3QRH | Genus

Total Genus 133

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	133
sequence length	337
structure length	337
Chain Sequence	MDCDHLLRLGMTAKKILENGKGILAADETPKTLGRRFEKLGITNTEENRRKFREILFSTKGIERYIGGVILNQETFEQTSGSGVPLTELLKKKGIEIGIKLDKGLIDYKEKEKISVGLEDLDLRCKSSAFKDATFAKWRSLFYFYDGIPSEDCINENCSILAKYAIICQKNGLVPIVEPEVFLEGDYSMKRSYEVTRQILSTLMKYLNYELVYIPGVLIKASYVTSGQLSNEKYTPKKVATFTLRALLSTIPCGIPGIVFLSGGHGSEDAIGFLNAINMERGCRTWSLSFSFARALTDGVLETWRGDDSNIEEAQKILLETSFKACRGAEGKLWDQE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	Fructose-bisphosphate aldolase
publication title	Crystal structure of fructose bisphosphate aldolase from Encephalitozoon Cuniculi, bound to glyceraldehyde 3-phosphate rcsb
source organism	Encephalitozoon cuniculi
total genus	133
structure length	337
sequence length	337
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2011-02-17

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00274	Glycolytic	Fructose-bisphosphate aldolase class-I

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3qrhA00

2A2IA 3BW3A 1TRDA 4MY8A 1TO3A 4M6VA 3VCRA 4HNTA 2RFGA 4FXSA 1I2PA 5FEPA 3F1QA 2VELA 3OBKA 5D30A 1RVGA 2BZNA 2LLEA 2V30A 3F4WA 5D05A 1TJRA 3C56A 3EXRA 2EAWA 3D0CA 1H7NA 4K6AA 4LRSA 2DP3A 4O19A 4A2RA 3QM3A 3PG8A 1BWKA 3C8FA 5KITA 1ICPA 1YLVA 1A5CA 2YGYA 4LC6A 1KV5A 3HMJG 3P84A 5F4WA 1ZCOA 2ZRUA 3F4NA 4JDBA 1IXNA 4UTHA 3LCGA 4LS1A 4JTIA 1I8JA 1TPB1 4O1BA 1YDOA 1FXPA 3P62A 3CHVA 3DFNA 4AXKA 3O6YX 2GUUA 4MPQA 4O10A 3TAKA 1UASA 2R14A 3BGJA 2ZZ1A 1SZNA 3S9YA 3T7VA 4NU7A 1T99A 5A5WA 3STFA 3DFTA 1AL8A 1KM2A 4FEZA 4O1AA 2GQ9A 1LROA 5FEZA 2QAPA 3V75A 4RK8A 3ABQA 3CB8A 3WFAA 4O8RA 4JTSA 3L5AA 1LBFA 3W7EA 5LGZA 1QAPA 1GVQA 2ZRYA 4LU0A 2VEMA 1FQ0A 1M7OA 3UWVA 4CCEA 3S5OA 4XZ9A 4XTDA 1V5XA 5BMWA 1Q6RA 3GDMA 4NJIA 3W7HA 3NGJA 4FX7A 2B7PA 3HQ1A 4ALDA 1Z48A 4NZJA 3H55A 1AW1A 3BLIA 4N9BA 1R2RA 1SO5A 5F2IA 4JYEA 2QJIA 4KKXA 2DZSA 3PUOA 3GIYA 1GWJA 3LHVA 4ICNA 4UFHA 1P4CA 3G8RA 4YLWA 3MBFA 4ZVJA 1Z41A 4CQ8A 4OQVA 3G8EA 4WOZA 5LZLA 1YTDA 2ZZ2A 3QQ0A 1H1YA 3IEBA 5AB3A 1ML1A 2ATMA 2ALDA 5EMUA 3HPSA 1DKWA 3HGJA 1DJNA 5C55A 2NX1A 2A7PA 5LNSA 4UIOA 2HS6A 5EL1A 2WSQA 4OBTA 4N4QA 4O50A 2CLKA 3BG9A 3QRHA 4CCCA 5HWNA 3L9CA 2C3ZA 1HG3A 4GUHA 3T44A 5LSMA 1X7FA 3GAYA 1FWRA 4UR8A 3BVJA 2VFDA 4PCFA 4MOZA 1Z42A 3GAKA 4DBDA 3PBVA 3M44A 3MW7A 5G5IA 4UFKA 1NF7A 1FXQA 4Y9AA 3GX9A 1KM3A 2ZA3A 3W2LA 1L9WA 3NQMA 2QDGA 1CX9A 5IBXA 3W1UA 1FWSA 2GQAA 2C13A 4JN6A 3M47A 4WY0A 4XWUA 5F1VA 3A22A 3SIZA 1B9BA 3W1LA 3FFSA 4UTLA 3W83A 2DORA 5EYWA 1YADA 4K7YA 1RQHA 4GUIA 3MP5A 2JBMA 5AHFA 1WOAA 2TPSA 2WKJA 4GWEA 4UR7A 3FKRA 2V5BA 1T8XA 3NL3A 3LXCA 2QCDA 4UFJA 2B7QA 4UTKA 2P0OA 1TSIA 2W6RA 4Q33A 1SFLA 2FPVA 4FNQA 3W22A 1GVRA 1P1XA 3UPBA 3HOJA 1ICSA 3A5FA 3ATYA 2Q3RA 1KA9F 4EF8A 1VYPX 3TSMA 1C9DA 3I7RA 5AN7A 1ZENA 4IMEA 2E1DA 1LP6A 4RKAA 1VR6A 2XN1A 2YFOA 5SWUA 1OFOA 3R89A 1WAUA 2R8WA 1A53A 2E6DA 3P5ZA 1NVMA 5C54A 3M5XA 1K8YA 2CZEA 1ALDA 2Y85A 1PE1A 2BX7A 2KZHA 2V81A 3PG9A 4NNCA 3W7RA 2E68A 1RQEA 3TK7A 3QW3A 1R30A 3RNDA 2C0AA 1OYCA 4YXGA 4JS3A 4NVTA 2Z2UA 2V8ZA 4H6KA 3IGUA 3LHZA 2FIQA 5KSWA 3UWYA 3W7NA 5CPLA 1KFLA 2E5BA 1TTQA 3GDTA 3IGSA 2NLIA 3UQNA 3W7JA 5TQLA 1K7XA 3NPVA 1W31A 3C61A 4ADUA 2NUYA 1Z44A 4BWLA 2ABBA 3WJXA 1MSSA 3W74A 1FBAA 4C1LA 4BI7A 6ALDA 2QDHA 3WK3A 2FB3A 2ZZ6A 1GOXA 1UJPA 2Z0IA 4AF0A 3IIZA 1G4TA 1THFD 2VOMA 2XN0A 3BLFA 1Q45A 1WDWA 1J2WA 2NUWA 5K3VA 3I7QA 1L6WA 5IBXC 1LLZA 2VFGA 4R7JA 1MZHA 3CWNA 5LNRA 4LC8A 1OK4A 2Z6JA 4JTFA 1W54A 3H53A 3SW6A 3I68A 4N02A 1L6SA 3DHDA 3NR0A 3O1NA 4LV9A 5F4SA 4LVFA 4IXHA 4EIVA 5KMYA 4IX2A 2H8XA 1F05A 2B4GA 4TMCA 6TIMA 4AAJA 3L66A 1KLYA 4LVGA 4UTJA 1VQTA 4JTTA 3UY8A 1KFBA 1IGSA 3FLUA 3I7SA 1TPEA 4MUZA 1PVNA 1ZALA 2DZWA 2G5WA 3B0PA 3S8HA 4FB7A 1YXDA 4FX6M 1CI1A 3MI6A 1W8SA 3WJZA 2VENA 3HPXA 1SZFA 3P67A 2Q8LA 1VPXA 3LV5A 2NV1A 1DJQA 3LM7A 3L65A 4L4LA 3ELFA 2I1OA 4P61A 1F6KA 4UFMA 5D2XA 1IXOA 3KAOA 3C3NA 3R12A 1SZEA 1C8VA 4YWIA 4FNUA 3DH7A 3R13A 4E38A 1CW2A 1LRNA 4MJZA 3LBCA 4MYAA 4B5NA 4JDYA 3FIGA 4AB4A 4FF7A 1QWGA 4PODA 2WJZA 3T40A 1PS9A 5ABTA 3B06A 2JKEA 5DY3A 4AH7A 2JKAA 3EX4A 1P0KA 4IWWA 1K8XA 1RPXA 2WNZA 3PSWA 4FNTA 1GVFA 1DQXA 3LTSA 2PCQA 2XFWA 4M6PA 4GUFA 2QUTA 1GZGA 3LX9A 3UWWA 3QH2A 3SSJA 3WK1A 3DKLA 3HG4A 4A29A 3W23A 3NL5A 3UXDA 2PURA 2J27A 3EX3A 4TR9A 2QAFA 1LTDA 1TB3A 2QR6A 2FPYA 3G1XA 1M7PA 3W87A 3S42A 1TQXA 1MEWA 3NQCA 3W2MA 2QCLA 2OT0A 2ZRZA 4UMCA 2DU2A 1K3UA 1O94A 3PUEA 1ZNNA 3HGOA 5FEXA 2NWRA 2ZRWA 4Q32A 5AFDA 2CLEA 5HUPA 3N2XA 1OVDA 2YX0A 3CQ0A 5FF3A 4IJBA 1R47A 2CZFA 3FOKA 2J9YA 4WXZA 3UXAA 3O6CA 3LHTA 3ANYA 3PS7A 1GVOA 3LCFA 3NQDA 2P10A 1P5BA 2ZRXA 5AYZA 2E6AA 3OEXA 1TPC1 2Q8ZA 5D2TA 4LWWA 4OV9A 4JYDA 1OABA 1OYAA 1PCWA 1HUVA 3G1AA 3PBWA 3BW2A 4DO6A 4BI5A 3G1FA 4O1CA 1EP1A 1OFAA 2V0TA 4JGDA 1G4EA 4JX5A 2WNQA 4CNNA 1S3HA 2Y6ZA 3HO8A 3DZ1A 1S5TA 5DBUA 3B0VC 2A7NA 4FO4A 3DKJA 4IX0A 3MWAA 5I3IA 5CPNA 1W1ZA 3KOFA 3G1YA 5BRBA 1SQ7A 3C52A 3VI2A 4O28A 3NEVA 4IOTA 3DFOA 3NQ8A 4DO5A 5TIMA 4N9DA 4WD0A 3NXFA 5AC7A 4ZMGA 3TR2A 3M6YA 1EUNA 1A5BA 5AHNA 3RU6A 4AWTA 5K2ZA 3L5LA 2RDWA 3P74A 1EA0A 3TW7A 3KRZA 3O07A 3B0UX 1I2OA 4UXDA 3K30A 2CLOA 2NXGA 4HN4A 1GJPA 4JR5A 1R2TA 5AYXA 3SGUA 4QQ3A 1VGAA 1QOQA 3IIOA 3U6WA 4NT0A 1QPNA 3TC7A 1QPRA 2H6RA 1JCMP 2I14A 1MO0A 3V1PA 3VKJA 5DBTA 3TQVA 2FFCA 3KFTA 1XBXA 3LI0A 3O6DA 2B0MA 3GXPA 3MO7A 2GVLA 3OA3A 3AO0A 5LHFA 2TSYA 3BLEA 3T4CA 1XKYA 5D32A 3E9AA 1KFEA 4R34A 5BW6A 1KBJA 3W72A 2V9DA 5MHBA 5DELA 5K9DA 4UTWC 2H90A 4N2YA 3GVGA 4S2CA 3DI0A 4ML9A 1IF2A 2JGQA 4AWSA 2W79A 3GB6A 1NEYA 3EWUA 5CZTA 5IM51 3EX2A 4ZZ9A 2GVJA 5F4XA 3VE9A 3IVTA 3W1TA 5G1TA 3GDLA 1Y0EA 2Y7DA 4HPXA 5CGQA 4O57A 1LORA 5U7SA 4M6QA 3LCWA 2YDAA 1TJPA 4JTKA 1W5NA 1SSDA 3PC0A 4ADSA 3VFLA 2Y63A 1H5YA 5DN1A 1WV2A 4MFEA 1UCWA 1ZAJA 3CIWA 3MJYA 1JCYA 2Z6IA 3A5VA 3EEGA 3N3MA 5FEWA 3DHFA 1ME8A 1SW7A 2Y70A 1QFEA 4O4WA 3NL2A 3KVLA 4MY1A 2J6XA 5EBUA 4AWUA 4DO4A 3LLDA 2VFIA 3GKAA 2ZTJA 2TYSA 1NFBA 4JX4A 2PRMA 1Q6LA 4TIMA 1D9EA 3G0SA 1LRTA 1VC4A 3LHUA 2DJXA 3CTLA 3L0GA 3P60A 4WQ6A 3QMTA 3MYPA 1JJKA 4KFOA 5BNKA 1YTEA 3M1ZA 4Y8FA 4TU1A 1AW5A 3M9YA 1X1ZA 3INPA 3IIPA 4C1KA 1RD5A 3EWBX 4CQ9A 1ME9A 2H3BA 3S1WA 2BXVA 2VXNA 3IIVA 4ZQNA 1ZJIA 1LBMA 4NNBA 2ZCGA 3WJYA 3SFKA 2BTMA 2YW3A 3E49A 2CLIA 2X30A 4QNWA 4PEKA 1W3IA 4TMBA 1VLIA 5CG7A 2AQWA 2HSAA 2JKPA 1OF8A 2V2HA 4PTNA 4POCA 3HG5A 1ICQA 5FF7A 2OMAA 3G0UA 1XM3A 1EX5A 4LW7A 3PAJA 2JK2A 1BKSA 4NJJA 2B7NA 2P1FA 4BF9A 3UYCA 3GZ3A 2A4AA 3W2UA 3FJLA 4CCDA 3O16A 4WUIA 1KFCA 3W7DA 7TIMA 3H54A 3NQGA 1YDVA 5DXYA 3BG3A 3OVRA 1ZAHA 2FPTA 4LT9A 2CLLA 3EKLA 1W5OA 1XXXA 1FWWA 4XKYB 3HG2A 4ONVA 4KFNA 4TO8A 5EY5A 2VFFA 2V5LA 2J88A 4N4PA 1F2JA 1M5WA 1WX0A 3N9RA 4YCOA 3OVPA 3GK0A 2ISSA 1LM1A 3GKFA 1GEQA 2CZ5A 1HO4A 4LOCA 5D2YA 3FA5A 3NOEA 3L21A 1W0MA 4X22A 3BO9A 3B03A 4A2SA 5DCDA 3ABOA 1VJIA 5CZJA 4UFLA 5LNVA 3TH6A 3LCXA 2CU0A 3B4UA 5E93A 4JXCA 3I6RA 3TKFA 2IQTA 2BWGA 4HNNA 4XUGA 5KINA 1FCQA 3NQVA 4LRTA 1O4UA 1ADOA 3C2RA 1OFPA 3S6DA 3W2KA 3BPWA 3SJ3A 5I3JA 3TNOA 4Q4KA 2UV8G 2FTPA 8TIMA 4Z1DA 2O7QA 1OX4B 3TV8A 4ZQPA 4ORMA 2QEZA 2OZ0A 2WO5A 2Q3OA 3P61A 2A21A 3UNDA 1OFDA 1V7YA 1O95A 1QDSA 4WZHA 1RV8A 4D2JA 4Z08A 4UC5A 1VYRA 3QQ1A 1LCOA 3PY2A 3PF3A 4YL2A 3S5YA 4S2BA 3W84A 3KX6A 4LV4A 2J24A 3W7QA 3R2GA 4WOQA 5L6UA 3C4UA 4HSNA 1KLZA 4RLIA 4NQ1A 4I7WA 2OX1A 1FCBA 2X2GA 1VRDA 2DZTA 3W1AA 3NPXA 4O53A 3L2IA 1VZWA 3M5YA 1G7VA 3MP3A 1WYIA 4JY8A 3Q58A 1TRIA 3EX1A 2Y88A 2YXGA 5K4XA 3ZS4A 1F5ZA 3PB0A 1RZMA 5G4WA 4UUIA 3O8AA 3W7PA 1PHQA 3I65A 1XL9A 4EVZA 3G1SA 1JRCA 2QCCA 4LVDA 3MUXA 5D33A 5FF0A 2RH9A 3TC6A 3FS2A 1XUZA 5H91A 4QSHA 4N6FA 1EB3A 3EXSA 4DPQA 1XFBA 4ZQRA 3UWUA 5HMSA 2WV8A 3C0JA 1O5KA 3NQAA 1EWEA 1E51A 1QPOA 4WJEA 2QKFA 4FX8A 1H60A 2WQPA 3RFAA 1HO1A 1H51A 3CM4A 1EUAA 3L68A 3QF0A 1IIGA 4ZL1A 1O60A 4GUGA 1SO3A 2ATSA 1UUMA 4BK9A 3LRMA 5J5RA 3TU9A 5DLCA 1UUOA 3P5YA 3W7KA 1K8ZA 3PUDA 1K02A 1FDJA 4UNKA 3A24A 3IVSA 3W1RA 3G1DA 1HL2A 5G2HA 2RKXA 3BGGA 3EWZA 3QPYA 1YDNA 5U4NA 3IVUA 3DBPA 4JICA 1HTIA 4U28A 4MFDA 4K39A 4K8HA 4IPIA 3UPWA 3PSVA 2BSLA 3W75A 1S5WA 3PULA 3MI2A 3ZR4A 4DF1A 3W7GA 2QCMA 5D37A 5T26A 2A0NA 2EPHA 1RQBA 2VEPA 1AW2A 1H50A 2V2DA 4MZ1A 5LNUA 1G7UA 1OFBA 4DPPA 4RX0A 3TROA 3M43A 3TSDA 4IMDA 1R46A 3HG3A 1H7PA 4XQ6A 4EOUA 3OIXA 3C2EA 2FDSA 1TTIA 3TSBA 2VEKA 5KZDA 1AK5A 5AC6A 4YCPA 3F03K 3SECA 1DL3A 1EWDA 2QF7A 3LRKA 3CEUA 1FCUA 3GYEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3QRHA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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