3RCNA

Crystal structure of beta-n-acetylhexosaminidase from arthrobacter aurescens
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
537
structure length
525
Chain Sequence
MSAFHQLIPAPWSFSAGTGELELDAGTSVGADPELRGPRRWLTRALGGATGWDLAPAPAREAGIRLLLDPSLDAEAYRLEVSDAVVISAGGAAGAFYGAQTLLQLLGPAALRQAPVVAVEGWSVPRVSVEDKPRFGYRGTMLDVARHFMPKDNVLRFIEVMAMHKLNVLHLHLTDDQGWRMQINRYPKLTETGAWRRESSLGSWRAGVFDGRPHGGFYTQDDLREIVAFAADRHITVIPEIDVPGHSQAAIAAYPELGAGPSPVEVWTRWGINETVLEVSETSLEFYRNVLDEVVEIFPSPWISLGGDEVPLTQWQASAQAQAKAAELGLDDVSGLHSWFVGQLALHLKHHGRATSVWDELPDGALVASWRGYEGGIDALRKGYDVVMCPEHKLYLDHRQADGDDEPVPVGFVTTLQAVYEFEPLPGTDFPGRLLGAQANIWSEHLDSPRRVQFAAFPRLSAISEVFWSNPAGRDYDEFLTRLTGAHLARLEAMGVEYRPLSGPAPWQQRPGVEGWKRDYDAEQL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-N-acetylhexosaminidase
publication title Crystal Structure of Beta-N-Acetylhexosaminidase from Arthrobacter aurescens
rcsb
source organism Arthrobacter aurescens
total genus 169
structure length 525
sequence length 537
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2011-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3rcnA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3rcnA01
3OZOA 5FD0A 3S2CA 3ZR6A 3WQ5A 1US2A 2VX4A 2Y4SA 1UR4A 3GBDA 4TTGA 1UWIA 3VIOA 1WKYA 3N04A 4LPCA 4U5IA 2G3NA 4PMQA 2WSKA 1LWHA 5JBFA 1BG9A 1UWUA 3VOCA 4C7FA 4HOZA 2OYKA 4Z2IA 1MQRA 3UG4A 2QMKA 4ATLA 3PBGA 1H09A 4LYRA 3B9AA 3AS1A 2WWCA 1R86A 3A3HA 4CD4A 4EAMA 3BAIA 4PMZA 5BXSA 4PUDA 5BROA 2F61A 3AS3A 5D9MA 3W4RA 1C7TA 3AIWA 4WSJA 4CD6A 3KWXA 2GDUA 1US3A 4BZYA 3W53A 2WWDA 5CGMA 4Z2HA 4UOQA 4GIAA 7TAAA 3GH5A 1E70M 1VF8A 1EIBA 5FIPA 1NP0A 1K9DA 1WNOA 2ZE0A 1CECA 4HA3A 3RM4A 5JBEA 1DWHM 3DYOA 3RPMA 2CNCA 1W9UA 4MDOA 3UEQA 1CGUA 5A69A 1QNQA 5A6JA 1E3ZA 1OGSA 1AVAA 2EPNA 1VBRA 1UQZA 1X1NA 3UCQA 1KCKA 2JFEX 3ALFA 2V3DA 1OD8A 1AQMA 3M7SA 3ARWA 4CU6A 2PF0A 3NSXA 3CUJA 2XPKA 4UQ9A 4W7UA 2DSZA 2XIBA 3CZGA 4XUYA 2YLAA 4PCSA 4Z2LA 4LYPA 5A8MA 3VU2A 4OBSA 3LPPA 1NWTA 1WB0A 2DGAA 3E1F1 3CZKA 5BYWA 1NWUA 3SCRA 1IT0A 3K1DA 1UOKA 4RL3A 1KXQA 1JI1A 3NDZA 3VUPA 3UR7A 1NOFA 2DIJA 3WH9A 2VQUA 1EOMA 1JDAA 3T2PA 1F4HA 2X8RA 4OUEA 3DC0A 4BQ5A 4QCFA 4PCTA 2ZXQA 1QW8A 1B3YA 2W92A 4NZCA 4HZ8A 3KL5A 1V0LA 1WAWA 1KR0A 3IJ7A 2CKRA 2XGBA 1BSIA 4AZCA 2YBUA 4R5EA 1J9YA 1HVXA 1RH9A 4W8BA 4MB1A 1V6WA 3CZJA 4XZWA 1E4LA 3F5JA 3PZUA 3AJ7A 4CUCA 3SCPA 3T2OA 5CSUA 2VJXA 1FFQA 1E73M 3F4VA 3KEHA 4B9ZA 1DWJM 4PRWA 3AISA 3NSNA 1QI2A 3ZQ9A 2F2HA 1UR1A 2EEXA 3THCA 5E0CA 2J7BA 1W1VA 4P7QA 4TXEA 3WMBA 3I3EA 3TTYA 4GXPA 5EB8A 1UYQA 4TX8A 4E2OA 3MU7A 3UR8A 1EQCA 4Z2GA 1MWOA 2QPUA 3UERA 3B9DA 4YHGA 2JF6A 1H0IA 1H4PA 3VD4A 1VIWA 3ZJ6A 1EXPA 3M07A 3NCOA 1RP9A 4GO8A 4XX6A 3BH4A 2Y5EA 1ZBKA 1XCWA 2DT0A 2W5FA 3SCQA 3RDKA 1J01A 4PMRA 2VZSA 4GQQA 3BSHA 2ZX5A 5GPRA 3VMOA 4AZ5A 4WLCA 4W93A 5KEZA 3ARVA 1XH1A 2WAGA 1H3GA 5A2CA 3VGGA 1E5JA 5LA1A 1GJWA 2J74A 4AZBA 4GZJA 1V3JA 2G3JA 4CVUA 3FHQA 2E9MA 4JCMA 1VBUA 3WQ8A 1JZ2A 5EFFA 4H8HA 4AZ6A 3A4AA 3SCWA 3L4WA 1EH9A 1NARA 5E70A 5BXRA 2J75A 2W63A 2DPEA 1IV8A 2X09A 5A6SA 1DHKA 4JFTA 5CSYA 1E4NA 1ZS2A 4RE3A 3A47A 2VX5A 5BWFA 2D0HA 3WBAA 1CGXA 2OWWA 1QI5A 1GOQA 3IAQA 4NRSA 2Y24A 3FHAA 4CVWA 4ZEPA 5M03A 4UFHA 4UQDA 3VGFA 1X6LA 1ODZA 1W2PA 1XC6A 2VVNA 4JFWA 1KQZA 1M01A 1UKPA 3CHFA 2PC8A 3VDBA 1B3XA 4UNIA 3K46A 3U5UA 1ISXA 4DM1A 1JYNA 4RE2A 2OLHA 3ARPA 3WD4A 2WM0A 2CPUA 2JE8A 4H7VA 3CHCA 2MANA 4AZCB 2BV9A 1NWSA 1OIFA 2CESA 4ML4A 8CGTA 2X05A 1HJXA 1VJSA 3VGDA 3N11A 3QOMA 1I1XA 2V5DA 3IJ8A 3HMCA 4H2CA 1HN1A 3TTOA 4A3HA 3OA5A 1TUXA 2WCGA 4MDPA 1MXDA 2J7CA 5HBFA 1GQKA 4CD8A 3VNYA 3QHMA 1QI4A 1D3CA 1JXKA 1KXTA 3GZAA 5A6AA 2WPGA 2GDVA 3ECQA 2UY3A 3OLGA 3VIHA 1C92A 3TP4A 3W29A 4TVDA 1HT6A 1Q6DA 2HVMA 5FKYA 2Z1KA 3WN6A 1JFXA 1VJZA 4CU8A 3BLPX 3WUGA 4AD5A 4J3WA 4JKKA 2XVKA 4TVCA 5CPQA 2CHOA 1K6AA 1E72M 1UKQA 1GUVA 3OZPA 1E55A 2UWFA 3AIUA 1C91A 2ZXBA 1E5NA 1JXJA 2YL9A 5F7UA 4CD7A 5LYRA 3LPFA 1OT2A 5HXMA 1OBAA 3WF2A 3FXYA 2ZX7A 5EFDA 3SCSA 4MAZA 1PX4A 4BQ2A 1BVZA 3AHTA 1JYVA 4AY1A 4U33A 4YHEA 2OYMA 1B90A 3AYSA 1BYBA 4D1JA 1W9PA 1UWSA 4P8VA 4AC1X 5ABFA 1HJUA 4UR9A 2J77A 2FGLA 1J0ZA 1M04A 4RE4A 2UY5A 1WP6A 2O9PA 2D23A 3ARTA 3ZT6A 1ISYA 2PB1A 4CCCA 2NW0A 1UD6A 3EBVA 3GBEA 3BAWA 1C8XA 2ESCA 3VIKA 4P8UA 4QCEA 2F8QA 1BHGA 3OGVA 1U33A 2YKKA 3A4WA 4EKJA 3ZT7A 3QGVA 4C91A 1E4MM 3WD1A 2X2YA 4M80A 1H49A 4V2XA 3W38A 3WNPA 4HP5A 3NUKA 4UZUA 3QR3A 4V27A 1HJSA 3CHDA 1HP5A 1CGTA 1EA9C 4BA0A 3POCA 4UTFA 2YA1A 3ZM8A 3W6LA 2AAAA 5DFAA 1DWFM 2FHBA 5C8BB 2A3EA 3WF4A 3CZ8A 1PAMA 4ACZA 3T2QA 1B2YA 2CIPA 3AROA 5IXEA 2VC9A 1HX0A 1UZ1A 1G01A 4CD5A 2YL8A 1D7FA 3OGRA 4CU7A 1AQHA 4AIOA 3BAKA 4W87A 1E56A 4W7WA 4IISA 1VENA 1OWQA 2D3NA 1HL9A 2E40A 2XUCA 4W5UA 4EANA 1LG2A 1R8LA 1Z32X 2XVPA 2WMHA 3B9EA 3UESA 4L4PA 1GOKA 5JBDA 1FOBA 2XVGA 3MS8A 3SUSA 3MUY1 2PWEA 3AZSA 1UWRA 4R27A 3RIKA 3EDJA 2WMKA 3VDHA 4AD4A 3DYPA 1WDSA 3PN8A 4A4AA 1PIFA 5DMYA 1CBGA 1GPFA 1ECEA 3K8LA 2QHAA 4E8DA 5M17A 3WY1A 1RP8A 4UQEA 1MW0A 5M3WA 1L0PA 4UFJA 1WZMA 2WZEA 3ARYA 2DEPA 1UA7A 3AIEA 5BRQA 3CUHA 1SMDA 1ESWA 4LYQA 1VRXA 1KFWA 1FA2A 2O9TA 1CYGA 2WHJA 3VIGA 1O7AA 2YDQA 5AC4A 3TOPA 1E0VA 4N0RA 4OOUA 2PWFA 1BYCA 1E6QM 3W27A 3WMSA 5AC5A 5CJ5A 4UQAA 4JFVA 3QHNA 4GO9A 3RJYA 4PTWA 1D2KA 3MKKA 2YL6A 1CXEA 1LJYA 1E6XM 1TE1A 2VCBA 4UFMA 1XCXA 2WC4A 3ZJKA 1B30A 1H1NA 5FL1A 2DIEA 2ZXAA 1FP9A 5ABFB 2BVYA 1J0KA 4W89A 3G6LA 1ISWA 2BHZA 2G8ZA 4JKMA 1HKMA 2E0PA 2WCSA 1WE5A 6CGTA 1B3WA 1HJQA 1WCGA 3RILA 5ABHA 2JEPA 4KGLA 4LX4A 1U2YA 4AEEA 4X0NA 1VFOA 4U2ZA 4PMYA 1CWYA 5IFTA 1J0YA 4URIA 1OSEA 1NQ6A 5DF0A 1A47A 4AIUA 3TTSA 1CGWA 2BY3A 3W37A 2YA0A 3TTQA 1N82A 4MNKA 4D1IA 3CUGA 6TAAA 4AZGA 3AXXA 3NIYA 4HOXA 1JZ4A 1B31A 5LA0A 1QPKA 3CO4A 3BAYA 1OM0A 4PMDA 2W91A 2GSJA 3NJ3A 2IXUA 1XSIA 1R85A 3MUAA 3GNRA 2FHFA 3GTNA 3GYCA 5ECUA 2ZWYA 1HF6A 3L4TA 3WBEA 3IAPA 1NH6A 2WZHA 1E0XA 1W32A 5A8PA 3GDBA 3N17A 4A3YA 4ACZB 2NT1A 2YA2A 5LA2A 1R7OA 3PZNA 2VQTA 4FK9A 1DEDA 2PI6A 3BMVA 2WKGA 2EXOA 4ACYA 3PZVA 1GHRA 2QF8A 1V0KA 2D22A 4D6FA 2WXDM 3IK2A 3PTQA 4PTMA 5IHSA 2J8GA 2WVSA 3WD0A 4MB5A 4UFIA 4F79A 5GNXA 4WJXA 1G9HA 2XJ7A 2ZIDA 3AS2A 3CIVA 2PWGA 4V28A 5D8ZA 3WL0A 2IUZA 1FH7A 1QNSA 2CEQA 3J7HA 4EK7A 3PZ9A 3WQWA 3WL1A 1WZKA 1S46A 2ZUMA 1B3ZA 5I24A 4WIWA 3BXWA 3CLWA 1JDDA 1GHSA 4UCFA 4WK9A 1PPIA 4B3LA 1LL4A 2D2OA 1MW3A 2Y8KA 4OZOA 3VKKA 3CMJA 3WUFA 1ZB5A 1H11A 2XSAA 5FCZA 2J79A 4Y7EA 1HL8A 4NI3A 4CN4A 4PEEA 1R87A 4IPLA 3VIIA 1EOKA 4UFKA 4AIEA 3EDKA 3VMPA 4F9DA 2CETA 3UG3A 3WDQA 2JALA 1V3KA 1OGBA 3K4AA 5A2BA 1BFNA 2VUYA 1VEOA 3RJXA 1UH2A 1ZJBA 2FDMA 1UD3A 3W25A 1JZ7A 2JEQA 2ZX6A 3AMGA 3AXHA 5AYBA 4BQ4A 1E3XA 5A95A 4AXNA 3BCDA 1RD6A 2ZUUA 1Q6GA 3ZJ7A 2G4FA 1FFRA 1MQQA 3O6AA 5FL0A 5A1AA 1GVIA 5I79A 4WKFA 2J25A 3PZOA 1TVNA 5M5DA 2PBOA 5E9AA 1B0IA 4D6HA 2DQXA 1E71M 3DYMA 2EJ1A 3WUEA 3GNOA 1MW2A 4WKHA 1JF5A 2VZUA 2WMJA 1CZ1A 4HA4A 1W2VA 4P8WA 3WQ6A 1WO2A 3VIMA 4HOWA 2DSWA 1LG1A 3N1AA 1CGYA 1UQYA 2UY2A 1OIMA 4JL1A 4TVUA 1BGGA 1EGZA 4AMCA 2WVTA 4E8CA 1E40A 1CXFA 3I3DA 1SR0A 1KWGA 2WSPA 4IM4A 1EHAA 1GONA 1VB9A 1M03A 3FAXA 3MV01 2E3ZA 3SEPA 1LQ0A 8A3HA 1R7AA 2PBGA 1CENA 3VO0A 1E9LA 4U3CA 2DT3A 4FLSA 3EMZA 5HOSA 2RGLA 4KRTA 4MNLA 2CBIA 4MB3A 4HU0A 1WZLA 4XB3A 1E0WA 5DO8A 2O9RA 2X0HA 3PTKA 4J3UA 3KE0A 2WLYA 4D6IA 4BQ3A 1HKJA 2XTKA 1JI2A 4F8XA 5IDIA 3WFZA 5A6MA 5A6KA 3GXIA 1QBAA 3PZGA 3AIRA 4QFUA 4M81A 3WDRA 3L4XA 2VI0A 2J7GA 3NDYA 4GQRA 3AIQA 1LWJA 2EQDA 4P7OA 2WCAA 5I0DA 1LL6A 1J10A 3II1A 3VM5A 2D1ZA 3L4UA 2UY4A 4FMVA 1GOMA 1EO7A 5BXTA 3A4XA 1ITXA 1G94A 1JAEA 2YBTA 4S3KA 3AI0A 1QI0A 3VM7A 7CGTA 1V0MA 3I3BA 1TA3A 1UD4A 3WEZA 4U3AA 4AW7A 4NF7A 2Z1SA 2DDXA 4PSRA 4DUWA 1J18A 3T08A 2XWDA 3GH4A 4P8XA 2J8FA 2ZOXA 4JL2A 2ZUTA 5CGTA 2WB5A 5A6BD 1H0GA 2JIEA 2ZUWA 2WC3A 1DP0A 1JZ5A 1K9TA 4YPJA 3SCVA 4WF7A 2J78A 1TCMA 4X9YA 1JZ8A 1ZU8A 1G1YA 3KZSA 4KMQA 1J0IA 4UQBA 3BSGA 2PWHA 4QDMA 2BNJA 4ZENA 1UD5A 3SCOA 3AIBA 1K9EA 2XFYA 4MJ4A 3WKZA 4D72A 1EO5A 4BS0A 4PMOA 1VFFA 3MSGA 3SCTA 2J4GA 2VURA 3KL0A 1GQLA 1CXKA 2VL4A 2CBVA 1RPKA 4AD1A 3ZIZA 4HMDA 4GI6A 2ZWZA 2VX6A 3ZO9A 1XSJA 5A8QA 3AOFA 4AZ7A 1UWTA 3K8KA 1JZ3A 2XM1A 3AQUA 3LPGA 2EPKX 3APGA 1UKSA 2WVUA 1QOXA 5CQ1A 2OYLA 3MUZ1 4ZE5A 3WH7A 3ARSA 2ZUNA 4W8LA 2E4TA 2CBUA 4Q22A 4HU8A 2WBKA 3AHXA 5IHRA 1KGWA 5A6BA 4JHOA 3AZRA 3U7VA 2V3FA 3IANA 4ZXOA 1XH2A 3D5HA 4PSPA 4OKDA 1E6RA 2GJPA 4X0VA 3L4VA 2OSXA 4C7GA 4D71A 3AFBA 2Y2WA 1MW1A 5FOOA 3CPUA 2CKSA 1SYTA 3VMNA 9CGTA 1P6WA 2WYSA 3DECA 1G0CA 1JD7A 3SCNA 2VR5A 4H04A 4E4PA 2D24A 1QBBA 3T09A 3AIVA 1GZJA 1MQPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3OZO A;  5FD0 A;  3S2C A;  3ZR6 A;  3WQ5 A;  1US2 A;  2VX4 A;  2Y4S A;  1UR4 A;  3GBD A;  4TTG A;  1UWI A;  3VIO A;  1WKY A;  3N04 A;  4LPC A;  4U5I A;  2G3N A;  4PMQ A;  2WSK A;  1LWH A;  5JBF A;  1BG9 A;  1UWU A;  3VOC A;  4C7F A;  4HOZ A;  2OYK A;  4Z2I A;  1MQR A;  3UG4 A;  2QMK A;  4ATL A;  3PBG A;  1H09 A;  4LYR A;  3B9A A;  3AS1 A;  2WWC A;  1R86 A;  3A3H A;  4CD4 A;  4EAM A;  3BAI A;  4PMZ A;  5BXS A;  4PUD A;  5BRO A;  2F61 A;  3AS3 A;  5D9M A;  3W4R A;  1C7T A;  3AIW A;  4WSJ A;  4CD6 A;  3KWX A;  2GDU A;  1US3 A;  4BZY A;  3W53 A;  2WWD A;  5CGM A;  4Z2H A;  4UOQ A;  4GIA A;  7TAA A;  3GH5 A;  1E70 M;  1VF8 A;  1EIB A;  5FIP A;  1NP0 A;  1K9D A;  1WNO A;  2ZE0 A;  1CEC A;  4HA3 A;  3RM4 A;  5JBE A;  1DWH M;  3DYO A;  3RPM A;  2CNC A;  1W9U A;  4MDO A;  3UEQ A;  1CGU A;  5A69 A;  1QNQ A;  5A6J A;  1E3Z A;  1OGS A;  1AVA A;  2EPN A;  1VBR A;  1UQZ A;  1X1N A;  3UCQ A;  1KCK A;  2JFE X;  3ALF A;  2V3D A;  1OD8 A;  1AQM A;  3M7S A;  3ARW A;  4CU6 A;  2PF0 A;  3NSX A;  3CUJ A;  2XPK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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