4AEOA

Structure of xenobiotic reductase b from pseudomonas putida in complex with tnt
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
349
structure length
349
Chain Sequence
TTLFDPIKLGDLQLPNRIIMAPLTRCRADEGRVPNALMAEYYVQRASAGLILSEATSVSPMGVGYPDTPGIWNDEQVRGWNNVTKAVHAAGGRIFLQLWHVGRISHPSYLNGELPVAPSAIQPKGHVSLVRPLSDYPTPRALETEEINDIVEAYRSGAENAKAAGFDGVEIHGANGYLLDQFLQSSTNQRTDRYGGSLENRARLLLEVTDAAIEVWGAQRVGVHLAPRADAHDMGDADRAETFTYVARELGKRGIAFICSREREADDSIGPLIKEAFGGPYIVNERFDKASANAALASGKADAVAFGVPFIANPDLPARLAADAPLNEAHPETFYGKGPVGYIDYPRLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Determinants of Aromatic Ring Reduction in the Xenobiotic Reductase B from Pseudomonas Putida
rcsb
molecule keywords XENOBIOTIC REDUCTASE B
molecule tags Oxidoreductase
total genus 134
structure length 349
sequence length 349
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4aeoA00
1QDSA 5H2ZA 1LCOA 2E5CA 2FQIA 2OT1A 1OFAA 4Z1CA 3PF3A 4OE7A 3P81A 1PHQA 4R7JA 3G1DA 3C6CA 3WJXA 3G0SA 1P5BA 1Q3NA 1F2JA 3S42A 5E1QA 1KM6A 1OFRA 3W2NA 1DQXA 5FEXA 1CI1A 3B4UA 4IX2A 3B0PA 5AFDA 1H60A 3BW4A 4JTLA 1IXQA 3P5YA 3W83A 3LHUA 4UFLA 3Q2DA 5AB3A 3PB0A 5HUOA 5A5WA 2AAMA 3IVTA 4LRSA 4UFJA 3FIGA 2ABBA 3UY7A 1KM5A 1TJPA 4NJHA 2BLEA 1SZFA 1F76A 4IPIA 1NAL1 1ZAJA 4A29A 1OFBA 4ICNA 3OHIA 3LV5A 1FWRA 3MW7A 3ATYA 1TTJA 2DZXA 3NVTA 4PL2A 5U7SA 4AWUA 3B05A 3VE7A 5HNRA 3IV3A 2FB3A 3A5FA 4Y6GA 1KFCA 3TK7A 1I2PA 3DENA 2Z0IA 3H53A 1KFLA 2QAPA 1GTHA 1Q6OA 1P0KA 1KM2A 4UFIA 5TBOA 3G8RA 3E02A 1K8XA 1MXSA 5J5DA 3TFCA 2RKXA 3R89A 3S0CA 1YYAA 4ZVJA 4K37A 5TQLA 3DU0A 3DHDA 4N02A 1KA9F 1U83A 5F2IA 4LUIA 3LCWA 3EWZA 1C9DA 3A5VA 2QEZA 1KBIA 1KTNA 3QSRA 3QFEA 5IM51 3FYPA 1W3IA 1GT8A 3N9SA 5HWMA 3FLUA 5D09A 4H4IA 3MYPA 4X9SA 3M16A 3EX3A 3BPWA 5FF4A 3PB2A 4DBEA 3DKLA 2OX1A 5F2GA 4JXCA 2YX0A 4NUWA 1OHLA 4JTUA 1HUVA 1L6YA 4UFMA 2V5LA 3EWXA 3T55A 5C6MA 2FFCA 2V81A 2HS6A 3W7IA 1YDNA 3W3OA 1M7OA 3LRMA 4MJMA 2WJZA 1OJXA 2B7QA 2Q3OA 3VKJA 3LTYA 1TYGA 3DFNA 4YWIA 1QAPA 4LVBA 7TIMA 3QPZA 5AYYA 1W5QA 3FFSA 2NUXA 2DZPA 1EUNA 4FB7A 3W71A 3C2VA 4FX8A 5L6UA 3S6DA 3EXRA 3I7SA 1HO1A 3TFXA 3WK3A 3O8AA 3EWYA 1EIXA 3WJZA 4AF0B 5LHFA 4JYDA 4HPJA 1OFQA 5T26A 4A2SA 2J24A 4XTIA 4WY0A 3STEA 3N14A 3L68A 3NG3A 1DVJA 2ZZ2A 1DOSA 1Q45A 3NR0A 1N55A 3P74A 2CLFA 2ZQ0A 1SZNA 4NQ1A 1OYBA 3K30A 3RF9A 1GWJA 3BLFA 4OQVA 4FXSA 2HS8A 5L9FA 4UTJA 3M9YA 3KVLA 4AB4A 2F7FA 4MY8A 4OBTA 4O1DA 3NNTA 2JBMA 3ABSA 1YDOA 3NQFA 5BRBA 3P62A 5FF3A 3UPWA 3B04A 3I65A 4LNYA 5HJLA 4O16A 3O1NA 1IXOA 2QCNA 4IX0A 1C8VA 5G1YA 4K38A 3W7NA 1KM1A 4DF2A 1TPWA 3CTLA 3LHWA 3UWQA 4LUJA 5DBTA 1TRDA 4UMBA 1DL3A 2WNNA 4HT3A 1VZWA 1XM3A 3ZWTA 3NQGA 4BI6A 4CCDA 3GDRA 1VYRA 4QITA 3HG3A 4LC6A 4JICA 3LM7A 1UCWA 1GVQA 3W85A 1GTEA 1G69A 5I3IA 1RQBA 1W8SA 4IMFA 2P0OA 3HGSA 4AXKA 4O12A 4UCGA 4RR4A 4R33A 4UMCA 4QNWA 2H8ZA 2Y62A 1QO5A 1SFJA 4WXZA 3LHYA 5DELA 5AOUA 4QNEA 1RV8A 3M41A 1FWWA 2WO5A 4POCA 1G4PA 1G6CA 3GNDA 1LBMA 3W7DA 1G4EA 4FNQA 2ZDRA 1OABA 1GYNA 4N9BA 4CNPA 1L2UA 3S9YA 4YCPA 2VEIA 4UTUA 3R13A 3PBWA 3W7HA 4K6AA 3NL6A 3U8GA 3PC0A 1QR7A 3C2EA 3FA5A 3PG8A 2JK2A 3NM1A 3M44A 3TUUA 2DZTA 1T99A 5CZSA 3W7LA 4HSOA 4FNSA 5DN1A 3MJYA 5F4SA 2I9EA 4R53A 1YTKA 4GUIA 1WX0A 1EB3A 1OYCA 2JKAA 3UZ5A 1H63A 4NJKA 5KZMA 4HN4A 2B0MA 3UWVA 2V2CA 3EWUA 1GVRA 4BF9A 3ABRA 2WSQA 2Y7FA 4A21A 1B4EA 1WA3A 1MO0A 3SFKA 8TIMA 1X7FA 5HWNA 3T4CA 3W2JA 3AO0A 1SSGA 3NQDA 1RR2A 5AC6A 4O52A 2GJLA 4ZZ9A 3DZ1A 3BLEA 3L65A 4M5PA 2E6AA 1LBLA 3W9ZA 5FI8A 3O6YX 2YYUA 1KFKA 1SPQA 5F4WA 1H1ZA 3CT7A 3ZR4A 5CZJA 4E2BA 4UTMA 3UWUA 1X1ZA 3USBA 1L9WA 3BVJA 2HSAA 4LWWA 3OVPA 4I7VA 2R91A 3TE9A 1TPC1 1RD5A 3SGUA 2NZLA 3W2KA 4KFNA 4JTJA 3RFAA 4Y90A 4Z1BA 2Y7EA 1GVOA 1TTIA 3B8DA 2V0TA 3M47A 4B5NA 1IIGA 5HWJA 1EUAA 4K8HA 4UR7A 3LXCA 3W72A 2TPSA 5CPMA 4O15A 1QFEA 3P67A 1Z41A 4IMGA 4JGDA 4XWUA 4C1KA 4EIVA 3CQ0A 1TPH1 3BG3A 3SY5A 3TU9A 4L4LA 3A23A 3HPSA 4AHOA 1PCKA 3G3DA 3F4NA 5LNRA 3NGJA 4UTLA 4UUIA 1TB3A 3JRKA 3S5OA 1UBSA 1ZFJA 4XQ6A 1ZHAA 2C19A 4E38A 3DI1A 4HIBA 5HINA 4PCFA 3CIWA 2VFIA 3VFLA 3FKKA 3W88A 1O94A 3S1VA 3LHVA 2X2GA 4MLRA 2V82A 2CZDA 3MP3A 4ZQOA 1OFEA 5D2VA 3CIXA 1F73A 1HTIA 4O17A 3TQVA 1J2WA 2FB2A 3SI9A 5AC7A 2YXGA 1D3GA 5FF2A 4NVTA 5KINA 3MI6A 4MFEA 1VQTA 2Z6JA 5AYZA 3G8EA 1DQWA 5FF7A 3AJXA 4O4VA 1L6SA 3W84A 3LCXA 5K9CA 2ABAA 1JCYA 4O57A 3TC6A 4FNRA 4AF0A 1KFBA 3G1HA 1FWSA 3UWWA 1UASA 4DO4A 1BTMA 5HQEA 2X1UA 4GJ1A 3G1FA 3H54A 3TA6A 3G24A 3Q58A 3UXAA 5CZTA 2TYSA 4WX2A 2NWSA 4ORMA 1KBJA 1BWLA 1JUKA 1SR9A 4XBKA 4JTHA 3KVMA 4JIPA 5GVJA 4PODA 2Y63A 1VHCA 1TIMA 2VFHA 2ISVA 2EHHA 1JCMP 2ZRWA 1FCVA 2VFEA 3MMTA 3F4WA 1BWKA 1NVMA 2CWNA 4YMZA 1ZENA 4KWVA 1VH7A 3M5XA 1VJIA 4LS2A 1KFEA 3L5AA 4AHPA 4OGZA 3M5VA 1XDMA 1SZGA 1S3HA 5EMUA 4K39A 3PS7A 3L67A 1WDWA 2GQ9A 4HKPA 2Y89A 1SW3A 2Y88A 2V30A 2A6NA 3W7JA 2ZYFA 4BFAA 1TV5A 2VFDA 3FKRA 4GC4A 3T44A 3W74A 4IQLA 3OEXA 1RZMA 2QCHA 5IBXC 1KV5A 2ZA3A 3STFA 3EWBX 3SZ8A 3QF0A 1W1ZA 1I4NA 1ZJIA 1A5SA 3IIZA 2QCDA 2J9YA 3S1UA 1W0MA 4IPJA 1JR1A 5CG7A 2VOMA 3O15A 4DELA 3PBUA 1W56A 3IVUA 3Q94A 4LVDA 3NZ1A 2VXNA 3QPYA 1LM1A 3DFSA 3W70A 2EKCA 1YLVA 5EYWA 3MHFA 2FDSA 1VCFA 4M19A 1Z48A 3EB2A 1HO4A 3QMTA 3R2GA 2CLMA 2EPHA 1W31A 3OIXA 4RZ5A 3A22A 2E77A 1EP1A 4GUFA 1EP2A 1LLZA 4MOZA 3NQAA 3DFTA 4HNNA 1F74A 4FIRA 3JR2A 4O50A 3SGZA 4FNUA 2YFNA 3M5YA 1KW1A 3HBLA 3LV6A 1Q6RA 3N2MA 4FX6M 2C0AA 3U6WA 3TSDA 1MEIA 1C29A 2G97A 2X16A 4WY0F 4ALDA 5CPOA 4NZFA 1TSIA 4JYEA 3PUOA 3TNOA 5D32A 3W7OA 4DXVA 1H51A 3PY2A 3P5ZA 1T96A 3M0ZA 5TIMA 4LU0A 4AWTA 3UNDA 4O53A 4JX5A 2P10A 4JTKA 3GKFA 5AC8A 4CNNA 3RU6A 4D2JA 1WYIA 5C55A 5BMWA 3P80A 3W2UA 2H8XA 3FEMA 1CX9A 1GVSA 1SSDA 4CQ8A 1LRNA 2YR1A 3LI0A 5ABTA 1FCBA 5C54A 2GJNA 4LV4A 1QOQA 2A7PA 3M6YA 3QM3A 4WXYA 1JUBA 4IMCA 4R34A 2BTMA 4NJGA 3LHZA 1TTQA 3P84A 1SO3A 2Y7DA 4LOCA 1LDCA 3C56A 1QO2A 3Q37A 4LVFA 3IIVA 3WK0A 5D2WA 2RDWA 4A3UA 3P8JA 1PVNA 1R2RA 5AYXA 3KRSA 1Z44A 4K7VA 4J9JA 3HB9A 3NPUA 3PVFA 3W1RA 4IGHA 4JEQA 3JS3A 1GG1A 3NL3A 3UWYA 4OT7A 5I3HA 1L6WA 3F1QA 4RXGA 3U2OA 3MHGA 4CCEA 3CWOX 1H5YA 3KHJA 4GRSA 4BWLA 1G7VA 5CPLA 4IMEA 4NX0A 4EF8A 1LP6A 4IMDA 2E5DA 2NXHA 1D9EA 3QYQA 2ZRVA 1JRBA 3HPXA 4EVZA 4Z0JA 2E5BA 4DF0A 3NQ2A 2QDGA 3MYOA 2VEKA 1TPVA 3BG9A 3TH6A 1XCFA 2Q8LA 1IXNA 1PV8A 3INPA 3IGSA 4JNMA 1T0OA 3BGJA 3C3NA 4LS0A 3NM3A 1SU5A 1GQNA 3W86A 1JRCA 3QQ0A 4JTGA 1DHPA 5D38A 1VLIA 1VCVA 2QR6A 4YLWA 3W76A 1SFLA 4PL1A 4FEZA 1WAUA 3LBCA 1ZY9A 3CM4A 1VLWA 3EKLA 4HPXA 5U4NA 4FNPA 2BSLA 1YXYA 3KFTA 1QOPA 1SZEA 4O13A 2C1HA 4NT0A 4HNVA 5I3JA 2QCMA 3E49A 4N4QA 5D2TA 1THFD 1V7YA 2CZFA 4XBSA 3PM6A 3GAYA 2I1OA 3PAJA 4IXXA 3NPXA 4LC8A 1H7RA 3E96A 1SUXA 3IEBA 1ME8A 4NXSA 3I7RA 1YADA 3EX1A 3THAA 3ZWSA 2NV1A 5LGXA 1J4EA 1DV7A 2YDAA 3EX4A 2CLKA 3WJSA 4LV9A 4I9AA 4PC8A 4BWLC 5LGZA 2J27A 1NF7A 1VYPX 1JQXA 3EX2A 1B4KA 5HR6A 2QJIA 3NPVA 2WPBA 4JTTA 4IUOA 1H7OA 2V9DA 4IOTA 4DPQA 1A53A 2NX1A 4UXDA 5J5RA 3LLFA 1O5KA 2NXGA 1R30A 3S5NA 3NA8A 3KOFA 2QCCA 3HMJG 3IIOA 3G1YA 5EBUA 1ML1A 3LTPA 1NFBA 2A0NA 4XZ9A 4S2CA 5D37A 4JX4A 1EEPA 1ZCOA 3VE9A 1R2SA 2ZA2A 1FXPA 3TIMA 4CQAA 1JCJA 4O18A 2CLIA 3TCEA 3R8RA 3TW6A 3C2FA 1V5XA 1N7KA 2YZRA 2CLHA 1SO4A 4PFMA 1TPEA 1O4UA 3GZ3A 4I7WA 1ALDA 3L21A 1Y0EA 1XBYA 2ZTJA 2BX7A 1TCDA 3HIJA 3KRZA 3BV4A 1LROA 3QQ1A 1GJPA 4WJEA 4O1BA 5EA9A 4WD0A 1JJKA 2CZEA 2DJXA 5D03A 5AHEA 1ZALA 2CLEA 3CPRA 1G4SA 1TV8A 5D30A 5DBUA 3TMQA 3GB6A 3V75A 3N73A 3H55A 2AQWA 3W1TA 4IXHA 2YCEA 2A4AA 1A5CA 4Z08A 3HPZA 2YFOA 2ATSA 4CCCA 4HNTA 1XBVA 4S1FA 4NNBA 3WK1A 4AHQA 4IJBA 1SO6A 1EWDA 4P2VA 5DCDA 2RH9A 5AHIA 4K36A 5D05A 2QKFA 3MP5A 4JIQA 2ZFAA 1JCNA 3TJXA 4AH7A 3TXZA 4MY9A 3L0GA 3TMLA 1TRIA 4EOUA 1H61A 1JULA 4MVAA 4BR1A 1DJNA 4N9EA 2PRMA 1UUOA 2WQPA 2X1SA 1W3TA 2XN2A 1KM0A 3V1PA 3TXVA 3LRLA 1CW2A 2G96A 2A7NA 1VGAA 4MPQA 2FIQA 4RKAA 3O06A 4QM1A 1TQJA 4BI5A 1ICPA 1K03A 5A8GA 1F5ZA 3WFAA 4IWWA 2ZTKA 3W7GA 1VPXA 2WOQA 5G2HA 3STGA 5E93A 4O11A 3HO8A 3NQVA 4EWND 1OK4A 5LNWA 2KZHA 2ISSA 5LKYA 1EA0A 1FCQA 4CQ9A 4UNLA 3IRDA 5BNKA 1I45A 2OT0A 3E0IA 3GNNA 3DFOA 3QW4B 3MP4A 1KV8A 1LRQA 1R47A 2Q3RA 3BLIA 3DFPA 3R5EA 2E68A 4H6KA 3LCIA 3HGJA 1DBTA 3SW6A 1P4CA 4RV8A 5LNUA 2NUYA 3ABOA 1X1OA 2J9ZA 3UZJA 3RLUA 3LCFA 3NAVA 2ZZ7A 2A7RA 3C4UA 1OX4B 3L2IA 3OVRA 1SQ7A 2ATMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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