3SGUA

Crystal structure of methanothermobacter thermautotrophicus orotidine 5'-monophosphate decarboxylase covalently modified by 5-fluoro-6-iodo-ump
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
213
structure length
212
Chain Sequence
NRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Methanothermobacter thermautotrophicus orotidine 5'-monophosphate decarboxylase covalently modified by 5-fluoro-6-iodo-UMP
rcsb
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
molecule tags Lyase
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 81
structure length 212
sequence length 213
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2011-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3sguA00
2WQPA 3UWWA 3LI0A 3W7MA 1J2WA 2W6RA 3DHFA 3W7HA 5F2IA 3TJXA 3UY8A 5LNWA 5AYYA 3FJLA 3QMSA 2HS6A 1WX0A 1O95A 1VPXA 1KFBA 2E6DA 4Q33A 2X30A 3BG3A 5EL1A 5HJLA 4JYDA 2VFEA 1HUVA 1S5WA 1FCVA 1SSDA 2GQAA 3N3MA 1XCFA 3O1NA 4ML9A 4IMCA 1KV5A 5AB3A 2Y62A 4JYEA 4P2VA 4NX0A 4OV9A 5BMWA 1KA9F 3GK0A 3O05A 3ABOA 4JY9A 2PRLA 3W2KA 1VCFA 1ZENA 2G95A 3FS2A 4FF7A 4MPQA 1ME8A 5KMYA 1W5QA 5FEXA 3VE9A 1GYNA 4ORMA 2GJNA 3STEA 4KWVA 2OJPA 5LSMA 2V8ZA 2BZNA 5K2ZA 1XI3A 3L67A 4CQ9A 4LV4A 1NFBA 4OWGA 1PVNA 3GDMA 2RH9A 3HGJA 2QF7A 4GJ1A 2V81A 4BWLA 1ZAJA 3OG3A 2PE4A 1X1OA 2OCZA 1GTHA 3VKJA 3Q37A 4ZL1A 2G5WA 5LZLA 3ZWTA 3HPXA 3QH2A 1B9BA 2QUTA 3WFAA 1MSSA 4NJGA 1IIHA 2C13A 1AK5A 3LM7A 1NSJA 1TV5A 4N6EA 4ALDA 4UC5A 3TQKA 3E0IA 3L5AA 3TROA 4JD4A 3GAYA 3B0UX 3LV5A 1QO2A 1SW0A 2ISVA 1UB3A 2GUUA 3KFTA 2CWNA 2OMAA 1KTCA 3WJZA 4XTIA 3G1FA 1GVOA 4M6PA 5C5YA 4AH7A 2VENA 2VELA 1K8YA 4WX2A 3VNDA 2CZEA 3W23A 1UASA 3P8IA 3EXRA 4Q4KA 4NJIA 1IGSA 2TSYA 1G4TA 1FWTA 2DORA 4UFLA 1QPQA 3Q94A 2VFHA 3W7OA 4NUWA 4Y90A 1L9WA 4N02A 2WNQA 2DZWA 4H6KA 1N55A 4U28A 3PG8A 5DXYA 3HQ1A 4EF8A 4E2BA 1TPWA 1AL8A 1PV8A 4HHPA 3RNDA 3JS3A 4UFJA 3UWUA 1UUMA 4GRSA 3S1XA 3W1TA 2YSWA 4LVDA 3P62A 1XDLA 1F2JA 4CQ8A 2H8ZA 2Z0IA 3C2FA 3FFSA 4ZQNA 2RDUA 3Q2DA 1Q6RA 4UTJA 3NQ6A 3LTPA 1LRNA 5F2MA 3MYPA 2DZPA 4WOQA 1ME7A 2GPTA 4S2BA 4QITA 4XZ9A 2EF9A 1VYRA 2VEKA 1C9DA 5CPOA 3LBCA 2E5CA 1JJKA 1O5KA 1B3OA 1DVJA 2F7FA 3GKFA 4UMCA 3NXFA 3LXCA 3O16A 2Q8LA 4J9JA 2V9DA 1H61A 4O1DA 3USBA 2QJGA 1ZY9A 3P60A 1A5BA 1TIMA 5G1TA 2A7RA 4K6AA 1ONRA 5L9FA 1O94A 2RFGA 2V2DA 3QMRA 5CG7A 4O1AA 4CQAA 4W9TA 4O1CA 4CNPA 3BK0A 3DXIA 2V0TA 3HG5A 2B7OA 3L5LA 4KKXA 5DCDA 4DXVA 2WNNA 2YZRA 1LDCA 4PFMA 5LNVA 3S0CA 3GB6A 4N9BA 4OV4A 3W1LA 2ZTJA 1K7FA 5EA9A 1BWLA 2FFCA 1XM3A 3W73A 1LRQA 5E93A 3SIZA 4JY8A 3DI0A 5DCBA 4H3DA 4XTDA 1SFLA 5I3FA 1TJPA 1U5JA 3N19B 2WSQA 1Q6OA 3NGJA 2HTMA 1HFBA 4DELA 4WD0A 3N73A 3SY5A 1QAPA 2FPVA 4DO5A 3CT7A 1BKSA 2Y85A 2ZRXA 5AFDA 4M19A 1LROA 5EMUA 2P10A 1OFOA 3NL5A 2DJXA 5EBUA 4MY1A 3I6RA 4GXMA 1HO1A 4HKPA 3V75A 3DFPA 1H1YA 3GLCA 4CCDA 1G6CA 4NXKA 2QR6A 1OFAA 3NYZA 5F2LA 3P5YA 5AHEA 1DL3A 1YLVA 2ZQ0A 1VHCA 2TPSA 3V1PA 1KFEA 1W37A 3G3DA 5F4XA 4GWEA 2E68A 4LOCA 3L0GA 4E2DA 5G5IA 1OK4A 3WJSA 3EWYA 2QAPA 5LHFA 1S3HA 4JICA 4FNUA 2FQIA 4RJEA 1H62A 2Q8ZA 3FJ6A 1R2TA 5D30A 1F76A 3LCLA 1TB3A 4CNOA 3S8HA 3NL3A 2NXHA 4UFHA 3N9SA 3P74A 4YXGA 2DZUA 2TRSA 1RPXA 3W75A 3RU6A 3UNDA 3DFQA 3NEVA 3G1DA 3VE7A 5AOUA 3BW2A 3PBVA 2F84A 4Z0SA 4YCOA 1VLIA 4U4MA 1Q6LA 2GQ9A 4QQ3A 5D2YA 1P0KA 5TBOA 1RQHA 3MP5A 4HNNA 4NJKA 5F1VA 2GVJA 1ZAIA 2Y88A 3EX6A 3W7IA 1A50A 4M7SA 4YWIA 2NUWA 3UY7A 5H91A 4OBTA 1H5YA 4KFPA 4NNBA 1A5SA 3LTYA 3QZEA 4RXFA 1GWJA 4IMGA 2QUVA 5AHLA 5HINA 3LCHA 5K4ZA 1DHPA 4QSHA 3BW4A 3PG9A 5FF7A 2R8WA 1X8FA 3PULA 4GUHA 1YDOA 3I7RA 3IRDA 3O07A 3C6CA 4KWWA 4S1FA 3UZJA 3GX9A 3EWXA 3M5VA 4ZQPA 4LRTA 1EWDA 1SW3A 1YTEA 3SECA 1I2PA 3LCXA 4R53A 3VI2A 3NPUA 4GUFA 2H90A 1V5XA 3C0JA 4Y6GA 3R2GA 5FI8A 1HTIA 1O4UA 3MHGA 1VRDA 1WXJA 1GJPA 4AVFA 4NU7A 3TCEA 1LZOA 2R14A 3W86A 1SO3A 1SR9A 3NR0A 2GVLA 3M43A 3W7RA 1XDMA 5KZMA 3B04A 4MOZA 5A5WA 4N6FA 1ZHAA 4NX5A 5C6MA 3VFLA 2ZZ6A 1WAUA 4O10A 4LUIA 3ZS4A 5I3JA 1W54A 3W7DA 1YPIA 3GNNA 5EPDA 3M6YA 4UTWA 4ZQRA 3IGUA 3KX6A 2EAWA 3VCRA 3P81A 3KOFA 4UTTA 4RX0A 1OX6A 4JN6A 4GC4A 3S9YA 2DZTA 1P0NA 4NT0A 3TQ0A 1H7PA 1WOBA 4MZ1A 1OYAA 1K7EA 1TPEA 4CCEA 2A21A 4MY8A 1QR7A 3DZ1A 2Y7FA 1NVMA 1L6SA 1SZGA 3EX2A 2V5LA 1PL9A 3S1UA 3PB0A 1KLYA 1A53A 1TREA 1IF2A 3WJXA 2C18A 1LLZA 5G4WA 3M0ZA 1N7KA 2BLEA 3AO0A 4AAJA 4HPJA 4UFIA 4UFMA 5CSSA 4OT7A 1JCMP 4I7VA 3TW6A 1H7XA 5BOOA 1S5VA 5AHMA 3MMTA 3W7EA 5AC8A 3BLEA 4LTSA 4A21A 1X1ZA 1JCXA 3LRKA 1TPB1 2PURA 4ZMGA 1FXPA 4QISA 4GE8A 2EGZA 4HN4A 3BPWA 2X16A 2C6QA 2P0OA 4XBKA 3ABSA 3R89A 4Z1BA 2ZYFA 3SZ8A 3A24A 3W7NA 2E77A 4JTKA 3CLMA 3LCWA 4JDBA 5KTLA 2FIQA 4FNSA 2Y7DA 4JX6A 4WY0F 4DO6A 1DJNA 4YCPA 5G2IA 1AW1A 4AWSA 3NQ2A 3W7JA 2KZHA 2GVGA 3MI2A 3C2EA 3QQ0A 3TXZA 3MO7A 3LERA 5D2TA 4O12A 1LBLA 3A21A 1Y0EA 3P84A 2J6XA 3L21A 4N9EA 4FB7A 1GG1A 4MVAA 5LHEA 3NVTA 4FIQA 5HUPA 4RCXA 1XXXA 3QPYA 5DBUA 3W2MA 1PE1A 5CKSA 4ICNA 3DI1A 2ZA1A 1TV8A 1SFJA 3O15A 1SPQA 4LS0A 1LM1A 3CEPA 4NNCA 2IQTA 2ZRZA 3HGRA 3W7CA 1TO3A 5DBTA 4N9CA 4FO4A 2NUXA 1WQ5A 3QEZA 3EKLA 4TMCA 3C4UA 3B0VC 3U6WA 3MBDA 5K9XA 3KVJA 1OFPA 4M6VA 5CZ0A 3MI6A 2C19A 1AG1O 4UR8A 2R94A 3QYQA 5AHNA 1KW1A 4IPJA 1YDNA 4MUZA 1EIXA 3NL6A 1WA3A 4RZ5A 5D09A 3HMJG 3UZ5A 3JR2A 5G1YA 5KSWA 1FWSA 1LORA 1W3NA 4O53A 3M7WA 1XBVA 3LDVA 3PUEA 1GQNA 4MLRA 3L2IA 2WJZA 4LY8A 3CM4A 3L66A 3FYPA 2Y7EA 1D9EA 3PC0A 3W1XA 1EEPA 4KFOA 3DKLA 1ADOA 3C56A 1Z44A 4UMAA 1OG0A 2QJHA 3W72A 3H54A 2BWGA 1ZALA 1DOSA 5AC7A 3C8FA 3A22A 1ICSA 3S5OA 3PWAA 2VEIA 1HG3A 2A6NA 2YXGA 4N2YA 3UPWA 1K03A 4YL2A 2W79A 3S1WA 4XKYB 3A23A 4ORIA 4ZQCA 1I2OA 3NQDA 1RD5A 3TA6A 1TTQA 2ZRYA 3FKKA 3NG3A 4TO8A 2ZZ7A 3GVGA 3QW3A 1DBTA 1XBYA 1DQXA 1G4SA 3W2LA 1VLWA 4JTLA 3G1HA 3GZ3A 1WV2A 4UNKA 4ZQOA 4LS1A 4D2JA 2G97A 3WK3A 1ZCOA 1SW7A 4FNRA 3EX4A 4JR5A 4Q32A 1TPDA 1KFCA 2C1HA 2WV8A 4MZ8A 2VEMA 1F6KA 2Z2UA 1I45A 4K7YA 3IIZA 1LBMA 2JKPA 2DZXA 4CNNA 5E1QA 5H2ZA 3LHWA 5ABTA 3W85A 2OX1A 4LW7A 2H6RA 1JUEA 1MZHA 1W5OA 3IIPA 3BARA 2O7QA 3NO5A 1WOAA 1CI1A 3ABRA 6ALDA 1W5NA 1GT8A 4QIUA 4OE7A 3GXNA 3NQ7A 1NF0A 3QW4B 3P67A 1G69A 3P7YA 3LLDA 4O16A 1KFJA 2CLEA 1PHQA 4LU0A 3LHZA 3C2VA 3L0KA 3NM1A 1KFKA 1RR2A 4LNYA 1B4EA 3C2OA 3TMLA 1W3IA 3NQCA 1MEWA 3B03A 4JDYA 3NQGA 3MJYA 3RFAA 5DXXA 2WSRA 4JTEA 3LCFA 3PVFA 2JKEA 1Q6QA 3EX1A 3HBLA 3C61A 4O0KA 3GIYA 4NJJA 3LRMA 5D38A 1SU5A 3W1NA 1FY6A 1GEQA 4ZZ9A 2AAMA 4DBEA 3M9YA 3SFKA 4UTIA 4CLMA 4ADSA 3GYEA 3N9RA 1TSIA 4R33A 3LHUA 1LP6A 1FWRA 1QDSA 3TV8A 4DF2A 2CLFA 1IXPA 4MZYA 1GVQA 1VQTA 5DY3A 2E1DA 2RHGA 3MP3A 3W1RA 3LLFA 1ZFJA 1KM4A 3SW6A 1GYLA 3P82A 4FXSA 3HGSA 4XKYA 3E96A 4UIOA 3KVMA 3GR8A 2I9EA 2VFGA 3NZ1A 3OBKA 3ZWSA 1D3HA 3G1YA 4K7VA 2E5DA 1SO6A 4EVZA 4QJ1A 2YYUA 3FIGA 1AL7A 3TE9A 1EB3A 4OU1A 4MY9A 3W74A 3BGGA 3SGZA 4NVTA 4JTHA 2J9ZA 2NLIA 3PB2A 4H4IA 4CCCA 4O50A 2QCGA 1EP3A 3QJAA 4I7UA 3N34A 4OHQA 6TIMA 2B4GA 1FDYA 1QO5A 1VZWA 1FUYA 3NPWA 2FTPA 3W1QA 1GVRA 5FF0A 2QKFA 4LVAA 1G4PA 3W2NA 3KAOA 2J27A 2ISWA 3QSRA 2A5HA 4JXCA 5D33A 3H53A 4WXYA 5IBXC 4GUGA 3FA5A 1J5TA 4JIQA 3RLUA 4JTUA 1FX6A 1K8XA 1TCDA 5HNRA 1VC4A 2QUUA 2H8XA 1PIIA 2X1UA 1W31A 1FDZA 4JTSA 2VXNA 3W07A 2A7NA 5HMSA 4AHPA 4UTLA 8TIMA 4RV8A 3M16A 4LVBA 3PAJA 5U7SA 5D05A 4Z0JA 5CPLA 3PR2A 3FOKA 4AEOA 1I2QA 4C1LA 3W84A 3BG9A 2XN0A 4I9AA 3W70A 1OJXA 1PCKA 1C29A 2OZ0A 3THQA 5MHBA 2WOQA 4HSOA 2ZDRA 4PL2A 3EWZA 1XC4A 1TMHA 3DFTA 3I65A 5FEPA 2NXGA 4JX4A 2GJLA 3RLVA 3EXSA 3KVKA 3NQVA 3TMQA 3W1AA 1KFLA 3G1SA 3CWNA 4PTNA 3W76A 1EX5A 3TSDA 1J4EA 3R5EA 2ATSA 3NPXA 5LNRA 2NWSA 1UCWA 4FNQA 2YW3A 3ATYA 2HSAA 3NAVA 3OVPA 4XQ6A 1DORA 1YPFA 4PC8A 4B5NA 1IXNA 3PBUA 3BV4A 4KFNA 3GDLA 4DPPA 4IXHA 2QCCA 5D02A 1G7VA 3MWAA 4EWND 1KM0A 1UBSA 2CZDA 3TC7A 3LBMA 3NNTA 1XL9A 3G0UA 3KRZA 1G4EA 2Z1BA 4TX9A 1EP2A 3WK0A 3HGOA 4NJHA 3TW7A 2PCQA 2JGQA 1BWKA 5D03A 5D2VA 1DV7A 3T4CA 4ZQMA 3G8RA 3EEGA 5SWUA 5BRBA 4PEKA 1P5BA 5EKYA 4IMFA 1X6UA 3MHUA 2YYTA 5FF3A 3UXAA 3QRHA 4C1KA 5CPMA 4FEZA 1KV8A 1W56A 4O17A 1WBJA 5CSRA 3HJZA 4RLIA 3QF0A 5HR7A 4NNAA 1H50A 1ICPA 2E6YA 4GUIA 2YPIA 2O7SA 1KTNA 5D04C 3T44A 4UUIA 3TSBA 5F2GA 4O57A 3DFNA 4Y9AA 3TUUA 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 1TPH 1;  3LB0 A;  4HNV A;  1QPO A;  1TJR A;  4K8E A;  3ANY A;  4AB4 A;  1IXQ A;  2J24 A;  2NV2 A;  2QCH A;  4N9D A;  4S2C A;  2V2C A;  2WPB A;  2E6A A;  1LYX A;  3HG4 A;  2OT1 A;  1IIG A;  5CZJ A;  5CGQ A;  3HOJ A;  4MJM A;  1L6Y A;  5F4S A;  2CW6 A;  1AMK A;  2CLK A;  3S5N A;  1EP1 A;  3PS7 A;  4FXR A;  5G4E A;  1ME9 A;  2WKJ A;  4BR1 A;  2ZCG A;  5CZT A;  4ADU A;  3NQE A;  4AF0 A;  3S6D A;  4IME A;  3QM3 A;  2R91 A;  4O18 A;  5DCE A;  3UPB A;  1T96 A;  2ZZ4 A;  1FDJ A;  4I7W A;  3TX9 A;  1KM1 A;  3CTL A;  2E6F A;  3LV6 A;  5DLC A;  3IVS A;  1LLW A;  4JTF A;  3TFC A;  1EWE A;  1ZAH A;  3BGJ A;  2NXI A;  3GND A;  3TKF A;  2ZFA A;  3M5Z A;  5J5D A;  4EIV A;  1QPN A;  3QPZ A;  3IEB A;  2ZRW A;  3LRL A;  3W1U A;  3PSV A;  1IXO A;  3S5Z A;  3INP A;  3LOT A;  3G1A A;  1W5M A;  2V30 A;  1MEH A;  5AYZ A;  1P4C A;  3LXA A;  4WJE A;  4WOZ A;  4E0C A;  3P5Z A;  3FYO A;  5FEZ A;  4Z1C A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2WQP A;  4GGB A;  1R3S A;  3W7M A;  2ZDS A;  3W7H A;  2J7C A;  4H9X A;  3S1G A;  5CC5 A;  4DLF A;  4A8N A;  1IEQ A;  1O95 A;  2Q71 A;  4GQG A;  3LLX A;  2Z24 A;  4XK2 A;  1KFB A;  4L64 A;  2FHF A;  2X30 A;  4F40 A;  2PMQ A;  2HE5 A;  3LZ3 A;  4M56 A;  3TYU A;  2Y8U A;  3B9O A;  3A47 A;  2P8C A;  1AH4 A;  3RPD A;  3W4R A;  1WXY A;  5AZ1 A;  2UBP C;  4ML9 A;  4IMC A;  1KRC C;  3TTQ A;  3EDE A;  3M0I A;  1SFS A;  3GK0 A;  3O05 A;  3ABO A;  1CXL A;  3AIC A;  3FS2 A;  1WZM A;  3AZR A;  4MPQ A;  5KMY A;  1GZJ A;  1CDG A;  5LSM A;  1IV8 A;  2DZB A;  1XI3 A;  2VUR A;  3I4K A;  2XUC A;  3GVW A;  1RD6 A;  2DH2 A;  1PVN A;  3SN0 A;  3L2L A;  3LN3 A;  2QF7 A;  4GJ1 A;  4BWL A;  1ZAJ A;  5A6K A;  2PE4 A;  3RIK A;  4E6M A;  1GTH A;  1QW9 A;  1E4I A;  4IJC A;  4NAF A;  3KOZ A;  5A6B D;  3UCQ A;  3W53 A;  4JL2 A;  4IPN B;  1TV5 A;  4N6E A;  3TN4 A;  2WVS A;  1JGM A;  3TRO A;  3FVD A;  1QO2 A;  2ISV A;  4QCF A;  5G4H C;  3AUO A;  3CAS A;  1BRL B;  3E2S A;  4M6P A;  4Z2L A;  3B97 A;  4HJF A;  3VND A;  2CZE A; 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 4OBR A;  4DAI A;  2P10 A;  3ZLH A;  4E3V A;  5EBU A;  3WMS A;  4GXM A;  1HO1 A;  3WFL A;  4KWO A;  4CCD A;  3NYZ A;  3QV7 A;  2YA1 A;  2PDL A;  1KXV A;  3KRB A;  1DL3 A;  3EDJ A;  4H2C A;  1W37 A;  5F4X A;  4LOC A;  3L0G A;  4F8X A;  2CXE A;  1S3H A;  4JIC A;  3TWA A;  4RJE A;  2IXV A;  1ESW A;  1KRA C;  3GIP A;  1R2T A;  1F76 A;  4PN2 A;  1TB3 A;  4CNO A;  2QV5 A;  4CQC A;  3S8H A;  3NL3 A;  3WCZ A;  1ISY A;  4RE0 A;  1RA5 A;  4B5W A;  2XGB A;  3UZZ A;  3CYV A;  4LSB A;  2BXZ A;  4LH8 A;  3W75 A;  1UPP A;  1EF3 A;  3UZW A;  3VIO A;  2VGI A;  3G1D A;  4GA8 A;  3VE7 A;  5AOU A;  1XQK A;  2XU2 A;  4GQQ A;  4URI A;  3N15 A;  5D2Y A;  2E1W A;  1DJH A;  2GZX A;  4NL1 A;  3W7I A;  3IUH A;  1CBG A;  3PJT A;  2OSY A;  4MJ4 A;  3WD4 A;  3APY A;  3LTY A;  3CAV A;  4RXF A;  2QUV A;  4IFK A;  1W32 A;  5AHL A;  4QE1 A;  3Q67 A;  1GOW A;  5K4Z A;  1FHV A;  4JFS A;  3BW4 A;  3G6M A;  3T9P A;  4JTA A;  5AYI A;  2R8W A;  1X8F A;  3PUL A;  2DY3 A;  3LNP A;  3O07 A;  3GX9 A;  4KEU A;  4ZQP A;  3SM0 A;  1TA3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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