3WH7A

Crystal structure of gh1 beta-glucosidase td2f2 l-fucose complex
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
443
structure length
443
Chain Sequence
MAGERFPADFVWGAATAAYQIEGAVREDGRGVSIWDTFSHTPGKIADGTTGDVACDSYHRYGEDIGLLNALGMNAYRFSIAWPRIVPLGAGPINQAGLDHYSRMVDALLGAGLQPFVTLYHWDLPQPLEDRLGWGSRATATVFAEYADIVVRQLGDRVTHWATLNEPWCSAMLGYYLGVHAPGHTDLKRGLEASHNLLLGHGLAVQAMRAAAPQPLQIGIVLNLTPTYPASDSPEDVAAARRFDGFVNRWFLDPLAGRGYPQDMLDYYGAAAPQANPEDLTQIAAPLDWLGVNYYERMRAVDAPDASLPQAQRLDDPDLPHTADREVYPEGLYDILLRLHNDYPFRPLYITENGCALHDEIAEDGGIHDGQRQAFFEAHLAQLQRALAAGVPLKGYFAWSLLDNFEWAMGLSMRYGICYTNFETLERRIKDSGYWLRDFIAGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords beta-glucosidase
publication title Crystal structure and identification of a key amino acid for glucose tolerance, substrate specificity and transglycosylation activity of metagenomic beta-glucosidase Td2F2
pubmed doi rcsb
source organism Metagenomes
total genus 179
structure length 443
sequence length 443
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2013-08-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wh7A00
2J7CA 2F2HA 1QW9A 1LF1A 2IUZA 3BLPX 3TTQA 1E5NA 2W63A 4U33A 2QPSA 2VX4A 5FL0A 2VZSA 2V38A 1QPKA 4GKLA 4GO9A 1UA3A 3T0BA 3SURA 1H0GA 2XVNA 3EDJA 4CD5A 4HU8A 1M7XA 1HJWA 1US2A 3WBEA 5F7UA 1M03A 2D20A 4AZIA 2XWEA 1G0CA 3M7SA 2ZUUA 3POHA 2YLLA 3CUIA 3ZR5A 4MNKA 4ATDA 4J3VA 4P7OA 4Q22A 1J0KA 4KGLA 3MSDA 2CEQA 5CSYA 1O6IA 1QI2A 3SCPA 1JZ5A 3VIFA 3IANA 3N1AA 3ALGA 3GH4A 2XPKA 4GXPA 5JIPA 1ESWA 4FLOA 5M17A 3T2PA 1LQ0A 1HKMA 4AEFA 1TE1A 5IXEA 4NF7A 3VDAA 1W9XA 5D9NA 4GZEA 1LJYA 1NWUA 3WD3A 1VEPA 4CU8A 1PEZA 1J12A 2UY4A 2BHZA 4U2ZA 1OGSA 1E6SM 4ZFMA 4HZ8A 2XSBA 2G3MA 1PX4A 2WANA 3WIJA 3AYRA 2Y2WA 4EE9A 1EDTA 3MO4A 3WF0A 4MB3A 3MU7A 4JL2A 5A2AA 3ARSA 2EXOA 3WEOA 1LLOA 2ZOXA 3F5KA 3KE0A 3MMWA 1ECEA 1E6NA 3UERA 1OCQA 2CIPA 3OA5A 1H5VA 3B9AA 5A8PA 4JKLA 5A3HA 3AIUA 1JF6A 2CETA 4ZEPA 1V0KA 3CZEA 1HKKA 1W1PA 3VM7A 4GIAA 2ZUMA 3OIHA 1PX8A 3BGAA 2PWDA 2D0HA 3AHYA 1W9VA 1V0LA 4W5UA 5JBFA 1QI4A 4Z2LA 1CGUA 4P8VA 1LWHA 3QOKA 5M3WA 4M81A 2IXUA 2VZTA 4BQ2A 6TAAA 4E2OA 1JXJA 1OT1A 1BPLB 5CXPA 4PN2A 3JUGA 1HJQA 3GTNA 2XGBA 3SCTA 1FH8A 3SCNA 1XC6A 1IV8A 4UZSA 1CNVA 2Y8VA 1KR1A 2OYMA 4H8VA 1Z32X 1FFRA 1U30A 3U5UA 3B9EA 3ZIZA 3PBGA 2G4FA 4C7GA 5EBAA 1SR0A 1TFVA 3VO0A 3OLGA 2ZX6A 1NARA 2OSXA 1GPFA 1V6YA 2UY3A 3A6OA 3TP4A 4YPJA 4URIA 2Y24A 1Q6FA 1B3VA 3II1A 3O6AA 2VCAA 2VNCA 3WDPP 1VB9A 2EPOA 1MW3A 5EB8A 2J8FA 2A3BA 4AISA 3TTSA 3VD7A 2EO7A 3I3DA 1AQHA 2XHYA 5A1AA 1CTNA 2D0GA 1Q6GA 3W26A 5JIWA 3RIKA 2ESCA 3CHCA 4OBSA 5HDRA 1XYZA 3VPLA 3CTTA 1C8QA 4AZ6A 3VKKA 1TMQA 3T0DA 1MYRA 1JF5A 2VOTA 5CJ5A 1GOOA 1SMAA 4XZBA 4C7FA 3FW6A 1R7AA 5I23A 5D9MA 1B3ZA 2EPLX 3KL0A 5CPTA 1JAEA 1GVIA 5FIPA 2E4TA 5AC4A 1D2KA 4M24A 5CLWA 1V3LA 5FKYA 2RGMA 1CECA 2XVLA 4H04A 1GOMA 2WXDM 1F4AA 3ARQA 2FH6A 1UWRA 5E70A 3GM8A 5CGMA 2E3ZA 3BLKA 4PMVA 3NDYA 2XGIA 4DWSB 1AQ0A 4GPNA 3L2MA 3WL1A 1HJSA 1BF2A 4GZJA 1W3JA 1JD9A 1DWJM 1A47A 1WDSA 1WZMA 5BROA 1GQIA 1W9UA 1E6ZA 1GCYA 3W24A 3E1F1 4HOXA 2BXZA 1A3HA 1JI2A 3AFBA 3GH7A 2F8QA 5IDIA 2XTKA 3VD3A 1VEOA 1QHZA 1JXKA 3PZOA 3WD2A 2YDSA 2WZEA 3G6LA 3ARYA 3FHAA 2WLZA 1PAMA 1BLIA 1VAHA 5AYIA 3DC0A 3ZT5A 4Z2GA 3SUVA 1H49A 1V3HA 2BS9A 2J62A 3EYPA 4HMEA 4PMXA 1TUXA 1BSIA 3SCQA 5E0CA 3AHVA 2GVYA 3CUJA 4D6FA 1LL4A 4D6EA 5IHRA 4GINA 1VRXA 1C7TA 2VT0A 1UA7A 4W7UA 3ALFA 2X05A 4D6JA 4QDMA 1B1YA 1OIMA 2J79A 1G5AA 1TA3A 3RO8A 3RM9A 3WH5A 5I77A 3RJXA 1DWHM 4PMDA 3ZJKA 1FP8A 3PZIA 5LA1A 2NT0A 3BMWA 1J9YA 2XFRA 4MB4A 1KGXA 4PEEA 3VGGA 1H1NA 3U7VA 3QOMA 3PZNA 4R5EA 3W28A 1NOFA 4AZHA 3RDKA 3L4UA 4BZYA 1VBRA 9CGTA 3AZSA 5ECUA 1EA9C 4PMYA 5EFDA 1FHLA 4Z2JA 4CUCA 3VMNA 1U33A 4F66A 1V3IA 2VZVA 1BVZA 5FOOA 1KGUA 1ZS2A 1TCMA 2WBKA 1R86A 3OZPA 3VD5A 4PYSA 3WUFA 1MFVA 2OSYA 4DM2A 1EDQA 3VNYA 3WELA 2WC7A 2J74A 2WK2A 4UFLA 2WCSA 4A3HA 3WEZA 2W91A 2WMIB 1FH7A 4BS0A 3HMCA 2D22A 3MS8A 1XHGA 3ZO9A 1UUQA 3AIVA 1JZ8A 2X0HA 1EHNA 4TTGA 3SUTA 3WNNA 1GHSA 2W66A 1NOUA 1B90A 4H8UA 5ABFB 2CKRA 2WVUA 3CUGA 3WQ6A 4AC1X 1BHGA 1GOIA 2BHYA 4M56A 3WNPA 2DSUA 2DT2A 3WH9A 1CIUA 4JHZA 4MB1A 2B31A 4UOQA 1E6PA 4P8WA 1E43A 2CHOA 3U57A 4BCEA 1KQZA 2VC9A 4NI3A 1P6WA 1VEMA 4FMVA 5FD0A 1E70M 1NWTA 3RM4A 4YHEA 3GZAA 1NOWA 5LYRA 1EXPA 2OWWA 4P8UA 5A6JA 5C8BB 2DT0A 4JCMA 1I1XA 1S46A 3ZJ7A 4UFHA 5DO8A 1UD5A 3N17A 1UR9A 2BFGA 5A8MA 4D1JA 4ATWA 4AXNA 1UQYA 2CXGA 1BYAA 2WWCA 1WNOA 2PWHA 2ZWYA 4A4AA 1OGBA 3B8SA 1XRVA 5GNYA 1WKYA 2YDQA 5A94A 4AY1A 1VF8A 1CXKA 2XVGA 3PHAA 4W85A 4J3TA 1CPUA 1FOBA 4LPCA 3O2LA 1BVNP 2GJXA 4MTVA 3IJ8A 1JIBA 3L4XA 2Y5EA 3K8MA 1U2YA 2CBIA 1GOKA 3DYOA 2GJRA 2IXVA 3F5JA 2E8YA 1NP0A 3OGVA 2GK1B 1Q6DA 1JYXA 4PTWA 4CU7A 4TVDA 8A3HA 1CYGA 2Y8KA 2HISA 3WDIA 1ISYA 3EDFA 3PZQA 2Y4SA 1DWIM 5HNNA 3M6DA 4W5ZA 1CEOA 1UKPA 5GPRA 1RP8A 2PWGA 1C3FA 3RM8A 2BY1A 3HU7A 4UQ9A 2VZOA 1AMYA 4HOWA 1V3MA 1WZKA 4J7RA 4J3WA 4WKFA 4XV0A 2OYKA 1ITXA 2QV4A 3S6TA 1E4MM 3LMYA 2O92A 2TAAA 4OUEA 1PBGA 1X1NA 3TTYA 1OD0A 1QNRA 1CGVA 2DSZA 1E40A 1WDRA 1BAGA 1DHKA 1BTCA 4KMQA 5EFFA 5FL1A 5A6SA 4P7RA 4D71A 3SCOA 4MNMA 2GDUA 4JFVA 4PTMA 4V2XA 5BRPA 1E4LA 1SFSA 2YL6A 1OWQA 2YIHA 1H0IA 1JAKA 2XUCA 4Z2HA 1BG9A 3CHEA 2FGZA 1JZ2A 2BXYA 1OIFA 7TAAA 4B15A 4AD5A 3WUGA 2NW0A 3VGFA 3J7HA 5A2BA 3WENA 4OOUA 4EKJA 4M29A 2WLYA 3SEPA 2WM0A 4MADA 1M53A 4GI6A 1OSEA 6CGTA 4OBRA 2V3FA 3PTKA 3SIMA 4U2YA 2E9LA 3MUZ1 1H11A 3M07A 1EO7A 2WW5A 3IAQA 2OYLA 5D9OA 2EPNA 1J01A 1WDQA 4TTUA 4F8XA 2G3JA 4OZOA 2WMFA 4HPHA 1VJZA 4HMDA 2EJ1A 2VX5A 3DYMA 4AZ5A 1BG4A 4U3CA 4V27A 4PMUA 2O9OA 1DP0A 2V3EA 2YA2A 2VCBA 1YHTA 3WMSA 2X09A 1UZ4A 3NSMA 4AD0A 4D1IA 3AIBA 2YA0A 2ZIDA 4IPNB 1QI0A 4W93A 2YJQA 5M5DA 1EO5A 4RE4A 1NWRA 2VRJA 4W84A 3WUEA 4UFJA 4CVUA 4YHGA 4PCSA 1MW2A 3K4DA 1E0XA 2WMJA 2DH3A 1HN1A 2DIJA 3QHNA 1K9FA 2WHJA 1HVXA 1PZ3A 4CKQA 2WB5A 1OB0A 2WPGA 5BYWA 3WNOA 3W81A 5DMYA 2WYSA 4DM1A 1E1EA 1TVPA 4Y7EA 2W67A 4JFSA 3RMEA 1PZ2A 1N82A 3AMCA 3UETA 2BV9A 2WZIA 2WMGA 4M82A 2CKSA 4AIEA 2QHAA 2WCGA 5E0FA 1UQZA 5AC5A 1W3LA 2G3IA 3WDHA 1J0YA 1J0JA 2X0YA 1RD6A 2D24A 3AS2A 1ODUA 3ARRA 1BFNA 4WLCA 1QHPA 3N04A 2E9BA 3WNLA 1JZ7A 2Z1KA 3GXDA 1MFUA 1RH9A 2DGAA 1E0VA 3GBDA 1QOXA 1EOKA 4W86A 2CPUA 3K1DA 3FN9A 1UWTA 1QI3A 4NRRA 3ZT7A 4J27A 4F9JA 2G41A 2YL8A 5CZKA 2JE8A 3QR3A 4KH2A 5DT5A 5CPQA 2CBJA 3VD4A 3WD1A 3NYDA 4UFKA 4E4PA 1TVNA 2WVVA 3CH9A 3ZSTA 1UWIA 3GXFA 2BNJA 3UG5A 5JBEA 3UR7A 2DQXA 4P7LA 2V5DA 1ZJAA 2BVTA 3NCOA 1FFQA 5DFAA 4UQEA 5LA0A 3WH8A 3BCDA 2VQUA 3UR8A 3FNDA 4HA3A 3T2OA 2GDVA 3MV11 1DWFM 4Z2IA 1JNDA 4AMCA 1XH1A 3N15A 4QLJA 1OBAA 5BXSA 2XG9A 3VINA 5I24A 3CIVA 3W6LA 2D1ZA 3BXWA 3N18A 1JDCA 1E9LA 5C70A 3W6MA 2PI6A 3W4RA 1Q6CA 5D9PA 2FGLA 4IPLA 4PUEA 3FAWA 4XUYA 4PTXA 1V0MA 4QLLA 4H8HA 1CDGA 2ZICA 5E6YA 1NH6A 2GJPA 1WB0A 3ZOAA 2G3NA 4QAWA 1CGYA 4TOQA 2JFEX 4W89A 3WD0A 3WH7A 3AS1A 1LWJA 3APGA 1E3ZA 3GYCA 3W25A 1B30A 2BVYA 4DUXA 4X0NA 2VURA 4PCTA 2OSWA 1KXVA 3WH6A 2CCRA 4ACZA 5CG0A 1JFHA 3A47A 4RE3A 3AMLA 3T2QA 3AMDA 2XM1A 4B9YA 1CZ1A 3MMUA 1PJ9A 2JALA 3S2CA 1KXHA 4CCEA 1K6AA 4CD6A 3K8KA 4J3SA 3BAYA 4N0RA 4AEEA 3VIIA 4CN1A 1GJUA 2XFYA 2V3DA 2OWXA 3MV01 2X2YA 1GOWA 4PMZA 3AMGA 3T08A 5TD4A 3VGDA 3KWXA 1K9EA 5I5RA 3FAXA 5A8QA 4D6CA 2VUYA 3VNZA 3DHUA 2XIBA 5DEZA 1B3XA 1JGIA 1ITCA 2ZX7A 1XSKA 1UWUA 1XH0A 3SCWA 5KZ6A 5KEZA 1GQKA 4IISA 4WK9A 4PUDA 3WBAA 1WO2A 4AYSA 2CERA 1KXQA 5I78A 2J7GA 5JBDA 3OG2A 7CGTA 4P7NA 4WSJA 3VIPA 2J7FA 3D3AA 4QFUA 1EIBA 2BVDA 3UG4A 1ISVA 4MJ2A 2W61A 1WDPA 1EQCA 1TA3B 2WSKA 4X0VA 2DH2A 3WNMA 4FLSA 3CPUA 3FHQA 3W27A 4QP0A 4BQ4A 1FH9A 1I75A 2PB1A 3IAPA 4UFIA 2D0FA 3ARTA 1C8YA 3PN8A 1M04A 4CGTA 1CLXA 1VJSA 2WHMA 2WKLA 1QNSA 4D6DA 4MNJA 4PRWA 4J3XA 4W88A 1V3KA 4EAMA 2VQTA 2O9PA 4UFMA 1HVQA 4GZIA 3MKKA 1KQYA 1TR1A 3CZ8A 4J28A 3F4VA 1ZU8A 3SCSA 2BY0A 2YBTA 3W38A 3VGBA 5CSUA 4BF7A 1BGAA 4JZ5A 1JDAA 4D72A 3K46A 2ZXBA 3UG3A 2C8NA 3TOPA 4MDPA 1E71M 2WC3A 1WCGA 3AYSA 5CQ1A 1JYWA 4OJYA 3WQ4A 1HF6A 2XIIA 3B9DA 1R7OA 3TONA 3LPOA 3OBAA 1C92A 3AZTA 2YL5A 4P7QA 1B3YA 2VI0A 3IK2A 4DUWA 5A69A 2XVKA 1VENA 2AMGA 5ABEA 4U5IA 1JG9A 1EGZA 5BWFA 1MQRA 4ZXOA 2VO5A 3VOCA 4JFUA 4Z2KA 3BAXA 1F4HA 1KXTA 2J78A 4J3UA 3MANA 1H4PA 1JNEA 4XX6A 3L4VA 4OIFA 4V28A 4Q7NA 4U3AA 5DT7A 1EHAA 3ZR6A 4ZXLA 3GXIA 3OB8A 1MXDA 2VX7A 2FHBA 4M80A 4FLQA 3WF1A 1E6XM 1GNXA 1JDDA 1KWGA 3UESA 1UWQA 2W92A 5HPCA 1J0ZA 4UQDA 1GOQA 1ZBVA 1L8NA 1HJUA 4DUVA 3WF4A 4MAVA 3MMDA 3L4YA 1MQQA 3VMOA 4S3KA 5C71A 1E73M 2CESA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2J7C A;  2F2H A;  1QW9 A;  1LF1 A;  2IUZ A;  3BLP X;  3TTQ A;  1E5N A;  2W63 A;  4U33 A;  2QPS A;  2VX4 A;  5FL0 A;  2VZS A;  2V38 A;  1QPK A;  4GKL A;  4GO9 A;  1UA3 A;  3T0B A;  3SUR A;  1H0G A;  2XVN A;  3EDJ A;  4CD5 A;  4HU8 A;  1M7X A;  1HJW A;  1US2 A;  3WBE A;  5F7U A;  1M03 A;  2D20 A;  4AZI A;  2XWE A;  1G0C A;  3M7S A;  2ZUU A;  3POH A;  2YLL A;  3CUI A;  3ZR5 A;  4MNK A;  4ATD A;  4J3V A;  4P7O A;  4Q22 A;  1J0K A;  4KGL A;  3MSD A;  2CEQ A;  5CSY A;  1O6I A;  1QI2 A;  3SCP A;  1JZ5 A;  3VIF A;  3IAN A;  3N1A A;  3ALG A;  3GH4 A;  2XPK A;  4GXP A;  5JIP A;  1ESW A;  4FLO A;  5M17 A;  3T2P A;  1LQ0 A;  1HKM A;  4AEF A;  1TE1 A;  5IXE A;  4NF7 A;  3VDA A;  1W9X A;  5D9N A;  4GZE A;  1LJY A;  1NWU A;  3WD3 A;  1VEP A;  4CU8 A;  1PEZ A;  1J12 A;  2UY4 A;  2BHZ A;  4U2Z A;  1OGS A;  1E6S M;  4ZFM A;  4HZ8 A;  2XSB A;  2G3M A;  1PX4 A;  2WAN A;  3WIJ A;  3AYR A;  2Y2W A;  4EE9 A;  1EDT A;  3MO4 A;  3WF0 A;  4MB3 A;  3MU7 A;  4JL2 A;  5A2A A;  3ARS A;  2EXO A;  3WEO A;  1LLO A;  2ZOX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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