3S6TA

Crystal structure of insect beta-n-acetyl-d-hexosaminidase ofhex1 v327g complexed with pugnac
Total Genus 189

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
189
sequence length
575
structure length
575
Chain Sequence
VAAEDVVWRWSCDNGKCVKLKNDPRSSEPALSLEACKMFCNEYGLLWPRPTGEADLGNFLSKINLNSIEVKILKKGATDDLMEAAAKRFKEQVSLAIPRGSTPKLTGKAVDVYLVNENPNEKAFSLEMDESYGLRVSPSGADRVNATITANSFFGMRHGLETLSQLFVFDDIRDHLLMVRDVNISDKPVYPYRGILLDTARNYYSIESIKRTIEAMAAVKLNTFHWHITDSQSFPFVTTKRPNLYKFGALSPQKVYTKAAIREVVRFGLERGVRVLPEFDAPAHVGEGWQDTDLTVCFKAEPWKSYCGEPPCGQLNPTKDELYQYLEDIYSDMAEVFDTTDIFHMGGDEVSEACWNSSDSIQNFMMQNRWDLDKESFLKLWNYFQQKAQDKAYKAFGKKLPLILWTSTLTNYKHIDDYLNKDDYIIQVWTTGVDPQIKGLLEKGYRLIMSNYDALYFDCGYGAWVGAGNNWCSPYIGWQKVYDNSPAVIALEHRDQVLGGEAALWSEQSDTSTLDGRLWPRAAALAERLWAEPATSWQDAEYRMLHIRERLVRMGIQAESLQPEWCYQNEGYCYS

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Ostrinia furnacalis
publication title Active-pocket size differentiating insectile from bacterial chitinolytic beta-N-acetyl-D-hexosaminidases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-acetylglucosaminidase
total genus 189
structure length 575
sequence length 575
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2011-05-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF14845 Glycohydro_20b2 beta-acetyl hexosaminidase like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3s6tA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3s6tA01
2C8NA 2OSYA 1H41A 2WZHA 3N15A 4ZENA 3PZMA 4W86A 1FP8A 3NDZA 1LWJA 1LL6A 2QF8A 3I3DA 3GNRA 2WSKA 5E6YA 3FW6A 4MNLA 5BXSA 5CLWA 1B0IA 1NWRA 2FH8A 8A3HA 5F7UA 1HKMA 2GUYA 4LYRA 1J18A 3WQ8A 8CGTA 2WHJA 1G94A 1JZ6A 1RPKA 1EDTA 1KGUA 1E4LA 1CXHA 3WEMA 3D5HA 3PTKA 4Z2JA 3TTQA 3AIVA 3CUFA 5C71A 1V6UA 4MJ4A 4UQ9A 2YLAA 2GVYA 4HU0A 4FLSA 3AS0A 2WHKA 5IFPA 1JZ5A 3HJEA 2UY5A 4UZUA 2IUZA 4GKLA 2W66A 4HTYA 3FXYA 4L4OA 3ZT7A 1TZ7A 1EH9A 1MVYA 2D2OA 2WMKA 3FHAA 3ZT6A 3WMBA 4F8XA 3VIPA 4AD4A 2VCBA 5AYIA 4J3SA 4DM2A 1MYRA 3VNYA 2O9RA 2PC8A 3THCA 4HA4A 3AI0A 1SMDA 4OOUA 4D6GA 4U31A 3VIHA 4QLKA 2WCGA 4OOZA 4D6DA 5A6BA 3VKKA 3OG2A 3RPMA 3WQ5A 1BLIA 4PMQA 3ZJ6A 3J7HA 2X0YA 3WH5A 1UH2A 1KGXA 4D72A 2NW0A 2WHMA 1ZBCA 2J25A 3EMCA 2Y8VA 2OWWA 1R8LA 2WMIA 3WNNA 4W8LA 1J11A 1J0HA 4LYQA 3MU7A 3AIEA 4W5UA 3POHA 3F4VA 1NARA 2XVNA 5A8OA 3EMQA 1NQ6A 3MSDA 4CD6A 4AXNA 2WZIA 3TONA 3WD2A 1XCXA 1QI2A 2WHLA 5KEZA 3AMLA 3AICA 1UZ1A 1KBKA 5DT7A 1B3WA 3WNKA 1LL7A 1BGGA 4M8UA 1CXIA 1QW9A 1XC6A 4AEFA 1MFVA 1W1YA 3WD3A 1V3MA 4ATWA 4OJYA 1X1NA 4W8BA 3AS1A 2WNWA 2ESCA 4LPCA 4A4AA 1V6YA 1TMQA 2FHBA 3NSNA 3W25A 4PMDA 1ISWA 1JNEA 1GJWA 1AQ0A 4D71A 2AOSA 2WKGA 4JL2A 1CPUA 3VDAA 4LX4A 4W93A 3AIUA 1XSIA 3VD3A 3CMGA 2DSUA 1TE1A 2CHNA 4P7LA 7TAAA 4HP5A 3K4AA 2GDUA 2ZUTA 3ZOAA 1JZ2A 3AHTA 4FF5A 4H8UA 1QPKA 1E3XA 4P7NA 2EQDA 1LF1A 1Q6DA 2PI6A 4KWUA 1HL9A 3W28A 1SYTA 5A6KA 4M80A 3ARSA 3WD0A 2EO7A 3S6TA 1C90A 2JIWA 3PZGA 1N82A 4AZCB 3BCFA 4YHGA 1CECA 3VOCA 4E8CA 2ZX6A 2E9MA 1FFQA 1BTCA 3ZQ9A 3WNMA 1E4MM 4ATDA 1WZKA 3VMNA 1TR1A 1KCLA 2XTKA 2XFYA 1QOXA 2WC7A 3RIKA 3WNPA 3AZSA 3WQ4A 1V0NA 4Q7NA 4BF7A 5ABFA 3I3EA 1UKTA 4PEEA 2XGIA 4M29A 5JBFA 3AZTA 2YBUA 3NIYA 4WSJA 3W81A 3WDQA 3W4RA 2ZUMA 2VI0A 3ZO9A 5GQBA 1GOKA 1CWYA 3ZR6A 2CERA 1UKSA 4GZEA 1M53A 1ZB5A 1B1YA 3WF0A 1DWAM 5A2CA 3ALGA 4B3LA 3T0BA 3HU7A 1UZ4A 5IDIA 1W1TA 5IHRA 1TVNA 4CKQA 1QBAA 1J0JA 3DC0A 4CCDA 4UOQA 1U33A 3PZTA 3WDJA 2ZWZA 4JFUA 3W27A 1V6XA 1J0ZA 2AAAA 3O6AA 2WBGA 1AVAA 1X6NA 3BAJA 3UR8A 2YA2A 4B15A 4E8DA 5HPOA 1WDSA 1UH4A 2A3AA 4X0VA 3LPOA 2DH3A 1TA3A 3QGVA 4CVUA 3GYCA 1ISZA 1JXJA 2Z1KA 3GTNA 1UD6A 3B8SA 3DHUA 3U57A 4J3TA 2ZXQA 1KB3A 1OD8A 3WL0A 5E09A 2E9LA 3OLGA 1AQMA 3W37A 1HXJA 3VNZA 2ZUNA 2EJ1A 1PBGA 1KXVA 2ZIDA 5CLTA 5A6LA 2X0HA 1HVXA 3OBAA 1BHGA 4TVDA 4IISA 1J10A 4PMRA 2OYKA 4E2OA 1OM0A 4B9ZA 2PWGA 3PTMA 3T2QA 1UWSA 1E5JA 5CXPA 2BHYA 1US3A 4HA1A 1JD9A 1B3XA 2CESA 1HJUA 3GNPA 4H8VA 4DWSC 2GK1A 3THDA 1UR1A 3GBDA 3MKKA 4QLLA 4B3KA 2DT0A 5GNZA 1FP9A 1ZBKA 3OA5A 1JFHA 1MW0A 4A3HA 4TTUA 2Y24A 4W8AA 1FHDA 4D1IA 4DM1A 4DWSA 3OGRA 5M5DA 4MB1A 1V3LA 5HNNA 3MMWA 3CUGA 2YL5A 1E6ZA 4CN1A 4WKFA 5I24A 3BMWA 2FDMA 3FAWA 1XD0A 1E4IA 3OGVA 2OWXA 1QNOA 1QI4A 1CXKA 1G0CA 1UD4A 2W5FA 2X2YA 4B9YA 1W3LA 4W87A 1Q6GA 1L8NA 2FGZA 3W26A 4Y7EA 1UD8A 3LPGA 3OLIA 5A8MA 3T2OA 3VIMA 1OCQA 3TTSA 2F61A 1KR0A 2VUYA 1UA7A 4AC1X 1WZLA 1B3ZA 3IJ7A 1HT6A 4UOZA 1DWJM 1M7XA 3AIQA 2D1ZA 3W38A 3W0KA 4J28A 2VZTA 3N18A 1LJYA 1E71M 4ZEPA 5HDRA 5I5RA 1Q6EA 3PZ9A 4MJ2A 1GW1A 3VGDA 4UQAA 1XYFA 1EHNA 4YPJA 4YHEA 2TAAA 4CU7A 5KZ6A 5DO8A 4GO8A 4AZBA 3IK2A 4QAWA 2Y5EA 4AZHA 3EYPA 2PWDA 2W67A 2WXDM 4AY1A 1QVBA 1S46A 1J01A 3KL0A 4ML4A 2XM1A 1HF6A 4Z2HA 2VZVA 1DHKA 2CBVA 3FHQA 2GJRA 4ZE5A 1MWOA 2DGAA 1JIBA 1EGZA 1CXFA 5D8ZA 3SCUA 2BY3A 3ALFA 4CD7A 4D6EA 3EDFA 1GORA 1UR2A 2XSBA 4PUDA 4EAMA 2WVVB 1E43A 4Z2KA 3GM8A 1GQLA 1EOMA 5ABGA 3SCVA 1G5AA 3WF4A 3KE0A 4BA0A 3VMPA 5C70A 2PWHA 1JFXA 1SMAA 3VVGA 1HNYA 5BROA 3QOMA 2J7DA 3N13A 3IANA 1HN1A 2J7HA 1UYQA 2W62A 3OZPA 1ZBWA 4GI8A 1E9LA 2VQUA 3VIKA 2PB1A 2YL6A 5E70A 2D20A 4MPKA 5FL1A 4JHZA 2DIJA 4TX6A 4TVUA 2UY2A 3AHVA 3AS3A 3K4DA 3FAXA 3CZEA 5HPCA 1V0LA 4CD8A 1GCYA 2A3EA 4NRSA 3PZNA 3TOPA 4AWEA 3MUZ1 3VIGA 1W3HA 4DUVA 1BG9A 4W7UA 2MANA 4JIEA 3ARXA 3A4AA 1C8QA 4W88A 1UOKA 6TAAA 1WDPA 1W3JA 1ISXA 3OZOA 2ZWYA 1R87A 3WFLA 4EANA 4JAWA 4NRRA 2VL4A 3CGTA 1ODZA 1B90A 4HMEA 1HJVA 4OKDA 5BWFA 1FH9A 3L4XA 1KBBA 1UD2A 1PX3A 1E6RA 2BY2A 4WKHA 3A4XA 4MAVA 4WKAA 3U7VA 2XIIA 4BQ5A 3B9AA 3HN3A 3IJ9A 4FLOA 1NP0A 1SR0A 4J27A 2YBTA 1YQ2A 4JFVA 2J4GA 3GXDA 4J3UA 1JDCA 1H5VA 5C8BB 1E6SM 2ZXDA 4HZ8A 4NI3A 1HP4A 2O9TA 2VQTA 2ZICA 3ZJ8A 2X8RA 1PPIA 2VRQA 2WVUA 2E0PA 1PX8A 4LQ1A 5IHSA 1I1WA 3ZMRA 5I23A 2ZXBA 3GH5A 1QBBA 2BFGA 4JKMA 1O7AA 1GVYA 3WUBA 1OIMA 2YDQA 2G4FA 4UTFA 4S3KA 2GFTA 1EQCA 3BLKA 3GBEA 1D2KA 4PMYA 4D6CA 1QNPA 1WPCA 2ZUSA 1CGXA 3K1DA 4J7RA 1K6AA 2J75A 2VRJA 4Q22A 1JNDA 3DYPA 4WLCA 1CDGA 1VFUA 3AOFA 3LPFA 3VX0A 1QI3A 4IPLA 3UG3A 2WAGA 4R5EA 1ISVA 1GZJA 4MB4A 3CUHA 4QP0A 4KRUA 1MQPA 3WFZA 1RP9A 4QLJA 1KXQA 4W5ZA 3ARPA 2PBGA 3VMOA 2FGLA 2BVYA 1KXTA 1UWIA 3L4UA 3OLDA 1BYDA 1JGIA 4S3JA 1EQPA 4KH2A 3QHMA 7CGTA 1EDGA 5LYRA 3MMUA 1DEDA 4XV0A 4ZXLA 2BY1A 1E3ZA 4P8VA 2DEPA 3CHDA 5EFFA 3WDRA 4EKJA 2WC3A 1WCGA 5A8NA 3VO0A 4H7VA 3K46A 1RP8A 5CGTA 2UWFA 2VX7A 3PBGA 2YDRA 3T0DA 4PMUA 3BSHA 2JEQA 1ECEA 5JUVA 4V27A 3ZM8A 4PTXA 2VT0A 1UKPA 5IXEA 3L4WA 1FA2A 1GJUA 4IPNB 1TFVA 4F9JA 1EOKA 3CZ8A 1W91A 1BYCA 2QPSA 1XH2A 5M3WA 1E0WA 4AISA 3WUEA 3QHOA 1C91A 4D6JA 2X09A 3AJ7A 3SUSA 3AZRA 1C92A 1E6PA 2A3CA 3L4VA 3VDCA 3WDPP 3WQ6A 3SURA 2XJ7A 2FHFA 2BHUA 1UWUA 2XVKA 4FLQA 3NJ3A 4M82A 1KQYA 3EMZA 1CLXA 5E6ZA 1VAHA 3CMJA 2D3NA 3MUY1 1CTNA 1GOMA 3CHEA 4RE3A 1ZJAA 4AD0A 3CBWA 1VFMA 1GVIA 3E1F1 4TOQA 3CZGA 2VTFA 3W29A 3SUTA 1OWQA 2J62A 4RE4A 5D9PA 1E0VA 3VTRA 4E4PA 1UKOA 2CXGA 2ZX8A 1C8YA 4XX6A 4MDOA 1F4HA 1KFWA 1U2YA 5CSYA 1PAMA 4AD3A 2V3DA 3ZSTA 4AD2A 1H09A 1K9DA 1VFFA 1DP0A 2WANA 2CBIA 1JZ8A 4UFLA 1LG1A 2C7FA 4PMZA 1NOFA 2WMJA 1WDRA 3RILA 2W63A 1C7TA 1CLVA 2XFFA 1VBUA 2UY3A 1E70M 1QNRA 2GJXB 5E0FA 1PIGA 1BGAA 1JI1A 2DSKA 1VIWA 2CYGA 4BZYA 3VM7A 5AC4A 1C3FA 3O2LA 4JL1A 3AMGA 1OBAA 2PWEA 4GZJA 4TVCA 1ITCA 1VRXA 4JHOA 2E9BA 4AD1A 4AD5A 2J8GA 3ARTA 3SCNA 3SCRA 1UR9A 4AZ5A 5A94A 2CIPA 3WD1A 5A95A 4GI6A 5A2BA 4W85A 2YJQA 5LA2A 3BH4A 3WIJA 3SIMA 1GNXA 2GSJA 4JFTA 4MAZA 3O9NA 2VURA 3NUKA 1GPFA 1CXEA 3SCSA 1NWUA 2V3EA 4AZGA 2YOCA 1UWTA 2DSZA 1V3KA 3WH9A 3W82A 1MW3A 3CZKA 2X1IA 1Q6CA 3FN9A 2ZXAA 5JBEA 2DPEA 1OGSA 3UG4A 1WE5A 3VIJA 2DIEA 3LPPA 1UKQA 1WZMA 7A3HA 1BYAA 1E5NA 1XH0A 3MANA 4NZCA 1UD5A 2WPGA 3VD7A 3EDEA 3PN8A 4Z2IA 1EA9C 1RH9A 5A2AA 4AYSA 1BVNP 1NWTA 2DSVA 2NSXA 4V28A 3TA9A 1W9DM 3WBAA 3AIWA 4N42A 4PSPA 2ZX5A 4JKLA 2OWCA 1HKKA 2YA0A 2J7CA 5EMYA 3W6MA 3WENA 5JBDA 2YKKA 3N1AA 4M81A 3RJYA 3UERA 1E56A 1PZ3A 3VX1A 3N11A 2HVMA 1IT0A 1HL8A 2PF0A 4CD5A 1HJXA 4YN5A 4K68A 1NOUA 1E55A 3GXIA 1MQRA 3BAWA 3FNDA 2CKSA 3WMCA 1W9BM 1PIFA 3RM4A 9CGTA 1JYVA 4N0RA 2VX6A 2J7BA 1JL8A 1VFOA 1UR4A 2W91A 3A4WA 4LXFA 1QI5A 4UFHA 1JI2A 4U2YA 1MFUA 4UNIA 2CCRA 3NDYA 3ZSSA 2Z1SA 1J0YA 1H1NA 2EPOA 1W1PA 3WQWA 1W9PA 1C7SA 5GNYA 2WVSA 2VR5A 1VEOA 3K8LA 5ABEA 3AYRA 2Y4SA 1EO7A 2D23A 2XSAA 2V5DA 4OZOA 5FKYA 1Y7VA 1CGYA 1MQQA 4J3XA 3TTYA 1FFRA 4TXEA 2VOTA 2XUCA 1UA3A 4WIWA 1V6VA 1JYWA 4GQQA 3PZQA 4AIUA 2WSPA 3F5JA 4H41A 3S2CA 1KXHA 5ABHA 1J0KA 3CIVA 1UWQA 2CKRA 3BAKA 3BGAA 4CU8A 2WWDA 4CD4A 1BPLB 4CU6A 3DECA 2C0HA 5BXRA 1PX4A 2VRKA 3SCTA 5LA1A 1IV8A 4HPHA 5CZKA 4F9DA 4UR9A 3GH7A 3JUGA 3UETA 3II1A 1J12A 4OBRA 1XSJA 4GINA 5LA0A 1B2YA 4PYSA 1E6QM 1R7AA 5DT5A 2F8QA 1E6NA 4F66A 3ZJKA 4ACZB 4AIOA 2WKLA 4CGTA 1Q4NX 1E40A 3AQUA 5I3DA 3M07A 3W6LA 1V0MA 1V08A 3RMEA 5HOSA 4X9YA 1CGTA 3MSGA 1D3CA 1BAGA 1OGBA 3DYOA 1UG6A 1XGZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2C8N A;  2OSY A;  1H41 A;  2WZH A;  3N15 A;  4ZEN A;  3PZM A;  4W86 A;  1FP8 A;  3NDZ A;  1LWJ A;  1LL6 A;  2QF8 A;  3I3D A;  3GNR A;  2WSK A;  5E6Y A;  3FW6 A;  4MNL A;  5BXS A;  5CLW A;  1B0I A;  1NWR A;  2FH8 A;  8A3H A;  5F7U A;  1HKM A;  2GUY A;  4LYR A;  1J18 A;  3WQ8 A;  8CGT A;  2WHJ A;  1G94 A;  1JZ6 A;  1RPK A;  1EDT A;  1KGU A;  1E4L A;  1CXH A;  3WEM A;  3D5H A;  3PTK A;  4Z2J A;  3TTQ A;  3AIV A;  3CUF A;  5C71 A;  1V6U A;  4MJ4 A;  4UQ9 A;  2YLA A;  2GVY A;  4HU0 A;  4FLS A;  3AS0 A;  2WHK A;  5IFP A;  1JZ5 A;  3HJE A;  2UY5 A;  4UZU A;  2IUZ A;  4GKL A;  2W66 A;  4HTY A;  3FXY A;  4L4O A;  3ZT7 A;  1TZ7 A;  1EH9 A;  1MVY A;  2D2O A;  2WMK A;  3FHA A;  3ZT6 A;  3WMB A;  4F8X A;  3VIP A;  4AD4 A;  2VCB A;  5AYI A;  4J3S A;  4DM2 A;  1MYR A;  3VNY A;  2O9R A;  2PC8 A;  3THC A;  4HA4 A;  3AI0 A;  1SMD A;  4OOU A;  4D6G A;  4U31 A;  3VIH A;  4QLK A;  2WCG A;  4OOZ A;  4D6D A;  5A6B A;  3VKK A;  3OG2 A;  3RPM A;  3WQ5 A;  1BLI A;  4PMQ A;  3ZJ6 A;  3J7H A;  2X0Y A;  3WH5 A;  1UH2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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