4B3L | Genus

Total Genus 184

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	184
sequence length	461
structure length	461
Chain Sequence	LAFPKEFWWGGATSGPQSEGRFAKQHRNLFDYWYEEEPDLFYDYVGPDTASDAYHQIESDLTLLASLGHNSYRTSIQWTRLIDDFEQATINPDGLAYYNRVIDACLANGIRPVINLHHFDLPIALYQAYGGWESKHVVDLFVAFSKVCFEQFGDRVKDWFVHNEPMVVVEGSYLMQFHYPAIVDGKKAVQVAYNLALATAKVIQAYRRGPAELSDGRIGTILNLTPAYPASQSEADMAAAHFAELWNNDLFMEAAVHGKFPEELVAVLKKDGVLWQSTPEELALIAENRVDYLGLNFYHPKRVKAPDAIPVISPSWSPEWYYDPYLMPGRRMNVDKGWEIYPEAVYDIAIKMRDHYDNIPWFLSENGVGISGEDRYRDETGQIQDDYRIQFLKEHLTYLHKGIEAGSNCFGYHVWTPIDGWSWLNAYKNRYGLVENNIHTQVRRPKASAYWFKKVATHNRL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure and Activity of the Streptococcus Pyogenes Family Gh1 6-Phospho Beta-Glycosidase Spy1599 pubmed doi rcsb
molecule keywords	BETA-GLUCOSIDASE
molecule tags	Hydrolase
source organism	Streptococcus pyogenes
total genus	184
structure length	461
sequence length	461
chains with identical sequence	B, C, D, E, F
ec nomenclature	ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date	2012-07-24

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4b3lA00

1FHDA 3POHA 4XX6A 2BVTA 1VIWA 3K4AA 3RMEA 4JZ5A 3MMWA 2J7FA 1D2KA 1HXJA 2V3FA 3VGEA 4BQ4A 1W1VA 4WKHA 4NI3A 2VR4A 2W66A 1ISVA 2WLZA 1EDQA 3B9DA 2XFRA 1WZLA 5IFTA 4GI8A 1KXQA 3UR7A 4Q7NA 3OLIA 3K8LA 3W24A 2WZHA 4M82A 2IUZA 2YL8A 1R87A 3KZSA 3VX0A 3ZMRA 1V3HA 4B9YA 5HDRA 2HVMA 3GNOA 4AISA 1QHOA 4AD2A 3VIHA 4CU8A 4D6CA 3SCOA 1VBUA 1MQQA 2ZOXA 4B3LA 3WEOA 2DSZA 4W89A 4A4AA 4AZ7A 1E43A 1FOBA 3FHQA 4J3TA 3CMGA 4HU0A 4TUFA 2Y4SA 4UZUA 4GO8A 1MXDA 1NM9A 3DECA 1JXJA 2DT1A 2F61A 1GJWA 4MB3A 4DUXA 4PMQA 1BSIA 1ESWA 5JUVA 3EDEA 3GXFA 5E9AA 2QV4A 3ARWA 3GXIA 4W8LA 3ZIZA 2J4GA 3AZTA 1HNYA 4JFSA 1B90A 4Q22A 3CHEA 1E4MM 1SYTA 4IPLA 2CHOA 1DWGM 2Q8XA 3WDPP 2BNJA 2WKLA 2V3DA 4F8XA 1VAHA 5C70A 1MWOA 1Q6DA 1V0LA 1V02A 2VRKA 4UQAA 4MADA 3SCPA 4UQ9A 2XHYA 1C7SA 4PRWA 2WVVA 2WVTA 1CWYA 8A3HA 2F2HA 3B8SA 3WDIA 1K9EA 3CUIA 5D9OA 2VX6A 3AIBA 3AZSA 4B16A 4AD0A 5FL1A 3VM5A 1DEDA 2WVVB 2W5FA 3GNPA 1KGUA 2VVNA 4FLQA 4AZBA 1UH3A 4S3KA 4HPHA 5KEZA 5A6MA 2A3AA 1QNSA 3WNPA 1B3VA 2CHNA 4V28A 1PAMA 1KR1A 1BGAA 1M01A 3MUIA 1O7AA 2QMKA 4P7OA 3PZUA 1E1EA 1BYDA 1UWTA 3WD0A 1JZ2A 3POCA 1ITCA 3THCA 3UCQA 2J7DA 3AHXA 2G8ZA 5BXSA 5E6ZA 1KXTA 3NSXA 5EFFA 4LYRA 5I5RA 2VL4A 1D3CA 1JFXA 1Y7VA 1UQZA 1WP6A 3NJ3A 2WHLA 4J3WA 4MPKA 1TCMA 4H8HA 2CBUA 1Q6EA 2XVKA 1UWRA 5FCZA 3BAXA 4WSKA 5CXPA 3WEZA 4NZCA 3ARSA 4NRRA 3ZR6A 1J0IA 2A3HA 4AD4A 5F7UA 1HKMA 1ZJBA 4Z2JA 1CGUA 5A6KA 3W28A 2YL5A 3K8KA 5E0CA 1KGXA 1B3ZA 5JBDA 1JYWA 1NWTA 3AJ7A 5HPOA 4LYPA 3EBVA 4U5KA 1VJZA 4QCFA 5A8OA 3ZO9A 1HKJA 2Y2WA 1MFVA 1KQYA 3TTOA 4LPCA 2Y24A 1W2PA 5I3DA 1UD4A 2ESCA 3DC0A 3VIJA 3N04A 3UG5A 1ISXA 2TAAA 3SUWA 2CESA 2VOTA 1E40A 4QLLA 3WD4A 4PMNA 1E0XA 2G3IA 1V0NA 4D6DA 1WCGA 5CPTA 3M6DA 4P7LA 1B3WA 2BXZA 5BWFA 3OZPA 4QFUA 1ZS2A 1EOMA 2PC8A 2Y5EA 3ZJ7A 4AD1A 1WB0A 1TG7A 1VFOA 3ZT6A 4BQ2A 1H4PA 1KWKA 1TMQA 1W3HA 4GO9A 4AY1A 4D6HA 1KCLA 3O9NA 1OINA 9CGTA 2V5DA 3FXYA 4MTVA 1FP9A 4IM4A 1LWHA 4OUEA 1B0IA 3ZSSA 3LPOA 5I2UA 1VRXA 1JYNA 4E2OA 1JZ8A 3W37A 3DYMA 1UR9A 1JD7A 1EHAA 3VDBA 3PZNA 2JIEA 3VOCA 5A95A 2YOCA 8CGTA 3ARYA 1GNXA 4DWSA 3CUHA 1FHLA 1E15A 1IZKA 3WNOA 4GQRA 1CIUA 1I1XA 3AHVA 3U5UA 3VMOA 3VIFA 4H7VA 4CCEA 1UR1A 1LG2A 4EK7A 1G1YA 4KRUA 2XWDA 5JIPA 3WH5A 3RIKA 2AAAA 4DWSB 2XM2A 1WZMA 3WENA 2V3GA 4CVWA 2XG9A 3W25A 1OD8A 2CBIA 1FFQA 4Y7EA 5D9PA 2XYLA 1H5VA 3AZRA 3WF1A 3WF0A 3CZKA 2WW5A 1ZB5A 3VIGA 4MNJA 2W4XA 5LA2A 2WM0A 4W7VA 3QHMA 1QNPA 4LYQA 3MS8A 4PTMA 2E8YA 3TTSA 4OIFA 4CN1A 4BQ5A 3A3HA 1W9XA 1UD2A 4IUGA 1ZBVA 4QAWA 1C93A 1BGGA 3PZIA 1J9YA 2BHYA 4PMZA 4P8VA 3CUJA 1K9TA 4A3HA 4FLSA 4MAVA 2YDSA 5I77A 3BGAA 2VZTA 2ZUVA 4WF7A 4UOZA 1UWSA 1XC6A 2J7HA 1WDPA 4UFIA 4DUVA 5CPSA 3MMDA 2WBKA 2VCAA 4JCLA 3T0DA 1AMYA 2O9TA 3J7HA 4D6FA 4L4OA 2XVGA 3CZGA 5DF0A 2GK1A 4ZE4A 2GDVA 1ZBKA 4UCFA 3VGBA 3WQ6A 5JBEA 5LA1A 1E70M 5CG0A 3BAKA 3MUY1 5FL0A 4CCDA 1LF1A 1GOOA 1TE1A 1E1FA 1HVQA 4PN2A 1OSEA 1NH6A 3K46A 4AZGA 1ODUA 1KFWA 3W27A 4M29A 4PTWA 5ABEA 1LG1A 5IDIA 5KZ6A 2O92A 3CHCA 5A2CA 4EAMA 1WPCA 1NP0A 5A6BD 3AMKA 4HMCA 3AICA 3F5LA 3KWXA 1E0VA 1XHGA 4UQEA 1VENA 2G3NA 1C3FA 2O9PA 1UWUA 3UEQA 2CNCA 1MW0A 2ZIDA 1JZ5A 2EPMX 3VILA 1E6XM 1GW1A 1UQYA 1QW8A 3QGVA 1E71M 3L2LA 3OB8A 4UOJA 1PBGA 4PEEA 3OGRA 3WBAA 3WUBA 1UOKA 3VNZA 3T09A 2GDUA 2WMFA 1J01A 2FGZA 5FIPA 3W82A 2BVDA 1B31A 1E4LA 3AHTA 1CGVA 2CPUA 2W67A 2Y8KA 5CZKA 4BCEA 3PTQA 2G3JA 4W93A 1JAEA 1ISYA 3DHUA 2F8QA 3N12A 1CGTA 1C8YA 5AY7A 1CNVA 3FY1A 2BY2A 2VCBA 1UUQA 3KE0A 4YHEA 3UESA 1WZKA 2ZXDA 1H1NA 1B2YA 1B3YA 1RH9A 3TTYA 3TTQA 3BMWA 3CTTA 2WBGA 2B31A 1OWQA 4DUWA 3W4RA 5DFAA 4ZFMA 1GQIA 2XFFA 3EDFA 4X9YA 2ZUSA 3VIPA 1BYBA 2XWEA 4HMDA 3ARZA 5A8PA 3EDJA 3KL5A 4D6IA 4P8WA 3AHZA 1Q4NX 3VDCA 3ARXA 1WE5A 4WK9A 3CUGA 1DHKA 3AXIA 2VUYA 1C8XA 3I3BA 2VCCA 5AYIA 5BXRA 1PZ2A 1HN1A 1UA3A 3VMPA 5GQBA 1AQHA 1VFFA 4J3UA 3WF2A 4GQQA 1OT1A 4GZEA 3W38A 5M5DA 2VRJA 3APGA 1ZU8A 4CVUA 4J28A 4ZXLA 4DWSC 2DGAA 5CQ1A 1MW2A 3WD1A 2UWFA 2CERA 6TAAA 3OLEA 2BY1A 3VO0A 3IJ9A 1XCXA 2VTFA 4YN5A 1VB9A 1V6UA 2WHKA 4OBSA 1W9VA 2RGLA 2ZX7A 4CD6A 2PWHA 3FN9A 3PBGA 2W92A 2E0PA 1JDAA 2HISA 2E9BA 3VINA 1DWIM 1GVIA 1WNOA 1UA7A 3CH9A 5A6JA 1DWAM 5GNZA 2OLHA 1HX0A 1UR2A 4Z2IA 2NW0A 2BS9A 4HOXA 2C7FA 3PZ9A 1SFSA 4R5EA 3W26A 1HF6A 1XH1A 5ECUA 3NDZA 1BF2A 1NOFA 3BAIA 2NT1A 1MXGA 3WDJA 1W1TA 3VPLA 3WH8A 2CITA 1J18A 2EXOA 3GBDA 4PMXA 1WKYA 1LL6A 1ISWA 1XYZA 2OYLA 4U2YA 4M80A 3NUKA 1PX8A 3CZ8A 2WMIA 1J0ZA 3WDRA 2WHJA 1EHNA 2Z1SA 3VD7A 2DIJA 1HJVA 4UFJA 4B15A 5GNXA 1NOUA 2GJPA 3IJ8A 4JKMA 4F66A 3KEHA 4L4PA 4RE2A 2QLYA 1H49A 2WMIB 3WUGA 4AZ6A 3T2PA 2BY0A 5BROA 2FH8A 1JZ4A 1V03A 1EO7A 4CKQA 4E8DA 4D1JA 4FF5A 1JI1A 1NOWA 3ZJ6A 5DO8A 4OOZA 1BPLB 1KR0A 3BLPX 3QHNA 4PSRA 2VX5A 4D6JA 1BVZA 1G94A 3SIMA 4CN4A 3CMJA 4EKJA 3MANA 1PZ3A 3BCFA 3MKKA 3PTMA 3HU7A 2DQXA 2J7BA 4PMOA 3SCSA 1CLVA 2X0YA 1FH8A 3WF3A 4JKLA 1NWUA 1BYAA 1TVNA 1KBKA 4W85A 4E8CA 3W6MA 3QOKA 4HA3A 3VIKA 4UTFA 2V5CA 2W91A 4C7FA 2RGMA 3WUEA 2BV9A 1OM0A 2IXVA 1EDTA 1V6VA 3RILA 4ZE5A 1US3A 4UZSA 1JF6A 1E56A 4AD5A 1V6WA 3PTKA 1WO2A 2J62A 1UKSA 5D9NA 1SR0A 4C7DA 5A3HA 4CD5A 4ZXOA 4ML4A 1QVBA 1E6QM 1E6NA 5I0DA 2BHUA 1DWJM 1OB0A 2PF0A 2YLAA 3OIHA 4H8VA 1HJUA 3VIIA 3S2CA 1BFNA 4HA1A 1W9DM 2XJ7A 2WNWA 3VGDA 1QI4A 5IHRA 1MQRA 1N82A 1QBBA 4J3XA 4JFVA 2YKKA 1XSKA 4W87A 4JCMA 2JF7A 4R27A 4W5UA 1V0KA 1VEPA 2EQDA 2WSKA 2J7EA 1G0CA 2D0FA 3II1A 3IK2A 2JFEX 1UD8A 2WC7A 4EANA 1XRVA 2ZX5A 4J3SA 5DT7A 1LQ0A 3WFZA 1S46A 1FFRA 3PZGA 4FK9A 1CBGA 2VZSA 4QP0A 1CGWA 3E1F1 2WB5A 3O6AA 3ARQA 2X2YA 2OSYA 3B9EA 4QLJA 5FKYA 3WNKA 3AS3A 3MSGA 4RL3A 5D8ZA 2AOSA 4AZHA 2C0HA 4K68A 2XFYA 3ZT5A 4TTGA 1J11A 2VQTA 3AROA 1OGBA 1QNRA 3AXXA 5M17A 5DMYA 5I78A 3U5YA 5TD4A 3VTRA 3CGTA 4W84A 4PBGA 2EBNA 1GQLA 5ABHA 3OA5A 1M53A 1FH9A 2VRQA 1VFUA 3MSDA 1GVYA 4PMVA 1UKTA 5A6AA 5M03A 1Z32X 3ZJKA 2W61A 3RPMA 4BZYA 5CPQA 3VGHA 5A2AA 1V02E 1FP8A 4KGLA 2WMKA 4HPGA 3W0KA 3AFBA 1YHTA 1ECEA 4H8UA 6CGTA 1H41A 1NP2A 3WKZA 2YL9A 3PZVA 1EGZA 1BG9A 4FLRA 1W9PA 4KH2A 3SCVA 1X6LA 4NSBA 4TX6A 5E09A 1AVAA 3L4ZA 2PWFA 1CLXA 1M7XA 4GIAA 3EMZA 2E4TA 3AISA 5E70A 4WIWA 3GYCA 3I3DA 1HP4A 4AEFA 1V6YA 3LPPA 1RPKA 1V3MA 2CEQA 2PWEA 2PBGA 2WPGA 3DYPA 4F9JA 2ZWYA 2OYMA 3SCNA 4P7QA 3AI0A 2D0GA 3RCNA 1WDRA 4UOQA 4PMRA 1HKKA 5M3WA 2XSBA 4KMQA 2DSUA 3CBWA 2ZXAA 1H3GA 2V3EA 1X6NA 1XD1A 5GNYA 2VT0A 3K1DA 2XGIA 1ZBCA 1ZL1A 4TX8A 4UQDA 1NARA 1TZ7A 1GOWA 2DSVA 3WMSA 4MAZA 3GH5A 1UZ4A 1U30A 2JEQA 3WBEA 4CCCA 3QOMA 1UR0A 1EO5A 2CKSA 1TA3A 4TOQA 4AIOA 5IFPA 1KCKA 4U5IA 2DT0A 4CU7A 1GZJA 1I75A 2ZXQA 2VVSA 5C8BB 1GQKA 4UFKA 1TA3B 1PIGA 5EMYA 1RD6A 4HMEA 3U57A 3WDQA 1E9LA 3FAXA 3SUUA 3BMVA 4JFUA 5EB8A 5FOOA 2VNCA 3VX1A 1GHRA 4E4PA 5BXTA 2DSKA 2XIBA 1W1YA 1HP5A 3CPUA 2BVYA 1MYRA 3BAWA 3K4DA 3W6LA 4B9ZA 1B3XA 1C92A 4M56A 3BXWA 3ARPA 3WL1A 1QI5A 1UD3A 2CKRA 3SCQA 1GOKA 1V08A 3SUTA 1UZ1A 4KGJA 1H11A 2ZICA 4HZ6A 4D6EA 2PI6A 2YDRA 2DPEA 4CU6A 1R7OA 2CYGA 3CLWA 1E4IA 4BA0A 3BCDA 4DWSD 4ATLA 4J27A 4MDPA 4JAWA 2XGBA 5BXPA 4CGTA 1H0IA 3L4TA 2ZX9A 3F5KA 2ZUWA 7A3HA 1MW1A 2CETA 5EBAA 4AZCA 2QF8A 1HJSA 1QNOA 2CBJA 4A3YA 3WIJA 3WSUA 5BYWA 3M07A 4AZCB 4PUDA 3A47A 2CXGA 1E55A 1JYXA 1I1WA 4XV0A 3VKKA 3GXMA 3SCTA 4OJYA 5E0FA 2XUCA 2WVUA 1JNDA 1Q6FA 2WYSA 1W3JA 1NWRA 3VDAA 2QMJA 5A6SA 2E9LA 4XZWA 5IHSA 4MB5A 3QR3A 5BRQA 3WMCA 5HPCA 1KB3A 3NIYA 4TVUA 1JIBA 3AOFA 4D6GA 1U2YA 3VGFA 1HL9A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4B3LA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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