4AF0 | Genus

Total Genus 121

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	121
sequence length	522
structure length	395
Chain Sequence	TNPNAPPRPDSLLNPSDALKHLEEYPRGDGLSLQELMDSRKNGGLTYNDFLVLPGHINFPASDVSLQSKATKNIVLNTPFLSSPMDTVTEDRMAIALALHGGLGIIHHNCSAEEQAAMVRRVKKYENYPYASKVPESKQLYCGAAIGTRPGDKDRLKLLAEAGLDVVVLDSSQGNSVYQIEFIKWIKQTYPKIDVIAGNVVTREQAAQLIAAGADGLRIGMGSGSICITQEVMAVGRPQGTAVYAVAEFASRFGIPCIADGGIGNIGHIAKALALGASAVMMGGLLAGTTESPGEYFYHEGKRVKVYRGMGSIEAMEHTGLDNAATARYFSEADAVKVAQGVSGDVADKGSINKFVPYLFTGLQHSLQDAGIKSVSELHSCARSGSLRFELRTAS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	De Novo GTP Biosynthesis is Critical for Virulence of the Fungal Pathogen Cryptococcus Neoformans pubmed doi rcsb
molecule keywords	INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Cryptococcus neoformans
total genus	121
structure length	395
sequence length	522
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2012-01-15

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
B	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
B	PF00571	CBS	CBS domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4af0B00

2YCEA 5C6MA 5LNWA 1FWSA 1ME9A 2JBMA 3KX6A 1K8ZA 1YDOA 4PCFA 3RNDA 4IX2A 2FPTA 4UFKA 1T96A 1F76A 3BVJA 4AMAA 3STCA 2R91A 1OG0A 4AWTA 1X8FA 5F4XA 3UZJA 1ADOA 1CX9A 2JK2A 3GR8A 3ATYA 3F1QA 1Y0EA 2GVGA 1DVJA 4NVTA 1K7EA 5CZTA 1MEHA 2WJZA 4AWSA 4NZFA 1JCLA 3B4UA 3LLFA 2WOQA 3KFTA 3NZ1A 1PL9A 3S5OA 1IXQA 2DZUA 1XL9A 3KAOA 1G6CA 4MFEA 1XBVA 1PS9A 3LCIA 2FLIA 3S5YA 1UCWA 4HPXA 1JRCA 2H6RA 3NPWA 5EMUA 2HS6A 1H7OA 4OV4A 4RZ4A 3W1QA 2D73A 2V5LA 2Y89A 4UFLA 1L9WA 4NNBA 3DGRA 2ABAA 2ZRUA 3PBVA 4K8EA 1X7FA 1PCKA 2V8ZA 2Y7EA 2X30A 2A7RA 5C5YA 2QF7A 1TPC1 3CEPA 1MSSA 3FKKA 3P5YA 1GVFA 1GWJA 1Q6LA 3BG5A 2E6YA 4OWGA 3NQ6A 5E93A 3HG5A 4KFOA 1K02A 4O10A 3W07A 2RKXA 1KTNA 3INPA 2ISSA 2Y62A 4NNCA 1O94A 2QCEA 3L0NA 5I3JA 4NT0A 1SUXA 3L68A 1UBSA 4D2JA 4QQ3A 3TMQA 3W75A 3TJLA 2HTMA 4ZQNA 4M6VA 5LGZA 3EWWA 2CLFA 1H7RA 1AW2A 4JS3A 5G2HA 4NJJA 2CZEA 3KVKA 1IGSA 4Y9AA 2XN2A 1DQXA 3STFA 4IXHA 4MKNA 4O4WA 4WZHA 3S1XA 5C54A 1SFJA 2R14A 3M5XA 4GUHA 5D30A 1IF2A 4UNKA 3HG2A 1QOPA 3Q94A 4FX6M 1XFBA 2RHGA 1PE1A 2P1FA 4FX8A 1D3GA 4PL2A 1YYAA 3RLVA 3NDOA 5HMSA 1TQJA 1BEUA 3QRHA 3HGJA 4MIMA 5LNSA 2ZFAA 5FEPA 1OYCA 1RPXA 1UB3A 3VNDA 1GTHA 5HJLA 1UUMA 2G95A 4UMAA 3WFAA 4NZJA 1TTQA 3BG3A 2Q8LA 2DP3A 1SW0A 4DF0A 1TTIA 5TBOA 1F6KA 2EGZA 1DJNA 5DCDA 5F1UA 4CNNA 1M6JA 2OT1A 2FQIA 4RXGA 5LSMA 1OX6A 4N6EA 3WJSA 1OX5A 4MY8A 4LUJA 3PUEA 2A7NA 2ZRZA 3GB6A 3DBPA 3MWAA 2QCLA 4JN6A 3NL5A 4LWWA 1TB3A 1GQNA 1R2RA 3QSRA 2Z1BA 4FNQA 2ALDA 1NVMA 4I7UA 4IPIA 3W7DA 4O8RA 3TFXA 1J2WA 3MUXA 3MMTA 6TIMA 2Z6IA 5LGXA 3R13A 1B4KA 2IQTA 2OMAA 2RFGA 4N9EA 2YW3A 1MO0A 4O1BA 2E6AA 5F2IA 1FWNA 4GBUA 4ALDA 3AJXA 3TAKA 3FFSA 3LRKA 3BV4A 3CC1A 4OU1A 1O95A 3P67A 1SO4A 3DFOA 2X1RA 3EWUA 1IIHA 3CEUA 1Z41A 1THFD 2BZNA 1F73A 2WV8A 1JUBA 4LRTA 1FXPA 4XTIA 2NUWA 1OF8A 3W1UA 1SW7A 1WBHA 3LOTA 4LT9A 3S1VA 4WD0A 3W76A 4X3ZA 3NPUA 1H1ZA 1G7VA 2R94A 4UFHA 2W79A 5FEWA 4ZZ9A 3OBKA 3DAQA 4K37A 4JY9A 4IOTA 3W7MA 2VFIA 5CPLA 2F84A 3NPVA 2AQWA 3ANYA 3GXTA 3RFAA 3T44A 3LCGA 3NAVA 3TROA 3TXVA 4BK9A 3SSJA 4FIRA 1GOXA 5BOOA 2V82A 3VFLA 1M7OA 1NFBA 3OG3A 4JIQA 2ZZ1A 1WX0A 3MJYA 4TO8A 3W83A 1DBTA 2PRHA 3KVMA 3U2OA 4XQ6A 4QJ1A 3W84A 4BI6A 3HBLA 3M43A 3W87A 4MZ1A 1TPFA 1SO6A 2J27A 1KM2A 2QCDA 4K39A 1C9DA 2YR1A 3W7CA 5DBTA 4EVZA 3P84A 3LXCA 1GEQA 4FNTA 2ZZ3A 4MFDA 2OZ0A 1SR9A 2VELA 4OHQA 3ZWTA 2ABBA 3TAOA 2EKCA 3W2JA 3GZ3A 4N4PA 4BWLC 1JR1A 3PR2A 3W1PA 2ZRXA 3W22A 1L6YA 4H4IA 3P8IA 3NG3A 3ELFA 4ONVA 4MYXA 1LYXA 2Z6JA 4UIOA 1H61A 4LY8A 4EWND 5D2WA 2BLEA 2V5BA 3QF0A 2NZLA 4S2CA 4CCEA 3E49A 5D2XA 3EEGA 3T40A 5MHBA 3TA6A 5AB3A 3R5EA 4P2VA 4I9AA 3PG9A 1OFQA 1KFKA 2X16A 3LRLA 5FF4A 3UWQA 2CW6A 1LLWA 4BI5A 2E6FA 1OF6A 4Q4KA 3V1PA 1WOAA 3MI3A 1H62A 1ML1A 3BLEA 4JD4A 1FWTA 4O18A 4AWUA 5D2VA 5AYXA 1RZMA 5CZJA 2Y85A 3NQCA 1WOBA 2CLMA 4NXSA 4DEFA 3EWXA 3NQDA 5HULA 5FEZA 3EKLA 1S5VA 4LVAA 1ICSA 2VKZG 1GZGA 4PA8A 3JR2A 4A2SA 5AHNA 5F2GA 4M6PA 4IX0A 4A29A 4ZQOA 1MXSA 5DBUA 1I2NA 2ZRVA 2BSLA 3RMJA 1HFBA 4OV9A 5D33A 3G8RA 1KFBA 2A1YA 2EPHA 2B7NA 4HNVA 3EX1A 2DU2A 1D3HA 5H91A 1PCWA 1I45A 3QFEA 5ABTA 3VE7A 3N3MA 2NWSA 5KMYA 2YFNA 2I1OA 2Q3RA 3MBDA 4N2YA 5I3KA 3NM3A 3FKRA 1HO1A 5LHEA 1LRNA 4XUGA 3W1NA 2A4AA 4LS1A 4NUWA 3O8AA 2VXNA 4WXZA 2C15A 1AL7A 4R33A 4LRSA 1ZENA 1YXDA 1LBLA 4ICNA 1LOSA 3V75A 4JYEA 1SZGA 2H90A 1ICQA 1KLZA 4JR5A 2VOMA 3W7OA 4PC8A 1GG1A 3LHTA 2R8WA 1XXXA 1W5QA 1TJRA 5J5RA 1T8XA 4LV9A 3ZFHA 4DELA 1VS1A 4UTUA 2CLHA 1EEPA 3C0JA 1HUVA 1OFBA 4UTIA 4MZ8A 1BWKA 5EY5A 3EWZA 1VR6A 3PM6A 2NXHA 4DF1A 3GDKA 3C2OA 3H53A 2DZXA 5K9CA 5EA9A 3QW4B 1RQBA 6ALDA 4O54A 5FF7A 3DH7A 1FQ0A 4O57A 2E1DA 3PWAA 3W1XA 1GT8A 1WA3A 5D02A 3H55A 1VCGA 1GVRA 3UWVA 4AB4A 5D37A 4IUOA 2JGYA 4MY1A 3NZRA 3LRMA 2Q8ZA 3WK3A 4JIPA 1W1ZA 4LW7A 5G4WA 1H7PA 3A9IA 1QPRA 4YWIA 4I7VA 4HSNA 3HJZA 3W1RA 1LBMA 5DXYA 1B3OA 2TYSA 3I65A 1EX5A 3QMRA 2OCZA 2C3ZA 3WJYA 4NJKA 2VC6A 2YXGA 1TJPA 2CLEA 4ORMA 2V30A 2I9EA 1TQXA 4GUFA 3HG3A 5SWUA 2EHHA 3OVQA 4S2BA 5AHFA 3TDFA 1VYRA 2G5WA 1JCNA 1MZHA 3TC7A 4O52A 1YTKA 5LZLA 4K7VA 3GVGA 2JGQA 1EP3A 4JDYA 4NX5A 2YW4A 4Z08A 3UWZA 4FX7A 2A21A 1H50A 5HWMA 4FF7A 3W7JA 4Q33A 5IBXC 3JRKA 1RD5A 2LLEA 3W1AA 4DQWA 4POCA 2FJKA 1EIXA 2B4GA 3NQAA 4HNUA 1LLZA 4LVGA 3F4NA 1QPOA 2ZRWA 3JS3A 2WSYA 2A2IA 3DKJA 1ZHAA 1JCMP 5D04C 2CWNA 4JEQA 1KV5A 3EX6A 1RQHA 3UXDA 1GVQA 1TV8A 4PFMA 2TSYA 2WO5A 4DPPA 3QQ1A 3WK2A 4ZVJA 3G22A 3LBMA 3W2MA 1NF0A 3C4UA 3G1AA 4X9SA 2QCFA 3NYZA 3HGSA 1I2QA 5F4SA 3QMSA 2ZA3A 1JVNA 3KVLA 4AHQA 3T7VA 3A24A 5BNKA 4DBEA 1HL2A 2E5DA 1KA9F 3OIXA 4QSHA 3S6DA 2B0MA 3GDTA 3F03K 3D0CA 2OJPA 3BK0A 2WNZA 5AHLA 5FF0A 4O17A 1K8YA 4MLRA 3SECA 2RH9A 4UNLA 2G96A 1RV8A 3TX9A 1S5WA 5EPDA 4L4LA 5FESA 3HPZA 3HGRA 4O1AA 4QNWA 3NQ7A 3M7WA 4QIUA 3P82A 4NQ1A 5AFDA 4GXMA 4YMZA 4JYDA 4HKPA 1XC4A 4DO5A 3FIGA 5DY2A 3Q37A 1ZJIA 1FDZA 4UMBA 1TMHA 4IPJA 2AGKA 4ML9A 3O16A 2CFFA 1DJQA 1N7KA 2G97A 5CPNA 3ZS4A 1SO3A 1XI3A 4DO4A 2J88A 3THQA 1NEYA 2Y7GA 4HNTA 5EYWA 3MHFA 3TNOA 1FBAA 3G1YA 2QUTA 3GDRA 5DCEA 1TTJA 2AAMA 4MJZA 1W56A 4ZQPA 3P80A 2Y63A 3C52A 1PV8A 4BI7A 3QM3A 4UFJA 1OFAA 1K7XA 4IMCA 3PAJA 5KZMA 1ZFJA 1FXQA 3HIJA 3QEZA 3NQ8A 1BWLA 1UJPA 3G0UA 1H7WA 3B0VC 3SGUA 5D09A 4KFNA 1TRIA 3W6YA 2QCCA 3LHWA 1YDVA 2VEMA 1G69A 4UTWA 1OHLA 3CIXA 1TPDA 3P7YA 4YXGA 1Q6RA 2QJGA 1OFOA 4M7TA 4MJMA 3UPWA 2YDAA 4PEKA 1R30A 1TCDA 3E96A 1QCWA 2NXIA 3LXAA 2QR6A 4UUIA 4HNNA 3LBCA 3I7RA 4FXRA 2CZDA 5L6UA 4BF9A 4O4VA 4MOZA 1IIGA 1QPNA 2ZTKA 4MPQA 4XKYA 5KSWA 4RZ5A 4XTDA 4O1DA 2JKPA 3QJAA 5F4WA 4Y8FA 2NX1A 1WBJA 3BW2A 3PSWA 3DI1A 1EUNA 3HMJG 4WUIA 2QCDB 3M0ZA 3N34A 5FI8A 2ZZ6A 1KFLA 3G24A 1NSJA 3S8HA 2HSAA 3C2FA 4M5PA 3M5ZA 3YPIA 4CQ9A 2YPIA 1K7FA 3EX4A 4CCDA 1LCOA 3PBYA 3IRDA 4P61A 4EOUA 3S1WA 3NPXA 4JY8A 1LDCA 1GYLA 1QDSA 2A5HA 1LTDA 4A3UA 1DORA 3OHIA 4UTJA 3P81A 3B06A 4H6KA 1V7YA 3W1TA 2O7SA 4OQVA 1TYGA 4WX2A 1EP2A 3L5AA 4MLJA 1YLVA 2YSWA 2H3BA 4FB7A 1IXOA 1PHQA 3SJ3A 3QPZA 3S9YA 5D2TA 5KINA 4XBKA 3G1FA 4LV4A 4IMDA 4DF2A 4CQ8A 4RXFA 1VLIA 4LNYA 4JDBA 3N73A 3SR7A 1XM3A 3PUOA 3TMLA 2CLIA 1H5YA 3TUUA 1F2JA 1FY6A 2B7QA 4IMEA 4O16A 3S5ZA 3FEMA 1QWGA 3O6YX 3E9AA 4JTFA 1TPUA 5LHFA 3G1HA 3SW6A 1LROA 3L0GA 5EBUA 4MUZA 3S1UA 2WSQA 3N14A 3GDLA 3RU6A 3EB2A 2ZTJA 1SSDA 1S3HA 5KZEA 4RV8A 2QCHA 1W5NA 2XN1A 3M16A 4K38A 4H3DA 4HPJA 1OFDA 4IGHA 2OT0A 3W7GA 3S0CA 3PB2A 4ZMGA 4WOZA 3L5LA 1NF7A 4AHPA 3T4CA 3L5MA 1X1OA 3HB9A 1QPQA 4Z0JA 4O12A 1YDNA 1L6WA 3A5FA 1FCVA 3G0XA 1EPXA 3GLCA 2PCQA 5I3HA 2P0OA 1W0MA 3NEVA 1MEIA 3CB8A 1KM4A 3NOEA 5U4NA 4S1FA 3I6RA 1ZAJA 3EX3A 5D32A 4GRSA 3G18A 1OVDA 2BXVA 1VC4A 2C0AA 2QDHA 4OBTA 2DJLA 1ME8A 5CSRA 1L6SA 3LTSA 1V5XA 1KLYA 3VKJA 2QEZA 2CLKA 1WDWA 2ZQ0A 3NGJA 4R34A 3KHJA 2WNNA 1XBYA 4O0ZA 3FJLA 4RR4A 1TSIA 4FEZA 1GPWA 1H51A 3RLUA 4RJEA 3LI1A 3GX9A 3B03A 2GJNA 5CGQA 4C1LA 1SU5A 3KVJA 3W71A 4OE7A 2DZPA 3CM4A 5CPOA 3A22A 4GFSA 2V2HA 3IIOA 3PS7A 3NL3A 1M5WA 3LM7A 5BMWA 2YFOA 3DXIA 1VLWA 4E2BA 1ICPA 3G3DA 1TPEA 5DLCA 3MHUA 5J5DA 4O13A 4U28A 4UMCA 3H54A 1VHNA 3HPSA 3TW7A 1ZAIA 3R8RA 1U83A 2V2DA 1YXYA 1KW1A 5KZDA 2FIQA 3U6WA 3TJXA 3TSMA 1H1YA 3TH6A 1DQWA 2VEKA 5G1TA 4JTUA 3IVTA 3T55A 1OABA 3T78A 3P60A 3BPWA 3QQ0A 2Y61A 5LKYA 3CLMA 1VPXA 2ZYFA 5K9XA 4XZ9A 3EXTA 1OYBA 1GYNA 3ABRA 1QMLA 3L9CA 3SIZA 2CZFA 4FO4A 2WNQA 4M19A 4MYAA 5TQLA 1XUZA 1N55A 1F7BA 1VHCA 3DFNA 2QUVA 3W2UA 1B57A 5CSSA 2YGYA 3GNDA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4AF0B

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