4AVFA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa inosine 5'-monophosphate dehydrogenase
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
467
structure length
314
Chain Sequence
MLRISQEALTFDDVLLIPGYSEVLPKDVSLKTRLTRGIELNIPLVSAAMDTVTEARLAIAMAQEGGIGIIHKNMGIEQQAAEVRKVKKHETYPLASKDEQGRLRVGAAVGTGADTGERVAALVAAGVDVVVVDTAHGHSKGVIERVRWVKQTFPDVQVIGGNIATAEAAKALAEAGADAVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQISAIANVAAALEGTGVPLIADGGIRFSGDLAKAMVAGAYCVMMGSMFAGTEEAPGEIELFQGRSYKSVPYKGALSAIVHQLMGGLRAAMGYTGSADIQQMRTQPQFVRITGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Aeropath Project Targeting Pseudomonas Aeruginosa: Crystallographic Studies for Assessment of Potential Targets in Early-Stage Drug Discovery
pubmed doi rcsb
molecule keywords INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 98
structure length 314
sequence length 467
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4avfA00
1OYBA 3EX4A 3PY2A 1CX9A 5A8GA 1VCGA 4POCA 4O1CA 3RMJA 3UPWA 1FDYA 5F4SA 3PS7A 2EGZA 1WYIA 1ZFJA 1Q45A 1OYAA 4WQ6A 1KTNA 2QDHA 4RLIA 4A22A 3KX6A 1O4UA 5F2MA 3W2UA 2YCEA 1XL9A 1PVNA 2J88A 3CU2A 4IXHA 2QCHA 3G22A 1XUZA 3TQKA 1EIXA 1GVQA 3HGSA 4GNJA 4XTIA 1EP1A 4KWVA 1WXJA 4JD4A 3W23A 4NXKA 1Q6RA 4Y96A 5EL1A 1IIHA 4TO8A 3W87A 4FNRA 3M5XA 1GPWA 1QWGA 4O10A 3MW7A 2VFIA 1ZAIA 4IMGA 4GUGA 3SFKA 2TSYA 4AWTA 3U6WA 3BPWA 4RZ5A 2B7PA 5ABTA 5KZDA 5KZMA 4MJMA 3THAA 3N3MA 3A23A 4JTTA 5HUOA 3LCGA 4NT0A 1UB3A 4DELA 1T0OA 4X9SA 1LBFA 4FEZA 2R94A 2TYSA 2WQPA 5HWJA 3UZ5A 4DXVA 1OK4A 3R5EA 4O13A 1JCYA 3LHTA 5E1QA 4QISA 4S2BA 1EA0A 3D0CA 4PODA 1S3HA 2B7NA 1KM1A 1IGSA 3HJZA 4I7UA 3BV4A 2CFFA 4NU7A 4RZ6A 4X22A 5LKYA 4FXSA 4QSHA 1LROA 3G1FA 4UFKA 1DQXA 4AWSA 3CLMA 3JS3A 3PG8A 3THQA 4BI6A 1H7RA 4O57A 2NX9A 4LVFA 4AF0A 5D04C 2E1DA 2LLEA 4ZQPA 4NX5A 4C1LA 3Q94A 1ZCOA 5E0KA 2ZA3A 2C0AA 4NJGA 4AMAA 3W74A 1QPQA 4BR1A 2A0NA 1JCXA 1P0NA 3C3NA 1LOQA 3HGJA 3I65A 1KM5A 4WJEA 3TX9A 3MUXA 1KW1A 1TPWA 2VOMA 3SSJA 4BF9A 5CSRA 1E51A 3IGSA 1VYRA 4O14A 4ADTA 2QAPA 2A1YA 3FJ6A 2CLOA 5D03A 3W88A 1QAPA 4GUJA 4JEQA 4YMZA 3TDFA 2VXNA 5EYWA 4AF0B 3WK1A 2ISSA 1ZNNA 4O8RA 3G0UA 1I2OA 4JY9A 3E9AA 1AMKA 4K8EA 4FF7A 5D33A 3PWAA 5HNRA 1H1YA 3P8JA 3TSDA 5U7SA 4LS2A 5AHMA 2PC4A 1MO0A 3C4UA 5LZLA 4RR4A 1FXPA 1JULA 4A21A 3MYPA 3C0JA 3M47A 2E77A 3QMSA 4CCDA 4ALDA 4FX8A 4PFMA 4PC8A 3PM6A 2GQ9A 1JRCA 1DV7A 1ME7A 2W6RA 4K7VA 4FO4A 2GUUA 2QUTA 3DFPA 2ZRWA 4KWWA 1OX5A 4O1BA 3FFSA 4DF2A 1EUNA 1H1ZA 3L9CA 3G1VA 4R33A 3C2FA 3VCRA 1BEUA 1J5TA 1VJIA 4AHPA 3S5YA 1DQWA 1K8ZA 1QCWA 1TRDA 1TO3A 4LRSA 1SZGA 5G2IA 2VEPA 4PCFA 1QFEA 3KAOA 2YW3A 2VEKA 4Z1DA 1KTCA 1JCJA 4NNAA 4TMBA 1Q6LA 3HIJA 3O05A 2ATMA 2CLLA 4U28A 3W1TA 3CQ0A 2VFEA 1NEYA 4L4LA 4PH6A 4IWWA 1W5OA 4LRTA 3H53A 3W7OA 3NYZA 8TIMA 2PCQA 3NQDA 1XKYA 1THFD 3LCWA 4X2RA 5DY2A 2A2IA 3QYQA 3NG3A 5AHFA 2QCFA 1EPXA 3WK0A 3C2EA 3TSBA 1M5WA 1YLVA 3T7VA 3TC7A 3TQ0A 4UXDA 3P61A 3PBUA 4JY8A 4MYAA 5AHNA 2H6RA 2V9DA 1XXXA 3DZ1A 1C29A 3F1QA 3LRKA 4O17A 2B0MA 4WXYA 1TPVA 1KTBA 3ANYA 2ZRXA 4R7JA 1TQJA 4MYXA 3TW7A 5CG7A 2QJIA 1LRQA 2VEMA 3UQNA 3GKFA 1T96A 2NWRA 3TAKA 1G4TA 3SGZA 3NL6A 3SJ3A 4LS0A 2TPSA 3LHWA 1JUEA 3BLEA 2W79A 5G5IA 2WV8A 4LY8A 2CLEA 2I9EA 3HG2A 2GOUA 1K02A 3CIXA 2FFCA 1WOBA 1FCQA 2B4GA 2BXVA 1IXOA 2RDUA 2Y88A 1ME9A 5KMYA 1ZJIA 2YX0A 3LRMA 4AXKA 2BWGA 2VKZG 3GNNA 4HNVA 2V2HA 2NZLA 3G24A 1SFJA 3ABOA 3S8HA 1YYAA 1TPH1 3A24A 3FIGA 1UUMA 3Q58A 4OQVA 1PV8A 2R14A 2JKPA 5HULA 3NVTA 1EP3A 2X1RA 4AB4A 3EX1A 2RH9A 3HGOA 3WJYA 2QF7A 3GIYA 2Z1BA 4YCOA 1TQXA 1ZALA 3QPZA 1L2UA 1YPIA 4HSNA 2YXGA 3CT7A 4QM1A 3DBPA 3EB2A 3UWWA 1TJPA 1G67A 1EWEA 4NJJA 3GX9A 4K39A 4TIMA 3G1DA 3SR7A 3W7GA 1FDZA 4IOTA 3NQCA 5DN1A 1XI3A 1FWSA 4A2RA 3A5VA 4JYFA 2V5LA 1GZGA 3KVJA 2FPYA 2ZA1A 1V7YA 2WSRA 2J6XA 4J9JA 3NPVA 3WK3A 1MSSA 3LHZA 2EF9A 4O28A 3W1QA 2FB2A 1F6PA 1X1OA 3BARA 3ZS4A 3RFAA 1SW0A 3TNOA 5MHBA 2OMAA 3DENA 2Y7GA 4O50A 3W7MA 3UD6A 2ZRYA 5FF7A 3P60A 4DPQA 2JGQA 1OFOA 3M0ZA 1YTDA 2G5WA 1GVFA 3W1XA 1QOQA 2B7OA 3NPUA 4O16A 2ZYFA 4JS3A 1XBYA 2HMCA 2CLHA 4RJEA 4I7WA 4ZL1A 2NX3A 1FY6A 3F4WA 3R89A 4O1AA 3NQMA 1RPXA 3M6YA 4TU1A 4O0ZA 1AW5A 4ADUA 4PL2A 2X1UA 3LCHA 4QAIA 5H2ZA 1LTDA 3QZEA 5FF0A 1SO5A 4PL1A 2ZTKA 1XBZA 3L5LA 2WSYA 2Y70A 3GXNA 4XWUA 4CLMA 4GRSA 1JVNA 5K3VA 3S0CA 3L0GA 3W7IA 2A85A 2E5BA 2Y7EA 1GG1A 2ZZ6A 1XUUA 2VFGA 1H7WA 2YYTA 2F7FA 4OBTA 1LYXA 3HBLA 4ONVA 5F2IA 2Y85A 5HR6A 5DXYA 4JTIA 5CPNA 1BKSA 3MJYA 1MEIA 1FCVA 1FXQA 1KM3A 3M9YA 5I3IA 5AN7A 2J9XA 2Y61A 2ATSA 4JIPA 1W3IA 2A7NA 1I2NA 4IX0A 4S2CA 4I9AA 2CLMA 5AFDA 1H7PA 5F4WA 1VHNA 3MI3A 1TB3A 1K8YA 4UFJA 5CPOA 5D2TA 1AL8A 1YDNA 3A5FA 4MOZA 1PHQA 2KZHA 4BFAA 1W54A 1WBHA 4O11A 1S5VA 4H6KA 4Z1CA 2Z6IA 5D2WA 4DF0A 2NV2A 3BLFA 5LNWA 1PE1A 4OT7A 3MI6A 2VFHA 4MFDA 1XBVA 1IXPA 4JGDA 1B3OA 4LU0A 1FWTA 1JUKA 5I3HA 2OCZA 2C15A 2Q3OA 2RDWA 1GQNA 1JCMP 3KRSA 2YDAA 1R46A 1KM2A 1TREA 1RR2A 2Y7DA 3EWBX 1XFBA 1UCWA 2JKEA 4Y6GA 3P82A 5AC8A 5D02A 3B0UX 3GZ3A 4M7TA 3T55A 3DGRA 3M5ZA 4YWIA 2R8WA 2V0TA 3LLFA 3W86A 4N4QA 3WK2A 4HNNA 2XN0A 3FYPA 4MJZA 3NL2A 2NUWA 4FHAA 1TMHA 3B03A 2DZWA 3TR2A 3WJXA 4NZFA 1XC4A 4WY0A 1YDOA 1ZHAA 3TH6A 2OX1A 1KBIA 1R2TA 3IVSA 4LUIA 3MP5A 4O19A 4GWEA 3BO9A 4K8HA 5KITA 1VRDA 3CIWA 3N73A 1DBTA 3CPRA 3W72A 3QRHA 3NZ1A 1O60A 2RKXA 2GVLA 3ZFHA 4ORIA 3ZWTA 4N2YA 2NX1A 2V2DA 1D3GA 4RV8A 1X1ZA 4ICNA 3W7EA 5C5YA 3TROA 3QMRA 3EXRA 4MUZA 4YCPA 2G95A 4Q33A 5LSMA 4OGZA 3YPIA 4LC8A 4WY0B 1KM6A 2E09A 3G1YA 3TUUA 1OFBA 3PSVA 2FQIA 2P0OA 3LHYA 3O06A 1VQTA 1YXDA 3JRKA 4UTJA 4UIOA 1OFEA 2HTMA 1LCOA 3TE9A 1OHLA 1GTHA 1XM3A 2QCGA 3PB0A 3M44A 1W3NA 3N2MA 2CLFA 1D9EA 5AC6A 2Y62A 1V5XA 3NR0A 1F73A 3DFSA 1H7NA 1SZEA 1TTJA 5FI8A 4HHPA 1L6YA 1O5XA 4Y90A 3U8GA 1G6CA 2E5DA 3UNDA 3R13A 2A21A 3LHVA 2TMDA 2QUVA 1QOPA 4LV9A 6ALDA 4UFLA 2H8ZA 2EAWA 5D05A 3EKZA 1SO4A 2J9ZA 3W9ZA 1YDVA 3TSMA 3NXFA 3L0KA 3VE9A 4UTKA 2ABBA 1B9BA 4M19A 3P84A 2ALDA 1K7EA 3S6DA 4FXRA 3O15A 4LNYA 3W2MA 3S5NA 4FNPA 4GUFA 3G0XA 3W22A 1P5BA 2DZXA 4RKAA 4Z1BA 4O15A 3DFTA 2J24A 3QW3A 1KFKA 3HPSA 2GQ8A 1F05A 1WA3A 2Z2UA 3C8FA 4RCXA 1GWJA 1L6WA 3GR7A 1X6UA 4WX2A 4LC6A 5E93A 1CI1A 5G1TA 4DEFA 3W76A 1KA9F 5DLCA 5J5DA 3NA8A 4XQ6A 3G18A 3CWNA 1W56A 4FNSA 3MYOA 2A5HA 4RZ4A 1VGAA 3PUEA 3UZJA 3BW4A 1J4EA 3TCEA 5H91A 3P81A 3QH2A 3JR2A 5L9FA 3O6CA 1Z42A 1TRIA 5LGZA 1QR7A 1I45A 2J27A 3EX3A 4UTIA 1FWRA 3QJAA 3NPWA 5G2HA 1K7XA 2DU2A 3PSWA 4O52A 3IIPA 3L68A 1P4CA 2Y63A 2DZUA 3B04A 4ML9A 1FWNA 1SZNA 4JTEA 1F5ZA 4JTLA 1U5JA 4PTNA 3W1LA 2JGYA 1XCFA 4EWND 4O54A 5I3JA 5TIMA 1QMLA 3RNDA 1WDWA 2QUUA 5L6UA 2FPVA 4MLRA 1UJPA 2ZCGA 4LV4A 2NXGA 3FLUA 1J2WA 5TQLA 4JTGA 3QFEA 5D37A 3IIZA 5D09A 2DZVA 3DKJA 1FUYA 7TIMA 2ZZ7A 3HQ1A 1G7VA 4IJBA 2EHHA 2Q8ZA 2A6NA 4WOQA 1I2RA 4PEKA 3ELFA 2H3DA 2DZPA 4LT9A 3WJWA 1F6KA 3LDVA 3N14A 3NQGA 1VYPX 2CWNA 1SUXA 3QW4B 3T4CA 2A7PA 1OX6A 2WNQA 4ZQNA 2H8XA 4FIQA 1H7XA 5EPDA 4IX2A 5CSSA 5DBTA 4UTWC 3NQEA 4B5NA 1TYGA 3LCIA 3BVJA 2YFOA 3EWYA 2YW4A 3FKKA 2P1FA 3BGGA 1PL9A 4OV4A 4DBDA 3TK7A 1AW1A 4AVFA 2E68A 1LBMA 5AB3A 4ORMA 4Z1AA 5DCDA 3SI9A 3R8RA 3VI2A 2QEZA 4JN6A 4O4WA 1LZOA 1QNVA 1OJXA 3IGXA 4UMAA 1PCKA 1VH7A 3MHGA 4LVDA 3MBDA 2NXIA 3OVRA 4N9BA 1RQEA 1YTEA 3GDLA 3CTLA 1GYNA 1G4SA 1PCWA 4LWWA 1ICPA 3I7SA 5I3GA 5I3FA 1TPDA 3TU9A 2QJHA 4FX6M 4N9EA 1GT8A 1R2SA 2JKAA 2CLKA 4IMEA 5KTLA 5D32A 2F84A 1BWLA 4K7YA 4IMDA 3ATZA 3B8DA 3DHDA 3TFXA 3UWVA 5BOOA 3W7NA 1L6SA 5D38A 3GAYA 3R12A 1IIGA 1YXYA 1TPB1 4YL2A 4UTMA 3B0VC 2EKCA 2I1OA 1SW3A 1G4EA 4BWLC 3PG9A 3C2OA 5FF3A 1KM4A 3EEGA 2AAMA 3NM1A 2AQWA 1ICQA 4I7VA 5C2XA 2HS6A 3IGUA 2J9YA 3NGJA 1SO3A 2HSAA 3W2JA 4Z08A 4O0KA 3USBA 4Y8FA 3W73A 1BTMA 3S1WA 4RX0A 1TPEA 5KINA 3LBCA 4WD0A 2ISWA 1PS9A 3N9RA 5LNUA 1H50A 5LGXA 1ALDA 4UTWA 4M5PA 3TJLA 4CQ8A 4EF9A 1R47A 1W5PA 1TTPA 2QDGA 4OWGA 3W85A 3O8AA 2GJLA 2RHGA 2YFNA 1DL3A 3TQVA 3DAQA 2NV1A 1EP2A 4GUHA 3EKLA 2Y89A 3E12A 2WKJA 4AHQA 5AHIA 1G4PA 4E38A 1TCDA 3P7YA 3C2RA 4C1KA 4HNTA 2V2CA 4R34A 5DCEA 1H7OA 4LUJA 1UUOA 1AW2A 3LCFA 3IIVA 2ABAA 4P61A 4ZQOA 4E2DA 2E6AA 1A5AA 5HJLA 4OU1A 3UY8A 1I4NA 3FJLA 3UWYA 4JYEA 4IMCA 1W31A 1QO2A 1BWKA 4A2SA 1X8FA 3GLCA 3T40A 3OEXA 3DI1A 3W2LA 2C18A 1DJQA 4BK9A 3K30A 2YR1A 3W7LA 4NX0A 4MY1A 1LLWA 5CGQA 4OHQA 3IIXA 4HT3A 3SZ8A 5G2WA 4E2BA 1DJNA 2V82A 3G3DA 3QQ0A 3TMQA 3DFOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1GEH A;  4KMQ A;  4Q7I A;  4POC A;  4KS0 A;  3RMJ A;  3IAC A;  3LSC A;  1A0C A;  1UKT A;  2QDH A;  4RLI A;  1L0P A;  1ISW A;  1JG9 A;  4W5Z A;  4PRR A;  1I0B A;  4IXH A;  3G22 A;  3HGS A;  4BQ4 A;  5GQB A;  2IPF A;  4YNG A;  4NXK A;  4Y96 A;  5EL1 A;  3W87 A;  3WDP P;  2VGI A;  1GPW A;  4IMG A;  1A3X A;  1W9B M;  1EC9 A;  3SFK A;  3BPW A;  4RZ5 A;  4Q6J A;  3WKZ A;  5ABT A;  3SUT A;  2QZR A;  4UOJ A;  3THA A;  5HAT A;  7REQ A;  3RJX A;  4DEL A;  4NT0 A;  1EIB A;  2EO7 A;  3GNX A;  1OK4 A;  3R5E A;  2J8G A;  3ISI X;  3G1R A;  1OGB A;  2XH2 A;  1FWF C;  4POD A;  2XH0 A;  2OFJ A;  3OOD A;  4MM1 A;  2VX6 A;  3HJZ A;  4QG6 A;  1J2B A;  4REQ A;  2CFF A;  4NU7 A;  3MUA A;  4X22 A;  2E9L A;  4FXS A;  1LRO A;  4AIU A;  1RXO B;  3PG8 A;  4WDU A;  4B5V A;  4D8A A;  1H7R A;  2NX9 A;  4ZTX A;  2E1D A;  3ABZ A;  2Y0F A;  3Q94 A;  1ODU A;  3K8L A;  1GVY A;  1ZCO A;  2AGT A;  5E0K A;  4XV0 A;  2C0A A;  4AMA A;  3W74 A;  2J8F A;  2A0N A;  4JZ5 A;  1UWU A;  5XIA A;  1KM5 A;  3QY6 A;  3VOI A;  2DGA A;  5BXP A; 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