3SUUA

Crystal structure of beta-hexosaminidase from paenibacillus sp. ts12 in complex with gal-pugnac
Total Genus 193
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
193
sequence length
519
structure length
504
Chain Sequence
HHHHSSGLVPRGSHMSQPSILPKPVSYTVGSGQFVLTKNASIFVAGNNVGETDELFNIGQALAKKLNASTGYTISVVKSNQPTAGSIYLTTVGGNAALGNEGYDLITTSNQVTLTANKPEGVFRGNQTLLQLLPAGIEKNTVVSGVQWVIPHSNISDKPEYEYRGLMLDVARHFFTVDEVKRQIDLASQYKINKFHMHLSDDQGWRIEIKSWPDLIEIGSKGQVGGGPGGYYTQEQFKDIVSYAAERYIEVIPEIDMPGHTNAALASYGELNPDGKRKAMRTDTAVGYSTLMPRAEITYQFVEDVISELAAISPSPYIHLGGDESNATSAADYDYFFGRVTAIANSYGKKVVGWDPSDTSSGATSDSVLQNWTCSASTGTAAKAKGMKVIVSPANAYLDMKYYSDSPIGLQWRGFVNTNRAYNWDPTDCIKGANIYGVESTLWTETFVTQDHLDYMLYPKLLSNAEVGWTARGDRNWDDFKERLIEHTPRLQNKGIKFFADPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Paenibacillus
publication title Gaining insight into the inhibition of glycoside hydrolase family 20 exo-beta-N-acetylhexosaminidases using a structural approach
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-hexosaminidase
total genus 193
structure length 504
sequence length 519
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2011-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3suuA01
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3suuA02
1UHVA 2BVDA 4PMVA 4PN2A 1I75A 3WF4A 4F79A 1J0JA 5A6AA 4LXFA 2BXYA 3OLEA 4PMRA 4UOZA 4QAWA 2VNCA 4GINA 1UKSA 4CCDA 1DWAM 2VOTA 2JFEX 2YL9A 2PF0A 4W8LA 5A2BA 1H49A 1V3JA 3VINA 2D20A 1LG2A 1KBKA 2VJXA 4TX6A 5I77A 1MQQA 2WHKA 2DIJA 5DF0A 4JHOA 1VJSA 4ACZA 3CZKA 1E0VA 2YL6A 1DP0A 5CGMA 3AZTA 1E70M 5HNNA 1Q6DA 5LA0A 4EE9A 4UFJA 4W85A 1BSIA 2X09A 1V6XA 4MB4A 1EOMA 3JUGA 4D6DA 2V5CA 1CGWA 2A3CA 4P8XA 2AMGA 1ZU8A 2XHYA 4WLCA 4FLQA 3MMUA 3CLWA 3G6MA 3PZUA 1JAKA 3N1AA 2WNWA 1YQ2A 3BAYA 4B9ZA 3KL3A 5JBEA 2GVYA 3EDKA 3VGDA 1B3YA 2XSBA 4A3YA 2O9PA 2GJPA 2DT2A 2W63A 4AMCA 5A6BA 5FOOA 3IANA 1V02A 1BG9A 3KE0A 1JI1A 4QLLA 1WDSA 2WHJA 2JIEA 1MW3A 3OZPA 1J12A 1GW1A 1QNSA 1V0KA 2CESA 1E6ZA 5LA1A 3OZOA 3I3DA 5GNZA 2YL5A 1TA3B 4NSBA 4CN1A 1OB0A 3FHAA 3ZT7A 4UQ9A 2FH8A 5LA2A 1D3CA 4AEFA 3L4TA 2PWDA 3WF0A 5M17A 3CTTA 1GPFA 1C90A 2JEQA 3TOPA 5HXMA 1W1VA 2XSAA 2WB5A 4HMEA 4DM1A 3SCWA 2D0FA 1G0CA 3AHXA 4CN4A 5CLTA 3MV11 1CTNA 3WNPA 4AD2A 3W53A 1O7AA 2EXOA 4MAZA 3IAPA 2FDMA 3KZSA 3CH9A 1HJSA 1JIBA 4X0NA 3AIEA 4UOQA 3APGA 2CHNA 2XFFA 2WYSA 4PTXA 4CCEA 1UKTA 3EYPA 1CNVA 4W86A 4ZEPA 1SMDA 1GJUA 3NSXA 1V3HA 1VRXA 1E55A 1V08A 4AZ7A 2BY0A 1VBUA 3CUJA 3TP4A 4ZFMA 1AVAA 2YKKA 4DWSD 2XJ7A 4IPNB 2W66A 3AQUA 1HKJA 3L4ZA 4HA3A 1VAHA 5A6SA 3T2QA 3VNYA 2BY2A 1B31A 2WCGA 5AY7A 1HT6A 3VD3A 3BGAA 4AD1A 1H09A 5JBFA 2WXDM 4NZCA 5E09A 1CGYA 2Z1KA 4UQAA 3F5JA 5BCAA 1JD9A 1J18A 2BHZA 3AFBA 4HZ8A 2PWFA 5KEZA 1Q6GA 1A3HA 4UNIA 1E3ZA 3POHA 3AS1A 2CBUA 4ACZB 1OWQA 1SYTA 3QHNA 3CO4A 3NYDA 2JALA 2VCBA 2GDVA 3UETA 1UWIA 1FA2A 5I78A 2AAAA 3M07A 1B3WA 2WC7A 1OGBA 2VMFA 3WSUA 2G3JA 3S2CA 1HL9A 2CPUA 6CGTA 3CHEA 3WQ6A 5JBDA 1J0HA 2J75A 1FFRA 3B8SA 3FXYA 3WUFA 3ZIZA 5IFPA 3CZGA 4M29A 5ABGA 1EQCA 2ZICA 2Y24A 2Q8XA 1KXTA 1HJQA 1DEDA 3OGRA 2AOSA 3EDEA 3W28A 9CGTA 3MUZ1 1JZ6A 3VIGA 4ZXLA 1JF5A 2DGAA 2Y8KA 4HPGA 4UZUA 2G8ZA 1UR0A 4H04A 2BXZA 1NWSA 1C8QA 5I24A 2ZUTA 3WUGA 3BLKA 2J7GA 1EH9A 3LPOA 4TUFA 2DH3A 4UR9A 4URIA 3VIFA 4GI6A 4TTUA 1E4LA 3W6LA 2EEXA 1LWHA 5I3DA 1DWGM 2E8ZA 1QW9A 4GI8A 1EIBA 1BQCA 3GNRA 4E8CA 2YL8A 2BS9A 1GOOA 4NRRA 3VM5A 1XGZA 4PMDA 2VZSA 3SCPA 3N9KA 1CZ1A 5BXPA 2WZHA 4HOZA 3FHQA 4QP0A 1MQPA 3GH7A 1VEOA 3T0DA 2CHOA 8CGTA 2XM2A 3UR7A 1S46A 1J0YA 2QPUA 3BH4A 3SCUA 1EDTA 4N0RA 1E43A 2XIBA 1JZ3A 1X6NA 4WKFA 2VR5A 4H7VA 1WZAA 4DUWA 1ZJAA 1XSKA 3FN9A 4AD5A 2WANA 2YJQA 1H11A 7A3HA 4AISA 1WB0A 3AXIA 4PCSA 3ZQ9A 4H2CA 4BS0A 2PC8A 3W37A 1HVQA 4JFSA 4HZ6A 2OWXA 1E71M 4TVCA 3WH5A 5E6YA 3ZT5A 1KQZA 1B30A 4Z2LA 1XCXA 4ML4A 3VMOA 1WCGA 2ZIDA 1EHNA 1E5JA 5CG0A 3GZAA 3EDJA 3WF1A 3I3EA 4F9JA 1NWTA 2BY1A 5A8PA 3N11A 1US2A 1K9EA 3RIKA 2W61A 4P8UA 1JG9A 1BYDA 3KL0A 1E56A 3MUAA 4F8XA 4J3TA 1W2VA 1OGGA 2A3HA 4J3WA 2CETA 4HMCA 2E0PA 3PZOA 2J7EA 5JIWA 4OIFA 1G94A 4P8WA 8A3HA 4M82A 4GZJA 1NP0A 2CBIA 1CXKA 1G9HA 4WSKA 2EJ1A 4BQ3A 4GI9A 2DSWA 3POCA 5CQ1A 1VFOA 2V3FA 1BYAA 2IUZA 2E9MA 4PCTA 3VIPA 2WC3A 3W27A 3AIRA 2BFGA 5A94A 1UH4A 3ZOAA 1CLVA 3WQWA 1GNXA 5A95A 4JCLA 4YHEA 3UG5A 4HOXA 1LQ0A 4WJXA 4GPNA 4UFLA 3W81A 1QI2A 3UCQA 4W5UA 3AHYA 4UQEA 3PN8A 1C91A 3SUTA 1UWSA 3WD1A 2XVGA 5A8OA 4WF7A 3OLDA 3AS3A 4GIAA 2WMHA 1V3KA 3LPGA 5AC5A 3VOCA 1ECEA 1FH8A 1K9FA 3BAWA 3WNMA 3GH4A 3WL1A 3ECQA 3QHMA 3WQ4A 3AISA 4AXNA 1MVYA 5A2AA 1IZKA 3VIOA 1JL8A 1HKKA 4LQ1A 2D1ZA 3VGEA 2A3EA 2CNCA 3GTNA 1BVNP 2VQTA 3O9NA 5FD0A 4HZ7A 1K9DA 4AY1A 1V6UA 2PI6A 4MB3A 2DT1A 1JZ7A 1E9LA 3BLPX 4M80A 5AC4A 3K1DA 3L4UA 3RMEA 4IUGA 4W88A 4DUVA 1HVXA 2ZXBA 3F4VA 3PZQA 5GNYA 5CZKA 3WMCA 3WEMA 2YDRA 4QLKA 1OT2A 3WBEA 5BRPA 1R87A 3WNLA 4D6EA 4U33A 2XWEA 4UQBA 3HMCA 2X1IA 3MUIA 2JIWA 1GOWA 1KGUA 3SURA 2CBVA 4E2OA 1CLXA 2PB1A 1K6AA 1PBGA 3IJ7A 1N82A 1FP9A 4JL1A 3ZO9A 5JIPA 3CUIA 2WSKA 4DM2A 3PBGA 3TTYA 3AMDA 3AMKA 3VPLA 3W6MA 1QNRA 3LPFA 4EANA 1UH2A 1TG7A 1BGGA 2PWHA 1CEOA 3ARTA 4U3AA 3NDYA 1CPUA 1JXKA 1E4NA 2D22A 5I2UA 1E1FA 4PMOA 2ZWZA 1C3FA 1VFFA 2E3ZA 2V5DA 3VIIA 3UG4A 3OIHA 2DSKA 3IAQA 5I23A 6A3HA 2WM0A 4D1JA 2W4XA 1W3LA 1OD8A 3IJ9A 1ITXA 1W9DM 4CU7A 4GXPA 4LYQA 5CGTA 3UEQA 1CXFA 2WZIA 1UR2A 2WLZA 3EBVA 1EO7A 3AIWA 1VB9A 5M3WA 2J8FA 3AS2A 3K8LA 4PUDA 4MDOA 1UQYA 3ZSTA 1V0NA 1MFVA 2BVTA 3DYPA 1HJVA 4OKDA 2QMKA 4J28A 4P7OA 2WBKA 5A1AA 1R7AA 1H4PA 4PMQA 1KCLA 2VZTA 5E9AA 1JXJA 4UFMA 4HTYA 4PMUA 5HDRA 3DC0A 1KR0A 4JKKA 4MPKA 1KXVA 5D4YA 4WSJA 3WY1A 1BLIA 3CHFA 4U31A 1GHSA 5BWFA 1UZ1A 1PX4A 3PZTA 2VVNA 1ISWA 2V3EA 4KRTA 3GH5A 4AZ5A 3PZMA 3WNOA 4PSRA 4F66A 1E40A 4V27A 4CD5A 1B1YA 2VRQA 1FOBA 1XYFA 4W84A 1CXIA 2J25A 4ATLA 2D2OA 4UZSA 5IFTA 1Q6EA 1VIWA 2VR4A 1BTCA 3CZEA 2XFYA 4LGXA 3U5UA 3AIUA 3K4DA 3VDCA 3RPMA 1U30A 2OWCA 2UY2A 3PZVA 3G6LA 4MB1A 5GQBA 4KH2A 1OGSA 1CYGA 3VDAA 1V3IA 1M04A 3CZ8A 3MANA 4TXEA 1UR9A 3MUY1 3TONA 3CUHA 3WKZA 4AZCB 3FY1A 4AC1X 1GORA 1V3LA 1V6YA 3WQ5A 4MNKA 2BV9A 5M5DA 2VT0A 1EOKA 2EPLX 2J8GA 3ARXA 3WDIA 1HF6A 4QDMA 2ZWYA 3EMZA 2XTKA 1KGXA 5JUVA 2YLLA 4KWUA 1JDDA 5CSUA 1GCYA 4C91A 3T2PA 5A8QA 3A4XA 3L4VA 4WKAA 2OYKA 1NARA 4R5EA 4ZE5A 4M81A 1M7XA 2FH6A 3AHTA 3GXFA 3L4WA 3SUWA 1QNPA 1JYVA 1E6RA 2FHBA 4YHGA 4AZIA 5A6MA 1PZ3A 3NUKA 3ZJ7A 1WE5A 1BGAA 1E3XA 1OBAA 1GQLA 1NH6A 4M24A 4PMZA 1VBRA 3A3HA 2WVVA 1E15A 1WDPA 4W87A 4BF7A 1QI0A 4QLJA 4OJYA 4KGLA 1SR0A 1XD0A 4CD8A 4QFUA 1CBGA 3VDHA 5D9OA 4Z2KA 2ZXQA 1E6PA 1W9BM 1V6WA 2J74A 2DEPA 3WMBA 5DEZA 1U33A 1TCMA 4GZEA 4AD4A 1PJ9A 5E70A 1IV8A 5ECUA 5CXPA 6TAAA 1GQIA 3WELA 1QI4A 1J0ZA 2J47A 1G1YA 1PEZA 1W9XA 3K46A 1LWJA 3WDQA 1BYBA 1FP8A 4L4OA 4D6FA 4PTWA 1Q6CA 1PPIA 1JAEA 3AHZA 2WPGA 3ZM8A 3CUFA 4Z2GA 2V3DA 1WNOA 1X6LA 2WHLA 4W7UA 4OBRA 1OSEA 2WLYA 3AI0A 1H1NA 5D9MA 4HMDA 3NSMA 3BXWA 4AEEA 1W2PA 2GUYA 4NF7A 2IXUA 3M7SA 1PX3A 5BYWA 1QI5A 1RPKA 1WP6A 4NI3A 3LMYA 1GZJA 1UKQA 3RJXA 1W91A 2VC9A 3B9DA 1W3JA 4FLRA 4DWSA 4W7WA 3O6AA 1X1NA 3SCOA 3AMLA 3SUSA 3FAWA 1EDGA 4CUCA 3TTQA 5DMYA 3AZRA 5DT5A 4QCEA 2VRKA 4GQQA 1UUQA 1V3MA 3N15A 2F61A 1OM0A 3QOMA 2E40A 2GDUA 3KL5A 2A3BA 1XYZA 2ZE0A 1E0XA 1OIFA 1GOKA 5LYRA 4AZGA 1CGUA 3MO4A 3TA9A 2EQDA 1H0IA 1LL4A 1LJYA 4JAWA 2GK1A 1KGWA 4TOQA 3GBDA 1QHZA 1O6IA 4J7RA 1QVBA 3HU7A 1GQKA 3S6TA 5ABFA 1PIFA 4PMNA 3EDFA 3VGGA 1SFSA 2DIEA 1JZ4A 1B2YA 2D0GA 3CMGA 1WO2A 2ZX5A 2B31A 1VFMA 3AOFA 5EMYA 2OYLA 2GSJA 3SCTA 1FHLA 4UFKA 3CHDA 4RE3A 1Z32X 3AXHA 3WBAA 3WFZA 3O2LA 2J7CA 1EQPA 1WDRA 1CGTA 4OZOA 3WH8A 1ISZA 2OLHA 4B3LA 4AD3A 3GM8A 3VTRA 4J3XA 4CVUA 4D1IA 3TTOA 2ZX6A 3SCSA 1DTUA 1UG6A 4MDPA 4BA0A 5BXTA 2CYGA 1UQZA 3WL0A 1M03A 3MS8A 1FHDA 1ZBVA 1V6VA 3WNKA 4GZIA 2WSPA 2NT1A 3BCDA 3PZIA 4BQ4A 2YA2A 4D6HA 1WDQA 4AYSA 2WKGA 1UYQA 4XV0A 4B16A 3K4AA 4UFHA 3VNZA 1G01A 1NQ6A 2WVVB 1ESWA 1KCKA 5FKYA 2JEPA 1CGXA 4EAMA 1KXQA 1EA9C 2OWWA 2DT3A 2XWDA 2WC4A 1TUXA 3VD4A 3SCVA 5DFAA 5CSYA 3ZJ8A 3SCNA 3GDBA 4U5KA 1E73M 1GOMA 4A4AA 1E0WA 4PRWA 1H3GA 1XC6A 2ZX8A 3L2LA 2C7FA 2CKRA 2XG9A 1EXPA 1RP8A 3GYCA 3WFLA 3WDRA 3VU2A 1J9YA 3BSHA 4TX8A 1MXGA 1WZLA 2ZXAA 2RGLA 4MJ2A 2JF6A 1QBAA 2DPEA 1W9VA 1M53A 3PZGA 3VX1A 1ISXA 4ZENA 4S3KA 1GHRA 5D8WA 4AW7A 1U2YA 1J0IA 2CXGA 3AYSA 4FLSA 3VD9A 1V0LA 4BQ5A 1DWFM 3A4WA 4IPLA 1D7FA 1A47A 1E6SM 2FHCA 3MU7A 2J78A 4J3UA 5E0FA 3W38A 1BVZA 4UOJA 4J3SA 2XVPA 5F7UA 2ZXDA 3SCRA 4UCFA 4A3HA 5M03A 3M46A 3WMSA 4Z2HA 3QHOA 1JFHA 1J11A 1E6NA 1QHOA 2CKSA 4HA4A 2XPKA 4U2ZA 4AIUA 2HISA 3DHUA 2OSXA 3KEHA 3UERA 1OT1A 1UR4A 2GK1B 3WDHA 2J7HA 5BXRA 2XVNA 5HPCA 1H0GA 1TZ7A 2GFTA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1UHV A;  2BVD A;  4PMV A;  4PN2 A;  1I75 A;  3WF4 A;  4F79 A;  1J0J A;  5A6A A;  4LXF A;  2BXY A;  3OLE A;  4PMR A;  4UOZ A;  4QAW A;  2VNC A;  4GIN A;  1UKS A;  4CCD A;  1DWA M;  2VOT A;  2JFE X;  2YL9 A;  2PF0 A;  4W8L A;  5A2B A;  1H49 A;  1V3J A;  3VIN A;  2D20 A;  1LG2 A;  1KBK A;  2VJX A;  4TX6 A;  5I77 A;  1MQQ A;  2WHK A;  2DIJ A;  5DF0 A;  4JHO A;  1VJS A;  4ACZ A;  3CZK A;  1E0V A;  2YL6 A;  1DP0 A;  5CGM A;  3AZT A;  1E70 M;  5HNN A;  1Q6D A;  5LA0 A;  4EE9 A;  4UFJ A;  4W85 A;  1BSI A;  2X09 A;  1V6X A;  4MB4 A;  1EOM A;  3JUG A;  4D6D A;  2V5C A;  1CGW A;  2A3C A;  4P8X A;  2AMG A;  1ZU8 A;  2XHY A;  4WLC A;  4FLQ A;  3MMU A;  3CLW A;  3G6M A;  3PZU A;  1JAK A;  3N1A A;  2WNW A;  1YQ2 A;  3BAY A;  4B9Z A;  3KL3 A;  5JBE A;  2GVY A;  3EDK A;  3VGD A;  1B3Y A;  2XSB A;  4A3Y A;  2O9P A;  2GJP A;  2DT2 A;  2W63 A;  4AMC A;  5A6B A;  5FOO A;  3IAN A;  1V02 A;  1BG9 A;  3KE0 A;  1JI1 A;  4QLL A;  1WDS A;  2WHJ A;  2JIE A;  1MW3 A;  3OZP A;  1J12 A;  1GW1 A;  1QNS A;  1V0K A;  2CES A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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