3UWY | Genus

Total Genus 90

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	90
sequence length	261
structure length	261
Chain Sequence	HHHHHHGSMRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Isomerase
molecule keywords	Triosephosphate isomerase
publication title	Crystal structures of triosephosphate isomerase from methicillin resistant Staphylococcus aureus MRSA252 provide structural insights into novel modes of ligand binding and unique conformations of catalytic loop pubmed doi rcsb
source organism	Staphylococcus aureus
total genus	90
structure length	261
sequence length	261
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date	2011-12-03

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00121	TIM	Triosephosphate isomerase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3uwyA00

3VNDA 4R7JA 5E1QA 1QCWA 4UFLA 3NA8A 3PY2A 3E12A 5D2VA 3W2UA 4ICNA 4TMBA 3NL3A 2R91A 3FIGA 4NJHA 3NPWA 1GT8A 4LVBA 3M5XA 3ABSA 3NL2A 4LW7A 3W7DA 1QOPA 4WUIA 1F74A 4K39A 4RZ5A 4POCA 3GR8A 3QQ0A 2PRLA 3PUEA 3UZJA 2TYSA 3NDOA 1YDNA 1TREA 3FKRA 2FIQA 3FOKA 5FF2A 1OVDA 2E5CA 1GTEA 1XKYA 4HSOA 4NJJA 2H3DA 1KBIA 5AC6A 3W87A 5LNWA 2FPYA 1A5AA 3L5AA 3MJYA 1FWWA 1R46A 1QR7A 3GDLA 5G2WA 4NUWA 1WXJA 2R94A 1SZGA 2VFEA 3W7KA 5C6MA 3OVRA 3QC3A 1GYLA 3TA6A 1TPEA 4O28A 1M6JA 1YPIA 1WA3A 3TFXA 1W37A 4PEKA 4RZ6A 5G4EA 2ABAA 5HR7A 3LHTA 4LY8A 2CLMA 2DZVA 4BFAA 3H53A 1GYNA 1Z44A 4UTWA 4NNCA 1XBXA 3I7RA 4Z1CA 5HUPA 5G1YA 1ZFJA 3LLDA 1MO0A 1HL2A 4MZ8A 2Y88A 1VHNA 3PSVA 4NQ1A 1Z41A 1QOQA 4UTIA 2GJNA 3R5EA 2E68A 2DZXA 2FPTA 4LC8A 5K7JA 1KV8A 4R33A 1GVFA 4HN4A 3WK1A 3STEA 4GUJA 3L67A 2GVGA 3LI1A 3C3NA 2DZUA 2F84A 3LOTA 4UUIA 1YYAA 3FYPA 1MSSA 1LOQA 1EB3A 3GXNA 2OJPA 4DEFA 3M9YA 2Z6JA 4FNQA 3EX3A 3G0SA 3S1UA 3UYCA 4K38A 3QW4B 2PC4A 5BRBA 4WXYA 3W86A 4A2RA 1MEHA 4UFKA 1KFJA 1UBSA 3W2NA 4MFDA 4UTKA 3P5ZA 3FFSA 1KV5A 4FX8A 4LVDA 3RK8A 2BWGA 3S9YA 3C2VA 1TPWA 4UNKA 1AL8A 3DKJA 1QPOA 4HT3A 5LHEA 2FFCA 4X3ZA 4FNSA 3L5MA 1C29A 2PRMA 5HR6A 2GOUA 7TIMA 5LSMA 1G4EA 1ICPA 2H90A 4N02A 2VELA 4ADUA 4P61A 1IIGA 2BTMA 1SU5A 4IMGA 2BXVA 4Q32A 4LT9A 4CNNA 2UV8G 4OWGA 4I7VA 3NAVA 3INPA 2WSQA 3M43A 5EKYA 1IGSA 3Q94A 4IJBA 1B4EA 2QCFA 3T44A 5BOOA 1I2RA 3CT7A 4IXHA 1OFRA 5FF3A 4AWTA 3SY5A 3W72A 3C0JA 1R47A 2EF9A 5F4XA 4BI6A 3EXRA 3EX2A 5AHLA 4NZFA 4JR5A 1XDLA 3G18A 1ZCOA 2PURA 1K7XA 1WDWA 3S5YA 4Z1BA 1RD5A 1NEYA 1QPNA 4CQ9A 3P74A 3EWBX 3W22A 2J24A 3VI2A 1TV7A 3EXSA 2CFFA 4RLIA 5KZMA 2V5BA 4MJZA 2RDUA 1YXDA 3GNDA 4UMCA 4N4QA 3G0XA 3Q2DA 1WOAA 1GOXA 3HB9A 2B0MA 4J9JA 3G1XA 4NX5A 1W56A 3T4CA 3QSTA 2X1RA 1TTIA 1A5CA 3NQFA 4JXCA 4N9CA 3R13A 1OFQA 3F03K 1VHCA 1JCNA 3KRUA 1DBTA 3GK0A 3HGJA 2WV8A 3DFNA 1VH7A 5F2GA 4JX5A 3BW3A 2FB2A 1DJNA 4WY0F 1KM5A 5G4WA 2V81A 1I2PA 4MLJA 1LRQA 3G1AA 3PUOA 3TFCA 3CQ0A 3GIYA 1IXOA 3D0CA 3PS7A 2E6AA 1P4CA 5AYXA 1LCOA 1KTCA 3O6CA 3QH2A 1H7NA 3NNTA 1W31A 2DZWA 1TTQA 1EP1A 1EP3A 3P8JA 1ML1A 1SO6A 3UXAA 1Y0EA 2FDSA 2V0TA 3GB6A 4MOZA 4Z08A 1Z48A 4LVAA 3KFTA 1XC4A 5HUOA 1PE1A 2NUXA 1GJPA 2A0NA 5D38A 1W5MA 1G4PA 1QAPA 1F5ZA 5IM51 3G3MA 4PA8A 2HMCA 1TRIA 3TSDA 2ZA1A 1NF7A 3HBLA 3STGA 1FWSA 2NLIA 3USBA 5CPNA 6TIMA 4FXRA 5C55A 2EPHA 3G22A 1K8XA 2ZZ7A 3QEZA 4AF0B 1LM1A 4JX6A 4KKXA 1HUVA 2ZRYA 3YPIA 4GUHA 1D3GA 1SSDA 3HF3A 3BVJA 3ZFHA 3TK7A 2GJLA 4GBUA 1FY6A 3NQ8A 1WOBA 2VOMA 3N2XA 4YCOA 1M7OA 3E02A 3UY7A 3LBMA 4DO4A 3LV6A 4JTTA 3G3DA 4JIPA 1H7WA 5CPOA 3TJXA 1GPWA 5D32A 3W75A 4MUZA 1G4TA 2J9ZA 2QDHA 1S5TA 1QFEA 3G0UA 4Q4KA 5CSSA 4O50A 1P1XA 2C0AA 2NV2A 2Q3OA 2TMDA 1FBAA 3PBUA 4I9AA 4ZMGA 1LRNA 1YXYA 2C16A 4CCCA 4G1KA 4E38A 3DHFA 3G1DA 4MYXA 2R8WA 1TPDA 3I7SA 4FO4A 2C14A 1L6YA 5F4SA 5H2ZA 3T78A 1TB3A 2ZZ5A 1AW5A 1SUXA 1DOSA 2RDWA 3B03A 4M7SA 1A5BA 3W1NA 2V5LA 3LHVA 2P1FA 1XCFA 1OYCA 2C3ZA 3LBCA 3R2GA 1F73A 1PIIA 5LZLA 3B05A 4PCFA 1HFBA 2C1HA 3EWWA 5AN7A 1JULA 3TX9A 1VGAA 1I2OA 2JKAA 1RVGA 4S2CA 4N9DA 1LP6A 2FB3A 4KFOA 1QDSA 2Z6IA 3PG9A 2I14A 3NVTA 2NZLA 2QEZA 2ZYFA 1KM2A 5G2IA 4JY8A 1RV8A 2CLEA 5KITA 1K3UA 3TW6A 4WZHA 4ALDA 3THQA 3TU9A 2B7OA 3DBPA 3QQ1A 4MJMA 1VYPX 4A2SA 3BV4A 4M5PA 3UWWA 1H1ZA 1AMKA 3S5ZA 2NXHA 3GXPA 1WX0A 4YWIA 3QPYA 1H60A 1RZMA 1VR6A 1THFD 1TIMA 3EWYA 1XL9A 4O1BA 4UTUA 2ZCGA 4H6KA 1XXXA 1C8VA 2PRHA 3QJAA 3GAYA 1XBYA 1G7VA 4AB4A 3A24A 3L0GA 4LV4A 4JDBA 3WFAA 1TO3A 3B4UA 4JGDA 5F1VA 5AHFA 3B0UX 2ZQ0A 3GX9A 1V7YA 4OV9A 3JS3A 1A50A 5AHNA 3TSMA 4JTJA 4RV8A 5F2MA 3P67A 3FYOA 2ZFAA 3IVUA 5DY3A 4YCPA 2YFNA 2OCZA 3BARA 2RDTA 3FS2A 3CB8A 3A22A 1OX4A 5G1TA 3W84A 3KAOA 4EF8A 1FDZA 5DY2A 4ADTA 4Y96A 2H8XA 3W23A 2QCNA 4CNOA 2E5BA 4UTTC 3NM3A 2ZTKA 2QCMA 4ML9A 4AF0A 4JTKA 5FEWA 2QCLA 4FNRA 2GQAA 3K30A 4CQAA 2G95A 5EMUA 1J4EA 3THAA 2KZHA 3TROA 1LLZA 5DXXA 6ALDA 1H1YA 1MZHA 3N73A 4UIOA 1KLZA 2ISWA 4UC5A 5A8GA 3H54A 5U4NA 1QWGA 5LNVA 2QUVA 3W1UA 3HGSA 4N6FA 4PL1A 2ALDA 2Y61A 1Q6QA 4GNJA 1RR2A 1UJPA 3KOFA 1FWTA 2FLIA 4DPQA 3S0CA 4ZQNA 4QAIA 2NXGA 2DJXA 2EKCA 3IGSA 1X7FA 3OEXA 3UXDA 1O5XA 3SGUA 1JQVA 3G1FA 3VCRA 2W6RA 4TX9A 1OJXA 1O94A 2CU0A 2GVJA 4O57A 4DF2A 3L9CA 4M6VA 1QO5A 5TBOA 4GWEA 3F4WA 1FCBA 1KM4A 4LS2A 3W1RA 5D2TA 3LLFA 4GJ1A 1BTMA 3S5NA 1UASA 1GEQA 4TIMA 3W7CA 3NQGA 3L21A 1Q3NA 2QUTA 5GVJA 4U4MA 3W7OA 3CEUA 3LXCA 2BSLA 1TQJA 2CLOA 1FXQA 1F6PA 3MI3A 1FCQA 2XN2A 3NYZA 2QCDB 3W1PA 3DXIA 3M5VA 4N9BA 1G69A 3LCGA 1J5TA 1KTBA 3DI1A 4OV4A 4KWVA 4FIQA 5CZJA 2A2IA 4HNTA 2GQ8A 5KZDA 3E96A 1JRCA 3ATZA 4UTTA 1KTNA 2QCHA 5DBTA 1F6KA 3RMJA 2V2CA 1OG0A 4NT0A 5D2YA 3NO5A 1H7RA 3LRKA 4RR4A 5C2XA 3RF9A 2YW4A 1AG1O 2QUUA 4IMFA 2QCGA 3LCFA 4ZQPA 2Z2UA 5F1UA 1QPQA 3LHUA 4EWND 1KFEA 3CLMA 3TE9A 3W2KA 4S1FA 3W7PA 3O15A 1H62A 3M44A 1F05A 1VJIA 1GVSA 3DENA 3GDRA 3LM7A 2ISVA 3LHZA 4K8EA 3SW6A 4CCEA 5DCEA 2VXNA 1VQTA 3TIMA 1JUEA 1K02A 3HMJG 4QJ1A 3PSWA 2XFWA 5I3KA 1OX5A 2Y70A 4XKYB 1TQXA 2D73A 1TCDA 3W73A 3S5OA 4X9SA 3M6YA 1DL3A 2PE4A 2QAFA 5I3IA 1H50A 1VLIA 2PCQA 3QZEA 3LXBA 4NXKA 4O8RA 1I2NA 4JX4A 4O0ZA 1DV7A 4AEOA 1O5KA 3CEPA 1CX9A 1EEPA 4AHOA 5KZEA 4MIMA 4NJIA 3NQDA 3S1WA 1EWEA 1IIHA 3EX4A 4DELA 3GDMA 4U28A 1QMLA 3UPBA 5LGZA 3MP5A 4YLWA 4QNEA 3NQMA 3TAOA 1OYBA 3TQ0A 4K37A 5CG7A 3UWQA 3HIJA 3S1XA 3O6DA 1LYXA 2JKEA 5FESA 1KM0A 2JKPA 1OYAA 1B9BA 3UWYA 4BR1A 3IV3A 4EVZA 1U5JA 5TIMA 2TSYA 2CLIA 1HO1A 1O95A 4IMEA 4OU1A 3LDVA 4QISA 4ZQRA 1ZAJA 2VC6A 3HGRA 4UCGA 4BK9A 1LOLA 3T55A 4N2YA 3TMQA 3NGJA 2XN1A 4Z0JA 2QCEA 4LWWA 4UNLA 3A9IA 3W85A 1BKSA 3PBYA 1GG0A 2YYUA 1Q45A 3IIVA 4HHPA 3BLIA 3FJLA 5EPDA 2VEPA 1D9EA 1G7UA 3UD6A 1IXPA 1EX5A 3O8AA 3IEBA 4E2DA 5DLCA 1XFBA 1K8YA 1QPRA 4GRSA 2CLKA 4O54A 2DP3A 4O4WA 5D30A 3EKZA 3I6RA 5D09A 4E0CA 3LXAA 2ZZ6A 4H3DA 2Y7DA 4PL2A 1WAUA 1MXSA 3GKAA 1KM3A 4UFJA 4XWUA 3DFPA 3MHGA 5L6UA 1WQ5A 2G96A 1TV8A 2QF7A 1BWLA 2WQPA 3PUDA 2TRSA 3KHJA 1K7EA 4EF9A 5I3GA 3OVQA 3JR2A 4Y6GA 1GVQA 1R2SA 5HQEA 4NVTA 3C2EA 3W2LA 3A5VA 5FF0A 1PS9A 2JK2A 2QCDA 1ZAIA 3TJLA 3BK0A 1W5PA 4JYDA 5AYZA 1I2QA 2DORA 1Q6RA 1JVNA 1TV5A 3BG5A 3EWUA 2AAMA 4LUJA 3HJZA 3LV5A 2HTMA 1NF0A 1Q6OA 4IQLA 4RJEA 3OA3A 4MY9A 3NQAA 4N6EA 4UR8A 5KSWA 3UWUA 4I7WA 2BLEA 3P8IA 1A53A 2Y6ZA 4M6PA 4FX7A 3L66A 1N55A 3G1HA 1ZY9A 3NZ1A 3G8EA 1A5SA 4DPPA 2A7NA 8TIMA 4NNAA 3C4UA 1OK6A 4WJEA 2J6XA 1VC4A 4MKNA 4RK8A 4BF9A 2DJLA 3NPVA 1VYRA 1KM6A 2RFGA 3HPXA 3FKKA 1UUMA 4JEQA 1OABA 4DQWA 2IQTA 4XKYA 2ZRXA 2YGYA 4JD4A 4O1AA 2FPVA 3MBDA 5K9CA 2E6DA 3EKLA 5TQLA 2OZ0A 4IOTA 3TMLA 2I9EA 1ZALA 1SZFA 2WSRA 2A6LA 3QPZA 4GUGA 2QCCA 4AVFA 4MPQA 4O53A 4UTHA 1KLYA 1W1ZA 2F7FA 3SZ8A 3SR7A 4XUGA 3BW2A 3W7RA 4E2BA 3TUUA 2ZZ2A 1L6SA 2BZNA 4O1CA 2B7QA 1SSGA 5F2LA 3STFA 1B4KA 3VE7A 3IRDA 3R12A 4M7TA 3M7WA 1VS1A 4AHQA 3W88A 1SFJA 2Q8ZA 3TXVA 1SPQA 4O52A 5CPLA 1KW1A 2E6FA 4DF1A 4JTLA 3GZ3A 1W0MA 4XQ6A 3VFLA 3C2RA 3TC6A 4HPJA 1BEUA 1DKWA 2ZTJA 1QNVA 4W9TA 3EWXA 3E49A 3U6WA 4K8HA 4HNUA 3P82A 2B7NA 2R14A 2CLFA 3KVJA 3I7QA 3TAKA 1TMHA 4FIRA 2ZRZA 3PBWA 1T99A 4CLMA 1WBJA 4AWUA 1XUUA 2G97A 3L5LA 3ZS4A 1I8JA 5FI8A 3LX9A 3LTPA 3N9RA 3TV8A 3CC1A 5LNSA 3M5YA 3ABOA 2ZA3A 2Q3RA 3DFTA 3MYPA 2V30A 4O18A 1RQBA 3GKFA 4CNPA 4QIUA 1F2JA 4NJKA 4Y9AA 4UR7A 3WJXA 4HIBA 4TMCA 4WY0B 2G5WA 4NXSA 4D2JA 3ZWSA 4YXGA 3GAKA 4XTDA 4A29A 2OMAA 3GYEA 3CM4A 1GWJA 4PTNA 2A7RA 1XBZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3UWYA

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