4AF0 | Genus

Total Genus 121

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	121
sequence length	522
structure length	395
Chain Sequence	TNPNAPPRPDSLLNPSDALKHLEEYPRGDGLSLQELMDSRKNGGLTYNDFLVLPGHINFPASDVSLQSKATKNIVLNTPFLSSPMDTVTEDRMAIALALHGGLGIIHHNCSAEEQAAMVRRVKKYENYPYASKVPESKQLYCGAAIGTRPGDKDRLKLLAEAGLDVVVLDSSQGNSVYQIEFIKWIKQTYPKIDVIAGNVVTREQAAQLIAAGADGLRIGMGSGSICITQEVMAVGRPQGTAVYAVAEFASRFGIPCIADGGIGNIGHIAKALALGASAVMMGGLLAGTTESPGEYFYHEGKRVKVYRGMGSIEAMEHTGLDNAATARYFSEADAVKVAQGVSGDVADKGSINKFVPYLFTGLQHSLQDAGIKSVSELHSCARSGSLRFELRTAS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	De Novo GTP Biosynthesis is Critical for Virulence of the Fungal Pathogen Cryptococcus Neoformans pubmed doi rcsb
molecule keywords	INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Cryptococcus neoformans
total genus	121
structure length	395
sequence length	522
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2012-01-15

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
B	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
B	PF00571	CBS	CBS domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4af0B00

4O19A 4UTMA 1OFEA 3C2FA 2Z2UA 5CPOA 2NWSA 1YXCA 3BW3A 3DKJA 4K7YA 4Z0SA 3VI2A 3W1MA 1PL9A 5I3JA 2AAMA 2CLLA 3UNDA 3G8EA 1FCQA 1XBVA 1OF6A 1QPNA 2ZZ7A 1ZALA 1L2UA 3QMTA 3TUUA 4O1BA 3BPWA 3NNTA 2GUUA 3THQA 4HNTA 4DPQA 4WUIA 1HG3A 3M7WA 1JUEA 3WFAA 1FUYA 4FX6M 1D9EA 3NO5A 4JX6A 3EX1A 3IIVA 1G69A 3NEVA 3NQ7A 1I4NA 4E0CA 3LXCA 4JR5A 4NJIA 5CPLA 3TROA 3HPZA 5I3HA 3RLVA 4O18A 4HPXA 1ADOA 3NQAA 3PBWA 3TJLA 2BTMA 1M6JA 2E09A 1OFOA 3P7YA 2W0UA 1NSJA 2E77A 2C1HA 1MEWA 1LLWA 3U2OA 3MMTA 3NZ1A 5I3IA 3L2IA 1VZWA 3NPVA 3ANYA 3M6YA 5HMSA 3LI1A 4UTUA 3PVFA 4RX0A 1OX5A 3PUOA 4GJ1A 2IQTA 3H54A 4LRTA 4O1CA 1S5VA 4M5PA 3WK0A 5K2ZA 2O7QA 1H63A 2ZRZA 3NL2A 3LB0A 4ADTA 4BWLA 3HBLA 2G97A 3LTYA 4PL2A 3UWVA 3BW2A 2ZZ1A 1JQXA 2H3DA 3IVSA 3BLIA 4KFNA 4AWUA 1SUXA 4O8RA 3GZ3A 2W6RA 4JX5A 5GVJA 5KITA 3RK8A 2JGQA 2ISSA 1W5OA 2XN0A 2X1SA 2Y61A 2Y88A 4ALDA 4DF0A 4LUIA 2QCDA 3WK3A 5D2TA 1TQJA 1H1ZA 2FB2A 3QMSA 2B7QA 4O16A 2YDAA 2A4AA 3NXFA 3ABRA 3DI1A 2WPBA 2NX9A 1TRIA 3IEBA 5LZLA 2YXGA 3SY5A 4UTIA 1G4PA 1M7OA 4UTTA 1H7OA 3EWUA 2V9DA 4XTDA 3WK2A 4ICNA 3U6WA 2CZFA 3S1VA 3W70A 3O6DA 1EWDA 5D2WA 3A5VA 2CW6A 1X1ZA 2OZ0A 1OFBA 3HGRA 4FNSA 3TQVA 5LNWA 1THFD 4PODA 1H7XA 3DFSA 4NJJA 3NPUA 2ZZ2A 5F4SA 2VEKA 1L6YA 1QPQA 4XWUA 3FJ6A 1EPXA 1XBXA 3NGJA 4Z1DA 4MOZA 2A21A 2J6XA 4O13A 3TDFA 3W7DA 3EWWA 3UPWA 4M6PA 3P62A 4JYEA 2Z6IA 4AF0B 5D33A 4GE8A 2QAFA 3BLEA 3CM4A 3VFLA 3E49A 4AEOA 1WXJA 3AO0A 2NXHA 3UWYA 4JTIA 4JY9A 1ZAIA 3QSTA 3FOKA 3TMLA 1GYLA 3S1UA 4NQ1A 4A3UA 4YCOA 3LRLA 4CCCA 2VFGA 3B05A 3W2KA 4BF9A 4MPQA 1TTPA 1TPWA 4DXVA 4U4MA 2OJPA 3GDRA 4QNWA 4QNEA 1F6PA 5E1QA 2YYTA 1OX4A 1VPXA 4IMGA 2WSYA 3DGRA 2G95A 3GVGA 3B0VC 3N19B 2OCZA 1KW1A 1A5BA 3TMQA 4UMAA 2V30A 3HPXA 5AFDA 1MO0A 1W5PA 3BK0A 3N3MA 3QM3A 1Q3NA 3PM6A 3TJXA 1SW3A 2JKAA 2QCHA 1LDCA 5EBUA 3W7CA 2GVGA 4TX9A 5C54A 4QIUA 1KFJA 5K3VA 2YR1A 1V5XA 2C18A 3GAYA 4LS1A 1DQWA 1I2QA 2A0NA 1B3OA 1M7PA 1JJKA 4EF9A 4S1FA 4M7TA 2YFNA 5G1YA 3LLDA 1TPUA 1I2OA 5LHEA 1KTNA 5D03A 4RK8A 1KLYA 1OYBA 4M7SA 1ME7A 2A6NA 2A7PA 2YW3A 1OYAA 1EUNA 1GQNA 1DJNA 4N9BA 4FHAA 3QC3A 3WJXA 1GPWA 4IUOA 2FTPA 4N9DA 4O17A 3N9SA 1AL8A 3M5VA 4Z0JA 3NA8A 3GDLA 3QYQA 2FQIA 5G1TA 3PR2A 3O6CA 3I7RA 3NQGA 3B8DA 3C3NA 1KV8A 1R47A 2ZZ5A 2BXVA 4MIMA 4GXMA 5EYWA 1FWTA 3R2GA 3IVTA 2ZZ6A 3ZR4A 3KFTA 5FF0A 3IGXA 1B4KA 3GAKA 4H4IA 4LVFA 1KFEA 3G3DA 4AHOA 5HULA 2VXNA 1A5SA 2CU0A 2CZDA 2X1RA 1LLZA 5MHBA 2QCLA 3OVRA 4JTUA 3GDMA 5HQEA 2ZA1A 3VKJA 5AB3A 2YPIA 3DH7A 4DO4A 3L0NA 5F2MA 1V7YA 2BSLA 1EEPA 3MI2A 5K4ZA 5TQLA 3TAKA 5HWNA 3TK7A 1A50A 2A7RA 4QM1A 4DO5A 4K7VA 4O1DA 1WAUA 1L6WA 3Q37A 3NL5A 3M47A 2ZTJA 1PCWA 2DJXA 5FEXA 4NNCA 5EMUA 1FDYA 4CQ8A 1W5NA 3VNDA 3LRKA 4LV9A 2FIQA 4E2BA 3CC1A 4AH7A 1H5YA 1SFLA 4IQLA 3CWOX 1B57A 2QUTA 2Y89A 1UCWA 2XFWA 1ZJIA 4GUIA 4XQ6A 1VGAA 3FA5A 4N02A 5K9XA 3LRMA 3UWUA 3S9YA 3W7OA 1WX0A 3S5OA 3L68A 4RZ5A 3G0SA 5BMWA 3TSDA 1VCGA 5AN7A 1QMLA 2ZRUA 1W3TA 3FYPA 3O63A 3G1AA 3DFTA 1PCKA 3KXQA 4TMBA 2PRMA 4O11A 3P82A 5G2HA 4TIMA 5AYYA 4JXCA 2QDHA 3EXSA 4O53A 3P67A 4FEZA 2Z0IA 5FEPA 2A85A 3C2EA 1Q6OA 1XBYA 5G5IA 1I2RA 2YFOA 3QEZA 2CLKA 4UCGA 1TV5A 1LORA 3RMJA 2QCCA 4WXZA 5CKSA 4JS3A 4A2RA 3THAA 1L6SA 1VC4A 3RF9A 5D09A 4JYDA 4O4WA 4FNQA 1W3NA 2P1FA 4PC8A 2A7NA 3BO9A 4GUJA 1VYPX 3M0ZA 3NQ8A 1TPVA 2VFDA 5D38A 4CNPA 3EB2A 1W8SA 3F1QA 4JTSA 1ZAJA 4IOTA 2C0AA 3KRUA 4LOCA 1T8XA 2WKJA 1KTBA 1Z41A 2V2HA 4QAIA 3SJ3A 1CW2A 1SW0A 2GJLA 3DBPA 3LCIA 3HG4A 1TJRA 2CLHA 3BGGA 2ZA3A 4LTSA 1BTMA 4IJBA 1GVSA 5LNSA 3RFAA 1G4TA 2P0OA 1TPFA 1QFEA 3L5AA 4O4VA 5CSRA 5J5DA 1VHNA 5AC6A 2ISVA 2PC4A 4QJ1A 4ZQMA 1GTEA 5AHMA 4P61A 3L0GA 1P5BA 1T0OA 1RV8A 5SWUA 5C6MA 3T55A 1XDMA 1F5ZA 4LS2A 4GC4A 3KRZA 3A9IA 2NLIA 1ZENA 1RQBA 1OFAA 4K6AA 4MZ8A 1W5QA 3JRKA 3GKAA 1AW1A 2QDGA 2C13A 2Q3RA 2VFHA 3KAOA 5DCBA 1DV7A 4K8HA 1EP2A 2ZRVA 3STGA 4LC8A 3PSVA 1W3IA 4K38A 3UZ5A 2Y7EA 3PS7A 3G1SA 4FNRA 3GLCA 4WOZA 1MEHA 5IBXC 2FFCA 1O4UA 4JYFA 1W56A 4ZQOA 2BZNA 3S6DA 3SGZA 4UFLA 1FQ0A 3MW7A 3TV8A 1RVGA 1KM0A 1LM1A 1B4EA 1LZOA 2B4GA 1EX5A 4N4PA 4DELA 2ZRWA 3IGUA 1GVRA 4XKYA 1F73A 3TH6A 3CTLA 3UXDA 3L21A 4NU7A 4UTWC 3LERA 1OFDA 3O1NA 3C8FA 3ZWTA 3PULA 4LU0A 3IGSA 5DY2A 6ALDA 1LBFA 3W2LA 3LCFA 4HNUA 3QQ1A 4UTJA 2VELA 4M6VA 4L4LA 4ZQPA 2PRLA 4N2YA 2V82A 5IM51 3S5ZA 3NR0A 3W2JA 5LNUA 4ZQNA 4XZ9A 4O50A 5BOOA 4PA8A 2WV8A 3W22A 2J24A 5D05A 3W7RA 1OFQA 1EUAA 3M5YA 3STFA 1QR7A 4ORIA 2WSRA 3HO8A 4YLWA 2OT1A 1QO5A 3TC7A 2QCNA 2QJIA 3LCLA 5AHFA 1NF0A 1PS9A 3G1YA 2Y70A 4FIQA 4A29A 3TNOA 4IPJA 1JVNA 1UUMA 4X3ZA 3W84A 3LI0A 2E6DA 4JX4A 2ATSA 3SSJA 4NNBA 1YTDA 2NXGA 3T78A 1OK6A 4AF0A 5F4WA 1A5AA 1R2TA 1ZY9A 2C15A 1GTHA 2FB3A 1TV8A 5CZJA 3L9CA 2R8WA 1NAL1 5CSSA 4PL1A 4UR8A 3L5LA 4O14A 2NXIA 3HMJG 3STEA 1Q45A 3M1ZA 3W7PA 1HUVA 3VCRA 3EWZA 1IIHA 3B04A 4DBEA 1G4EA 4LW7A 1VYSX 2J27A 3HG2A 1DKWA 5LGZA 1W1ZA 1GG1A 4JIPA 2DZXA 3H53A 3LBMA 1FCUA 1Q6LA 2YYUA 3NZRA 3W7QA 2QF7A 4C1LA 3E12A 4ZVJA 1VRDA 3S5YA 2ABAA 3ATZA 3YPIA 5L9FA 5LNRA 1DBTA 1JCXA 3BVJA 4JIQA 2A1YA 4UTHA 5D2YA 3G24A 1GVFA 1H7PA 4NX0A 4FNPA 3TAOA 3G1FA 5HWMA 1IIGA 3C6CA 4Z1CA 4NUWA 1NF7A 3HB9A 3PG8A 4AWTA 4WXYA 1DQXA 3MWAA 5DBUA 1NVMA 5BMXA 1HO1A 2ATMA 3FLUA 3EKLA 1TIMA 2NV1A 1YXYA 3U8GA 2YZRA 1LRTA 3O05A 4Y9AA 3I7SA 4LNYA 4D2JA 4BFAA 3QH2A 2R14A 2ALDA 1LRNA 3MJYA 4HN4A 5HUPA 3TSBA 3HF3A 1GG0A 5H91A 2V81A 3W7JA 1GJPA 4ADUA 3N34A 2GVJA 3W1NA 3MP3A 1AG1O 3O06A 5D04C 1WDWA 5DCEA 3UWZA 2RDUA 4OU1A 1K03A 4JTGA 1KM6A 2C16A 4O1AA 1Z42A 1JCJA 4XTIA 4RXFA 5DELA 1QO2A 5AHNA 5I3FA 5HUOA 1WBHA 3T44A 3CB8A 1PVNA 3MYOA 1ME8A 4CCEA 2WNZA 2QUUA 3PAJA 5I3KA 3WJSA 2WNQA 2X1UA 1F2JA 1J5TA 2RH9A 1H62A 3PC0A 1R30A 3W75A 1O60A 1SZGA 3TE9A 5EL1A 4Y90A 3OVQA 3DAQA 3TSMA 3SFKA 4UNLA 4IMFA 4ZQRA 4M6QA 3OA3A 3LCXA 5FF2A 3W2MA 1SZFA 3EEGA 3SZ8A 3O07A 1QWGA 4Y6GA 3L5MA 3N9RA 4UR7A 4RXGA 3IIXA 3DXIA 2FPVA 3W6YA 2VEMA 3TX9A 3LM7A 3DZ1A 5LNVA 3GB6A 3FFSA 1S5WA 1WQ5A 3QW3A 2H3BA 4PCFA 3TFCA 4ORMA 3O16A 1RQEA 1H7NA 5T26A 4WY0A 5D32A 3B03A 4OHQA 1JRBA 2XN1A 3KRSA 2QCDB 3NQEA 3CEPA 3UXAA 4R7JA 3P8IA 4MKNA 4LWWA 3CT7A 5LGXA 4HNNA 1XDLA 1GOXA 2YCEA 4OV4A 2D73A 3SECA 2ZA2A 4JTEA 3C56A 3E02A 2RFGA 3STCA 1VR6A 2Q8ZA 1XBZA 1F76A 1LP6A 3EWXA 1I45A 3QFEA 2CZEA 3TW7A 3BG3A 1XM3A 3LTSA 1B9BA 2FDSA 4JDBA 3W71A 2A2IA 2TMDA 2ZDRA 2GJNA 4LT9A 4IX2A 5K4XA 3C61A 4OGZA 3C0JA 3W7KA 3G0UA 3PBUA 4A22A 1E51A 1G6CA 2VFFA 2H8ZA 4O0KA 3UZJA 1IF2A 4ZQCA 3R89A 1ML1A 1QCWA 1TTQA 3V75A 3M41A 2V5BA 1ALDA 5BNKA 1QAPA 2EGZA 3C2RA 4RKAA 1ZCOA 3PG9A 2BWGA 4ZL1A 4UMBA 4TU1A 4HNVA 4AMAA 4L4MA 3NYZA 1OJXA 3GYEA 1P4CA 4LRSA 2QCGA 4UC5A 5G4WA 3UYCA 1OG0A 4KFPA 1SU5A 2CLOA 3M44A 3MP5A 3WJZA 3EX2A 5D37A 3FS2A 4HSNA 4MVAA 3TKFA 3IIPA 3N2XA 3M5XA 3M16A 1EIXA 2TSYA 1Y0EA 3GNNA 4IGHA 1XUZA 3ABSA 1YPIA 4IXHA 5AOUA 3CU2A 2GVLA 2EAWA 2Y7DA 3OG3A 4Q4KA 1FWRA 1OX4B 3TIMA 3INPA 2E6AA 3DHDA 1K8XA 2CLFA 3NAVA 1ICPA 2BLEA 1YDOA 3A24A 5KZEA 3PSWA 5E93A 2GQAA 1BWLA 1VLIA 4K36A 1R2RA 1SO4A 3W1RA 3WJYA 2H6RA 3FJLA 2QEZA 3W2UA 3NQ2A 4HPJA 3LHTA 4U28A 4GUFA 1P0NA 1XI3A 3LOTA 3A5FA 3G8RA 4TO8A 3LXBA 3IRDA 3W3OA 1A53A 5CZSA 2ISWA 1AK5A 2CLMA 1GWJA 1FDJA 1CX9A 5EA9A 1XXXA 1UUOA 2HMCA 1PE1A 1BWKA 1MZHA 2ZZ4A 2GQ9A 3FKKA 1ICQA 2AGKA 1TPDA 2TYSA 3LHWA 4NXKA 1P1XA 4N6EA 5J5RA 1DJQA 4I7VA 1VLWA 4QISA 1H60A 2E5BA 4O57A 3O15A 1IXQA 4X2RA 4EOUA 2JBMA 3Q58A 2VC6A 2NUXA 4O0ZA 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1SO5A 3NQ6A 2O7SA 3IIOA 4YWIA 4EVZA 4ZMGA 5HR6A 2VKZG 1XC4A 2C19A 1RQHA 3GKFA 4MY1A 4FIRA 3USBA 1OF8A 5LSMA 4CCDA 1TSIA 1SQ7A 3BARA 4WY0F 2DZUA 5I3GA 3JR2A 1KM1A 3HIJA 2NX3A 4YL2A 4JD4A 4X22A 1K7FA 2R94A 3HOJA 3ZS4A 3IVUA 2Z1BA 1FXQA 1W37A 1TTJA 3G22A 4MY8A 1IXOA 2G5WA 1KM3A 3DFNA 4IX0A 5D02A 2WNNA 4N9CA 4P2VA 5FF3A 4BWLC 2TPSA 3R13A 2X2GA 3F4NA 1PV8A 3N14A 3LV5A 5KMYA 3UPBA 2NUWA 2G96A 4C1KA 4Z08A 2F7FA 1NFBA 4R33A 3I68A 1VCFA 3L65A 4O52A 4E38A 1YXDA 4UUIA 3P74A 3I6RA 4JTLA 1FXPA 3T4CA 1UASA 1BEUA 4YXGA 3BV4A 3TU9A 4RV8A 3O8AA 4NNAA 2DZVA 3MI6A 4IMDA 1WA3A 4GWEA 2E68A 2ZYFA 2EHHA 3TQ0A 4MZ1A 3GDTA 3Q2DA 3DU0A 3GDKA 3LX9A 2E6FA 4FNTA 3TXZA 1AMKA 1H50A 1GT8A 3PB2A 5KSWA 3RU6A 5IBXA 1MSSA 3N2MA 4UXDA 3UY8A 4A21A 5K9CA 4RZ6A 4UFIA 1YADA 1DL3A 3F4WA 2E6YA 2OT0A 4UTTC 3NPXA 3C4UA 3E0IA 5D2XA 2CLIA 4I7WA 3W9ZA 2PCQA 1KLZA 1W54A 2J9YA 3QW4B 2X16A 1A5CA 3ABQA 1KV5A 3GK0A 5A5WA 4E2DA 1SZEA 3DENA 2GPTA 3W7GA 1X7FA 4DBDA 5AC7A 1K7EA 2ZQ0A 2Y6ZA 4BR1A 1H61A 4LS0A 4UTWA 2DZWA 1WBJA 3SI9A 3T40A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4AF0B

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