3WQ8A

Monomer structure of hyperthermophilic beta-glucosidase mutant forming a dodecameric structure in the crystal form
Total Genus 177
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
177
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
KFPKNFMFGYSWSGFQFEMGLPGSEVESDWWVWVHDKENIASGLVSGDLPENGPAYWHLYKQDHDIAEKLGMDCIRGGIEWARIFPKPTFDVKVDVEKDEEGNIISVDVPESTIKELEKIANMEALEHYRKIYSDWKERGKTFILNLYHWPLPLWIHDPIAVRKLGPDAAPAGWLDEKTVVEFVKFAAFVAYHLDDLVDMWSTMNEPNVVYNQGYINLASGFPPGFLSFEAAEKAKFNLIQAHIGAYDAIKEYSEKSVGVIYAFAWHDPLAEEYKDEVEEIRKKDYEFVTILHSKGKLDWIGVNYYSRLVYGAKDGHLVPLPGYGFMSERGGFAKSGRPASDFGWEMYPEGLENLLKYLNNAYELPMIITENGMADAADRYRPHYLVSHLKAVYNAMKEGADVRGYLHWSLTDNYEWAQGFRMRFGLVYVDFETKKRYLRPSALVSVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Monomer structure of a hyperthermophilic [beta]-glucosidase mutant forming a dodecameric structure in the crystal form
doi rcsb
source organism Pyrococcus furiosus
total genus 177
structure length 448
sequence length 448
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2014-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wq8A00
3CPUA 1BG9A 2O9OA 3VUPA 5A6KA 3VX1A 4CCEA 5DF0A 5JIWA 1CDGA 4P8VA 1JIBA 2WKLA 3CHFA 3W24A 3CZ8A 1LQ0A 1LL6A 3NDZA 4AIEA 1FHLA 4W93A 3N9KA 3ARRA 4W5ZA 4HU0A 1UYQA 3CMJA 1EDQA 2CITA 2ZE0A 3CBWA 1Y7VA 2ZUTA 1LWHA 2WC7A 4H7VA 2WHLA 5ECUA 1QPKA 1OIMA 3RO8A 2CYGA 3POCA 4X9YA 3SCRA 3AXIA 1KBKA 4AD2A 3WELA 5BXSA 5A6BA 1KXVA 1QI0A 2ZUMA 2NT0A 3AHXA 2XVGA 2QV4A 3SCTA 1IT0A 2WMHA 1GNXA 3SURA 1GQIA 3N13A 2WKGA 4PUDA 3VNZA 1FHDA 3ALGA 3W27A 1TFVA 3KEHA 3RIKA 4GXPA 4U33A 4QP0A 3DC0A 4J3UA 3OLDA 4W7UA 3WFZA 1B0IA 4W8LA 4UQBA 4M8UA 4HPHA 4EANA 4UTFA 1ISZA 1GORA 2ZIDA 1B31A 1WDSA 1UR9A 1MWOA 3IAQA 2X1IA 4PMDA 3GNRA 5C70A 4BZYA 1C7TA 4P7OA 1JZ2A 2WLZA 3THDA 3SCWA 1EA9C 2VT0A 2D0GA 1NOWA 2XWEA 2OWWA 1FP8A 4LYQA 3UR7A 2Y5EA 1WDRA 3ARZA 3GXMA 1J18A 3AMLA 1R85A 1FA2A 1CXKA 2UY4A 4JFUA 4Z2LA 2YA2A 5GNYA 4DM1A 4EKJA 3TTQA 1H49A 3DHPA 1GOKA 2BY3A 4B3LA 1US3A 1BSIA 4M1RA 3NSNA 4AZ7A 1Q6GA 4E2OA 1K9DA 3B9AA 4ZENA 3RJXA 2VOTA 5A2AA 1LLOA 3CZGA 3A4XA 4HOZA 3MMWA 3PZVA 1E6ZA 1H4PA 5HXMA 1GOIA 2J8FA 3AZSA 4IPLA 1BLIA 4S3KA 1ZBKA 1E56A 1RP9A 1GJUA 4AZCB 3ARPA 4D72A 1NWTA 2YDQA 1EO7A 5BCAA 2WZEA 4W87A 4FLQA 3WF0A 4AD1A 2E40A 2F61A 3VPLA 2XUCA 1S46A 3CUFA 2F8QA 1J01A 1E9LA 3VGGA 3JUGA 5M17A 1DWHM 2OYMA 3VD9A 4RL3A 1UR0A 3AYSA 4QLKA 2J7CA 3SCUA 3SEPA 1JF6A 5DT5A 2W4XA 3GM8A 5E70A 4PMVA 4TVUA 2W63A 4HPGA 4UOQA 5FOOA 1JZ3A 1ZL1A 3VD5A 3WD1A 1EO5A 3RM8A 3I3DA 2OSYA 1W1YA 1XSJA 3AHZA 3PTMA 1VEOA 5AYIA 1W9UA 2BV9A 3EDEA 2YL5A 3IANA 2VZVA 2V3GA 5GPRA 1JZ8A 2WMIA 3K8KA 2XVLA 1DWIM 3GNOA 1KXQA 3T0AA 5I24A 3OGVA 4HA3A 1QHPA 1DWFM 1VIWA 1M03A 4FMVA 1V6WA 2NSXA 2E9BA 2JEPA 2J7GA 1HIZA 2BVTA 1WB0A 2V38A 2GK1A 3M46A 1UQYA 3WDIA 1E0VA 2PWFA 1P6WA 3QHMA 3M07A 4KH2A 4NRRA 1WAWA 1RD6A 3FN9A 3W28A 3EBVA 2FH8A 4M81A 3L4XA 1VBUA 1V3LA 3PZUA 3WNKA 5CJ5A 4J3VA 2QLYA 2FGLA 4HA4A 3DYMA 1ZS2A 5LYRA 4FLRA 2BXZA 3S2CA 1ODZA 2BY2A 1A47A 3VGHA 1G0CA 2WPGA 5I78A 3K8MA 1H41A 4PCTA 4CD7A 5HOSA 2CKRA 4MB4A 4P7RA 4HU8A 1CGUA 4OOZA 5D9OA 1E1EA 3APGA 3BGAA 2EO7A 4JKLA 3OLEA 1B3XA 4HOXA 4J27A 3VIGA 2D24A 2PC8A 1C8QA 4CCDA 3AROA 5I5RA 1XD0A 3OZPA 1O7AA 1R8LA 4MNJA 1WZMA 2XM2A 4ATWA 2GDUA 3VMNA 3WD3A 1FH9A 2WMJA 3GDBA 3T2QA 4AIOA 1XSKA 1ZU8A 2J7HA 5TD4A 2G4FA 4FLOA 3O6AA 5E09A 1J0IA 1VJSA 1KXHA 3MSDA 2ZXDA 3UERA 1C93A 2ZXQA 5EMYA 4GQRA 4MNKA 1C8XA 1JFHA 5KZ6A 4F9DA 3AI0A 3N18A 3GXDA 5JBEA 3CZEA 3WFLA 2Y8VA 1UKTA 5M5DA 4UQCA 2J4GA 5HBFA 3NCOA 4UFKA 3WF2A 1CGWA 1CGTA 4BQ5A 2GJXA 3WUBA 4BQ2A 1OCQA 2X8RA 1UWRA 1EOKA 5E0CA 2IXVA 3I3EA 1EIBA 3F5KA 6TAAA 3DYPA 2B31A 2XVNA 3B8SA 2IUZA 3HMCA 2AOSA 1W91A 2CEQA 4U2ZA 4JAWA 5A6SA 2CKSA 2PBOA 4D6DA 2WVSA 4U3CA 1WDQA 1EGZA 2YOCA 2WNWA 4D6HA 1HT6A 5HPOA 2JEQA 3VGBA 1BGAA 2ESCA 1EQPA 4P8WA 3OG2A 1OD8A 2JIEA 2PB1A 4GIAA 4M82A 3WBAA 3VD3A 2QPSA 3GBDA 8CGTA 4ZXOA 2VO5A 1U2YA 5A3HA 2JALA 3ARXA 2A3EA 3RDKA 2PWDA 1BG4A 3VIPA 3N12A 3MV01 4NSBA 1RH9A 2WBGA 3N04A 4EAMA 1HL9A 1JYWA 4KRUA 4AISA 4V28A 4WJXA 1UD3A 1UG6A 2Z1KA 5HPCA 4MADA 1PZ2A 3BSGA 1AVAA 5AY7A 1OB0A 2JFEX 1E5NA 1BPLB 1JAKA 3U5YA 2GUYA 4OBRA 4ZE5A 4H8VA 1E6PA 3EDKA 1HJUA 1UKQA 4CKQA 2J62A 2PWHA 3WDQA 4J3TA 4HP5A 2DPEA 2G41A 4J3WA 1AQHA 1OSEA 1WZKA 2WWDA 4UOZA 4PSPA 3TP4A 1JZ7A 2VNCA 1YHTA 2VC9A 3L2LA 3POHA 3BMWA 3PZGA 2BFGA 2WVVA 3WL0A 4MTVA 3ZSSA 2ZWZA 2ZUSA 1V3KA 1ZB5A 2GJXB 4LGXA 3WEZA 1UUQA 1LL4A 1JDCA 3MV11 2EJ1A 3CHEA 1Z32X 3S6TA 2G3MA 3WD0A 1JZ5A 4PMQA 4CU6A 5CGMA 2G3JA 2DT0A 2O9RA 4PMUA 2J7FA 4N42A 1C8YA 5LA2A 3AXHA 4DUVA 1J0HA 1H1NA 2W67A 2YIHA 4AZBA 3WDPP 1JXJA 3AIVA 4BS0A 3ARYA 4IPNB 5I2UA 2C0HA 4W8BA 5ABFA 2VX6A 3AHTA 1JF5A 1V03A 4D6EA 2XIBA 4J3SA 4A3HA 2XWDA 3VDAA 1UKSA 4LX4A 1V6YA 5GNZA 5JIPA 4W89A 1G5AA 4Z2IA 5M03A 3BAXA 4IUGA 1QOXA 2FHFA 2YL9A 3THCA 2BVYA 1QI2A 2DH3A 4TX8A 1CXFA 5FIPA 3SUWA 4QLLA 3OLIA 2D3NA 3ZT6A 4Z2KA 4DM2A 5JUVA 2WCGA 1H11A 2EQDA 3NJ3A 4OOUA 1JXKA 4V2XA 1C91A 1ECEA 4A4AA 4OJYA 3WUGA 1B30A 5I79A 4B9ZA 2UY2A 3ZQ9A 4X0VA 3WNNA 2Y24A 4YHEA 5FCZA 1Q6EA 3WEOA 2E3ZA 4LQ1A 1B3ZA 1JZ4A 1AQ0A 2XVKA 4ACYA 3BAJA 1V0MA 3WF3A 1IZKA 1IV8A 4GKLA 1PX4A 1HF6A 2CHNA 1HKKA 3WH9A 1UWTA 1W2PA 4OUEA 3W6MA 4HZ6A 3CLWA 4Y7EA 2YA0A 3UG4A 2DEPA 4QCEA 4S3JA 1UD8A 3UG5A 2WHMA 3A6OA 4B9YA 3TTYA 1GZJA 1SR0A 1I1XA 1MQQA 1V3MA 2OYKA 3VDBA 4UQ9A 4AZ5A 3AIWA 4MAVA 3VKKA 4KRTA 5A2CA 4PMNA 2X0YA 3MSGA 1MXGA 1V08A 3CZKA 3FNDA 1PJ9A 1OGSA 1E6XM 3ARTA 2BY1A 2DT1A 3CUJA 3UETA 2MANA 3QOKA 1FP9A 3L4WA 3CUGA 1MW1A 2DQXA 4PTMA 1XH0A 3VVGA 4UZUA 5CXPA 1CXHA 1UZ4A 2C7FA 2WZIA 1QNRA 5A6MA 4F9JA 3ZMRA 4ZE4A 4Z2GA 1PBGA 2IXUA 4DWSD 4XX6A 2J77A 3VD7A 4D6FA 3AFBA 1E0WA 2VVNA 1F4HA 3CTTA 1X6NA 1WZLA 4OIFA 4MB5A 1W9XA 1W9BM 1K9TA 3L4TA 3NSXA 2BHZA 4OKDA 2D20A 4AD4A 1GW1A 3UR8A 4W85A 5DFAA 4F66A 2BY0A 3GH5A 3AQUA 2ZWYA 1NOFA 1GOOA 3IAPA 6CGTA 2DIEA 4U3AA 4MDOA 2DSWA 1BGGA 4J28A 2E0PA 1E0XA 5FL1A 2VX5A 3AMCA 5FKYA 1HXJA 2YDSA 2F2HA 1NWRA 2W61A 2CPUA 4GZEA 3ARQA 4PTXA 4WKFA 2O9TA 3KZSA 1HKIA 2WMKA 1BFNA 2BHYA 2YBUA 4L4PA 1XYFA 4CN6A 1HX0A 5KEZA 4MNLA 4E8DA 1O6IA 2J7DA 4P8UA 4UFJA 1JYNA 1KQYA 1R86A 4UNIA 4GQQA 2DH2A 2WHKA 5AC4A 5IHRA 5M3WA 3TA9A 1TMQA 4GI6A 4TTUA 1HL8A 5E6YA 3W38A 4NI3A 1UH2A 4TVDA 3VIHA 2VZUA 1UQZA 2JF6A 1E4NA 1E73M 2YL8A 1CXIA 1E6SM 1LG2A 1MQRA 1XCWA 1WE5A 1IZJA 4CU7A 3MO4A 3L4UA 2YJQA 2EPLX 4MPKA 1JDAA 5A69A 3J7HA 2WXDM 1B90A 1UZ1A 1B3WA 1B2YA 2ZXAA 3AZRA 4H41A 4FF5A 5A95A 3RCNA 3WUEA 4W84A 4WKAA 4GI9A 4U5KA 1UA3A 1W3HA 1GQLA 3ZJ8A 4XZBA 1M7XA 3LPPA 1VB9A 2A3CA 3L4ZA 5DO8A 3W6LA 2UWFA 1Q6DA 1E3XA 2X05A 3CUIA 1KGWA 3AMDA 2OWCA 3L2MA 4KMQA 2YKKA 4HMDA 4F79A 2VUYA 1AMYA 2WMFA 3WMSA 2VZTA 4GO8A 3ZT5A 4J3XA 1QI4A 1U33A 3U7BA 3W81A 2GSJA 1XH1A 2CCRA 1H0IA 3AZTA 1J0ZA 4EK7A 3UEQA 4XV0A 3K46A 5ABEA 4D71A 1W1VA 1PIFA 1BQCA 1VEPA 1XH2A 2BHUA 1KFWA 2YLAA 3IJ7A 4PMRA 5BRQA 4KGLA 3VDHA 1EOMA 4BQ3A 5A1AA 1QBBA 3CUHA 3MUZ1 3CGTA 3PHAA 3AMGA 2YA1A 4M29A 2A3BA 4H8HA 2WW5A 5GQBA 2FDMA 3CHCA 3EMCA 3IJ9A 2WZHA 1PAMA 2XGBA 3PZIA 3WMBA 4JFTA 1B9ZA 4NZCA 5A8MA 4WSKA 3AHVA 2J7EA 1G1YA 1BYBA 4UCFA 4ACZA 5CSUA 1KCKA 3EYPA 4JHZA 1OT2A 3WMCA 1UH4A 2DDXA 1KWGA 1Q6FA 1ISWA 1QNSA 2D1ZA 3OGSA 1WCGA 1UOKA 2WSPA 2CBJA 4JKKA 2BNJA 3BMVA 1PZ3A 2BXYA 3DYOA 1CLVA 2BVDA 3PZNA 2ZXBA 2JIWA 1AQMA 2HVMA 3TOPA 2EPOA 1OWQA 4CVWA 1QNPA 2XHYA 4PN2A 1H3GA 3ZR5A 3QGVA 1UD5A 1TCMA 3WBEA 4HZ7A 3EDDA 4CN4A 4AEEA 1W3JA 4CN1A 4P7NA 1C92A 5I77A 4YPJA 1E15A 5GNXA 4WSJA 1E72M 4W86A 1QVBA 4TOQA 3BAIA 1FH7A 2JF7A 4FLSA 1NP2A 4Q7NA 1GOMA 1J11A 4U5IA 2WANA 3NSMA 4B3KA 2VX7A 5BYWA 4PMZA 1EHNA 1E1FA 3WEMA 1QI5A 3OB8A 2WMIB 2VR4A 4H2CA 4BA0A 2QMKA 2VQTA 1OM0A 1JNDA 3ZM8A 1E6NA 3MMDA 3AIEA 1W1TA 4H8UA 3WNOA 1QI3A 1CECA 5CQ1A 1B1YA 1I1WA 3II1A 3K4DA 3VNYA 3PZTA 2W66A 5CSYA 4Q22A 2UY5A 4DUWA 2GK1B 1CZ1A 3MUIA 4GINA 2XM1A 3WD4A 4HTYA 4XB3A 1BF2A 2VCBA 3VMPA 2VRQA 1CGXA 1XYZA 4AC1X 1NWSA 3VX0A 1K9FA 1DWGM 1HP5A 4CGTA 4ACZB 2XTKA 2O9PA 4UZSA 3SIMA 2YBTA 1DP0A 4Z2JA 1QNOA 4D1IA 2CETA 1ISXA 3VGEA 3WH8A 4HZ8A 1QHZA 3IK2A 3OLGA 4HA1A 3PZMA 1TG7A 1EHAA 3SUTA 2RGMA 4BCEA 2RGLA 1MXDA 3CHDA 2X0HA 2VURA 3WUFA 2VR5A 2ZX8A 3B9DA 3SCQA 1MFUA 1E5JA 1CYGA 3QHNA 5HNNA 1E71M 5AC5A 5A8QA 2VMFA 4D6JA 4U2YA 2E9LA 3MMUA 3BCFA 3U7VA 1JZ6A 2VCAA 5CG0A 1LL7A 3WF1A 1HN1A 4GPNA 2ZUVA 1A3HA 4D6CA 1V3HA 4W7WA 2WVTA 2CESA 4C7DA 3W0KA 3WENA 3N11A 1KWKA 2VRJA 2V5CA 4UQEA 3WNMA 2DSVA 3VIFA 3VTRA 4MB3A 1E4MM 4OZOA 4M24A 2QHAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CPU A;  1BG9 A;  2O9O A;  3VUP A;  5A6K A;  3VX1 A;  4CCE A;  5DF0 A;  5JIW A;  1CDG A;  4P8V A;  1JIB A;  2WKL A;  3CHF A;  3W24 A;  3CZ8 A;  1LQ0 A;  1LL6 A;  3NDZ A;  4AIE A;  1FHL A;  4W93 A;  3N9K A;  3ARR A;  4W5Z A;  4HU0 A;  1UYQ A;  3CMJ A;  1EDQ A;  2CIT A;  2ZE0 A;  3CBW A;  1Y7V A;  2ZUT A;  1LWH A;  2WC7 A;  4H7V A;  2WHL A;  5ECU A;  1QPK A;  1OIM A;  3RO8 A;  2CYG A;  3POC A;  4X9Y A;  3SCR A;  3AXI A;  1KBK A;  4AD2 A;  3WEL A;  5BXS A;  5A6B A;  1KXV A;  1QI0 A;  2ZUM A;  2NT0 A;  3AHX A;  2XVG A;  2QV4 A;  3SCT A;  1IT0 A;  2WMH A;  1GNX A;  3SUR A;  1GQI A;  3N13 A;  2WKG A;  4PUD A;  3VNZ A;  1FHD A;  3ALG A;  3W27 A;  1TFV A;  3KEH A;  3RIK A;  4GXP A;  4U33 A;  4QP0 A;  3DC0 A;  4J3U A;  3OLD A;  4W7U A;  3WFZ A;  1B0I A;  4W8L A;  4UQB A;  4M8U A;  4HPH A;  4EAN A;  4UTF A;  1ISZ A;  1GOR A;  2ZID A;  1B31 A;  1WDS A;  1UR9 A;  1MWO A;  3IAQ A;  2X1I A;  4PMD A;  3GNR A;  5C70 A;  4BZY A;  1C7T A;  4P7O A;  1JZ2 A;  2WLZ A;  3THD A;  3SCW A;  1EA9 C;  2VT0 A;  2D0G A;  1NOW A;  2XWE A;  2OWW A;  1FP8 A;  4LYQ A;  3UR7 A;  2Y5E A;  1WDR A;  3ARZ A;  3GXM A;  1J18 A;  3AML A;  1R85 A;  1FA2 A;  1CXK A;  2UY4 A;  4JFU A;  4Z2L A;  2YA2 A;  5GNY A;  4DM1 A;  4EKJ A;  3TTQ A;  1H49 A;  3DHP A;  1GOK A;  2BY3 A;  4B3L A;  1US3 A;  1BSI A;  4M1R A;  3NSN A;  4AZ7 A;  1Q6G A;  4E2O A;  1K9D A;  3B9A A;  4ZEN A;  3RJX A;  2VOT A;  5A2A A;  1LLO A;  3CZG A;  3A4X A;  4HOZ A;  3MMW A;  3PZV A;  1E6Z A;  1H4P A;  5HXM A;  1GOI A;  2J8F A;  3AZS A;  4IPL A;  1BLI A;  4S3K A;  1ZBK A;  1E56 A;  1RP9 A;  1GJU A;  4AZC B;  3ARP A;  4D72 A;  1NWT A;  2YDQ A;  1EO7 A;  5BCA A;  2WZE A;  4W87 A;  4FLQ A;  3WF0 A;  4AD1 A;  2E40 A;  2F61 A;  3VPL A;  2XUC A;  1S46 A;  3CUF A;  2F8Q A;  1J01 A;  1E9L A;  3VGG A;  3JUG A;  5M17 A;  1DWH M;  2OYM A;  3VD9 A;  4RL3 A;  1UR0 A;  3AYS A;  4QLK A;  2J7C A;  3SCU A;  3SEP A;  1JF6 A;  5DT5 A;  2W4X A;  3GM8 A;  5E70 A;  4PMV A;  4TVU A;  2W63 A;  4HPG A;  4UOQ A;  5FOO A;  1JZ3 A;  1ZL1 A;  3VD5 A;  3WD1 A;  1EO5 A;  3RM8 A;  3I3D A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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