3QMTA

Crystal structure of the mutant v182a,y206f of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with the inhibitor bmp
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
VMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGAGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIFLADNPAAAAAGIIESIKDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Conformational changes in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase: a structure-based explanation for how the 5'-phosphate group activates the enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus str. delta h
total genus 85
structure length 219
sequence length 219
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2011-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3qmtA00
4O15A 4UCGA 5HQEA 5K2ZA 4FX7A 3PB0A 2F84A 4FF7A 3S9YA 2Q8ZA 1IXPA 4FNQA 1TTPA 5AYZA 3P84A 4EWND 3ZFHA 3SECA 5EPDA 1KM0A 4GUFA 4WZHA 5BOOA 1TYGA 4O4WA 3HMJG 1M6JA 3TK7A 3GAYA 5F4XA 2NXHA 3MWAA 1TTJA 3M1ZA 4LVGA 3DFSA 2Y70A 1YLVA 5CSSA 3QW4B 3JS3A 1H62A 5FI8A 1G4PA 1QCWA 1RZMA 3DBPA 4N9BA 4Z0SA 2JK2A 1B57A 1ICPA 3L68A 4QIUA 2QCLA 3LGEA 1G4TA 5G4EA 5DBUA 3FFSA 4DF2A 4EF9A 3NXFA 4CNPA 1H51A 1LCOA 4XQ6A 2DZUA 5D38A 1OX4B 2JGYA 5U7SA 4E0CA 2WJZA 2ISSA 3N9RA 5EYWA 3PBWA 5KINA 3SIZA 2P1FA 1QO2A 1G7VA 1F5ZA 3ZS4A 1YYAA 1L6YA 2DP3A 4ICNA 3NEVA 3GXTA 8TIMA 3DAQA 1W5PA 3W76A 3MYOA 3TIMA 3B03A 1XDLA 1O4UA 4ZQNA 1X8FA 4K6AA 3G3DA 1JQVA 3CC1A 1K8ZA 3NGJA 1TV8A 3HOJA 3TQVA 1TPUA 1GYNA 3G1YA 3BVJA 5IM51 5F2MA 3TQKA 2ZTJA 3W71A 3P82A 3SJ3A 5I3IA 1R2TA 1SW7A 3IVTA 1FDJA 4MLJA 4XKYA 4NJHA 4YXGA 5C5YA 3W1LA 3L67A 4LV4A 1I2OA 1GT8A 1R2RA 3BARA 3W7KA 3GR7A 1ZJIA 4O54A 1T8XA 2OX1A 1WOBA 1WX0A 4UTKA 3D0CA 1TPB1 4JTHA 2PE4A 4UNLA 1KV5A 4JNMA 1QNVA 5LGZA 3TAOA 3QQ0A 5DELA 1NF0A 2B7PA 3NAVA 4JD4A 1HUVA 3W84A 2C0AA 3OIXA 1X1ZA 1OABA 4O0KA 3PG8A 5FEWA 3LTYA 4QQ3A 4RXGA 4JIQA 2J88A 1MEHA 5GVJA 3MJYA 1KM3A 1BWLA 4LVBA 3S5NA 4YWIA 2EF9A 1WYIA 3IVSA 4DBEA 2E5BA 4IMEA 4KFNA 4I7WA 3EX3A 3LBCA 1TIMA 3TCEA 3JR2A 3E49A 3C61A 3LI0A 2RDTA 3O07A 1OJXA 2GVLA 4IMFA 4JTTA 1CW2A 5DXXA 5D2TA 1UCWA 3LHWA 4FX6M 4JTGA 3USBA 1KM2A 1TPFA 4MOZA 1JCLA 3NQ7A 1E51A 3W1AA 1YTKA 5LNRA 3EWXA 2ZZ3A 4TU1A 5TQLA 4BWLC 1WBJA 3HQ1A 4FO4A 3TX9A 4DQWA 1B4EA 1F7BA 1KA9F 3CTLA 1OYCA 2TYSA 3LBMA 4DBDA 1C9DA 1D3GA 4R33A 3O05A 4DPPA 2E09A 1Z48A 1TV7A 2G5WA 4ZQCA 3W2NA 4JIPA 5LSMA 4E2DA 3OG3A 1VHNA 2TPSA 1HO1A 3O1NA 4WJEA 2O7QA 4RR4A 3MHGA 5D2YA 1A5CA 1EX5A 2A6LA 4FEZA 5FF4A 1FWTA 2ABBA 2C18A 2FJKA 5L9FA 4TIMA 3I6RA 4M19A 4M6PA 4JEQA 2V0TA 5F1UA 3VKJA 3T40A 3C6CA 3MW7A 1Q6OA 1SO6A 2QAFA 2NWRA 5A8GA 1XUZA 3E0IA 4UC5A 3W1XA 3W7CA 3QQ1A 1OK4A 4UFIA 1MXSA 1YTDA 1ZY9A 3F4NA 2ABAA 2VELA 3KHJA 2C13A 1VYPX 4CQ8A 5HULA 1QPRA 5AHMA 3IRDA 3NQ6A 3BGJA 3LXBA 2QF7A 1FXPA 4JS3A 4FNUA 2ATSA 2FB2A 4I7UA 2WNNA 3O16A 2Y7FA 5CKSA 4Z08A 4N6FA 3NZRA 1QPOA 4O18A 2AGKA 1FDZA 2FPTA 4JTLA 5IBXA 1Z44A 4NVTA 2VFEA 3GAKA 3C2VA 5HWNA 2GVJA 1JULA 3LV5A 3TXZA 4JTIA 3PC0A 3OHIA 3TFXA 3I7RA 2ZTKA 3DHDA 5E0KA 4GJ1A 5KSWA 2WNZA 2HSAA 4MLRA 5LZLA 4CCEA 3GXPA 4PL1A 1WXJA 1GVOA 1H7XA 4AH7A 1YPIA 3DFTA 2X1RA 2ZBTA 1I2NA 2NX1A 1ZFJA 3LM7A 1ICQA 1I45A 1TPC1 4LW7A 1N7KA 3BLFA 4MY1A 2QUVA 2RDWA 4A22A 1ICSA 3W6YA 1EB3A 2ATMA 4NZJA 5HR6A 4ZQOA 4POCA 4MZYA 5D2WA 2CZDA 1LRNA 3C0JA 1SSGA 3LCWA 1R30A 4RCXA 3IIVA 1H1ZA 2C19A 1V5XA 1B4KA 1PIIA 2YYTA 3PBVA 4D2JA 3NQGA 4P2VA 1ML1A 4CCDA 1PS9A 4BR1A 2QCCA 2H6RA 1OX4A 3MI6A 3C56A 3WK0A 1S5VA 2A85A 2G95A 3QZEA 1Z42A 2NX3A 3PBUA 5A5WA 1JRBA 2AQWA 3N34A 3CWOX 2ZA1A 3FIGA 2NWSA 4O28A 3STGA 3L21A 1K8YA 2X16A 1DV7A 1B9BA 1ZNNA 3C2RA 3VNDA 4FB7A 4KWVA 3M47A 4IMDA 1I2QA 3M5ZA 5G4WA 3R12A 3TNOA 3M9YA 4CQAA 1O5XA 3PUEA 4MIMA 1SFJA 3GK0A 3C4UA 2E5DA 1LRQA 3FS2A 4GWEA 2R91A 2DJLA 3BPWA 3WJYA 1TJRA 3HO8A 3O06A 2ZFAA 1XFBA 2RH9A 3MP4A 4QAIA 2YCEA 5G1TA 4LNYA 5AHFA 4PTNA 1HL2A 3NQVA 3Q94A 1X6UA 6TIMA 1Q3NA 3GDTA 4UIOA 1K8XA 4IX2A 2B7QA 3UD6A 1XXXA 4BFAA 2R94A 4OQVA 1KLZA 4C1LA 3GX9A 3W88A 4FIQA 5KZEA 3ABOA 5DY2A 1W0MA 4N9DA 4QJ1A 3W2KA 1G4SA 4A2RA 2W79A 4RK8A 4S2CA 2ZZ6A 5K4XA 1W5NA 1A5AA 4GRSA 4LUJA 3P74A 4UTIA 1GG1A 1MO0A 3C8FA 4RKAA 2Q3RA 5G2HA 4O1AA 3FKKA 4E2BA 1J2WA 1W3NA 2Y7DA 5LGXA 1NEYA 1VLIA 4O13A 1GTEA 3LRLA 1M5WA 1F6KA 3KXQA 4A21A 5D04C 1G69A 1L2UA 3FKRA 3TSMA 3GDKA 3PVFA 4IOTA 3GIYA 4ZQPA 1LP6A 3EB2A 3QPYA 1Y0EA 4Q32A 3P62A 3QM3A 3CEPA 1GQNA 1GWJA 3FA5A 2Q8LA 4FNTA 2BWGA 2A5HA 3E96A 4JN6A 4WUIA 4Z1DA 1HG3A 3ATYA 4AVFA 2JKEA 1K02A 3W7HA 4MFEA 4Z1BA 3O8AA 1GEQA 2OJPA 3DFOA 1QFEA 4LVDA 1FBAA 3TC7A 4ZVJA 1CI1A 4Y96A 2V9DA 1TCDA 1FQ0A 3F1QA 3DH7A 3G8RA 3GLCA 2O7SA 4CCCA 3MUXA 2EPHA 4MFDA 1L9WA 2QAPA 3E9AA 4UMBA 2V30A 1JUEA 3STEA 2A0NA 5EKYA 2QCDB 5D2VA 4HIBA 2JKAA 1DOSA 4NT0A 1W5MA 2J9XA 1H63A 1UASA 3TKFA 4FXRA 5AHNA 5LKYA 2CWNA 1QWGA 1FCQA 3I7SA 4BWLA 1KW1A 1TQXA 2FTPA 5KZMA 4AAJA 1EA0A 1XC4A 5AC6A 1DQWA 3CHVA 4NJJA 2CLOA 1O94A 5KTLA 2BXVA 1LLZA 3G18A 1SZGA 3GDRA 3GKFA 4M6QA 3S1VA 1Z41A 4JDYA 4LS1A 4ZQMA 3WJZA 1JCYA 3L5MA 1QMLA 5HR7A 1AMKA 2CW6A 3CPRA 4QM1A 4JTUA 4MZ8A 1GG0A 3KAOA 4N02A 3DENA 4YL2A 5D05A 4HHPA 3NYZA 3LOTA 1KLYA 3NNTA 3HPZA 3CLMA 4JY9A 2UV8G 3G1VA 3LHZA 4AHPA 5LNUA 4N9EA 1FWWA 3W1MA 2WSYA 3STFA 4UMAA 3S5ZA 2ZDRA 3DXIA 1FCBA 3P8IA 5EY5A 1XUUA 2RDUA 5G5IA 1H7OA 2FQIA 3LERA 3IGXA 1OFPA 3RFAA 1TRDA 2GUUA 5C2XA 2E5CA 3UWUA 1SPQA 4NJIA 2XN1A 4N6EA 1HTIA 5F1VA 4IMGA 3L0GA 5BNKA 4PODA 3TXVA 2JGQA 2VEPA 2QDHA 1DBTA 4JXCA 4HKPA 2FPVA 5DCBA 3DHFA 1ZCOA 4TR9A 1FDYA 3TW6A 3P7YA 4BI5A 3G0XA 5BMXA 2NLIA 4LC6A 1BWKA 5DCDA 3LTPA 1YADA 1GTHA 1IXQA 1TREA 3EX2A 2DORA 1PCWA 4IWWA 1TB3A 4O12A 3LDVA 4GC4A 3GDLA 4ZZ9A 1VYSX 1GVRA 1KTBA 1LLWA 3H54A 3N3MA 3W9ZA 3HG3A 2FB3A 1U83A 3UWQA 2B0MA 1W31A 3W7QA 2PCQA 5K4ZA 4TO8A 3UPWA 4HNTA 3CB8A 4HNVA 2QJGA 1B3OA 1W1ZA 3O15A 3SFKA 3W70A 1H7RA 1QR7A 1DL3A 4AF0B 3C2OA 3H55A 1FWRA 1ZALA 3TJLA 4IPJA 4MJMA 2ISVA 2YX0A 3B0PA 3M5XA 4YCPA 3VI2A 3NVTA 3S5OA 4FHAA 1FWSA 2NUWA 2Y6ZA 3MBFA 3WJWA 2E6YA 1JCJA 4JYDA 5F2IA 2ZA2A 4UFJA 5K3VA 5CPOA 3BG3A 3EXSA 1MZHA 4GBUA 2V5BA 1M7PA 1IF2A 2DZPA 1R2SA 3CIXA 1PHQA 2H8XA 1OF6A 1VH7A 4KFOA 3W2MA 4QSHA 1VCVA 1NAL1 2E6AA 4MZ1A 2Z0IA 5D02A 1H60A 1YXYA 1F74A 1RQHA 4FXSA 1SUXA 1LORA 1DJNA 4AEOA 4JICA 3BV4A 1K3UA 4OWGA 3B04A 1OX5A 2NXIA 1UUOA 1QPQA 1YDNA 3Q37A 4IXXA 3LCGA 1BKSA 2EAWA 2ZZ5A 4MY9A 3CT7A 3DZ1A 2VFFA 5C55A 1TJPA 3OA3A 3O6DA 2YYUA 2ZRWA 4AHOA 1XDMA 5FF0A 1RR2A 3WJSA 1F2JA 3BG9A 3A24A 3TV8A 2CLEA 3EWYA 1VRDA 1NVMA 3ABQA 2DZVA 3E12A 1SO5A 3GVGA 2FFCA 1H1YA 1XI3A 2A7RA 2YW3A 3IV3A 1JUBA 4JDBA 3A5VA 4FNRA 2QCGA 2XFWA 1O95A 4DO4A 4FIRA 3W22A 3PBYA 3MBDA 4ORIA 1TSIA 2WV8A 3LCXA 1I4NA 4N2YA 2VENA 3GYEA 2OZ0A 1ME8A 3ANYA 3P5YA 1SFLA 3NQCA 4M6VA 3NO5A 2J9YA 3LHUA 4UTJA 1F76A 1RQEA 3QSRA 4K38A 5AB3A 4O4VA 4ONVA 1XBZA 4NJKA 3PWAA 4DO6A 1Q6QA 5AHLA 3EKLA 3SR7A 2W6RA 3W7RA 1W5QA 3G1SA 3VE9A 1WBHA 3NQ8A 2ZA3A 4MPQA 1P5BA 3THQA 2Y7EA 4AB4A 4BK9A 1TV5A 1VLWA 2YR1A 3LLDA 3TMQA 3BGGA 3LCFA 3W7JA 1WOAA 4L4LA 5FESA 5CPMA 1K7XA 2QCDA 4O50A 5G1YA 4MJZA 1SSDA 2DZTA 4U4MA 3ZWTA 3ABSA 2PURA 3R5EA 3NPXA 3I7QA 4ADUA 4JTEA 3W07A 4NXSA 3BW3A 3IIPA 4LRTA 3WK1A 3KRZA 1QPNA 4CLMA 3O6YX 5CZ0A 1AL8A 3TE9A 1LTDA 2Y62A 3RLUA 3LRKA 1S5WA 3UY7A 2JBMA 3LRMA 3SZ8A 1M7OA 4WOQA 4JY8A 1DQXA 4MKNA 3MO7A 2G96A 4K39A 4NX5A 3M5YA 4O10A 3PM6A 4K36A 1Q6LA 4O1CA 2H90A 4UTTC 1TPH1 3EX6A 5C6MA 1UB3A 4UTHA 3SI9A 1THFD 3W2JA 4WOZA 5K9CA 5F2GA 2NX9A 5U4NA 3HG4A 4JTKA 5G2WA 3P60A 3W7NA 4UFLA 2NV1A 3HPSA 4BI6A 3M44A 5FF7A 4IUOA 1KFBA 2GQ8A 1R47A 4LC8A 2QCHA 5I3JA 5G2IA 3BW4A 2C14A 3HBLA 2YSWA 2R8WA 4O14A 1VS1A 4JX4A 3FYOA 4O57A 2X1TA 2ZCGA 3SY5A 2E6DA 4MUZA 3M43A 1K03A 7TIMA 3RLVA 1SO3A 5AN7A 3G1FA 3UXDA 4ADTA 4WY0F 4H4IA 3HGOA 3HB9A 2FDSA 1TPEA 3LHYA 3H53A 1WDWA 1XBXA 3W1QA 4LUIA 4RJEA 2CLIA 1FXQA 5F4WA 3DKJA 3L65A 2YPIA 5D09A 3QH2A 2VXNA 3M5VA 3LX9A 3TFCA 3V75A 3HG5A 3LLFA 3HIJA 4UR8A 4LWWA 1QDSA 1PV8A 4S1FA 4PL2A 3IVUA 1G4EA 2W0UA 3NR0A 5T26A 4N4PA 5D03A 4UTMA 3F4WA 3EWWA 4YMZA 4X3ZA 2A7PA 5DBTA 2ZZ4A 1ME7A 3W1UA 3P61A 3M6YA 1SO4A 5D30A 3IEBA 3NPUA 1F05A 3P81A 2C6QA 3B05A 4UTWC 3RF9A 4AF0A 3W2UA 1MSSA 2YFOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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