3WUEA

The wild type crystal structure of b-1,4-xylanase (xynas9) with xylobiose from streptomyces sp. 9
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
TATLGELAEAKGRYFGSATDNPELPDTQYTQILGSEFSQITVGNTMKWQYTEPSRGRFDYTAAEEIVDLAESNGQSVRGHTLVWHNQLPSWVDDVPAGELLGVMRDHITHEVDHFKGRLIHWDVVNEAFEEDGSRRQSVFQQKIGDSYIAEAFKAARAADPDVKLYYNDYNIEGIGPKSDAVYEMVKSFKAQGIPIDGVGMQAHLIAGQVPASLQENIRRFADLGVDVALTELDIRMTLPRTAAKDAQQATDYGAVVEACLVVSRCVGITVWDYTDKYSWVPSVFPGQGAALPWDEDFAKKPAYHAIAAALN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural perspectives of an engineered beta-1,4-xylanase with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces sp.
molecule keywords Endo-1,4-beta-xylanase A
total genus 126
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2014-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wueA00
3QHOA 3ZJ6A 1EO7A 2QLYA 1EH9A 4KGLA 3IJ7A 5A95A 3L4YA 2IXUA 3G6MA 1FFQA 1CGXA 3VGFA 1BG4A 3TTQA 2O9RA 1UD2A 1I1XA 2ZX5A 3N1AA 1C93A 5IHRA 5CSYA 1C90A 4W8LA 3SCOA 1HL9A 2W61A 2WBKA 5M3WA 4OOUA 2G3MA 3K4AA 4D72A 2CEQA 3VKKA 2G3IA 4ZXLA 2E8YA 1GHSA 5BXTA 4U5IA 1GQJA 1KB3A 4D6DA 2WXDM 1V3MA 4KRUA 3IK2A 3M46A 1XCXA 1OGSA 2UY3A 3BSHA 5BCAA 2DH3A 4D1JA 1EDGA 1BFNA 4JFVA 1UWRA 4JKMA 4CD8A 2WC7A 2ZX8A 2J47A 3K1DA 2FGLA 3DYOA 4P7RA 3UG3A 4RE3A 4WKFA 1XH1A 1W9XA 5IFPA 3VM5A 2WSKA 3VU2A 4OBSA 2ZIDA 3ZT5A 3D3AA 3F5KA 3CZLA 1OSEA 3MO4A 2BNJA 2QF8A 4W87A 4S3KA 4GQRA 3OLEA 2B31A 1CGVA 5CZKA 4ZXOA 4HMCA 3BAJA 3BLPX 4A3YA 2E9MA 1M04A 1JDDA 2XG9A 2J7FA 1E40A 4GO8A 1WCGA 2J74A 4QP0A 1VJSA 5I2UA 2WVSA 1E15A 1DWJM 1HJVA 2EEXA 4W88A 5TD4A 1E6PA 1WDSA 4AZ7A 3PZGA 1E4NA 1ZJAA 1W2PA 4AIEA 3W26A 1OINA 4AZ5A 2UY2A 4C7DA 2BY3A 4AD1A 1E72M 3W37A 1LF1A 1X6LA 1B30A 3FW6A 1EDQA 2TAAA 1DWHM 3WNOA 4C7GA 1CXEA 1VFMA 2WVTA 1M03A 3AXXA 2XGBA 4CD5A 4UR9A 3WD4A 5A8NA 1C7SA 3VIHA 1W3HA 1BYCA 1MFUA 4AEFA 4PYSA 2YBTA 4UCFA 5M17A 3T09A 4BA0A 1U2YA 3CUHA 4XUYA 5LYRA 3NJ3A 4PMVA 4Z2HA 1HJWA 4CD6A 2VQUA 1PX3A 1C8QA 1UG6A 1R87A 4HZ7A 5A6JA 1UH4A 2VI0A 3WSUA 6A3HA 3ARZA 1J18A 1MQQA 5C8BB 4F66A 1Q6EA 2VCBA 3D5HA 3J7HA 1WO2A 4M29A 4D6IA 4QCEA 3RM8A 3WNMA 1JAEA 4UOZA 1NH6A 4OBRA 2AOSA 1XYZA 2OYKA 2OWCA 1L8NA 4Z2LA 3MMDA 2PWDA 1QOXA 1G9HA 3PTMA 4H8HA 3AS3A 1JDCA 4P7NA 2WHKA 4FF5A 3U57A 4AC1X 2WVUA 3SCNA 2J7DA 3GH4A 3VIOA 1GOMA 5DEZA 3K8LA 3ZT7A 1BVZA 1W3KA 3ZM8A 2AAAA 1MQRA 2JIEA 1W9BM 1BF2A 1FHLA 2JIWA 1GPFA 1M53A 3AZRA 2WKLA 4WSKA 5BYWA 1HN1A 4KGJA 5I6SA 4GZIA 3MKKA 3UETA 5D9OA 4J3SA 5JBDA 2WC4A 1OD0A 1QHZA 2BY1A 1QI0A 2J78A 4QAWA 3AS2A 1H1NA 3EYPA 2W67A 3L4VA 3BCDA 2E40A 2E8ZA 4W8AA 3WMCA 1UZ1A 2QPSA 2VTFA 1XSJA 2D23A 3OG2A 2PBOA 1GNXA 2F8QA 1PEZA 2ZUVA 3VX1A 1NWTA 3WDHA 1XD0A 2ZXDA 4YPJA 3GM8A 1HX0A 1B3WA 2DIEA 3WQ4A 4Z2GA 3AISA 1VJZA 3AIVA 4PBGA 1AVAA 4AZGA 2XWDA 3QOMA 4CUCA 3EDEA 1H49A 3AIWA 3RIKA 2F61A 4MB1A 2HVMA 5LA0A 1K9EA 4JFTA 2BXYA 3PZMA 4QLLA 3VDCA 1OM0A 3KZSA 4J7RA 1UQYA 1SR0A 2O9TA 5HPCA 5C70A 1UR2A 2YOCA 3L2MA 1CTNA 1BTCA 4KMQA 1HIZA 1E6SM 3PZOA 1Y7VA 1E71M 3SUWA 3OGSA 2FHCA 2VT0A 4U2ZA 3WD2A 3ARUA 5AYIA 1QHOA 4AZ6A 1GZJA 3A3HA 3PBGA 4M56A 2VVSA 1MW0A 1F4AA 4TTGA 2QPUA 4V27A 4GIAA 1VFFA 2JF6A 1EOMA 2VJXA 2NSXA 3RCNA 1OGGA 1GUVA 1V02A 3SEPA 4HP5A 2XFFA 1UA3A 2CCRA 3DYMA 1MVYA 2XVGA 3VIIA 3CZGA 3T08A 5FIPA 2A3CA 2WHLA 3VD7A 2BY2A 2GJRA 2OWWA 5JIPA 3PZ9A 2CHNA 1H4PA 4J3TA 1K9FA 1CNVA 2VCAA 1E6QM 1VEPA 1IV8A 2HISA 2YKKA 4GKLA 1MW1A 3CPUA 4DWSC 1NQ6A 3FAWA 3KL3A 1LQ0A 4Z2IA 4WJXA 4MJ2A 4MB5A 2V5DA 2D20A 1JYWA 2A3BA 1C7TA 2WMIA 1J0HA 1D3CA 1ZBCA 3CUIA 5ABHA 2BY0A 7A3HA 3WMSA 2ZXAA 4JIEA 4YHGA 2OYLA 1KGXA 4ZENA 1DWAM 1G94A 3SCUA 2VR4A 5IDIA 3BLKA 2ZX9A 3QR3A 1JIBA 1Q6DA 2PB1A 4FLQA 1J01A 3PN8A 3IJ9A 3CBWA 3L2LA 1QI4A 4J3XA 1G01A 3BMVA 2W92A 3U5YA 2OWXA 2XTKA 3WN6A 4CCEA 1QW8A 3KWXA 2WPGA 4IPLA 3AMGA 2BVTA 4MB4A 5GPRA 1UWIA 1RH9A 2X09A 2QV4A 3UG4A 4FLOA 5A6LA 1PZ3A 3LMYA 1TA3B 3FHQA 3AOFA 3AIBA 1VBRA 4F8XA 3AQUA 2A3EA 1NOUA 3W38A 2J7GA 2OSYA 1CENA 2VZVA 2XUCA 4P8WA 3VNYA 4B9YA 2GJXB 1W1VA 1V6WA 2ZUTA 3WF3A 4DM2A 5EB8A 1WZLA 2YLLA 5D4YA 1XHGA 1Z32X 1NM9A 1MW2A 1V6UA 3WENA 3EMQA 4J3VA 2QMJA 4CD7A 3W53A 4OKDA 1KGWA 4PUEA 1EXPA 2JFEX 3CZJA 3PZQA 2WZIA 4YHEA 5EMYA 3AHVA 5ABFA 3SUVA 1BSIA 2DT0A 1W91A 4ATWA 2CIPA 1GOKA 2EPMX 1UWUA 3OIHA 4OOZA 4W7WA 1JI1A 1VEOA 4BF7A 3ARRA 1JFHA 2V3GA 1CXKA 3O2LA 1ESWA 3F5JA 1VB9A 2J7CA 4UQEA 3RPMA 1LL6A 5E6ZA 4M82A 1LL7A 1GW1A 3VPLA 3QOKA 3T2QA 3WQ8A 4HU0A 1V3HA 3VGBA 3S2CA 4PTWA 3ARPA 3ZO9A 2RGLA 2V5CA 1PAMA 2CBIA 4GXPA 4F9JA 1B9ZA 1J10A 3VMPA 1CZ1A 3U5UA 1KXTA 1E6ZA 1W9VA 2BFGA 3CTTA 3CLWA 3WNNA 3BC9A 2DSKA 3DYPA 5FCZA 1JZ5A 1V0NA 3MV11 2XVKA 1TUXA 3CMJA 1JYNA 1HJUA 4RE2A 4UOQA 3GH5A 2FH8A 3NIYA 3B8SA 3VD9A 1TE1A 5IXEA 3WY1A 4W7VA 1KCKA 2ZXBA 4P7LA 1TR1A 2W62A 3BAKA 4J28A 4E8DA 1EIBA 4AD4A 1QNPA 4NSBA 1WZAA 1PJ9A 1ISYA 1UWTA 1RD6A 3WDJA 4JL1A 1KCLA 2YL9A 1GVIA 1FP9A 4XB3A 4DUXA 1D7FA 3B9AA 1UWQA 3DHPA 5IHSA 4URIA 1PX8A 4Q22A 5GQBA 5A8MA 4GI9A 2CERA 2JEQA 3ZIZA 2VX5A 4ACZA 3UR7A 3MS8A 4MNJA 5CPQA 3S6TA 1UD5A 2WVVA 4IISA 3ZOAA 3PZUA 3KE0A 4H7VA 3AMLA 4PSPA 1OT1A 1JXJA 2WC3A 3ZJKA 1H09A 1R7OA 1JZ6A 4U3AA 3AHTA 3OZOA 3ZJ8A 2PC8A 1GJUA 2VRQA 2Y8VA 2E9BA 3VD3A 5A3HA 1E1EA 3W82A 1UR8A 2J79A 2WNWA 4CVWA 3CUFA 3EMCA 7CGTA 3EDDA 1V3JA 4UNIA 3VDHA 1NARA 1V6YA 2CBUA 1CYGA 4EANA 3FXYA 3WF2A 1QNRA 2D24A 3VD5A 1O7AA 5A8QA 1C91A 9CGTA 3GNRA 8A3HA 4LGXA 3WEZA 1QNOA 1B90A 3ARTA 4PMQA 4BQ2A 5A6MA 4RL3A 4AZCA 1XGZA 3DECA 5FKYA 1ZB5A 2D0FA 1GQIA 3F4VA 1HKJA 1E6XM 2W4XA 4ZEPA 2GK1B 1BGAA 1JL8A 4J3WA 4ZFMA 5BRPA 5I5RA 4AMCA 3SCTA 3UG5A 1JNDA 1HKKA 1LWHA 2E4TA 4ZE5A 1E55A 1AQMA 3NDZA 4AIOA 2D1ZA 5FL0A 1H5VA 1J0JA 4AW7A 1O6IA 2W66A 1R85A 3VILA 5E0FA 3VIGA 3G6LA 1JNEA 3APGA 5A94A 2CYGA 2XSBA 1GOIA 1CWYA 1ZS2A 2WMJA 1ZJBA 3WL1A 1MW3A 4U33A 3GXFA 3UCQA 4HA1A 3WBEA 2J75A 5A1AA 3W4RA 4UFMA 4MNMA 1VBUA 2E9LA 5D8WA 3ZMRA 2DDXA 3WDRA 3VINA 1IZJA 1JZ8A 1GHRA 1FA2A 4EAMA 4Z2KA 1UD6A 1E56A 1ECEA 4TUFA 5CGTA 1HNYA 1A3HA 4HPHA 4YN5A 3AMDA 2ZE0A 3WQVA 4BQ4A 5BXPA 1JGIA 2ZUSA 1SMAA 5EFFA 3GH7A 3UERA 2FDMA 1UQZA 3CUGA 4KH2A 3T0BA 3N9KA 1BYDA 2VUYA 4MDPA 3WD1A 3I3BA 4DWSB 3AIUA 2VNCA 1HVQA 1AMYA 3WUEA 1EHAA 3WH5A 3WH8A 3L4ZA 1IT0A 1NOWA 2W63A 4TX6A 3VUPA 5LA2A 1CXIA 3CHDA 1W9UA 1C3FA 4QDMA 3GXDA 4XV0A 3GXMA 1YHTA 3EDKA 4JCLA 3VX0A 1G1YA 5HBFA 1HP5A 5CJ5A 3ARYA 1ODZA 4KRTA 2E0PA 4P8UA 2PF0A 3AJ7A 4L4PA 5E9AA 3WDQA 1DWFM 3IAPA 1P6WA 1US3A 1S46A 2VCCA 4P7QA 1J9YA 3NCOA 5I0DA 2DQXA 1KQZA 4LXFA 2WCGA 2VX7A 1A47A 3TOPA 5BXSA 2YA2A 5AY7A 3SURA 5JUVA 2JEPA 5AC5A 3OLGA 4BCEA 2YLAA 1OWQA 1HVXA 4UQAA 2Z1KA 4PTMA 2WK2A 3BH4A 4CCDA 3CH9A 4HOXA 1MYRA 1G5AA 4L4OA 4UQBA 4JFUA 2YA1A 3HJEA 3DC0A 3K8KA 2DH2A 5GNYA 1QI2A 1HJSA 3PZVA 1CPUA 1VAHA 4GO9A 3FN9A 2V3DA 1CXLA 2VURA 1Q6CA 4CKQA 1UKPA 3WD3A 3VO0A 2Y5EA 1HKIA 2MANA 1VIWA 4A4AA 1OGBA 1E6NA 2PWEA 2O9OA 3AYRA 4M24A 4QFUA 1JZ3A 2ZX6A 3K8MA 4E2OA 1KGUA 4PMOA 1JYXA 3AIQA 5A6SA 3ARWA 3BAXA 1BG9A 4Y7EA 1KFWA 3THDA 3AYSA 4UQ9A 3SCRA 3UEQA 2JF7A 8CGTA 4B15A 3VGHA 1E4IA 1BHGA 1NWUA 1KBKA 1DEDA 4HMEA 1V3KA 5KEZA 2C0HA 1H41A 3AMCA 5BROA 4CCCA 2J7HA 3EMZA 2CBVA 3T0DA 5D9NA 1MWOA 2VRKA 2WYSA 2WZHA 5EFDA 5I78A 2YL5A 2GDUA 2YJQA 1E4LA 3JUGA 4TVCA 2D3NA 3AXHA 4AD5A 2X1IA 1PZ2A 4HOZA 3W27A 4UFJA 1OCQA 3WUFA 1U30A 4M81A 1TVPA 5DFAA 1CGUA 2FGZA 5AC4A 1B3ZA 3THCA 5FL1A 4W93A 3PZTA 1UR1A 5F7UA 5D9MA 1PIGA 4CVUA 2VZUA 3M07A 1LG2A 4MJ4A 4D6EA 1HKMA 2W5FA 2EPNA 2X0HA 4P7OA 5DF0A 1V3LA 4WK9A 3WKZA 2VX6A 1CBGA 4AISA 1GVYA 5HXMA 4W5ZA 1J12A 1JZ7A 3SUSA 1GOWA 3MSGA 3W24A 1MQPA 1WDRA 2QHAA 2DPEA 1HL8A 3OLIA 1ZBWA 4P8VA 3TP4A 1CGTA 2Y24A 2VZSA 2C8NA 1NP2A 5BWFA 2AMGA 3EBVA 4MPKA 3SCSA 3ALFA 4GI6A 1J0IA 2RGMA 3PTQA 3QGVA 2CXGA 3QHNA 1H11A 1E0XA 3W6LA 4LYQA 2VRJA 1J0YA 4MAVA 1W2VA 2VL4A 1E1FA 4H41A 3NDYA 3N12A 2V3FA 2WM0A 1XH2A 4EE9A 4WKAA 1KWGA 1V6VA 4PUDA 1W32A 4NI3A 4NRSA 4UQDA 1OD8A 3CHFA 2OLHA 4PMNA 1B3YA 2WBGA 2X8RA 4D6JA 4A3HA 1XD1A 4PMUA 2YL6A 3ARXA 1FFRA 5M5DA 2DSZA 3CIVA 1HF6A 1UHVA 4FLSA 5A2BA 1VEMA 1M7XA 5A8PA 2XWEA 3WEOA 4GQQA 1K9DA 1E70M 1UH3A 4ML4A 1E6RA 3TONA 1WZMA 4MNLA 1JZ4A 3MU7A 1UKTA 1E3ZA 6CGTA 1JFXA 2XSAA 3MUY1 3U7VA 2Y4SA 1ZBVA 1IZKA 4W84A 2VZTA 2PWFA 3TTOA 3VOCA 3OGVA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3QHO A;  3ZJ6 A;  1EO7 A;  2QLY A;  1EH9 A;  4KGL A;  3IJ7 A;  5A95 A;  3L4Y A;  2IXU A;  3G6M A;  1FFQ A;  1CGX A;  3VGF A;  1BG4 A;  3TTQ A;  2O9R A;  1UD2 A;  1I1X A;  2ZX5 A;  3N1A A;  1C93 A;  5IHR A;  5CSY A;  1C90 A;  4W8L A;  3SCO A;  1HL9 A;  2W61 A;  2WBK A;  5M3W A;  4OOU A;  2G3M A;  3K4A A;  4D72 A;  2CEQ A;  3VKK A;  2G3I A;  4ZXL A;  2E8Y A;  1GHS A;  5BXT A;  4U5I A;  1GQJ A;  1KB3 A;  4D6D A;  2WXD M;  1V3M A;  4KRU A;  3IK2 A;  3M46 A;  1XCX A;  1OGS A;  2UY3 A;  3BSH A;  5BCA A;  2DH3 A;  4D1J A;  1EDG A;  1BFN A;  4JFV A;  1UWR A;  4JKM A;  4CD8 A;  2WC7 A;  2ZX8 A;  2J47 A;  3K1D A;  2FGL A;  3DYO A;  4P7R A;  3UG3 A;  4RE3 A;  4WKF A;  1XH1 A;  1W9X A;  5IFP A;  3VM5 A;  2WSK A;  3VU2 A;  4OBS A;  2ZID A;  3ZT5 A;  3D3A A;  3F5K A;  3CZL A;  1OSE A;  3MO4 A;  2BNJ A;  2QF8 A;  4W87 A;  4S3K A;  4GQR A;  3OLE A;  2B31 A;  1CGV A;  5CZK A;  4ZXO A;  4HMC A;  3BAJ A;  3BLP X;  4A3Y A;  2E9M A;  1M04 A;  1JDD A;  2XG9 A;  2J7F A;  1E40 A;  4GO8 A;  1WCG A;  2J74 A;  4QP0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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