IWWA 1O94A 1DVJA 1S5VA 5L9FA 2B7OA 1EWDA 3LTYA 4N6EA 5D2WA 3K30A 3WK3A 1K7EA 3W71A 3KVJA 1MEIA 1VCGA 3IVSA 1OVDA 3FEMA 3O16A 4BFAA 3W76A 1TPFA 4JGDA 4MKNA 1K7XA 4LV9A 4UTHA 2C6QA 5FEPA 5BRBA 5FF0A 4FHAA 4GBUA 1TRDA 3MHGA 2QDGA 4RXFA 5G4EA 3TXZA 3IGSA 2BX7A 1ZJIA 4LW7A 1QNVA 4C1KA 1PHQA 1MZHA 2Y61A 3RMJA 3QW4B 1A5CA 3MMTA 3G1FA 3DKJA 4WUIA 3LCFA 4ADTA 1KBIA 1GQNA 3R2GA 4I7UA 1J4EA 3SECA 2ZTJA 1OFRA 2ISVA 4JNMA 3AO0A 1HO4A 1P1XA 3SZ8A 1U5JA 1TTJA 2R14A 5D04C 4JX4A 2A4AA 3G1YA 5K3VA 4NNBA 3G18A 1QMLA 2B4GA 3N2XA 3RLVA 1K03A 2EKCA 4JD4A 2FB2A 5KZMA 1XDLA 4ML9A 2Y7FA 3ZFHA 1OFOA 1FWSA 3BLIA 2GVJA 4IMEA 3O8AA 3S1XA 1SO4A 3GDKA 4ICNA 4O8RA 2RDTA 2Y89A 3PM6A 1YDVA 2ZCGA 3QFEA 1LDCA 4UTUA 4IX2A 3IIOA 2YCEA 1H5YA 1K3UA 4CCDA 3UWQA 4NJHA 1ICQA 4BI6A 4HPXA 4O19A 3MI2A 3UWUA 4NU7A 1YXCA 4LV4A 3S6DA 4NVTA 1ALDA 2A6LA 2WPBA 4ZQNA 2ZRVA 1YPFA 1BWLA 4XKYA 3L5LA 1EX5A 4ZL1A 1SZFA 2CFFA 7TIMA 4QM1A 3FA5A 4JDBA 4WY0A 1X1OA 3M43A 3KAOA 5CSRA 3PG8A 4UMBA 1AW1A 1I8JA 1GT8A 2BWGA 3MHFA 4M19A 1CI1A 4MLRA 3OHIA 4NJIA 1SQ7A 3SIZA 4NQ1A 1FWTA 2I1OA 3STEA 3H54A 3KRZA 5G2WA 2A7NA 1JJKA 5D03A 3B04A 4U28A 1QDSA 4HT3A 4MZ8A 3GYEA 4OV4A 3CIXA 1W3NA 3UXAA 1AW5A 2A7RA 4CNNA 2Z0IA 4O52A 2E68A 1RV8A 1TPDA 3BK0A 2Y7EA 1OX4B 4WOQA 4NJKA 4NZJA 3QZEA 2Y85A 3ABSA 3UZJA 2ZZ2A 1S5WA 1WQ5A 2AQWA 3DENA 3F03K 4IPJA 1DL3A 2QUVA 3NZRA 1AMKA 1S3HA 5FI8A 1WYIA 1OK6A 4ZQMA 1RQBA 1EIXA 1FDJA 1SSGA 4JY8A 1T8XA 1ADOA 4AWUA 4KFNA 4JN6A 3QPYA 3G3DA 4JX5A 1IF2A 3P8JA 2H8XA 1RPXA 3U6WA 1EEPA 3NEVA 1IXNA 4YCOA 2RDUA 4UFIA 1OFQA 3L2IA 3HOJA 3R8RA 1AK5A 3FYPA 4ORMA 1N8FA 4YL2A 3W3OA 1WV2A 3CEUA 3P82A 3EWWA 3QSRA 1BWKA 2ISSA 5H91A 5C2XA 1H7XA 2HS8A 1Q45A 3L0GA 4DO5A 5EYWA 3VFLA 3A24A 1OYCA 4FXRA 4S2CA 3G8EA 3R89A 1W3IA 3SY5A 3PY2A 5BMXA 2ZRZA 4JTJA 5AHFA 4NXKA 5LNUA 1F73A 1YPIA 2QUTA 4Z1CA 1ZALA 3TJXA 1TPWA 4UTTC 5DXYA 2TSYA 5CZSA 5DN1A 3WK0A 2Q3RA 1YXDA 1GVRA 1JRBA 3LRLA 1KTNA 3C61A 4NX0A 5LHEA 3UWYA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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