4A21 | Genus

Total Genus 115

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	115
sequence length	342
structure length	314
Chain Sequence	PIATPEVYAEMLGQAKQNSYAFPAINCTSSETVNAAIKGFADAGSDGIIQFSTGGAEFGSGLGVKDMVTGAVALAEFTHVIAAKYPVNVALHTDHCPKDKLDSYVRPLLAISAQRVSKGGNPLFQSHMWDGSAVPIDENLAIAQELLKAAAAAKIILEIEIGYTSPEDFEKTIEALGAGEHGKYLLAATFGNLRPDILAQGQQVAAAKLGLPADAKPFDFVFHGGSGSLKSEIEEALRYGVVKMNVDTDTQYAFTRPIAGHMFTNYDGVLKVDGEVGVKKVYDPRSYLKKAEASMSQRVVQACNDLHCAGKSLT

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Mycobacterium tuberculosis
publication title	Glycolytic and Non-Glycolytic Functions of the Fructose-1,6-Bisphosphate Aldolase of Mycobacterium Tuberculosis, an Essential Enzyme Produced by Replicating and Non-Replicating Bacilli pubmed doi rcsb
molecule keywords	FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE
total genus	115
structure length	314
sequence length	342
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2011-09-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01116	F_bP_aldolase	Fructose-bisphosphate aldolase class-II

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4a21A00

7TIMA 3RMJA 5LHFA 4N02A 2GQAA 4IX0A 5D33A 3GDRA 5HR6A 1W31A 2X1UA 2A2IA 1Y0EA 4O53A 4LVFA 2AGKA 1CI1A 4DF1A 3LXCA 2QUUA 1FCQA 4ZQRA 3B0PA 2A1YA 1GQNA 2O7SA 1TTQA 1Q45A 1YTKA 2ATSA 3E0IA 3HOJA 4E0CA 2CLKA 1R30A 3O8AA 4JY8A 1OABA 4BK9A 4UMCA 4NJGA 1TTPA 3LTYA 4UR8A 1QNVA 4GC4A 1XUZA 3DFOA 3HG3A 1C29A 1JCXA 3EWUA 5AYZA 4JYDA 1H5YA 3LHUA 3W7OA 5CZTA 1XC4A 2GQ9A 1KM6A 3CU2A 3W76A 4I7WA 2FB3A 4NJJA 3L67A 4QIUA 3HIJA 1V5XA 1T96A 2RDTA 3LRKA 3P82A 4WZHA 2E5CA 2VELA 1Z44A 3TNOA 1A53A 2AAMA 1ME8A 3W1LA 4R53A 5CG7A 1J2WA 1LM1A 3HGJA 2QAPA 2GVGA 2F84A 3NQCA 5HWMA 4RXGA 4AHQA 2C1HA 5L6UA 4XTDA 1XBYA 4RLIA 3DFSA 4L4LA 3PB0A 2RH9A 1SFLA 1GTHA 4FX6M 3T7VA 3W86A 5G2HA 4MUZA 3S5ZA 4O8RA 4ALDA 2GVLA 1BTMA 2WNNA 3UQNA 5KINA 3TR2A 1XBZA 1RVGA 3TDFA 2YXGA 4ZL1A 3QRHA 5HJLA 3GDMA 1PHQA 5FF4A 5D30A 3QC3A 3LCXA 3G0SA 2FPYA 2GJLA 2XN1A 3W7KA 3W85A 4LWWA 2DZTA 1TO3A 1JR1A 3S1WA 3DH7A 3TW7A 1XM3A 3NQEA 3B05A 4GUFA 2QAFA 1O95A 3BLEA 4O19A 3UY7A 1EPXA 2RKXA 3PSWA 3W2UA 1DV7A 5E1QA 3ABSA 1OHLA 3OVRA 4WXYA 3NQGA 3TJXA 2WSRA 2ZTKA 2E6YA 4CQ9A 4NVTA 2RHGA 3NQ2A 1GVRA 1N7KA 3QZEA 5L9FA 1ICSA 4UNLA 3BV4A 3G1AA 4KKXA 1SUXA 1N8FA 1LLZA 2ALDA 2E6DA 5LNWA 3M41A 3PS7A 1LOSA 5KZDA 4RKAA 4AHOA 2GOUA 3UWZA 4Q4KA 1XL9A 1JJKA 1ONRA 3F1QA 3Q58A 1IIHA 2QJIA 2DJXA 2OMAA 1SO5A 1G69A 3MYOA 3CM4A 5KSWA 3STFA 2FFCA 2QKFA 2WPBA 4UUIA 3OIXA 4NJKA 3HPXA 3ELFA 3E96A 2OT0A 3P80A 4R33A 4X9SA 1JCYA 2WV8A 1KM0A 1SW0A 5BNKA 2A4AA 3E9AA 2YW4A 4S2CA 1IXQA 1F5ZA 1KLZA 3F03K 3I65A 4IMGA 4HNTA 3W72A 2BSLA 3DKLA 3QJAA 4N2YA 3PBWA 3TXVA 3L66A 2ZRZA 4HSOA 4FIRA 4UNKA 1G67A 3HQ1A 3NGJA 5HUOA 1AW2A 5K4XA 1OFAA 1R47A 4TX9A 1DORA 4C1LA 1G4TA 3KFTA 3W7RA 1GVFA 1MEIA 3EKLA 4OE7A 2YGYA 3CB8A 3CLMA 4LVAA 3GDTA 4OWGA 3NQMA 1P5BA 3LV5A 4ORMA 4AWTA 3S0CA 2E09A 3MYPA 3W2NA 3W70A 5FF7A 4PC8A 3E49A 2QUTA 2FQIA 5LHEA 2ZDRA 1Z41A 3LI0A 1T99A 1FUYA 1J5TA 4G1KA 3M9YA 1TQXA 2ZZ6A 2ZZ4A 3VFLA 2NXGA 5BMXA 1K3UA 3TK7A 2VC6A 4RX0A 3L21A 1UASA 1XXXA 4FNTA 1KTBA 1QPOA 2B7NA 4MY8A 5D38A 3ZWSA 3TJLA 2Z6JA 2A7PA 4POCA 3LXAA 3TIMA 1XCFA 3ABQA 3NO5A 3ATZA 4ADUA 3KX6A 2V82A 2FPVA 1F05A 2VFHA 3W87A 5C6MA 4LVBA 3V75A 3GLCA 3LXBA 3HF3A 3NQDA 3W1MA 1W1ZA 5C2XA 4KFPA 4YWIA 3LRLA 3PSVA 1NF7A 1Q6LA 4TU1A 1EUAA 1YDNA 1WBJA 4J9JA 2BLEA 2YR1A 3GNDA 3NPUA 3M7WA 1FCVA 2Y62A 2QJGA 1H50A 3C8FA 4FEZA 3UD6A 1M6JA 5DCDA 3HG5A 4LW7A 3GKAA 2C6QA 4E2BA 3W7EA 4NX5A 4LT9A 1H7OA 3PC0A 4AAJA 3PBYA 2C18A 1VH7A 2VFDA 1OVDA 1TV8A 4BWLA 5HULA 1J4EA 3TMQA 3N19B 2Y6ZA 4N6FA 4IWWA 2J27A 5FEWA 2JK2A 3PY2A 3MHUA 3P8IA 5C55A 3W1AA 2W79A 2Q3RA 5LGZA 2QR6A 2C3ZA 2FDSA 5LZLA 2VFIA 1GYLA 3IEBA 2QCEA 2CWNA 4K36A 3W6YA 3W1TA 1KBIA 1K7XA 2YW3A 4UTTA 4GUHA 4DPQA 2A7RA 3GYEA 4B5NA 2X1RA 1W5OA 3NQ6A 2ZTJA 1EP1A 5DELA 1YDOA 2CLHA 2EKCA 4UCGA 5FF0A 2HS8A 2ZRUA 3TSBA 3IGUA 2YSWA 2DU2A 2G96A 4BI6A 1A5BA 3NOEA 1JCJA 3N34A 2FIQA 3FKRA 4Z1CA 1EEPA 3FYPA 2DJLA 3EWYA 1W3IA 3BLIA 3BW2A 3GR8A 4YMZA 3WK0A 1KM1A 1TPB1 4ZMGA 3KHJA 1HG3A 4BF9A 3I7QA 3VI2A 3M6YA 2PRMA 3MP4A 4NXKA 1I4NA 2E1DA 4CCDA 3M5XA 4FB7A 4UTKA 3GVGA 4RK8A 3DFPA 3QW3A 4A2SA 4GXMA 2H3DA 3S42A 3D0CA 3HJZA 3O63A 5AHIA 1O94A 5AHEA 4BR1A 3PF3A 4JTFA 3UWVA 1TJPA 4NJHA 4FIQA 2ZZ1A 4M5PA 5HUPA 1YADA 4LU0A 3LBMA 2V81A 1ICPA 1WX0A 3W7LA 2ZRYA 2Y89A 4O10A 3C6CA 4U28A 3SI9A 1R2SA 3OA3A 4WQ6A 2OCZA 3G8EA 4OV4A 5GVJA 1SW3A 3MP3A 4JTIA 1KV5A 4AF0A 1SO3A 4DPPA 2CZDA 3W88A 1YYAA 3TSMA 1NFBA 1EP2A 1FWWA 3QMRA 1DL3A 3SECA 1WYIA 3QW4B 4MY9A 2QCFA 4JYFA 4C1KA 1DOSA 2I1OA 4GE8A 1WOAA 3LM7A 3C4UA 4JTEA 3LOTA 2BWGA 3R2GA 3G22A 3LHWA 1OX5A 2CZ5A 3FA5A 1QFEA 5F2LA 2GQ8A 3CEPA 3S6DA 3OG3A 3CC1A 2YZRA 1OYAA 2Y88A 1EX5A 2A0NA 4IMFA 5AC8A 5AC6A 1S5VA 2EPHA 2FTPA 2Y7DA 3FIGA 5K4ZA 4QQ3A 4XZ9A 4AF0B 2DZXA 4QAIA 4MZ1A 3N2MA 1NSJA 1JCMP 4CLMA 4LTSA 5K3VA 1DKWA 3L5MA 2H3BA 3L2IA 4GNJA 1I2NA 3UWWA 4CQAA 1S3HA 1OX4A 3C2RA 2Q8LA 1H7RA 2JKEA 2VFGA 3C2OA 4I7UA 3IVSA 5EPDA 1LYXA 3G18A 3EWBX 1VYPX 3AJXA 3DAQA 3TV8A 3W1PA 4PFMA 4DELA 3DHDA 1MEHA 3HMJG 3PBVA 3W83A 1OFPA 3P5ZA 4HKPA 2A21A 3SW6A 4DF0A 5DY3A 1SSGA 4JIPA 4P2VA 3CHVA 3JS3A 1TIMA 3NL2A 4QJ1A 3DBPA 3GDLA 3EWXA 1EWEA 3GXNA 5SWUA 2CW6A 4H3DA 3BARA 4FF7A 4O50A 1ME7A 2YDAA 3IVTA 3L0KA 5FF2A 2CZEA 3NQ8A 4ZQCA 5F4XA 4UMBA 3NPWA 4ADTA 3TXZA 1G6CA 3W7CA 2FPTA 3AO0A 3LV6A 4X2RA 1H7NA 4LV4A 4EWND 4UFHA 1TQJA 1OX4B 3W7IA 1LP6A 3PB2A 3O16A 3SJ3A 3LHVA 4UC5A 3E12A 1QWGA 3C61A 4MFDA 4ICNA 5I3GA 4UFMA 1SFJA 3CIXA 1TYGA 1VJIA 3UXDA 1HFBA 4HIBA 1H62A 1GWJA 2OX1A 1JUBA 5FF3A 5HWJA 2NUXA 3THQA 3YPIA 2VFFA 2EAWA 1OF6A 1DVJA 1S5WA 1JCNA 5H91A 1PCKA 2GPTA 3G1SA 3L68A 4XTIA 3UZJA 3W75A 1ZHAA 1U83A 3BO9A 1P4CA 5LGXA 3P74A 3UZ5A 4PL1A 2Y7EA 3TQVA 5D09A 1OF8A 3LCWA 2PRHA 4M6PA 5KTLA 4YCPA 3I6RA 2Y7FA 4OU1A 4ADSA 4MLRA 4NJIA 4JICA 4YLWA 3EX3A 3G1FA 3M5YA 1X6UA 3M5VA 3MI6A 4MYAA 2H8ZA 4N4PA 2I9EA 3JR2A 3O05A 1T0OA 2Z1BA 2ZCGA 4ML9A 1WDWA 5D2TA 3LHYA 3HG4A 2J9YA 2ZZ7A 4MJZA 4LS0A 2Z0IA 5I3HA 2CZFA 2X30A 3RNDA 3I68A 2W0UA 5FEPA 2V2HA 4CCCA 1TTIA 2QUVA 3THAA 5LNRA 3UY8A 3TH6A 1KBJA 2ZRXA 3T55A 3QSTA 3IV3A 3TQKA 2P1FA 1WA3A 3BK0A 3LGEA 4OQVA 1QCWA 5LKYA 3ZFHA 1TCDA 3SR7A 3L5LA 2X16A 3A9IA 5C5YA 1FXQA 4A3UA 1UCWA 3B06A 5F2IA 2Y7GA 3A24A 1OFDA 3KRUA 3VKJA 5KZEA 4FXRA 4O18A 2NV2A 4HNNA 5CGQA 1LZOA 2QDGA 5KMYA 3TE9A 3M44A 4D2JA 5U4NA 4EF9A 4JTJA 1LRNA 4R7JA 4O1BA 1ZAHA 3TX9A 3R13A 4ZZ9A 1O4UA 2RDUA 1JUKA 1S5TA 1KLYA 1IGSA 1UBSA 1G4SA 4UTJA 2E68A 1Z48A 5G4WA 1W5MA 1H1ZA 5BRBA 1QPQA 3R8RA 1AL8A 1OX6A 4RR4A 4O0KA 2ZZ3A 5K2ZA 3MBDA 3S1XA 2E5BA 5E93A 4K39A 3DFQA 3N2XA 5F4SA 4QISA 3W1RA 1W5NA 3R5EA 1O60A 4DBEA 4QITA 2TYSA 3W7PA 4GBUA 4NT0A 1L6YA 1YXDA 1LDCA 4IOTA 4ZQNA 3S9YA 3W1XA 5CKSA 1X8FA 3P5YA 1AW1A 1W0MA 3EWZA 1VGAA 3K30A 2VEIA 3TC7A 1GOXA 4LRSA 1JQXA 1I2OA 3TA6A 3W23A 5EY5A 5AHLA 2BX7A 4S1FA 4BI7A 2CLEA 2C14A 2XN2A 2J9ZA 3B0VC 5I3IA 1VZWA 1SR9A 5EKYA 1K8ZA 3RFAA 4OBTA 5D2VA 1U5JA 3I7RA 5CPNA 5AYYA 4UFJA 1QOQA 2V8ZA 4FO4A 1D3GA 2LLEA 5FESA 4ZQMA 3HPSA 3UWYA 2W6RA 1B57A 1UJPA 3QFEA 1RZMA 1PV8A 3IGSA 5G2IA 3W73A 2R8WA 4LOCA 3BG5A 1OFEA 3GIYA 4K8EA 5AN7A 3LCGA 4AEOA 2NV1A 3LHTA 1P0KA 3W7HA 1SPQA 4TMCA 3CEUA 2X1TA 1RV8A 3BVJA 3TU9A 4LVDA 4JX5A 2E6AA 5G5IA 2WOQA 1HUVA 5TBOA 3MHFA 4O13A 4UTIA 3LRMA 3UYCA 3FJLA 2NUYA 3LI1A 1THFD 2G97A 3CWOX 3NDOA 3NL6A 1LLWA 4FXSA 3KRZA 4LC8A 4MVAA 3TC6A 3T40A 1MZHA 4AXKA 2A6LA 3NPXA 5K7JA 2DZUA 1PHWA 3W7NA 5AYXA 2R14A 1H63A 4UFKA 4Z1AA 5TQLA 3W84A 3GKFA 5D32A 3H55A 4JTHA 4IMDA 3KOFA 1M7PA 5AHFA 3CPRA 3RK8A 1KV8A 1L6SA 2TMDA 1I2PA 1L6WA 1GVSA 5LNUA 4M6VA 1F2JA 3W22A 4XKYB 3KVJA 3SZ8A 1TPFA 1EP3A 1WAUA 2NX1A 1FXPA 4PEKA 4CNOA 1A5AA 4O4VA 1FY6A 2E5DA 3DGRA 4Y8FA 1SU5A 4MIMA 1F7BA 3EX1A 4NNBA 1P1XA 3GZ3A 4O52A 4LY8A 1XDLA 1M7OA 2YX0A 5U7SA 4JIQA 1SZEA 3NG3A 1FWTA 3FFSA 1ME9A 3C2EA 1LBLA 3OBKA 4RZ5A 3G3DA 4EVZA 1LBMA 4O4WA 3LCIA 3S1UA 1TMHA 4I9AA 1TPDA 1H61A 1F73A 3A5FA 3NL3A 4N9CA 4EF8A 3P7YA 3U6WA 4ZVJA 3W2LA 1KTCA 1KM2A 3C2VA 4LC6A 4UMAA 2ISWA 3ANYA 5TIMA 1ZNNA 3QYQA 3Q2DA 3LTPA 4HNUA 3NQFA 3WJYA 1YLVA 5CSSA 5DLCA 4Y6GA 5K9XA 1FCUA 4CNNA 3W7MA 4ORIA 3MHGA 3EX4A 2I14A 4E38A 1KFEA 3NEVA 5HWNA 3N9SA 5ABTA 4K38A 2WNZA 1NEYA 5D02A 3T44A 1CW2A 3GAKA 1TPEA 4OT7A 1XFBA 1YTEA 4PL2A 3CT7A 4K37A 5CPMA 5EYWA 1FDJA 4FNRA 3EXRA 2XFWA 3HB9A 3WK1A 3B04A 4LS1A 2QDHA 5EMUA 1BKSA 2ZQ0A 1XBVA 3QQ1A 4TIMA 1QMLA 4FX8A 3A22A 3A21A 1F74A 1L9WA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4A21A

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