3ZJKA

Crystal structure of ttb-gly f401s mutant
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
424
structure length
424
Chain Sequence
EKFLWGVATSAYQIEGATQEDGRGPSIWDAFAQRPGAIRDGSTGEPACDHYRRYEEDIALMQSLGVRAYRFSVAWPRILPEGRGRINPKGLAFYDRLVDRLLASGITPFLTLYHWDLPLALEERGGWRSRETAFAFAEYAEAVARALADRVPFFATLNEPWCSAFLGHWTGEHAPGLRNLEAALRAAHHLLLGHGLAVEALRAAGARRVGIVLNFAPAYGEDPEAVDVADRYHNRFFLDPILGKGYPESPFRDPPPVPILSRDLELVARPLDFLGVNYYAPVRVAPGTGTLPVRYLPPEGPATAMGWEVYPEGLHHLLKRLGREVPWPLYVTENGAAYPDLWTGEAVVEDPERVAYLEAHVEAALRAREEGVDLRGYFVWSLMDNFEWAFGYTRRSGLYYVDFPSQRRIPKRSALWYRERIARA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Semi-Rational Approach for Converting a Gh1 Beta-Glycosidase Into a Beta-Transglycosidase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Thermus thermophilus
molecule keywords BETA GLYCOSIDASE
total genus 155
structure length 424
sequence length 424
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2013-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3zjkA00
3MS8A 3ARVA 1X1NA 2A3HA 1KXTA 1XSIA 3M07A 5IHRA 5A69A 3D5HA 3TA9A 4A3HA 4EKJA 5I0DA 3AIBA 4KGLA 1EA9C 3F4VA 2DT1A 4IPLA 1M01A 1BHGA 3ARTA 3EMCA 2XPKA 3W4RA 1MFUA 5CGMA 3ZO9A 3WDIA 3N12A 3QHOA 4J3UA 1BFNA 1CNVA 2OSYA 1G9HA 1QNOA 2WANA 2ZOXA 1GCYA 3WQ6A 3VDCA 1J0YA 1GQJA 1JFHA 2ZUVA 1BG9A 1L8NA 1K9EA 1ISYA 5GPRA 1KWKA 5IFPA 1JD7A 4TOQA 5CQ1A 1E6RA 1BSIA 1BYDA 3WQ4A 5HBFA 1CGXA 1FH7A 3FHQA 2X09A 2G8ZA 3WF2A 4KGJA 4Z2JA 2DDXA 3VMOA 3AMKA 3WNKA 1R86A 4GI6A 2VVSA 4PMUA 3SCRA 3WSUA 1XSKA 2FHCA 5LA2A 3K4DA 1VENA 4W5ZA 4U2YA 4Z2KA 1WDQA 3RM8A 2PBOA 4AIUA 4Z2GA 1QHPA 3BAXA 3L4XA 5D8ZA 2OYKA 2XWDA 1H2JA 1GOWA 3VNZA 1GOOA 2OYLA 3CGTA 4P7QA 4M1RA 4ZENA 1BVZA 3W28A 4JIEA 2JEPA 2CBJA 3AIEA 2VUYA 5E0FA 3VGFA 3EDDA 2BY1A 4UQEA 3WUFA 1E9LA 1P6WA 1ZJBA 1CGTA 1WDSA 4B9ZA 1VBUA 2VRQA 4J27A 2XM1A 2FH6A 5IFTA 3CUIA 4AEFA 2CKRA 2ZXQA 1EO7A 1JF5A 4AIEA 1WZKA 1KXHA 1TA3A 3ECQA 2Y24A 5FOOA 2IUZA 3GXIA 1JXJA 3VIFA 1I75A 2IXUA 4LQ1A 4JHOA 4UFMA 5A1AA 1W91A 1X6LA 3MMDA 1NWRA 2CEQA 1FH9A 4FLRA 4D1IA 5A6BD 4OBSA 4BQ2A 1XD0A 3OGRA 3WUGA 4R27A 3ARYA 3D3AA 2W66A 3AZRA 5E6YA 3VIJA 3WF1A 5LA1A 1UZ4A 3N11A 2CHNA 4GO8A 4QFUA 3AS2A 3UG4A 2X05A 3CUGA 3WNMA 1JDCA 1WKYA 3AYSA 1ITXA 3S6TA 3N15A 4MPKA 4J3WA 1TG7A 3POCA 4P7OA 3U7VA 4JCMA 2C8NA 1UH4A 4UQDA 2ZUNA 4IPNB 4GQRA 1OM0A 1I1XA 3AHYA 2EQDA 2WWCA 1CTNA 1J0JA 1UR0A 4UOQA 2DIEA 1CXHA 1C7TA 4AYSA 2BV9A 4WSJA 5TD4A 4W8BA 5A6LA 1BYCA 3ARSA 4P8UA 3CZ8A 1WAWA 3TOPA 2V38A 3G6LA 4HPHA 4JZ5A 4HZ6A 1E0VA 1JZ7A 4D6GA 1O6IA 5A94A 1LLOA 3EDJA 4LYPA 4DWSD 4CU7A 1CBGA 2VOTA 1XC6A 3GNPA 3HU7A 2CYGA 4F66A 1PJ9A 4MDOA 2JEQA 1H0GA 2J7FA 3UR8A 2V3DA 4UQCA 1W2PA 5DEZA 4XV0A 2D0GA 6A3HA 3BMVA 3W29A 3SEPA 4PTVA 5I77A 1PX4A 5A6BA 5E09A 4FK9A 3KL5A 2FH8A 1UR9A 3WBAA 5AC4A 4LX4A 4V27A 5F7UA 2BS9A 4M80A 2XVPA 4F9DA 1QVBA 3GBDA 1LWJA 2W5FA 3ZT5A 4JFVA 2ZE0A 2WHJA 3VIKA 3OLGA 4M56A 3S2CA 1V6WA 5ABHA 2QMKA 3L2MA 1KGWA 4PN2A 5DO8A 3F5KA 4UFIA 2F2HA 2HISA 2ZUMA 3OLIA 1WO2A 4PRWA 3WELA 1Q6GA 1PZ2A 3HJEA 1Q6EA 1SYTA 1V6YA 1MQRA 2DH3A 1JGIA 1VIWA 1H3GA 3NDZA 2O9OA 4NF7A 1BF2A 5DF0A 3MUAA 4B15A 1UKQA 1J0HA 2WC7A 4CN6A 4HA4A 1MW1A 1W9VA 4E8DA 1QI3A 3W38A 3RO8A 4W7WA 4AD3A 1EDGA 4UR9A 2J77A 3T08A 4HTYA 1VF8A 3GH7A 4DWSA 2CETA 4UOJA 1HKMA 5A3HA 1WCGA 5FL1A 1D7FA 1JAEA 2G4FA 3T09A 1KR1A 5A8MA 4J3SA 3O9NA 3AQUA 2EPLX 4Y7EA 4DM2A 2YL9A 1CXIA 3AXIA 3CZKA 3MO4A 1DWGM 2C0HA 2VI0A 1HJSA 4PSPA 4OUEA 1VFFA 2VX7A 3WL0A 3W53A 2EPKX 3WMSA 1UA7A 3EBVA 3A4XA 1CXLA 1FP9A 2YL6A 4X9YA 1UWUA 2DH2A 2QF8A 4QDMA 3APGA 1UD5A 5JBEA 2XJ7A 5E6ZA 3EDEA 2WKLA 2WMGA 3SCNA 2XTKA 1OGSA 2WVUA 5C71A 2GFTA 2F61A 4TTGA 1XSJA 4UFKA 1ZL1A 1UD6A 2W91A 4PMOA 5JBFA 5JBDA 5GNXA 1VBRA 5I3DA 1Z32X 3NSXA 2QPUA 2GDVA 4GINA 4J3TA 4C7FA 4YPJA 2XVNA 2WSPA 3SCQA 4QLLA 4GIAA 4HU0A 4S3JA 4J7RA 1E6NA 3BSGA 1Q4NX 4X0VA 2VURA 1KFWA 2MANA 4R5EA 1EQPA 1KQZA 3AHTA 1J18A 2VJXA 4CD6A 1UR4A 1OT1A 1E71M 1BVNP 3TTYA 5ABFB 2PI6A 4AC1X 4CCCA 1UR2A 4QP0A 4W89A 1CGVA 2WMFA 1FHDA 3WNPA 2VL4A 4DUWA 1DWFM 1V3KA 2BY0A 2W63A 1AQMA 3PZTA 1KGUA 1EDQA 2YL8A 3UEQA 1US3A 4B3KA 4UFLA 5D9OA 1PIGA 3GH5A 1UKSA 5HNNA 3I3DA 1HX0A 3AXHA 4N42A 4CVUA 1OT2A 6CGTA 4AISA 4D6JA 2CESA 1MYRA 5A8QA 3UG3A 2V5DA 4PMRA 3VMPA 3WN6A 2YIHA 4WF7A 4AZGA 1W3HA 2ZX8A 4OIFA 1J0ZA 1H5VA 5FCZA 1W9XA 1RH9A 1QI5A 3K1DA 3AS3A 4YHEA 2RGLA 3WQ8A 3WF0A 1QNSA 2GJXA 1H49A 1QBBA 1J0KA 4TXEA 2JIEA 1JYVA 1JYNA 1QI0A 3HMCA 1GOQA 1OIMA 3PZ9A 4ACYA 3MMWA 4F8XA 1MVYA 3AICA 2PWHA 3A4WA 5D9MA 1TR1A 1ZBKA 1E73M 3SCWA 1NOWA 2BXYA 5D9NA 5DMYA 2W61A 2Z1KA 3K8LA 5CLWA 3DYPA 1UWQA 4P7LA 1E6XM 3A4AA 5HPCA 5BRQA 1OCQA 4LGXA 1E0WA 2A3BA 2GK1B 1K9TA 3O2LA 2DIJA 4HU8A 4MJ4A 3UCQA 4KWUA 4H41A 5A6KA 1FHLA 1JZ6A 3VGBA 4OOZA 2FHBA 3SUWA 4M8UA 1E43A 1JIBA 2WMIA 1J11A 2OSWA 4F9JA 4JFWA 1R8LA 4IISA 1UH2A 2ZX6A 3DYMA 1QHOA 1EH9A 1LJYA 1SMAA 2J7EA 4AEEA 3VM7A 1UQZA 3MSDA 4URIA 1JFXA 5I24A 1H11A 2D23A 2ZIDA 3VIPA 4PTMA 4CU8A 1DWHM 5FD0A 2GK1A 3W27A 3N17A 5FKYA 3EMZA 5M5DA 1E6PA 3ZM8A 1W1PA 3K46A 4IM4A 3WDHA 4B3LA 2EXOA 2OWWA 1HKJA 1J01A 3WMBA 2CIPA 4MADA 5CG0A 3AMGA 3DHPA 4JHZA 3L4WA 3AI0A 4W7VA 2C7FA 3VIIA 3NUKA 4D71A 3MSGA 1W3KA 3ARWA 2D2OA 1JZ4A 1D2KA 2YKKA 4JKMA 5ECUA 1O7AA 2EO7A 1FFRA 2YOCA 1ZBCA 3OIHA 3L4VA 3ZJKA 3CUJA 4AZBA 1ODZA 5EB8A 5HPOA 1V0KA 1QPKA 1E5JA 2NT0A 2XSAA 2JALA 3FAXA 2CERA 5CLTA 1E4IA 2BVYA 1HP5A 1QNPA 1DWJM 1JDAA 4U5KA 3KL3A 8CGTA 1LWHA 3PTQA 4L4OA 1C8QA 4WKFA 2WWDA 4HZ7A 3WKZA 3VD7A 3AYRA 4CD7A 3RIKA 1XD1A 2XHYA 2WPGA 1JNEA 2QMJA 2VZUA 2A3EA 2VR5A 2JF6A 3THDA 3RM9A 2B31A 1LL6A 1EO5A 5EMYA 4CD5A 1E4MM 5DT5A 2Q8XA 3PZIA 1UG6A 2VX4A 3T0DA 3PZNA 2J47A 3WD3A 2VCBA 2G3MA 5I78A 2J4GA 1UWTA 5A8PA 3T2OA 4MB1A 3VD9A 3WUEA 3OA5A 2D3LA 1FA2A 2DSKA 3CUHA 1XCWA 1HVQA 1WZMA 2PWFA 1EOKA 4UZUA 3II1A 1Y7VA 1E70M 1RD6A 4Z2LA 3WH5A 3ZIZA 1TVNA 1BPLB 2OYMA 4TVDA 3I3EA 1QW8A 1YQ2A 2EPOA 4QAWA 4BQ5A 1JXKA 3DYOA 1TE1A 2ZUTA 3GXDA 4QCFA 1GJUA 1XCXA 1GZJA 2O9RA 3BMWA 3OGVA 2XVKA 4N0RA 1ISXA 4U3CA 5E9AA 2FGLA 3OZPA 4UZSA 4PSRA 4HA1A 4GO9A 2WHKA 1PBGA 1V0MA 2CNCA 2FGZA 5A95A 4MJ2A 1XYZA 3AZTA 1E1FA 5DT7A 1M03A 1HJWA 2WVSA 1FH8A 2YDQA 2D3NA 1C91A 1VFMA 2XFFA 1JZ2A 4PMDA 5BROA 2Z1SA 3T2QA 2WYSA 5A6AA 1FOBA 2VZTA 2X2YA 1FFQA 2YL5A 5KEZA 2CBVA 1OIFA 3RDKA 2G41A 3T0BA 4NRRA 3WD0A 4ZFMA 1B3XA 3FHAA 2J78A 3ZJ8A 3RMEA 3CBWA 2J8GA 1BAGA 3W0KA 5D9PA 3AIUA 3BLKA 4FLOA 2CKSA 1JNDA 4RL3A 1QOXA 3WH9A 1JD9A 2WW5A 4TUFA 1CECA 1NM9A 1C3FA 2D0HA 2DT0A 1U30A 1RPKA 1CIUA 4GI8A 3LPPA 7CGTA 1R7OA 2XYLA 2QHAA 1S46A 3GM8A 1LL4A 1V3JA 3SCPA 1V0NA 1KXQA 4KRUA 3T2PA 4ATLA 4CCEA 3VUPA 5JIPA 1WE5A 2BVDA 5BCAA 1G01A 3BXWA 2DGAA 3LPFA 2CPUA 3LMYA 2WMKA 1NWUA 5AY7A 3OB8A 1VFUA 2ZICA 1JZ5A 1C93A 1B1YA 3KEHA 3ARUA 3VIGA 5IXEA 4EE9A 1H0IA 4ML4A 4XB3A 1ITCA 1BTCA 2J8FA 3MV01 1MXGA 3PZUA 1NARA 3N1AA 4FF5A 4P7NA 4AD5A 2VX6A 2PF0A 4CCDA 1GOKA 3OLDA 3MV11 1HJUA 1QI4A 4LYRA 4MNLA 1ZS2A 4D6HA 2DSVA 3WEOA 1K9DA 3WH6A 4MB4A 4UFJA 3UG5A 1E72M 3AHVA 2XFYA 4J3XA 3W25A 2XGBA 3AFBA 5CXPA 2TAAA 1CLXA 2WB5A 3RILA 3VNYA 1B3WA 2YA1A 3SCUA 1J9YA 4WKHA 4U2ZA 4JFTA 2CBUA 4W93A 4CU6A 1HL9A 2WAGA 1NOFA 3VINA 1KCKA 1RP9A 1US2A 2VO5A 3CHCA 1UD2A 3WH7A 1V3LA 4AZCB 1UD4A 2E8ZA 5EFDA 3PZOA 2UY3A 2VNCA 2PWGA 1WPCA 5BXSA 1LG1A 2FDMA 3ZT7A 3WENA 3BAJA 1B90A 2CITA 4TX8A 2V3GA 3POHA 4U3AA 5A2AA 1UKTA 1KCLA 2GVYA 3VGDA 3PZVA 3AROA 4C7DA 3B9EA 3TTOA 4UNIA 1NP0A 2PBGA 3F5JA 5CPTA 1E4LA 3BAKA 2ZX7A 4K68A 4ZEPA 4HMCA 3WD2A 1SFSA 1E1EA 4XZWA 4AZCA 1Q6DA 4XX6A 2ZXDA 1VRXA 4E8CA 1KGXA 3VILA 3MUIA 3SIMA 2D20A 2YBTA 2BHYA 1V02E 4MB3A 2G3NA 3FW6A 3WEMA 2WVVB 4DWSC 1BYAA 3SUVA 3GZAA 1OB0A 3VO0A 1ISZA 3OG2A 3VIOA 1XH2A 4AMCA 3EMQA 1PEZA 1XGZA 2GUYA 5HXMA 1Q6CA 3LPGA 1CGWA 3WQWA 3WFLA 1K9FA 3EDKA 5BXPA 3WNNA 1XV8A 2EJ1A 2VX5A 3ZSSA 1VAHA 5BWFA 4BA0A 4D6CA 4GKLA 4W5UA 2XIBA 2A3AA 1HP4A 3AS0A 1ECEA 1E4NA 3DECA 3WQVA 1KBBA 4H8UA 4P8XA 3BCDA 4U5IA 1E6QM 3ZJ7A 4CGTA 3O6AA 1OD8A 3SCVA 2W62A 2DT3A 5D4YA 1WP6A 4W88A 1HJXA 1E6SM 2DT2A 2W4XA 4TTUA 5JIWA 2O9PA 3F5LA 2E9LA 4GXPA 1MW2A 1GQLA 3TONA 1MQPA 4U33A 3VKKA 2DQXA 5BYWA 1W32A 1CZ1A 1GORA 1UKPA 1WB0A 1ESWA 2VCCA 2JE8A 1E56A 1BGAA 2PC8A 3SUSA 4TX6A 3T0AA 4MNMA 1ZBVA 3CTTA 3L4ZA 2HVMA 4FLQA 2BHUA 4W86A 3BAWA 1R85A 5M17A 1DWIM 4PTXA 3OGSA 5ABFA 1UYQA 2WHLA 3GBEA 4HPGA 3PZGA 3IJ8A 2J7GA 3LPOA 2VT0A 3CH9A 3WNLA 1GVYA 1K6AA 1M53A 2RGMA 1J0IA 3J7HA 3M6DA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3MS8 A;  3ARV A;  1X1N A;  2A3H A;  1KXT A;  1XSI A;  3M07 A;  5IHR A;  5A69 A;  3D5H A;  3TA9 A;  4A3H A;  4EKJ A;  5I0D A;  3AIB A;  4KGL A;  1EA9 C;  3F4V A;  2DT1 A;  4IPL A;  1M01 A;  1BHG A;  3ART A;  3EMC A;  2XPK A;  3W4R A;  1MFU A;  5CGM A;  3ZO9 A;  3WDI A;  3N12 A;  3QHO A;  4J3U A;  1BFN A;  1CNV A;  2OSY A;  1G9H A;  1QNO A;  2WAN A;  2ZOX A;  1GCY A;  3WQ6 A;  3VDC A;  1J0Y A;  1GQJ A;  1JFH A;  2ZUV A;  1BG9 A;  1L8N A;  1K9E A;  1ISY A;  5GPR A;  1KWK A;  5IFP A;  1JD7 A;  4TOQ A;  5CQ1 A;  1E6R A;  1BSI A;  1BYD A;  3WQ4 A;  5HBF A;  1CGX A;  1FH7 A;  3FHQ A;  2X09 A;  2G8Z A;  3WF2 A;  4KGJ A;  4Z2J A;  2DDX A;  3VMO A;  3AMK A;  3WNK A;  1R86 A;  4GI6 A;  2VVS A;  4PMU A;  3SCR A;  3WSU A;  1XSK A;  2FHC A;  5LA2 A;  3K4D A;  1VEN A;  4W5Z A;  4U2Y A;  4Z2K A;  1WDQ A;  3RM8 A;  2PBO A;  4AIU A;  4Z2G A;  1QHP A;  3BAX A;  3L4X A;  5D8Z A;  2OYK A;  2XWD A;  1H2J A;  1GOW A;  3VNZ A;  1GOO A;  2OYL A;  3CGT A;  4P7Q A;  4M1R A;  4ZEN A;  1BVZ A;  3W28 A;  4JIE A;  2JEP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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