4A2SA

Structure of the engineered retro-aldolase ra95.5
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
PRYLKGWLEDVVQLSLRRPSVRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAYYSRKSPSGLDVERDPIEYAKFMERYAVGLSIKTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMSDFIVKESQIDDAYNLGADTVLLIVKILTERELESLLEYARSYGMEPLILINDENDLDIALRIGARFIGIFSMNFETGEINKENQRKLISMIPSNVVKVAKLGISERNEIEELRKLGVNAFLISSSLMRNPEKIKELIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Evolution of a designed retro-aldolase leads to complete active site remodeling.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INDOLE-3-GLYCEROL PHOSPHATE SYNTHASE
molecule tags Lyase
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 93
structure length 247
sequence length 247
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2011-09-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4a2sA00
2ZRWA 5F2GA 2FIQA 3BO9A 1SR9A 2WV8A 4N4PA 3HMJG 2Q8LA 3W07A 1HFBA 1GVSA 3DFSA 1N7KA 1XUUA 5G2HA 3B0UX 4AAJA 2H3BA 2OMAA 2R91A 3ZFHA 1G4SA 5HJLA 4PODA 3O8AA 3L0NA 2QUVA 3GB6A 2YCEA 4JTTA 3TNOA 1EP2A 2YW3A 4LUJA 2ZZ7A 3LI0A 3G3DA 4JXCA 1TPH1 4TMCA 2JKEA 1TTQA 2ZRZA 4N4QA 2E6YA 5D2XA 3E49A 1JVNA 3G0UA 2HTMA 2CZEA 2CLLA 3CU2A 2G96A 2GVLA 3C4UA 2JGYA 3STCA 1OFQA 5AHLA 4XTDA 3TMQA 1G4EA 3TDFA 2NZLA 4LRSA 1GT8A 2BWGA 1GYLA 3MI6A 2FJKA 2ZFAA 4FX6M 3L9CA 2NV1A 3SECA 4A2SA 3NGJA 5AHMA 3EKZA 3GDKA 3IGUA 4UMCA 5D02A 3NL2A 4L4MA 1GTHA 1BWKA 4TMBA 5LNWA 3W1LA 4MLJA 5FEZA 2H8ZA 3M7WA 5MHBA 4DQWA 2EKCA 1K8ZA 3ZWTA 5AYZA 1PIIA 3TSDA 1Q6OA 5H91A 3UWYA 3UY8A 2FB2A 2QCDB 4LTSA 5CG7A 4M19A 3N2MA 1LRQA 2WNQA 3DFOA 4A22A 3Q94A 1ZJIA 1OK4A 1QPOA 4W9TA 4FX8A 4RZ4A 3PG8A 1LOSA 5DN1A 4CCEA 3DFQA 2ISVA 3R89A 1FCUA 5F4SA 1Q6LA 3W7DA 5FF2A 4Y8FA 3OA3A 4J9JA 1YXDA 3LHTA 4AH7A 2P10A 4IMDA 1JCMP 1G4TA 4MFDA 1W54A 1PL9A 4NT0A 4LVDA 1NF0A 3LBCA 4NQ1A 4Q4KA 2DZUA 4UTIA 1SO3A 4ZQPA 4WXYA 1IXQA 3RMJA 1G4PA 4TIMA 3HPXA 1EA0A 1ZALA 3P8JA 4UFHA 4O1DA 4AB4A 2J9XA 3QZEA 3TA6A 3USBA 1VS1A 2RFGA 4DELA 1OF8A 4Y9AA 4LT9A 3NL5A 3GAYA 1Q3NA 2ISSA 3L21A 4GE8A 5DCBA 2CLOA 1QMLA 1NSJA 1EWDA 2ATMA 4Y90A 1U5JA 4BR1A 1OFAA 3HG5A 1AW1A 2QCFA 3W1MA 3DKJA 3F1QA 2DU2A 3R8RA 3LV6A 3T55A 1VC4A 4ONVA 4IPJA 1TTJA 5K7JA 3G1VA 5DBUA 1ME9A 3LHVA 1KLZA 3NZ1A 1IF2A 4I7WA 4HHPA 3CIXA 2BSLA 3DFPA 2R94A 4IOTA 3OEXA 3W1UA 3P60A 2V82A 4O19A 1OYAA 1KBIA 4AF0A 1OX4B 5AYYA 3EWWA 4IXHA 3MHFA 4JD4A 3SY5A 2V5LA 2BLEA 1KV5A 4UR7A 3W1RA 2DZXA 5D09A 4JTGA 4JTIA 3UYCA 5BMWA 3NQMA 3QPZA 1GG1A 3W22A 4WXZA 3ABQA 5D32A 1SW0A 1LDCA 3MYPA 4DEFA 4ZQOA 1OHLA 3G1HA 3W1NA 1AW2A 3P5ZA 4YCPA 3C52A 1MEWA 1YPIA 5FF0A 3EWYA 4N9BA 4DF0A 4LS2A 4GUIA 5AHEA 5LGXA 4HSNA 5HUOA 1H1YA 1TB3A 4ORIA 1X1OA 2UV8G 3UD6A 1N55A 4MZ1A 4UFLA 3QW4B 1KM5A 5KTLA 4EIVA 1K03A 3HO8A 2H6RA 3PC0A 1HO4A 2A21A 1LTDA 1OX6A 4K8HA 1FWTA 3G8RA 1JULA 3QEZA 4FXSA 1QCWA 4MYAA 3FLUA 4ALDA 1DQWA 1H7RA 3NA8A 3NL6A 5CGQA 2A7PA 4HN4A 4RXFA 1HO1A 3WJWA 3TQVA 3KRUA 2Q8ZA 3V1PA 3JS3A 3HQ1A 1RVGA 2Y89A 3FJ6A 1LZOA 1VYRA 3DZ1A 3PBYA 1JUBA 3TIMA 1E51A 3TR2A 5EPDA 4GWEA 2WO5A 1W5PA 1T99A 3G1AA 1D3HA 3TW7A 1UASA 3KVKA 5K9XA 1A50A 1ZAJA 3C3NA 2A5HA 4HNVA 1VZWA 4DPQA 3HG4A 3OVRA 3KFTA 2ZZ2A 1KTBA 4ADTA 3ATYA 4UTTC 4OGZA 1S5TA 1FCQA 2VKZG 5F4XA 3EX2A 3LCIA 3M5XA 5AOUA 3W73A 4TU1A 4YL2A 2A0NA 2VEMA 3WJYA 2GVGA 3W1AA 2B7NA 5AN7A 3M47A 5C2XA 1M7OA 2GQ8A 3CEUA 2QEZA 4CNPA 1X7FA 2DZTA 2CLIA 3NPWA 2QKFA 4CQ9A 1T96A 1GEQA 2NXIA 3TC6A 3LB0A 2YR1A 5BRBA 4QITA 1XKYA 1LBLA 4Z08A 1GVRA 1QWGA 3NO5A 1H7NA 4ZQCA 3W84A 3QQ0A 1XC4A 2QDHA 3NPVA 1WYIA 3S1XA 1W5OA 5G4EA 4O4VA 3IEBA 2Z6JA 1H63A 3N73A 2HS8A 1WBJA 4YMZA 2NUWA 5IBXA 4DO6A 2CWNA 3W86A 5J5RA 3EWBX 3AJXA 3R13A 1THFD 4ZQMA 4CNNA 1C29A 1KFEA 2TRSA 5AYXA 5AHFA 5E1QA 1ZAHA 3PUOA 5EYWA 3HG2A 3EX1A 1ML1A 1I2NA 2J9ZA 2CLEA 1SFJA 4Z0SA 4M6PA 1WAUA 5AC8A 5HR7A 1UCWA 3I68A 4QSHA 4O4WA 3QF0A 4LV9A 4DPPA 4IGHA 3W88A 3W7LA 4MLRA 2HMCA 2E68A 4UFKA 4RKAA 4OBTA 3W2NA 2TPSA 3QMTA 3BGJA 1MEHA 1C8VA 1EP1A 1LP6A 5D05A 4JGDA 4Y96A 3NVTA 2A6LA 3W7QA 2OJPA 1VYPX 3QSTA 3N2XA 4PL1A 3UXDA 3LBMA 1W1ZA 4LW7A 3FJLA 1FXPA 2JKAA 2WQPA 1XUZA 4O54A 4ZMGA 3QW3A 1SFLA 3LRKA 3PB0A 3PM6A 1XBZA 4H6KA 2GJNA 3TFCA 3W7HA 5DBTA 2B4GA 5EL1A 3M44A 4K7YA 3W2JA 3PB2A 5I3KA 1V7YA 1GZGA 4NUWA 4JNMA 2C1HA 3O6CA 2EF9A 1ZCOA 1Q6RA 2YGYA 3GX9A 2V30A 5KINA 3PG9A 1H7OA 3YPIA 2NWSA 1L6WA 2VFEA 4Q33A 3OVQA 3IIZA 4HPXA 3C6CA 4MY1A 4MYXA 3IIOA 3EX6A 4X2RA 2E77A 4A3UA 3W7KA 4E0CA 3UNDA 4JYFA 4XTIA 3S1UA 5DY3A 1I2RA 2Q3OA 3TQ0A 2V8ZA 4O11A 3HB9A 1QPRA 4KKXA 2VC6A 4OU1A 4HT3A 3P82A 2CLMA 5D04C 4O12A 2QUTA 3U2OA 5CKSA 4Z1BA 2VOMA 1UJPA 5KITA 2WNZA 4QJ1A 4GUFA 4JTHA 3GXNA 1A53A 2E5BA 5CZSA 1WXJA 4JX4A 3W72A 3W7JA 2ISWA 1F7BA 4A21A 3P84A 1XCFA 3W74A 1ME7A 4NU7A 4QISA 1WBHA 1O94A 2ZA1A 1GPWA 3LGEA 1B4EA 1TPFA 5LHEA 3SGUA 3LCWA 3WK2A 2JKPA 2ZRXA 3P67A 4L4LA 5D38A 4HNTA 1WQ5A 3NQGA 5DLCA 1BEUA 1LOLA 3HGOA 4NJJA 4WY0B 3TK7A 2DZWA 1H7PA 3NQ7A 4LRTA 3L67A 2ALDA 2OCZA 3SW6A 3IGSA 4FNUA 2JBMA 3G0XA 1WOAA 2J24A 4Z1AA 4O8RA 1A5AA 1FCBA 4PCFA 3RF9A 2PRHA 4DO5A 2E5DA 1I45A 4JX5A 3IVTA 1SZGA 3W7NA 1XM3A 5EY5A 4DO4A 3W70A 1QOQA 1TPWA 1BWLA 1YXCA 4ZVJA 3TC7A 1KW1A 3HBLA 4O1CA 4ZQRA 4PFMA 4CCCA 4IMEA 3WJXA 1J2WA 2Z0IA 4LU0A 4NJHA 4K36A 2QJGA 2WNNA 3NYZA 4NXSA 5D2WA 1KFLA 3NQ2A 4IMGA 1VCGA 2C13A 4RK8A 4MVAA 3W2KA 3S9YA 1DQXA 1DV7A 3ZR4A 2YFNA 1Q45A 1TQJA 1S3HA 1BKSA 5T26A 1S5VA 3LHYA 4DXVA 3C2RA 2CLHA 1IGSA 2LLEA 3W87A 4JY9A 3W7EA 3TJLA 1KLYA 2ZZ4A 1Z41A 2FTPA 3A24A 3L66A 3DHDA 4FB7A 1KV8A 4UC5A 5CZTA 2TSYA 1IIHA 3CQ0A 1AMKA 2QCEA 3CWNA 3GIYA 4O57A 1QPNA 3BV4A 3SR7A 4O13A 1OG0A 5A5WA 2QCHA 4UTTA 2RDWA 1OX5A 3TX9A 2OZ0A 3N9RA 4UTHA 4O1BA 5CPMA 4JTEA 3LXCA 2Y85A 2C19A 3INPA 4JICA 5AC6A 3BARA 4ICNA 3N34A 1EEPA 1H7WA 1O4UA 1RV8A 3I7RA 1LLWA 2ZYFA 3WJSA 4NJIA 3NEVA 5LNRA 2X1TA 1QPQA 2VEKA 4OV4A 1W3IA 4JIPA 4FO4A 4IX2A 4NZJA 1F5ZA 1FWNA 2XN0A 4XWUA 4XBSA 4XKYA 5G1TA 1TMHA 1MZHA 5D2VA 3UY7A 3B0PA 2BTMA 5LNVA 3TAKA 1X8FA 5HINA 5TIMA 3W6YA 1EWEA 1TPEA 4GUJA 5DY2A 4HKPA 3TV8A 4GBUA 5HQEA 3E02A 5HWMA 2ZRVA 2W6RA 3RFAA 3W85A 1P0KA 5F2IA 5FI8A 1TREA 1R2RA 3W2UA 3ELFA 3ABOA 4AVFA 3T4CA 1P0NA 1PVNA 2DZVA 1BTMA 1HG3A 4U4MA 4NNAA 4TX9A 4UXDA 2DP3A 3G24A 1RR2A 1QO2A 1WV2A 2FPYA 4AHPA 3LRMA 3NQ6A 2AGKA 4UFIA 1K7EA 2QCGA 1ZY9A 2FQIA 1JUEA 3RNDA 1TPVA 4UUIA 3MBDA 3DI0A 1ALDA 1WOBA 2Q3RA 2Y88A 2CZFA 1K8XA 3PY2A 3B05A 3B0VC 1ZENA 3EWZA 4WJEA 3CWOX 3LXBA 3PUDA 4U28A 5LZLA 1RQEA 2QCMA 1TJPA 1OYBA 2QCLA 3W1QA 3HF3A 4YWIA 1IXPA 1WX0A 4Z1CA 5IM51 1JCLA 3EEGA 1ZFJA 1ME8A 3B04A 2V81A 1UUOA 3LI1A 3DXIA 1B4KA 3CC1A 3QQ1A 5CPLA 1TV5A 2QCNA 2E6DA 1U83A 2A85A 1LLZA 3G0SA 2P0OA 1M7PA 1JCNA 1TSIA 3RU6A 1MXSA 1G7UA 2VFIA 3CEPA 1TV7A 1VGAA 2YZRA 3GDLA 3IIPA 3BW4A 4LVFA 4S2BA 1TQXA 2J88A 3CPRA 3GLCA 3O63A 3RLVA 2ATSA 2J6XA 5DXYA 1TV8A 1I4NA 1F6PA 2YX0A 2Y61A 2YPIA 3GK0A 5BW6A 5K3VA 5FESA 2C6QA 4O17A 3TKFA 5K9DA 1DOSA 2D73A 3G1DA 4JTFA 5KSWA 4PEKA 5F1VA 1A5BA 2HS6A 3GYEA 3KHJA 4LVBA 5CZJA 1L2UA 4UTWC 4RR4A 2B7PA 4K37A 4LC8A 1O95A 4XBKA 2PRMA 3S1VA 1M5WA 3M41A 2YDAA 1KFKA 3PBUA 3VE7A 4JR5A 4FIQA 5HR6A 5I3HA 1W31A 3VFLA 2ABAA 3EKLA 2ZRUA 1KBJA 4CCDA 2F84A 4QNEA 4LNYA 4ADSA 1D9EA 4AEOA 2RKXA 3I6RA 3LCFA 2BZNA 3E96A 3D0CA 3HGJA 1ICSA 5K4XA 3HJZA 2XN1A 1LOQA 1GG0A 1JRCA 3W7GA 1DL3A 5I3JA 1SZNA 4BK9A 3CHVA 1W8SA 4PC8A 3R12A 5CZ0A 1SQ7A 1DORA 3PBWA 3TW6A 2DZSA 3IVUA 3ZWSA 1VLWA 1RZMA 4UNLA 5KMYA 3GDRA 3C2FA 3P81A 4WY0F 4N6EA 1FDZA 3O6YX 3PF3A 1JQVA 4UFMA 3W23A 3MP5A 2QJIA 2H90A 1KTCA 3MI3A 4OE7A 3MHGA 4O53A 2Y7DA 5C6MA 2ZCGA 4RJEA 3SI9A 2YW4A 2GJLA 2CW6A 2OX1A 5HULA 4XZ9A 2C18A 4OV9A 2X30A 1I2PA 2VEPA 5EA9A 3FS2A 1VCVA 1YDNA 2Y7GA 3CLMA 1VLIA 4O1AA 1OJXA 4LY8A 1YTKA 4FNQA 4IWWA 3DHFA 3PS7A 3G1XA 3BLIA 1W56A 3A22A 3WK3A 1TJRA 2NWRA 3M6YA 2Y70A 3BG9A 4ZZ9A 1FBAA 3L68A 4KWWA 3KX6A 3MP4A 2A2IA 3H54A 1IXNA 1TRDA 1KM4A 4GNJA 1HL2A 3RLUA 1PCWA 2E6AA 3QMRA 3W7CA 2XN2A 2CLKA 4AMAA 5HUPA 1H51A 4DBEA 4O0ZA 1DKWA 4YXGA 4IPIA 2AAMA 3C0JA 3P8IA 3NR0A 3NZRA 1GJPA 3GXPA 4C1KA 3UWQA 3LM7A 4E2DA 4M7SA 1AK5A 3LERA 1AL8A 1SSGA 3UXAA 1F74A 1Z44A 4XQ6A 2PE4A 5C5YA 2B0MA 5FF4A 4AWSA 4Z0JA 2Z6IA 4AWUA 4H3DA 1XXXA 3STFA 5I3GA 2VENA 2I14A 1RQBA 3K30A 4PA8A 1Z42A 1TIMA 4FEZA 1J4EA 3DBPA 4BI7A 3BVJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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