3S6TA

Crystal structure of insect beta-n-acetyl-d-hexosaminidase ofhex1 v327g complexed with pugnac
Total Genus 189
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
189
sequence length
575
structure length
575
Chain Sequence
VAAEDVVWRWSCDNGKCVKLKNDPRSSEPALSLEACKMFCNEYGLLWPRPTGEADLGNFLSKINLNSIEVKILKKGATDDLMEAAAKRFKEQVSLAIPRGSTPKLTGKAVDVYLVNENPNEKAFSLEMDESYGLRVSPSGADRVNATITANSFFGMRHGLETLSQLFVFDDIRDHLLMVRDVNISDKPVYPYRGILLDTARNYYSIESIKRTIEAMAAVKLNTFHWHITDSQSFPFVTTKRPNLYKFGALSPQKVYTKAAIREVVRFGLERGVRVLPEFDAPAHVGEGWQDTDLTVCFKAEPWKSYCGEPPCGQLNPTKDELYQYLEDIYSDMAEVFDTTDIFHMGGDEVSEACWNSSDSIQNFMMQNRWDLDKESFLKLWNYFQQKAQDKAYKAFGKKLPLILWTSTLTNYKHIDDYLNKDDYIIQVWTTGVDPQIKGLLEKGYRLIMSNYDALYFDCGYGAWVGAGNNWCSPYIGWQKVYDNSPAVIALEHRDQVLGGEAALWSEQSDTSTLDGRLWPRAAALAERLWAEPATSWQDAEYRMLHIRERLVRMGIQAESLQPEWCYQNEGYCYS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords N-acetylglucosaminidase
publication title Active-pocket size differentiating insectile from bacterial chitinolytic beta-N-acetyl-D-hexosaminidases.
pubmed doi rcsb
source organism Ostrinia furnacalis
total genus 189
structure length 575
sequence length 575
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2011-05-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF14845 Glycohydro_20b2 beta-acetyl hexosaminidase like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3s6tA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3s6tA01
1R86A 2V3EA 2EPKX 3VILA 1UR8A 3O2LA 1G1YA 1JGIA 4QLLA 4CD4A 3N17A 3EMZA 3PTKA 3KZSA 2OLHA 1GOIA 1XH0A 1U2YA 5JBEA 3S2CA 2YA1A 2WVSA 3LPFA 7TAAA 5GNXA 3GZAA 1PZ3A 1EA9C 3IAQA 4TX6A 3IK2A 4PMQA 3MANA 5BYWA 2GJXB 3W38A 1UD5A 3K46A 1B9ZA 4PTMA 5I6SA 2CBJA 4J3TA 3GNOA 3RJXA 1SMAA 2OWWA 1KGUA 4PMVA 3PBGA 1JXKA 4D1JA 1M03A 3WN6A 3EMQA 4ACZA 4CGTA 2B31A 4W86A 3RIKA 1CXFA 4L4PA 3PZQA 1UG6A 4L4OA 1FHLA 2ZX6A 1JFHA 1GZJA 4GIAA 3OGRA 5I0DA 4P7QA 4UFLA 3UETA 1HL9A 4MPKA 2TAAA 2VRQA 2W66A 1J0KA 1UD6A 2DSWA 1OCQA 2VX6A 1WCGA 1NP0A 5M03A 2J7HA 3SCVA 2BY1A 4HA4A 3BCFA 5FL0A 3A6OA 4UOQA 1E1FA 2FHCA 3WNOA 5A6MA 1C92A 4P7RA 5CZKA 5TD4A 2ZE0A 2XGBA 3AFBA 2X0YA 1J11A 3ALFA 3WQWA 3WQ5A 4KRTA 2CPUA 1FA2A 3HJEA 3I3EA 4UQCA 1RD6A 5JIWA 3VD4A 3WBEA 2QMKA 1ISYA 1J12A 3T0AA 4PMOA 1JZ7A 2DH3A 2VR4A 1TG7A 1JI1A 3SUUA 1HJVA 1OIFA 1EQPA 2YKKA 1YHTA 1QI2A 1S46A 1ZJAA 2E40A 4JHOA 4PRWA 3MV11 2DEPA 5DFAA 3CUFA 5I3DA 3EDEA 1CLVA 2ZWZA 2ZWYA 4F9JA 1W2VA 3AMLA 1UWIA 3WD0A 4LQ1A 2DQXA 3AQUA 1WPCA 2VVSA 1V6VA 5ECUA 1C8QA 5E0CA 4Y7EA 2ZX7A 4JFVA 1ZBCA 3VNYA 3MUAA 1LL4A 2X0HA 4JCMA 1US2A 1TCMA 2GUYA 2WHMA 1JDDA 3GBEA 2A3HA 3KL3A 3WMBA 3ZJ6A 3BMVA 2QMJA 1H09A 1GQIA 1QW9A 2J62A 1UH3A 1CXLA 2J7CA 1QI5A 1TVPA 3EBVA 4FLRA 1UA3A 5IFPA 3AIRA 5I23A 3LPOA 3TTQA 3OA5A 4JFSA 3WQ4A 4DWSD 3WD1A 3FHAA 3OG2A 4FLOA 3WFLA 9CGTA 1MFUA 2BHUA 2DT0A 3MSDA 3N18A 2EQDA 3GH7A 3W27A 4LXFA 4AYSA 2XVLA 1QNOA 3A3HA 1LQ0A 1JD7A 3CMJA 1KFWA 2FDMA 5AYIA 4PUEA 1LL6A 2O92A 1R87A 3UERA 3L4TA 1HXJA 4M29A 6TAAA 3N9KA 3AHXA 4W8BA 1QNRA 1W1YA 2A3EA 3CGTA 4ML4A 4PMNA 3WF3A 1WZMA 5ABFB 4N42A 2XIIA 2D24A 3SUTA 3QOKA 1KQYA 2O9RA 2VMFA 3AXXA 3WF1A 4KH2A 1BVZA 4J3UA 3GNRA 3SEPA 2JFEX 3AS3A 2GK1B 1H4PA 1TE1A 3CPUA 1QNSA 2WMIA 2Q8XA 2XVKA 1G94A 3W0KA 1E4LA 4CCCA 1J9YA 5GNYA 4JCLA 4M8UA 2XFRA 3MU7A 3SCQA 4LGXA 1CBGA 4J28A 3T2QA 3GXFA 3VDBA 1ZBVA 1H41A 4CCEA 3QHNA 2J78A 4GI9A 3OZPA 1UR2A 1LL7A 1JZ5A 3VVGA 1VENA 3MS8A 1PAMA 5FIPA 3HN3A 2W92A 2AOSA 1JDAA 3T0BA 2Y2WA 3AI0A 1UZ1A 2YDRA 5E6ZA 5HXMA 3VD7A 3FY1A 1VJSA 1VEMA 3SCOA 4AD3A 2PWGA 4HPGA 1R8LA 5E70A 1CZ1A 4IPLA 1NARA 1WNOA 5D4YA 2VX5A 3HU7A 1F4HA 2W4XA 3SUWA 2D2OA 1ZJBA 4BQ5A 4KMQA 4UFIA 4FLSA 1UH2A 3ZR6A 1TZ7A 2WC4A 4ZENA 1GOMA 2XSAA 3VM7A 1BLIA 4FLQA 5FL1A 1AQMA 2BHYA 1H49A 3CZEA 1V3MA 3ZO9A 4Z2HA 3QHOA 1JYWA 1W3KA 5E6YA 3PZNA 3DYMA 2DSZA 4PCSA 5LA0A 3WDQA 2J8FA 3NSMA 3BLPX 4AEFA 1QPKA 2XFYA 3W82A 2EBNA 3GM8A 4MNMA 4P8XA 2A3AA 3MMUA 1B1YA 4D6JA 2DGAA 4Z2IA 1DEDA 4JL2A 3VO0A 2VR5A 1UD3A 4H7VA 1UA7A 1E6XM 1WO2A 1CECA 3WL0A 2QV4A 1OT1A 3BAYA 1KWKA 2V3FA 4AZIA 5CQ1A 3NIYA 1MFVA 3PZGA 3VIMA 4Q7NA 1J01A 2GSJA 4DWSA 4MB3A 3CUGA 2J7EA 3FW6A 2CEQA 2WCGA 1HNYA 3TOPA 3B8SA 4LYPA 3RCNA 2CITA 4KRUA 3F5KA 3CHDA 5FOOA 3ZT7A 1UD8A 4B16A 3VIJA 3CHEA 2XTKA 1H2JA 3CHCA 3D5HA 2VRJA 2VC9A 5BROA 4AZ5A 1VFUA 2ZICA 5C71A 4HMEA 2D23A 1V3JA 4EE9A 3WD3A 2UY4A 3SCUA 2WC3A 3VMPA 4XUYA 1Q4NX 2WMGA 2CKRA 3N1AA 4HOZA 5A8NA 4WKHA 2WANA 3L4UA 2GVYA 1XCWA 3HMCA 1CGXA 3ARYA 4MB4A 4JL1A 5HDRA 5I78A 1UKQA 5CGTA 2VZUA 1BAGA 4BF7A 4GINA 3W81A 1V08A 1SMDA 5CPSA 1A3HA 6A3HA 1BGAA 4H8HA 2VTFA 2ZXDA 1NWSA 1FP8A 3WIJA 2JF6A 3WDJA 2ZXBA 1VFFA 4CCDA 1JXJA 2YDQA 3S6TA 3WF2A 4D6FA 2VQUA 3WENA 3WELA 3ZT6A 3BSHA 4M80A 3MMWA 3W6LA 3PZMA 1XD1A 5EFDA 2WM0A 4D6GA 5DEZA 1QHZA 3WH9A 4IUGA 3O9NA 1LWHA 4X9YA 3RMEA 3K4DA 4QCEA 3AXIA 1J0HA 5EB8A 4B3LA 1G01A 1K6AA 1UR1A 3A4XA 4DWSB 1M53A 3TONA 4XZBA 5JUVA 1E3ZA 4AD0A 1BYBA 3RDKA 5A8PA 3F4VA 3QHMA 3O6AA 1JF5A 3W29A 3POCA 3WDRA 4HA1A 3T0DA 4BZYA 1HKKA 3G6MA 4F66A 1MXDA 4H04A 1GCYA 3GDBA 5EFFA 1OD8A 1E72M 3CZGA 4ZE5A 2MANA 4M56A 3WL1A 3I3DA 2VCAA 4JKLA 3CBWA 3AMGA 3NSNA 1CXIA 4URIA 4CU8A 2NT0A 3GXDA 2W63A 3UR7A 2PC8A 2ZXAA 4S3JA 3T09A 2QHAA 1MXGA 4XV0A 5A6JA 2DSKA 4F79A 1WB0A 3U7VA 3EDDA 2YL8A 5ABHA 3VNZA 3MV01 4J27A 3WUBA 4BCEA 1V03A 5BXPA 1UWSA 2X05A 3WY1A 3VMOA 3W26A 3FN9A 4M1RA 4HOWA 1IZKA 1DTUA 1TA3A 2BY3A 3ARTA 3W53A 1AQHA 3RPMA 5A6LA 3FHQA 1GHRA 2ZX8A 1EIBA 5A69A 2DIJA 5A2AA 2PB1A 3ARVA 4D6CA 2VZVA 3L4ZA 4GZJA 3E1F1 1MQQA 1BF2A 3LMYA 3WH5A 2W67A 3KL0A 1WZLA 3VIFA 4MADA 1GHSA 4MNJA 1E0XA 1QW8A 1WAWA 2WHLA 3VIHA 4MAVA 3AZSA 2WBKA 3AOFA 1JL8A 1WDPA 2VO5A 4P8UA 1MVYA 3ZR5A 2WYSA 2ZUWA 3PN8A 3DHUA 4MB1A 3DECA 2UY5A 5ABGA 2G4FA 1JFXA 5HPCA 2JALA 1CDGA 3SCPA 1E40A 4UZSA 1HIZA 1XH2A 4WK9A 4HA3A 1W3LA 4U33A 1B31A 3W37A 3D3AA 2FGZA 2E9LA 4W87A 3EDKA 1UWTA 4F8XA 1E73M 1XH1A 4W5UA 3VU2A 4AC1X 1XYZA 5IFTA 3ZJKA 1BG4A 1GUVA 2JIWA 4CD7A 3CHFA 3FNDA 1FFRA 1WZAA 1W3HA 2X8RA 3GTNA 4KGLA 3THCA 1U30A 1MQRA 1E70M 2EPLX 1CGVA 4TXEA 1V3LA 3OBAA 1EHNA 3BAIA 4Z2GA 3SCWA 1XYFA 1H1NA 2G8ZA 3PTMA 3QOMA 1TA3B 2DT2A 3PTQA 1V0KA 2D0FA 5A94A 1CENA 1KQZA 3OLEA 1DWGM 3N04A 1VB9A 4D72A 3SCSA 3WEOA 2DPEA 1J0YA 4ZXOA 4DWSC 1D7FA 1HVQA 1NWUA 3WDHA 3VGDA 1PIFA 5A6KA 4ATLA 4CU6A 1UKOA 3AXHA 2E9MA 1WE5A 4OBSA 1BTCA 2WVVA 5IDIA 1O7AA 4E2OA 3WNKA 2XVGA 3A4AA 1X6NA 3IAPA 1DWJM 3AZRA 2PBOA 1NH6A 4C91A 2BVYA 4H2CA 1XV8A 4B9ZA 5ABFA 1V0NA 2J7BA 4XX6A 2NW0A 5AY7A 1OIMA 5C70A 1JZ8A 3WKZA 3W24A 1V3KA 2GK1A 4OKDA 4QFUA 3EDJA 2IXVA 2D0HA 1OSEA 4UQDA 3MSGA 5EBAA 4PMYA 1EDGA 4PTWA 5A6BD 4CKQA 3ZSTA 1PX3A 1V6UA 4YPJA 4HOXA 3BLKA 1VFOA 4HU8A 2ZXQA 4WSJA 4TVDA 5D8ZA 1C8YA 4V27A 1QNQA 3VOCA 5CLWA 1TFVA 1C7TA 3WDIA 2YLLA 1H3GA 2YIHA 3ZSSA 1J18A 1VJZA 1UKSA 2EPNA 2CBVA 3AHTA 2WVUA 4LYRA 3WQ6A 5D9MA 1KBKA 4CN4A 2YJQA 1XRVA 4XZWA 2X1IA 2C7FA 4EKJA 4PTVA 2GJRA 5I24A 4C90A 3WEZA 2CHNA 4DUVA 4PMZA 1OBAA 2J47A 5ABEA 4HU0A 2XSBA 2CYGA 1E0VA 2WMHA 2BV9A 4GZEA 4C7FA 2EPMX 2VZTA 1PX8A 2EPOA 3RM9A 3BH4A 3ALGA 4MDOA 2NT1A 2QPSA 3BAJA 1E4MM 2XHYA 3BMWA 1I1XA 4AD2A 4BQ2A 2WAGA 2G3IA 1ISZA 1JYVA 1GORA 4AIOA 4AZCB 5GPRA 1CIUA 1Q6GA 3AJ7A 2WVVB 3ARRA 2GFTA 3U5UA 3A4WA 2E8YA 3WH8A 2WZEA 1N82A 4N0RA 4J3XA 3VX1A 1MQPA 2DT1A 5KZ6A 4UZUA 2W61A 3GYCA 5BRPA 1BYAA 5IXEA 3BAXA 2VNCA 2XGIA 3UG4A 4RE3A 3WUFA 2WC7A 2VL4A 4AZHA 4E8DA 3AYRA 3L4XA 1V02A 2VQTA 3VDCA 2J7FA 2PWEA 2OSXA 2WKLA 2CXGA 1NM9A 5BRQA 1D2KA 4HMDA 1JYXA 4IISA 3SIMA 4QCFA 3PHAA 1GOKA 5IHRA 3SUVA 3U5YA 4EK7A 4AZ7A 4BS0A 2O9TA 2V3GA 3TTOA 2DSUA 3IANA 4YHGA 3T08A 4D6DA 2UY3A 1W2PA 5IHSA 4RE2A 4PN2A 2ZUSA 2WMJA 5A1AA 1EO7A 3WF0A 2CNCA 1GOQA 1SR0A 2XIBA 2PWFA 1E6NA 2YL9A 3K8MA 1E4IA 4U5IA 1HKJA 3W28A 1MW0A 3OLIA 5I79A 1XSIA 3POHA 1PX4A 1VF8A 1NQ6A 4D6HA 1BVNP 4R5EA 1RP8A 1WZKA 2FH6A 4Z2KA 1WP6A 2XUCA 2WK2A 1TMQA 4AD1A 4WJXA 4UTFA 1C8XA 1Y7VA 5JBDA 2YBUA 3NYDA 2YDSA 3RM4A 4UQBA 3NDZA 1V3HA 5BXSA 2ZX9A 1IZJA 2BVTA 1BFNA 3AIUA 2IXUA 1RP9A 1LG1A 4BQ4A 3WMSA 3U57A 3ECQA 3BGAA 1QBBA 1JDCA 3OIHA 3ARSA 1UD4A 2E8ZA 3L2LA 2F8QA 3UCQA 1DWAM 3AZTA 4OJYA 5LYRA 2PF0A 3ZJ7A 4AWEA 3PZUA 2Y4SA 5HOSA 1E5NA 1CPUA 3IJ8A 1GPFA 1MWOA 2A3BA 4QAWA 1XSJA 3NSXA 1OGBA 4AW7A 1AMYA 5AC5A 3T2PA 3WNLA 1CLXA 1BGGA 1EDQA 1MW2A 1C7SA 1F4AA 1ZS2A 5E9AA 2HVMA 2V38A 2AAAA 3AIQA 2OYMA 2D0GA 3ARWA 1EDTA 4P7NA 2WWCA 2XWDA 5DMYA 1Q6CA 4CVUA 5E09A 1QNPA 5E0FA 1CEOA 2QF8A 3RM8A 2E3ZA 1W9UA 4NRSA 1XSKA 1R7AA 1E56A 3DYPA 3VIKA 1V0LA 3OGVA 2WW5A 1JG9A 7A3HA 1DHKA 3WH7A 2XM1A 1ISXA 1V02E 1GONA 1PJ9A 1J0IA 1OB0A 1PBGA 3I3BA 2CIPA 3SCRA 5DO8A 2ZUVA 5D8WA 1M04A 4CN6A 4JFWA 3THDA 3WD2A 1B3ZA 3N11A 5A3HA 5M3WA 1E1EA 3EYPA 4NZCA 4D1IA 1JZ6A 1US3A 4PMUA 4H8UA 1ITXA 4JFUA 3TP4A 1BSIA 4A4AA 4UFKA 4PYSA 3NUKA 3NDYA 2WSPA 2C0HA 1HT6A 2G3MA 1Z32X 1WKYA 1JZ4A 3AIBA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1R86 A;  2V3E A;  2EPK X;  3VIL A;  1UR8 A;  3O2L A;  1G1Y A;  1JGI A;  4QLL A;  4CD4 A;  3N17 A;  3EMZ A;  3PTK A;  3KZS A;  2OLH A;  1GOI A;  1XH0 A;  1U2Y A;  5JBE A;  3S2C A;  2YA1 A;  2WVS A;  3LPF A;  7TAA A;  5GNX A;  3GZA A;  1PZ3 A;  1EA9 C;  3IAQ A;  4TX6 A;  3IK2 A;  4PMQ A;  3MAN A;  5BYW A;  2GJX B;  3W38 A;  1UD5 A;  3K46 A;  1B9Z A;  4PTM A;  5I6S A;  2CBJ A;  4J3T A;  3GNO A;  3RJX A;  1SMA A;  2OWW A;  1KGU A;  4PMV A;  3PBG A;  1JXK A;  4D1J A;  1M03 A;  3WN6 A;  3EMQ A;  4ACZ A;  4CGT A;  2B31 A;  4W86 A;  3RIK A;  1CXF A;  4L4P A;  3PZQ A;  1UG6 A;  4L4O A;  1FHL A;  2ZX6 A;  1JFH A;  1GZJ A;  4GIA A;  3OGR A;  5I0D A;  4P7Q A;  4UFL A;  3UET A;  1HL9 A;  4MPK A;  2TAA A;  2VRQ A;  2W66 A;  1J0K A;  1UD6 A;  2DSW A;  1OCQ A;  2VX6 A;  1WCG A;  1NP0 A;  5M03 A;  2J7H A;  3SCV A;  2BY1 A;  4HA4 A;  3BCF A;  5FL0 A;  3A6O A;  4UOQ A;  1E1F A;  2FHC A;  3WNO A;  5A6M A;  1C92 A;  4P7R A;  5CZK A;  5TD4 A;  2ZE0 A;  2XGB A;  3AFB A;  2X0Y A;  1J11 A;  3ALF A;  3WQW A;  3WQ5 A;  4KRT A;  2CPU A;  1FA2 A;  3HJE A;  3I3E A;  4UQC A;  1RD6 A;  5JIW A;  3VD4 A;  3WBE A;  2QMK A;  1ISY A;  1J12 A;  3T0A A;  4PMO A;  1JZ7 A;  2DH3 A;  2VR4 A;  1TG7 A;  1JI1 A;  3SUU A;  1HJV A;  1OIF A;  1EQP A;  2YKK A;  1YHT A;  1QI2 A;  1S46 A;  1ZJA A;  2E40 A;  4JHO A;  4PRW A;  3MV1 1;  2DEP A;  5DFA A;  3CUF A;  5I3D A;  3EDE A;  1CLV A;  2ZWZ A;  2ZWY A;  4F9J A;  1W2V A;  3AML A;  1UWI A;  3WD0 A;  4LQ1 A;  2DQX A;  3AQU A;  1WPC A;  2VVS A;  1V6V A;  5ECU A;  1C8Q A;  5E0C A;  4Y7E A;  2ZX7 A;  4JFV A;  1ZBC A;  3VNY A;  3MUA A;  1LL4 A;  2X0H A;  4JCM A;  1US2 A;  1TCM A;  2GUY A;  2WHM A;  1JDD A;  3GBE A;  2A3H A;  3KL3 A;  3WMB A;  3ZJ6 A;  3BMV A;  2QMJ A;  1H09 A;  1GQI A;  1QW9 A;  2J62 A;  1UH3 A;  1CXL A;  2J7C A;  1QI5 A;  1TVP A;  3EBV A;  4FLR A;  1UA3 A;  5IFP A;  3AIR A;  5I23 A;  3LPO A;  3TTQ A;  3OA5 A;  4JFS A;  3WQ4 A;  4DWS D;  3WD1 A;  3FHA A;  3OG2 A;  4FLO A;  3WFL A;  9CGT A;  1MFU A;  2BHU A;  2DT0 A;  3MSD A;  3N18 A;  2EQD A;  3GH7 A;  3W27 A;  4LXF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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