4AF0 | Genus

Total Genus 121

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	121
sequence length	522
structure length	395
Chain Sequence	TNPNAPPRPDSLLNPSDALKHLEEYPRGDGLSLQELMDSRKNGGLTYNDFLVLPGHINFPASDVSLQSKATKNIVLNTPFLSSPMDTVTEDRMAIALALHGGLGIIHHNCSAEEQAAMVRRVKKYENYPYASKVPESKQLYCGAAIGTRPGDKDRLKLLAEAGLDVVVLDSSQGNSVYQIEFIKWIKQTYPKIDVIAGNVVTREQAAQLIAAGADGLRIGMGSGSICITQEVMAVGRPQGTAVYAVAEFASRFGIPCIADGGIGNIGHIAKALALGASAVMMGGLLAGTTESPGEYFYHEGKRVKVYRGMGSIEAMEHTGLDNAATARYFSEADAVKVAQGVSGDVADKGSINKFVPYLFTGLQHSLQDAGIKSVSELHSCARSGSLRFELRTAS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	De Novo GTP Biosynthesis is Critical for Virulence of the Fungal Pathogen Cryptococcus Neoformans pubmed doi rcsb
molecule keywords	INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Cryptococcus neoformans
total genus	121
structure length	395
sequence length	522
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2012-01-15

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
B	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
B	PF00571	CBS	CBS domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4af0B00

2V0TA 1XI3A 4TO8A 4UFMA 1GT8A 2ZYFA 4QSHA 1TV7A 2PRLA 4GUFA 1YPFA 3NQFA 1H50A 1J4EA 3LV6A 3MUXA 4OGZA 4RJEA 1OYCA 5IBXA 3O1NA 3C6CA 4PCFA 5D2YA 2CU0A 4EF8A 5LHFA 1K7FA 2YFOA 3QH2A 2FQIA 2PRMA 5DCEA 1RQEA 1L6SA 3W6YA 4FNUA 3HBLA 2A6NA 2OJPA 1H7PA 3SIZA 5K9XA 4WX2A 3S9YA 5K7JA 3UY8A 3B0VC 4RZ5A 3CB8A 3GLCA 1G67A 2NUXA 5F1VA 2CLMA 3HOJA 5BOOA 4X3ZA 1H5YA 4NJKA 4LC8A 3C61A 4RZ6A 1KFBA 5LGZA 4IMDA 4POCA 3KAOA 3ZR4A 4JTFA 4AH7A 1GYLA 1LRTA 4BR1A 3S6DA 3UWWA 2I1OA 3P84A 4OE7A 3TV8A 3QF0A 4E38A 4Q33A 3TFXA 2DZWA 4MY9A 1XCFA 3LHWA 3L65A 2C0AA 3O8AA 1P1XA 5D2TA 3LDVA 3P8IA 4R53A 1AL7A 1EUNA 2ZTKA 3MBDA 3TQ0A 1H7NA 1RD5A 3T78A 4K7VA 5AC7A 1KM3A 2LLEA 1C29A 5LKYA 2AQWA 4RXFA 5J5DA 1VGAA 2NLIA 5F2IA 5A8GA 2Y7FA 1V5XA 2ZA2A 3DFPA 3G24A 1K02A 4FNRA 4O50A 4AB4A 4JTIA 5AYYA 1GOXA 4WXZA 4HIBA 1TREA 2TYSA 2VFGA 1ICQA 3N73A 1Q45A 2VEKA 2DZTA 1J5TA 1O5XA 3BG5A 1N8FA 2ZZ1A 4M7TA 5DY2A 4ADSA 2WNZA 3NDOA 4CCDA 2E09A 3MW7A 1G4TA 3C4UA 3L0KA 4YMZA 2V9DA 5AHEA 3W3OA 5FEZA 1SZFA 3W7CA 1K03A 3S1UA 2TMDA 1OHLA 2GJNA 3L2IA 1D9EA 1JJKA 1OF6A 1Q3NA 5BW6A 4H3DA 3M5XA 5CPLA 2AGKA 3UQNA 1Z42A 2B4GA 3TMLA 4DBDA 1JRCA 2CZFA 1W1ZA 1S5TA 3GDTA 1GTHA 1TIMA 1JUEA 4MY8A 3KFTA 2YSWA 2EHHA 3EXRA 1QO2A 1CX9A 3HO8A 4FO4A 3CEPA 1VYRA 3NG3A 3MWAA 1DORA 3L0NA 1SFLA 1OFOA 3DFNA 3EX3A 2Y61A 1G4EA 1EP1A 3QPZA 4JDBA 2P0OA 1IXNA 3W7DA 1FXQA 2FPVA 3M16A 3OEXA 1IF2A 2B7OA 1FXPA 4MFDA 3M1ZA 4M6PA 3M5ZA 1VC4A 1XBYA 1G69A 5G1YA 2ABBA 4O53A 1FWTA 3PSVA 4AXKA 1W37A 4O57A 2NXHA 1LM1A 3MHUA 1W5PA 4CCCA 3MO7A 4O1BA 4YCPA 1UJPA 4XBSA 4E2DA 1NVMA 1QOQA 2ZZ4A 4GUJA 1SO5A 4UMCA 2WO5A 1B4KA 4PA8A 1FCQA 2GPTA 2NX3A 4IX2A 4O1DA 1F73A 1V7YA 1KM1A 4NJIA 5EBUA 5BRBA 1TQXA 4L4LA 3C2FA 3IGUA 4FF7A 5I3JA 3G1DA 1A53A 1W56A 5D30A 3MP4A 1QAPA 4U4MA 3THAA 2FB2A 5FI8A 5FF7A 2X1UA 2GQ9A 4PH6A 2FIQA 4UTLA 4HN4A 4DF0A 3IGSA 2QCDB 2E5CA 3DENA 4LV4A 4MZ8A 1HUVA 4OT7A 4HNTA 3HMJG 2BXVA 4O12A 1I2NA 4ALDA 3LXAA 2Q3RA 4UTTC 4DO6A 2ZZ7A 3NOEA 3S42A 1ONRA 5D2VA 3LRKA 4FIRA 5D05A 4DO4A 1FBAA 2EKCA 1TPUA 4A2SA 3LCLA 3TROA 1DQWA 4RKAA 6ALDA 4IPIA 5KZEA 4Y9AA 5EMUA 1W5QA 3LERA 1KV5A 1QPOA 2Y6ZA 3W73A 4MOZA 3HG2A 1SQ7A 1WBHA 3DI0A 3S5YA 4NNCA 1DQXA 3T55A 3KVMA 3BLFA 3F1QA 1YXCA 3OVRA 3WJXA 5AYXA 2FPYA 1UCWA 3P80A 1VHCA 1NAL1 3GVGA 4DO5A 3LX9A 4IQLA 3RU6A 4GRSA 3W7JA 1DJQA 2YCEA 1P0KA 2I9EA 5G1TA 4R33A 2GOUA 2H3BA 4O15A 3CIXA 1CW2A 2JKAA 1DHPA 2A0NA 1VPXA 4K6AA 4KFOA 2HTMA 5F2MA 4XQ6A 4CCEA 3TW7A 4N9DA 1QPQA 2C13A 1FDYA 3W84A 2CLEA 4N9CA 1ME7A 4AAJA 4CQAA 1FDJA 3F4NA 4JD4A 5DBTA 3C8FA 1A5AA 3OG3A 4ZQCA 3W7GA 3SJ3A 2F7FA 3LTSA 3R13A 2DJXA 2FFCA 2G97A 2QCGA 5L6UA 3C2OA 4LV9A 1GG0A 2VOMA 3H53A 1TRDA 4UTIA 5DXXA 1LRNA 2WSYA 5EPDA 4O52A 3SFKA 3GXTA 5LGXA 4UUIA 3GAKA 3I65A 2ZRZA 1DBTA 1SO6A 1M6JA 3W1UA 1ZHAA 4UTTA 3A24A 3W1AA 4AEOA 4AHQA 1T99A 4O28A 1DKWA 1EP2A 1TV8A 1GVFA 2YYUA 3LCFA 1OK4A 4A22A 4MY1A 4FX6M 3AJXA 3H54A 4P61A 3MJYA 3NQ6A 3BG9A 4UTWC 1THFD 3HQ1A 3GYEA 2B7NA 1TTQA 3HG4A 3W1XA 3VKJA 4LS0A 3USBA 4OQVA 1A5CA 5I3KA 1OFDA 3OA3A 4LVDA 1N55A 4JX6A 4LY8A 2VFFA 3UWQA 1RV8A 3EKLA 2VKZG 2J27A 3I6RA 2Z6IA 4O10A 3E49A 3OHIA 4DPPA 2ISVA 5BNKA 1L6WA 1GVQA 4MJZA 3BPWA 1W3IA 4M6VA 3P5ZA 1SPQA 1ZENA 1TCDA 4DXVA 3W9ZA 3W7OA 5HULA 2A21A 2GVGA 4NUWA 3IV3A 2Z6JA 3Q2DA 4MYAA 1JUBA 4NT0A 5LNVA 3EWZA 3F4WA 5FEPA 1W3TA 4GWEA 4XKYA 3NQGA 1F6KA 3JRKA 4JDYA 2CZEA 3UY7A 4JTUA 1SZNA 2ZA3A 1M7PA 3N3MA 4I7WA 3UZ5A 3THQA 3DFTA 3DFQA 4AVFA 1RZMA 3MYPA 3LB0A 1L6YA 3BW3A 3W7RA 3P62A 1OFBA 2C15A 3G8RA 3SI9A 4H6KA 6TIMA 1W8SA 3EX6A 2O7QA 5DCDA 2ABAA 3W2NA 3W87A 3QQ1A 1QPNA 2QCMA 3G0XA 3UXDA 1I4NA 3YPIA 1NSJA 1I8JA 2ATSA 3CU2A 3NQVA 3UYCA 1QPRA 4QNWA 5BMXA 4RR4A 1F2JA 5KZDA 3S5OA 2Y89A 1BWKA 5HJLA 3TMQA 4UTMA 1L9WA 2CLIA 3GX9A 1MSSA 5EY5A 4LRSA 2BSLA 4XBKA 2ZRWA 1TSIA 3MP5A 3TJXA 3M43A 4LT9A 3CC1A 4JGDA 4JTTA 1XL9A 4DBEA 5ABTA 4CNOA 2C14A 3K30A 1EIXA 2R14A 5CG7A 3DH7A 1TMHA 3CM4A 4UTWA 3NPWA 2X16A 2D73A 2ZDRA 4QM1A 1Y0EA 4UXDA 4NU7A 1ZY9A 1VHNA 2CLFA 4FXSA 2Q3OA 1HL2A 1SSDA 4ZQMA 2OZ0A 5D09A 2XFWA 3KHJA 1F74A 1ZCOA 3LBMA 1OFAA 3W22A 1M5WA 3TW6A 3LXBA 4OHQA 1TPWA 4OV9A 3Q94A 4W9TA 3UPBA 3SGZA 3W1TA 4NVTA 1L2UA 2VEPA 3HGSA 4YCOA 2YGYA 3OIXA 4UTUA 1WV2A 2QDGA 1LRQA 1OFEA 4ZQRA 3QMRA 1QMLA 4O1CA 4LVAA 1LLZA 1TPFA 2WSQA 3P67A 1OFQA 1YDVA 5CPMA 1H1ZA 4CNNA 1KM2A 1ML1A 3W2KA 4LTSA 1O5KA 3LLFA 1TPDA 3PAJA 3QQ0A 5AHIA 1HO4A 4MFEA 1XC4A 3FFSA 1TRIA 3U6WA 5G2HA 1PHQA 3SGUA 1LOSA 2FDSA 3O06A 1Z48A 1FY6A 3L0GA 4IJBA 3EWBX 2DP3A 4BK9A 3LCGA 4PC8A 3G1YA 3KVJA 4ML9A 3SZ8A 5K4ZA 2GUUA 1VJIA 4KFPA 1QOPA 4QISA 4L4MA 2ZRUA 3WJZA 3HGJA 2QDHA 5F2GA 4K39A 4K38A 5D03A 1SW3A 3TJLA 2A4AA 4NJHA 1OYAA 3M6YA 4HT3A 4LRTA 1R46A 3KX6A 1MEIA 5CSSA 1KFJA 2CW6A 4KWWA 4TMBA 4DQWA 1HTIA 3NO5A 2TSYA 1KFEA 4K37A 2FJKA 2VEMA 4DF2A 2ZBTA 3I7SA 4NJJA 2Y63A 2CFFA 2QCHA 3GR8A 3SECA 5FESA 1OFRA 4QQ3A 4N9EA 1X7FA 1YXDA 3DFOA 3NVTA 1R2TA 2WNNA 3GDMA 3C56A 3C2RA 1EWDA 4LOCA 1H7OA 1ZALA 3PBVA 2B0MA 4IOTA 4RCXA 3W7EA 4XUGA 4NX0A 2QR6A 2O7SA 1JCJA 3TQVA 4AHPA 4Z0JA 3B05A 1KFCA 5H2ZA 4OU1A 1EX5A 3TXZA 3A5VA 4MZ1A 2Z0IA 2PCQA 4S1FA 3WJWA 1F76A 5K3VA 5I3FA 4AF0A 3HG5A 1OX4B 2VFEA 4XTDA 2P10A 1MZHA 3WK3A 3B03A 3GXNA 4NNBA 1X1ZA 1BWLA 3HGRA 2TPSA 4PODA 3DGRA 3MI2A 2J88A 1LLWA 4O4VA 4ADUA 4I9AA 3LHZA 2A7PA 2J24A 4XWUA 1K8YA 4EOUA 1KA9F 3KRUA 3NQ2A 1U83A 2V2CA 1EEPA 3HB9A 5HQEA 4JXCA 2RKXA 2I14A 4JYFA 1GG1A 2VFHA 2ZRYA 2H6RA 2WNQA 1FX6A 4R34A 3W2UA 4JY9A 4UTKA 4LU0A 2QAFA 1KBIA 3TNOA 2YW4A 5EA9A 3QPYA 1G7VA 2YFNA 1EP3A 5G4EA 2ZA1A 3E02A 3VE9A 3W86A 2FTPA 4DF1A 4N6FA 2QUVA 1O94A 1YTDA 2ALDA 1T8XA 2QUUA 4Q4KA 5KSWA 3T4CA 3B0UX 3L5AA 4WY0A 2J9XA 3BV4A 3KOFA 4GFSA 4IMGA 4JICA 3TC6A 4WXYA 4WOZA 4OBTA 3QM3A 5DLCA 2Z1BA 2H90A 1QDSA 5KITA 3LLDA 4UFKA 2C3ZA 2OT1A 3FYOA 4FX8A 1XUUA 4GNJA 1KLZA 1ZNNA 3LCIA 5AOUA 1B9BA 2CLOA 4AMAA 3NPUA 2RFGA 1MXSA 2V2DA 3TSDA 1SW7A 1B57A 3JR2A 2E6FA 3G1VA 4R7JA 1D3GA 1ZFJA 2NZLA 5LNWA 2VEIA 2IQTA 3EXTA 3W1PA 3BARA 4JS3A 3G3MA 3GKAA 1Q6RA 1EB3A 2CZ5A 3G1FA 3O63A 5FEWA 2G95A 3GIYA 3LRMA 3PSWA 1YDNA 4HPJA 1SSGA 3G1AA 1VS1A 1KW1A 2NV2A 5BMWA 4LVBA 3E0IA 4FHAA 5HWJA 1KV8A 2G5WA 4LS2A 4YXGA 2J6XA 3GDRA 1JQXA 1MO0A 1GVRA 4UNKA 5LNRA 4ORMA 2DZSA 2PC4A 4IGHA 5KMYA 1TPVA 3O16A 5F4SA 3L66A 4Z0SA 3PC0A 5DY3A 3N19B 3BGJA 3M9YA 4KKXA 3W1RA 1DL3A 1FUYA 1SFJA 2QCLA 3QSRA 4N4PA 4O17A 3EX4A 2NXIA 2ZRXA 2ZZ2A 3ANYA 4M19A 1LBFA 3PULA 1TO3A 1VYSX 2DJLA 3QFEA 1BKSA 1QWGA 3C52A 3GDKA 3QMTA 3W70A 4IX0A 1KTBA 4UR8A 3L9CA 4GUHA 1VRDA 2AAMA 2RDUA 4A2RA 3MI3A 4CQ8A 1WXJA 1WAUA 3LHYA 3ZWSA 2R8WA 3DBPA 2F84A 3L67A 2A85A 4X9SA 1N7KA 1PV8A 3CWOX 2WQPA 4TR9A 3EEGA 5U4NA 3QZEA 5DELA 2HS6A 3GDLA 1A5BA 3A23A 4E2BA 3TQKA 3Q37A 1S5VA 4P2VA 4Q32A 4LS1A 1H51A 2Y7GA 3G3DA 1DV7A 1O95A 3L21A 3W1QA 1G4PA 1FWSA 3FIGA 5EL1A 2XN2A 3TX9A 4M7SA 3KRZA 2VFIA 2Y88A 3NL5A 3NYZA 3N2MA 2FPTA 5FF4A 5HINA 5KTLA 3A9IA 2DZXA 4J9JA 5AB3A 5KZMA 1OK6A 3S1WA 4Y6GA 2E1DA 4RV8A 3NM1A 3E9AA 2QJGA 2X2GA 4RXGA 4TIMA 4FNPA 3G22A 2J9ZA 3QRHA 1B3OA 5C2XA 4FNSA 1PCWA 3NQDA 3KVLA 3GZ3A 3G1XA 5J5RA 4DPQA 1GVSA 2VENA 3P5YA 4N2YA 3ZFHA 2ZZ5A 3UZJA 5AFDA 2YR1A 3UNDA 2GVJA 5AHNA 3PB2A 1K8XA 2NWRA 4QAIA 2HS8A 2YYTA 4JEQA 2C18A 3STEA 5I3IA 3PBYA 3B04A 3VI2A 2CLLA 3ZS4A 1XXXA 2C1HA 3G0SA 3B4UA 3CEUA 1ADOA 4RK8A 3UPWA 3LCHA 4X22A 1S5WA 3G1HA 4ZL1A 3NL3A 3KRSA 4BFAA 4GC4A 4IWWA 3DU0A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4AF0B

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