3QM3A

1.85 angstrom resolution crystal structure of fructose-bisphosphate aldolase (fba) from campylobacter jejuni
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
355
structure length
350
Chain Sequence
AMGVLDIVKAGVISGDELNKIYDYAKAEGFAIPAVNVVGTDSINAVLEAAKKVNSPVIIQFSNGGAKFYAGKNCPNGEVLGAISGAKHVHLLAKAYGVPVILHTDHAARKLLPWIDGLIEANAQYKKTHGQALFSSHMLDLSEESLEENLSTCEVYLQKLDALGVALEIELGCTGGDNTGIDNSKLYTQPEDVALAYERLGKISDKFSIAASFGNVHGVYKPGNVSLQPEILKNSQKFVKDKFALNSDKPINFVFHGGSGSELKDIKNAVSYGVIKMNIDTDTQWAFWDGVREYELKNRAYLQGQIGNPEGDDKPNKKYYDPRVWLRSGEESMIKRLEIAFEDLNCINKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title 1.85 Angstrom Resolution Crystal Structure of Fructose-bisphosphate Aldolase (Fba) from Campylobacter jejuni
rcsb
source organism Campylobacter jejuni
total genus 140
structure length 350
sequence length 355
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2011-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3qm3A00
3BW4A 1OFOA 2X30A 3TH6A 1X7FA 3FOKA 4UMCA 5D2WA 3S0CA 2WNQA 1L6SA 3PUEA 2EKCA 3STEA 3CT7A 4LWWA 4R53A 2DP3A 1ZAHA 4WOQA 4O8RA 1KTCA 2QCGA 4IMGA 1XUZA 4DF2A 3TROA 3O6YX 4EF8A 4Y9AA 3W3OA 3IIXA 3TFCA 4NNAA 4A3UA 1P0NA 2NWSA 3M5VA 3W2UA 4Z1AA 3KX6A 3W2NA 3TQKA 1LLZA 5HUPA 2DZVA 2QCDA 4HNNA 4CCCA 5KITA 3HOJA 4TX9A 1TTQA 4AF0B 5DN1A 1VLWA 2EGZA 3UD6A 3BK0A 2Y7EA 3BW3A 3VCRA 3NL2A 4JGDA 3UWUA 1XDMA 3PG9A 5IM51 1IIGA 1UUOA 3W70A 3KFTA 1A5SA 4LRSA 4AAJA 4GC4A 3TAKA 1NAL1 2ABAA 4A29A 4FNQA 1EUAA 4IOTA 1XL9A 3EX2A 1YLVA 1M7OA 1QMLA 3IIZA 3A21A 2DZPA 3G0UA 4UTWC 3GK0A 4LS1A 5LNUA 1SFLA 3G3MA 3LI1A 2E1DA 3WJWA 3IIVA 5G2HA 1TJRA 1GVFA 5K4XA 2E09A 1TTPA 5I3JA 2WOQA 4XTIA 3CM4A 1WXJA 3NG3A 3WK2A 1YDVA 1ICSA 1W54A 2X16A 5EKYA 1XC4A 2XFWA 3TK7A 5EBUA 1L6WA 1VCGA 2WNNA 2O7QA 1WOBA 3GDMA 3UWYA 2A21A 4CQ8A 2ZA2A 3T55A 1TO3A 2V82A 3NL6A 1WV2A 1H61A 4LVFA 2I14A 2HS6A 1PL9A 1FDZA 1AW2A 4BR1A 1OX4A 3R89A 5D2VA 1H1ZA 2B7NA 4KWVA 1OHLA 5G5IA 2J24A 3LRKA 3T7VA 3JRKA 1GYNA 4OWGA 1TSIA 4E2DA 1OFEA 4W9TA 1GEQA 3P62A 3MYOA 1T0OA 2Y88A 4NUWA 3C2RA 4M7TA 4M5PA 4P2VA 4CQ9A 3G1YA 3TSMA 2YDAA 1V5XA 4UTWA 3TNOA 1CX9A 4PCFA 1LROA 4IX2A 2DJLA 3O8AA 4O4VA 1BWLA 1H7XA 3E96A 2DORA 1W3IA 4UUIA 1JCLA 4JY8A 1G6CA 2EHHA 3QFEA 4B5NA 4Y90A 1N55A 5E1QA 1SZNA 4RZ4A 3VE7A 5A5WA 3ELFA 2CZEA 4FXRA 3DKJA 3GDLA 4MOZA 4CLMA 3TSDA 4OHQA 3MI3A 3NR0A 1KFLA 3LCWA 5FF7A 1JUBA 3NQ2A 1WYIA 5T26A 1LM1A 5DCDA 4MVAA 5HINA 4LC8A 5K9CA 2WO5A 1XKYA 1UCWA 5CG7A 3BG3A 3CU2A 4NX5A 3S1WA 4RZ5A 5TQLA 2E5CA 1KFCA 1QCWA 1FDJA 4IMDA 3G0XA 4MY9A 1IGSA 4LVGA 1GVRA 2PC4A 4MLRA 1XBVA 1SSDA 2QCDB 1YPIA 1DL3A 1H1YA 3CWOX 4IJBA 4POCA 4N6EA 4KFPA 4GFSA 4ZZ9A 4HN4A 3SFKA 3W23A 3PBUA 3BGJA 4AHOA 2ATMA 3O1NA 3JR2A 1XBXA 1K7XA 2CLMA 1VS1A 5AB3A 1EP3A 2BX7A 5AHEA 2C14A 2Y7DA 3QMTA 1KFBA 2WNZA 2FQIA 4Z0SA 5LNWA 3HBLA 5EL1A 3LXAA 1Z44A 1WBJA 2X1TA 3GAKA 2FB3A 1QAPA 3HB9A 4HKPA 2ZTKA 3PBVA 1G7UA 4K39A 4BI7A 4ADUA 4D2JA 4JTTA 1AG1O 1RQHA 2P0OA 3W73A 1IXPA 4G1KA 1GG0A 2R94A 4OV4A 4QJ1A 1Q6QA 1OFAA 4O0ZA 1I8JA 1NVMA 3BG9A 1JCMP 4MKNA 1XBZA 1EUNA 2NZLA 1CW2A 1XCFA 3N9SA 3M43A 3OA3A 1OFQA 3H54A 3W85A 4FX8A 3EX6A 4UTMA 2VFIA 3W87A 3I7SA 3PG8A 3I7QA 4IXXA 5EPDA 2AQWA 1FXQA 4JEQA 1TPB1 3LCLA 2GJLA 3FKRA 1OX4B 3NQMA 1I2QA 5FESA 3W7MA 3M0ZA 1ICQA 3PF3A 1XFBA 4GRSA 1C29A 4WQ6A 1XDLA 5F2IA 2YXGA 3H55A 2NWRA 2VEPA 2P10A 4YWIA 3STFA 3MBFA 1H50A 5HWNA 4JDYA 3LV5A 4UTTC 1QO5A 3AO0A 5AFDA 3EKZA 1SPQA 4O17A 5FF2A 3LCHA 4H4IA 3G0SA 5KZEA 4HNUA 1KBJA 1QOPA 3TA6A 4M6QA 4JXCA 2Y89A 2ZZ3A 4O18A 3E0IA 3ATZA 1TMHA 1HO1A 3Q2DA 4LV4A 3LXCA 2AAMA 3OVRA 3O15A 5AC6A 2JGYA 3G1FA 5KZDA 3W7NA 3GXNA 1N7KA 2VXNA 1NFBA 1FXPA 4IGHA 4JICA 5AHNA 3GB6A 3UPWA 1SSGA 3OVQA 5AOUA 3HG5A 1VC4A 1EEPA 3UPBA 2OX1A 3LRLA 4LT9A 4UTLA 3TXVA 3DFNA 3EX4A 3BVJA 3OEXA 4K6AA 2DZXA 5EMUA 1ZCOA 4UTHA 3THAA 4BK9A 1TTIA 2AGKA 4UNKA 3SR7A 3WK3A 3W7KA 5LNVA 3NPUA 1Q45A 2V5LA 4NJGA 3QYQA 2YFOA 3ABOA 4K37A 5LKYA 1V7YA 3S6DA 3NA8A 1T96A 5HMSA 3W1XA 1LBLA 4UTTA 4RK8A 2RDUA 4FNRA 4WY0A 1Q6RA 4UNLA 4DBDA 4U28A 1DOSA 2Z1BA 2Z6IA 1Q6LA 3FA5A 2NUWA 4ORMA 1VYSX 3IV3A 1TQXA 3TAOA 2VFEA 3G3DA 4AB4A 3GDRA 1RV8A 5C6MA 1SW7A 1RZMA 3TQ0A 3G1XA 3YPIA 3NQGA 4ADSA 3TU9A 3O05A 4K36A 3KRZA 3UWWA 4XKYA 3NXFA 3W76A 3P84A 1OK4A 4PL1A 4MY1A 1R2TA 3TXZA 4EF9A 1OX6A 3PC0A 3O16A 3GNDA 1TV8A 3DFTA 4DELA 4HNVA 1N8FA 4K7VA 3NM1A 2WV8A 2H8ZA 2PE4A 3DFQA 3SZ8A 1G67A 2ZA1A 1LTDA 1YDOA 1W8SA 3M6YA 3UWZA 5HUOA 2Q8LA 5CZJA 2I9EA 2QAFA 4DF1A 1QFEA 3PULA 1MEIA 1EWEA 5D37A 3KRUA 3NM3A 1JCJA 1A50A 1MEHA 1LDCA 2BWGA 3QQ0A 3Q58A 4NZFA 4MJMA 1GQNA 4NT0A 1K02A 1WDWA 3C56A 2A4AA 4WUIA 1GOXA 3GAYA 3L67A 3PSVA 4WJEA 4MFEA 1H7OA 1OYCA 4GUFA 1B4EA 1H7PA 1OX5A 3NPWA 5CZSA 3PBYA 1OYAA 4UFIA 5F4SA 3S8HA 1P4CA 1KM2A 2QJGA 4U4MA 4BFAA 1J4EA 1TQJA 2B0MA 2GPTA 3P7YA 3GDKA 2B7OA 4NQ1A 2Y70A 4DPQA 1GJPA 1THFD 1T99A 3TFXA 3DH7A 1LZOA 4Q32A 3QM3A 3LRMA 1OF6A 2VENA 2YW4A 4AWSA 2W0UA 3L0NA 5FEZA 2RDTA 1W0MA 4S1FA 3LXBA 1H5YA 1JRBA 4YL2A 1VR6A 3CQ0A 2ZZ6A 4M19A 4O52A 5F4XA 3HPSA 2V2CA 5DY3A 1H60A 4QIUA 4GWEA 4FNTA 5DLCA 1SW3A 2G5WA 4QNWA 3P81A 1HL2A 4DO5A 3L21A 3O6CA 3G1AA 4OE7A 4CNNA 3NNTA 4X22A 1OK6A 3CPRA 2ZRVA 1KFEA 4JTKA 1GWJA 1C8VA 1TPVA 3VFLA 1UUMA 3W88A 1W3NA 5CSSA 3B4UA 4Y96A 2ZZ2A 2ALDA 1WQ5A 2JKAA 3C6CA 2NLIA 5K4ZA 3DKLA 1ME9A 1AK5A 5F2MA 1QPOA 2B4GA 1GVSA 3TCEA 2HS8A 1ONRA 1F73A 1GPWA 3W1MA 4ZQRA 4XBKA 3QSRA 3CLMA 3P60A 3MWAA 1YPFA 4MY8A 1U83A 2DJXA 2OT0A 2ZRUA 1SUXA 4IXHA 4PC8A 1I4NA 4RV8A 4DQWA 3LX9A 3V1PA 3INPA 1DQWA 1K7FA 4IMCA 1HTIA 3HPXA 1A5CA 1W5PA 3EXTA 5HR6A 4FO4A 3SSJA 2QJIA 3O63A 3EWBX 5U7SA 2V81A 3PAJA 4WY0B 1LRTA 3TMLA 1JRCA 2RDWA 2Z2UA 4FNSA 3WK1A 5KSWA 5D02A 4BI6A 1TB3A 4Q33A 3TR2A 4A2RA 1BEUA 3BGGA 2VFDA 2CZ5A 3P80A 3G24A 4A22A 3W71A 1FCBA 5HWMA 5KMYA 3W7LA 4RJEA 2CLKA 1W5NA 5U4NA 1JJKA 4XKYB 1TPFA 2FPYA 1DKWA 1ZNNA 1LLWA 1F74A 2GVJA 2HMCA 1O60A 3FIGA 4E0CA 1KM0A 3A5FA 1RQEA 3DBPA 4WX2A 4C1KA 1OVDA 4FF7A 3A24A 2ZRWA 1LORA 4LVAA 3HPZA 1FWSA 4LVDA 2YGYA 4MFDA 4MYXA 4CCDA 1BKSA 4K7YA 4OGZA 1GG1A 4K8HA 3NL5A 3QSTA 1TJPA 3VI2A 3P5ZA 3EWZA 3L9CA 4OV9A 1SZEA 4CQAA 1WOAA 5AYXA 3HG3A 2OT1A 4HSNA 6TIMA 2VEIA 2EF9A 1O95A 1FWRA 1YXYA 3W7CA 4PA8A 3BV4A 3DENA 3L66A 4IQLA 1DV7A 3KHJA 4GNJA 3N3MA 4FB7A 4M6VA 3A22A 2NX3A 5DBTA 4N4PA 4O1DA 1B9BA 1F6KA 5LGXA 4R33A 1Y0EA 1GVQA 4IMFA 3G22A 2BLEA 3GKAA 2YR1A 5HQEA 5IBXC 3LTPA 1VCFA 3LHVA 1KM6A 1ZY9A 3OBKA 3MI6A 3QPYA 3WFAA 1HG3A 3DHFA 3IGSA 4LS2A 3WK0A 4LTSA 1ZHAA 3GLCA 4EVZA 3WJXA 3M44A 2X1UA 5TBOA 2R14A 3P8JA 3M16A 5G4EA 1SR9A 3QC3A 4N4QA 2YX0A 1RD5A 4ONVA 3THQA 3W9ZA 4I7VA 1RPXA 1D3GA 1OFBA 2YYUA 1PV8A 1W5OA 2YZRA 4TMCA 5HWJA 3VE9A 2ZDRA 4S2CA 3CHVA 2UV8G 3SY5A 4XUGA 4BI5A 1KFJA 2E6AA 3OIXA 1YYAA 5HJLA 3GXTA 1RR2A 1NEYA 3B04A 4ZQPA 4PH6A 1DORA 2WJZA 1JCXA 1XUUA 3W1AA 3DFSA 1JR1A 4K38A 4Q4KA 5DCEA 4MPQA 2WSRA 3NZ1A 3I68A 1QOQA 1JQXA 4UTKA 2V2HA 1L6YA 1FX6A 1HUVA 2PURA 3BPWA 2WSQA 1H7RA 3ANYA 5E93A 2GJNA 3PVFA 3TJLA 3G1VA 1QPRA 5FF0A 3B06A 4NJJA 3KVLA 1H7WA 2FIQA 1D9EA 1IXOA 1M7PA 1VZWA 4AWTA 4QAIA 2QDHA 4ADTA 1OJXA 1VCVA 1YTDA 3RK8A 2ZZ4A 3NQDA 3N14A 4AH7A 2Z6JA 5DXXA 5D03A 1TPH1 3T40A 2WSYA 4HPJA 4JS3A 4O28A 4WXZA 3W75A 4JN6A 4MJZA 1P0KA 1KA9F 5L9FA 1QNVA 1TPC1 3HGRA 1EWDA 5DXYA 2ABBA 1XBYA 1O94A 2C6QA 2F84A 1D3HA 1RQBA 3C3NA 3EWUA 2ZCGA 1ADOA 2QCNA 1ZALA 3ABQA 3GR7A 1F2JA 4GE8A 1RVGA 2QJHA 3FLUA 1XXXA 2A1YA 2X2GA 5KTLA 3SECA 3NQAA 1GZGA 2J27A 2VEKA 4FHAA 2B7QA 4N9BA 1H51A 3P8IA 2VC6A 4O50A 3TQVA 3W1RA 2QAPA 1KFKA 3P5YA 3NOEA 1WX0A 4O15A 2HTMA 4IPJA 1B3OA 1L9WA 5I3HA 4UR7A 1G4SA 4HNTA 3MP4A 1DVJA 3TW6A 1G4EA 2J9YA 2JK2A 3S5ZA 2LLEA 2CZDA 4X3ZA 4MUZA 3SI9A 8TIMA 2FJKA 4YMZA 1ME8A 2VELA 3U8GA 3G1SA 3ABRA 1Q6OA 3C2OA 3PB0A 1L2UA 3W83A 1KBIA 1VLIA 5K9XA 1GVOA 3GX9A 3W07A 1E51A 1OFDA 3A9IA 3W7GA 3TUUA 3PY2A 4RR4A 4ZL1A 1C9DA 4LUIA 2ZRXA 3UXDA 4TR9A 3VKJA 2V8ZA 3O07A 2VFGA 1R47A 3G8RA 1F76A 5D33A 1U5JA 2YYTA 4EWND 1G4TA 2ZTJA 3IEBA 5AYZA 1DJNA 2E68A 4OBTA 1GT8A 3MBDA 3K30A 4HPXA 4GBUA 3W2JA 4WY0F 3MO7A 3UYCA 2JGQA 2QR6A 3RLVA 5GVJA 3ZR4A 1SO4A 4GUHA 1WA3A 3QPZA 2DZSA 3U2OA 3KRSA 2A7NA 5K2ZA 4FIRA 1M6JA 4O1BA 1EIXA 4BWLC 3UY7A 2NUXA 4RZ6A 1TTJA 4JX6A 1MZHA 4UFJA 5D30A 1QWGA 3IGUA 2C13A 3E9AA 1JQVA 2X1RA 3PUOA 4JYFA 4X2RA 3HGOA 4FEZA 3B0VC 2ZRZA 4X9SA 1UB3A 4GUJA 3IIOA 2F7FA 4UR8A 1CI1A 3R2GA 1KLZA 1F05A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1TMQ A;  2X30 A;  3FOK A;  3VII A;  5IFP A;  3EGJ A;  4LWW A;  4R53 A;  4WOQ A;  2WM0 A;  4O8R A;  2QCG A;  1P7T A;  4ZOC A;  4DF2 A;  3CNY A;  3O6Y X;  4Y9A A;  3MY9 A;  2FZ9 A;  5CBB A;  4NNA A;  2E9L A;  3U0H A;  2Y8K A;  1ISZ A;  4MWA E;  3RG6 A;  4C5Y A;  1LLZ A;  2AQV A;  4TX9 A;  4AF0 B;  1BG9 A;  1QI4 A;  4FOK A;  3VCR A;  1OCN A;  3WEZ A;  3N2T A;  4AWE A;  4HMD A;  1IT8 A;  4LRS A;  4C60 A;  1E15 A;  4M0X A;  4FNQ A;  4C6F A;  3KLL A;  3V0T A;  4D6I A;  5H8M A;  3JW7 A;  5I77 A;  1SFL A;  2PZ0 A;  5I07 A;  1B90 A;  1UWS A;  4L9Z A;  4G8T A;  1H4P A;  4LQ1 A;  1M7J A;  2VGI A;  4V2X A;  1S2T A;  3A4X A;  2VQU A;  2X16 A;  5EKY A;  1A47 A;  2BGS A;  3S2N A;  3WQ4 A;  3WLR A;  5EBU A;  1EF2 A;  3B40 A;  4PBE A;  2AOS A;  4I9M A;  2A21 A;  3RRA A;  2DPE A;  1TO3 A;  4UQ9 A;  2PDI A;  1ZLP A;  3QN3 A;  4LVF A;  3HN3 A;  1J93 A;  4AVO A;  1MW0 A;  4LJ3 A;  1H1Z A;  2B7N A;  1E6S M;  3STP A;  3T7V A;  2PDQ A;  3U9I A;  4W8L A;  4YNG A;  3VGE A;  2CC0 A;  3MPG A;  4WGX A;  4CQ9 A;  3VIP A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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