3WMCA

Crystal structure of insect beta-n-acetyl-d-hexosaminidase ofhex1 complexed with naphthalimide derivative q2
Total Genus 198

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
198
sequence length
572
structure length
572
Chain Sequence
EDVVWRWSCDNGKCVKLKNDPRSSEPALSLEACKMFCNEYGLLWPRPTGEADLGNFLSKINLNSIEVKILKKGATDDLMEAAAKRFKEQVSLAIPRGSTPKLTGKAVDVYLVNENPNEKAFSLEMDESYGLRVSPSGADRVNATITANSFFGMRHGLETLSQLFVFDDIRDHLLMVRDVNISDKPVYPYRGILLDTARNYYSIESIKRTIEAMAAVKLNTLHWHITDSQSFPFVTTKRPNLYKFGALSPQKVYTKAAIREVVRFGLERGVRVLPEFDAPAHVGEGWQDTDLTVCFKAEPWKSYCVEPPCGQLNPTKDELYQYLEDIYSDMAEVFDTTDIFHMGGDEVSEACWNSSDSIQNFMMQNRWDLDKESFLKLWNYFQQKAQDKAYKAFGKKLPLILWTSTLTNYKHIDDYLNKDDYIIQVWTTGVDPQIKGLLEKGYRLIMSNYDALYFDCGYGAWVGAGNNWCSPYIGWQKVYDNSPAVIALEHRDQVLGGEAALWSEQSDTSTLDGRLWPRAAALAERLWAEPATSWQDAEYRMLHIRERFVRMGIQAESLQPEWCYQNEGYCYS

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Ostrinia furnacalis
publication title A crystal structure-guided rational design switching non-carbohydrate inhibitors' specificity between two beta-GlcNAcase homologs
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-hexosaminidase
total genus 198
structure length 572
sequence length 572
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2013-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF14845 Glycohydro_20b2 beta-acetyl hexosaminidase like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wmcA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3wmcA01
4C90A 2WWDA 4W84A 3VIHA 1W3LA 2J7GA 1CGYA 2ZE0A 2ZUUA 5JIWA 1K9FA 1M03A 1NQ6A 4KRUA 4J3VA 3NSNA 4UNIA 4HOXA 3L4UA 3W38A 2GSJA 1UYQA 3KEHA 2GVYA 3CUIA 2QLYA 1DWAM 2D23A 2D20A 5KZ6A 4UQ9A 1JZ5A 5I0DA 3CUGA 5BYWA 1ZJAA 1HL8A 1H49A 3GM8A 1PAMA 4UOJA 3UETA 5CZKA 2ZX9A 1US3A 3ALFA 3ZIZA 1UZ4A 1V6UA 3ZSSA 3UG5A 3OGVA 3GXFA 4B9ZA 1V3KA 2PBGA 3UEQA 3WMCA 5CLTA 1QI4A 2DT2A 1W1YA 3BH4A 1W9BM 1DP0A 3VD5A 5HNNA 5CGTA 1ITCA 3GH5A 3UG4A 4Z2LA 1C8QA 4B16A 5JBDA 3ZJ8A 3VDHA 5I79A 2GDVA 1WDSA 1DEDA 3PZIA 2YOCA 1ZS2A 1RPKA 4J3WA 3MUIA 4XB3A 3VILA 4RL3A 1E5NA 2XHYA 3ZMRA 4WLCA 1UD3A 1QNOA 3W29A 1P6WA 4YPJA 1VF8A 1CGWA 4MJ4A 5I3DA 1A47A 3OLEA 2GJRA 1GONA 5A8PA 1HKMA 1OGSA 1QNPA 7A3HA 3EDKA 5CG0A 5A2CA 5AC4A 4WJXA 1WZKA 5A94A 4UFLA 4AEEA 4UFKA 3AIQA 3B8SA 1Q6FA 2PC8A 3W4RA 3RO8A 4HTYA 1DTUA 2QPUA 2J25A 3VDBA 1GHRA 2W4XA 1UWSA 3J7HA 1FH7A 1KXVA 3N18A 1H0GA 3ZSTA 1J0YA 3N17A 4AMCA 3M46A 1JAEA 2WMFA 3A4XA 4Z2JA 3WNMA 1AQ0A 2IXVA 1HVQA 1TUXA 1C93A 3VTRA 1K9EA 4PMRA 1WNOA 1SMDA 2NT1A 2PF0A 4Z2HA 4FLOA 5AYBA 1CPUA 3WQ8A 3RMEA 2ZOXA 1GJUA 3WH5A 1X1NA 3WBEA 3WNPA 2EXOA 4AISA 1VENA 1VAHA 2WHKA 2ZUTA 1JI1A 1CBGA 3M6DA 1J0HA 1SYTA 5AY7A 1W9UA 4RE4A 2XJ7A 3A3HA 1XSKA 2MANA 1UR1A 5M5DA 2WK2A 4KMQA 2WVVB 3NIYA 5I23A 4NSBA 4E2OA 1CGTA 1V08A 1ESWA 2EPNA 3EMCA 4IUGA 3PZUA 1JXKA 3G6LA 1LJYA 2G3NA 3N15A 1G01A 3AIBA 2WCAA 2D0HA 3VGBA 1O7AA 2QHAA 2CNCA 1WDRA 2ZUMA 3AHVA 1WZLA 2WMKA 1MWOA 2W92A 3B9DA 2DH3A 2WYSA 2WMIA 1QBAA 3WF0A 4Z2KA 3ARPA 3ZT6A 1UR0A 4HMEA 4D71A 1MFUA 4GO8A 3K4AA 5HPOA 4W8AA 2W67A 1BVZA 5BRPA 2ZXQA 4W87A 2FDMA 1JZ3A 2O9PA 2BV9A 2E4TA 2WANA 1OIFA 1BGAA 2XIIA 3SCPA 3DYOA 2CKRA 3VGEA 2YDRA 1BG4A 3LPOA 3CIVA 2WBKA 3CUHA 3VIOA 1OBAA 1GPFA 4W93A 1DWFM 1HF6A 3WDPP 1CIUA 5GQBA 2XVPA 2XWEA 2WW5A 2QMKA 3GTNA 4MPKA 2VRKA 1V6YA 1M04A 2VJXA 4EAMA 1QNQA 4QDMA 3S2CA 3TONA 2A3CA 2BVDA 3A4WA 2YBUA 3PHAA 1W1VA 1G5AA 4MAVA 3ARYA 3GZAA 5CLWA 4MNMA 4MADA 4NRSA 4FK9A 3T0AA 2FH6A 4AZ5A 1E55A 1ODZA 3DHUA 1OGBA 4UTFA 3BXWA 2XIBA 4GZIA 2WMGA 3RCNA 2G8ZA 2D2OA 3CTTA 4WKAA 2WLYA 4AD5A 1GOQA 4DUVA 1OT2A 4P7OA 4OUEA 4ATLA 1MW3A 4AWEA 2J47A 4UFHA 1LQ0A 4ACZB 1QVBA 2OWCA 2VZOA 3MSDA 4MTVA 3MMDA 4M24A 3RM9A 1HJVA 4GZJA 4CU8A 3PZOA 2AOSA 3ZJ7A 3CHDA 5BWFA 2ZUWA 3HN3A 1KGWA 2XG9A 4WSKA 1E0WA 1UH3A 2CKSA 2GDUA 3F4VA 3GH4A 1WP6A 2BHUA 1UKSA 3VGDA 4BA0A 4DM2A 4ATDA 3PBGA 3MMUA 2PWFA 2BFGA 3CMGA 3ARUA 3BC9A 4M80A 1CNVA 4WK9A 3VO0A 4PTVA 4QLJA 3VD4A 3EDDA 3GYCA 1UR4A 1E9LA 1H0IA 5EB8A 4P8UA 3WD4A 1IZJA 3IAQA 3OIHA 2GK1B 2J7CA 2HVMA 2GFTA 4GINA 4W7WA 3MS8A 2E9BA 2WKGA 3W24A 3ARQA 1OSEA 1UKPA 4KH2A 5FIPA 1UQYA 1OWQA 3RDKA 1XH2A 1CDGA 1UKTA 4EKJA 3MSGA 1GVIA 1XC6A 1HX0A 3TTSA 1QI2A 4D6IA 1JIBA 5ECUA 1GOKA 1GW1A 1GOWA 5CPQA 3SCVA 2WLZA 4JFVA 4FLQA 3ARXA 4CN4A 1UWQA 2Z1KA 1H4PA 1SMAA 1VFFA 1R85A 1JXJA 5A8OA 4CKQA 5GNZA 4Y7EA 1R7OA 4W5UA 4E4PA 4HU0A 3RM8A 4LX4A 1LWHA 5M03A 5M3WA 3PZQA 4AC1X 2W5FA 3VKKA 4TTGA 1JD7A 3MUAA 3WUFA 3L4XA 2J7EA 2W62A 3VIFA 3SUSA 1XYZA 4D6JA 2J79A 3CHCA 5BROA 3WBAA 1KFWA 3GDBA 4UR9A 1UA3A 3WMBA 2WVTA 2DQXA 4LPCA 4GKLA 1HJQA 1AQMA 3QR3A 1V3JA 4EK7A 3ZJKA 3K8KA 4QLKA 3I3EA 2J75A 4JZ5A 3D5HA 3BMWA 4GQQA 3LPPA 3POHA 3AS3A 5IDIA 2BS9A 4OZOA 6CGTA 1CXFA 4CUCA 3BAYA 3HU7A 2OWWA 2FGZA 5CJ5A 3MU7A 1H41A 1HP5A 1WZAA 4JKLA 4UZUA 5DT7A 5AYIA 2FHCA 1VBUA 5DT5A 3RPMA 5EFDA 2YBTA 1KCLA 4GXPA 1W9XA 4Z2GA 2Y24A 1JF5A 1HN1A 2J7BA 2BNJA 3PZNA 3AYRA 5CQ1A 2CHNA 1K6AA 1JDDA 2PWEA 2DGAA 3WN6A 1SR0A 3IJ7A 4FLSA 4W7VA 4MB4A 4B15A 3AMLA 3FAWA 2E40A 4AIUA 3N11A 4AD3A 1JZ8A 1XCWA 5A8NA 4W86A 3B9AA 4IPNB 5LA2A 2CERA 2CBIA 1MQRA 3SIMA 1QI3A 2WHLA 1UH2A 2XVGA 3N13A 1VFMA 1EGZA 2YL9A 1UD5A 1HJXA 4CVWA 1HJWA 2V3GA 3FNDA 4XZBA 3ZT7A 5HBFA 4JFSA 4D72A 4W5ZA 2NSXA 3RILA 5DFAA 2EJ1A 3RM4A 3ARSA 3UG3A 3MO4A 2VC9A 4AZBA 4GQRA 3W25A 1H09A 1NARA 2Y8KA 1HKIA 4A4AA 4AZCB 4PMUA 4DWSA 2FHFA 4H04A 3L4VA 2ZX8A 1US2A 2AAAA 4ACYA 4P8VA 2WMHA 3AQUA 3MANA 1VB9A 4P7NA 2Y4SA 2XUCA 3U5YA 1TMQA 5A6JA 4PMOA 3THCA 1BSIA 5A6LA 1TZ7A 4P7LA 4JKKA 1QI5A 2VVSA 9CGTA 1GUVA 4MB5A 2DIEA 2YA2A 4U33A 2ZXAA 3BLKA 4UQDA 4WKFA 1B3XA 2C8NA 3GH7A 2DT1A 2VZSA 5HXMA 4KRTA 1NP0A 2VX6A 4PMYA 2D24A 2XSAA 8A3HA 2WVSA 4CVUA 1V6WA 3K4DA 2A3EA 1VRXA 1FHLA 4TX6A 1EOMA 5F7UA 5AC5A 2E3ZA 4MDOA 3UERA 1B9ZA 1OIMA 2OSWA 4UQEA 3AS0A 3G6MA 3U57A 3F5JA 1R7AA 2JF7A 4FF5A 1H11A 1WAWA 3ALGA 3DYMA 4JHOA 5ABGA 3GNOA 1Y7VA 3CGTA 1EO7A 4D1JA 1E0XA 3AHYA 5HDRA 5E9AA 1EA9C 3IJ9A 1EHNA 1UR8A 2J62A 1H3GA 5LA0A 5FOOA 1TR1A 4DM1A 1QNSA 3VIMA 1I1WA 1NOFA 4BQ2A 4AZHA 1CEOA 3L4TA 4AYSA 4QLLA 1FHDA 5D9OA 4CN6A 3SUVA 1E6NA 1HJUA 4UQBA 3WUGA 4UFMA 1WO2A 1E3XA 1VEPA 1JAKA 3CHFA 3AXHA 1VFUA 1OD8A 4LYRA 3A47A 4JFWA 4H41A 2ZXDA 2YA1A 2CYGA 2DT0A 1EQPA 3VIIA 3OLIA 4CD7A 3M7SA 1E43A 2BHYA 1PX8A 4AZIA 2WZHA 1WB0A 3AHXA 1VJZA 3WELA 1JL8A 4HA3A 3FHQA 1GOOA 1ZBCA 1AMYA 2A3HA 5A95A 3AS2A 5A1AA 3W28A 3OG2A 1H2JA 3W37A 4NF7A 3UR8A 3WH6A 1EO5A 3FHAA 4R27A 3WEZA 1V03A 1M53A 4EE9A 4E8CA 2GJPA 1MYRA 2PBOA 5I24A 2EBNA 1HJSA 5CSYA 4PBGA 2NW0A 1CECA 2YIHA 3EDFA 4JCMA 4MDPA 3ZT5A 3WSUA 2D0GA 3VNYA 1C7SA 5E0CA 5E09A 4NRRA 3AXXA 1JZ4A 4LQ1A 2DSUA 2VUYA 3QGVA 3WNLA 2VZVA 3OZOA 3SUUA 3PZMA 4DWSC 3AIRA 2FH8A 1CXKA 1W3KA 2D3NA 5BXRA 3MV01 3N1AA 3WQ4A 4AY1A 4C91A 3ECQA 5A69A 4MNKA 4CCDA 2IXUA 2WZEA 2WCGA 2DSKA 3K46A 3SCOA 1JYNA 4D6FA 4QAWA 1X6NA 1EDGA 1L0PA 4PTWA 4QFUA 2W66A 1G0CA 5ABFB 4V28A 1Q6EA 2WC4A 4AZGA 1PZ3A 1ZJBA 1CLVA 1UZ1A 4JFUA 1V02A 5GNYA 2WSKA 1Q6GA 4AZ7A 3QOMA 4RE2A 1CGXA 1MW0A 1CXIA 4CD5A 2UY4A 2J7FA 3VM7A 1KGXA 3BAXA 4MB1A 1L8NA 1HP4A 4MNJA 3WL1A 3NYDA 4URIA 2O92A 1FOBA 2EPKX 2FHBA 3PZGA 4QCFA 4U5IA 4M56A 2VR4A 2XPKA 2QV4A 3LMYA 1JYWA 3MMWA 4CU6A 3VGFA 3OGRA 1RP9A 2Y5EA 5IHSA 2VO5A 1TA3B 3BAKA 3VINA 4JIEA 2DPEA 2WC3A 8CGTA 1VFOA 1YQ2A 4LGXA 1UD4A 4PSRA 4M82A 1GZJA 4GI8A 2V3EA 4F66A 4QCEA 3WFZA 3K8LA 3BCDA 1MVYA 1B0IA 1NOUA 1S46A 1W1PA 4JL1A 5CPTA 1PIFA 2X09A 4U2ZA 2WMJA 3ARWA 3AYSA 4MAZA 2V3FA 3AMCA 3T2PA 4PEEA 1B31A 4V2XA 1JDAA 2YDSA 3EDEA 4OJYA 4XZWA 4IM4A 3W53A 2OSXA 2J4GA 6A3HA 1D7FA 1B2YA 3VD7A 1G9HA 1QW8A 3CH9A 3N9KA 3F5LA 1UHVA 3TA9A 1IV8A 4PUEA 3SCNA 3ZQ9A 3FAXA 3GNRA 3S6TA 2EO7A 3BSHA 1V3LA 1GORA 2VNCA 3T08A 1E6RA 3WF1A 1W3JA 4PMVA 5FD0A 3WENA 4U2YA 2WVVA 1J9YA 4R5EA 1HKKA 4PCSA 2VL4A 2WVUA 1MQQA 2VQUA 3SURA 5ABHA 2V5DA 3DHPA 1XSIA 3A4AA 1QHOA 1V02E 3BCFA 3GXIA 3T09A 1ODUA 1DWHM 2XFRA 4B3LA 1KBKA 3TP4A 4ZE5A 3IAPA 2CBJA 3UR7A 1TCMA 3WUEA 1TG7A 1PPIA 3K1DA 1BYCA 1E72M 4TOQA 3L4ZA 1UD8A 4H2CA 1F4AA 1JNEA 1V3IA 4U31A 5GPRA 2W91A 2QF8A 4FMVA 3TOPA 2JALA 1GVYA 1GCYA 4BF7A 4S3JA 3OGSA 2E9LA 1E4IA 3BAWA 4YHEA 4HOWA 3PTMA 3MV11 4AW7A 1V0LA 4CCEA 5JUVA 4TUFA 4DUXA 2DSVA 3GXMA 5A6SA 1UA7A 2C0HA 3N12A 3WY1A 4J3UA 1E70M 4GO9A 3W26A 4M1RA 4J3XA 1V6XA 4EANA 2YL6A 3FN9A 2G41A 3QHNA 5IXEA 3FXYA 3VIPA 4ZEPA 1E15A 2J7DA 4NI3A 4P8WA 2E8ZA 1JZ6A 1W2PA 1R87A 3QOKA 1H1NA 1JZ7A 3W81A 4L4OA 4CD6A 1NH6A 1UH4A 2XWDA 3OLDA 3VIGA 3SEPA 1JFHA 1NWTA 3EMZA 4JFTA 4Q22A 3NDZA 4UQAA 1XH1A 4F79A 1BG9A 1E3ZA 1ZL1A 4DWSD 1WDQA 2BY2A 2VX5A 1E5JA 4X0VA 5A2AA 3ZO9A 2EPOA 4PMXA 2X05A 2OYMA 3CZJA 1UKQA 2ZIDA 3DYPA 3LPGA 3CZKA 5HOSA 2C7FA 3ARRA 3THDA 3WDRA 1FP8A 2PWGA 3VDAA 1J0ZA 3DC0A 4TXEA 5FKYA 4W8BA 3F5KA 3VMNA 2D3LA 2XYLA 3KZSA 2X0YA 5I77A 4TVDA 4BQ5A 4M8UA 2VRJA 4H8VA 1UWUA 1XGZA 1CENA 3VD9A 3SUWA 1ZBWA 1B90A 4JHZA 1ZU8A 4C7GA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4C90 A;  2WWD A;  4W84 A;  3VIH A;  1W3L A;  2J7G A;  1CGY A;  2ZE0 A;  2ZUU A;  5JIW A;  1K9F A;  1M03 A;  1NQ6 A;  4KRU A;  4J3V A;  3NSN A;  4UNI A;  4HOX A;  3L4U A;  3W38 A;  2GSJ A;  1UYQ A;  3KEH A;  2GVY A;  3CUI A;  2QLY A;  1DWA M;  2D23 A;  2D20 A;  5KZ6 A;  4UQ9 A;  1JZ5 A;  5I0D A;  3CUG A;  5BYW A;  1ZJA A;  1HL8 A;  1H49 A;  3GM8 A;  1PAM A;  4UOJ A;  3UET A;  5CZK A;  2ZX9 A;  1US3 A;  3ALF A;  3ZIZ A;  1UZ4 A;  1V6U A;  3ZSS A;  3UG5 A;  3OGV A;  3GXF A;  4B9Z A;  1V3K A;  2PBG A;  3UEQ A;  3WMC A;  5CLT A;  1QI4 A;  2DT2 A;  1W1Y A;  3BH4 A;  1W9B M;  1DP0 A;  3VD5 A;  5HNN A;  5CGT A;  1ITC A;  3GH5 A;  3UG4 A;  4Z2L A;  1C8Q A;  4B16 A;  5JBD A;  3ZJ8 A;  3VDH A;  5I79 A;  2GDV A;  1WDS A;  1DED A;  3PZI A;  2YOC A;  1ZS2 A;  1RPK A;  4J3W A;  3MUI A;  4XB3 A;  3VIL A;  4RL3 A;  1E5N A;  2XHY A;  3ZMR A;  4WLC A;  1UD3 A;  1QNO A;  3W29 A;  1P6W A;  4YPJ A;  1VF8 A;  1CGW A;  4MJ4 A;  5I3D A;  1A47 A;  3OLE A;  2GJR A;  1GON A;  5A8P A;  1HKM A;  1OGS A;  1QNP A;  7A3H A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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