4ADSA

Crystal structure of plasmodial plp synthase complex
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
282
structure length
282
Chain Sequence
DYADNDSILLKHGWCEMLKGGVIMDVKNVEQAKIAEKAGAIGVMILENIPSELRNTDGVARSVDPLKIEEIRKCISINVLAKVRIGHFVEAQILEELKVDMLDESEVLTMADEYNHINKHKFKTPFVCGCTNLGEALRRISEGASMIRTKGEAGTGNIIEAIKHIRTVNNEIKYLCSLDESEVYNFAKKLRAPIDLILLTRKLKRLPVVNFAAGGIATPADAAMCMQLGMDGVFVGSGIFESENPQKMASSIVMAVSNFNNPKILLNVSLGLGKAMHGNTAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Assembly of the Eukaryotic Plp-Synthase Complex from Plasmodium and Activation of the Pdx1 Enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PYRIDOXINE BIOSYNTHETIC ENZYME PDX1 HOMOLOGUE, PUTATIVE
molecule tags Transferase/transferase
source organism Plasmodium berghei
total genus 98
structure length 282
sequence length 282
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-01-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4adsA00
2J9ZA 3STEA 2YFNA 1DOSA 1GWJA 1VJIA 5BRBA 1LCOA 5D05A 3UNDA 5DXXA 4Q4KA 1KBJA 3C3NA 2PRMA 1GOXA 3KVMA 4XKYB 2EHHA 3EX4A 4UTTC 3NYZA 3B04A 3FA5A 3NAVA 4IMGA 1MZHA 4KFOA 3S6DA 4RKAA 3N2XA 2DU2A 3KAOA 5TQLA 2CLMA 3W3OA 1SUXA 1Q45A 4LUIA 5D2WA 4JTGA 1CX9A 1WBHA 3DHFA 1HO4A 4O4VA 5DCDA 1EUNA 3L66A 2Y7FA 2R91A 1AMKA 4Z1BA 3BLFA 3W72A 3M41A 4BI5A 4RX0A 3L0NA 3NR0A 3LDVA 1LRTA 4O57A 4Z0SA 2R8WA 4U4MA 2DJLA 1W5PA 3NQ2A 4ICNA 4O8RA 3TQKA 3W7QA 3NPWA 4ADUA 1FDZA 1XFBA 4NX0A 5EKYA 2OCZA 3MBDA 3GLCA 4H6KA 3CEUA 2W6RA 4M6PA 1TJRA 2FPYA 5KINA 1W0MA 4N9CA 2VEKA 1W3IA 5CGQA 3NA8A 3G3DA 3OEXA 3TSDA 1VRDA 1EWEA 1JULA 3QJAA 1LBLA 3HGRA 4M7TA 2YFOA 3PBVA 3N73A 5FEXA 5C6MA 4A21A 4K39A 2Y7EA 5D04C 3QRHA 3S1WA 2A85A 3TAKA 1LLWA 5AC7A 2A2IA 3TSBA 2DZWA 4ORIA 1IXNA 1HTIA 2F84A 1WYIA 4O53A 3V1PA 1F2JA 1TQJA 4K6AA 2QJHA 1VZWA 3IGSA 3LHUA 5LZLA 5SWUA 2QJGA 1G4PA 5FF0A 3MI6A 4NX5A 6TIMA 2FB2A 1C9DA 4WOZA 4OGZA 3FS2A 3NL5A 4N9DA 4O19A 3TSMA 1JUBA 1SW0A 4N4QA 3DHDA 3TXVA 4WY0B 1TB3A 2FFCA 1XI3A 1PE1A 4O1CA 1FWTA 8TIMA 2Y85A 4QNEA 5BMXA 3NQDA 4OE7A 4Z1AA 2Y61A 5AC8A 3OA3A 5ABTA 1SU5A 3GAYA 1ICSA 2NZLA 4UMBA 1OX4A 1I2RA 1FWSA 2VFGA 1R2TA 2E5BA 4RXFA 3L21A 1ZALA 1Z42A 3BG3A 5D32A 3NGJA 4IX0A 3W1MA 1PS9A 1X1OA 4XKYA 5I3GA 1A5CA 1SZEA 3EX1A 1W5QA 4MY1A 1OFBA 2VXNA 3HPSA 2E5CA 4DO5A 2NXHA 3W71A 4NZFA 1BKSA 1F76A 3FIGA 3MI2A 5HWJA 4O18A 3GNNA 3C2VA 4LRSA 3W1RA 4M5PA 3W7EA 4UTUA 4JTKA 4LW7A 1UUOA 4O12A 1YTDA 4AHOA 3P5ZA 4H3DA 4C1KA 3W7RA 5HUOA 3UZ5A 1ME7A 2J24A 5DELA 4DPQA 3T44A 3F1QA 4BR1A 2QJIA 2RDTA 1S3HA 3EWUA 4WQ6A 3TH6A 2Y7GA 1SSDA 4AWSA 5AC6A 2QUVA 3PG8A 3FFSA 3UY7A 2R14A 3B0VC 1VH7A 5G4EA 3A22A 2GJNA 1SZNA 3N34A 4WZHA 4M19A 4AF0B 3EWYA 4IXHA 4UTWC 3GDLA 1IXPA 4M7SA 4N9EA 3UXAA 2H8ZA 4WY0F 4IMCA 5L9FA 3PM6A 1FQ0A 5G4WA 3C61A 5BOOA 4UXDA 5HNRA 3G1YA 2E1DA 4RZ5A 4YMZA 2HMCA 5AHNA 5FEZA 3FJLA 4Q32A 4O10A 2A0NA 1J5TA 4CCEA 1B3OA 4HHPA 1BEUA 3W85A 3L68A 3VE9A 2E09A 1QOQA 5DBUA 3LBCA 2IQTA 1C29A 4IUOA 2NLIA 1A50A 4HIBA 2QDHA 1FDJA 2A7RA 1ZAIA 2DZUA 5LNWA 3NXFA 1AG1O 3L0GA 1EB3A 1TPUA 3IVTA 4QQ3A 4LUJA 3W74A 1O60A 1SQ7A 1FCBA 1YDNA 2DZSA 2NX9A 3IV3A 1W31A 1EWDA 3NOEA 1OABA 3TQ0A 4XQ6A 3YPIA 4N4PA 4EIVA 5T26A 4LC8A 3TC7A 3G1DA 3H55A 1O94A 3V75A 3MW7A 5DLCA 1W5MA 1KM5A 4E2BA 3UWVA 1JJKA 3OBKA 3NNTA 3W1PA 4MYAA 1SZFA 4LVBA 3TC6A 1SO3A 4O15A 1EX5A 2H6RA 3KXQA 1H7PA 3BV4A 4A3UA 2R94A 4RZ6A 3R2GA 1ML1A 4UMAA 3M6YA 2Z6IA 3OIXA 4IOTA 2DZPA 1H1ZA 1LRNA 2WSRA 3HG3A 1L6WA 3BO9A 2A5HA 3W2NA 2TPSA 3SI9A 1KBIA 3TJLA 4OU1A 2V8ZA 1H62A 2WV8A 5HMSA 1LLZA 3BVJA 4G1KA 1KM0A 3KRUA 4UR7A 1W3TA 4FX8A 5DY3A 5DN1A 2QDGA 1L6YA 3LXBA 3BLEA 1VHCA 4FNRA 1M6JA 3IVSA 4JEQA 1LDCA 2Z0IA 4QITA 1YXYA 3GR7A 3NEVA 4XBSA 3FEMA 3ZWTA 1TCDA 2PC4A 3STGA 5I3JA 1W5NA 1JVNA 3W1AA 2V2HA 4HNNA 1Q3NA 2F7FA 6ALDA 3NG3A 2B4GA 3ZFHA 4AF0A 1GVQA 3LI1A 1FWNA 1MXSA 4O52A 2V81A 4JTTA 1H50A 1U5JA 1NSJA 3SSJA 3PSVA 3WK0A 3S9YA 3L0KA 1OFRA 2NWRA 4S2CA 4KFNA 4EF8A 1XDLA 5FI8A 2QCFA 1ICPA 4IX2A 4TR9A 4LV9A 3NL2A 3IGXA 3FKRA 4PL1A 3ABSA 5EPDA 2C0AA 2Y89A 3QMTA 1WOBA 5AFDA 1J2WA 1KFCA 2BLEA 3C2OA 3B4UA 4EWND 3FOKA 1LORA 3SW6A 2NXIA 1XC4A 3PR2A 4O0ZA 1Q6OA 1TPEA 3GXPA 3W1TA 3QW4B 1JQVA 3DKJA 4KKXA 3EEGA 1VR6A 3HB9A 1SFJA 3UY8A 2OZ0A 5FF4A 3N14A 3P82A 4N9BA 1H61A 2VKZG 3GVGA 3L65A 3QYQA 3KVJA 3NZ1A 3LGEA 3TE9A 1OK4A 3O1NA 1TPFA 5F1VA 2ZRVA 5U7SA 5F2GA 2AAMA 5DXYA 1K7EA 1GT8A 1OFAA 2CZDA 1EA0A 2NXGA 3RMJA 4O50A 1C8VA 3LHWA 1JUKA 1S5TA 3FYOA 1F6KA 1VS1A 1NAL1 5BNKA 1M7OA 2WSQA 2X16A 1K8YA 2C19A 2NV1A 1U83A 4CQ8A 3UWZA 5HR7A 4AXKA 3QSRA 3JS3A 3CTLA 4RV8A 5CPNA 1P0NA 3OHIA 1XCFA 3MMTA 4PTNA 2CU0A 3SECA 3OVQA 1PV8A 4JS3A 5FF3A 1I2QA 3PUDA 2CLEA 1AW2A 1PHWA 2D73A 5U4NA 3GZ3A 1XL9A 1D3GA 2DORA 1DQWA 1I2OA 1QPOA 4IWWA 4R33A 4BI6A 2ZZ2A 4C1LA 2ATSA 1NVMA 2XFWA 4CCCA 3NVTA 1TTQA 1FUYA 3EWXA 3EXRA 5AB3A 3MHFA 3P7YA 4A29A 4HNTA 1L2UA 4UTMA 2BXVA 3ATYA 4CLMA 1TV5A 1SR9A 3A9IA 5CPMA 5AHEA 3F4WA 1KFLA 4AVFA 3MYPA 2JKEA 3TKFA 4Y6GA 3N2MA 3NQMA 2VOMA 1WBJA 3M7WA 4O54A 5CG7A 1I45A 3HJZA 2YR1A 3EB2A 2YPIA 2B7PA 5G2WA 4GUIA 3P8IA 3N9SA 5K9CA 3PBUA 3LXCA 1FDYA 3S5OA 3HIJA 4IGHA 4O28A 4FXRA 3AO0A 3SZ8A 3TROA 1KM6A 4JX4A 4UFKA 3E02A 4MZYA 2VFDA 2EGZA 4UTLA 2I9EA 1EEPA 1K8ZA 5LKYA 2YX0A 2A4AA 1VHNA 3SR7A 1THFD 1ZFJA 2Y62A 4NNCA 1R2RA 2G95A 4JTIA 2C13A 4NJKA 3EX3A 1VCFA 4MIMA 2Y88A 1YDOA 4WXYA 4ZQNA 2CZEA 3BLIA 5K3VA 1OX4B 5AYYA 2FDSA 4YXGA 3MBFA 1TRIA 4FNTA 3ZS4A 2QCNA 3IIZA 4I7UA 3LHZA 2CLLA 2XN2A 1G4SA 4PCFA 1WQ5A 5LNUA 2CLOA 1EUAA 4LV4A 3INPA 3RU6A 3FLUA 3PB0A 3BG9A 1Q6QA 4JIQA 4JN6A 2XN0A 4EVZA 3O6CA 2WSYA 3UPBA 5LNRA 2G5WA 2CW6A 2ZDRA 3FJ6A 3IEBA 1OFQA 4FIRA 1K02A 3C8FA 4ZQMA 2C3ZA 1ADOA 3E9AA 4O13A 2XN1A 1OJXA 2C14A 3W7DA 1QCWA 3HG5A 2GQ9A 1KLZA 1RQEA 2X30A 4LVAA 5HWMA 1HUVA 2CZ5A 1SO5A 3UPWA 1TREA 5C2XA 3E12A 1EIXA 5J5DA 3VNDA 5E0KA 3LV5A 3QFEA 4MJMA 1T96A 2H3BA 4EF9A 3TU9A 4XWUA 4DPPA 1ONRA 3G1HA 4NXSA 3NQ6A 1GTEA 3JR2A 2ZYFA 3ZWSA 1SW7A 3Q2DA 4MVAA 2OT0A 4ZVJA 1LZOA 1KA9F 5LGXA 2GOUA 1Z44A 2FQIA 1OG0A 3ABOA 5FEWA 5CPOA 3NM3A 4IMEA 3ZR4A 4ONVA 4NQ1A 1KLYA 1R30A 3RK8A 1W54A 4ZMGA 3LTPA 1DL3A 1XKYA 2Z2UA 1H7NA 2X2GA 4PL2A 3Q94A 3WJXA 2W0UA 4R34A 1Z41A 3P67A 2JBMA 4O4WA 3LLFA 1RZMA 3G1SA 5FESA 4NNAA 5D03A 3PSWA 3W23A 3QMRA 5D2TA 1KFJA 1UCWA 1IIGA 1R46A 1DHPA 2FTPA 1OK6A 5C54A 2WPBA 4JX5A 3QH2A 3NL3A 3EWBX 1DJQA 3W7CA 4GC4A 1JRCA 2QCEA 3KOFA 2Y6ZA 1QFEA 4HSNA 3S8HA 1Q6LA 3G1FA 3M5ZA 2QUTA 2WKJA 3GNDA 2PRHA 3M5XA 3L5AA 2E6YA 2ALDA 3W7MA 4JY9A 1V7YA 5EMUA 2NX1A 2EF9A 2Q3OA 4MZ1A 3ABQA 4TIMA 3O63A 1K3UA 4Y9AA 2A7PA 3C2FA 1ZJIA 4LY8A 2Z6JA 5E93A 1RR2A 1TMHA 2QCDB 3W84A 1ZNNA 4IXXA 4HNVA 1EP2A 3O6DA 4JTJA 1B4KA 5IBXC 1QPRA 3W7IA 3MP3A 3T78A 1OYCA 5FF7A 3O06A 4NJJA 4JDBA 5EY5A 4XUGA 1SO6A 3N9RA 3LRMA 4FNSA 4FNQA 1TPC1 2AQWA 1FXQA 1LM1A 2ZZ4A 4UFMA 4GRSA 3QM3A 5G1TA 2RDWA 3SY5A 1GG1A 2H3DA 2V2CA 3C52A 3I65A 2CLFA 2QAPA 4ORMA 3WK2A 5IM51 1QPNA 3DXIA 2E68A 3DZ1A 2FLIA 1DQXA 4LU0A 2G96A 3QZEA 5HJLA 3TK7A 2I14A 3LBMA 5DCEA 1TYGA 2QCGA 3IIXA 2Q8LA 3LHYA 4Z1DA 2LLEA 3WJWA 2ZCGA 3DKLA 3PAJA 4OQVA 4I7VA 2P0OA 4TMBA 1GG0A 1Q6RA 1JCMP 2DZVA 4GWEA 1P1XA 1FWWA 3E49A 2P1FA 1FWRA 4FNPA 4CNOA 3F03K 1R47A 3GDKA 4DBDA 5GVJA 3MWAA 3W88A 2C6QA 3NPXA 4KWVA 3Q37A 1V5XA 1PL9A 3MJYA 3A23A 5C55A 4UIOA 4XBKA 1OVDA 4AHQA 2C18A 2W79A 3ELFA 2G97A 2WNZA 1UASA 4UNKA 5F4XA 3U2OA 4I9AA 4MY9A 5EL1A 2QCHA 2CLIA 5F2MA 1QAPA 1R2SA 1SW3A 3P8JA 1YYAA 4AEOA 2QUUA 3NQ8A 3PB2A 1JCJA 4MFDA 2FPTA 3HG4A 3O6YX 2NWSA 4N02A 4DF2A 1AW1A 4ALDA 4Y8FA 1UBSA 4MYXA 1FBAA 3W1QA 4X9SA 1IXQA 4K37A 4UMCA 1YPFA 5KMYA 3NPUA 3LLDA 1DORA 4O1BA 2OJPA 7TIMA 5DBTA 4N6FA 3M1ZA 3KVLA 1JCYA 1P5BA 2ISWA 2O7QA 4BI7A 3GIYA 5H2ZA 3TFCA 1F7BA 2V9DA 5I3HA 2A6LA 2JK2A 4JYFA 2ZZ6A 2BSLA 2QCDA 3R12A 4DBEA 2J88A 3R5EA 4DF0A 1EP3A 3I7QA 3R13A 2PE4A 3W07A 3SGUA 4RJEA 1OYBA 2RFGA 2QF7A 4UFHA 5D30A 3TFXA 5I3FA 3IIPA 4UTIA 4BWLA 1XBZA 4NJGA 5K9DA 4P61A 2ATMA 3MHGA 3S0CA 1L6SA 3W86A 4PODA 3PUEA 5J5RA 2V30A 5F2LA 1YDVA 1H7WA 3PVFA 3NZRA 2AGKA 5H91A 1LBFA 1K03A 1OX6A 3LCLA 1N55A 2H90A 4MOZA 3DFNA 3OVRA 4LS0A 1MEHA 3N19B 2FPVA 3VKJA 3S42A 3QMSA 4OWGA 1SFLA 1TPDA 5A8GA 4NT0A 1AW5A 3CPRA 1LOQA 3HGOA 2ZTKA 1KV8A 1JQXA 2YGYA 3M5VA 3TW7A 3C2RA 3W73A 3PUOA 1GQNA 3LX9A 3PG9A 1O5KA 4ADTA 5C5YA 5D33A 1YXDA 3R8RA 3W1UA 5LNVA 3G0XA 3VI2A 1TQXA 1LP6A 2YDAA 4JTUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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