3WUFA

The mutant crystal structure of b-1,4-xylanase (xynas9_v43p/g44e) from streptomyces sp. 9
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
DTATLGELAEAKGRYFGSATDNPELPDTQYTQILGSEFSQITPENTMKWQYTEPSRGRFDYTAAEEIVDLAESNGQSVRGHTLVWHNQLPSWVDDVPAGELLGVMRDHITHEVDHFKGRLIHWDVVNEAFEEDGSRRQSVFQQKIGDSYIAEAFKAARAADPDVKLYYNDYNIEGIGPKSDAVYEMVKSFKAQGIPIDGVGMQAHLIAGQVPASLQENIRRFADLGVDVALTELDIRMTLPRTAAKDAQQATDYGAVVEACLVVSRCVGITVWDYTDKYSWVPSVFPGQGAALPWDEDFAKKPAYHAIAAALN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural perspectives of an engineered beta-1,4-xylanase with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces sp.
molecule keywords Endo-1,4-beta-xylanase A
total genus 129
structure length 313
sequence length 313
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2014-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wufA00
1UKTA 1CLVA 3QOMA 3AHYA 5FOOA 1DWGM 1FFQA 3N11A 1HKJA 3W25A 1W3KA 4V27A 2GJPA 2CXGA 4DWSB 1OINA 3W81A 1FP8A 3FHAA 1OSEA 1TR1A 2J78A 1TE1A 1GQKA 3WD1A 4AZBA 4MDOA 3SCRA 4AC1X 3N13A 2ZUVA 1JZ2A 4WKAA 2QF8A 2VUYA 5HDRA 1OIMA 5BXTA 1ISZA 5BRPA 2DSVA 3UG5A 1JXJA 1KGWA 1TA3B 2WKLA 4OBSA 5TD4A 2OSXA 2WBGA 2BXYA 2D3NA 2VZTA 1QI4A 3ZJKA 1TMQA 4PMVA 3QHMA 3VDHA 1AVAA 1BHGA 1Q6FA 2OYLA 4PMQA 4U5IA 1XHGA 1HX0A 5ABFA 1WAWA 1OBAA 1BVZA 2VNCA 1E6XM 3T2PA 2WHLA 1R7OA 3AIEA 1DP0A 2WKGA 1NP0A 3VMPA 1C7SA 1J11A 4ZENA 4WLCA 1UYQA 2WXDM 3WELA 1Q6GA 1NWTA 2ZWZA 1UZ1A 2CCRA 3AS3A 4PYSA 3RMEA 3NSMA 2WZHA 3THCA 3UETA 4D6HA 1XSKA 3VX0A 2G3IA 1GHSA 3BAWA 1V3MA 4F9JA 2EJ1A 2WNWA 1K6AA 4D1JA 4HPHA 4PMNA 4Z2IA 4S3JA 4B15A 1K9EA 4AZCB 1ESWA 3VMOA 2OYMA 3QOKA 4W7UA 1GOWA 1QOXA 3SCTA 3VNYA 2JF7A 1FH9A 3CMJA 1LL4A 1KWGA 4GINA 2QPUA 4D1IA 3AS1A 3D3AA 1UWUA 1VIWA 3GTNA 3AS0A 7CGTA 4CN4A 4GXPA 3N18A 4HOWA 4P7QA 3QHNA 2J7GA 2ZXQA 3WNMA 3K46A 1J0KA 4AZGA 1JL8A 2O9TA 4LYPA 3AHXA 2D0GA 1WO2A 5DT5A 3NSNA 1JI2A 2O9RA 4W85A 4Q7NA 3UR7A 1X6LA 1OIFA 4UFKA 1JG9A 4CCDA 4QDMA 1CIUA 1XH1A 2FDMA 4W8LA 1GOKA 5CPQA 1I1XA 3VGBA 2E3ZA 4P8WA 3L4WA 3K8KA 3U57A 3E1F1 4J7RA 2ZX6A 2O9OA 1VENA 3FY1A 2BVDA 2J7CA 3VTRA 1QI5A 1OCQA 2WSKA 2WMJA 3HN3A 2NT0A 3A4AA 2XM2A 3VIGA 5JUVA 1GOIA 2PWEA 3ZT5A 3VD5A 3PBGA 3WNKA 1PAMA 1RH9A 1O6IA 5LA2A 4AIOA 5IFPA 4AXNA 1E55A 3WQ5A 3ZJ7A 2BV9A 2X09A 1IT0A 3MANA 2J7EA 4MJ2A 4D6FA 2Y2WA 2UY2A 1TZ7A 1FP9A 2WMIA 4W86A 2Y4SA 1Q6EA 4C7GA 4XZBA 3AMLA 3VGDA 3WBAA 4WIWA 5CSUA 3IANA 1CYGA 3NYDA 1EQCA 1LF1A 4A4AA 4BCEA 2BY1A 1JF5A 2OSWA 2OLHA 1PX8A 1TFVA 1EO7A 3CO4A 3VD3A 5IXEA 3MO4A 2J77A 2VCAA 8A3HA 2X05A 3I3BA 3EDKA 3CZJA 3II1A 4F66A 5FKYA 2DT2A 1C91A 4PMOA 3AS2A 1JAEA 2A3EA 1V0NA 4RL3A 5D9PA 4ZFMA 1ODZA 3VIPA 5A6SA 3OZOA 3K1DA 1GOQA 3OG2A 3OB8A 1UG6A 3A6OA 1V6WA 1V02A 5A8MA 3BMWA 1SFSA 4HU8A 1KXQA 3PTKA 4W84A 1SMDA 1JD9A 2YL6A 4CD4A 3RCNA 2GFTA 2BFGA 1C3FA 1V3IA 3GXFA 1MW3A 3AIVA 3DECA 1KGXA 5HPCA 2G3JA 1E6QM 4MJ4A 1ISWA 1J0HA 3B9EA 1N82A 2CETA 2XM1A 3BCFA 4JCMA 5I5RA 2WVTA 1LWJA 3NJ3A 5HNNA 1WZAA 1FH7A 2E4TA 1EIBA 3SUTA 1EO5A 2NT1A 3RM9A 1H11A 1E9LA 5GPRA 2VRKA 3OGSA 4B3LA 2WANA 1W2VA 2G41A 3WUBA 1JFHA 2WYSA 1V3KA 4YPJA 1CTNA 1NQ6A 3MSGA 1BYCA 3ZMRA 1BAGA 3WF2A 2EO7A 2FGZA 4CKQA 5A6LA 4TX8A 4ATWA 5ABFB 4OBRA 4QCEA 4XUYA 2AMGA 1UKQA 4BQ3A 3POCA 1XGZA 1W3JA 5I2UA 2J4GA 4W8BA 4GQQA 1KR0A 5DFAA 4J27A 3LPOA 4IUGA 3ZT7A 5GNZA 3W38A 2EPMX 1HXJA 4W7VA 2HVMA 2XFYA 3AZRA 2ZUUA 2YDQA 1NWRA 1HJQA 2G4FA 3O9NA 3AFBA 4FK9A 3WD0A 4QLJA 1BPLB 1E72M 3AXIA 2WVVA 1BSIA 3PZGA 5BWFA 3VIOA 3AQUA 1JZ8A 3DC0A 2WW5A 3WBEA 1MVYA 3GBEA 5D8WA 4IPNB 4W8AA 1KBBA 3ZR6A 2W5FA 1J18A 3OGVA 2ZXBA 1JDCA 4U33A 1AQMA 4YN5A 1AMYA 3VIHA 3J7HA 3NDYA 1L8NA 1HJSA 4GPNA 1W3HA 2OYKA 5E09A 2CESA 3BXWA 4E2OA 3WKZA 2DT0A 4GI9A 2BY0A 1UWQA 1JAKA 1QW9A 1CGYA 1CGWA 2Q8XA 1UR1A 4EE9A 3VM5A 2YL8A 5A8NA 5GQBA 4FLQA 1JZ3A 2J7DA 2VQTA 3CUHA 4P8VA 4ACZA 4MB1A 2D23A 1V02E 1ZU8A 2E8YA 1KB3A 5CQ1A 1FHDA 5AYIA 1C8QA 5D9MA 2BVYA 2VJXA 3ARPA 4R5EA 3VNZA 5A3HA 4D6IA 3U5UA 1JFXA 1JZ7A 2DSWA 4PSPA 4Z2LA 4L4PA 2GVYA 5D8ZA 4AZIA 2X2YA 1BG4A 1ISVA 1XD0A 4JFSA 4GZJA 5FL0A 4AYSA 1WZLA 4CU8A 3SUSA 4QP0A 4MB3A 3IAQA 1KXTA 1QW8A 1UOKA 1BGGA 4PCTA 4B3KA 2VMFA 2VX6A 4LGXA 1BYBA 1EDGA 5E0FA 1LLOA 5DMYA 4YHGA 2CKRA 4ATLA 1QI0A 3SURA 3SCPA 3VDBA 4HA3A 6A3HA 5D4YA 5CGMA 1D2KA 1WDSA 1UQYA 5E0CA 4JCLA 1PIFA 3WNPA 1UD3A 2V3GA 3GBDA 3W28A 2WMIB 1X1NA 3AJ7A 3FW6A 2J75A 1XH0A 3KL5A 2D24A 2PF0A 2WMKA 3B9AA 5EFDA 4PMRA 5BYWA 3KL0A 3WH7A 1GUVA 2VO5A 1BGAA 1JZ4A 3GXDA 3T09A 3AOFA 2DSZA 3ARYA 5HBFA 5A8OA 1M01A 2J8GA 2XGBA 1C93A 2D1ZA 1PIGA 1VEPA 4UQBA 2YKKA 2D3LA 1W32A 3TOPA 4Z2GA 1WPCA 5I3DA 5CPTA 1V3LA 4A3HA 4W89A 1E15A 1GQJA 1MYRA 5KZ6A 1DWFM 1G94A 3MV11 1WDQA 4OOUA 1TG7A 2WM0A 2DEPA 3A3HA 2PC8A 4DM1A 1QHPA 4W93A 1ITXA 1US3A 4NZCA 3EMZA 4H8VA 4NSBA 3BAIA 4ZXLA 1MQPA 2Y24A 2WHJA 1QNSA 1SMAA 2VI0A 1E0VA 3MMWA 3VIJA 4PTWA 3ZJ8A 4B9ZA 1EOMA 4P7NA 2XIBA 3KWXA 1E6PA 4MDPA 2PWHA 2AAAA 3L2LA 1ZS2A 2BHUA 4ATDA 1ZBWA 1JYVA 4PMDA 4OUEA 1CXFA 1WDPA 1GPFA 4CGTA 2PBGA 1OGGA 2RGLA 1GVIA 1TUXA 1E4LA 4W87A 1CWYA 5A8QA 1V3JA 1VRXA 4AD4A 1VAHA 1US2A 1C90A 3CMGA 4CU6A 1JGIA 4EAMA 4DM2A 8CGTA 2FHBA 4UZUA 1QVBA 1DWIM 3AIQA 2WB5A 4RE2A 3L4ZA 2ZOXA 1D3CA 1Q6DA 4HTYA 3M46A 1M03A 1NH6A 1UWRA 3TTSA 5A2CA 3HU7A 1JNDA 1CXHA 4N42A 4JL1A 3IJ8A 1VFUA 5E6YA 3CZ8A 2W61A 1S46A 4PUDA 1W1TA 3OLGA 2E9MA 1CGVA 1V6YA 2XHYA 2WVVB 3PZMA 3U7VA 3VDCA 2ZXDA 2AOSA 3APGA 3EMQA 4LX4A 4S3KA 3BAJA 3AZTA 3LPGA 3OZPA 3CUIA 3OA5A 1BQCA 4KMQA 1X6NA 2ZUTA 4TUFA 5EB8A 3QHOA 1Z32X 1GW1A 3SCSA 3M07A 3PN8A 1P6WA 3G6LA 2DSUA 2ZIDA 4QFUA 2VZUA 3N9KA 4HZ7A 2XUCA 1QNOA 1H5VA 2YL5A 1MFUA 1QBAA 1B90A 3ALFA 3AYSA 3NCOA 4K68A 3WDJA 3VILA 3ZIZA 1K9FA 1JI1A 2W4XA 4ACZB 4P7OA 2VZSA 1XSIA 4XB3A 1WDRA 1C8YA 1UD8A 5A6BD 3PZIA 3AMCA 5JBEA 1WZKA 3FAXA 2WMGA 2V3FA 4PUEA 4XX6A 2WAGA 4NF7A 3F5KA 5D9OA 3GH7A 4JKLA 4D6CA 5FL1A 4JFWA 1CBGA 4J28A 4W7WA 3WL1A 1XD1A 3I3DA 3ZOAA 3EDDA 1LG1A 1KXVA 3WDHA 1DWJM 3OBAA 2OWWA 5D9NA 1LL6A 1RPKA 3AIRA 4XV0A 1WCGA 4E8DA 1TCMA 5I23A 4Z2KA 1AQ0A 6CGTA 1E3ZA 1E56A 1LJYA 1OD8A 5CJ5A 3VD7A 1WE5A 2RGMA 3OGRA 3WQ6A 3WD4A 1CDGA 5I0DA 1MXDA 2WC7A 3ECQA 1UKOA 3NSXA 1CXIA 1G9HA 2Z1SA 4AD2A 1PX4A 2YDSA 4HU0A 4D6EA 4J3SA 2DIJA 2VT0A 4J3WA 3WH5A 2J62A 2CKSA 2YLAA 3RILA 3L2MA 1EDTA 3WDIA 3VX1A 3SCQA 1GZJA 3PHAA 4JKKA 1F4HA 3AMDA 4GO9A 3L4XA 5CGTA 3B8SA 3AIUA 3WD3A 1ECEA 1NOWA 4M81A 3SCUA 1GCYA 1E4MM 5FCZA 2F2HA 1KWKA 3WDQA 1V6UA 3CZGA 1UUQA 4LPCA 4V28A 2VVNA 1BTCA 4D6GA 3EDFA 3AIBA 4CVWA 1W9VA 2WCAA 3DYOA 2G3NA 3WNOA 1EQPA 3W4RA 4WSJA 2QMKA 1PPIA 2WHKA 2F61A 4TVCA 3RIKA 3WFZA 4B9YA 4TOQA 1UQZA 1KBKA 3AMGA 3CHFA 3GH5A 2ZX5A 1IZKA 2DH3A 3UG3A 3WMCA 2ZICA 4L4OA 4BQ2A 5I6SA 2YA1A 2ZUSA 3MSDA 3G6MA 2W66A 4RE3A 4AZ6A 5IHSA 5ABHA 5LYRA 3ZQ9A 3VKKA 2BHYA 2UY5A 3VIKA 1KCLA 2DT1A 1HJUA 4AIEA 4LYRA 3VO0A 2E9LA 1B31A 2OWCA 1A3HA 1E71M 2VR4A 5HXMA 1HKIA 2DQXA 3N17A 3VM7A 4GI8A 1YHTA 3CPUA 1B3YA 4W5ZA 3U5YA 2QV4A 2DH2A 2BY3A 4LXFA 4UOJA 4JKMA 1ISXA 3EMCA 4UQ9A 3BMVA 3SEPA 2W62A 3QGVA 1H0IA 2EPKX 2JEQA 2QMJA 5FD0A 2J7BA 3O2LA 1CGUA 4ML4A 3DHPA 4R27A 1NM9A 5JBDA 3L4UA 4BQ4A 1D7FA 2VX5A 4UQCA 2V5DA 1UH2A 2GSJA 5GNXA 1JZ5A 1H09A 1L0PA 4CN6A 4LYQA 1I1WA 1HP4A 3LPFA 4N0RA 4HMDA 1J0YA 4GKLA 4D71A 3CBWA 1OT2A 4CD6A 1JZ6A 1XH2A 4M80A 1SYTA 1EHNA 1C92A 3CLWA 1E5JA 4PTXA 3AMKA 4JHZA 4M82A 1B3ZA 1IZJA 4JAWA 3W24A 2IXVA 5F7UA 1UWTA 3GDBA 4UOZA 2W67A 2PWFA 5BCAA 1LG2A 3ZO9A 3ZT6A 4UOQA 3CHDA 1BFNA 2QLYA 3VGHA 4HA4A 1BYDA 3NIYA 1B0IA 3KEHA 2IUZA 2BY2A 4NI3A 3VIIA 2GJXA 1WZMA 1XV8A 2YBTA 2ZX8A 4ZE4A 3VINA 2D0HA 5M03A 1H49A 3WIJA 4EK7A 4JFTA 3QR3A 1XYFA 1DHKA 3UG4A 2FHFA 3VD4A 5JIWA 2YA2A 1FOBA 1VFFA 4BF7A 1RP8A 3A47A 1J01A 4JHOA 4QLKA 1QPKA 1E1FA 4DUVA 3WQWA 5LA1A 3EDEA 1TA3A 2BNJA 1OD0A 2GK1A 1UD2A 4CN1A 3NDZA 4DWSD 2G8ZA 1GQIA 3MMUA 1ZJAA 1ISYA 7A3HA 1JIBA 1OB0A 4HZ6A 1UHVA 2VC9A 1ZBCA 2X8RA 5M5DA 3BC9A 3CIVA 3SIMA 4Z2HA 1M7XA 3UR8A 2WVUA 3WMSA 3F5LA 1CXKA 5E70A 1KQZA 2VL4A 4BZYA 1VJSA 2ZE0A 1W2PA 3CZEA 1MQRA 1W9PA 4OIFA 3RJXA 2TAAA 4D6DA 4HOZA 1VFMA 3RO8A 2CYGA 4UR9A 1PBGA 3UCQA 3PZOA 2BXZA 5ABEA 2VRQA 4OOZA 1XCWA 2YOCA 4OZOA 4OJYA 3OLEA 3D5HA 3VGFA 3GNOA 1G5AA 3DHUA 4KGLA 2CHOA 1QHZA 3MUY1 1Y7VA 3SCWA 2WWDA 3ARQA 2X0HA 1B9ZA 1H2JA 3WEOA 5IFTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1UKT A;  1CLV A;  3QOM A;  3AHY A;  5FOO A;  1DWG M;  1FFQ A;  3N11 A;  1HKJ A;  3W25 A;  1W3K A;  4V27 A;  2GJP A;  2CXG A;  4DWS B;  1OIN A;  3W81 A;  1FP8 A;  3FHA A;  1OSE A;  1TR1 A;  2J78 A;  1TE1 A;  1GQK A;  3WD1 A;  4AZB A;  4MDO A;  3SCR A;  4AC1 X;  3N13 A;  2ZUV A;  1JZ2 A;  4WKA A;  2QF8 A;  2VUY A;  5HDR A;  1OIM A;  5BXT A;  1ISZ A;  5BRP A;  2DSV A;  3UG5 A;  1JXJ A;  1KGW A;  1TA3 B;  2WKL A;  4OBS A;  5TD4 A;  2OSX A;  2WBG A;  2BXY A;  2D3N A;  2VZT A;  1QI4 A;  3ZJK A;  1TMQ A;  4PMV A;  3QHM A;  3VDH A;  1AVA A;  1BHG A;  1Q6F A;  2OYL A;  4PMQ A;  4U5I A;  1XHG A;  1HX0 A;  5ABF A;  1WAW A;  1OBA A;  1BVZ A;  2VNC A;  1E6X M;  3T2P A;  2WHL A;  1R7O A;  3AIE A;  1DP0 A;  2WKG A;  1NP0 A;  3VMP A;  1C7S A;  1J11 A;  4ZEN A;  4WLC A;  1UYQ A;  2WXD M;  3WEL A;  1Q6G A;  1NWT A;  2ZWZ A;  1UZ1 A;  2CCR A;  3AS3 A;  4PYS A;  3RME A;  3NSM A;  2WZH A;  3THC A;  3UET A;  4D6H A;  1XSK A;  3VX0 A;  2G3I A;  1GHS A;  3BAW A;  1V3M A;  4F9J A;  2EJ1 A;  2WNW A;  1K6A A;  4D1J A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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