3PY2A

Structure of c126s mutant of plasmodium falciparum triosephosphate isomerase
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
246
structure length
246
Chain Sequence
RKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYTGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHFERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVSFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIGTGKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Probing the role of the fully conserved Cys126 in triosephosphate isomerase by site-specific mutagenesis--distal effects on dimer stability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 95
structure length 246
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2010-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3py2A00
5L9FA 3IIZA 2A4AA 3A23A 2XN1A 4TIMA 6ALDA 1N8FA 3W1RA 4OV4A 1I8JA 1DQWA 2BLEA 4HNUA 4E2BA 1W3TA 2J27A 3O15A 3GNDA 4MPQA 3CU2A 1B4EA 4UTUA 5LGXA 1LDCA 3TUUA 4WY0B 1AL8A 4AMAA 4LWWA 4JTJA 4Y9AA 4PH6A 1IXPA 4WXYA 2V81A 3W1MA 1EB3A 5CPOA 2YFNA 1TTJA 3W2UA 2Y7EA 2YZRA 4RZ4A 2DJLA 2B4GA 2GJNA 4YXGA 2DZUA 3T55A 4XQ6A 3RU6A 5ABTA 3PG9A 1FWWA 4UR8A 3NQ6A 1FBAA 1IIGA 3G3DA 1OYAA 2FIQA 2HMCA 3LTPA 4M7TA 1OK6A 2QCLA 2YW4A 3VFLA 4UFJA 1EP2A 3W1UA 3W7NA 4A3UA 5HWJA 4JD4A 1S5WA 1GVOA 2WNZA 3USBA 3UZ5A 3S0CA 4HPJA 3GDKA 1PVNA 4CCCA 3W75A 3HPZA 3TXVA 1G4EA 1Z44A 3BW2A 3BG5A 1N55A 3WK0A 1EIXA 3O1NA 1FXQA 3OG3A 2C13A 1WA3A 1XUZA 1VQTA 1FWRA 3OVPA 5H2ZA 2VFFA 4PTNA 2TPSA 3NQMA 4O1BA 3VCRA 3ZS4A 1YYAA 5DXXA 3LCGA 4Z1BA 2TMDA 2H8XA 3DXIA 2CLEA 4KWWA 1F2JA 1WXJA 4OWGA 3PWAA 2I14A 3GVGA 3M1ZA 1KM4A 1W31A 5D2TA 1W56A 1OYCA 4O17A 2FFCA 5E1QA 2V30A 4JX4A 1NF0A 4JIPA 2CLLA 3BG3A 4GRSA 4HSNA 1JQVA 5DCEA 1FWSA 2ZBTA 2GVLA 2FB3A 2X2GA 4DF0A 4YCOA 1K02A 4YLWA 3SW6A 4N6EA 4OGZA 3W87A 2V2HA 2ISSA 4UCGA 3TNOA 1VCVA 4FHAA 3TK7A 4DXVA 2ZZ5A 1W5MA 2Z6IA 4AVFA 2Y88A 4H4IA 3LHVA 3G1FA 3M6YA 4C1LA 3W70A 3B0PA 1X8FA 1FDZA 3W7DA 2YCEA 5IM51 3S1WA 4RR4A 3EXSA 3NQGA 3TAOA 5D33A 5CKSA 5F2GA 3W9ZA 4E0CA 3QH2A 3CIWA 1PIIA 2IQTA 2FQIA 1FX6A 4NUWA 3W22A 1A5CA 2JKAA 3QQ0A 4O50A 4XUGA 1V7YA 2CWNA 2X16A 3TR2A 5D05A 3TW7A 3DBPA 5C6MA 2E68A 2NX1A 3IVSA 2ZZ1A 4FIQA 1NSJA 4I7WA 1H60A 4FO4A 1KV5A 3A5VA 5LNRA 4ADSA 3Q2DA 1QPOA 5FEWA 4XZ9A 3NZ1A 1Q6LA 3RF9A 3EEGA 1I2NA 4NVTA 4O52A 1PHQA 2V0TA 1I2QA 1H1YA 3D0CA 4R7JA 4UFIA 4LRSA 3C3NA 3FEMA 1G4SA 1F05A 4O16A 1YADA 1H63A 1WOBA 3UD6A 3W2JA 2QDGA 5FESA 2E6AA 2UV8G 1LP6A 4IX2A 4JR5A 2TYSA 2ZZ7A 4DO6A 2E1DA 4B5NA 3QW4B 1UASA 3V1PA 5EMUA 2F7FA 3RLVA 3TMQA 4XKYA 3UWUA 4RXFA 1FUYA 1O5KA 3QJAA 5E0KA 4UTMA 4JTIA 3KXQA 2ZA3A 3M5VA 3N3MA 1DVJA 1TV5A 5BW6A 4O4WA 1VZWA 5KSWA 1OFDA 1SZFA 2OT0A 5CZJA 4IMCA 1KTNA 5AYXA 4LU0A 1R47A 1VJIA 2A6LA 3CTLA 3W7IA 1DV7A 3IGUA 4EOUA 1R30A 3E12A 4Y8FA 2FDSA 2JGQA 1W37A 3TJXA 4QQ3A 1LZOA 3EWYA 1TB3A 4IOTA 3T4CA 3N9RA 3B05A 2EF9A 2Q8ZA 1Q3NA 2WSRA 5LNWA 5DY2A 3W74A 4HIBA 3W7KA 3M47A 4UMAA 3IVUA 3N73A 1XKYA 1X1OA 3STFA 1N7KA 4RLIA 5D38A 1XDMA 5AC6A 3BGJA 3SFKA 3OEXA 2GOUA 3DKLA 2Y7GA 1U5JA 4G1KA 1HTIA 4O19A 3E0IA 3RK8A 1JCYA 1GTHA 4K7YA 3LV6A 3DHDA 1ZENA 2NXGA 3O16A 2OMAA 3FKKA 3WK3A 2A7PA 5EYWA 1EWDA 4M6QA 5CSSA 1TPDA 3TE9A 3W3OA 3LLFA 4NZJA 3LTSA 3SGZA 2OX1A 2EAWA 1K8YA 1KTBA 3W2KA 4YCPA 3R5EA 1ICQA 1YPFA 1HL2A 3FYOA 3UWWA 1H7WA 4K6AA 4TX9A 3JRKA 5BNKA 1D3GA 2FB2A 4DPPA 4IUOA 4ALDA 5LHFA 1VYSX 1PCWA 2D73A 1H5YA 3ZWSA 1NF7A 1L6YA 4WJEA 2CZEA 4DBEA 3INPA 1WQ5A 3G1AA 4WQ6A 2NV2A 2GVJA 1S3HA 3WFAA 1BWKA 4XKYB 3PUOA 5FI8A 1T0OA 3BGGA 3G18A 3OVRA 3L68A 3T40A 2CZ5A 3QMTA 2HTMA 3IIXA 4TR9A 1I45A 1LBMA 1T96A 1J5TA 2E5DA 3LCHA 2J9YA 5IBXA 5CGQA 3TFXA 4ADUA 2QUUA 2QEZA 2AGKA 3S5ZA 2ZRUA 4QNEA 3BG9A 5TQLA 2Q8LA 1LRTA 2C1HA 1JCLA 5EL1A 5F2IA 3TROA 5K4XA 2NWRA 4JTKA 4E2DA 3EX1A 5F2MA 4BK9A 4YMZA 1KTCA 1I2PA 1S5VA 2B7NA 3PVFA 3TCEA 1WAUA 4O0KA 3EXTA 2VEIA 3MP4A 4Z0JA 3S6DA 4QIUA 2X30A 3MHUA 5K4ZA 2ZRYA 3W1TA 1MEHA 4BI5A 1ME8A 3M5XA 3VKJA 1G67A 2YW3A 2Q3RA 2DP3A 3QPYA 3RMJA 3GKFA 4CQAA 5D2VA 1KFKA 4RX0A 3UXDA 1DQXA 2PURA 3A22A 1AK5A 3LI0A 3PF3A 3GNNA 1VRDA 5SWUA 1NFBA 1LLZA 1QPQA 1ICPA 3BK0A 3DFOA 1P0NA 2E5BA 4O14A 5D37A 2GPTA 1DJNA 4IXXA 1XBXA 3S1UA 4ZZ9A 3HPXA 3LBMA 4GUGA 3NL6A 2NV1A 3SSJA 4NX0A 3PBUA 2R94A 3PY2A 1OX6A 4OE7A 1DL3A 4UFHA 1RR2A 3GDMA 2KZHA 3BPWA 2WO5A 1ICSA 5G1YA 4MIMA 1GEQA 3CQ0A 2PE4A 1ZAJA 2HSAA 4BWLA 4XBKA 3R8RA 1VYPX 1EP1A 2WKJA 1K7EA 2J9XA 2ATSA 4EF8A 5CPLA 1A50A 1G4TA 5IBXC 1TPEA 2FJKA 4O54A 4Z1AA 5BRBA 3WJYA 1LORA 2A1YA 4UTTC 2GQAA 5D04C 1DORA 1DOSA 1QOQA 1RPXA 2BXVA 3W7PA 3HG3A 2GVGA 1SU5A 3LXAA 1TPC1 3PM6A 4N2YA 3C4UA 1DBTA 1YXDA 5TIMA 1QO2A 3SIZA 4AHPA 1SZNA 2VELA 1A5AA 5FEZA 5I3FA 3MI6A 4M7SA 2F84A 1W3IA 4ZQNA 4N9CA 4OV9A 1GWJA 1TPFA 3T7VA 2LLEA 4GBUA 2V9DA 4PCFA 5D32A 1LOSA 1VPXA 4GUJA 4FNPA 1XBYA 4LRTA 5DY3A 1ZFJA 1JUEA 2QCDA 1CW2A 4NNBA 2Q3OA 4TMBA 1W5PA 1IXQA 4LVGA 3O8AA 5DBTA 3W7CA 3UZJA 2QCNA 2C0AA 3GX9A 2QJHA 4L4MA 5AYZA 3W2NA 4IMGA 4IQLA 1FDJA 1FCQA 3LXCA 4BWLC 3TQKA 3LBCA 1OABA 4BF9A 2JKPA 3LCFA 4K8HA 3S1XA 5HUPA 4JY8A 3LXBA 4GJ1A 4AHQA 2QCHA 2ZDRA 4LVBA 4LUIA 1JRCA 3CEUA 1PHWA 2QCMA 1R2SA 1QNVA 2VFEA 1JVNA 4LW7A 5F1VA 2DJXA 2RH9A 3NNTA 2DZTA 4FNTA 1H62A 3FOKA 2CLFA 4X2RA 3WJXA 4A22A 2VOMA 3HJZA 3N34A 4JYDA 3W7JA 3T44A 3KFTA 1VR6A 1TCDA 1MSSA 4LC8A 3KOFA 4GFSA 2YXGA 3K30A 3P60A 3LHYA 5D03A 4JTFA 3QRHA 1SFLA 2XFWA 2YYUA 1Z41A 5G5IA 1QPNA 2ISWA 3ABRA 3ATZA 4MKNA 1CI1A 2C15A 3N19B 3C2EA 1L9WA 2ZZ3A 3W7QA 2P1FA 3NYZA 5BMWA 1XC4A 3ELFA 1L2UA 5G4WA 4CNPA 3P82A 4ZQRA 4IPIA 1SR9A 2QDHA 3CB8A 1SZGA 2R14A 1W5OA 1SW3A 2QJGA 2J6XA 1GVFA 3P5ZA 3L66A 2E77A 4LC6A 1IXNA 4FF7A 1SO6A 3RFAA 1LOLA 4NJHA 3DFNA 3UY8A 1A5BA 2RDUA 3W76A 1CX9A 1TYGA 1GJPA 1GVQA 2QCDB 3O6CA 3STEA 2ALDA 3IGSA 3MYOA 1HUVA 4AWSA 4KWVA 3C56A 4WZHA 1IF2A 4RKAA 1YDOA 1SUXA 3KRZA 4H3DA 4OBTA 4QNWA 2Y61A 2G5WA 3IGXA 3LCXA 3M9YA 4N9BA 3BO9A 4HNTA 5D2WA 1RZMA 1SFJA 4JTEA 2X1RA 4CNOA 3O06A 3A5FA 4UTHA 1LOQA 1ZHAA 4IX0A 4JICA 1JULA 3SECA 1R2RA 1VYRA 4UTJA 1FXPA 2JGYA 1RQHA 3ABSA 4N6FA 1X7FA 3AJXA 4PA8A 1YXYA 4JTLA 3NXFA 5I3IA 1VS1A 2PRHA 2V8ZA 1SQ7A 1WBHA 1AW5A 3UNDA 4MJMA 2JKEA 4IMFA 3LB0A 4IJBA 3P81A 3L0GA 1X6UA 3L65A 3SZ8A 1OVDA 4P61A 4A2SA 3MP3A 3G24A 1NEYA 3DI0A 5HR6A 3LHTA 2ZFAA 4I7VA 3F4WA 4ZMGA 3HB9A 4JY9A 3NDOA 4MLJA 4LTSA 3L0KA 3PUDA 3LDVA 4K8EA 4I9AA 5CPNA 1L6WA 3LHUA 1J2WA 1WBJA 2GJLA 1TSIA 1H7XA 1SSDA 4LY8A 4A29A 5D2YA 3OBKA 1BKSA 1KBIA 4DO5A 5HNRA 1A5SA 2QKFA 2O7QA 2OCZA 3GYEA 3GR7A 3W1AA 4N4QA 3UWQA 1G4PA 4LS2A 4O1CA 5G1TA 5AFDA 2EHHA 2QCFA 4KKXA 1W5QA 4CLMA 3CT7A 1MEIA 5D09A 3MI2A 1K7XA 4RZ5A 4ML9A 3THQA 3U2OA 5F2LA 2QAPA 2C16A 4PC8A 3NGJA 5LNSA 3HGOA 3G3MA 3T78A 3M5YA 3NQDA 1SZEA 3GR8A 1H61A 2ZZ6A 1TO3A 3G8RA 1YTDA 4MZ1A 4POCA 1W1ZA 1BTMA 3OIXA 1AMKA 5AHLA 4HSOA 3F1QA 5FF4A 5DXYA 5AN7A 4AWUA 5EKYA 3IV3A 3L5LA 2H90A 1OHLA 2I9EA 3EXRA 5F4SA 5LHEA 3LOTA 3WJWA 2BZNA 1W54A 1TTPA 4ZQPA 3BLIA 3S9YA 1RV8A 1OX5A 1QO5A 2VFDA 3QSRA 5TBOA 5FF7A 1C9DA 4ONVA 4EF9A 1WYIA 3KVLA 2E6YA 1TPH1 1DKWA 5I3HA 4E38A 1VLWA 1EX5A 3NL3A 1RQBA 3QSTA 1FCBA 5HJLA 1SO5A 4K36A 3P62A 1UCWA 4MYAA 1GVSA 1WOAA 1R2TA 1OF6A 3LERA 1TMHA 2TSYA 3F4NA 4FNUA 2CU0A 5AYYA 3BW3A 4FB7A 2X1SA 1WV2A 3RNDA 4BI7A 3PBVA 1Q45A 4WD0A 2RHGA 4A2RA 5LNVA 5LKYA 1KM6A 3CLMA 1XCFA 1FWNA 2ISVA 4Y90A 1M7OA 5AC8A 3TAKA 3SR7A 1B4KA 4HT3A 5C55A 4GUIA 3NQFA 1Q6QA 3G22A 1GG0A 2E09A 3C61A 3P67A 4MJZA 4L4LA 4UTWA 2CZDA 3LHZA 4JTTA 3PC0A 3H55A 3EKZA 3UY7A 4UTKA 2B7QA 4H6KA 3C2OA 4NXKA 3DFSA 3W84A 1LYXA 1XXXA 2C6QA 4CCEA 4ADTA 3PBWA 3QEZA 4MUZA 1G69A 4YL2A 4Z1DA 3P7YA 3KVMA 1YDVA 3I68A 1OFAA 3S5NA 4ZQOA 2ATMA 3GZ3A 5FEPA 1KLZA 3DFQA 2QAFA 4K38A 2DZXA 3CPRA 4JYEA 3OHIA 3AO0A 1KW1A 1K3UA 2WPBA 3G1HA 2XN0A 3B06A 1HO1A 1EEPA 3EX3A 2RDTA 5J5RA 1FCVA 1RQEA 4GE8A 3W2LA 5KINA 4N9DA 3MHGA 5AHNA 2NZLA 5KZEA 4IMEA 3HGSA 2ZRVA 1AW2A 5LZLA 3HGRA 5F1UA 1HO4A 1SO4A 1Z48A 3GKAA 1MO0A 3NZRA 1GZGA 4ZL1A 2G96A 1OFQA 1XL9A 1XDLA 4ZVJA 1ALDA 5I3KA 3P5YA 3W7OA 4TMCA 4O57A 4W9TA 2BSLA 5HULA 5CZSA 3QMRA 3TQ0A 1TTIA 4KFNA 4RK8A 4UTWC 1JQXA 4GWEA 3UXAA 1UB3A 1T99A 1KFEA 3MMTA 3O07A 3G1YA 1THFD 5I3JA 4MY1A 3KRSA 3B04A 1W0MA 3DH7A 3C0JA 4Z1CA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3AS2 A;  3IIZ A;  2EEX A;  4TIM A;  4HD5 A;  6ALD A;  1XF0 A;  5FJR A;  5HQM A;  4OV4 A;  1POK A;  2Z1X A;  2W5F A;  4CN1 A;  1LQ0 A;  4H6R A;  3O15 A;  1JPI A;  4UTU A;  4HPH A;  5LGX A;  7CGT A;  4QP0 A;  1TA3 B;  4A8I A;  1HGY A;  4AMA A;  4JTJ A;  4ZGY A;  4Y9A A;  4PH6 A;  1IXP A;  4YTR A;  4WXY A;  3W1M A;  3H2O A;  4PSP A;  3QV8 A;  1W1A 1;  4V33 A;  1DJZ A;  4XV0 A;  2B4G A;  5HDR A;  3T55 A;  1TV4 A;  1IIG A;  3DHU A;  2FIQ A;  3LTP A;  3WD4 A;  2QCL A;  3WH5 A;  1UKT A;  5M1T A;  4UFJ A;  4C6B A;  4ACZ B;  1PTA A;  3VOF A;  5GNX A;  3UXI A;  1WPC A;  3PK7 A;  2ZKM X;  3EWC A;  3PZM A;  4CCC A;  4B2D A;  3HPZ A;  3TON A;  3POH A;  1G4E A;  3BW2 A;  1N55 A;  4CNT A;  1TFV A;  1EIX A;  4Q6J A;  1O5R A;  1R38 A;  2VGI A;  2W92 A;  1VQT A;  2PI6 A;  2VFF A;  4XZH A;  1UR1 A;  1GCY A;  1GQI A;  2A3B A;  1XW8 A;  3ZS4 A;  3UT0 A;  4AMC A;  1FFR A;  2CLE A;  3I4E A;  5HQL A;  1F2J A;  1WXJ A;  1QI4 A;  1YMY A;  4OWG A;  2HVN A;  2I14 A;  3CAW A;  4HHL A;  3H2A A;  5D2T A;  1W56 A;  2WMK A; 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