3WMBA

Crystal structure of insect beta-n-acetyl-d-hexosaminidase ofhex1 complexed with naphthalimide derivative q1
Total Genus 190

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
572
structure length
572
Chain Sequence
EDVVWRWSCDNGKCVKLKNDPRSSEPALSLEACKMFCNEYGLLWPRPTGEADLGNFLSKINLNSIEVKILKKGATDDLMEAAAKRFKEQVSLAIPRGSTPKLTGKAVDVYLVNENPNEKAFSLEMDESYGLRVSPSGADRVNATITANSFFGMRHGLETLSQLFVFDDIRDHLLMVRDVNISDKPVYPYRGILLDTARNYYSIESIKRTIEAMAAVKLNTLHWHITDSQSFPFVTTKRPNLYKFGALSPQKVYTKAAIREVVRFGLERGVRVLPEFDAPAHVGEGWQDTDLTVCFKAEPWKSYCVEPPCGQLNPTKDELYQYLEDIYSDMAEVFDTTDIFHMGGDEVSEACWNSSDSIQNFMMQNRWDLDKESFLKLWNYFQQKAQDKAYKAFGKKLPLILWTSTLTNYKHIDDYLNKDDYIIQVWTTGVDPQIKGLLEKGYRLIMSNYDALYFDCGYGAWVGAGNNWCSPYIGWQKVYDNSPAVIALEHRDQVLGGEAALWSEQSDTSTLDGRLWPRAAALAERLWAEPATSWQDAEYRMLHIRERFVRMGIQAESLQPEWCYQNEGYCYS

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Ostrinia furnacalis
publication title A crystal structure-guided rational design switching non-carbohydrate inhibitors' specificity between two beta-GlcNAcase homologs
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-hexosaminidase
total genus 190
structure length 572
sequence length 572
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2013-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF14845 Glycohydro_20b2 beta-acetyl hexosaminidase like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wmbA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3wmbA01
1V3MA 3VM5A 3WMSA 2XJ7A 3WNLA 2GJRA 1ODZA 5E0FA 4Z2HA 3FAWA 2BVYA 2WCSA 1E9LA 2WMHA 5IXEA 2DDXA 4UOZA 4TTGA 4M24A 1GOIA 2XVGA 1JFHA 1QHZA 4P7RA 1JAKA 1ITCA 4JFUA 4EANA 1W9VA 4HMDA 2MANA 5HNNA 1CXEA 3B9AA 4WKAA 1QW8A 4CGTA 3ZT6A 2Z1SA 2WMGA 1RP9A 4CD7A 5BWFA 3LPFA 3W6LA 3EDDA 3DECA 3N9KA 1GQKA 1PX3A 2YA1A 4BS0A 4D6CA 5A6JA 3B9DA 4E8DA 4HP5A 2BXYA 3AMLA 1GHSA 1KQYA 2WLZA 3OZPA 2UY3A 4WKHA 4TVUA 4UNIA 1XSJA 1KGWA 5GQBA 1NP2A 1GOWA 1V3KA 1CGTA 3VIFA 3PZMA 4BA0A 1WPCA 2VO5A 1CGXA 2G3IA 2V38A 5AC5A 3AZTA 1AQMA 2JALA 8CGTA 2WSPA 3BAJA 3WENA 3CO4A 1GJWA 1E4MM 2Y24A 1HNYA 1E3ZA 1LL7A 4AEFA 3EDFA 3NDYA 1W9BM 1V0KA 4Z2LA 2W5FA 2VRKA 1E1FA 1J9YA 2ZX5A 3VMPA 4H7VA 2WZEA 4D6DA 2YL5A 3T2OA 4GZEA 3GZAA 4UCFA 4YPJA 3DYOA 3SCVA 4FF5A 1ISVA 3SCSA 1GQJA 4H2CA 2D1ZA 4B9YA 1GOQA 1XH1A 4H04A 1CYGA 2X1IA 3T0BA 1NWTA 1OIFA 4AY1A 2E9LA 4WF7A 3GDBA 4P8VA 1VB9A 3K8MA 5HOSA 3WH7A 2D3LA 3SIMA 3MSGA 1WO2A 2JF6A 2WC7A 2XVKA 1XD0A 4J3VA 2YIHA 2O92A 3APGA 3WEMA 4HZ6A 1TA3A 3CZLA 3OB8A 2YBTA 2PWGA 2XYLA 3I3BA 1MXGA 5KZ6A 3AS0A 4TVDA 3T09A 2JEQA 3VIHA 1J18A 1CBGA 3SURA 4WJXA 4MADA 5FL1A 2ZX8A 4J3UA 3WH9A 1C92A 4PYSA 2ZE0A 4F9JA 1HN1A 1R86A 1I1WA 1W91A 1D7FA 2V5CA 2OSWA 4X0VA 2ZWZA 4UFKA 3W53A 3VX1A 1V3HA 4QCEA 1PZ2A 1GVIA 4YN5A 1M7XA 2PBOA 4M1RA 2BY2A 5D9PA 1V02E 2DQXA 3RJYA 1WDQA 2D22A 1GOKA 2ZIDA 3M7SA 5CLWA 1GCYA 3M46A 4W85A 1HVQA 3U57A 4Z2GA 3I3DA 2X2YA 5HPOA 1E6RA 4TX6A 3WEOA 3RMEA 1XSKA 4NRRA 3TONA 1CLXA 1VAHA 1QBAA 2DSZA 1J0HA 1BYBA 4C91A 1X1NA 4M56A 3WMBA 3G6LA 1EIBA 4M82A 4W86A 2BS9A 4S3KA 1JDCA 1FA2A 1W9PA 1DHKA 1US2A 1WZMA 1EHNA 2YL8A 3WNOA 4UFLA 5E6YA 2WZIA 3WDRA 5AYBA 1LL4A 4GPNA 3BXWA 1E1EA 3ARYA 1CNVA 4J3WA 3N04A 4HMCA 4U2ZA 1OGGA 3CMGA 2WNWA 3MS8A 1B3ZA 1S46A 3W25A 3EBVA 1BVNP 4JKKA 5A6AA 1UH4A 2RGLA 3SCTA 5CG0A 2GUYA 1J0JA 1KBBA 3NSMA 3QGVA 3VGBA 2EPMX 2NT0A 3K8LA 3DHUA 4RE3A 4AIUA 1JXJA 2EBNA 3VU2A 3U5YA 3WDPP 4NF7A 3ARPA 4J7RA 2A3AA 5I77A 3AMGA 1GQIA 1KQZA 2VCCA 4MJ4A 3U5UA 1E6ZA 3U7VA 2IXVA 1MXDA 2WMIB 4MNLA 1LLOA 2DEPA 4LYQA 4PMYA 5C70A 3ARSA 4TOQA 3VIJA 4H8UA 1WZLA 5HXMA 5M5DA 4LQ1A 3SUWA 4OUEA 2XWEA 5I5RA 4UQBA 3GTNA 4PEEA 2J25A 3IAQA 1KBKA 1ISXA 2WHKA 3ALGA 3FHQA 5LA0A 2C7FA 4IUGA 1TCMA 2OYMA 2ZX6A 1NWSA 4J28A 2WWDA 5EBAA 3TA9A 3VPLA 2G3JA 1DWIM 3CTTA 4WK9A 3UESA 1PZ3A 3EYPA 1F4HA 1JZ2A 4WLCA 4Q7NA 1HKKA 1ISZA 3O6AA 5A6MA 1R8LA 4QAWA 1CXHA 4HOWA 3T2QA 4HPGA 3ARQA 1RH9A 2WHJA 1WKYA 3VIOA 4AD4A 3SCPA 4UZUA 1R87A 5BYWA 4BQ4A 1DWAM 3AZRA 1ITXA 4PRWA 5A6LA 3CIVA 3VIGA 1OBAA 3A3HA 1R85A 2CXGA 2J47A 3TP4A 3CZJA 2ZUMA 1E0WA 3WSUA 1NP0A 3AJ7A 2X8RA 3BLKA 1GW1A 2ZUWA 1UR9A 1UWTA 2BXZA 1M03A 1Z32X 1RPKA 3ARRA 4F8XA 1PBGA 2YL6A 2XVPA 3ZIZA 1CDGA 3ARTA 1WB0A 3N1AA 3PZNA 1C8XA 2HISA 4OIFA 1OT2A 2PWDA 3W27A 2VR5A 1DEDA 4OBSA 2WHLA 4BQ2A 1MFVA 3SUVA 2V5DA 1JYVA 1W9XA 1V3LA 1OSEA 1JDDA 5GNZA 5A94A 4MTVA 3SCWA 2OWXA 7TAAA 3VD5A 1UKQA 3OLEA 5GNYA 3S2CA 4CN6A 4AD5A 3L4UA 3NSXA 3DYMA 4ZE4A 1IZJA 3WH6A 1ISYA 3N15A 2ZUVA 1BFNA 5ABFB 7CGTA 1OCQA 3L4WA 1LWJA 2CYGA 5E0CA 4BCEA 1N82A 2XFFA 1HP5A 3AOFA 2JIWA 2BHYA 1M53A 1QNQA 2WCAA 1B3VA 1QI4A 1RD6A 3RPMA 1E0XA 1SMDA 5FCZA 4ATLA 1V6VA 4RL3A 5CQ1A 1UKPA 2XGIA 3WQ5A 3A4AA 4HU0A 4B3LA 2V3GA 2WMFA 2WBGA 3HJEA 3WFZA 1Y7VA 2UY4A 3ZJ7A 2PC8A 2G4FA 3AXIA 4KGLA 4MNJA 1W3JA 4LYRA 1JNDA 1VFUA 3GM8A 3VGFA 2WMIA 5IHRA 3GBDA 2PWFA 2YOCA 4W87A 1NM9A 1ZS2A 3BH4A 2YLLA 2BVTA 3VIIA 4NZCA 3AXHA 3F5KA 4K68A 4AZCB 1RP8A 4V27A 3CHDA 3KZSA 3W81A 3OBAA 2J7EA 1BHGA 6CGTA 4JFWA 3ZT7A 4AW7A 3QR3A 5LA2A 3THCA 2CBJA 1OWQA 5I24A 2TAAA 2E3ZA 4D6HA 1JZ7A 1H2JA 5D9NA 1EOKA 3AQUA 1QVBA 3RM9A 3N12A 2ESCA 5CLTA 1WNOA 2CKSA 2V3FA 2W62A 3GH5A 3AYSA 4AD3A 2PI6A 1HF6A 3VGEA 1BTCA 3RCNA 3KWXA 4XV0A 4JFSA 1UD2A 5A69A 3BCFA 5ABHA 1MQPA 2CIPA 2VOTA 5FIPA 1U30A 2XG9A 3TTSA 4JHZA 4J27A 2ZX9A 1NWUA 2E8ZA 5F7UA 4CD6A 3A6OA 4H41A 2VNCA 1MW0A 4OZOA 3WF1A 2CITA 3CH9A 3WNMA 4PMZA 3WUGA 1XYZA 1PPIA 1ZJAA 4N0RA 3MMWA 2BVDA 4U33A 4ZE5A 3W4RA 4AZIA 1XYFA 1UD6A 3QHNA 4Y7EA 1BF2A 1HL8A 1ZJBA 3T2PA 4OBRA 1KGUA 1HT6A 5GPRA 4UQCA 4JHOA 4HMEA 4M29A 4B3KA 1KXHA 3BAXA 3OLDA 5BXSA 3OGRA 5I3DA 1VEPA 3BAKA 2XSAA 1X6NA 3RM8A 2PBGA 2XPKA 1UWQA 2OYLA 3POCA 4JIEA 4Q22A 3GXIA 3ARXA 3CZGA 2J7CA 3VO0A 1V3JA 1UA7A 5DEZA 2YA0A 1Q6DA 2FGLA 4PMUA 1VIWA 5CPSA 2W61A 5E70A 3MUZ1 3EDJA 1M01A 3VIKA 4DWSB 5E09A 4CN4A 1B30A 1OGSA 4H8HA 2VX7A 1E71M 4NSBA 1VJZA 5FKYA 3WH8A 1E6NA 4XZBA 3QHMA 4AZ5A 5JBDA 2VVSA 3ZR5A 5EFDA 3WDJA 4GI6A 1J0YA 5A2AA 6TAAA 3VKKA 3VTRA 3UETA 1CGUA 4HA4A 1SMAA 2WC3A 1JZ8A 1KFWA 1JG9A 3FHAA 2J78A 4B15A 1UQYA 3BCDA 4UFIA 3SUTA 4MDPA 4FLRA 1BG9A 1UZ4A 4UQDA 2QHAA 3UCQA 3W82A 4BZYA 3AICA 4IPNB 1G0CA 1H41A 4HZ7A 5A8QA 1VFOA 2BFGA 3ZMRA 4JKMA 1I1XA 4MAVA 2VURA 1V6WA 1UR2A 3AROA 3RDKA 3PZGA 1QPKA 3PZIA 1QW9A 4AZCA 1MQQA 1LF1A 4MB3A 1GNXA 1EO7A 1W2PA 3MO4A 3AHVA 2OSYA 3WNPA 4UOJA 2CBIA 3AS1A 5DFAA 4W7WA 3AS3A 2DSKA 5CXPA 1QHOA 4R27A 1JIBA 2D0GA 2J8FA 1HKMA 1L0PA 3QOMA 1UR1A 4JFTA 1VEMA 2A3EA 2FHBA 2Y8KA 1GPFA 1C93A 3SCRA 1HX0A 3WDHA 2DSUA 2WAGA 4PMDA 2CCRA 2GDVA 1WZAA 1JD7A 4X9YA 4D1JA 4PMRA 1DTUA 1K6AA 5JIPA 3A4WA 4DUXA 1E6PA 1YHTA 3AIQA 5FD0A 2EO7A 3BSHA 4D72A 3PN8A 2OWCA 2VZTA 1FHLA 2VCBA 3NYDA 4R5EA 1E15A 4C7GA 1EDTA 2CESA 5BXTA 3QHOA 1PIFA 1K9DA 1TVPA 2Y5EA 4D6IA 1H0GA 3WQWA 4EK7A 5IHSA 2W4XA 4DWSD 2WWCA 1HJVA 3PBGA 3MUAA 2DIJA 1E6QM 5D8ZA 3NUKA 5I79A 2ZXAA 1XD1A 1BYCA 2OWWA 3W29A 1MQRA 1MWOA 1UHVA 4QFUA 4UFJA 3CHCA 4HOZA 1JNEA 3MMDA 4AEEA 1W1PA 4URIA 2FDMA 3VGHA 4AD1A 2J7FA 3DHPA 2O9RA 5A8MA 1E73M 2AAAA 4GQRA 4TTUA 2A3BA 3CZEA 4D6GA 2E8YA 4QDMA 5BCAA 3CZKA 3CPUA 4FLSA 4IM4A 2XM2A 2XIIA 2XM1A 1JYNA 1SYTA 2W92A 1TG7A 2VZUA 2ZXBA 4DUVA 4HA1A 4WSKA 4DWSA 4KRTA 1CXIA 4GQQA 4P7OA 4CKQA 5E9AA 3WD3A 2JF7A 1GZJA 2VZOA 2CETA 1W9DM 4W84A 1JF6A 2EPNA 2YDSA 3WD0A 4B9ZA 3EDEA 4UR9A 3WH5A 4ZENA 1E3XA 4AISA 3GH7A 1W3LA 2GJPA 2VZVA 3AMKA 4CCDA 3FN9A 3UR8A 5C8BB 1BLIA 3HMCA 1MVYA 3DYPA 5E6ZA 3BAIA 2DGAA 1J10A 1G94A 3G6MA 3GNPA 3WF2A 3TTOA 2EPKX 4MNMA 1QOXA 3GBEA 1E40A 4JCMA 5D9OA 1LG1A 3WIJA 1DP0A 4QLJA 3WL0A 2CNCA 4KWUA 1BYAA 1JYXA 1UR0A 5IDIA 5BXRA 1XCXA 4W88A 2E4TA 2ZXDA 2FHCA 4XX6A 1VEOA 4JAWA 1C91A 4CD5A 5A8NA 5A6SA 1FH8A 3BSGA 1CIUA 3AHXA 3ARVA 2Z1KA 1V6YA 1ZBWA 2WVTA 1UKTA 2J7GA 3HU7A 4MPKA 1H4PA 3MU7A 2ZUNA 4MAZA 2YJQA 1CXKA 1BYDA 3CUGA 3KL5A 1JDAA 1HJQA 2PF0A 4Z2JA 2YDQA 1TMQA 2CHNA 4W8AA 1W3KA 2XTKA 3KE0A 2FHFA 1JZ6A 1E70M 4HA3A 2QMJA 2ZXQA 1JL8A 3KL0A 5JBEA 2PB1A 1NARA 5ABEA 5EB8A 1VENA 1NOUA 3VDCA 1HVXA 5A1AA 3A4XA 1JAEA 1JZ5A 2DT0A 4AZ6A 1VFMA 1ECEA 1E5JA 2J7BA 5I23A 4W7VA 4U5IA 2WM0A 5DO8A 1Q6GA 3CHFA 1E4NA 3VIMA 1EQCA 3IANA 4CUCA 5CPQA 3J7HA 1HJSA 1W9UA 3AIEA 1V0LA 2XSBA 1XV8A 4QLLA 4P8XA 5A3HA 4AZ7A 1H3GA 1CEOA 2F8QA 3AHTA 3F5LA 4JCLA 3ZOAA 2VVNA 1IT0A 1HJXA 1H11A 1Q4NX 2GJXB 2YLAA 4P8WA 3ZM8A 1MW3A 4AC1X 3FNDA 2VMFA 1J12A 1E4IA 3WD2A 1QI5A 2VRJA 1H1NA 8A3HA 1XHGA 1O6IA 3AIVA 1V6UA 3ARZA 1JD9A 3VGGA 4GI9A 1XGZA 1W3HA 1IV8A 1LJYA 5ECUA 3CGTA 3LPGA 4PSRA 2WLYA 4U3CA 3ARWA 4UOQA 1K9TA 1UWIA 5LA1A 3IJ9A 1BQCA 2CHOA 3GNOA 3QOKA 2ZICA 4CD4A 5I2UA 3K4DA 5EMYA 1HL9A 2BNJA 3VMOA 4A3HA 1UD4A 3UG5A 4XUYA 1MW2A 1V0MA 2C8NA 4ZXOA 2A3CA 1TR1A 3VX0A 4CU6A 3W24A 2VT0A 2XUCA 1UH2A 4PUEA 1OM0A 3IAPA 5HPCA 2D3NA 2EPLX 1FOBA 3CUHA 3W6MA 2F61A 1BPLB 5IFTA 1J0ZA 1BVZA 4F79A 2WW5A 1SFSA 3FAXA 1UWSA 2E40A 4CVWA 1G5AA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1V3M A;  3VM5 A;  3WMS A;  2XJ7 A;  3WNL A;  2GJR A;  1ODZ A;  5E0F A;  4Z2H A;  3FAW A;  2BVY A;  2WCS A;  1E9L A;  2WMH A;  5IXE A;  2DDX A;  4UOZ A;  4TTG A;  4M24 A;  1GOI A;  2XVG A;  1JFH A;  1QHZ A;  4P7R A;  1JAK A;  1ITC A;  4JFU A;  4EAN A;  1W9V A;  4HMD A;  2MAN A;  5HNN A;  1CXE A;  3B9A A;  4WKA A;  1QW8 A;  4CGT A;  3ZT6 A;  2Z1S A;  2WMG A;  1RP9 A;  4CD7 A;  5BWF A;  3LPF A;  3W6L A;  3EDD A;  3DEC A;  3N9K A;  1GQK A;  1PX3 A;  2YA1 A;  4BS0 A;  4D6C A;  5A6J A;  3B9D A;  4E8D A;  4HP5 A;  2BXY A;  3AML A;  1GHS A;  1KQY A;  2WLZ A;  3OZP A;  2UY3 A;  4WKH A;  4TVU A;  4UNI A;  1XSJ A;  1KGW A;  5GQB A;  1NP2 A;  1GOW A;  1V3K A;  1CGT A;  3VIF A;  3PZM A;  4BA0 A;  1WPC A;  2VO5 A;  1CGX A;  2G3I A;  2V38 A;  5AC5 A;  3AZT A;  1AQM A;  2JAL A;  8CGT A;  2WSP A;  3BAJ A;  3WEN A;  3CO4 A;  1GJW A;  1E4M M;  2Y24 A;  1HNY A;  1E3Z A;  1LL7 A;  4AEF A;  3EDF A;  3NDY A;  1W9B M;  1V0K A;  4Z2L A;  2W5F A;  2VRK A;  1E1F A;  1J9Y A;  2ZX5 A;  3VMP A;  4H7V A;  2WZE A;  4D6D A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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