4AB4A

Structure of xenobiotic reductase b from pseudomonas putida in complex with tnt
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
349
structure length
349
Chain Sequence
TTLFDPIKLGDLQLPNRIIMAPLTRCRADEGRVPNALMAEYYVQRASAGLILSEATSVSPMGVGYPDTPGIWNDEQVRGWNNVTKAVHAAGGRIFLQLWHVGRISHPSYLNGELPVAPSAIQPKGHVSLVRPLSDYPTPRALETEEINDIVEAYRSGAENAKAAGFDGVEIHGANGYLLDQFLQSSTNQRTDRYGGSLENRARLLLEVTDAAIEVWGAQRVGVHLAPRADAHDMGDADRAETFTYVARELGKRGIAFICSREREADDSIGPLIKEAFGGPYIVNERFDKASANAALASGKADAVAFGVPFIANPDLPARLAADAPLNEAHPETFYGKGPVGYIDYPRLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Determinants of Aromatic Ring Reduction in the Xenobiotic Reductase B from Pseudomonas Putida
rcsb
molecule keywords XENOBIOTIC REDUCTASE B
molecule tags Oxidoreductase
total genus 135
structure length 349
sequence length 349
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ab4A00
1NAL1 1FWSA 1LRNA 5F2GA 2RKXA 3WFAA 4MUZA 1W3NA 3UY8A 4UCGA 1KFLA 1OABA 2DZPA 5BMXA 4D2JA 2UV8G 5F2MA 3QC3A 4HIBA 2Q3OA 5DBTA 3NL2A 2NWSA 4HHPA 5EPDA 4KKXA 1RZMA 3TK7A 3S5OA 1I2RA 4QITA 4DO6A 4IMDA 1YPIA 3G8RA 1LYXA 4HKPA 3BW3A 1SW7A 4YLWA 1K8YA 1F6PA 1GEQA 1KLYA 3NL5A 1W5PA 4AXKA 4UTMA 4KFNA 3UPWA 3W7QA 2DZUA 3P67A 1S5VA 1KV5A 1IXQA 5AC6A 1Z41A 3AO0A 1OFQA 3PWAA 1Y0EA 4HNNA 3L21A 1JCJA 4QAIA 2FPVA 1XDMA 2CZ5A 3BLIA 3BPWA 3UQNA 1O60A 4OGZA 1QNVA 1ME8A 1OX5A 5I3FA 5D2TA 1HG3A 4QIUA 4AEOA 3TSMA 3PBVA 4UFJA 3DBPA 2YR1A 1HL2A 1SFJA 1LDCA 2G96A 1TJRA 2NUYA 5FEZA 3NQ6A 1H7WA 1NVMA 3W7OA 3C2VA 1TV5A 4LU0A 2WV8A 3ABQA 4JTTA 4UTTC 3GXTA 2HS6A 4N9EA 1WX0A 4O1BA 1RVGA 2CLFA 4KWWA 3EEGA 4TO8A 4C1KA 2YX0A 4UTWA 1KW1A 1NSJA 4FNQA 3B0UX 2B4GA 3TX9A 5HWNA 4MIMA 5AHEA 4XTDA 1I2OA 2TSYA 2YCEA 1DVJA 3LERA 4XUGA 3HG5A 4JTJA 3T4CA 3CIXA 5BRBA 2HS8A 1GOXA 3QW3A 4JTSA 1G7UA 1BKSA 4UFMA 4AHQA 3ABRA 1XKYA 3S1UA 3THQA 4UUIA 3W7IA 3UY7A 1F6KA 2CFFA 5IBXA 4X2RA 3LV6A 3GYEA 4Q4KA 1H7PA 2V5BA 3DFQA 3GDLA 2JGYA 4IPIA 3GKAA 3W1UA 1OFOA 1KM3A 3A9IA 1QWGA 5LGZA 3OG3A 4GXMA 1BTMA 2NXGA 2NV1A 5G5IA 5ABTA 4OV4A 1HUVA 4Y9AA 1IIGA 3TXZA 3Q2DA 3EWWA 2QCCA 3NQFA 3SIZA 1SU5A 2FIQA 3SW6A 1X8FA 3W07A 1FXQA 3AJXA 3L5MA 3P5ZA 4MY9A 4WY0B 4GUJA 5AC8A 3CEPA 3WJSA 5LKYA 3BW2A 1Q6QA 1NFBA 2E5BA 2WNQA 1QPNA 5EBUA 3GLCA 1U5JA 4ZL1A 1B3OA 3S0CA 3MYPA 3P61A 1TPWA 5MHBA 4U28A 3QH2A 5C55A 1X1ZA 1LOQA 3G1XA 2V2HA 1YDVA 2DORA 2R94A 1J4EA 4IXXA 1VHCA 1AL8A 5GVJA 4BWLC 2PRMA 4HPXA 3W3OA 4CCCA 3K30A 1AG1O 3GR7A 1XBXA 2Z1BA 2GQ9A 4LT9A 1F2JA 4RR4A 1LBFA 1UUOA 1PE1A 3E02A 4Q33A 5AHFA 4TR9A 4WY0A 4M19A 4UTWC 1IXNA 3O07A 3IGXA 1GZGA 8TIMA 4OU1A 5DBUA 1TPB1 1C8VA 3CC1A 3PAJA 3HPZA 1R30A 3MUXA 2A4AA 4S2BA 4DF2A 4LTSA 4ZMGA 3W7RA 2OZ0A 3L5AA 3SGUA 1L6SA 4X22A 2OX1A 5D2VA 2A6LA 3BW4A 6ALDA 2QKFA 3O6YX 2AAMA 4UNLA 3NQEA 4ZZ9A 4O17A 3SJ3A 5DCEA 5SWUA 1XC4A 2WKJA 3BARA 3CEUA 2B7OA 1QPOA 2PRHA 4ZQPA 3D0CA 4MOZA 3N9SA 4N4PA 1O95A 3NQVA 2V82A 4X9SA 3LHUA 2VFDA 4NNAA 3W1MA 1A5SA 3GAYA 3JS3A 3STCA 3W1NA 3CHVA 1DQXA 4WQ6A 3W76A 3BLEA 2V2CA 1ZHAA 1TPFA 3W75A 3NG3A 2PE4A 4FHAA 3NNTA 3N9RA 3W70A 3W1LA 1EPXA 4Y8FA 2JKEA 3LV5A 3WK1A 5LNRA 4MKNA 3TA6A 5LNSA 5TQLA 2CZEA 1WOAA 2P10A 3M0ZA 5G1YA 2Y63A 3NQCA 1I2QA 3GR8A 3NPWA 1IXOA 2J24A 4WUIA 2X2GA 3KRZA 4LY8A 2OCZA 3UD6A 3V1PA 5AC7A 1SZGA 3STEA 1SZEA 2W0UA 4R7JA 2VEKA 1AW1A 4DO4A 1OYBA 4LOCA 3DFOA 3QMTA 3IIPA 4NJHA 3W7GA 3N3MA 1FWTA 3G1YA 1WBJA 3W1QA 1K02A 3LI0A 2YPIA 1GVSA 1OFDA 3A5VA 3G1HA 3PM6A 1HTIA 1LROA 3IIXA 1GTEA 3NXFA 3WK3A 1OFPA 3M43A 1L6YA 1TSIA 3IIZA 5AHNA 1H7NA 3R13A 4N6FA 2Y88A 4MFEA 2VC6A 4FX8A 1GG1A 4ZQRA 2HSAA 5HULA 1W5MA 4QNEA 2B7PA 1JQXA 4MLJA 2QUUA 1SW3A 5LGXA 2RDWA 4O54A 2BLEA 1X1OA 2ATSA 1A53A 3TMLA 1IXPA 3KX6A 3GDRA 3M5ZA 3W73A 5T26A 1M7OA 2J9YA 1QPRA 5DY2A 4HPJA 3GDMA 1ZNNA 3S5ZA 3TIMA 5D03A 5FF2A 1JULA 1R47A 5E93A 3PR2A 3LX9A 3TUUA 3FFSA 3UWVA 3F1QA 2BWGA 1A5CA 4OE7A 4R34A 1FY6A 3HPSA 3MI3A 4O0ZA 1VCFA 1FUYA 3LM7A 2QF7A 3EKZA 2H8ZA 3UNDA 3HGJA 4YCPA 5J5RA 3W2MA 1J2WA 3THAA 3W87A 4YL2A 1PL9A 3DFNA 3KVJA 4K8EA 1JUEA 1TTIA 3LGEA 4L4MA 1VRDA 3W2UA 2Y85A 2NV2A 5CSRA 4A21A 3EB2A 3I6RA 3LCLA 3MHGA 1GG0A 3QQ1A 4HN4A 3B0VC 3W88A 4I7UA 4JGDA 2ZRVA 4FX7A 5F1UA 2ATMA 3TDFA 3ZS4A 4JTHA 3GNNA 2A6NA 4LVGA 3W1AA 4O19A 3N14A 4JYFA 1K3UA 1LM1A 3PBWA 2CLMA 3TFCA 4AMAA 2Y7EA 5D09A 3LB0A 2QAPA 4IX2A 5G2HA 3WK2A 4ZVJA 4RZ5A 4DF1A 2QCLA 1GYLA 4ONVA 2DZWA 3PBYA 1J5TA 3G0UA 3TSBA 1SO6A 3CB8A 2WPBA 3NL3A 5FEXA 4O28A 4JYEA 1FWNA 1K8XA 5EA9A 1FXPA 1UCWA 4LV4A 3W6YA 1LOSA 2EHHA 5AHIA 4XKYB 2VENA 1TPC1 1W3IA 5K4XA 2V9DA 4UTKA 4RX0A 2J9XA 4O57A 3IIVA 3Q94A 4IGHA 3BK0A 1T96A 3LHTA 4MZ1A 1WQ5A 2E77A 1TYGA 4O11A 1VYRA 3MBFA 4JYDA 4AWUA 4FF7A 1WV2A 2CLOA 4QISA 2WSQA 3G8EA 3ABOA 2O7SA 5DCBA 1DL3A 1XFBA 4XKYA 5K9CA 3L67A 5U4NA 3OVQA 2VFEA 2BZNA 4FO4A 3PSVA 4NZFA 4K7VA 5K9DA 3STGA 1FCBA 1LP6A 3TE9A 4OHQA 1W3TA 2VFFA 1MEHA 2J6XA 4N9BA 2LLEA 3NM3A 5HJLA 3RNDA 4LV9A 1SO5A 4AHPA 3EXRA 3KAOA 4E38A 4ADUA 3L66A 1Q45A 1OFRA 1ICPA 3W2LA 3TJLA 1VLIA 1BWKA 3L0GA 3NZ1A 3LI1A 1YTKA 1MZHA 1F5ZA 2R14A 3W7NA 3T55A 3TROA 4A22A 1XBVA 1YDNA 4Q32A 5EKYA 2CLEA 1DBTA 3L5LA 3SGZA 5BMWA 3H54A 5K9XA 4JTEA 4ADTA 1SO3A 3QMRA 3VNDA 2Z2UA 4UTTA 4A2RA 3YPIA 1MSSA 2FB3A 2QR6A 1TPEA 3UXAA 4JXCA 1DHPA 5AOUA 2E09A 2EGZA 2ABBA 3U8GA 1L6WA 3TQ0A 3DXIA 4S1FA 4OQVA 4CNOA 2XFWA 2DJXA 1HO4A 3OBKA 3MO7A 5KTLA 4MVAA 3G1FA 1IGSA 1MO0A 4WOZA 1HFBA 1H7RA 1OYAA 4UR8A 4JNMA 4BI7A 1W0MA 4TMBA 5C6MA 3OEXA 2I9EA 1GJPA 3W7DA 7TIMA 4XBSA 4GUHA 3EX6A 3C2OA 1NF7A 3B06A 3O16A 5HR7A 2X1SA 2CLLA 4DPPA 4JIPA 1GVOA 1KFBA 1K7EA 3TW6A 2RFGA 3O1NA 4GUIA 1UJPA 1OX4B 1XL9A 1WXJA 3PS7A 1LBLA 1QMLA 3NQ2A 1R2RA 1YYAA 3KFTA 4RCXA 1AW2A 1JCXA 3A23A 3E12A 4N2YA 1DORA 3NEVA 1V5XA 1F05A 3W1RA 2W79A 4UR7A 1PIIA 2Y70A 1KFKA 4QSHA 4GUGA 2OJPA 1OG0A 4LVBA 1TIMA 5D33A 4P2VA 1I45A 4M6VA 3CWOX 1SZNA 3LCXA 1OX4A 3LCHA 3PBUA 1OF6A 3T40A 3TJXA 5DLCA 4UFKA 3EKLA 4UTIA 2V0TA 3TC6A 4UTUA 5LNWA 3S42A 2QJHA 3TV8A 3EXSA 5CZ0A 4RLIA 3PUEA 4UFIA 2H3DA 2ZZ1A 1VLWA 5FEWA 5G2WA 4ZQOA 2QCFA 4BWLA 1PVNA 2VEIA 1QO2A 1MXSA 4MPQA 3I7RA 3I68A 1AMKA 2ZZ6A 4MZYA 3EWZA 4E0CA 3P74A 3DENA 4O15A 1AW5A 3DFSA 3ATYA 1D3GA 1KFJA 1TPUA 1FX6A 4NJKA 5C5YA 1RQHA 3W22A 1JCMP 2XN1A 3HG4A 2ZTKA 1RQEA 3FYPA 3VE7A 3TAOA 4I7VA 4DF0A 4JY9A 1UASA 1RPXA 2DZTA 4O8RA 3EX3A 1W8SA 3O8AA 5K3VA 2FLIA 3JRKA 1H62A 3G3MA 3PF3A 3HIJA 2ZRWA 2E1DA 2ZA1A 3CQ0A 3SI9A 1R2TA 2B7QA 5CPOA 2ZA2A 2YW3A 3MWAA 1P0KA 1OFBA 3LCIA 3R5EA 3RK8A 1PCKA 2RHGA 3PG8A 5FESA 2G5WA 5U7SA 3N34A 4CQ9A 4PCFA 2A2IA 2Z6JA 3IEBA 4NQ1A 1Z44A 4LC6A 4GNJA 1JR1A 1EEPA 3IVTA 1JCNA 2VELA 4HSOA 4MJMA 4NZJA 3SY5A 1PCWA 3QSTA 2J88A 1XUZA 4FIQA 3E9AA 3PULA 2VFHA 1KLZA 5D32A 3FLUA 4IQLA 2R8WA 1QOPA 1SUXA 2Q3RA 1W5OA 4LRTA 1RQBA 1XDLA 3A22A 2CZFA 3PB0A 3B03A 4NVTA 2GVGA 2D73A 2NUWA 5HWJA 4XZ9A 1IF2A 1K7FA 4YCOA 2G97A 2CLHA 2YXGA 4ORMA 3BVJA 3PUOA 4GC4A 3NVTA 4NX5A 4NX0A 2V81A 1GPWA 2QUVA 3RF9A 1Z48A 3NR0A 2ZQ0A 2ZCGA 4HNTA 1BWLA 4MY1A 2VEPA 4DBDA 1Q3NA 3MP5A 3U6WA 1EP3A 3B05A 5A8GA 2WOQA 2Y7GA 3BGGA 4Z0JA 2AQWA 1H7XA 2JGQA 1P0NA 5G1TA 4XWUA 2BTMA 3OA3A 4A29A 2CZDA 5AHMA 5KZEA 1B4EA 1KBJA 2NX1A 3TH6A 1TRDA 4JEQA 4UMAA 3HG3A 1BEUA 1M7PA 1JUBA 4EIVA 3OIXA 1X7FA 1SW0A 3W1XA 2ZZ2A 4RK8A 5G4EA 3IVSA 4A2SA 2RDTA 4IWWA 4O52A 4ZQNA 4AAJA 2HMCA 2NWRA 4JD4A 2H8XA 4HT3A 4RZ6A 3M47A 5I3KA 1NF0A 3F4WA 3USBA 3IV3A 1W1ZA 5TIMA 1H63A 4EVZA 4N4QA 3EX4A 3UYCA 4JR5A 3W2NA 5DXXA 1ONRA 3W84A 1P5BA 2WQPA 2WJZA 1G7VA 3O15A 2E5CA 3DI1A 1WYIA 1E51A 4AF0B 4KWVA 5EL1A 4DPQA 1OHLA 3F4NA 4A3UA 3NPUA 2NX9A 4DELA 5AYZA 1YXYA 3M44A 3C61A 1VH7A 3TNOA 3C52A 2KZHA 2VFIA 2X16A 3HGRA 3NM1A 3FJ6A 4OBTA 3INPA 1LRTA 5CGQA 1TREA 1ZJIA 3CPRA 1VPXA 4CNNA 2GPTA 1EUAA 3FOKA 3HQ1A 5HMSA 4PA8A 2WSRA 1W5QA 3A5FA 3HJZA 1OFEA 3PSWA 4WXZA 4YXGA 4O1DA 1SQ7A 4AF0A 3NQ8A 1T8XA 1KTBA 3LTPA 4N02A 3GXNA 5I3IA 3DKJA 2EAWA 1VCVA 3LCGA 3G22A 1ZALA 2YYTA 2ZRUA 3EX1A 3NO5A 4R53A 5G2IA 3PC0A 4M6QA 2ZFAA 3RU6A 4GE8A 3M5YA 1FCQA 3OHIA 3FKKA 2YFNA 4J9JA 5CKSA 3W23A 5HUPA 1FCVA 3FYOA 2OMAA 2NXIA 1TQXA 4O18A 3QMSA 1GVFA 1I8JA 4IMFA 3NL6A 3I7SA 2CWNA 3GKFA 2TMDA 4FNSA 1XXXA 1FQ0A 1ICQA 2EKCA 3HGOA 5AN7A 3FKRA 2ZTJA 3QPYA 3KVKA 4XBKA 1JUKA 1N55A 2Q8ZA 4JTFA 2WNNA 2W6RA 3ANYA 3GK0A 2Y7DA 3VI2A 1LCOA 1FWRA 3NOEA 3MBDA 1VZWA 3HPXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1FWS A;  2WC3 A;  3JW7 A;  1U30 A;  1MDL A;  4L7Z A;  3WSU A;  4PBG A;  4AD0 A;  1W3N A;  2BHU A;  3UY8 A;  2WCG A;  4UCG A;  4ZEN A;  1VEP A;  1MUW A;  2UY5 A;  4D2J A;  3H2M A;  4HIB A;  2IPW A;  2Q3O A;  3TJI A;  5M03 A;  3ANU A;  3NSN A;  3ZT7 A;  1D8C A;  4PB5 A;  4QQU A;  1YPI A;  3G8R A;  1LYX A;  1HNY A;  1SW7 A;  4I8D A;  4YLW A;  4JKL A;  2ZDS A;  1XLI A;  4HD5 A;  2P3E A;  2XUC A;  4AXK A;  3UXI A;  1W8G A;  4EK7 A;  3TYC A;  1XX1 A;  1IXQ A;  2PDQ A;  5AC6 A;  2IW0 A;  3S4T A;  5LIU X;  2XM1 A;  1WZL A;  3QV6 A;  1Z41 A;  4X2P A;  3PWA A;  4HNN A;  4TQT A;  1UPP A;  4MNM A;  2B31 A;  3BLI A;  4DIA A;  4MGG A;  4TTG A;  3U48 A;  1V6T A;  4GGH A;  2WHM A;  4AG0 A;  3TSM A;  3DBP A;  1PO9 A;  1TVL A;  2BOF X;  2G96 A;  1TJR A;  1AZ1 A;  2QDD A;  1Y5V A;  5FEZ A;  1NVM A;  3W7O A;  3SM0 A;  4P8X A;  2Z25 A;  3ABQ A;  3AIE A;  1GQK A;  3LMY A;  1X1N A;  1TR1 A;  2VGB A;  2HS6 A;  3OG2 A;  5D9M A;  3PUG A;  4QSF A;  3USZ A;  4HJW A;  4KEU A;  4C1K A;  2OEJ A;  3MU7 A;  3B0U X;  2WHL A; 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