4A2SA

Structure of the engineered retro-aldolase ra95.5
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
PRYLKGWLEDVVQLSLRRPSVRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAYYSRKSPSGLDVERDPIEYAKFMERYAVGLSIKTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMSDFIVKESQIDDAYNLGADTVLLIVKILTERELESLLEYARSYGMEPLILINDENDLDIALRIGARFIGIFSMNFETGEINKENQRKLISMIPSNVVKVAKLGISERNEIEELRKLGVNAFLISSSLMRNPEKIKELIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Evolution of a designed retro-aldolase leads to complete active site remodeling.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INDOLE-3-GLYCEROL PHOSPHATE SYNTHASE
molecule tags Lyase
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 93
structure length 247
sequence length 247
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2011-09-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4a2sA00
1DKWA 3ZS4A 1M6JA 3UWYA 3TKFA 1OFPA 4IMDA 3BPWA 1Q6RA 2Y88A 3S5OA 5G2WA 3BG5A 2JKPA 2Z6IA 2FPVA 2H8ZA 1EIXA 1OFQA 2W79A 1OX4A 3UNDA 3DH7A 1TYGA 4FXRA 3GIYA 3G1DA 1OFAA 1VS1A 4L4LA 1OHLA 4PH6A 4K6AA 4MY1A 1LROA 3MMTA 1WBJA 1QPRA 1MEHA 1QDSA 2E77A 3I68A 3OBKA 2ZFAA 5LNSA 2WSQA 1XFBA 3LCXA 4JX4A 3EWZA 4EOUA 1SR9A 5G1TA 1JRCA 2KZHA 4ALDA 3EX2A 2QCMA 3NYZA 2YSWA 5AOUA 5LNRA 1G4PA 3M9YA 3PM6A 4XWUA 3MP5A 1VYPX 1UUMA 4MFDA 1EWDA 5FF3A 1AW5A 3GAKA 4O12A 3W1AA 4FHAA 5HR7A 1H7WA 1C29A 1L6YA 5AHFA 4AB4A 4A2RA 2UV8G 1W54A 3CU2A 4HPJA 1CX9A 1K8ZA 3DI0A 1W3IA 3M1ZA 3NQCA 3UZJA 3R13A 4PEKA 2HMCA 3I7QA 2ALDA 4O19A 4N02A 4NUWA 2OT0A 5DELA 2YW4A 2F7FA 4OV4A 2X30A 3BV4A 1LTDA 3LHVA 3ATYA 1A50A 2YZRA 3W3OA 1NF7A 3G1FA 4M19A 4C1KA 4LS2A 2G5WA 4O0ZA 1S5TA 3L0GA 4O8RA 1YXDA 4JTUA 5EBUA 4DQWA 4CQAA 3TR2A 5F4SA 4U28A 4UFKA 3KFTA 4ADTA 4NJHA 4AHQA 1ZY9A 1MEIA 3DFNA 1Q3NA 4JIPA 1IIGA 4ZQCA 1ZAJA 4A3UA 3Q37A 2NXGA 3W85A 3W2MA 3RNDA 3P60A 4DBDA 3DZ1A 1TPVA 4RZ5A 3P80A 4JTLA 2E5CA 3ZR4A 2Z0IA 1SW0A 4FXSA 2GVLA 4FX7A 3E02A 1F7BA 3RK8A 4FNUA 3S6DA 5KMYA 3O15A 2IQTA 2GPTA 2DZSA 3GAYA 1KM0A 4MKNA 5D30A 1O4UA 5BNKA 2YYUA 4OQVA 2PE4A 1VLIA 4KFOA 1FCQA 8TIMA 3M43A 3ZWTA 4OWGA 4Y8FA 2BZNA 1VR6A 2XN2A 4YLWA 4O11A 3BARA 3C56A 2GJLA 4HNVA 1F74A 1FDJA 1KFBA 3QQ0A 1THFD 3L0KA 3LBCA 4O1DA 1H1ZA 4G1KA 1XM3A 2V5LA 3C2FA 2H90A 3HG2A 3GXPA 2A5HA 1TPFA 1W31A 3LCHA 2ZQ0A 4LUJA 3SSJA 5KZEA 2A2IA 2V8ZA 5AHEA 3TAKA 2C18A 1XUUA 3NL2A 1ICSA 2NX1A 4GUFA 3EX1A 1DVJA 1W0MA 3N9SA 1K03A 4MOZA 4ZL1A 1S3HA 3RMJA 1WYIA 1XUZA 4K7VA 3TJXA 5EMUA 5F2GA 3FJLA 1ICPA 3WJYA 5TBOA 5CSRA 5CZSA 1HO4A 1PHWA 3W07A 1PV8A 3NQGA 3CWOX 3KOFA 1IXPA 3DAQA 3W76A 1KBIA 4NU7A 2C15A 2G95A 3PWAA 1O95A 3HBLA 4NZJA 4OBTA 4YXGA 1OX6A 4WX2A 4ZQPA 4FB7A 4B5NA 1X1OA 2FFCA 1L6WA 3KVJA 5CPMA 5BRBA 3A5FA 3N3MA 5AHNA 1PCKA 3EWXA 1W56A 3R8RA 1X7FA 1WOAA 3LHWA 4NNBA 4GNJA 1SFJA 1G7UA 4TMCA 2QDHA 4NXSA 4S2CA 2E68A 3RU6A 4QNEA 5F2LA 1YLVA 4DF0A 1ONRA 3EEGA 1FBAA 1TB3A 3W1UA 4NX0A 3D0CA 4FNPA 5FEPA 1IGSA 3LHYA 5CPOA 3W1MA 2CLMA 4DPQA 5A5WA 4JY8A 4JR5A 1OJXA 1Q45A 3R12A 3P67A 4O53A 4KWVA 1QFEA 5CPNA 1OYAA 4ZQRA 1JCMP 3RLVA 1T0OA 1UJPA 3LRMA 2QCDB 1FDYA 2V0TA 4UR8A 1H63A 3W7CA 4Q4KA 3B0UX 3KHJA 1VGAA 2ZZ4A 3H55A 3IIVA 2DZTA 3GVGA 4MJZA 2E6AA 2YR1A 3TXVA 3EKZA 3L66A 1TPDA 2Y7FA 2CZ5A 1YADA 4N9CA 4UTTC 2P0OA 2VENA 5A8GA 3OVRA 3LCWA 4M7SA 1OABA 4QJ1A 4NJJA 1ADOA 1PIIA 1MZHA 3A5VA 3O8AA 3G8RA 2QCDA 1A5BA 4PODA 1GVOA 1LRQA 1R2RA 3NL5A 3NR0A 4O18A 3MJYA 4IMCA 3BGJA 4RV8A 4M6PA 1FCVA 1MXSA 3N14A 1KFJA 3A21A 2C0AA 1N55A 2V5BA 1BTMA 4UFIA 4OE7A 5FF4A 4I9AA 4O1BA 5AHMA 3QH2A 3MI3A 1Z44A 4NT0A 1TPC1 1TTIA 1TTQA 1LBFA 1XBXA 1OF8A 5FESA 1DJQA 2NXHA 2NZLA 3EB2A 3IRDA 3UWZA 3KAOA 1EP3A 1I2OA 4PL1A 3G1XA 5AYYA 3CEUA 3MI2A 1LOSA 2QF7A 4RZ6A 1YYAA 1ZALA 4WOQA 5EY5A 4YCOA 1WBHA 3W1RA 4IXXA 3THQA 1JUKA 3HG4A 3W7NA 3GNNA 3W71A 1R2SA 1WAUA 1JRBA 5LNUA 4ADSA 1P0KA 2RDTA 3W74A 1PS9A 2VEIA 3AO0A 5K4XA 3QPZA 2VKZG 2X1RA 5AHLA 4XBKA 2R94A 2B0MA 2Y89A 3O05A 3DHFA 2P10A 4JTIA 4R53A 3W9ZA 4DEFA 1BWLA 4YMZA 4UTHA 4BI6A 2O7QA 3QW3A 2WNNA 5HUOA 4N2YA 3NG3A 1D3GA 3SGZA 2NXIA 1YDOA 2WNQA 4AF0B 4RXFA 1KA9F 1FUYA 2FQIA 4Y9AA 3F4NA 3P74A 3GDTA 2C16A 1GOXA 4UTKA 4LVFA 5C5YA 2PRMA 4GJ1A 3G0SA 3EWYA 4IMGA 5GVJA 3NL3A 5D2VA 2A0NA 2QEZA 1X1ZA 5F2MA 3T55A 4LV9A 4DPPA 3TA6A 2E1DA 5DCDA 1GTEA 2ATSA 3P5YA 3BLFA 4LT9A 3WK3A 4UTTA 2DJXA 3EXSA 2DJLA 5G4EA 1GWJA 1VQTA 3SI9A 4PCFA 5FF2A 4H6KA 3LCIA 4NNAA 4ZQOA 3NXFA 2DP3A 3SFKA 2ZZ2A 2A6LA 5F1UA 3MYPA 1D9EA 5AB3A 1GYLA 4S2BA 1K3UA 5HUPA 1TQXA 1H62A 1KM2A 1KW1A 4CCCA 2V82A 1KBJA 3PG8A 1TRDA 4HNTA 1JVNA 4GUGA 2QCHA 4NX5A 3THAA 2A7PA 4W9TA 2RDUA 4I7WA 4RR4A 3FIGA 3F4WA 5DXYA 3UD6A 1H7PA 5D09A 4MUZA 4UFMA 3W7MA 1ME8A 1JCLA 2ZRXA 5C6MA 1K7EA 2GVGA 4LS1A 3GXNA 4MYAA 3STGA 4UFLA 1ALDA 1G6CA 3O06A 1VRDA 4AVFA 3C2RA 4H4IA 1XDMA 3NPXA 3VE7A 3LM7A 1GVQA 3N34A 2E6YA 4I7UA 1MSSA 4JXCA 4BFAA 5HWJA 4JTHA 3JRKA 2EF9A 4WD0A 4QM1A 3C3NA 4MFEA 4ADUA 4OHQA 1M7PA 3QW4B 3TMLA 3EWUA 5DCEA 4FNTA 4CNOA 2H3BA 3LLDA 1ME9A 2FIQA 1R30A 1P0NA 3CT7A 4N9DA 3FKRA 4R7JA 3TV8A 4DBEA 3PVFA 3IIZA 5D04C 2R8WA 2Y62A 3NA8A 1FX6A 1TJPA 4P2VA 2PRLA 2Z6JA 3K30A 4IWWA 1VYRA 5AYXA 3DENA 2ZRYA 3O1NA 3C2EA 3C61A 3CIXA 3UWVA 3A24A 2F84A 5G4WA 2TPSA 1XKYA 3OA3A 2YFOA 3UQNA 2WO5A 1YTEA 2HS8A 3EXRA 3IGUA 4LVBA 4AWTA 3S5YA 1A53A 3CEPA 4CCEA 1KM3A 4ORMA 4TMBA 2ZA2A 1KFLA 2ZRVA 4E0CA 3HF3A 4N6EA 3OHIA 4RCXA 3UWWA 2VFIA 3ELFA 1JQXA 4BWLC 1H60A 3LB0A 3EXTA 3TNOA 3PUOA 1RQEA 1JQVA 1LLZA 4ICNA 4KWWA 3SECA 3W7OA 3PY2A 4FNRA 4QQ3A 2OCZA 2NWSA 2VXNA 3M6YA 2TYSA 4UMCA 1QMLA 3CB8A 3C2VA 4K8HA 1EP2A 3FA5A 1Z42A 4HSOA 5AN7A 1B4EA 1KFCA 1F05A 4WUIA 2J88A 5BMWA 2Y85A 4GUHA 4GRSA 3GKFA 4LVDA 5F4WA 1SO6A 1G4TA 4LRSA 1AG1O 5AHIA 3W22A 4AHPA 3P5ZA 3BLIA 2NUWA 1EEPA 4O1AA 1W37A 2QCGA 2A7RA 4QIUA 3DFTA 5AC7A 3NL6A 3W75A 1AMKA 5K9CA 3DFOA 1T8XA 3LRKA 3MHUA 2WKJA 2XN0A 3QRHA 3LERA 1GZGA 1L2UA 4JY9A 3BO9A 4JIQA 3W7QA 1DHPA 1G7VA 2Y7DA 4UTMA 5LKYA 5LGXA 1JCYA 1XC4A 2A21A 1UASA 3TSBA 3UXDA 5D32A 3M5ZA 1EB3A 3HQ1A 1E51A 1TPB1 1KM4A 1SO3A 1BEUA 4PL2A 4UC5A 3HJZA 3I7SA 4IJBA 1IF2A 1SW3A 4OU1A 4NQ1A 2TRSA 1LYXA 1RV8A 3ABOA 2ZDRA 1ZHAA 4O16A 4ZZ9A 1FWSA 3O6CA 3QMSA 3W1LA 1EA0A 3VI2A 1XXXA 4ML9A 4JICA 2AQWA 3S1XA 3C6CA 3TQ0A 1SZFA 1F2JA 5DBTA 1AL7A 2V2HA 4UMAA 3TMQA 1U83A 2FB3A 1KM1A 1C8VA 1N7KA 5D02A 5CZ0A 2FB2A 2V9DA 2E5DA 4O28A 2FTPA 3FLUA 1AK5A 3PAJA 2EAWA 3JS3A 5HINA 1PL9A 1KTNA 5F1VA 1BKSA 1K8XA 3PS7A 3B05A 2Y6ZA 4O0KA 5L9FA 1W3NA 5CGQA 4JTFA 1VCVA 2O7SA 1CI1A 2EGZA 3QMRA 1QCWA 3C0JA 4BWLA 3CC1A 3DGRA 1SSDA 3IIOA 5DCBA 1TV8A 3L68A 3PBYA 2QUVA 2RHGA 1W8SA 3PB0A 5H2ZA 4Q33A 5HWMA 1H7RA 4Z08A 3LTYA 2C14A 4GUJA 5CZJA 1T96A 5K9XA 5E93A 4HT3A 4N4PA 3G18A 1KTBA 3L2IA 3T78A 1TPEA 1FWNA 1TMHA 2C19A 1FWRA 4JTGA 2YFNA 4RZ4A 3HGRA 3TK7A 4UXDA 2J24A 4QITA 5U4NA 3LV5A 4LY8A 3N73A 3NNTA 1W5QA 4ZVJA 2YW3A 2QJIA 4MYXA 3LTPA 1O5XA 2VFDA 5E1QA 5AC8A 4NZFA 3HG5A 3EX4A 3W88A 4QISA 2W0UA 1V7YA 3EX3A 3CQ0A 1ZNNA 3LHUA 3I7RA 4FNSA 2QCFA 3O63A 4P61A 4C1LA 3N19B 3NQ8A 4HNUA 4EVZA 1M5WA 1I45A 4X9SA 4WQ6A 3B4UA 1DJNA 3HG3A 3M16A 3UWQA 1KTCA 4Z1DA 4J9JA 1XBVA 4TX9A 3GR7A 1ZAHA 4FO4A 4JGDA 3W7JA 3W7GA 3KRZA 2Y61A 4MPQA 3NEVA 2FDSA 5I3HA 3TQKA 5D33A 3RLUA 1R2TA 2FPYA 1X6UA 4LOCA 5G2IA 4EF9A 1XBYA 2NUXA 2PRHA 3PC0A 2QCCA 3GLCA 1H50A 4UTLA 3T40A 5LSMA 3W7RA 3P8JA 5IBXC 3OVPA 5KTLA 1NSJA 4JYEA 3MI6A 4JN6A 1F6KA 1J4EA 1RPXA 4LNYA 3LI1A 3NQAA 3MBFA 3S8HA 4A22A 1B9BA 4WJEA 1DQWA 1JCJA 1EWEA 3KVLA 1KLZA 3NPVA 1XCFA 3EKLA 5AC6A 5HQEA 5C54A 3M41A 2Q3OA 2NLIA 2VELA 3NM3A 4JNMA 1GG0A 1JULA 4O54A 4TR9A 2ZCGA 2G97A 3IIXA 1H7OA 1HG3A 4POCA 2YX0A 4O10A 4O57A 3S0CA 1I2NA 1GT8A 3P81A 1GYNA 2JKEA 1KLYA 3BW2A 3OEXA 3M0ZA 3SR7A 2XFWA 3NM1A 3I6RA 5E0KA 4MZ1A 3NAVA 3BG9A 4E2DA 3GYEA 4LC8A 4O52A 1XL9A 4CQ9A 1YDNA 3DFQA 4MZ8A 3IGSA 2QCNA 4PA8A 1TV7A 3TJLA 4MIMA 1IXQA 4X3ZA 3B8DA 2ABBA 2WSRA 1YTDA 3N9RA 2A1YA 2JGYA 4WOZA 4WXZA 5LNVA 2CU0A 2WPBA 4ORIA 3OVQA 3S42A 2J9ZA 1WDWA 1GEQA 3BGGA 4ONVA 3HGJA 1P1XA 3SGUA 3S1VA 1TTPA 1SO5A 3G1HA 4MZYA 3EWBX 4TU1A 1QO2A 2ZZ3A 3WFAA 1GJPA 2HSAA 2ISWA 3MHFA 5K9DA 4DF2A 4UTIA 1EP1A 2J9XA 3FFSA 4BI7A 1JUEA 1HUVA 5D2XA 2V2DA 3E0IA 3KVKA 3B04A 1HO1A 5BMXA 4Z0JA 2C1HA 3WJXA 4LV4A 1QOPA 5D37A 1Q6LA 4GC4A 3T7VA 1ZENA 2FLIA 3P82A 1F73A 3LXAA 3H53A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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