4AXKA

Crystal structure of subhisa from the thermophile corynebacterium efficiens
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
246
structure length
235
Chain Sequence
TFTILPAVDVVNGQAVRLDQSYGTPLESALRWQEQGAEWLHFVDLDAAFNRGSNHELMAEITRQLDIKVELTGGIRDDASLERALATGATRVNIGTAALEKPEWIADVIRRHGEKIAVDIAVRLENGEWRTKGNDGGDLWEVLERLDSQGCSRFVVTDVSKDGTLTGPNVDLLRDVAAATDAPIVASGGISTLEDVLGLAKYQDEGIDSVIIGKALYEHRFTLAEALEAVEKLGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Evolution of Substrate Specificity in a Recipient'S Enzyme Following Horizontal Gene Transfer.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 1-(5-PHOSPHORIBOSYL)-5-((5'-PHOSPHORIBOSYLAMINO) METHYLIDENE
molecule tags Isomerase
source organism Corynebacterium efficiens
total genus 82
structure length 235
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.16: 1-(5-phosphoribosyl)-5-
pdb deposition date 2012-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4axkA00
5EKYA 1ZFJA 4L4MA 1G67A 1OHLA 3W6YA 2VOMA 4HIBA 4UCGA 3G0XA 4IWWA 4GUIA 4YMZA 5AHMA 2V81A 3TMLA 1KFEA 3T44A 3P74A 3UWZA 3ABOA 5D30A 3TAKA 3JR2A 3G1HA 3MI2A 3TIMA 3P8IA 3C2RA 1GYLA 1XM3A 1PIIA 3GDTA 3TK7A 4UTWA 4NJKA 5K2ZA 1M5WA 5HWMA 4MYAA 4AWTA 4ADUA 1UUMA 2QCLA 5BNKA 3LRKA 3L0KA 4RLIA 3MWAA 2WQPA 5CG7A 1EWEA 1RV8A 1F76A 5D2XA 1OFEA 5AN7A 1KFLA 2ZZ4A 5CZ0A 3MI6A 3W71A 1G69A 1PVNA 3TE9A 2Y63A 5DCDA 5H91A 1FWSA 3P7YA 1SUXA 4NX0A 3BGJA 4LVFA 2H6RA 4IMEA 3S1WA 2G95A 2VFFA 3CM4A 1YLVA 3KOFA 1TV7A 1XDMA 3GX9A 1LOQA 3N2MA 3R89A 5KTLA 3N19B 3VNDA 4OGZA 3LV6A 2QAPA 3PBYA 2A4AA 1Z42A 3MP3A 3YPIA 4NVTA 1B3OA 2UV8G 3EWZA 1XBYA 4Y90A 3C3NA 3DI1A 4Z1DA 1KFKA 4IXXA 3KRSA 2ATSA 3PF3A 1VCGA 2X1TA 1Q6QA 2QEZA 3G1FA 1F7BA 4LWWA 4UR8A 4O0KA 2DZWA 1SZGA 4OWGA 3W2NA 3NQVA 3TQKA 5HQEA 4IXHA 3PAJA 1O60A 2QCEA 5I3IA 3SW6A 2CZEA 2BX7A 1W56A 2Y7FA 4JTEA 4JYFA 1TPVA 3UWYA 4WY0B 1XC4A 3NAVA 4GC4A 2ZRXA 3UPWA 3NQEA 1FQ0A 4OE7A 5FEWA 1ZAIA 1A5AA 6ALDA 4RJEA 3FA5A 1WAUA 4X9SA 1TPFA 3IV3A 1K7XA 3G3MA 4TMCA 1IXQA 2BLEA 5D09A 1C9DA 4EIVA 4ONVA 1VS1A 1QMLA 3W7PA 4UTUA 4XQ6A 4DPPA 3S6DA 1L6YA 5DCBA 1W0MA 2QJHA 4K8HA 3S0CA 4UTTA 1Q6LA 5CSSA 2ZZ1A 3BK0A 2G97A 3T55A 4A29A 4O10A 3TFXA 3UWQA 4QQ3A 3RNDA 5I3FA 5K4XA 1NF7A 1MEWA 1TTIA 4RV8A 5E1QA 2C3ZA 3C4UA 2B7NA 5HWNA 1FWTA 1LOSA 2H8XA 3L5LA 1FCQA 1OFOA 4AHPA 3HF3A 5KMYA 3CQ0A 4OBTA 3W75A 1EEPA 5LSMA 1G4SA 5AHEA 4O1CA 3W7EA 1OK4A 4WX2A 1X7FA 3W7OA 2JGQA 3ZR4A 3FIGA 3MHFA 1JULA 3I7SA 4X22A 4O57A 1SR9A 1S3HA 4S2CA 2A85A 1LZOA 4DBDA 4RX0A 3OVPA 3FYPA 1YTKA 1TO3A 1YTDA 1K3UA 1LRQA 4E2DA 3W7RA 4IUOA 2ZRZA 2RDTA 2JKEA 4KWVA 3UWVA 1EWDA 1TYGA 1J5TA 5G2HA 3PSWA 1TTQA 4MLRA 3P60A 1HO4A 4UTHA 1SPQA 1KBJA 3TR2A 2BXVA 2G5WA 5IBXA 1AW5A 4TU1A 5H2ZA 4O15A 1DVJA 5J5DA 1ZNNA 2E6AA 3BW2A 5D03A 1CW2A 1HO1A 4GWEA 2CLMA 3V1PA 5LGXA 3B03A 4RZ6A 4MKNA 3IVUA 4DO5A 2GPTA 1WXJA 1N55A 3I65A 1H7PA 2R8WA 2X1SA 2OT1A 4LU0A 2CW6A 4PFMA 2ZZ5A 3ATYA 4UC5A 5GVJA 3PC0A 3O16A 2CZ5A 5DCEA 3TMQA 3HJZA 3BV4A 1GJPA 1CI1A 2ISVA 2FPVA 5AYYA 4AB4A 4O52A 2OX1A 1QOPA 3NVTA 1SSGA 3W1UA 3THAA 4FO4A 1OFPA 2YSWA 2JKAA 4ZQMA 2O7SA 1S5TA 5F2IA 1XBXA 3W87A 4I7VA 2Y6ZA 3B0VC 3P67A 1GG0A 1W1ZA 5AC8A 3W1TA 3TFCA 3NNTA 2Y7GA 2Z0IA 4JTHA 3U2OA 3EX1A 1GWJA 2V0TA 4O4VA 4FIQA 3UD6A 4MJZA 3O6YX 4ORIA 1TSIA 5DXXA 4HNVA 2YDAA 3LB0A 1K7FA 2YCEA 3PUEA 1F73A 2J9YA 1VQTA 4EWND 1LDCA 3E0IA 3P62A 2GJLA 2HMCA 1ZAHA 3G1AA 3GZ3A 3Q37A 3TSBA 2BWGA 2WKJA 4ZQNA 1A53A 4LT9A 1H7XA 4IOTA 3IGXA 3DAQA 3R5EA 4LUIA 1GVOA 3S5YA 3NQMA 1W8SA 4FEZA 1LTDA 1W5QA 4DO6A 3FYOA 4TO8A 1T99A 2V9DA 1PE1A 4Z1AA 4AAJA 1SSDA 1KM6A 2E09A 2HTMA 5HR6A 3PUOA 4FNQA 4JTLA 3BLFA 1BTMA 1FX6A 1SO6A 4OQVA 1WV2A 4JIQA 5LNWA 3NYZA 1LLZA 2CWNA 3GKAA 4MPQA 2DJXA 1KLYA 1LRTA 1SO5A 3TJXA 2FB3A 4K6AA 4CLMA 1ZHAA 1GOXA 5TBOA 3E02A 3B0PA 1OFDA 3SJ3A 2VFGA 1SFJA 4JD4A 5HJLA 5D2YA 4R53A 4DQWA 5HWJA 2B4GA 4PEKA 3LOTA 1XUUA 1GPWA 3MW7A 1KM2A 3NZRA 3GLCA 4FB7A 3L2IA 2GJNA 2EKCA 3QZEA 1OFAA 4YCOA 5I3KA 4ZMGA 3EWUA 4X3ZA 4ORMA 3QRHA 4M6QA 1VC4A 2NUYA 3WFAA 1H62A 3NR0A 3ATZA 2DU2A 3HPSA 4Y9AA 1IXNA 1AL7A 4K7YA 4UFKA 4NU7A 3BW3A 3OIXA 5CZSA 3W1XA 4BF9A 2Z6IA 4MFDA 1OYBA 4H6KA 3M43A 1TPEA 1WYIA 3S5ZA 1GVRA 3GNNA 1G7UA 3PS7A 4LS2A 1UJPA 1YDOA 3LBMA 1LBMA 4FF7A 5AHNA 3MMTA 1LORA 2V82A 1QPOA 4NNBA 1H63A 3EXTA 1S5VA 3MJYA 4Q4KA 4LY8A 4UXDA 1NAL1 3HB9A 1ME8A 3FKRA 5D2WA 3UNDA 4HNTA 1X1ZA 4FNTA 4JR5A 1A50A 4DELA 1IIHA 1H7NA 4HPJA 2B7QA 3QMTA 1B4EA 3M47A 1TV5A 2Z1BA 3I7RA 3QMSA 4MZYA 1FCBA 1A5SA 5LGZA 3H55A 3GKFA 3A23A 5FEPA 2ISSA 4LVBA 2I9EA 4R33A 1QFEA 3A9IA 1D3GA 1I2QA 3M16A 4WY0F 3G0SA 3LLFA 4M6PA 3UY7A 2X2GA 4MUZA 4I7UA 3LCWA 2E6DA 3OG3A 3CLMA 6TIMA 2C18A 4FNSA 3WK3A 3RU6A 2ZCGA 3M5XA 3BLEA 1XCFA 4LOCA 3FS2A 4JTUA 3TA6A 5EPDA 1PV8A 3W85A 4BR1A 2ZA3A 4FNPA 5A8GA 4HNNA 5DY2A 1FBAA 4UUIA 3SSJA 1JRCA 1VCFA 1S5WA 4FNRA 2Y89A 3FFSA 1TQXA 2I14A 4CNPA 1OFRA 3F4NA 1NSJA 2A6NA 1YPIA 1VH7A 3U8GA 3O1NA 5EYWA 1KLZA 4PC8A 3C56A 3DU0A 1G7VA 3TNOA 3QEZA 2FPYA 3CC1A 4CQ8A 2NXIA 3B0UX 3M0ZA 4O0ZA 3OVQA 5HNRA 4CNOA 5K9CA 4N4PA 3B4UA 1SZFA 3EX2A 4LNYA 2NLIA 3BARA 3ZWSA 4ADSA 1JR1A 4HN4A 4MY1A 4PL2A 1Q6RA 2CLFA 3LCFA 5F4XA 3GIYA 1Y0EA 4N2YA 2QJIA 3W86A 4UR7A 3NL6A 4JY8A 3D0CA 3MI3A 1TREA 3I6RA 1T96A 2NWSA 1LRNA 4KWWA 3PULA 5AHLA 4S1FA 2V5BA 1OJXA 3N3MA 1EIXA 2XN1A 3P61A 2Y70A 4TMBA 1OABA 3FJ6A 4YCPA 2FIQA 3H54A 3TXZA 5G4WA 4LRSA 3WJZA 4OV4A 3DXIA 4C1KA 1HL2A 2ZZ6A 3GYEA 5D02A 4JN6A 1WBHA 5C5YA 4WOQA 4A3UA 3NPWA 2E6FA 3PY2A 1OX4A 1QO2A 4IX2A 4XKYB 4JTFA 2VFIA 4LVGA 5CKSA 3W7DA 3E49A 4UNLA 1TPUA 3SGZA 3LHUA 5CZTA 2AGKA 4FX6M 5I3JA 5HUOA 1QPQA 4NJHA 2V30A 1DORA 3H53A 3L0NA 3W73A 3VKJA 3DH7A 3GNDA 5U4NA 1EUNA 4ZQRA 1K02A 3PM6A 2JGYA 4MY9A 4LRTA 3LTSA 4UTIA 1F05A 3PG9A 4WJEA 4CQAA 3LXBA 5BRBA 5E0KA 4NZJA 4LC8A 3BG5A 5FF7A 2Y88A 5G1TA 4OHQA 3IEBA 3W7IA 2C14A 3NL3A 4DPQA 3F1QA 1CX9A 5F1UA 3I68A 4J9JA 4GNJA 1SO4A 3C52A 5D05A 1K8YA 4ALDA 4GJ1A 2VELA 2NUWA 2Z6JA 1B57A 4LV9A 1P0NA 1VLWA 4RKAA 2WO5A 4XTIA 4ZVJA 3CWNA 4LC6A 3TX9A 3W2LA 1F74A 2QKFA 2RFGA 4IMGA 1KTCA 3O6DA 3STGA 1W5MA 1C8VA 4MFEA 2AQWA 1DJNA 3HQ1A 3PWAA 3EXSA 3SY5A 5DLCA 4WXZA 3I7QA 2B0MA 1R2RA 1W5OA 2CLEA 4YLWA 1R2TA 2RHGA 3C6CA 1G4EA 2V2DA 4LS1A 1VRDA 2GVLA 3DBPA 4MZ1A 1V7YA 1AW1A 3MUXA 1FDJA 1A5CA 3R2GA 5CPLA 5K9XA 4BI5A 5BOOA 2A5HA 3GDKA 2YFOA 5FI8A 3PBWA 4QAIA 1EA0A 2GVJA 2WSQA 2G96A 4POCA 3W7HA 1H61A 2IQTA 5G4EA 3NA8A 3G24A 1DL3A 5KZEA 4WOZA 2ATMA 5AHFA 3HMJG 1VZWA 1VHNA 3C2OA 4E0CA 3S8HA 3QYQA 4AH7A 1N7KA 1T0OA 2ZZ7A 5LZLA 3L65A 4R7JA 1MSSA 3VE7A 1O4UA 3N9RA 3AO0A 3UXAA 3L5AA 3EWXA 3O06A 1GTEA 3V75A 5G5IA 2ZQ0A 1KTNA 3F03K 1JCMP 2QCCA 3A5VA 3L5MA 1AW2A 1YYAA 1H1YA 3OEXA 2ZZ3A 5HINA 2QUVA 5D2VA 3W7CA 4ZQOA 3EB2A 3MYPA 5FF4A 2WOQA 3M7WA 1OG0A 2VKZG 3O05A 5LNVA 3QW4B 1LBLA 3LCXA 4IPJA 1XXXA 2RDUA 2DZUA 3W2UA 1BKSA 5KSWA 1MEIA 2XN2A 4GXMA 5E93A 2QAFA 1W31A 3RFAA 1OX6A 2W0UA 2GQ9A 2ZDRA 4NZFA 4AMAA 1QPNA 4I7WA 4Y96A 5K3VA 3M44A 1W54A 1H7WA 4JTGA 1DOSA 3P5ZA 2QDGA 4HPXA 2FB2A 3QH2A 3E96A 4GUJA 1LOLA 3FJLA 5F2MA 4Q32A 1L9WA 3A21A 2NZLA 1UUOA 3P84A 3KRZA 1JQXA 1K03A 3WK1A 3HGRA 4HHPA 3VE9A 2W6RA 2CLKA 2EPHA 4DF0A 5AOUA 2LLEA 4O14A 3W7NA 3LV5A 2BSLA 3HPXA 3KVKA 2E5BA 4MLJA 4K8EA 4JNMA 3NM3A 1O94A 3L21A 3WJYA 3IGSA 1JCLA 1RVGA 4NXSA 3NDOA 3ABQA 3DFTA 1LBFA 5D33A 4AF0A 1SFLA 4UMAA 4WD0A 4LVDA 2F84A 4JIPA 4JTSA 2H8ZA 3DFSA 2JKPA 1RQHA 2JBMA 3CEPA 3IIZA 4A21A 3CIWA 1VHCA 1ZAJA 1TPC1 4JTIA 1I4NA 4ADTA 5D2TA 1UASA 1WBJA 2XN0A 3W23A 1JCJA 2E5CA 5K4ZA 3EX4A 1TTPA 1FDYA 4PTNA 1L2UA 4PA8A 1KFJA 2OJPA 3NQGA 4Z08A 1XFBA 5FESA 3NL2A 2EAWA 1TV8A 3TUUA 4IJBA 3RK8A 3PB0A 1RZMA 1TPDA 4E38A 1TTJA 2VEIA 5AYZA 3HOJA 2YGYA 4E2BA 4S2BA 2J9ZA 2ZTJA 4UTMA 4BWLC 3N2XA 4N02A 4UFIA 2R94A 3LCLA 1KW1A 3CPRA 3GDRA 4EF8A 2F7FA 2GUUA 4YXGA 4PL1A 4AVFA 3B05A 3EXRA 2QCNA 3DFPA 2NXHA 3NEVA 4AHOA 3GXPA 1FWRA 2ZRUA 3O6CA 1I2PA 2CLLA 3EKZA 1KTBA 1KM1A 3KAOA 3N9SA 4G1KA 5HULA 1HUVA 1OFQA 1SU5A 4MVAA 2ZFAA 1FXPA 3M5VA 3NQAA 1JQVA 3TAOA 4JX6A 1TJRA 3IIVA 3QPZA 1WOAA 2FJKA 3TROA 4XZ9A 1IGSA 4JY9A 3UPBA 2AAMA 4FHAA 1K8XA 5BW6A 1LCOA 2R14A 4AEOA 3LLDA 3TSMA 1A5BA 1X1OA 2QCFA 2EF9A 2YW4A 3NZ1A 1XBVA 5BMWA 1QPRA 2WNQA 4XTDA 3W70A 1LP6A 3SIZA 2YZRA 1F5ZA 2YYTA 3PR2A 2YPIA 4LW7A 1M6JA 4NJJA 3TV8A 2HS6A 4MYXA 1I2NA 1O95A 1OVDA 3W7QA 3G22A 2ALDA 5FF2A 1EP3A 1BWLA 4FIRA 4JTKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1EO5 A;  4L4M A;  1VFU A;  1V08 A;  1F4A A;  3KCO A;  3BXW A;  2OZT A;  4IWW A;  2VP8 A;  1CGX A;  3E6E A;  1KFE A;  3KZS A;  5JUV A;  3RX4 A;  1DJH A;  4TVD A;  3JR2 A;  3WUG A;  1H41 A;  3HPA A;  3MU7 A;  4U31 A;  6ENL A;  3TK7 A;  1LUC A;  1SR0 A;  1M5W A;  1A3H A;  4US6 A;  4MYA A;  1F6Y A;  3SCS A;  4IFK A;  3LEP A;  3KBV A;  5I7G A;  3MWA A;  2XIO A;  4U3A A;  1ECE A;  1OFE A;  1C90 A;  5E6Y A;  4LYR A;  1DWH M;  3W71 A;  3MI6 A;  5I79 A;  1Q63 A;  2BGS A;  1GZJ A;  3O3R A;  3SRH A;  4MWA D;  1BRL B;  5H91 A;  3L2L A;  4AX7 A;  4AZC A;  1T6M A;  3VGB A;  4JQ3 A;  4WK9 A;  3KOF A;  5MF5 A;  1XDM A;  4HOZ A;  3WQP A;  5CZK A;  3DHU A;  4OGZ A;  3MP3 A;  3OBE A;  3FAX A;  3SRK A;  2XGI A;  1DQU A;  1ZJA A;  3EWZ A;  4B90 A;  3C3N A;  2ATS A;  1OC5 A;  2SFP A;  2X1T A;  1Q6Q A;  3IPW A;  2Z24 A;  3APT A;  1L8N A;  4RNH A;  1SZG A;  4IXH A;  3PAJ A;  1AH0 A;  3OW1 A;  3P93 A;  3SW6 A;  1B5T A;  1GQK A;  1WKF A;  4JTE A;  2Q6Z A;  4JYF A;  2QPX A;  3KS6 A;  4RL3 A;  3CO8 A;  4GC4 A;  3UPW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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