4AWE | Genus

Total Genus 154

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	154
sequence length	383
structure length	381
Chain Sequence	GFVTTEGDHFKLDGKDFYFAGSNAYYFPFNDQPDIEKGMTAARAAGLTVFRTWGFNDKNRTYIPTGLPQYGNEGAGDPTNTVFQWFEADGTQTIDVSPFDKVVDSATKTGIKLIVALTNNWADYGGMDVYTVNLGGKYHDDFYTVPKIKEAFKRYVKAMVTRYRDSEAILAWELANEARCGADGTRNLPRSEKGCTTETVTGWIEEMSAYVKSLDGNHLVTWGGEGGFNRGEEDGFYNGADGGDFDRELGLRNVDFGTMHLYPDWWSKSIEWSNQWIHDHAASGRAANKPVVLEEYGWMTDKGRLDQLGQVKNETRLEVVGGWQKIAIQEKLAGDMYWQFGYGGYSYGRNHDDSFTIYLEDDEAKELVYKHAKKVQKLNER

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Endo-Beta-D-1,4-Mannanase from Chrysonilia Sitophila Displays a Novel Loop Arrangement for Substrate Selectivity pubmed doi rcsb
molecule keywords	ENDO-BETA-D-1,4-MANNANASE
molecule tags	Hydrolase
total genus	154
structure length	381
sequence length	383
ec nomenclature	ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date	2012-06-01

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4aweA00

1JFXA 1ITCA 3AOFA 1J0JA 1OM0A 2GUYA 1MXDA 3AMDA 4ML4A 2XG9A 5EFDA 2ZUVA 3J7HA 4FF5A 3PZIA 1UKPA 5A6KA 1Z32X 3ZM8A 1QBBA 3L4YA 3WFZA 4AIUA 3AS0A 5C8BB 9CGTA 3VDAA 3K1DA 4PMDA 2CHNA 3GZAA 4GPNA 4J3VA 1KBBA 4AZ5A 1C8YA 3AIRA 3WSUA 4W5ZA 1XH0A 4HOWA 1HVXA 3A3HA 2YDQA 1XRVA 4U5IA 1UZ4A 2WYSA 1B9ZA 3OA5A 4BQ5A 1V02A 1UUQA 2E3ZA 3KL5A 3AMCA 1LL7A 3ZR5A 5JIPA 2GJXB 2V3EA 2VZOA 4U2ZA 1HF6A 4KWUA 2BV9A 4UQAA 4GI6A 3HMCA 3MUIA 3CBWA 5M5DA 1W9DM 2EPMX 4U2YA 3APGA 5HPOA 2J7EA 1W3JA 3VOCA 5DT7A 3U57A 2ZX9A 1OGGA 4PBGA 2PBGA 4KRTA 2OLHA 1UWTA 2WANA 1VENA 3FAXA 4RE4A 4CD7A 3NDYA 2ZXBA 1S46A 1JXKA 4WKHA 2XSBA 5GNXA 5HNNA 3BAWA 3VIKA 4RL3A 3DC0A 3QOMA 4ZE5A 2JIWA 4IM4A 1VF8A 5KZ6A 4R5EA 1FHLA 1XSJA 5A6LA 5DEZA 4N0RA 1KWGA 4M82A 4CCCA 3WNNA 1W91A 1E6QM 1B3YA 4RE3A 3NSMA 3OIHA 2YIHA 1CECA 4PMVA 3WEMA 1JYXA 1UQYA 2W91A 2D0FA 3ARXA 3SCOA 4ACZB 1GPFA 4AZHA 3CHDA 3VD4A 2Y2WA 3BCDA 4DWSB 1V6VA 5E0CA 2QMKA 2VVSA 2XJ7A 1C8XA 1WNOA 4F66A 3N17A 4QFUA 1QNQA 3O9NA 1US2A 4TX8A 1VFMA 1QNOA 3DHUA 3VGGA 4A4AA 2CBUA 1CXIA 3MMDA 3W6LA 2CKRA 2DEPA 2E0PA 1EOMA 2D24A 2C8NA 3SCTA 3TTQA 1J01A 4GO8A 1JDAA 2QPSA 4J3UA 2ZOXA 1GJUA 3VGDA 2DT1A 7A3HA 2WWDA 5ABFB 1C3FA 3OZPA 1ZJBA 2WPGA 2G3IA 1QNSA 3HU7A 3WY1A 3OLIA 3ARRA 3B9EA 4PTMA 1JYVA 2BY3A 1CPUA 3ARSA 3L4TA 5IXEA 4M24A 3W81A 4B9ZA 1G94A 1MQRA 1PBGA 4PYSA 3S6TA 2CBIA 2YLLA 1E70M 1BTCA 1NP2A 1H49A 2WMIB 5F7UA 4LQ1A 3VMOA 3ZT7A 2WZEA 3PZMA 1BQCA 5AC4A 1V03A 3VD9A 3ZSSA 1V0KA 2J7CA 4BQ2A 1GOKA 4AD0A 4D1JA 1DWHM 1HKJA 2A3BA 2WMGA 1D7FA 2EBNA 2YL6A 1NWTA 4Y7EA 5EFFA 4PEEA 1MWOA 2WXDM 4P8WA 1CYGA 3UR7A 4D72A 1FH9A 1E6XM 2FDMA 3CGTA 1E5NA 5BXPA 3WNKA 2FGZA 1GONA 3A4WA 3ZJKA 1BVZA 1OIFA 2XM1A 4MB1A 3K46A 4ZXOA 3W4RA 4NF7A 4AC1X 2YDSA 4NI3A 1A3HA 4UQEA 1V3HA 5A8OA 5C70A 2ZX5A 3WDHA 3W0KA 3G6LA 1ITXA 1ZU8A 3N13A 2NSXA 1JAKA 3OBAA 1DHKA 1BYDA 1KR1A 2XYLA 1A47A 4A3HA 2CCRA 1J12A 3THCA 1WZMA 2EEXA 2RGMA 1GHRA 2ESCA 1QI3A 2OSWA 3DECA 4H7VA 1JDCA 1TVPA 5AY7A 2A3HA 3MUY1 4MNJA 3RM9A 5IFTA 1XV8A 3ZJ8A 3PZQA 2ZWYA 3VDHA 4Z2KA 3TTYA 1KQZA 5DT5A 1ZB5A 4ATDA 4B3KA 1MFVA 3AZRA 2BNJA 3RMEA 1LWJA 2XPKA 1CDGA 2XGBA 5FD0A 1OGBA 1B0IA 3JUGA 3IJ8A 5FCZA 2F2HA 3QOKA 1GVIA 1W2VA 1ISWA 3WH9A 2OYLA 3WDPP 4B9YA 4HZ7A 1LLOA 5D9PA 1C91A 3GXDA 1VJZA 1HJVA 2GK1A 1V3MA 4MDOA 3O2LA 4NSBA 3M07A 3WH8A 2DT3A 4U5KA 1V3LA 1E6RA 4HMCA 5A6MA 4JZ5A 5D9NA 3GNRA 2J25A 4W8BA 4P7QA 1NARA 4H41A 2CBVA 2BY2A 1Q6DA 2ZE0A 1QBAA 1UKTA 3W82A 2XHYA 1ZS2A 2WVVB 1AQ0A 1JAEA 4QP0A 3PZOA 4QCFA 3ZOAA 4AZGA 1K9DA 1CXHA 3OG2A 4D6EA 1LF1A 5I6SA 3N15A 3HN3A 1ZBWA 2VL4A 2D23A 1R87A 4S3KA 1KWKA 4E2OA 3RO8A 1ISVA 1Y7VA 3A4XA 1GQLA 1FFRA 1Q6GA 2JF6A 3AZTA 2J8GA 1GOMA 3VD7A 1E4NA 1GOIA 3ZQ9A 1CGTA 1W1TA 3DYOA 1E1FA 3AS3A 2CNCA 3ZSTA 3VU2A 1E6ZA 3PTMA 1KXVA 1HKMA 4J28A 1CGYA 1BF2A 5HPCA 1D3CA 4AEFA 4W89A 3QHMA 5ABHA 1EOKA 3EMZA 4UQBA 1H1NA 1HIZA 4QAWA 2WNWA 2FH6A 3ZJ6A 4AYSA 5BXTA 1G0CA 3VX0A 2BFGA 3ECQA 1DWAM 3WIJA 2WKLA 2J62A 4UFKA 4D1IA 4UTFA 2GJXA 1HJXA 2YL8A 4S3JA 4CU7A 5I2UA 1KCLA 3SUUA 1AMYA 5FL0A 4CKQA 1UH3A 3CTTA 3SCVA 1SMDA 2BY0A 5A6AA 4UFJA 3EMCA 3FHQA 1UD6A 3VIJA 1VJSA 4L4PA 2RGLA 3ARZA 4UFHA 4JKLA 2W92A 1CGWA 6CGTA 1KCKA 2V3FA 3DYPA 3WUBA 1F4AA 1HN1A 1PIGA 4D6IA 3FN9A 1H0IA 4W5UA 5A2AA 1QHZA 5BYWA 1QOXA 5A2CA 1KBKA 3SUTA 5I77A 1ODZA 3BH4A 3UERA 1ISXA 4AW7A 5D8WA 1QHOA 1GQKA 4CCEA 1US3A 2YBUA 4R27A 3WELA 3GNPA 4FLQA 1U30A 3GDBA 1JZ5A 3FW6A 4BF7A 5CSYA 1UG6A 4Z2IA 3RM8A 1PX3A 4U3AA 2XVKA 5GPRA 3F5JA 2VI0A 1UD8A 2PC8A 3W28A 4CD4A 1MQQA 2UY2A 3NJ3A 4GZIA 2BVDA 3BAYA 1E43A 4LPCA 3B9DA 5A3HA 1NQ6A 3D5HA 3VGFA 1NH6A 4JFTA 2OSYA 4ACZA 1RH9A 3IAQA 1HL9A 3ALFA 4TTUA 1ISZA 4HOZA 3LPGA 1K6AA 1LG1A 4HU0A 4BS0A 3GXIA 1C93A 3FHAA 3WBEA 2Y8KA 3AZSA 1PZ2A 1EDTA 3K8LA 1VFOA 3D3AA 3WN6A 2WVSA 1Q6CA 5HDRA 1M04A 2W4XA 2WW5A 1UR1A 3NDZA 3I3DA 4N42A 1MFUA 1FOBA 3WQ4A 5IHRA 1MXGA 1LWHA 2VCCA 4CN6A 2EPOA 3W38A 2BXZA 3LMYA 2XWEA 5ABFA 2J7GA 2VMFA 1M53A 4AZBA 5AYIA 5CGMA 2ZUNA 3SCPA 1UD4A 2E9MA 2TAAA 4P7NA 4ZEPA 2VZSA 2DQXA 1NM9A 1SYTA 4W85A 4WKFA 3AROA 4HPGA 1G01A 1QVBA 5CPTA 5I3DA 3VVGA 2V38A 5IHSA 1ZBKA 2O9TA 2F8QA 3KZSA 1HT6A 3PN8A 4XB3A 1EA9C 2WMIA 1LG2A 3O6AA 1UD2A 4Q22A 5EB8A 1GHSA 4M56A 4FLSA 4CD5A 4PN2A 3CH9A 1OCQA 3VX1A 3UETA 3CMGA 1W9VA 3WF4A 4OIFA 3NIYA 2VTFA 2YKKA 1JDDA 5JIWA 1IZJA 3AQUA 1YQ2A 3THDA 2PB1A 1AQHA 3TTSA 1FP9A 5EMYA 5A8MA 4WJXA 4ZXLA 3B9AA 3LPOA 4TVUA 1R85A 2Y4SA 1QI2A 3W25A 3VKKA 3CUGA 1XGZA 2E40A 1RD6A 2VZVA 1V3JA 4FK9A 1CLXA 2VURA 4F8XA 4B16A 3CHFA 2G4FA 1KQYA 2VCBA 2V3DA 3WNLA 3N04A 4IPNB 2WVTA 3VM7A 2WM0A 2VVNA 1M01A 1UYQA 2WLZA 1BGGA 1JZ2A 4MPKA 4JKMA 4E8DA 4Z2GA 1XD0A 2J7FA 4WIWA 3BMWA 5A1AA 4UR9A 3WDQA 5A69A 5LA0A 1UWRA 1R7AA 3L4UA 2V3GA 2OWCA 5I24A 2WB5A 1WB0A 4HZ8A 3GBDA 2VRKA 4DUWA 3T2OA 2DSVA 2XGIA 4J3TA 3QHNA 1JXJA 5D9MA 4BA0A 4EANA 5LA1A 3AYRA 4HPHA 3L4WA 1QI0A 1E1EA 1GJWA 2XVNA 5HXMA 2WKGA 1Q4NX 1UR4A 4AZ7A 1WO2A 5FIPA 4LXFA 1HP5A 4MAZA 1XYZA 4CGTA 3T0BA 2XTKA 4UOZA 3VIPA 1C8QA 1O7AA 1B3ZA 3IANA 1FP8A 1G1YA 1V08A 3UEQA 1XHGA 2CBJA 3DYMA 5CLWA 1J0YA 3CUIA 3NSNA 2C7FA 3PZNA 2DT0A 1UH2A 4PCSA 2ZICA 1ZBVA 2X0HA 1CBGA 5AYBA 5GNZA 4W8LA 4WK9A 2MANA 3PZVA 3MMUA 3ARPA 3GH7A 1Q6FA 2VJXA 3SUVA 1JD7A 3GYCA 3VIHA 5IDIA 4BQ4A 1O6IA 3AYSA 4AD5A 3MANA 4JFWA 4IISA 4IPLA 3ZIZA 2DDXA 1OWQA 3BLKA 1OD0A 1ZBCA 3PZUA 3SUWA 3WMBA 2ZWZA 3GTNA 3WD1A 1UWSA 2IXVA 2VUYA 1MW0A 1J9YA 1X6LA 4J3SA 4M29A 5GNYA 1E73M 3AMLA 4OJYA 3ZT5A 1WDRA 3BAIA 1CXFA 2QMJA 4JKKA 3SCNA 3T0DA 4LYRA 1W3KA 1IZKA 2EO7A 1UR9A 1FH7A 1JYWA 3LPFA 2DH3A 4AZCB 1UR8A 1BLIA 1WCGA 3CZGA 2DIJA 4KRUA 1OIMA 1QI4A 3AFBA 2OWXA 8A3HA 3FNDA 3E1F1 1VRXA 1JZ8A 1VEOA 3BSHA 4UQ9A 2J4GA 4GI9A 2PWDA 4TUFA 1V0LA 4JL2A 1KXHA 4XZWA 2XFFA 3BAKA 4JHZA 5I78A 1R86A 2VZTA 5E09A 2NW0A 3WD3A 2CHOA 4DM2A 4JL1A 2DIEA 2VR5A 2E4TA 4ATWA 2ZUMA 5I23A 3LPPA 3MO4A 4AD1A 4UNIA 1X1NA 1UR0A 4AD3A 2YOCA 3K8MA 3WUFA 5ECUA 1JG9A 4V28A 3N18A 2YJQA 4TVCA 3AIVA 1V02E 5D9OA 4W7UA 3VTRA 5E70A 4M1RA 3CO4A 2QF8A 2VQUA 4FMVA 3CHCA 3WNPA 4JCMA 1FHDA 4JFVA 4GINA 5A94A 2J75A 4TXEA 4HP5A 3WENA 2CERA 2JE8A 2XFYA 4JAWA 4GIAA 2J7HA 1BSIA 2B31A 2BHUA 4PTWA 2YA1A 3MS8A 3VM5A 3RILA 3WH5A 2VO5A 1B1YA 1F4HA 3CUJA 4U3CA 3GH5A 2XSAA 5DMYA 2G3MA 2JFEX 4H8VA 1GCYA 4HA3A 3TA9A 4AXNA 3SIMA 4W86A 4MNKA 1V0NA 1TUXA 1NOUA 3MUAA 4CD6A 1B3VA 2Q8XA 1VIWA 1TA3A 3ARYA 4GO9A 1JF6A 2PI6A 4WLCA 1V6XA 1BG4A 1CGVA 4ATLA 1L8NA 3BAJA 1J0ZA 1QNRA 4H8HA 1VEMA 2YL9A 1H09A 5CG0A 6TAAA 1HXJA 1TZ7A 1KGUA 3BXWA 2O9PA 4DUXA 3NYDA 1CEOA 2WHLA 1IV8A 3SURA 1BAGA 4J3XA 7TAAA 4UOJA 3L4VA 4M80A 3BGAA 4Q7NA 3PHAA 3AXIA 2PWFA 3WH6A 2EPNA 5E6ZA 4KGJA 1ZL1A 1JF5A 1GORA 1XYFA 2Y5EA 2A3EA 1UWIA 2J8FA 1E0WA 1WDPA 4OOUA 2CYGA 1C92A 3WF1A 3QR3A 1E0XA 5C71A 4AIOA 2WWCA 3VILA 4C7GA 1MW2A 3RJXA 3FXYA 2WMFA 4W7WA 1K9FA 2WC7A 5CZKA 1V6WA 4C7DA 1HNYA 3FAWA 5CSUA 4X0VA 1R7OA 3W53A 3UG3A 4YN5A 1OSEA 2JEQA 3CZKA 4MDPA 4OBSA 3MSGA 4OKDA 1UD5A 4EE9A 1W3HA 1GZJA 3ZMRA 5A6SA 1RPKA 3VDCA 5M3WA 4PMNA 3WD0A 1BGAA 2QPUA 2Y24A 5BXSA 3SUSA 1HJQA 2UY5A 3WQ6A 2X0YA 1GVYA 5LYRA 2WHKA 3HJEA 5JBEA 3GNOA 5I0DA 3WF3A 2F61A 2XUCA 2NT0A 5A8PA 3L2LA 1YHTA 5JBFA 3EDEA 2D3LA 3CUHA 3ZT6A 3WL1A 1UKOA 3I3EA 1BG9A 4H2CA 3IAPA 3T09A 2VX7A 5BRPA 1GOQA 2YA0A 2FHCA 2VX4A 2DGAA 1E4LA 3GXMA 3OB8A 3OLDA 3RJYA 3AHYA 1QNPA 1WZAA 2BHZA 4CUCA 3T08A 4W93A 1KB3A 2WSKA 2IXUA 3WF0A 1PJ9A 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5CJ5A 2G3NA 5BXRA 2DT2A 3WDRA 3VIMA 4M8UA 4FLOA 2WBGA 1HKIA 1KGWA 1HKKA 1MVYA 2ZXAA 1CZ1A 2UY4A 3EDJA 3WQ5A 1WPCA 3VGHA 3WUEA 3MMWA 2XVGA 4ACYA 1LL6A 1DEDA 3VGBA 1E6NA 3BSGA 5A6BA 1XSIA 4F79A 3W6MA 4NRRA 2VRQA 2W61A 4UQCA 3PBGA 1KFWA 1UH4A 4PMOA 1GW1A 4D6GA 4MADA 2DSKA 4LYQA 2W62A 3SCUA 1H3GA 3CZJA 3UR8A 3TONA 1OT1A 1MW3A 4YHEA 1CTNA 1B3WA 4LYPA 4H8UA 1D2KA 2WC3A 3IJ7A 4V2XA 2J77A 3AMKA 2YA2A 2XVLA 3BAXA 1UA3A 4DWSD 1GUVA 3WH7A 2CXGA 3N11A 1VEPA 3NSXA 1LJYA 2AAAA 2J78A 1PEZA 5FL1A 1DWJM 1J18A 4AMCA 3KEHA 4AY1A 2A3AA 1KR0A 1JNDA 1E72M 2DSWA 3MSDA 4H04A 3ARUA 4UCFA 2WMHA 3GH4A 4UZUA 1DWGM 3AXHA 1UZ1A 2CITA 3AICA 1TE1A 2ZUUA 3II1A 4CCDA 1Q6EA 1E5JA 4MB5A 4W88A 1BHGA 1EDQA 4XUYA 5CQ1A 1J0IA 1U2YA 1DTUA 1NOFA 1XSKA 1QI5A 4B3LA 4WSJA 1BYCA 1P6WA 2JEPA 5A8NA 3U7VA 5CLTA 4PSPA 1HVQA 1C7SA 1QW9A 2VQTA 1JI1A 4EAMA 3GBEA 4QCEA 1JYNA 3AI0A 4HZ6A 2OYMA 3W26A 2OWWA 1AVAA 4LX4A 2WHJA 2J74A 4KH2A 3U5YA 2JIEA 7CGTA 2ZX7A 1TCMA 5M03A 1HJUA 3WMSA 5DF0A 3AXXA 1W2PA 2X1IA 4QLLA 5ABEA 4V27A 3KE0A 4CVUA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4AWEA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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