3QEZA

Crystal structure of the mutant t159v,v182a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with the inhibitor bmp
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
MDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSVRPERLSRLREIIGQDSFLISPGAGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Conformational changes in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase: a structure-based explanation for how the 5'-phosphate group activates the enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus str. delta h
total genus 83
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2011-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3qezA00
3W1RA 1FY6A 3D0CA 3EX6A 1GVRA 3HOJA 4HIBA 2V2HA 1IF2A 4JD4A 4NZFA 4YL2A 3NL5A 5J5DA 5KINA 1R2RA 1KFCA 4FIQA 4MY9A 4Z1DA 2GUUA 4HNNA 4CQ8A 2GPTA 4UFLA 3NQ2A 3W7JA 1KM3A 2Q3RA 1JR1A 2J9XA 2VEMA 1YDNA 2OZ0A 2JKPA 3LCFA 4P2VA 3G1SA 1Z44A 3LHTA 3I68A 4OV9A 2QR6A 5D2XA 3KRSA 5AHIA 4DBEA 2RDWA 5GVJA 4YXGA 5F1UA 1VS1A 3KVKA 4JY9A 1KFEA 4UR8A 4FX8A 3O06A 5HR7A 3W7PA 2EHHA 2NUWA 1GJPA 3W9ZA 2FIQA 4MFEA 4NX5A 2QCNA 4KWVA 5LHEA 1KLYA 3H53A 3N9SA 3TDFA 3IIVA 4O19A 3PSWA 3M43A 1JQXA 4EF9A 5C6MA 3S0CA 4ALDA 1VJIA 3R89A 4O52A 1KBIA 2P0OA 2ZBTA 4LC6A 3T4CA 1WV2A 5EBUA 4AB4A 4JTGA 3CEPA 3EWXA 3L68A 3C61A 4M7SA 5DCEA 4OT7A 3GXTA 3W7NA 1SZGA 4H6KA 2ZZ5A 1GG1A 3P60A 2GVLA 5EYWA 2ZRVA 1TPH1 3B0VC 1JCYA 4FEZA 1ALDA 2ZRXA 4K6AA 4U4MA 3W72A 4YWIA 2DJXA 3F1QA 5CG7A 3EX3A 3HMJG 4M6VA 1DL3A 2FLIA 1S5VA 3LHUA 3W87A 1AL7A 1TREA 4GUIA 4YCPA 3WK0A 4LRSA 1I2OA 3GXPA 3CLMA 3W7GA 3RNDA 1XFBA 4MZ8A 2V8ZA 3MI6A 4Z1CA 2NWSA 2I14A 1JCLA 3GAYA 5D2TA 3QSTA 3TIMA 3HG4A 4PODA 3G24A 4O1BA 3S1VA 4A2SA 3VI2A 1W5QA 5E0KA 4MOZA 2V82A 5D38A 3PM6A 1Z48A 3UXDA 4XTDA 3B8DA 3NQ8A 1VHCA 3QQ0A 4CNOA 1NF0A 1M7PA 3FS2A 4C1KA 3OIXA 1I2PA 3QM3A 3BARA 4HN4A 1S5WA 3P84A 4WUIA 3TFXA 5K4XA 4L4LA 2QCEA 5D05A 1LDCA 4JX5A 4IJBA 2DZVA 2E5BA 4UCGA 4I7WA 1OFBA 2J27A 4NJKA 3TXVA 2Z1BA 1AW1A 1AL8A 4PH6A 4BI7A 4LRTA 3EXRA 3LHZA 5DELA 3TQKA 4WQ6A 2WKJA 1GZGA 3PB2A 5F2MA 3DKLA 1VCGA 4GJ1A 3WJZA 3GVGA 5HWNA 5AB3A 2GQ9A 2GJLA 5AYZA 5G5IA 3IGUA 4AMAA 3G0SA 3MHFA 2NV2A 3C4UA 1IIHA 2AAMA 4LUIA 3LHYA 3NQDA 2YZRA 3W7RA 2ZRZA 2A2IA 1ZFJA 1C29A 4LTSA 1I4NA 3VE7A 1TJPA 4RZ5A 2PC4A 3MI2A 3EWZA 4JTTA 4IOTA 5FEPA 2B7PA 5T26A 1N55A 2V5BA 4YMZA 4IWWA 3DFTA 1KV5A 1OFAA 3BLFA 1B3OA 4HNUA 4LS2A 1VRDA 3M5YA 3W1LA 1F7BA 2BZNA 1KM1A 5BOOA 1ME8A 4MVAA 3STGA 1VLIA 4R53A 2E6FA 1YPFA 4NZJA 3Q37A 4LY8A 1QMLA 5ABTA 5DY3A 2CWNA 3ATZA 3DU0A 1GTHA 3VFLA 3BGGA 3G0UA 3QW4B 3TMLA 1S3HA 2Y62A 1AW2A 2YCEA 1VYPX 2IQTA 5D30A 1TPEA 4Y90A 3BG5A 3PAJA 2X30A 4CNNA 4CCEA 3LBMA 5C5YA 3BGJA 4WXYA 4JTLA 1PE1A 3B0UX 3QSRA 3HG5A 1THFD 2CLIA 1Q45A 2FPTA 1BTMA 1EEPA 2GJNA 1OX5A 2H3DA 1F5ZA 3DFPA 2C6QA 3EB2A 1GPWA 2BTMA 1V5XA 1LRQA 1XBYA 4FXRA 3R13A 1IXOA 2GQAA 1DVJA 1EP2A 1H5YA 1ICSA 4RZ4A 2E1DA 3PUOA 3TCEA 3VNDA 2OJPA 4IPIA 5EPDA 2VFGA 2Y7GA 4DPQA 2PCQA 3FIGA 4U28A 1VCFA 1VYSX 1JJKA 4IX2A 2H90A 3S6DA 3I7QA 4EOUA 1Z42A 5HWMA 4NJGA 1SZFA 1VZWA 3UD6A 4UXDA 4WXZA 3LCWA 1K7EA 3L0KA 5G1TA 4UFMA 2W6RA 3DGRA 3SSJA 5K2ZA 3W23A 3HGOA 2QJGA 4LV9A 2A7PA 3W1MA 5KTLA 2TRSA 3NPUA 4UMBA 2Z2UA 2E6YA 3LXCA 2B7OA 3KXQA 1X1ZA 1EPXA 1LRNA 3TA6A 3R12A 1YDOA 2HS6A 1JUBA 3M9YA 4ZQNA 4NT0A 1YYAA 3O63A 4N6FA 2NX3A 3G22A 3ABSA 4QQ3A 1JRCA 5I3IA 4O0ZA 5FI8A 5CZJA 5AOUA 1S5TA 3CIWA 1G4SA 5E1QA 2J6XA 3GKAA 3HGSA 5C55A 4M6PA 1N8FA 1SZNA 3R8RA 1OK4A 1ZNNA 3H54A 3W7OA 2CZEA 4AWSA 3O1NA 3U8GA 1EWEA 3S5NA 4BFAA 1ZALA 5IM51 1T8XA 2WO5A 1SPQA 5F2LA 5LHFA 1E51A 2CW6A 3IIPA 1KM0A 3W71A 4ML9A 3LTSA 4JYEA 5G4EA 1P4CA 4NJJA 3B0PA 2Y7EA 3EWYA 3OVRA 4Q4KA 5HQEA 3NL2A 1ZJIA 1H7RA 3LXBA 4AH7A 3RLUA 4LVAA 3UZJA 2ZDRA 1OFPA 2GVGA 5DN1A 5L9FA 3GDLA 1QWGA 1JVNA 4JX6A 3W7EA 1ZCOA 3CWNA 3LLFA 3LRKA 3G1DA 1TQJA 1OFEA 2DZWA 2O7QA 1K3UA 3QJAA 3CB8A 4H4IA 1QO5A 4A29A 4RK8A 1F74A 3T78A 1FWTA 3NZRA 3N73A 3CU2A 3P62A 2KZHA 1EP1A 3P81A 3NNTA 3N19B 5CPNA 4Z0JA 3EX1A 2E5CA 4OBTA 3W2MA 1XM3A 2E6AA 1KA9F 5I3HA 2A0NA 4PCFA 3S42A 1PHQA 1O5KA 1D3GA 1JUEA 2GOUA 2WSQA 3W73A 2HS8A 3ANYA 3DFOA 4O18A 1RZMA 1A5AA 1PCWA 4OE7A 1GWJA 3GDMA 4GFSA 4UMCA 4RJEA 4N9EA 1YXDA 1X1OA 4MLJA 1FXPA 1KM6A 4AXKA 1KFJA 3A9IA 4GUFA 1MEIA 1IXQA 4N9DA 2A21A 3W7KA 4JYFA 1O94A 1GEQA 5CPOA 5LNVA 1A53A 3E49A 3OA3A 5AFDA 4R7JA 4AHOA 4UTTA 2RH9A 1VQTA 4K7VA 1BEUA 3WJYA 1O5XA 3FYOA 1RR2A 3GDKA 1H50A 1LOSA 3L9CA 3F4WA 3NQGA 4QM1A 3PR2A 3MP3A 5I3FA 3M6YA 3QFEA 3KVMA 3EWUA 2YSWA 5AN7A 3PBUA 3M5ZA 1G6CA 3FA5A 3EXTA 1EA0A 2YR1A 3G8RA 2CLMA 3GLCA 2F84A 4JTJA 3BPWA 1NEYA 3EX2A 1J4EA 4UTJA 3LI0A 3IV3A 4FF7A 4OWGA 1OYBA 1DQXA 1SW7A 2R94A 4UFHA 3TSDA 3E02A 2C16A 5HR6A 2EPHA 5C2XA 5MHBA 2BX7A 4RXFA 3L5LA 4NVTA 4MZ1A 3C3NA 1OF8A 3ABOA 5AC7A 3L65A 3EX4A 3FYPA 1OYAA 1JULA 2VKZG 3IEBA 3NPVA 3MBDA 1DJQA 3ZR4A 5IBXC 1FCVA 5FEXA 5D02A 1QO2A 3KX6A 5LNWA 2A1YA 2A7NA 2NXGA 4AF0B 1H7WA 1T96A 1X6UA 2CLOA 3P8JA 1Q6QA 1OG0A 3SGUA 1OHLA 2PURA 4UTLA 3AJXA 4ONVA 3AO0A 4QNEA 2CLFA 1LP6A 2DJLA 1SW3A 1TO3A 3UWVA 3NQVA 2ZTKA 3QF0A 2DZSA 4X3ZA 1R46A 3I6RA 2QEZA 4TR9A 4ZVJA 4NXKA 3NEVA 4O12A 1KTCA 4DO6A 4FNQA 3DBPA 3OVQA 3O07A 4ORIA 3JS3A 1KLZA 3FKRA 1KM5A 3BK0A 2DZXA 6ALDA 3W07A 1OK6A 2OMAA 4LUJA 5AC8A 2E68A 4DO4A 4QJ1A 2FB3A 4NX0A 1DBTA 3QZEA 4BR1A 4UTUA 4ZQMA 3DENA 1PL9A 5CSRA 4EWND 3A24A 4FNTA 4DELA 4JS3A 2G5WA 2DZTA 4O1DA 3BW3A 3TK7A 5KZMA 3TH6A 1VGAA 5DBUA 4AEOA 1LROA 5G2IA 4JTEA 4JTKA 3W76A 2ABBA 5CGQA 5BW6A 3GAKA 3DFNA 3M1ZA 3DHFA 5DBTA 3UWUA 3FFSA 1OFDA 3LCXA 1W3NA 4IX0A 3O8AA 4BF9A 1BKSA 3CEUA 3NGJA 2PRLA 3S5YA 3NQCA 8TIMA 3PSVA 4X2RA 3NL6A 3PBWA 4UFKA 4HNTA 3H55A 5DXXA 1U5JA 5EL1A 2ISWA 3TNOA 3TKFA 2C14A 2QCFA 2ZTJA 4RXGA 4JTHA 4NXSA 4O53A 2P10A 4R34A 3EXSA 3C2RA 3UWZA 3ZFHA 1TTQA 1HO1A 2XN2A 3DHDA 3KHJA 1YADA 3W1QA 4ZQRA 4UC5A 5BMWA 1RVGA 3NQMA 3MO7A 5D2WA 3DH7A 3G3MA 1FQ0A 3LCIA 1VYRA 2VFDA 1QAPA 3SZ8A 4YCOA 3N14A 5BRBA 1JCMP 1X7FA 4ZQPA 4E2BA 3LGEA 1JRBA 5LNRA 3IIXA 1EUAA 3CIXA 3W7LA 1IIGA 5G1YA 1H7PA 3M41A 2PE4A 4DF2A 3EWBX 3BO9A 4GXMA 4JTUA 1QNVA 2C3ZA 3QPYA 2QCGA 5TQLA 3G1FA 1Q3NA 1XBZA 3KVLA 2RDUA 1SW0A 1WOBA 4FNRA 1HG3A 1R2TA 2C0AA 3TC7A 2WJZA 4S1FA 2A7RA 3GDRA 4TMBA 3NPXA 5KITA 3P5YA 1ONRA 2QCHA 3MWAA 2E09A 1TB3A 5LKYA 3DI0A 3C2VA 1EB3A 4ZMGA 1U83A 3IIOA 1MSSA 4WX2A 2WSRA 1IXNA 2V30A 3OBKA 1I8JA 4UTTC 2BLEA 2WNNA 1G7VA 3W7MA 1SO4A 1KFBA 1F6PA 1B9BA 1J5TA 3VE9A 4K8HA 3PVFA 3BW4A 5F4WA 4JEQA 2QUVA 2JKEA 1DQWA 4O11A 3GK0A 3NL3A 1KTBA 4ICNA 3W7HA 2V0TA 4NNBA 4OU1A 4ZQCA 2QCLA 4A21A 3IGSA 1W5NA 2A6NA 1I45A 4K38A 3MMTA 2R8WA 3QPZA 2BXVA 3NOEA 3G18A 1AG1O 4LVDA 1X8FA 4NQ1A 1R2SA 3O05A 3L5AA 5CKSA 1LCOA 3PF3A 2YW3A 2QCMA 4GBUA 3E0IA 3G3DA 4Y96A 4LS0A 3THAA 2Y85A 4BI5A 4MIMA 2Y88A 1W5MA 3W6YA 1MZHA 1Q6RA 4O17A 1FXQA 1TIMA 2WPBA 3LBCA 2WSYA 1YTDA 5A8GA 3IRDA 1FCBA 1P0NA 4K36A 2EF9A 3CTLA 1H60A 1F05A 2QKFA 1F2JA 1H1YA 3P82A 2FPVA 3TE9A 4GUHA 1G4TA 1XBVA 3UY8A 4DF0A 1RQHA 4IXHA 1UBSA 2F7FA 3C2FA 3NR0A 3Q58A 1D9EA 1LBMA 2VXNA 1BWLA 2QCDA 1FDYA 4PA8A 4RX0A 3S8HA 1SO3A 3LTPA 1TTJA 3OG3A 4WY0F 3P80A 3MBFA 1W3IA 3LERA 2OX1A 3W7QA 2B0MA 1DKWA 1GVFA 3S9YA 4MYAA 1HO4A 3USBA 4LT9A 3W83A 2WNQA 4N4PA 3UYCA 3GX9A 2CZ5A 4XKYA 3HPXA 4N02A 5HWJA 1QPOA 3C56A 5K9XA 2JBMA 3MJYA 3PUDA 4QNWA 3MYOA 2ZZ6A 1CW2A 3C52A 3G0XA 3RU6A 3IVSA 3TQ0A 3YPIA 1P5BA 5LNSA 3LRMA 5LNUA 1QDSA 5I3JA 1OX6A 1SQ7A 3L0NA 4X9SA 3Q2DA 4HNVA 2B7QA 3HBLA 5A5WA 3U6WA 1UB3A 3LI1A 1OYCA 4HKPA 2ZZ1A 3TJXA 1TPUA 2Q8ZA 3OHIA 1L6YA 3FJLA 1TTIA 4HT3A 1TPFA 1OJXA 1B57A 2QUUA 5IBXA 4A2RA 2VENA 3E96A 3L21A 3B06A 3LM7A 5FF3A 3NVTA 3GIYA 4Y6GA 2DORA 3O6DA 4Y8FA 1TPWA 1PS9A 4DXVA 4R33A 1G4EA 4LOCA 4O14A 1OFRA 1GG0A 4TO8A 3T44A 4UTMA 3UZ5A 2CU0A 4Q32A 4S2CA 2QJIA 5EY5A 5HINA 4LW7A 1F76A 2EGZA 1DHPA 4UIOA 4MPQA 5C54A 2ZZ3A 2NUYA 3TFCA 2E6DA 5FF4A 3A5VA 3F4NA 4BWLC 5LGZA 5DLCA 1ZAIA 3DZ1A 1FWRA 1YDVA 4YLWA 1TMHA 3MP4A 1ICPA 3HQ1A 1K7XA 3L66A 4DPPA 3W1TA 2B4GA 1UJPA 1XBXA 1QPRA 3G1HA 5KMYA 2QUTA 4XUGA 4AF0A 4HSOA 1TPVA 3LV6A 1ME9A 4CQAA 2ZZ2A 3GB6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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