3RJYA

Crystal structure of hyperthermophilic endo-beta-1,4-glucanase in complex with substrate
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
310
structure length
310
Chain Sequence
MSAFEYNKMIGHGINMGNALEAPVEGSWGVYIEDEYFKIIKERGFDSVRIPIRWSAHISEKYPYEIDKFFLDRVKHVVDVALKNDLVVIINCHHFEELYQAPDKYGPVLVEIWKQVAQAFKDYPDKLFFEIFNEPAQNLTPTKWNELYPKVLGEIRKTNPSRIVIIDVPNWSNYSYVRELKLVDDKNIIVSFHYYEPFNFTHQGAEWVSPTLPIGVKWEGKDWEVEQIRNHFKYVSEWAKKNNVPIFLGEFGAYSKADMESRVKWTKTVRRIAEEFGFSLAYWEFCAGFGLYDRWTKTWIEPLTTSALGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endoglucanase FnCel5A
publication title Crystal structure of hyperthermophilic Endo-beta-1,4-glucanase: Implications for catalytic mechanism and thermostability.
pubmed doi rcsb
source organism Fervidobacterium nodosum
total genus 119
structure length 310
sequence length 310
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2011-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3rjyA00
2A3AA 3DYOA 5EFFA 1UD4A 2G3MA 3EMQA 4GI9A 4P8XA 4W86A 1J0JA 2UY3A 3MMDA 2X0HA 4M1RA 3HMCA 1JAEA 2DGAA 1MWOA 1RPKA 1MQRA 1QHPA 5JUVA 1FHDA 2J4GA 1DWIM 4CD6A 1C92A 5AYIA 4W89A 5E09A 2VVSA 3WENA 2J75A 1EDQA 1CGYA 1V08A 3L4XA 1BAGA 3J7HA 5KEZA 1KXHA 4V28A 3WFZA 4Q22A 3K4DA 3N18A 1H4PA 4PEEA 2G8ZA 4H8VA 4WKHA 1UOKA 1C7TA 3FY1A 1R7AA 3QR3A 1B90A 2ZE0A 1V3MA 2ZWZA 2ESCA 5C70A 3MS8A 3MU7A 2YDRA 3PN8A 4GQRA 3VVGA 1WO2A 3QGVA 4U3CA 1VEOA 2DT0A 2VVNA 4UFJA 1PX4A 2YL9A 3VIHA 1HL9A 1KGUA 4MNMA 2FH6A 3CIVA 4JHZA 5A8MA 1GOMA 1H49A 4XX6A 3SUUA 5CXPA 4PN2A 2J8GA 1MW0A 2O92A 1CECA 1CXIA 2JE8A 3NCOA 1UYQA 2XYLA 1E5NA 3WQVA 4C7GA 1JZ7A 1ISZA 1V02A 2MANA 2WBKA 5LA2A 1H0IA 4F8XA 2IUZA 4XUYA 2WCAA 4HZ8A 4U33A 2E8ZA 4QCFA 4DUWA 4PUEA 5DFAA 3ZMRA 4E2OA 2PB1A 1ZU8A 3PTQA 1Q6CA 2OSWA 4AD0A 1WZLA 3VTRA 4AYSA 3UESA 1FP9A 5I78A 1WP6A 2Y4SA 1CWYA 1ODZA 1UWUA 4LX4A 2YJQA 1H09A 1AQ0A 2XSBA 3ARUA 2AOSA 4CD4A 4D6CA 3O6AA 4U3AA 3N12A 3ZSSA 1V0NA 3WDIA 4H04A 3UR7A 3NDZA 3RPMA 4Y7EA 3SCTA 1JZ8A 4A3YA 2WHJA 3L4VA 4UOZA 4MAZA 2VZUA 4QLJA 4TXEA 1D3CA 5IHRA 1E6XM 3D5HA 1QNQA 2G3IA 2BY3A 3NUKA 1W9DM 2A3EA 3F5JA 3PZVA 2O9RA 3KZSA 3BAJA 2D0HA 3ZT7A 2V5DA 2WWDA 3EMCA 4NF7A 2WCSA 3BGAA 3VILA 7TAAA 2WXDM 5I5RA 3POHA 4IISA 1KBBA 4HOXA 3SCUA 1K9DA 3WEOA 2NW0A 4NSBA 4EE9A 1E3XA 1BHGA 1UKPA 2XVGA 2WVVB 3WUEA 3T0BA 4CU7A 5CJ5A 1EDGA 3ZJ6A 4JAWA 4HPHA 1W1PA 4X0VA 4LYQA 4AIUA 2CXGA 3CUIA 1S46A 2Y5EA 3CBWA 5E6YA 1MW3A 3AYRA 1NP0A 1KWKA 2GJXA 5IXEA 1JDAA 2DSVA 4J28A 3AMGA 2TAAA 2G4FA 2ZUMA 1XC6A 3UR8A 4PCTA 2HISA 3SURA 4F9DA 4AY1A 3PHAA 1JZ4A 4B15A 1HL8A 2WVUA 4PMZA 2W62A 3RDKA 4ZE4A 3SUVA 3KL0A 2WPGA 1GNXA 2WYSA 2BV9A 4DWSD 1MFVA 4P7QA 3U5YA 4UFLA 3VIMA 1XYFA 3HJEA 4PMRA 2WHLA 3N17A 3PZIA 1G94A 3WDHA 1RD6A 2ZOXA 1XSIA 1W1YA 5D8ZA 3DHUA 1IZKA 1JDDA 4MTVA 4B9YA 3VGFA 3VGHA 3G6MA 1O6IA 3K8KA 3WBEA 1QNPA 3IAQA 2DT3A 4AC1X 2BNJA 1JIBA 4MNLA 3W29A 2XVNA 2WANA 3SCOA 2EQDA 3BSGA 1E6PA 4BA0A 1MVYA 5M17A 5LA1A 3WY1A 2C8NA 3VDCA 1BFNA 5I0DA 1CBGA 2E3ZA 2CBVA 4WIWA 3VDBA 5I23A 2CERA 1E0XA 1E71M 3VD3A 4MPKA 4E8DA 1ZBWA 1K9EA 1UR8A 3ZR6A 4GQQA 1EOMA 1TCMA 4IPLA 1H5VA 4FLSA 1EHAA 4U2ZA 1H41A 2GJRA 3IK2A 1BG4A 1UWSA 3EDJA 2V3GA 1ISXA 2D3LA 4W93A 3L4YA 2WMGA 3ZO9A 3SCVA 4D6JA 4M80A 1UD3A 2QF8A 3ZR5A 3MKKA 3EYPA 1E6ZA 3CH9A 1VBRA 2ZX9A 3A3HA 3CZLA 3VX0A 2J47A 3CHDA 3KEHA 1E73M 2UY5A 4DUXA 1JZ3A 2VT0A 1OM0A 1DTUA 2BHZA 1V6XA 2EPMX 4LYRA 3VGEA 1V6WA 1FP8A 4UOQA 4LXFA 2DT1A 1EHNA 5CSYA 3VM7A 2XTKA 3N1AA 1JL8A 5E6ZA 4PMQA 1XYZA 3WDQA 3LPPA 1UD5A 2BXYA 4JFUA 1VIWA 3BAKA 3CUGA 4J3TA 1HJQA 3WELA 4KWUA 2VX7A 4TTGA 2B31A 5A8NA 5FKYA 2CYGA 3WMSA 5A8QA 1J11A 4AXNA 3VMOA 3T2PA 1KGXA 3UETA 3B8SA 3TTQA 3WMBA 3OLDA 4ATLA 1E4IA 1PIFA 3SIMA 1PZ3A 2VQTA 2VX4A 3VU2A 4IM4A 1ZL1A 4P7LA 4PMNA 1NOWA 3GH5A 3O2LA 3W28A 1Q6DA 4J3SA 1KFWA 3AOFA 3TTSA 3SCNA 2CBIA 3GZAA 3CO4A 5M3WA 5BWFA 1B30A 1NOFA 1OIFA 2DT2A 2J79A 3WL0A 4D6DA 4JFSA 2EJ1A 3A6OA 7CGTA 3UG5A 3K46A 3MUZ1 4AMCA 1FH7A 4PUDA 1WZKA 2D1ZA 1V0KA 4AD5A 4LQ1A 1B9ZA 3THCA 1UKQA 1G0CA 3BMWA 3L4ZA 3VGDA 3WH5A 5A6KA 1MXGA 4MNKA 3BAXA 4AZ5A 1M03A 1X6NA 1U33A 1ZS2A 1JDCA 4UQEA 5IHSA 4HOWA 5CPTA 4FMVA 2W61A 2GVYA 1BGAA 1CDGA 3NIYA 2XSAA 4MB4A 4AEFA 3WNKA 3SCSA 1ITCA 8CGTA 3PZGA 1PZ2A 3L4UA 1WDSA 1W9BM 4YHGA 1GVYA 2AAAA 1G5AA 2WHMA 3SUSA 2JIEA 4WSJA 1KR0A 1BF2A 1M53A 2PC8A 4J27A 2ZUWA 1FOBA 2VCAA 2BHYA 2VR4A 2WZEA 3WD0A 3EDDA 3HU7A 1LG2A 3AIUA 1WKYA 4MDOA 1LLOA 2DH3A 2BS9A 6TAAA 1OD0A 2Z1KA 1E9LA 1C7SA 1C93A 3FNDA 4OIFA 1UZ1A 2D0GA 3CMJA 4GO8A 2FHCA 1RH9A 1PX8A 2VJXA 2GJPA 1M01A 3K4AA 5AC4A 5A8OA 3WEZA 1PIGA 2JALA 3VUPA 5CLTA 3KWXA 4FK9A 1A3HA 1J01A 1WZMA 4D1JA 5A2CA 1V6YA 4HA3A 3W38A 3W6MA 3GH7A 3PZUA 2ZX5A 3WUBA 3TP4A 5AY7A 2BVYA 1U2YA 3ARZA 4AD1A 4MAVA 4ML4A 3TTYA 3MUAA 2ZX6A 2QPSA 1AVAA 1QNOA 2WSKA 2VC9A 4IUGA 1VJSA 4BQ2A 3L2LA 2W92A 1FA2A 1HJUA 4CD5A 1TZ7A 1JD9A 2QV4A 3VGBA 1E43A 4TVDA 3SUWA 2CESA 3WNNA 2V38A 1UH4A 2XIIA 1QPKA 1E0WA 2Z1SA 1B0IA 2DEPA 4JKKA 4ZXLA 1UA3A 4JKMA 3N11A 3GXMA 1J0KA 3ALFA 1DP0A 4XV0A 3CHCA 2EBNA 4MB3A 1JZ5A 1GOWA 3W25A 1FH9A 1L8NA 3OIHA 5CZKA 1HP5A 3L4WA 1GQKA 5GNZA 1BTCA 1IV8A 2D20A 5FOOA 3K1DA 2VURA 2FHBA 2DSKA 3AHVA 3FHQA 5BROA 3WH7A 4AZCA 1CGTA 3BLKA 3VPLA 5CGMA 3MSGA 1WPCA 2DDXA 1HP4A 4N42A 4W7WA 1TE1A 1GJUA 1WCGA 3AZTA 4TVUA 1W2VA 3QOMA 2XPKA 1E72M 4N0RA 2BY0A 2G3NA 3ARSA 1CPUA 4GI8A 4PYSA 2JF6A 2O9PA 4KMQA 4HP5A 4JKLA 4ZFMA 4UR9A 1V3KA 4W7VA 3WD4A 5E70A 2X05A 4J3UA 3WSUA 2WMJA 2XUCA 2CKSA 2JEPA 2WMHA 4PMUA 3G6LA 2RGLA 2VZSA 3GYCA 3RM9A 2G41A 2XWEA 1DWHM 1X6LA 1J10A 2W67A 4CU6A 1JFHA 4NZCA 1WDRA 2VNCA 1JF6A 1TG7A 2YL8A 1NM9A 1HKIA 2D23A 2BVDA 2XM1A 3B9EA 1JNEA 2JEQA 3D3AA 3UG4A 1AMYA 3NSNA 3CUHA 2GK1B 1VJZA 2YBTA 2F61A 3AHZA 3SCPA 2WNWA 1SFSA 3RJYA 3WUFA 3RMEA 1XCXA 2JIWA 1HX0A 3TONA 3JUGA 1W3KA 2VZVA 3SCQA 1Q4NX 4ACZA 2E0PA 2DQXA 2WMKA 3ARYA 5A6BA 2Q8XA 1IT0A 1GOIA 2WSPA 1ZBKA 1J0IA 2QLYA 3KE0A 1BVZA 3WD3A 2QPUA 3VD7A 2XG9A 3AIRA 4QLLA 4OBRA 4FLRA 5ABEA 3AS1A 2YLAA 3RJXA 2WKLA 2WMFA 5CLWA 1OINA 2J74A 1B2YA 1ISYA 5LA0A 1GOKA 1XSKA 4TX8A 4X9YA 4MJ4A 4QP0A 4YN5A 5I3DA 2E40A 1YHTA 1XRVA 1QBAA 1OD8A 3TTOA 1GPFA 1UWIA 3OZPA 5DEZA 1C91A 4D6EA 1E5JA 1HJXA 4CCCA 3VNYA 1XHGA 4W87A 4AZHA 3A4WA 1GCYA 3AS2A 4AD4A 4MB1A 4D72A 4ATWA 3WKZA 3UERA 5ABGA 3ZQ9A 1H3GA 1JFXA 4PMDA 1J9YA 2WMIA 1J0ZA 1NP2A 1X1NA 3VD9A 1JYVA 1JXJA 3CPUA 5HDRA 3GBEA 4FLOA 4PMVA 1QVBA 4AZIA 4D6IA 3ARVA 3ARWA 3WF0A 2CKRA 3AHTA 4MNJA 3M07A 2NT0A 1GOOA 2J62A 1MQPA 4J3XA 4ACZB 1BLIA 5I77A 3AS3A 1E55A 3QHNA 1FFQA 3AHYA 2W66A 2OSXA 3VGGA 3PTKA 3VDAA 5JBFA 2EO7A 4P7NA 2VQUA 4PBGA 1EGZA 1E6SM 2GDVA 1OWQA 3OZOA 1V0MA 5E9AA 1K9TA 4CVUA 3W0KA 3MV11 4HA1A 1QNSA 3GH4A 1XD1A 4J7RA 5FCZA 1C8YA 3IANA 3CHFA 3WH8A 1KWGA 1VEMA 1C8QA 3BSHA 4HU0A 5GQBA 3POCA 4DM2A 3MUIA 5CSUA 2RGMA 1UWTA 1US3A 1EO5A 1XH0A 1JAKA 3BH4A 4KGJA 3AROA 1KCKA 3PZNA 1OBAA 2E4TA 2OWXA 2CHOA 4NI3A 3AIBA 1US2A 2JFEX 5TD4A 1GHSA 3LMYA 2WMIB 4U31A 2XM2A 3HN3A 1LL7A 3CMGA 1KB3A 1ZB5A 4Z2LA 3M6DA 4RL3A 4AWEA 1R87A 4CVWA 1H1NA 3E1F1 1NQ6A 1NARA 4Z2GA 1CZ1A 1G9HA 4HPGA 5D9OA 1GQJA 1V6UA 5CQ1A 1VRXA 3VIPA 1XGZA 3OA5A 4OZOA 1CENA 3WQWA 2GUYA 2O9TA 2WZIA 4GKLA 1YQ2A 1W9PA 1Y7VA 5A2AA 3BAYA 1UH3A 5F7UA 4KRTA 1JYXA 1MXDA 2ZIDA 3S2CA 3WNLA 3K8MA 2V3FA 4MDPA 1JYWA 3T0AA 4HTYA 2J7BA 1L0PA 2GJXB 3DHPA 2QHAA 2W91A 3UG3A 2PBGA 3WQ8A 4QFUA 3ZJKA 1EQCA 3ARTA 3AFBA 1C3FA 5A69A 3M46A 2J7EA 4W8BA 1QW8A 3NDYA 1HN1A 3AZSA 3L2MA 2ZXQA 4UZSA 3CZGA 4DM1A 4UQAA 1JG9A 2DSUA 3LPOA 2CEQA 4QAWA 4B16A 3VIKA 2DSZA 2E9BA 1EOKA 1JI1A 1MW1A 3CUJA 3VIIA 4BQ5A 2J7GA 4Z2HA 1HJVA 2YBUA 4WKFA 3AYSA 3T09A 5CPQA 3BMVA 1J18A 2PWDA 5D4YA 1DWAM 1WDQA 4D6FA 1IZJA 4C7FA 1NOUA 2GDUA 5EFDA 4M8UA 1UD6A 4GPNA 3VIJA 4R5EA 2CIPA 4JZ5A 4D1IA 4LPCA 1W1TA 2XJ7A 4W7UA 4RE3A 1UG6A 2GFTA 5CPSA 3WD1A 4EKJA 4UFKA 3WQ4A 4GI6A 5DMYA 1A47A 4OUEA 1E1FA 1ZBCA 3M7SA 3U5UA 2EPKX 3OLIA 3OLEA 1LF1A 1BPLB 4U5KA 1V3JA 1QBBA 3A4XA 4KGLA 1GZJA 2WK2A 3DECA 6A3HA 3UCQA 4UNIA 4B9ZA 1PEZA 2YLLA 4PMXA 2FGLA 1G1YA 3AIVA 3MUY1 4WLCA 1W32A 5AYBA 1LWHA 3IJ7A 4H2CA 5HOSA 4H8HA 4V2XA 4CD7A 5ECUA 3AIEA 2OYMA 1GQLA 1EO7A 1W3HA 1EXPA 1HXJA 1JD7A 1KXTA 5A6AA 3CGTA 2PF0A 3W26A 1OT2A 4B3LA 4Q7NA 2OYLA 2D24A 5FL1A 3BAIA 4EK7A 1V3HA 1I1WA 3WF3A 5D9PA 1B3VA 2WBGA 2BHUA 5A94A 2UWFA 1P6WA 1GORA 4TVCA 1V03A 4GZJA 1Q6FA 2WHKA 3WN6A 3MMWA 4GXPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2A3A A;  3DYO A;  5EFF A;  1UD4 A;  2G3M A;  3EMQ A;  4GI9 A;  4P8X A;  4W86 A;  1J0J A;  2UY3 A;  3MMD A;  2X0H A;  4M1R A;  3HMC A;  1JAE A;  2DGA A;  1MWO A;  1RPK A;  1MQR A;  1QHP A;  5JUV A;  1FHD A;  2J4G A;  1DWI M;  4CD6 A;  1C92 A;  5AYI A;  4W89 A;  5E09 A;  2VVS A;  3WEN A;  2J75 A;  1EDQ A;  1CGY A;  1V08 A;  3L4X A;  1BAG A;  3J7H A;  5KEZ A;  1KXH A;  4V28 A;  3WFZ A;  4Q22 A;  3K4D A;  3N18 A;  1H4P A;  4PEE A;  2G8Z A;  4H8V A;  4WKH A;  1UOK A;  1C7T A;  3FY1 A;  1R7A A;  3QR3 A;  1B90 A;  2ZE0 A;  1V3M A;  2ZWZ A;  2ESC A;  5C70 A;  3MS8 A;  3MU7 A;  2YDR A;  3PN8 A;  4GQR A;  3VVG A;  1WO2 A;  3QGV A;  4U3C A;  1VEO A;  2DT0 A;  2VVN A;  4UFJ A;  1PX4 A;  2YL9 A;  3VIH A;  1HL9 A;  1KGU A;  4MNM A;  2FH6 A;  3CIV A;  4JHZ A;  5A8M A;  1GOM A;  1H49 A;  4XX6 A;  3SUU A;  5CXP A;  4PN2 A;  2J8G A;  1MW0 A;  2O92 A;  1CEC A;  1CXI A;  2JE8 A;  3NCO A;  1UYQ A;  2XYL A;  1E5N A;  3WQV A;  4C7G A;  1JZ7 A;  1ISZ A;  1V02 A;  2MAN A;  2WBK A;  5LA2 A;  1H0I A;  4F8X A;  2IUZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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