3QF0A

Crystal structure of the mutant t159v,y206f of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with the inhibitor bmp
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
220
structure length
220
Chain Sequence
DVMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSVRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIFLADNPAAAAAGIIESIKDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Conformational changes in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase: a structure-based explanation for how the 5'-phosphate group activates the enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus str. delta h
total genus 83
structure length 220
sequence length 220
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2011-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3qf0A00
4HPJA 1T8XA 2Q8ZA 3T55A 4RCXA 5AHMA 2J88A 1DHPA 1FX6A 4HKPA 5CPLA 3FYPA 4JN6A 3GDRA 4K8HA 1NAL1 1HO4A 5I3GA 4HNTA 1OFAA 3KRSA 4YCPA 4IX0A 1H7WA 1P5BA 4XQ6A 3PS7A 5C2XA 3A5FA 4H6KA 1ONRA 8TIMA 1W8SA 3HIJA 2X1SA 2VEMA 4FNPA 3EWBX 1W0MA 4LUJA 1LBMA 4FX7A 1TPFA 3RLUA 4O4VA 1OYCA 4QAIA 3EX4A 1BEUA 2TPSA 1OFPA 3BW2A 3MO7A 1UASA 3FA5A 3N19B 2W6RA 2YFOA 3NQVA 1MEIA 3G1XA 1PCWA 4M6VA 3I6RA 1LP6A 1VS1A 5F4WA 2NUXA 3WK2A 3MBFA 2Y89A 1R30A 3PUEA 3KAOA 3RLVA 1G6CA 4JX5A 3U8GA 1KW1A 4JTKA 4NNAA 3S9YA 3W7OA 3BARA 3QMRA 4O52A 3ELFA 4S1FA 3CPRA 4LRSA 1LBLA 3R12A 4FIQA 4RZ4A 4OE7A 3QW3A 5D30A 3W1RA 2FLIA 5HUPA 3UY7A 3W7GA 4HHPA 1W3TA 3GNNA 3HGSA 1SPQA 3GX9A 2YYTA 1DQWA 3H53A 1K7EA 3TC6A 5DBTA 1TYGA 1TJRA 4HIBA 3FJLA 2QCCA 5BMWA 2QAFA 3NL6A 2A21A 3A23A 4K36A 1GG0A 1WOAA 4EF8A 5K2ZA 5AYZA 1P1XA 3EX2A 3RF9A 5H91A 3TSBA 5G2HA 1K02A 3P81A 2VXNA 1WXJA 5HUOA 1S3HA 4GUFA 1SW7A 4NZFA 3MBDA 1WAUA 4GXMA 1OJXA 3TQVA 2ZZ7A 1DQXA 3EWYA 4I7WA 1THFD 4I7UA 1SUXA 1V5XA 2AQWA 4A2SA 5CPNA 1D3HA 4LUIA 2E6YA 3LXBA 4A29A 2A6NA 2E5DA 3W7RA 4GC4A 4KFPA 3GDLA 1IXQA 1AMKA 2R94A 4N9BA 5FEPA 2CU0A 1SZGA 4PL1A 5I3JA 2CLKA 2WOQA 3NPXA 5CSRA 1RR2A 4TX9A 3DHDA 3EWWA 2BSLA 1OVDA 1JCLA 1DORA 1KTBA 3C8FA 1QPNA 3S1WA 1IXPA 3HG2A 1E51A 1EX5A 3L66A 1QAPA 2VFFA 1OABA 5MHBA 2RFGA 2E6AA 3W70A 3WJSA 1K7FA 3GXNA 4PTNA 1ZENA 1NF0A 4NXKA 3SFKA 2ZTKA 4ZQPA 1W5MA 3FKRA 3SGUA 1Q6OA 4NJGA 4C1LA 4EVZA 1ME8A 3IIOA 1P4CA 3G1AA 3PG8A 1WYIA 2YPIA 1YDVA 3G3DA 3N9SA 3E02A 2V2HA 1TPWA 3DBPA 1HL2A 3W7LA 4ZVJA 5C54A 1W54A 2CZFA 4O19A 2YYUA 3KVJA 4UC5A 4Z08A 4WQ6A 3EXTA 1G67A 3HPSA 1KM3A 3IIVA 4UXDA 4CCDA 3DENA 3LB0A 3BG9A 3NGJA 3QYQA 3VCRA 3UZJA 3G0SA 1R47A 3LM7A 1MO0A 3DHFA 2ATSA 3NQMA 4DBEA 3W2UA 2ZZ3A 2ISWA 3SECA 3UWUA 2EPHA 1K3UA 1VPXA 5D2WA 1NFBA 2PRHA 3ABRA 5LZLA 3LCFA 2NXGA 2NX1A 2C16A 1GVOA 3V75A 1NF7A 3H55A 3DFQA 3ZR4A 2NV1A 3NQCA 1K7XA 4IPJA 4M7SA 4UNKA 1F5ZA 5C6MA 1C29A 2QCLA 1IXOA 1W56A 4Y96A 2BXVA 3TFCA 5CPOA 4RJEA 3IV3A 1B3OA 1V7YA 1X7FA 1WA3A 4NX0A 3NL2A 3BLIA 3IVTA 1KM1A 3TMQA 4R34A 3IRDA 4A21A 4LU0A 1H63A 1VGAA 4N02A 2J6XA 2Y6ZA 1O95A 3HOJA 3MJYA 5D38A 3TE9A 2OX1A 1IIHA 1TV7A 3CU2A 1JUEA 3TFXA 3WJYA 4ZQMA 3LLFA 3L21A 5EPDA 2X1UA 3NL3A 4TO8A 1SSDA 4PODA 3FKKA 1SSGA 2OZ0A 2ZRUA 1W5QA 2C14A 2E1DA 3UXDA 3W2LA 3TROA 3LCXA 1WOBA 2V2CA 2FPYA 4GJ1A 1KV5A 3MUXA 4Z1CA 3PVFA 3FLUA 4K38A 1AG1O 1RQBA 1TPB1 3G1SA 4MY8A 3W86A 4CQ8A 2Z2UA 3HF3A 3O07A 5LHEA 3BLFA 1W3IA 3KHJA 1LRQA 4BK9A 1FXPA 2C1HA 3GR7A 5K4XA 2QCEA 1GYNA 2ISVA 1M6JA 1LM1A 3G1HA 2CLIA 1EP2A 4YMZA 1EEPA 2ZYFA 4KKXA 3W7DA 1TPC1 5E93A 2ZDRA 1XDLA 3S6DA 4POCA 3MYPA 4A22A 5IM51 3N2MA 3MI3A 1YXYA 2Z6IA 3W6YA 3UY8A 3TR2A 2TYSA 3QH2A 2DZTA 3OVRA 1P0KA 3E0IA 1VR6A 3QFEA 4LW7A 4JX4A 1UUMA 4Q32A 1FBAA 1L9WA 3QF0A 1KM0A 5F2MA 3PR2A 5HMSA 3M1ZA 3CTLA 5I3IA 4ZL1A 1B57A 2NXIA 3Q94A 3CQ0A 3BK0A 3TV8A 3GDTA 2EKCA 3WK0A 3LHZA 3E9AA 3Q37A 1OF8A 5FEWA 2JKAA 4UFMA 4UTJA 2GQAA 5K9DA 4RXGA 3A24A 3CWNA 4LV4A 3TA6A 3IGUA 2DJXA 4MPQA 2RDWA 3DFNA 3QSTA 4O13A 3IIXA 3WJWA 4X3ZA 1ZAJA 1HO1A 3QRHA 1N8FA 2J9XA 2WQPA 4DQWA 4JTLA 4BWLC 3LRMA 2ZA2A 3TNOA 3LBMA 5EMUA 2CLOA 1FY6A 4O1CA 4H4IA 2CZDA 1ZJIA 4BF9A 1F2JA 4AB4A 3LTYA 1JQXA 3HG5A 1VHCA 4NJJA 2YZRA 3PSWA 4AEOA 4NJHA 1VLIA 1Z42A 2A6LA 3LI1A 5LNRA 5KITA 1GJPA 3LTSA 1YPIA 3MHUA 3SW6A 5AYYA 4N4QA 2OCZA 2GQ8A 3C2VA 4B5NA 5LNUA 4DEFA 3PBUA 3S5YA 1RVGA 4JDYA 1UUOA 4ZMGA 1TB3A 3W72A 4PEKA 1RQHA 2Q8LA 3G18A 1H7RA 4JTSA 3T40A 3STEA 1G4EA 2VEPA 4FNRA 4R33A 5BW6A 3S1VA 2QCGA 3N9RA 2BWGA 5KINA 5U4NA 4BR1A 5LNWA 1H60A 4OU1A 1AW5A 2ISSA 3W7NA 1TPDA 2PRMA 1RV8A 1VCFA 2E5CA 1J2WA 3LX9A 3G1DA 3LHYA 5E0KA 1TRDA 3D0CA 2V2DA 1K8ZA 2B0MA 1SR9A 1BWKA 5KTLA 4NJIA 1LLWA 3GLCA 3W7JA 5D09A 3ZFHA 1ICQA 3EX6A 1OK6A 3LTPA 5D37A 1XUUA 3IEBA 3CLMA 4FXRA 1TTIA 1XDMA 4QISA 1WBJA 3HPZA 2ZBTA 1CW2A 3R5EA 2EGZA 1YADA 4DELA 4AXKA 1H61A 4QQ3A 5AC6A 2X1RA 2AGKA 1QOQA 1SO6A 3S1UA 3TW7A 3MMTA 1R2TA 3BGJA 4MY9A 2IQTA 1GZGA 3STGA 1KM2A 5CG7A 4XBSA 1H7XA 1F6KA 2ZZ6A 1VC4A 4I7VA 1YTEA 3O1NA 2E09A 4BI6A 4WXZA 3NAVA 3W9ZA 1GOXA 5FF0A 1XBXA 1FCUA 4ADSA 3GVGA 3THAA 6TIMA 3W71A 3NG3A 2Y62A 1O5XA 3BO9A 3SR7A 5D2TA 2OT0A 4MY1A 5EL1A 2CLHA 2Y7FA 5KMYA 5LGZA 4IGHA 2DZPA 4XKYA 1PHQA 1I2RA 3C56A 1LRTA 2I1OA 4O8RA 1PV8A 4MFDA 3UWZA 4RX0A 3P60A 3UWQA 3TKFA 3C2RA 3C52A 4IPIA 3P5ZA 2YFNA 1DVJA 3O8AA 4O57A 3LXAA 1A5SA 1TTQA 2O7QA 1CI1A 4UTTA 1IIGA 3EKZA 4LV9A 3E49A 1KFEA 3HO8A 3BG5A 3EX1A 2ZRYA 3P84A 3MP4A 3C6CA 4FIRA 1QDSA 4X2RA 1K03A 3QSRA 2CFFA 2DZXA 2R8WA 3WJXA 4IOTA 5F2GA 3G8EA 1G4TA 3UZ5A 4JD4A 4Z1BA 3UPBA 4NJKA 4LTSA 2ZA3A 3WJZA 4DO5A 1KA9F 3DU0A 1OYBA 3GYEA 3KX6A 2ZRZA 5I3KA 3N34A 3PWAA 3W7KA 1KM6A 4O54A 5G5IA 1TO3A 1B4KA 2V5BA 3FYOA 5G4EA 3EB2A 2R14A 2FPTA 3W7PA 2GVGA 1XKYA 2VOMA 4O1AA 4DF2A 4K7YA 4HN4A 4TU1A 4UUIA 5EBUA 3O6YX 1SZEA 1F6PA 4O10A 5TIMA 1YTKA 1S5WA 4UMCA 1R46A 1I8JA 4HSNA 3W2NA 3HGOA 3M6YA 2QEZA 3O15A 3TAKA 5F4XA 1WBHA 1OFRA 1PHWA 3QZEA 3LXCA 3TDFA 3NR0A 1KTCA 1KFKA 4JY8A 4MYAA 2WNNA 3ABOA 4L4LA 3CWOX 4WZHA 2FFCA 1LORA 3GAKA 2C6QA 5H2ZA 4AMAA 4CCEA 4PFMA 3S0CA 3DH7A 4G1KA 1TQJA 4MZYA 2E68A 4BI7A 1NEYA 2X2GA 1ZCOA 3W87A 1ZY9A 3I7SA 5K4ZA 2Y7EA 3NQGA 1JUKA 4S2CA 3HPXA 3W74A 3MP3A 3TW6A 3U2OA 4UR7A 5K7JA 1H7PA 1YTDA 4WOZA 2XN2A 3G1FA 3JRKA 3M44A 4OV4A 4Z0SA 3BVJA 1QMLA 1X1OA 5F2IA 4JTEA 2JKPA 1LCOA 4MLRA 3E12A 3W1NA 3NQFA 2DP3A 2A4AA 3G22A 4GUIA 2X16A 1WV2A 4AWUA 3W7CA 4NXSA 1GVRA 3LI0A 2WSYA 3G3MA 4MJMA 3BW3A 3NPUA 3P8IA 2ZTJA 1O60A 5J5RA 3DFSA 2A7NA 1TV5A 1YPFA 1PIIA 2UV8G 4QITA 3N14A 3WFAA 4GUHA 1CX9A 5L6UA 1GVQA 2Y70A 3THQA 4RZ5A 2VC6A 1VCGA 2H8ZA 4M6PA 1F74A 2P1FA 3S8HA 1RZMA 5KZEA 3VNDA 5BOOA 1I2OA 4ZZ9A 3PB2A 3M16A 4OWGA 4KWWA 4JR5A 1RD5A 3PAJA 1LOLA 4LVDA 3PUOA 3UYCA 3W3OA 1VCVA 1XM3A 3L65A 1QFEA 4JTHA 4IWWA 2B7QA 4JTGA 1TPVA 2OJPA 1MSSA 4Y6GA 3S5NA 1QPOA 4O1BA 1Z44A 2RKXA 5AHFA 1KTNA 1A5CA 2HSAA 3TJXA 4EWND 1PE1A 2DORA 3TX9A 4O15A 3NL5A 4O12A 3W75A 2V30A 3LHTA 2ABAA 1PL9A 4L4MA 3O06A 4GFSA 1M5WA 3OG3A 5J5DA 4OHQA 4Q4KA 1JQVA 5HQEA 3L9CA 3PF3A 4HPXA 1VYRA 1EUAA 4CNPA 4FO4A 4MJZA 2EF9A 4MLJA 5IBXA 1I45A 5CZSA 4Y90A 5DY3A 3I65A 1N55A 1FDYA 3M0ZA 2ATMA 4K6AA 1H62A 3QEZA 3VKJA 3NPWA 2CZEA 4AF0B 4E38A 4NNBA 3QPYA 3DI1A 3STFA 1TTPA 1TV8A 1A53A 3GIYA 1GG1A 3YPIA 4N9DA 2WO5A 1QPQA 3QMSA 4NVTA 3QQ1A 3GR8A 1A5AA 1OF6A 1FCBA 5DCBA 3S5ZA 3LRLA 1K8YA 2VFDA 4GBUA 1EP1A 4JXCA 2HS6A 2ZCGA 5HJLA 3LOTA 3OVQA 4IMEA 3TQKA 4MUZA 1OHLA 3DZ1A 3T4CA 3NA8A 1H51A 5BMXA 2CWNA 4O1DA 4O50A 3SJ3A 2YX0A 4GUJA 2WSRA 1H1ZA 3BGGA 1IXNA 1VH7A 5U7SA 1JUBA 1QPRA 4K39A 4UR8A 1LZOA 5BNKA 4JICA 2FPVA 3PBWA 2QUVA 3DAQA 3B03A 1GVFA 3W1XA 3P61A 2YR1A 3HGRA 2ZRXA 1OG0A 5D02A 3LERA 3EXRA 3W2MA 3KRZA 4GE8A 1I2PA 4E0CA 2J9ZA 2WNZA 4XBKA 1OX4B 3RK8A 1JVNA 2WSQA 1F7BA 3T44A 1RPXA 3S5OA 1Q6RA 3A9IA 1L6WA 4YL2A 1AL7A 2QDHA 4UTKA 3GZ3A 2LLEA 5A5WA 3FJ6A 3VFLA 1DKWA 2GQ9A 2P10A 4QNWA 4AAJA 1FUYA 4AWSA 1FCQA 3QJAA 4MZ1A 3BW4A 5C5YA 3IGXA 1EWDA 2QCNA 2FIQA 3AO0A 3QW4B 2C0AA 3LRKA 2D73A 3DXIA 3P8JA 4M7TA 4N6EA 1K8XA 4WD0A 3P62A 2E77A 1FXQA 1QCWA 1IGSA 1PCKA 1LOQA 1U83A 2DU2A 3LHVA 2HMCA 4ORMA 3VE9A 4CQ9A 1GQNA 4IMDA 4O28A 5D04C 4FNQA 1X8FA 4FB7A 1BWLA 4K7VA 2Y61A 2BX7A 5G2IA 4O0KA 2V9DA 1J5TA 4GRSA 4UTUA 4KFOA 4MZ8A 3IGSA 3OBKA 3CEPA 1XL9A 4Y8FA 4Z1DA 4CQAA 3HG3A 3ATYA 1F05A 1KLZA 2NXHA 3HBLA 5FF3A 5AC7A 2O7SA 5HULA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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