3QW3A

Structure of leishmania donovani omp decarboxylase
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
255
structure length
250
Chain Sequence
MSFFDLLNERAKRSLLCVGLDPRAKTAAAAVEECKRLIEQTHEYAAAYKPNAAFFEFFGAEGWAALSEVIRAVPAGIPVVLDAKRGDIADTADAYATSAFKHLNAHAITASPYMGSDSLQPFMRYPDKAVFVLCKTSNKGSNDLQCLRVGDRYLYEAVAERAEGPWNVNGNVGLVVGATDPVALARVRARAPTLWFLVPGISLKASLDAGLRADGSGMLINVSRGLARAADPRAAAKELCEEINAIRFAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Leishmania donovani UMP synthase is essential for promastigote viability and has an unusual tetrameric structure that exhibits substrate-controlled oligomerization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine-5-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltr
molecule tags Transferase, lyase
source organism Leishmania infantum
total genus 94
structure length 250
sequence length 255
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2011-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3qw3A01
2J88A 4UMAA 1OF6A 3S0CA 3SGUA 5FEXA 2BSLA 5T26A 3OVQA 3PUOA 1W37A 1FWWA 2RDUA 2BTMA 3NAVA 1LOSA 5K3VA 2B7QA 3TU9A 2ZZ7A 5DCEA 5F4SA 3HGJA 1K8ZA 3HG2A 1I2NA 3LV6A 4WUIA 2CLOA 5K9XA 5TQLA 2VEMA 5DXYA 4MZYA 3C6CA 5LSMA 1B4EA 4Z1AA 4WOZA 3MI6A 1KV5A 4N9EA 1PHQA 1W5OA 3GVGA 1TV8A 1VC4A 1GYNA 4KFNA 3OG3A 1K02A 4AXKA 1T99A 2V81A 2Z6IA 1BTMA 4Y6GA 4N6FA 4DXVA 3LI0A 3Q2DA 2ABAA 1XDMA 4I7UA 4ALDA 1WXJA 3LX9A 4BWLA 3C2FA 3B04A 1I4NA 5BMXA 1B4KA 5CZSA 5EY5A 3TXZA 3TMLA 3QM3A 1LRNA 1JR1A 3LCLA 3QZEA 5J5DA 4JTSA 5AC6A 5I3JA 4O0KA 1XC4A 3E02A 1ONRA 1H60A 1LRTA 2FJKA 2WOQA 3TUUA 3WJXA 1EP3A 2YW3A 2B0MA 2GVGA 1OG0A 3N9RA 2CW6A 3EKZA 1BKSA 1H7XA 2YX0A 3OHIA 3UPBA 2O7SA 4R53A 5K4XA 2QCHA 3KVLA 5IM51 1SSGA 5FF4A 4CNNA 1NVMA 1P1XA 2ZA2A 4OE7A 1JCJA 1EUAA 1GVOA 2ZZ5A 3TJXA 4A3UA 2GOUA 4P61A 2GPTA 1C29A 4HSOA 1N55A 5DCBA 4MIMA 4WD0A 4XTIA 3IEBA 3IIVA 1XM3A 4I7WA 4GUJA 3G0UA 1VLIA 1G69A 3W1MA 3NM1A 4JY9A 1HTIA 3FA5A 3UY7A 1MXSA 4JX5A 1F76A 4GBUA 4LUIA 4MZ8A 3QF0A 4K39A 3W1RA 2W6RA 4A2SA 4HIBA 1C8VA 2ZZ1A 3W9ZA 2Z0IA 4FHAA 3NQGA 3QMRA 1F73A 1OX5A 3RMJA 4R34A 4OU1A 2LLEA 4GXMA 4X2RA 5DBTA 4XBSA 1SZNA 1VZWA 3TC6A 1LRQA 3QEZA 4NJJA 3P80A 4OGZA 4K7VA 3F1QA 3ABRA 1ICSA 3Q94A 1LROA 5D38A 1H5YA 1K7EA 1TTJA 2TYSA 4JIPA 3P8IA 3PS7A 4HN4A 3W07A 1SO5A 3W7PA 1ZHAA 4TR9A 1L2UA 5D33A 3W7RA 1VLWA 2E6YA 1OF8A 3EWBX 3W71A 1RPXA 2XN1A 1S5VA 1U83A 2V9DA 1FCQA 3OA3A 4EF8A 1V5XA 4GRSA 2CWNA 1KLYA 1XDLA 2OT0A 2Y88A 1O94A 1W3IA 1YDOA 5KZEA 1IXQA 4AF0A 1KM1A 3TCEA 2E6DA 3NPWA 1ADOA 1FDJA 4RR4A 4A21A 3NQ6A 1JRCA 3W73A 4PL2A 2QEZA 1QOQA 4NNBA 2XFWA 1Q6RA 4U4MA 5AHIA 1S5TA 5FF2A 1JQVA 2YCEA 3TQKA 3TFCA 3ATYA 2B7OA 1H1YA 2A85A 1LDCA 1GG0A 5FEZA 4LNYA 4CQ8A 3SIZA 2CZEA 4FNSA 4P2VA 1AG1O 1R2TA 3CHVA 1FWTA 1QAPA 2TSYA 3Q37A 1ZJIA 3LERA 1EA0A 1PE1A 5F4WA 3W7NA 1YYAA 3N2XA 3VKJA 3W7QA 2GJNA 2ZRYA 2QF7A 2QKFA 2VFFA 4UFJA 3W7JA 3IGUA 4Z0SA 2PURA 2EHHA 3LTYA 4PH6A 4UIOA 3UWUA 4UFIA 1OFOA 1G4TA 1YPFA 4NJHA 1ME8A 3UZJA 2BX7A 1FX6A 3TJLA 1XUUA 3NL5A 4UR7A 3IIPA 3W3OA 4PODA 2VFHA 2ZZ2A 2VEKA 3WFAA 3M5VA 3PR2A 1F74A 3STEA 3I7RA 2ZBTA 2YYUA 1LLWA 4E2DA 3T55A 4O1BA 4NXKA 4MVAA 1L6YA 1IIGA 1LORA 2RKXA 2A6LA 4UNLA 3BV4A 3QRHA 5G2IA 3MBFA 4LS0A 2YGYA 4UTKA 5EL1A 5CPNA 4O19A 3BW2A 2H6RA 2FTPA 4EOUA 5LKYA 1MSSA 3W7CA 4QSHA 2C0AA 1RQBA 4AHQA 3PBWA 3BLIA 2QDHA 2ALDA 1ALDA 1B9BA 3MI3A 2EGZA 3S1WA 5C2XA 4YCPA 1TPB1 1HO1A 1D3HA 4YMZA 4O52A 3DFQA 5AHEA 1G6CA 3I7QA 3ZR4A 5ABTA 3DH7A 4N9DA 3FYPA 1UASA 3QQ0A 1ZALA 5TBOA 1ICPA 1KTBA 3TK7A 1DQXA 5G2HA 2W0UA 2G97A 4JTFA 4JEQA 4PFMA 4S2BA 4LTSA 2X1TA 3LTSA 1UCWA 1TPEA 3O6YX 2X1UA 1OABA 1FCBA 3W85A 3PB2A 1H7WA 1FBAA 4UTMA 3EXTA 5D2YA 1HO4A 1TPUA 4O1CA 4AAJA 3IIXA 3G22A 3M5ZA 2WO5A 3CLMA 3B06A 1X1OA 2RFGA 4ZQPA 2G5WA 4LVDA 1LM1A 3GAYA 1W5PA 2ZTJA 4Y90A 2V5BA 6TIMA 3JRKA 3NQ8A 1W8SA 2FDSA 4R7JA 4DF0A 3ZFHA 1M6JA 1W3NA 1KM4A 2ISWA 4JGDA 1XCFA 4N6EA 5LNSA 4MOZA 4C1KA 4MLJA 4NUWA 4O18A 3UWWA 5EKYA 4QNEA 1G7VA 2FB2A 1LTDA 5E0KA 2WPBA 3GNNA 4M5PA 1UB3A 2I1OA 2YPIA 4DBEA 3M1ZA 4PTNA 2WNNA 1IXOA 4NT0A 4JD4A 3M16A 4NJKA 4N9CA 4AF0B 3QSTA 3ATZA 1QCWA 3O63A 3WK3A 4LVAA 2QCDA 2Y63A 3USBA 2YYTA 3C8FA 4FO4A 3S5YA 3SGZA 3HGOA 4RZ5A 2JGQA 3L21A 1R46A 3G8EA 5D2XA 1K7FA 2WJZA 2QJGA 4MJZA 3LHYA 4LV4A 4O4VA 1A5BA 5J5RA 4NJIA 5F2IA 1QPOA 3M0ZA 1OX4A 2DU2A 3R13A 2ABBA 4OHQA 5F1VA 3W84A 3S5ZA 3L0GA 4EWND 3LCXA 1XBXA 4JXCA 5CZJA 2ZFAA 3P60A 2YSWA 1SW0A 3EB2A 3H55A 1GVSA 1H7NA 3PAJA 4DELA 4IXHA 3N19B 3IVTA 4NU7A 3I7SA 1F5ZA 3E49A 1Z44A 1IXNA 3DHFA 3E12A 1WOBA 4LVGA 4JR5A 3WJWA 4JNMA 1QDSA 3U8GA 2OMAA 4AH7A 2J9YA 4TU1A 2X2GA 4DF2A 5CG7A 3W70A 2WV8A 2NUXA 3NM3A 4Z1DA 2QAFA 3PBVA 3LCGA 4UXDA 1KLZA 3DKJA 4XQ6A 3FLUA 3NGJA 3F03K 3KVKA 1RV8A 3NNTA 2NWSA 1TJPA 5DCDA 4IPJA 1OYBA 5U4NA 1RQHA 4RZ4A 1AL7A 4GUGA 2YXGA 2Q8LA 3GLCA 3C3NA 1JCNA 2TMDA 4L4LA 3GAKA 3L65A 3QC3A 3LXAA 4YWIA 3VNDA 2NUWA 4FNRA 2C1HA 2J6XA 2A7RA 5G4WA 3PF3A 3P74A 4KWVA 3S5NA 3TIMA 1EUNA 1OFRA 1P0KA 3M47A 5HWNA 4RJEA 3W74A 4Q33A 3GR8A 3UY8A 1P5BA 3QYQA 1G7UA 2OCZA 2V30A 5D09A 2ISVA 3M44A 1EB3A 2RDWA 3MHGA 1QNVA 1RQEA 1DQWA 4MY9A 3GXNA 1OFEA 1J2WA 1KM2A 3T44A 5LHFA 5BMWA 2RDTA 3WJSA 2X16A 3FOKA 3G1FA 1GQNA 3TE9A 5E1QA 2V8ZA 1GWJA 3AJXA 4TMBA 1KFJA 2EKCA 3DFNA 4E0CA 1G4SA 4ZQRA 2R94A 2CLHA 3GDMA 3QH2A 4ZL1A 4CCCA 3HO8A 3LHVA 3NA8A 4XUGA 2H3BA 3UXDA 3QQ1A 4JYEA 1SO3A 2NLIA 4WZHA 1RVGA 3ABQA 4XZ9A 5F1UA 2FPVA 3R89A 3CWOX 4NZJA 1PS9A 3DFSA 4E2BA 3LHZA 3RU6A 5L6UA 3A21A 3C52A 3QFEA 1MO0A 1G4EA 1LBLA 4WQ6A 2A1YA 4UMBA 5D2VA 2VFEA 4K8EA 3UZ5A 3SY5A 4IPIA 5DY2A 3M5XA 4Z08A 1VPXA 5I3FA 2A6NA 4KKXA 4JTEA 2VKZG 5I3KA 2Q8ZA 4Y8FA 4GJ1A 2X1SA 5G1TA 5AB3A 1SSDA 3Q58A 4WY0F 3O07A 3EKLA 1T8XA 3TA6A 3N3MA 2YW4A 3C2EA 4PC8A 1AW2A 4NJGA 1QO2A 3CB8A 1KM5A 1Q6QA 2CFFA 1DOSA 2ZRZA 5D2TA 1ZAIA 4GE8A 1L6SA 1TTIA 2F7FA 4JDYA 3W2KA 2HSAA 2A21A 8TIMA 4S2CA 3W1QA 3N34A 3DAQA 4O57A 4IQLA 5BRBA 4K37A 2QCGA 3S8HA 3DENA 1OX4B 2ZZ6A 4DPPA 3OBKA 3N2MA 3G8RA 2R14A 2V5LA 3MYOA 4UFKA 5KSWA 1W56A 1UJPA 3P67A 1LCOA 1Z42A 3W2NA 4PEKA 5A8GA 3UPWA 3DBPA 2FPTA 3MMTA 1TPC1 4S1FA 1THFD 1TTPA 4QM1A 4M6QA 4A2RA 3W86A 3W1LA 2YR1A 3TR2A 5GVJA 4BI6A 1MEWA 2GVLA 3P8JA 3LRKA 4DEFA 1N7KA 1GJPA 4HNTA 2EF9A 5KITA 1SFJA 4DO5A 1I2RA 3LCHA 2HS6A 2OT1A 5AYXA 5KTLA 5KINA 1X1ZA 3MI2A 4M6VA 3BLFA 1J5TA 1GPWA 3SECA 1TYGA 3UYCA 4IMDA 1OFPA 5CZTA 1F6KA 3TV8A 4DPQA 2PRHA 1UUOA 3BPWA 3G3DA 1TIMA 1YXYA 2V2HA 1R2SA 2AAMA 4GFSA 1A50A 1GZGA 3HBLA 1IIHA 1WOAA 1YDVA 3ZWTA 1XUZA 4JS3A 1PL9A 2NX9A 2D73A 2CU0A 3JR2A 2NXHA 2UV8G 4M7SA 4CQAA 4E38A 4WXYA 1WA3A 3E9AA 3HOJA 3P5ZA 5HQEA 3EX3A 3KAOA 2ATSA 2NZLA 3UQNA 2VC6A 4I7VA 3EXSA 1OVDA 1FDYA 3FJ6A 3NQVA 1QOPA 2NV1A 3LV5A 4KWWA 2QCLA 3HIJA 4CCEA 4O0ZA 2JBMA 1JVNA 2XN2A 2DZVA 3F4WA 5G5IA 2CLLA 3FKKA 5HMSA 3G18A 2C18A 5D03A 4WOQA 2OX1A 2WQPA 1TPVA 3U2OA 1SUXA 3B03A 3SI9A 3EX1A 1H62A 2FPYA 4HKPA 5CKSA 2ISSA 4QNWA 3IGSA 1TPDA 2EPHA 4O4WA 1U5JA 3RFAA 1UUMA 3W1UA 2WNZA 1ZCOA 4MYXA 1TO3A 3HG3A 1LBMA 1KBIA 2E6AA 4AWUA 3G0XA 4ONVA 1GVFA 1SFLA 2QCNA 1TQXA 3GDTA 2OZ0A 1DVJA 4BI7A 3TW6A 5A5WA 3R12A 5DY3A 2J9XA 3INPA 4NXSA 1EP2A 4LOCA 2DJXA 7TIMA 5EMUA 5FF7A 1SZEA 4LC6A 1TV5A 1GYLA 2E68A 3TDFA 3G24A 1F7BA 1TMHA 2CLEA 3B05A 4I9AA 3W87A 1TRDA 4ADTA 1TB3A 4DQWA 3MP4A 3W83A 5HULA 4JTHA 2Y7EA 2W79A 3GXPA 1FWRA 2CLKA 4UTTC 1TQJA 4NNCA 4IOTA 4Z1BA 2QR6A 1KFCA 5LHEA 3W1PA 3A23A 3W6YA 1TTQA 3KOFA 3RLUA 5HR6A 3NQFA 2Y85A 1AL8A 5AHNA 1IGSA 2F84A 3O15A 5F2LA 2G95A 1FY6A 4BR1A 3GK0A 3L66A 4QAIA 4O15A 3CM4A 2RH9A 3OVPA 4FX6M 1GVQA 2VXNA 5LNWA 4AB4A 2JKEA 1JUEA 3G1SA 4FF7A 4OT7A 4GWEA 2PRLA 3BG3A 4N02A 2Y61A 3HJZA 1I2PA 4O12A 4LT9A 4QQ3A 3CIWA 2DORA 4JTUA 4NX0A 3PSVA 4UR8A 2CZDA 5SWUA 4NVTA 3TX9A 3GX9A 1F05A 4N4PA 4FNQA 4N2YA 2ZDRA 4LVFA 3WJZA 4MUZA 3GDRA 3M41A 2GJLA 3UD6A 4O16A 3TXVA 3CC1A 4HNNA 3HPZA 1H1ZA 1DBTA 5KMYA 3TW7A 1OFQA 3VE9A 5BOOA 2Q3OA 5HWMA 3NPUA 3L0KA 3HPXA 5C5YA 3GDKA 3SFKA 3BGJA 3P84A 4ICNA 4JICA 1BWLA 5G1YA 1XBVA 3FKRA 1T96A 3W1TA 1SQ7A 1R30A 2BWGA 3MBDA 2ZQ0A 3TMQA 4AEOA 2QUTA 4N9BA 2Y89A 3P81A 1FWSA 3A5VA 1S5WA 4CNPA 3W22A 4N4QA 1S3HA 3GIYA 1I45A 2C13A 1AK5A 3KRSA 3MJYA 1I2QA 1PVNA 3E96A 1X8FA 1W54A 2OJPA 3PG9A 2X30A 1Q6LA 4XKYA 1W5MA 4UTLA 3EWWA 3O16A 2GUUA 4B5NA 4DO4A 1KM3A 4AWSA 2FFCA 3PC0A 3CU2A 5EPDA 4YXGA 2AQWA 1O60A 5KZDA 1VQTA 3QSRA 2P1FA 1HG3A 2DZSA 4ZQNA 3LRLA 3IGXA 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 4ORM A;  3BVJ A;  1EIX A;  1MEI A;  3W1N A;  4MFE A;  1OX6 A;  3FYO A;  3NPX A;  1OK6 A;  3PUL A;  2TRS A;  2ZRW A;  2H8X A;  1H51 A;  1VHC A;  3NXF A;  4Z0J A;  5HNR A;  1VRD A;  3MP3 A;  3FIG A;  3O6D A;  2A0N A;  1G67 A;  3EX6 A;  2VFI A;  4RX0 A;  4JDB A;  3LOT A;  5CSR A;  4XKY B;  1A53 A;  1QFE A;  3G1H A;  3M7W A;  4FEZ A;  1GTH A;  4UTI A;  3PUE A;  3MHF A;  4NNA A;  4POC A;  5MHB A;  5C55 A;  1HL2 A;  1F2J A;  4IMG A;  3W88 A;  4JY8 A;  3MP5 A;  1T0O A;  2E6F A;  2DZT A;  4RK8 A;  3PWA A;  1RD5 A;  3S1U A;  3BW3 A;  1XL9 A;  3LHW A;  1KFE A;  1R47 A;  1VS1 A;  1YXC A;  2ZRV A;  3G0S A;  1I8J A;  5HUP A;  3CIX A;  3TNO A;  1XI3 A;  3CT7 A;  1RZM A;  4PA8 A;  1HFB A;  1WBH A;  1DHP A;  5BW6 A;  3KFT A;  3NQD A;  3U6W A;  1KW1 A;  4HSN A;  3CEP A;  4EIV A;  3NPV A;  3QPY A;  3DFP A;  3I6R A;  1KFK A;  1TPF A;  2R8W A;  3B4U A;  3NDO A;  3S42 A;  1PII A;  3VCR A;  3DI0 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ARX A;  3DDM A;  3H4G A;  4XSL A;  3A4X A;  1IT7 A;  3OO2 A;  4HPG A;  3OVQ A;  3HA1 A;  2RDU A;  3NAV A;  3NSN A;  4M82 A;  1XIG A;  1E5J A;  4ZE4 A;  2PTY A;  5K3V A;  3E0V A;  3KL3 A;  3CMJ A;  5DCE A;  2C1I A;  2ZUN A;  4WIW A;  1K8Z A;  2CET A;  3IPW A;  3ITG A;  5LSM A;  4LX4 A;  2VM8 A;  1B4E A;  3VOI A;  4WOZ A;  3H7V A;  4F2B A;  1WKD A;  3GVG A;  3ARQ A;  2X1I A;  4HME A;  1TV8 A;  1VC4 A;  2NVA A;  3OG3 A;  4A8N A;  1T99 A;  1XIE A;  4B91 A;  3PPC A;  3PWG A;  4Y6G A;  4N6F A;  2YDS A;  4J35 A;  4DXV A;  3Q2D A;  4H6E A;  1XLA A;  2EEX A;  2PDH A;  3C2F A;  5BMX A;  5CZS A;  1A49 A;  2E1W A;  3CXO A;  1LRT A;  1UKQ A;  3WJX A;  1GHR A;  2B0M A;  2W27 A;  2W61 A;  1MW1 A;  3LLX A;  3UPB A;  1CGX A;  2VCC A;  3GTH A;  4XIS A;  5K4X A;  5FF4 A;  4CNN A;  1NVM A;  1P1X A;  5JVL A;  3WML A;  2ZA2 A;  3SN1 A;  2ZZ5 A;  1GVO A;  1Z9A A;  4UQE A;  3ITC A;  2XVG A;  2GOU A;  4P61 A;  2NLY A;  3MVI A;  1C29 A;  4HSO A;  1JL8 A;  4MIM A;  4WSJ A;  1BSI A;  4ZA0 A;  4I7W A;  3G0U A;  1G69 A; 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