4AB4A

Structure of xenobiotic reductase b from pseudomonas putida in complex with tnt
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
349
structure length
349
Chain Sequence
TTLFDPIKLGDLQLPNRIIMAPLTRCRADEGRVPNALMAEYYVQRASAGLILSEATSVSPMGVGYPDTPGIWNDEQVRGWNNVTKAVHAAGGRIFLQLWHVGRISHPSYLNGELPVAPSAIQPKGHVSLVRPLSDYPTPRALETEEINDIVEAYRSGAENAKAAGFDGVEIHGANGYLLDQFLQSSTNQRTDRYGGSLENRARLLLEVTDAAIEVWGAQRVGVHLAPRADAHDMGDADRAETFTYVARELGKRGIAFICSREREADDSIGPLIKEAFGGPYIVNERFDKASANAALASGKADAVAFGVPFIANPDLPARLAADAPLNEAHPETFYGKGPVGYIDYPRLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Determinants of Aromatic Ring Reduction in the Xenobiotic Reductase B from Pseudomonas Putida
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords XENOBIOTIC REDUCTASE B
total genus 135
structure length 349
sequence length 349
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ab4A00
3NXFA 4H4IA 3TJLA 4GUFA 3UZ5A 4P61A 3CTLA 1VCGA 4FX8A 2DORA 3UQNA 1OHLA 5AHLA 5CG7A 2ZZ5A 1ZJIA 1JRBA 4A3UA 1MSSA 5HINA 2PCQA 1SO5A 1BKSA 2A5HA 3TJXA 2GVJA 3O6YX 4EOUA 3CC1A 3B0VC 4O15A 3TROA 3LXCA 4RZ6A 4PC8A 1XUZA 4JY9A 3C6CA 3BGJA 2P0OA 2WO5A 1CW2A 4MYAA 3TC7A 4MY1A 3BV4A 1QNVA 4UIOA 1EX5A 5EL1A 5AC6A 3DHDA 3CEPA 4MIMA 3QYQA 4Z0SA 3GDMA 2LLEA 3QJAA 1ME9A 3DFPA 2Y6ZA 3I65A 5AC7A 3EB2A 3NQAA 5G1YA 3W86A 1AL8A 3T55A 2Q3OA 3FOKA 4NJKA 1RZMA 2V9DA 4W9TA 1QPRA 4UFLA 2TRSA 1Z44A 2NUXA 5EKYA 3RFAA 2J9YA 3ZR4A 1G6CA 3W1MA 3SIZA 1TQXA 3OEXA 4OE7A 3T7VA 5E1QA 4PH6A 2J9ZA 5D2XA 3NVTA 1PHWA 4ZQRA 4UMBA 5KINA 4YMZA 3I7RA 2F84A 3T78A 3CQ0A 3FLUA 4LVDA 2YW3A 2PE4A 2ZZ6A 4MVAA 4H3DA 3QQ1A 1A5BA 1PS9A 3DAQA 4LUIA 2J9XA 2VC6A 1EP3A 1Q3NA 2BZNA 1KFCA 1L6WA 4FXRA 1QWGA 1B57A 1KW1A 3CIWA 3TAOA 1Z41A 4NT0A 4ML9A 4QJ1A 5E93A 1MXSA 1ZENA 3Q94A 3NM1A 2A6LA 2CLLA 1BTMA 3W1RA 1X1OA 3Q58A 5DXXA 1S5WA 3IIXA 3NDOA 2R94A 4I7UA 3QEZA 4O16A 3PUDA 3QH2A 4JY8A 5K4ZA 3UNDA 1O60A 1OK6A 3DH7A 4TO8A 3W76A 2IQTA 2DZWA 2QCMA 3FKRA 3EWZA 3KAOA 4O1AA 4WZHA 3NEVA 2DJLA 4OV9A 3G1XA 2E09A 3DBPA 4IXXA 3KRSA 4Z1CA 4UCGA 4ZZ9A 4TMCA 3GVGA 5D03A 5FF4A 5FEWA 1LBFA 1ALDA 1GQNA 1LCOA 1QMLA 2DJXA 4ADSA 2I9EA 3P82A 2FFCA 1JCYA 1OFAA 1L6YA 1Q6LA 1KTCA 1YTKA 2V0TA 4RXFA 4OV4A 3B8DA 3DKJA 1JCXA 2RFGA 3P74A 4XZ9A 4ICNA 1UUOA 3IGSA 4JR5A 3TAKA 3C52A 4UTTC 4HNNA 5D30A 2A7RA 2V5BA 5IBXA 4DQWA 2E5DA 4XTIA 1EIXA 1OF6A 4LVBA 3RMJA 2ZFAA 4UNLA 5DBUA 1OFOA 3EWBX 1W5MA 3PAJA 1TPB1 4NZJA 2NUYA 2Y89A 1P1XA 1ME7A 4OBTA 4O11A 5D33A 2NXIA 3UPBA 2EPHA 1F2JA 2W79A 1EB3A 4GUHA 5AYYA 5K3VA 1W5PA 3W1XA 2Y62A 4BWLC 3C2RA 2VEPA 1AL7A 3P81A 1DKWA 3WJWA 2QCNA 3CM4A 1HFBA 4YXGA 2V30A 1XL9A 5AFDA 2RDUA 1WV2A 1Y0EA 2W6RA 1K7FA 2DP3A 3QW4B 3ZFHA 1B3OA 1F6KA 2KZHA 4M6PA 2RH9A 5FEZA 2ZTKA 3PVFA 1W37A 2ZA3A 1K8ZA 3R8RA 3JRKA 4O1BA 2WQPA 5DY2A 1LROA 5C55A 3ABSA 4S2CA 5U4NA 1CI1A 2FPVA 3EKZA 4FX7A 5GVJA 3G3MA 4LC8A 3HGRA 3IRDA 4NXKA 5EBUA 3TXVA 5SWUA 2ZZ4A 1RPXA 2FDSA 3DHFA 4O28A 4LOCA 1LRQA 3ZWTA 1AMKA 4JXCA 1FDZA 5F2MA 4O4VA 1GEQA 3KVKA 4UUIA 4OHQA 3R13A 3QSTA 1G67A 4AF0B 4AHPA 4WD0A 2WSYA 2E5CA 5KZDA 4AWSA 4JX5A 4UFIA 4N6EA 3P60A 1UB3A 2YYUA 3TQVA 4WY0A 4E0CA 2A4AA 2GPTA 1PCKA 4K39A 3TFCA 5D2WA 1TREA 5FI8A 1BWKA 2Y88A 4Q33A 4R34A 1OFDA 3W74A 3TCEA 4WXYA 2YW4A 1V7YA 1FDYA 1VQTA 1BWLA 5G2HA 1W3NA 3LHUA 1I2NA 3DXIA 4AWTA 4CNOA 2A0NA 2EKCA 3P5YA 2CLMA 5IM51 4PCFA 3RK8A 1KM6A 1OG0A 4UTMA 1JCMP 2RDTA 4YWIA 2V5LA 2Y7DA 5EMUA 1KTBA 3BVJA 3QPYA 4LVFA 5G2IA 1C9DA 3E0IA 1VS1A 3IEBA 4DO6A 5K9DA 3W7QA 2ZRYA 3HG4A 1J4EA 4MOZA 3HPSA 3NG3A 4FHAA 3N19B 1PHQA 4MZ8A 1X1ZA 2CLIA 5K4XA 3WJZA 1OFEA 3LI1A 1W31A 1EWEA 4NXSA 2C3ZA 1I45A 1DVJA 3OVRA 1KFEA 2VENA 1IXQA 3A22A 4NJHA 3QMRA 3DU0A 1IF2A 3W2KA 1Q45A 4HPJA 5HUOA 1B4EA 4N9BA 1RR2A 2QAPA 1G4EA 5D05A 3B0PA 1FCQA 3LTYA 2C6QA 5KTLA 4PFMA 3N9SA 3BARA 3LRKA 1H63A 2E6YA 1TMHA 3HG2A 1WOBA 4LRTA 1JQVA 5AN7A 4YCPA 3P84A 1B9BA 5LNVA 3FIGA 3G0XA 3KVJA 4BI6A 1TPH1 3G0SA 4PEKA 2HS8A 1TO3A 3UYCA 4GUIA 3VCRA 5EPDA 5I3IA 1IGSA 3F1QA 2H6RA 3A5FA 4HT3A 4PL2A 4K7YA 4I9AA 4M5PA 2YXGA 3E49A 1TPWA 3HF3A 4QITA 3QW3A 3NPWA 3FS2A 3UXAA 4M6QA 3HGOA 3HGJA 3W85A 2Y63A 5D38A 3TC6A 3PBUA 1GOXA 4POCA 4CNPA 4RJEA 3C2FA 3GAKA 3O63A 3W7IA 3PUEA 3OHIA 3BLIA 3MMTA 5HNRA 2FJKA 3O8AA 3JR2A 1LDCA 4IOTA 5DXYA 2A6NA 4JTTA 1RQHA 4M6VA 3MHFA 2QF7A 1JCLA 4O19A 2Q8LA 2YSWA 3LV5A 4PODA 3NZ1A 4K38A 1JULA 3QMTA 5EY5A 4JX4A 1DORA 2JK2A 3ZWSA 5U7SA 3EXTA 4HKPA 3G1AA 3SI9A 1OX4B 4WX2A 3ABRA 4RK8A 4TR9A 1LOSA 1H7OA 1GG1A 4IMGA 5I3HA 3PM6A 3LCFA 5H2ZA 2E6DA 3VFLA 2ZTJA 1AW1A 4M7TA 1A50A 1GTHA 2X2GA 3BG3A 1WDWA 4O0KA 1R30A 5AYZA 4TMBA 4JDYA 2VEKA 4L4MA 3S1WA 1EP1A 3PR2A 4LS1A 5FESA 1Z48A 3IIVA 2GJLA 3HG3A 3HPZA 4ADUA 5KITA 3C2OA 4MY8A 2ATSA 2Y70A 3M1ZA 4JTIA 3TMLA 2CU0A 3C2VA 3GB6A 4CQ9A 5E0KA 3L0GA 2B4GA 2YDAA 1QPQA 2CZDA 4K7VA 2V2DA 3GAYA 2A7NA 5HUPA 2NXGA 3W1LA 4K37A 4JTJA 5HQEA 1SW7A 4UTKA 2QCCA 3ABQA 1ZNNA 2BXVA 3M5VA 4JEQA 4OQVA 3B04A 4Z1BA 1SZFA 3L0KA 4MJMA 1DOSA 4NNAA 3RU6A 5KSWA 2V82A 4GBUA 1KM3A 2FIQA 4DEFA 3G1DA 3NOEA 1GTEA 1GYLA 4XTDA 3DFQA 3LCLA 2G96A 4TU1A 4OWGA 1SZEA 3HBLA 3BLEA 1FQ0A 2QCDB 3IGXA 3L65A 1OFQA 3UY7A 4AF0A 5D09A 1ZY9A 2PRMA 3L21A 4NZFA 3W2MA 2QKFA 3MWAA 1A5CA 1PV8A 4GWEA 1VPXA 2C19A 4X9SA 2H8ZA 7TIMA 1WAUA 5DN1A 3N14A 1NSJA 1W54A 1I2OA 1A53A 3HOJA 2VFEA 3P8JA 5KMYA 4JIQA 1VH7A 1GZGA 3STGA 1EUNA 4O4WA 1A5SA 1X7FA 2R91A 3GNNA 2XN0A 3CWOX 4WQ6A 5EYWA 4Y9AA 1ZAJA 2NWRA 2X16A 1NF7A 3LDVA 1OX6A 1XBXA 3LV6A 1F74A 4DBDA 2P10A 1F7BA 2A1YA 3PY2A 1H51A 4MUZA 1H7PA 3PULA 4AVFA 3EWXA 1YTEA 2YX0A 2ZZ1A 3TMQA 1TRIA 3WJSA 1TCDA 3LRMA 3M47A 4IMDA 2C1HA 3TW7A 4O50A 3LHTA 5I3KA 2B7PA 2VFFA 1LORA 4E2DA 4E2BA 3DFTA 3H55A 2AQWA 3LHVA 3LB0A 2H90A 3UWVA 4N2YA 1H61A 3DKLA 1OJXA 1EA0A 3NPVA 4UFKA 5DLCA 5F1VA 2YR1A 5LSMA 1TRDA 5AHEA 3H54A 3SECA 2HMCA 3MYOA 4LV4A 5KZEA 3O15A 3TV8A 4NNCA 2NXHA 2VFIA 5FEXA 3W22A 1TSIA 2J24A 4K8HA 4O53A 3TIMA 3GNDA 3STFA 1KA9F 4WOZA 1DQWA 5K2ZA 1KV8A 1D3GA 3VE9A 5IBXC 3W88A 1AG1O 4JTUA 1FX6A 2ZCGA 3ZS4A 2CLEA 5TIMA 4CCDA 4RR4A 4UMAA 1TPFA 5I3JA 3U8GA 1K02A 4AXKA 5J5DA 3QRHA 1LBLA 1ICPA 2FTPA 1ZFJA 3MHGA 2Y7FA 3IVTA 1OF8A 3FYOA 3A21A 3EWUA 3KHJA 5AYXA 4JTKA 3GKAA 4BI5A 2E77A 2ALDA 3DI1A 4DPPA 4EVZA 3BPWA 3LBMA 3N73A 3L2IA 2Z6IA 3W9ZA 2ZRZA 1KV5A 1CX9A 5HMSA 1H50A 4HN4A 4DPQA 1XBZA 4X3ZA 3W7MA 4CNNA 3QZEA 4IJBA 2WSRA 3HPXA 2I14A 3N34A 3THAA 2DZXA 1OYBA 4FIRA 3RNDA 2ISVA 4IQLA 2YYTA 1FWSA 4RZ4A 1WQ5A 1XFBA 1AK5A 1K3UA 5MHBA 4N9DA 3EX1A 5CZSA 2TYSA 2FLIA 3EX2A 3VE7A 4AMAA 1X6UA 2BLEA 4WXZA 3W83A 3G18A 3P80A 1IXNA 1OX4A 3GK0A 4KKXA 3ATZA 4LV9A 1BEUA 2H3BA 2EHHA 1L6SA 3MJYA 3W73A 1DHPA 1M7OA 5K7JA 1K7EA 2FPTA 4QNEA 1FCBA 4BF9A 4G1KA 3R5EA 2NLIA 2W0UA 4AAJA 1KLYA 2QJIA 1HTIA 1R2TA 4N6FA 2B7QA 3MP3A 3DGRA 3MBDA 1GPWA 4HSOA 3W87A 4QIUA 3NQGA 2OT1A 1VHNA 4XBSA 1TYGA 2I1OA 1FCVA 4C1KA 1GYNA 2NV1A 3G3DA 2A2IA 3S1XA 2ZRVA 4FX6M 3CT7A 3G8RA 4OGZA 5A8GA 2X30A 3LCGA 3V1PA 1KFJA 1Q6RA 3N2XA 5DCBA 1N8FA 5J5RA 2ABBA 1DV7A 3W7RA 1W5OA 1YPFA 4S2BA 3EXSA 1RVGA 1T99A 2C0AA 4HIBA 2E5BA 3TQ0A 2O7QA 3TA6A 4MLRA 4KFNA 3S6DA 1K8XA 4ZQMA 3K30A 3M5YA 3DZ1A 4UTUA 3O16A 1J2WA 1VLIA 2ZRXA 4Z1AA 3TR2A 5DBTA 3VNDA 1F6PA 1TTIA 4IPIA 4HNVA 2JKPA 1ZAIA 1VR6A 4JS3A 4QNWA 5I3GA 2VKZG 2GJNA 3NQDA 3SZ8A 2CW6A 1XKYA 4EWND 3NQMA 2QCDA 4NQ1A 4LUJA 1YTDA 4MY9A 1LYXA 3W23A 2QUVA 3DENA 3W2UA 1VYRA 5D04C 3CEUA 4DF0A 5KZMA 3GLCA 1JR1A 1ME8A 4GC4A 2G97A 4ZQNA 3PS7A 4JGDA 1VZWA 3G8EA 4KWWA 3M5ZA 4GUGA 2BSLA 5HR6A 1P0KA 1QAPA 4PTNA 3NQ7A 1H62A 1WOAA 6TIMA 1EUAA 3UWYA 5TQLA 1Z42A 3RF9A 1TPEA 1WYIA 2H8XA 5F2LA 3LI0A 2D73A 5G4EA 1R47A 1FY6A 4JTHA 2OT0A 3FYPA 4ZVJA 4L4LA 2R14A 1TPUA 1A5AA 3UWUA 4IXHA 2B0MA 4GRSA 3A5VA 4UR8A 3GDRA 3WJXA 3S0CA 3LLDA 5HULA 4D2JA 1ZHAA 3HQ1A 4WY0F 3W7LA 2A21A 1G7VA 2ATMA 5AB3A 1RD5A 3CU2A 4LTSA 2V81A 1SZNA 4N4QA 3NO5A 4LWWA 4YLWA 5CPNA 2GVLA 1Q6OA 4EF9A 1O5KA 3W72A 3BW4A 4AEOA 2AAMA 3UY8A 3W7DA 3KRUA 4BFAA 4A29A 3KRZA 3DFNA 3LHWA 4DO5A 1KTNA 3NNTA 4UFHA 2PURA 6ALDA 1XDMA 1VGAA 1PL9A 3KXQA 3S5YA 1I2PA 2X1RA 5D02A 4HNUA 5AOUA 1GG0A 1QO2A 4MLJA 1FUYA 5G5IA 3D0CA 3BGGA 4ONVA 3B4UA 3QMSA 3GXNA 3B0UX 2B7NA 2YFNA 1RV8A 3S9YA 3C56A 1DL3A 1SZGA 4N9EA 5F2IA 3DI0A 4N4PA 4K6AA 2JBMA 3QM3A 5FEPA 1UUMA 3W7HA 3MW7A 1YXCA 1W1ZA 4A2SA 3UWWA 2V2HA 1KBJA 2VXNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1X6L A;  1XIN A;  3NXF A;  1Q8J A;  2WVT A;  3UZ5 A;  3CTL A;  4FX8 A;  2XII A;  4F0M A;  4PUJ A;  1OHL A;  2WMJ A;  1JZ3 A;  1ZJI A;  3OBE A;  2PCQ A;  3OIH A;  1E0U A;  4Q8P A;  3GVW A;  3O6Y X;  3BCJ A;  3LXC A;  4X0N A;  2WHM A;  2YBT A;  5IHS A;  4HME A;  3ARZ A;  3BAI A;  1DXF A;  4ACZ B;  3NQB A;  3WLH A;  5EL1 A;  2HDJ A;  1BXB A;  3CEP A;  2QNE A;  3QYQ A;  4ENL A;  3IAR A;  4ES4 A;  2Y6Z A;  3CPU A;  3EB2 A;  5G1Y A;  4MDP A;  1U30 A;  1XYF A;  1W1V A;  3W86 A;  4YVP A;  4F8X A;  4JNZ A;  2NW0 A;  3T55 A;  2Q3O A;  3N15 A;  1RZM A;  1KQY A;  2TRS A;  3AMG A;  3TA9 A;  3BOF A;  3KEH A;  4NZ4 A;  2GVE A;  2NUX A;  3RFA A;  4PE8 A;  4NI3 A;  3W1M A;  1BQC A;  4W7U A;  3VMN A;  1TQX A;  5HPO A;  5E1Q A;  2J9Z A;  3NVT A;  2RGM A;  4ZQR A;  3SCW A;  4MNM A;  5JH2 A;  1OGB A;  3WLM A;  3I7R A;  3QKE A;  4LVD A;  1NWU A;  2ZZ6 A;  5HJY A;  4MVA A;  4ZTX A;  3QQ1 A;  4LUI A;  1PS9 A;  1HKI A;  2J9X A;  3WLT A;  1RCQ A;  1QBA A;  2BY1 A;  1L6W A;  1WDR A;  1KW1 A;  3CIW A;  1V0L A;  1S1R A; 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