4AH7A

Structure of wild type stapylococcus aureus n-acetylneuraminic acid lyase in complex with pyruvate
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
293
structure length
292
Chain Sequence
HNKDLKGLYAALLVPFDENGQVNEQGLKQIAQNAIETEELDGLYVNGSSGENFLLNTEQKKQVFKVAKEAVGDKVKLIAQVGSLDLNEAIELGKYATELGYDALSAVTPFYYPFTFEEIRDYYFDIIEATQNNMIIYAIPDLTGVNISIEQFSELFNHEKIVGVYTAPNFFLLERIRKAFPDKLILSGFDEMLVQATISGVDGAIGSTYNVNGRRARKIFDLARQGQIQEAYQLQHDSNDIIETVLSMGIYPTLKEILRHRGIDAGLPKRPFKPFNEAHRQTLDQLIAKYDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus nctc 8325
publication title Structural Insights Into the Recovery of Aldolase Activity in N-Acetylneuraminic Acid Lyase by Replacement of the Catalytically Active Lysine with Gamma-Thialysine by Using a Chemical Mutagenesis Strategy.
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-ACETYLNEURAMINATE LYASE
total genus 120
structure length 292
sequence length 293
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.3.3: N-acetylneuraminate lyase.
pdb deposition date 2012-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ah7A00
4HPXA 5HWJA 2PRMA 3I7QA 5EL1A 3UPWA 3BG9A 1ME7A 1RQHA 4O0ZA 3LERA 1Z42A 1LRQA 1M7OA 3TQVA 4YMZA 1MSSA 4ZQRA 4N9DA 2Y88A 3W1UA 1ZAJA 2RHGA 3LI0A 4PL1A 1GOXA 1JJKA 3I68A 4WUIA 1ME9A 4ADUA 3S1UA 1YPIA 4MFEA 5BRBA 3TV8A 1Q3NA 2BX7A 1BKSA 1TJPA 2Y89A 1TPH1 4EF9A 1BWLA 1J4EA 1BEUA 1F73A 3NPWA 4UTMA 3W22A 3CPRA 5HWMA 4FNRA 4JEQA 3KX6A 3CTLA 3UXDA 3LHWA 1E51A 2ALDA 1KFLA 1QPQA 4Z08A 3UWWA 4PCFA 2BZNA 4IX0A 4IMFA 3IGSA 1DOSA 3SI9A 4MFDA 3UPBA 3G24A 3G8RA 1SO3A 4O57A 5EY5A 2P1FA 2QF7A 3EEGA 2BTMA 1XBZA 4O17A 4GUFA 5AHFA 3TW7A 3G1FA 1WYIA 4MVAA 1NAL1 3LV6A 3B8DA 3NL2A 1PL9A 1O60A 4FX7A 3NL5A 3P8JA 4YCPA 1ZFJA 3UWVA 1G6CA 2B4GA 1GPWA 2Z6IA 3CB8A 4WXZA 4A29A 2B7NA 4C1LA 3N9RA 3OBKA 5EYWA 4S1FA 3G22A 3GAYA 1XUUA 1A5AA 1FDZA 3KHJA 3PB0A 4H3DA 1A50A 3TH6A 4TIMA 3QJAA 1FWSA 3P84A 4PL2A 2CLMA 1JULA 4RV8A 3C52A 4EVZA 2RFGA 3W2LA 4IXXA 3E02A 3NO5A 2NXIA 1DKWA 1GG0A 2J9YA 3EWWA 4XBSA 1YDNA 1VHCA 3NNTA 3O16A 1LZOA 4GWEA 4W9TA 2I1OA 1KBJA 2CLOA 4L4MA 2PRLA 3KVMA 3PUEA 1YTEA 3S5YA 5AYXA 5I3KA 1EUAA 4BI6A 1XUZA 1AG1O 3NQMA 1YXYA 3M6YA 3EX1A 1EEPA 1A5CA 1H7XA 1VRDA 1GVRA 1VCGA 3G18A 3F03K 1O94A 2OCZA 4UCGA 3S6DA 4JTHA 4UXDA 1WOBA 1FDJA 4XUGA 4E2BA 2C1HA 2OT0A 4H4IA 2WJZA 1ALDA 4ORMA 3HGJA 1GT8A 3T44A 1HUVA 2A6LA 2UV8G 2A7NA 3G1DA 3BLFA 1UASA 5DLCA 4K36A 3G1YA 3G8EA 2A2IA 4K7VA 2NLIA 3NQGA 3NA8A 3S1VA 2J24A 1AW5A 4M5PA 1YTKA 1LYXA 1OF8A 3PBYA 4BWLC 3INPA 3G3MA 1DVJA 3VNDA 1H7NA 3UWZA 1QPRA 2NV2A 4ZQPA 4Y96A 3WFAA 4NT0A 3UWUA 5FESA 3G1VA 4JICA 2HS8A 1FWNA 1JUKA 1TRIA 5BMXA 1JCJA 4MJMA 3O8AA 4RR4A 1QCWA 4JS3A 4GBUA 3EX2A 3TFCA 2VEKA 3NL6A 3EXSA 1D3HA 3C2VA 3KVKA 4LRTA 3A23A 4IX2A 4OWGA 1LTDA 1RZMA 3S42A 4JTLA 5DCBA 5AC8A 1LOSA 3W70A 3HQ1A 1K02A 3TJLA 3GNNA 3PC0A 2NUWA 3A5VA 4JD4A 4DO4A 1GTHA 1QOQA 4PA8A 3TMLA 1W3TA 1MXSA 3SIZA 1Q6QA 4UTWC 5GVJA 1VS1A 4A2RA 5C2XA 2V2CA 2QCCA 4KWWA 5L6UA 4N9CA 4JGDA 2FLIA 4NXSA 3TJXA 1SZGA 5U7SA 4MKNA 4WY0A 5DCDA 2QAFA 3TCEA 3P5YA 1YADA 4MUZA 3O07A 4N2YA 1FWWA 4FEZA 4X2RA 1YTDA 3LOTA 1OJXA 3A24A 2VFGA 3NYZA 3W2JA 2YYUA 1HG3A 1ZAIA 1SO4A 3F1QA 4IUOA 4QSHA 4NVTA 3Q94A 3MO7A 5K9DA 1KM4A 3BV4A 1F2JA 1PVNA 2QUUA 4JTFA 3Q58A 3W3OA 1JUEA 3FS2A 3L0KA 4IMEA 1QR7A 4UIOA 3TC7A 1ZNNA 1TRDA 4XTIA 1IXOA 1SUXA 2C19A 3C61A 3EWUA 5C6MA 2J9XA 4LVBA 5F2GA 3IRDA 3ABQA 2V8ZA 3CQ0A 3ABOA 4LV4A 1H7WA 3ABSA 3HMJG 1KA9F 3MMTA 3OA3A 3PY2A 1X1ZA 4NXKA 1KFKA 4TR9A 1F7BA 2HSAA 3LI1A 4LS0A 3NPUA 3STGA 1IXQA 4MZYA 3M5ZA 1KM2A 1R46A 5EKYA 1SO5A 4POCA 2RH9A 5AYZA 1N8FA 3DGRA 1W0MA 3E0IA 3MHFA 1KV5A 4KFOA 1VCVA 1TMHA 3OVPA 4DBEA 3IIZA 1ME8A 5BMWA 4UTJA 2FPTA 1MEIA 3LHYA 3QMRA 1YDVA 3CT7A 4Z1BA 4TMCA 4M6VA 3KFTA 3B04A 4LRSA 1H1ZA 4AAJA 1OFAA 2TSYA 2OZ0A 3KVJA 4XWUA 3ZR4A 2HTMA 3S5NA 4HHPA 1C29A 1QWGA 3DFNA 1K7XA 4O18A 1JCLA 3K30A 5F2MA 1R2SA 5EBUA 1V5XA 1VYSX 1VHNA 3M16A 1I2PA 1VYRA 2C18A 3QF0A 3EXTA 4AHPA 4GNJA 3ZWTA 4M7SA 1VGAA 1ML1A 2CLKA 1K7FA 1L6SA 4A2SA 2YFNA 5FEXA 4O1AA 3W7RA 3L2IA 1XXXA 3LB0A 2PC4A 5FEZA 1KM3A 1SSGA 3A5FA 1M6JA 2Y70A 1S5TA 1TPUA 4X22A 4O50A 4DPPA 1OFQA 2VFIA 2E5CA 2CZ5A 4LV9A 3S9YA 5D33A 1XI3A 3VE7A 5F4SA 3HGRA 5HULA 5HQEA 3R8RA 3O63A 3N2MA 4GUIA 4LY8A 4K39A 5KSWA 4PC8A 2H8ZA 4O53A 1JR1A 2RKXA 5F2LA 3B03A 4M19A 3W76A 4TX9A 3M44A 2F84A 3MUXA 5BOOA 2CLEA 4PEKA 3W84A 1XBXA 3UWYA 1NEYA 4LOCA 3QSRA 5D02A 2LLEA 4O0KA 1AL7A 3GXTA 3HGSA 3HG5A 5H91A 1X8FA 1QO5A 1DV7A 3V75A 1HO1A 3SW6A 4A22A 3S1XA 3C6CA 3C0JA 4ICNA 5CGQA 4OV4A 1TPB1 2AQWA 3P61A 1YYAA 2X1SA 3T7VA 4I7WA 1GZGA 3N3MA 2JBMA 3B0VC 3C2OA 3DI0A 2DZPA 3UXAA 4O4WA 3C2FA 1W5QA 3HF3A 2DJLA 3C56A 4FIRA 3W88A 3C8FA 5F1VA 3NDOA 1AMKA 1HL2A 4XQ6A 3UZJA 4GJ1A 2V30A 5HR6A 2J88A 5CG7A 3SY5A 4Y6GA 1QFEA 1GQNA 1O5XA 4FNPA 5DY2A 3U8GA 3W7QA 1YDOA 4AB4A 3GKFA 5K9CA 3TKFA 1W5MA 5F4XA 3TAOA 3FYOA 2OT1A 3U2OA 3M47A 3HG2A 4Y8FA 1IIGA 1L2UA 4UR7A 5TBOA 5KZMA 5LNVA 1X7FA 1TPDA 2QCDB 4AVFA 1GYLA 5D05A 3CM4A 2C13A 4UTTC 1DL3A 2Y85A 3LBMA 4HNVA 2YYTA 1B3OA 4OBTA 2QJHA 3SSJA 1RPXA 1PV8A 4MZ8A 5I3FA 1W5OA 4FB7A 4UFJA 3IGUA 3WJXA 1T0OA 3TROA 3G1HA 3EB2A 3KXQA 4IJBA 1F76A 3W7MA 2FIQA 5D30A 2FPYA 1JRBA 3BW2A 3W1XA 2PE4A 1IXNA 1JRCA 3GVGA 1B4EA 1C8VA 3R5EA 3PSWA 4GUGA 5CPLA 2VFEA 3P5ZA 2BSLA 3PG8A 4WQ6A 1S5WA 1H51A 4NX0A 3W87A 3TAKA 4CQ8A 2NXHA 4GUHA 3W7HA 1W37A 3STEA 3WJSA 2ZA2A 2A7PA 2VEMA 3TQ0A 3EWZA 3KRSA 2GPTA 5C54A 3H53A 1KM5A 2V9DA 4DXVA 3OG3A 3DFTA 1P0NA 3WJZA 2ZA3A 3CU2A 4NUWA 2YDAA 2Z0IA 3ZS4A 1WBJA 5LZLA 4Z1AA 3PWAA 2YGYA 1I8JA 3W7EA 1SFLA 3WK2A 3QQ1A 3T4CA 2H3DA 1EPXA 2C0AA 1MEWA 3HG4A 3NVTA 4U28A 2YFOA 2ZA1A 1O4UA 1WXJA 3B06A 1GVQA 4CCDA 5IBXC 3W7GA 2DZUA 4LC8A 3VE9A 3BARA 4S2BA 4GC4A 3PS7A 3W1NA 4O14A 1ICQA 4DF1A 3W1MA 3EWYA 2W0UA 1PE1A 3W6YA 6TIMA 2E77A 2IQTA 2H8XA 1KFJA 1PCKA 3QFEA 4LS2A 1OYBA 1VC4A 4PTNA 3VFLA 5LNRA 1KTBA 4S2CA 5K9XA 4N4PA 1ZALA 3W7IA 3KAOA 1OYCA 5U4NA 2C3ZA 4OU1A 3R12A 4WY0F 3M5XA 1FCQA 3PUDA 5SWUA 3MBDA 2CLLA 4JY8A 1RQEA 2R91A 4O11A 5G4WA 1YXDA 1ICSA 4UNLA 4HIBA 1TPFA 4WXYA 4NU7A 1D3GA 4ZQCA 3TFXA 4KWVA 4WZHA 8TIMA 3LBCA 4ALDA 1EP3A 1SPQA 2W79A 4HNNA 3CHVA 1TIMA 1LROA 4JTSA 1GJPA 3N9SA 1XM3A 3P62A 4O12A 1SZEA 3KRZA 3W23A 5BNKA 5KZEA 5AC6A 3EXRA 4JN6A 1FXPA 1JCXA 2YSWA 3N19B 2YW4A 6ALDA 5FI8A 4N4QA 4O54A 1H5YA 2FTPA 4DO6A 5D2TA 5D04C 1TB3A 1JQXA 4DELA 5LNSA 2V0TA 5HMSA 1TCDA 3O06A 2G5WA 2GVLA 4JIQA 2CLFA 2WPBA 3P80A 3DKJA 1F6PA 4HSOA 5KMYA 3S0CA 3W07A 1CW2A 1YXCA 3SGUA 3W86A 1OF6A 4LVGA 2YPIA 3AJXA 4WX2A 4HN4A 1GVSA 4IPIA 1P4CA 2YXGA 4XZ9A 1UBSA 5TIMA 3E12A 2FFCA 2JKPA 5LHEA 1THFD 2P0OA 1OG0A 4Z1CA 2YCEA 2ABAA 3L0GA 3CEUA 1TTPA 5K4XA 2NWRA 3F4NA 1JCYA 3L5MA 5CPNA 3M5VA 3LTPA 5AOUA 3C2RA 4OHQA 1OFPA 4FNQA 4M6QA 3BG3A 2ISSA 3W2UA 2A4AA 3PUOA 1LLWA 2VOMA 3HBLA 3NM1A 4HSNA 1ICPA 1QAPA 3NQ2A 3FEMA 4A21A 5EMUA 1OFDA 3P81A 3RMJA 5F4WA 1SFJA 3UYCA 2A6NA 2X16A 2Y7GA 4JIPA 4LW7A 3R13A 4WJEA 2ZRXA 3W1PA 2GVJA 3ATZA 4BI7A 1ZAHA 3HB9A 3W72A 2TMDA 3PVFA 1CX9A 4MYXA 1NSJA 3UWQA 1L9WA 5TQLA 3P82A 2QR6A 1SO6A 1DQXA 2RDWA 4L4LA 5G2WA 4BI5A 3FIGA 3DFSA 2WSYA 3FOKA 3GDLA 3W74A 3QRHA 1GWJA 4O1CA 3TXZA 4P61A 1LDCA 5D09A 2ISVA 3FFSA 2OX1A 3I7SA 3TX9A 1FDYA 2B7PA 4UR8A 3M5YA 4QIUA 5DY3A 1EIXA 3QM3A 3HPZA 2EPHA 2GUUA 1PIIA 2KZHA 1SW7A 4Z1DA 3CIXA 3LLDA 2HS6A 3PBWA 4IQLA 4X3ZA 2V5BA 2NX3A 2A0NA 3DFOA 4TO8A 3GYEA 4JDBA 3Q2DA 1EB3A 4IOTA 3W1RA 5ABTA 1TPC1 5HUOA 1P1XA 3PB2A 3USBA 5CSSA 1TO3A 3N34A 2Q8ZA 2Z6JA 4GRSA 1OFBA 4D2JA 4JY9A 1FCBA 3R89A 4UTLA 2ZRWA 2H3BA 5HR7A 3PR2A 2OJPA 4AF0A 3W2MA 1VJIA 2ZTJA 4JX6A 1O95A 3MYOA 1PHQA 5CZJA 3BGJA 3PF3A 2ZDRA 4CCEA 3CEPA 1S3HA 3NGJA 4EIVA 4OT7A 4JX4A 2CFFA 3BLEA 1VZWA 2R94A 2G97A 3NEVA 4GFSA 4QNEA 4CNOA 4UMCA 2H6RA 2AGKA 2ZZ6A 2Q3OA 2B7OA 5CZTA 4YCOA 4UTIA 1WV2A 4ML9A 3IIXA 2ZZ3A 2QEZA 4O10A 5F2IA 3MHUA 1JQVA 1VPXA 5AN7A 3SJ3A 2NX9A 4AF0B 2CZDA 4WY0B 5I3IA 4UNKA 1H7OA 3LCWA 1HTIA 4E0CA 1EA0A 3W73A 3FJ6A 2A1YA 3TXVA 2VKZG 3I65A 2B0MA 2CLHA 1TTIA 2DORA 3PBUA 3GAKA 3LTSA 5G2IA 4UMAA 4BK9A 2W6RA 3G0SA 1I2OA 3MP5A 3ZFHA 1G69A 2V81A 1JCMP 2E1DA 4DF0A 3QMTA 3LCIA 4CNPA 4NZFA 2FQIA 3WK1A 2J27A 4P2VA 3BLIA 3NQVA 2H90A 5LGXA 2NX1A 2EHHA 2X1RA 3P67A 4JTIA 1H63A 3EWBX 1EP1A 4YWIA 4N6FA 3KRUA 1D9EA 1F5ZA 4RZ6A 3FJLA 3W7LA 1PS9A 3S5ZA 1BWKA 1NF7A 3NPVA 1MO0A 3B4UA 3NQCA 3LCHA 4RCXA 1U5JA 4K38A 3MI3A 3ZWSA 4MPQA 3W85A 3LRMA 1R2RA 3S5OA 3G1AA 1W8SA 3H54A 4FNTA 3AO0A 2C6QA 4MJZA 3BW3A 3QQ0A 3M1ZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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