3QM3A

1.85 angstrom resolution crystal structure of fructose-bisphosphate aldolase (fba) from campylobacter jejuni
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
355
structure length
350
Chain Sequence
AMGVLDIVKAGVISGDELNKIYDYAKAEGFAIPAVNVVGTDSINAVLEAAKKVNSPVIIQFSNGGAKFYAGKNCPNGEVLGAISGAKHVHLLAKAYGVPVILHTDHAARKLLPWIDGLIEANAQYKKTHGQALFSSHMLDLSEESLEENLSTCEVYLQKLDALGVALEIELGCTGGDNTGIDNSKLYTQPEDVALAYERLGKISDKFSIAASFGNVHGVYKPGNVSLQPEILKNSQKFVKDKFALNSDKPINFVFHGGSGSELKDIKNAVSYGVIKMNIDTDTQWAFWDGVREYELKNRAYLQGQIGNPEGDDKPNKKYYDPRVWLRSGEESMIKRLEIAFEDLNCINKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title 1.85 Angstrom Resolution Crystal Structure of Fructose-bisphosphate Aldolase (Fba) from Campylobacter jejuni
rcsb
molecule tags Lyase
source organism Campylobacter jejuni
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
total genus 140
structure length 350
sequence length 355
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2011-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3qm3A00
1VZWA 4IMCA 1M5WA 4Y6GA 1HG3A 3RU6A 3PR2A 3KVKA 1VCFA 3ABOA 3FEMA 3W2NA 3G3MA 1H62A 1LM1A 2ZBTA 4N02A 4N9DA 4UTLA 5F4WA 1XFBA 1F6PA 1A5CA 4JTKA 5K4XA 2Q3RA 5L6UA 5CGQA 1KTCA 4IX2A 4JEQA 4CCEA 3N2MA 3R89A 2ZCGA 4IUOA 3AJXA 4IPJA 5K9CA 4CLMA 4FNSA 3H53A 1LROA 1Q6RA 3QSTA 1H7PA 2Y61A 2KZHA 3GNDA 2O7QA 3VE9A 2W79A 5CPLA 3D0CA 2A6LA 1PS9A 3DFOA 2QDHA 4HIBA 3DI0A 1GEQA 2QCNA 3PULA 5HJLA 3QW3A 2PRMA 4O19A 3N19B 1AL7A 1MXSA 4DELA 3WJXA 4TO8A 5HWNA 2GUUA 3NQ7A 2D73A 4UR8A 3S9YA 2X1SA 4MIMA 1F2JA 1IXPA 3GAKA 5IM51 3F1QA 2TMDA 5CPOA 3L67A 1G7VA 4Z08A 3TMQA 4MPQA 3LI0A 4EWND 5EL1A 4MKNA 1N7KA 2J88A 4XUGA 2DJLA 4M7TA 4S1FA 1SW7A 1VC4A 1UASA 4PFMA 2Z0IA 3SR7A 3BW4A 3R12A 3NQEA 3DFSA 3HG5A 3PWAA 3SJ3A 1YPFA 1W5PA 3L5MA 2VXNA 4GXMA 1PL9A 4RCXA 3N9RA 4LRTA 4NNBA 3HGOA 3RFAA 1QDSA 3PAJA 4GNJA 4HPXA 1I4NA 5D2XA 2VFDA 5F1VA 5AHLA 2V2HA 3MP5A 5EMUA 3W7NA 3ZWTA 5KZMA 1YDNA 2EKCA 1XUUA 3NL6A 4XBKA 3QSRA 2Y7DA 5DCDA 1LOLA 3W88A 3LOTA 2A0NA 3A24A 3C56A 3N34A 5LHFA 2QUVA 1W3TA 3A21A 4WQ6A 4ZQNA 3NM1A 2VFHA 3W70A 1WV2A 4E2DA 5AYXA 1R2TA 1YYAA 3BARA 2ISVA 3TROA 3W7GA 3OIXA 1ZCOA 3R13A 5LKYA 3IGUA 1GWJA 1XKYA 3OVRA 3G3DA 2X30A 4MLRA 2F84A 1OFQA 1W54A 5EKYA 4UNLA 3PY2A 1TTIA 4AH7A 5LZLA 4YWIA 1GOXA 4JN6A 1W37A 4O28A 2F7FA 4YL2A 1OHLA 1LZOA 2EAWA 3FKRA 5C54A 1SPQA 3FLUA 3O6CA 5BW6A 3M6YA 1JRBA 3B04A 1TTJA 4LVAA 4LRSA 5FEXA 3W6YA 1OFPA 4UC5A 5TQLA 3GX9A 3V75A 1YXDA 2E5BA 3LERA 1QO2A 4O1DA 2NUXA 3TXVA 5K3VA 3NGJA 1MO0A 3A5FA 3QC3A 3TE9A 3NZ1A 3S5NA 4X2RA 3BW2A 2RH9A 2VENA 1TMHA 3NPVA 1H50A 3IIOA 1RQBA 2GQ8A 1C29A 4M5PA 4A21A 3VFLA 3IV3A 2WNNA 5AHFA 3LHYA 3HGRA 2X16A 5DELA 4WZHA 1ZAIA 3EKZA 3NQDA 1GTHA 3G1DA 1VYPX 5KTLA 2DORA 3TDFA 3DAQA 3QMRA 5KINA 4AEOA 4N4QA 3KVLA 1TO3A 2QCGA 1JJKA 4YXGA 3EX1A 3B0PA 1CX9A 3C0JA 3KXQA 3EWYA 3M16A 3GB6A 4RJEA 3HMJG 1TPWA 4A22A 3S5ZA 2B4GA 2OT1A 5H91A 3MYPA 4TMBA 3A22A 5D05A 2BLEA 3DHDA 1NEYA 1X1OA 2EPHA 3FOKA 1SFLA 1RV8A 4G1KA 2QKFA 3MP3A 4O11A 2Z6IA 2NX3A 2ZZ7A 4S2BA 3STGA 1LTDA 3W23A 1TJRA 1Q6LA 3DZ1A 3G1YA 3M9YA 4BI5A 1HL2A 5E0KA 2CLMA 2ZZ3A 3W7OA 1LRTA 3YPIA 1JUBA 3LLDA 2NXHA 1VCGA 2C16A 2E09A 4JD4A 2C0AA 5C55A 3MJYA 2R94A 4DXVA 2PURA 4RR4A 4PCFA 4NJHA 5HULA 5F1UA 2RDTA 4HNNA 4NZFA 3RLVA 1EP2A 4UFLA 5CSSA 4E2BA 1XI3A 4NT0A 2C19A 4O4VA 3F4NA 1I2OA 2QCEA 2V30A 1LOSA 2CLOA 2VFFA 3W7CA 1K8YA 2ISWA 3CB8A 2AAMA 3QQ1A 4YCOA 2G95A 3UWUA 4JIQA 3I7SA 4LVDA 5LNSA 1LBFA 4POCA 1KBJA 5HWMA 4XBSA 3HG3A 1FCBA 3USBA 3NR0A 2C14A 4GUIA 3RMJA 1B9BA 3THQA 3OG3A 3TAOA 3UWQA 4ICNA 4K6AA 5CZJA 2WJZA 5U4NA 4JTFA 2R14A 3ABQA 4ZQOA 4ZVJA 4QAIA 1WX0A 3W2LA 1QPQA 3ELFA 1WDWA 1JCXA 3NQMA 3U6WA 1SZFA 3C2RA 2BX7A 1K8XA 3G1FA 2Y7GA 3B06A 1R2RA 3JR2A 1QO5A 3NL2A 3QPZA 3W75A 4H4IA 1KLZA 2QAPA 1FCUA 3W1MA 2GJNA 3TX9A 1DJNA 2A7PA 1B4EA 2DJXA 4O18A 2Y7FA 3PG8A 4R53A 3LRKA 5EY5A 5GVJA 5AYYA 4ZQMA 5KMYA 1XCFA 1QFEA 3G1SA 3B8DA 3T55A 3G1VA 1G4SA 2Z1BA 4NNCA 4JX4A 1BEUA 4FHAA 4MY8A 2YW4A 1BWKA 1P0KA 3A9IA 4OBTA 1OX4A 5FEZA 3ZS4A 3TU9A 3GNNA 4Z1BA 3UXDA 1TQJA 1RPXA 1LORA 2W0UA 3ATYA 2TRSA 3QH2A 3WK3A 4Z1AA 4MJZA 2PRLA 1RZMA 4OWGA 4QSHA 4LT9A 4PEKA 2OZ0A 1O4UA 4UTTC 1YTDA 1YTEA 1O5KA 5HMSA 3W7DA 3S1XA 4BI7A 1DHPA 4JTSA 4Z0JA 2GQ9A 5G5IA 1SUXA 3W1LA 2G97A 3MWAA 1SO6A 1IIGA 1SSGA 1U5JA 5E93A 4KFOA 3LB0A 3T4CA 1XDLA 1JCNA 3PG9A 3QQ0A 3FYOA 3OEXA 3QRHA 1P1XA 3EWZA 1W5OA 4LOCA 1VRDA 4IMFA 1EB3A 5MHBA 3NL3A 3TH6A 4E38A 3NQFA 1FWSA 2QCDA 3T78A 2DZWA 2CLKA 2R8WA 3MI6A 5AHMA 2YFNA 3S1VA 4B5NA 4K7YA 1OF8A 4ADUA 1VQTA 1PHQA 3W7MA 2RDWA 4PL2A 1THFD 1Z48A 1QR7A 3LGEA 3UQNA 4AVFA 1MEWA 3QMTA 1I2NA 2V0TA 1FQ0A 3HB9A 4LC8A 4QM1A 4UMAA 5D2YA 4GWEA 1EUAA 3DXIA 2B7OA 5CG7A 4LS1A 2YYUA 2Y63A 4HNUA 3DH7A 5ABTA 4JY8A 2YFOA 2CLLA 4NX0A 4LUJA 2VFIA 4IOTA 1JQVA 1KM0A 5FEPA 5F4XA 1KFBA 1L9WA 4JX5A 5F2LA 2V8ZA 3N9SA 3DHFA 4TR9A 3STEA 2PC4A 5DBUA 3LTPA 5HUOA 2ATMA 4IWWA 3LHWA 5D32A 3O1NA 3CM4A 2I1OA 1TPUA 3LCHA 5EPDA 3STFA 3PBYA 3TNOA 3PSVA 3K30A 3W7PA 2GQAA 2DP3A 3DGRA 2NX1A 2GOUA 4R33A 4K36A 1UB3A 3UD6A 4WOQA 3W1UA 2VFEA 3F03K 3A5VA 1NSJA 2BWGA 3UWVA 2Q8LA 4IJBA 2WSYA 4PH6A 2QCFA 1VHNA 3C6CA 3LCLA 1R30A 1IXOA 3L68A 4X22A 1O95A 4O17A 3TKFA 3PB0A 2ZRXA 4DPQA 2QCHA 3SIZA 1Q45A 4TU1A 1XBZA 2ZZ4A 1A53A 4AXKA 4AF0B 1GVSA 1SFJA 2WKJA 4FF7A 5IBXC 5HR7A 3BG3A 1ONRA 4UNKA 2E5DA 5H2ZA 5I3GA 1G6CA 3W7KA 3TMLA 3NXFA 3O6YX 3W1RA 4CNOA 3B05A 3E0IA 2DZVA 5D03A 4FIRA 5G1TA 4FNUA 2E6DA 3RF9A 4E0CA 2QUUA 5TBOA 3U8GA 2QR6A 2VEIA 3SFKA 4N9EA 1C8VA 3GIYA 3EKLA 1J5TA 3TV8A 3T44A 3P7YA 3T7VA 2WV8A 1AK5A 4TMCA 5CPNA 3NZRA 4RX0A 3CTLA 2X2GA 5E1QA 1SO4A 3B03A 2HMCA 5AC7A 2FTPA 3TR2A 3G0SA 3P8JA 1EWEA 1SU5A 2QF7A 4AAJA 1DORA 1QOPA 4UTKA 1A5SA 2H6RA 3W2KA 3CHVA 2QJIA 2XN2A 4AHOA 4Q4KA 2WO5A 5LSMA 4FXSA 4LVFA 1Q6OA 2OMAA 4OV4A 3NVTA 3GKFA 4S2CA 1KV8A 3OA3A 2OCZA 4ZQCA 1S5TA 5G2HA 4AB4A 4PC8A 4AHPA 2CWNA 3W76A 2C13A 3NNTA 4PA8A 4UTWA 4D2JA 4FB7A 3M47A 1WXJA 1JCJA 4IMEA 4MVAA 4UTJA 1JULA 3O15A 1VS1A 5C5YA 4O50A 2FB3A 3S5YA 3W1AA 4EF8A 1IXNA 2C6QA 3BG9A 2NLIA 1SZNA 2QDGA 4UTIA 4FX7A 1FWTA 2WNZA 1OFOA 4IPIA 3KX6A 1TJPA 3P62A 4O13A 3S0CA 1PCWA 3DFNA 3FJ6A 5EBUA 1TYGA 2DZTA 3N14A 3EWWA 3GKAA 5BOOA 1EEPA 1TSIA 5DCEA 3EEGA 3W7JA 1XL9A 1H60A 3DFQA 4M6PA 3FS2A 2ZYFA 5G1YA 5CZSA 5DY3A 3EXRA 2FJKA 1SZGA 2HSAA 2CZ5A 1RQHA 3G18A 4UIOA 3NEVA 4N4PA 3MBDA 3TQ0A 4JTIA 3SSJA 3MP4A 4J9JA 4WJEA 1N8FA 1DVJA 3TAKA 5AN7A 4HT3A 4H6KA 4PODA 3UWYA 3KFTA 1GVRA 3TSBA 4A2RA 4FX6M 2QCMA 2EHHA 2ZRYA 4WX2A 4LWWA 3MUXA 4BWLC 3E49A 2RDUA 1M7OA 3ANYA 3ABRA 4Z1CA 2B7PA 2FPVA 1S3HA 5F2MA 2RHGA 3OVPA 1GZGA 4JYDA 2QJHA 2VKZG 3M43A 1W3NA 3PBWA 1NF7A 1NFBA 7TIMA 1KM2A 1SSDA 3UPWA 3KRUA 3R5EA 3C2OA 4KWWA 4XZ9A 2NWRA 2NUWA 4K8HA 3TFXA 4M19A 2V5LA 1OYAA 1OFBA 3MMTA 4K8EA 2H90A 1L6SA 1H61A 4N2YA 4LS0A 1G4EA 1F6KA 3TXZA 4JR5A 1F7BA 3BGGA 3KRZA 3W83A 3QEZA 4JXCA 1AW2A 3CT7A 2ATSA 2G96A 3W73A 2ZA1A 2GPTA 4ML9A 3QF0A 3QJAA 3BVJA 3WJYA 1ALDA 1A50A 2TYSA 3PUEA 4IGHA 4YMZA 3NQCA 3LV5A 3P74A 4LY8A 5CSRA 4P2VA 4EVZA 1VLIA 2J9YA 5BRBA 3KRSA 4Q32A 3GXPA 3P5YA 1TV7A 3HG4A 4NJIA 5J5DA 5D2TA 1DQXA 1I2PA 1H51A 1I2RA 3HF3A 1TPVA 4LS2A 3W87A 5LGXA 2E6FA 3UZJA 4DO5A 1CI1A 3MI3A 3TSDA 3W1TA 5AC8A 3RK8A 3FYPA 4O1CA 2V5BA 1FUYA 1KFCA 1VJIA 4OT7A 4HN4A 1QWGA 2WPBA 1C9DA 1VGAA 1MEIA 2ZA2A 1GYLA 2CZFA 3I68A 2A2IA 4O10A 2H8ZA 1UUOA 3M5YA 1I2QA 3L0NA 1TTPA 4A29A 5A5WA 2VEKA 3W1XA 2V2CA 1OK4A 4JICA 2C18A 3HO8A 3KHJA 4XKYB 1SO3A 4KFPA 1KBIA 1QOQA 1JQXA 3TC6A 1QPNA 1EA0A 3LCIA 3W86A 4I7VA 3KVJA 1OABA 1K3UA 3C2VA 3GXNA 3UY8A 4JDYA 1GYNA 1ML1A 5J5RA 4DBEA 2DZXA 5D37A 3B0UX 1J2WA 3WFAA 3W1PA 1TV8A 3TW6A 2IQTA 5FI8A 3VKJA 2ZTKA 3NPWA 3GYEA 4LC6A 3CEPA 3WK0A 3GK0A 3LHZA 2ZRZA 3O07A 2HS8A 4WOZA 2A7RA 3CEUA 1HFBA 3NPXA 1VPXA 5HINA 1ME8A 3GVGA 3N2XA 4QISA 3M41A 5FEWA 3H54A 3GDMA 3TW7A 4NNAA 5AOUA 3NYZA 2QAFA 2ZFAA 5DXYA 3O06A 1WQ5A 4UFMA 2YW3A 1RQEA 4OV9A 2J9XA 4N6FA 3EXTA 2RFGA 1SR9A 2GVLA 2JK2A 1NF0A 3QYQA 1I8JA 1OYBA 1F76A 4YLWA 1OFEA 3CWOX 3LRLA 1ZAJA 3I7RA 2FB2A 1KLYA 2PRHA 3DBPA 1TPFA 2YGYA 1DBTA 3NO5A 4LUIA 3NQ2A 4ORIA 1TPEA 3V1PA 4ONVA 3HJZA 1FCVA 2Y62A 1W0MA 2ABBA 2XFWA 2FQIA 3C3NA 4FNTA 4BFAA 3LCGA 3TFCA 1H7NA 4MFEA 5EA9A 5C2XA 3L21A 3LHVA 3S1UA 3HGSA 2Y88A 2JGYA 4IMDA 4AWTA 4GBUA 3KVMA 1BKSA 4NQ1A 1T96A 1TPC1 3CWNA 2YPIA 3RNDA 3NAVA 3IIXA 4OE7A 1KFEA 4UCGA 3O8AA 1FXQA 5G2WA 2H3BA 2EF9A 1PHWA 2QUTA 3QZEA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5EML A;  4IMC A;  1HG3 A;  1E15 A;  3WLH A;  3RU6 A;  4JIE A;  3SCS A;  2WVV B;  2R1N A;  3HV9 A;  3W2N A;  3G3M A;  1H62 A;  4J5N A;  4N02 A;  2PDL A;  4N9D A;  4AY8 A;  3NGF A;  1A5C A;  2Q3R A;  5E70 A;  3N2M A;  2ZCG A;  1B31 A;  4IUO A;  1TZ7 A;  3AFB A;  3WMC A;  4HA3 A;  4DUW A;  2O9P A;  2Y61 A;  1E4I A;  3VE9 A;  1QTW A;  1T40 A;  3ORW A;  1PS9 A;  4JNY A;  4HIB A;  3Q67 A;  3KBV A;  1E40 A;  5H1W A;  3QV9 A;  4YTT A;  1X8C A;  1YKW A;  3BSM A;  2CKR A;  1CXF A;  5HWN A;  3LNP A;  3PAO A;  5MF5 A;  2HDJ A;  2IQD A;  4PUN A;  4EWN D;  4XUG A;  1OCB A;  2WZE A;  3KDN A;  4M7T A;  5FJT A;  3II1 A;  4S3C A;  3B0X A;  3TNB A;  1U1U A;  2EEX A;  1UAS A;  4MB1 A;  5HAO A;  6XIA A;  4Z2L A;  3BW4 A;  3R12 A;  1BXN A;  3DC0 A;  1XYF A;  2POZ A;  3HG5 A;  3PWA A;  3SJ3 A;  1W5P A;  4JFU A;  2XM1 A;  3USZ A;  2YZ5 A;  2W3Z A;  4RCX A;  3N9R A;  4LRT A;  3QLD A;  3RFA A;  2XVL A;  3CMG A;  5D2X A;  4B4F A;  3W7N A;  1HGY A;  1TCM A;  3NL6 A;  4XBK A;  2F8Q A;  3VOG A;  2Y7D A;  1CYG A;  2VRK A; 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