3SCUA

Crystal structure of rice bglu1 e386g mutant complexed with cellopentaose
Total Genus 197
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
197
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
NWLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNEPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITGNGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase 7
publication title Structural investigation of the basis for cellooligosaccharide synthesis by rice BGlu1 glycosynthases
rcsb
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 197
structure length 472
sequence length 472
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2011-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3scuA00
4E2OA 3ARQA 3WF0A 1TE1A 4HA3A 4HPHA 4PMVA 3SIMA 3VILA 1WZMA 5AC5A 3DHPA 3K4DA 4AD4A 4AC1X 5D9PA 1GHRA 1QNOA 3F4VA 4JFVA 4ATWA 2OWWA 3PZTA 1HVQA 4XZWA 5LA2A 3WD4A 4AIOA 1TCMA 4LYRA 1UR9A 3T2PA 1OGSA 3WMBA 1JXKA 1EOMA 1FH8A 2EPLX 2OYLA 5ABFB 4M81A 3VM5A 2XIBA 1H0IA 2WHMA 2VMFA 1JDDA 4BQ4A 1MW2A 1JD9A 1E70M 4PN2A 2BS9A 4PYSA 1KWKA 2VURA 2WXDM 4CU8A 5BRPA 4EAMA 2ZX5A 3SCPA 5I0DA 3AXIA 4Z2KA 1L0PA 1GQJA 1TA3B 2X0HA 3CBWA 3F5JA 1E40A 3TA9A 2UY5A 1GOWA 3WH7A 2W67A 3WUGA 3N11A 3VGBA 1PZ3A 1ITXA 1FOBA 3VIFA 1QI2A 5ABEA 2D2OA 1JZ8A 1X1NA 2FGLA 2WKLA 3L2MA 4Q22A 4GZJA 5A6AA 1UKTA 1UR0A 6A3HA 1BYCA 1UH2A 5FKYA 3W4RA 1ZBKA 5HNNA 1J18A 4MADA 1EH9A 5DFAA 1TVNA 1JF5A 1QNPA 1SR0A 1B3ZA 1MW0A 2ZWYA 1VBUA 2CHOA 2W92A 4WKAA 1WKYA 1MFVA 2W61A 3WEMA 1OGGA 1NOFA 2QMKA 1I1XA 4WIWA 3WF2A 3IANA 3ZJ8A 2QF8A 3TTYA 1GUVA 4MJ4A 3FNDA 4P7NA 1KGUA 4BQ3A 1UZ4A 4UNIA 3EYPA 1E43A 2ZUTA 1DEDA 3WFZA 5JIWA 1FFQA 1BPLB 2WMIA 1CGWA 4WK9A 7CGTA 3RPMA 1CZ1A 2ZE0A 4AWEA 2EXOA 5CQ1A 4ZE4A 1EO7A 4AD2A 1ESWA 1XCXA 4H41A 2WC4A 4ZE5A 2DIEA 2WC3A 1B90A 4X0NA 3ZMRA 3VIPA 3T0AA 5BCAA 1OT2A 3GBDA 4OUEA 4J27A 2DEPA 5ECUA 1W9VA 5LYRA 5BYWA 3W29A 3AS0A 4UOZA 1C8YA 4P8WA 1DWAM 1TR1A 2J77A 2PWDA 3A4AA 2VCAA 4PCSA 1QNSA 4MB3A 3LMYA 1H3GA 4AD0A 1G9HA 4H04A 3QR3A 4GXPA 3ZR6A 2Y5EA 3GYCA 3TOPA 4XV0A 4WSKA 4UOJA 3THDA 2A3HA 2X2YA 4GKLA 3I3EA 3WEZA 2UY4A 3HMCA 1JIBA 1CGYA 3AMGA 3UG5A 4J3XA 2ZUUA 2TAAA 3M7SA 1WDPA 2VZSA 4K68A 4UZSA 3K8MA 4TTGA 4XUYA 1UD3A 4W88A 1WE5A 3RO8A 5LA1A 2XVPA 1WDQA 4H8HA 1G01A 4J3TA 1H0GA 3U7BA 1JYXA 2XVGA 4KRUA 3CHDA 3L4YA 4EKJA 2FHCA 4IM4A 2E9BA 5A8MA 2VUYA 3DYOA 5CJ5A 5I2UA 1HL9A 1XC6A 2XYLA 2EJ1A 4PMQA 2YA1A 4JZ5A 1PEZA 2WYSA 3K8KA 3ARXA 2PBGA 3FXYA 3GTNA 2GVYA 1GNXA 2D20A 3VIHA 5D4YA 3WBAA 4V27A 1QI0A 3SCNA 5GPRA 3II1A 4BQ5A 3AOFA 2G4FA 2UWFA 2D24A 1EHNA 2YJQA 1WDRA 5D9OA 4B3LA 1HVXA 1VBRA 5KEZA 1UD4A 1K6AA 3CUIA 3VD5A 1HF6A 2W91A 1NQ6A 2O9TA 3WDHA 2XM2A 2DIJA 5GQBA 2JF6A 1QBAA 3OLDA 5C70A 4MB5A 3BCFA 3VGEA 1W3KA 2VTFA 1R87A 3K46A 1C91A 2YA2A 5BXTA 2BNJA 3AHTA 4HOWA 5FOOA 5IFPA 3N04A 1OINA 3CUJA 4NI3A 2ZUVA 4RE4A 3W81A 1V3HA 4CD7A 4GO8A 2WVVA 3TONA 3U57A 3PZOA 3UETA 3MV11 3ZQ9A 1E4NA 3CUFA 4TUFA 1DWIM 1CIUA 5CZKA 4MJ2A 1HNYA 2PB1A 4AZCA 1E4MM 1V0KA 1QI3A 2W66A 4HU8A 2YL9A 1Q6FA 1HJWA 4FLSA 4PMDA 4ML4A 4UQ9A 1V08A 1WZKA 1YQ2A 3VGGA 2G3JA 1JFXA 3LPPA 2BXZA 3A47A 3G6LA 2O92A 1UH3A 1XSJA 1MFUA 3SUTA 3FY1A 1WP6A 3SUWA 4B3KA 1UZ1A 6TAAA 5ABGA 3SUVA 3AHVA 2BVTA 3VIMA 3NCOA 1DTUA 4AZBA 3DYPA 4CU7A 2WHLA 1R85A 2CBJA 1UKQA 4H7VA 1C8QA 2HISA 2XVNA 3B9EA 1BTCA 2J62A 3W37A 1O6IA 1V3IA 1XH1A 4P7LA 3MKKA 3VIKA 1GW1A 5DMYA 3LPGA 4CKQA 1BFNA 3SUSA 4UFMA 1C92A 1XH2A 1ISVA 5GNXA 1M53A 1VRXA 3IJ8A 1M7XA 4KRTA 1UA3A 4M24A 3UR7A 2J8GA 2VC9A 4FLRA 2CCRA 1EXPA 2E40A 1Q6CA 1V6YA 2WLZA 4W5UA 5E0CA 4TX8A 4PMRA 1NARA 3U7VA 1J0ZA 3AS2A 1MYRA 1BGGA 5EFFA 1C3FA 1SMDA 4RE3A 1KGWA 4EANA 1LWHA 1EDGA 4N0RA 1Q6DA 5JBEA 5BROA 4L4PA 4A3HA 1GQLA 4HP5A 3F5KA 3U5YA 3WNLA 4JHOA 1LL7A 1ECEA 1E6ZA 5CG0A 3VDCA 1G1YA 3AMCA 2E3ZA 1US3A 1ZBCA 3A3HA 1QBBA 2CNCA 4UFIA 4E8CA 4GI9A 3SCUA 4AMCA 5BXPA 5CLTA 2EEXA 3F5LA 1W2PA 5A2AA 3NYDA 3WDIA 5LA0A 1EO5A 3CLWA 3IAPA 3VDHA 5ABHA 4UFJA 3A6OA 4BCEA 1E56A 2XJ7A 1Z32X 5AY7A 2E9MA 4FF5A 1TA3A 3K8LA 4TVDA 4WSJA 3IJ9A 4PMXA 3WMCA 2NSXA 4AEFA 2YDSA 3U5UA 5I6SA 1U30A 2XSBA 3OGSA 3ARRA 1JD7A 1ZB5A 1W3LA 3ECQA 2EO7A 4UZUA 1JG9A 1H49A 1OSEA 1ZJBA 2OYMA 1C93A 1E5NA 3WDJA 4TVUA 4H8VA 1FP9A 1VEMA 2WNWA 4J3SA 1TUXA 5AC4A 1H5VA 2GJXB 4F79A 4MAVA 2X1IA 3UESA 2OSXA 3FW6A 3WUFA 3WD3A 2WVTA 2G3MA 3OLEA 1MQRA 2D0FA 2ZX6A 2VNCA 4HZ6A 3VNZA 5FIPA 2F8QA 4ZFMA 5A69A 1XRVA 2Z1KA 4YN5A 2CHNA 1Y7VA 1UWIA 1PZ2A 2J7FA 3MMDA 4MNKA 2ZUNA 4ZXLA 4J28A 3PZMA 1VIWA 4JCLA 2BHUA 3N12A 3T0DA 3UG4A 4B9ZA 1XH0A 3SCRA 3OIHA 2ZXDA 4KGJA 3WY1A 1KBKA 3VUPA 5A6BD 2O9OA 1W9UA 3APGA 1A3HA 4DWSB 2JALA 3WL1A 1WO2A 4CD4A 3TTOA 3RJXA 2WKGA 3K4AA 4D6JA 2V3EA 3GNPA 3POCA 3CZLA 4GI8A 1B3XA 3ALFA 4BS0A 1EA9C 2RGMA 3MO4A 5A95A 3VMNA 2IXUA 1QW9A 3CHCA 3WIJA 1V0LA 2CBIA 3EDJA 4S3JA 5FL0A 1D2KA 1QHPA 4QAWA 3PTQA 2DT0A 3T08A 1VJSA 3EDEA 5A8NA 2G8ZA 3FHQA 1QOXA 3EMQA 3EDKA 2J25A 1V6XA 2OWXA 2G3IA 4HZ8A 4UQBA 3I3BA 7A3HA 1JI1A 3QOKA 3WH5A 3W6MA 1F4HA 2YL6A 2WBKA 5JUVA 1E71M 3OBAA 2Q8XA 2XWEA 2ZX9A 1FFRA 3PZQA 2ZOXA 5M5DA 3OG2A 4W7VA 4WLCA 2WAGA 1HL8A 4MNLA 5BRQA 5FL1A 3ARWA 4CCEA 4MAZA 1FA2A 1PAMA 3MUZ1 2DT1A 5IHRA 4U2YA 1KBBA 1W9XA 1E0XA 1CWYA 1VFFA 4CGTA 5KZ6A 1NWRA 3UR8A 2WW5A 1IZJA 3AQUA 4JFTA 3EBVA 1BYBA 4W93A 4CCCA 1XGZA 2WVUA 2VJXA 1OGBA 4OKDA 3WNOA 1R86A 4J3VA 3GH5A 5M03A 4A4AA 1E5JA 3WL0A 1HP4A 3VIIA 1JAKA 3M6DA 4W84A 5M17A 2Y8KA 4AXNA 1XD1A 5EMYA 1E3XA 1UYQA 2WHJA 5EBAA 1QW8A 4CD5A 4Z2IA 4NRSA 4AZ7A 3VU2A 2CEQA 3PBGA 1ISWA 3L4TA 3BAIA 2W4XA 1XV8A 2QLYA 4D1IA 2VRKA 3BXWA 2YL5A 1ODZA 2YKKA 4U31A 4U3CA 3RCNA 4C7GA 1TZ7A 4Z2HA 5CXPA 2WBGA 2OWCA 5I5RA 5IFTA 1W9PA 1SFSA 3ZT7A 2BV9A 2F2HA 3AS3A 1AQ0A 1UA7A 4UTFA 3NDYA 4E4PA 1JYWA 4Y7EA 3ARSA 3OZOA 2NW0A 5D8WA 2C0HA 2ESCA 5E70A 3AMDA 1W3JA 4AD5A 3WD2A 1CXIA 1FP8A 1EOKA 1GCYA 2BHZA 6CGTA 1JZ3A 5A94A 2G3NA 5A6JA 2E8ZA 4PTVA 2FH8A 5HXMA 3BC9A 1AMYA 1PX4A 2X0YA 5E09A 3AICA 3HJEA 4TVCA 2DSVA 2EQDA 1K9FA 2BFGA 4HMCA 4QCFA 2V38A 2J74A 1LLOA 4DWSD 2GK1B 3VMOA 2A3BA 2GFTA 2JEPA 3OLGA 4MPKA 3CUHA 2ZICA 1V3MA 3PZGA 2DSUA 1E6PA 3WDPP 3VMPA 1E6NA 2JF7A 1WZAA 2JEQA 1VENA 3S6TA 3KL5A 1TG7A 1S46A 3WD1A 1M04A 5D8ZA 3VTRA 1NM9A 1GQIA 1W9DM 4M29A 2XIIA 1CENA 3WQ4A 2DPEA 3WNKA 1GZJA 4D6GA 1XD0A 3ZM8A 4DUWA 3AYRA 3AIVA 4JCMA 4Z2LA 1UWSA 2YBUA 3D5HA 1ZL1A 4UCFA 3O6AA 2JFEX 1V6WA 3FN9A 2VR5A 4YHEA 1AQHA 4AZHA 1V6UA 3VD4A 5F7UA 4XB3A 2NT1A 1CBGA 1QHOA 3AIUA 4UQEA 4AY1A 3ARTA 2CBUA 2E8YA 4W87A 4ZEPA 2YBTA 2GDUA 5HPOA 4PMUA 3O2LA 3S2CA 3GDBA 4X0VA 4DUXA 2WHKA 1C90A 5A6BA 3WF1A 2Y8VA 1CLVA 3VDBA 1NWTA 1VJZA 5E0FA 3AFBA 1LG2A 4QCEA 2PWEA 2J7GA 3WQVA 2VO5A 3OGVA 1GONA 3AISA 2J7DA 4CCDA 3VM7A 2A3EA 4TXEA 1X6LA 5A2BA 5HBFA 1J0IA 1UH4A 3BSGA 2D1ZA 2EBNA 4XZBA 5BXRA 1ISXA 3OZPA 5I24A 1CGTA 3VD9A 5C8BB 1IZKA 1MXDA 5A2CA 1V3LA 2ZWZA 4NF7A 2DSKA 1WZLA 2DT3A 3BMVA 1KFWA 4AZ6A 2J79A 3WF3A 3WF4A 1NOWA 1E9LA 2BVDA 2CKSA 2C7FA 2YDQA 2YLLA 4GPNA 4ATDA 3OGRA 1W32A 4J7RA 1XCWA 1WNOA 1GQKA 2WMFA 2WC7A 2E0PA 4D1JA 4PUDA 1GOKA 2DH2A 1JI2A 3OLIA 3ZSTA 1B3YA 2XVKA 1K9TA 1JFHA 5JIPA 3WDQA 2O9RA 1C8XA 2VR4A 3RJYA 2W5FA 1IT0A 3NJ3A 4CD8A 2PBOA 3VX1A 1HN1A 2NT0A 2IXVA 4ACZA 1OB0A 3GH4A 1V3KA 4GZIA 4W8AA 4J3WA 1UD5A 2XSAA 3AZTA 4UR9A 2W62A 4JHZA 1D3CA 2WMIB 5DO8A 2EPOA 2VVNA 3ZR5A 4PMNA 2Y24A 3GXDA 4F9DA 3CMGA 5A8OA 1J11A 4FLOA 3L4VA 4CVWA 4OZOA 3DYMA 1BG4A 3M46A 1UWQA 3WENA 3B9AA 1P6WA 2D23A 3MSGA 4LGXA 1FHLA 4HOZA 3N18A 3CO4A 3CZGA 3SCSA 4W7UA 1ODUA 1J9YA 4NRRA 5AYIA 3FAXA 1I1WA 1B30A 2D0HA 1H41A 4MDPA 3BAXA 3AHZA 4OOZA 5EB8A 1JZ7A 2GJXA 1UG6A 4AIUA 5I23A 2VL4A 5JBDA 1W9BM 3GXFA 4U33A 2V3DA 3BSHA 1BG9A 3W0KA 2DSWA 1CXEA 2FHBA 2XUCA 4N42A 2ZUMA 3WNPA 3AXHA 2WZIA 3E1F1 2J7BA 1HKJA 4D71A 5I3DA 4HA4A 4D6DA 2VT0A 3PN8A 4CN1A 4CN6A 1M01A 1HXJA 4GIAA 1PPIA 3AIQA 3W24A 2XVLA 3ZT5A 4MDOA 1W1PA 2CXGA 1VFOA 1A47A 4Q7NA 3CPUA 2VCBA 2PC8A 4L4OA 2VRJA 3WNMA 2D22A 2VZUA 4H2CA 1J10A 3W82A 3RIKA 1V03A 1PX3A 1JYNA 3MV01 4GO9A 2X8RA 1VF8A 1CGVA 1V3JA 1W3HA 1UR4A 1GJWA 1GVIA 3BAJA 4W7WA 3BCDA 2X05A 2OSWA 4D6CA 3BGAA 4W89A 4M1RA 5ABFA 2JE8A 3CIVA 1JDAA 1B9ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4E2O A;  3ARQ A;  3WF0 A;  1TE1 A;  4HA3 A;  4HPH A;  4PMV A;  3SIM A;  3VIL A;  1WZM A;  5AC5 A;  3DHP A;  3K4D A;  4AD4 A;  4AC1 X;  5D9P A;  1GHR A;  1QNO A;  3F4V A;  4JFV A;  4ATW A;  2OWW A;  3PZT A;  1HVQ A;  4XZW A;  5LA2 A;  3WD4 A;  4AIO A;  1TCM A;  4LYR A;  1UR9 A;  3T2P A;  1OGS A;  3WMB A;  1JXK A;  1EOM A;  1FH8 A;  2EPL X;  2OYL A;  5ABF B;  4M81 A;  3VM5 A;  2XIB A;  1H0I A;  2WHM A;  2VMF A;  1JDD A;  4BQ4 A;  1MW2 A;  1JD9 A;  1E70 M;  4PN2 A;  2BS9 A;  4PYS A;  1KWK A;  2VUR A;  2WXD M;  4CU8 A;  5BRP A;  4EAM A;  2ZX5 A;  3SCP A;  5I0D A;  3AXI A;  4Z2K A;  1L0P A;  1GQJ A;  1TA3 B;  2X0H A;  3CBW A;  3F5J A;  1E40 A;  3TA9 A;  2UY5 A;  1GOW A;  3WH7 A;  2W67 A;  3WUG A;  3N11 A;  3VGB A;  1PZ3 A;  1ITX A;  1FOB A;  3VIF A;  1QI2 A;  5ABE A;  2D2O A;  1JZ8 A;  1X1N A;  2FGL A;  2WKL A;  3L2M A;  4Q22 A;  4GZJ A;  5A6A A;  1UKT A;  1UR0 A;  6A3H A;  1BYC A;  1UH2 A;  5FKY A;  3W4R A;  1ZBK A;  5HNN A;  1J18 A;  4MAD A;  1EH9 A;  5DFA A;  1TVN A;  1JF5 A;  1QNP A;  1SR0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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