4C7FA

Structure and activity of the gh20 beta-n-acetylhexosaminidase from streptomyces coelicolor a3(2)
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
494
structure length
494
Chain Sequence
AEPTPLDRVIPAPASVEPGGAPYRITRGTHIRVDDSREARRVGDYLADLLRPATGYRLPVTSHGHGGIRLRLAEGPYGDEGYRLDSGREGVTITARKAAGLFHGVQTLRQLLPAAVEKDSAQPGPWLVAGGTIEDTPRYAWRSAMLDVSRHFFSVDEVKRYIDRVALYKYNKLHLHISDDQGWRLAIDSWPRLATYGGSTEVGGGPGGHYTKADYEEIVRYAASRHLEVVPEIDMPGHTNAALASYAELNCDGVAPPLYTGTKVGFSTLCVDKDVTYDFVDDVLGELAALTPGRYLHIGGDEAHSTPQADFVAFMKRVQPIVAKYGKTVVGWHQLAGAEPVEGALVQYWGLDRTSDAEKAQVAAAARNGTGLILSPADRTYLDMKYTKDTPLGLSWAGYVEVRRSYDWDPAAYLPGAPAEAVRGVEAPLWTETLSDPDQLDFMAFPRLPGVAELGWSPASTHDWDTYKVRLAGQAPHWEAMGIDYYRSPQVPWT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure and Activity of the Streptomyces Coelicolor A3(2) Beta-N-Acetylhexosaminidase Provides Further Insight Into Gh20 Family Catalysis and Inhibition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces coelicolor
total genus 187
structure length 494
sequence length 494
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2013-09-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4c7fA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4c7fA01
1WDSA 2J7FA 2CEQA 1BQCA 1QHZA 3TTYA 2WMIB 4AIOA 4R5EA 3WD4A 2VI0A 4AZBA 1VJSA 4D72A 1CPUA 1JGIA 1OGBA 3IJ8A 3T0DA 1TVPA 2J79A 3VGFA 3VIFA 4JIEA 3L4UA 4HA1A 1V3LA 2DSVA 3CBWA 4OBRA 1H5VA 2UY2A 1K6AA 3IK2A 4J28A 7CGTA 1FH9A 4PMDA 4FLOA 2VR4A 4MDPA 2JIEA 1JYXA 3WF3A 1V03A 4YN5A 3TTSA 1KR0A 4MAVA 1K9TA 1WDQA 3WL0A 3WQ4A 4L4OA 1GHRA 1AVAA 1VEMA 1W3JA 3PZTA 1VFOA 2DIJA 3GDBA 1S46A 1BFNA 3TP4A 2G8ZA 3ZMRA 5A6MA 3WF2A 1EDTA 3VIJA 1DHKA 3AROA 4UQBA 1JNEA 4W8BA 1MVYA 4DM1A 4R27A 1WAWA 4E2OA 4F79A 5BXSA 3SURA 1R7AA 2D23A 3FHAA 1UZ1A 5CLWA 1J11A 4ZXOA 2QLYA 1B3XA 1X6NA 3PN8A 5DT7A 1UKOA 1FFQA 2YA2A 3I3DA 2VX7A 3EMQA 1SR0A 2YL5A 1GQLA 1ZL1A 2XVLA 4MNMA 2WMFA 1KQZA 1TUXA 1BVNP 1SFSA 3ARTA 3CUJA 4Z2HA 2GDUA 4D1JA 3VO0A 4MB5A 2X05A 3EYPA 2JFEX 4GPNA 1QW9A 4Z2LA 2JEQA 1JZ2A 4JCLA 1C7TA 1IZKA 3WUEA 1KXVA 1E4NA 2CBVA 3PTKA 4CU7A 2VUYA 3WL1A 2CITA 3BAJA 2GK1A 3CUIA 2DH3A 2QPUA 2J8GA 1V08A 1UD4A 2CIPA 5C70A 1JXKA 1PIGA 3O2LA 1GOIA 2QF8A 2WVUA 3WEOA 2OSYA 5A6BA 3T0AA 2ZIDA 2JEPA 2RGLA 5A2BA 2WHMA 1E71M 1HKKA 4LX4A 4ZXLA 4PMVA 1XSKA 3WDJA 2RGMA 1NOFA 1LL7A 1RD6A 4TVCA 4KWUA 4P8WA 1B0IA 2XVNA 4LQ1A 3EMZA 4KH2A 1FH7A 1JYNA 2J4GA 1UQZA 3THDA 1QI0A 5CPQA 5JUVA 4ZFMA 1GVIA 3VDCA 4A3HA 3WSUA 5D8ZA 5D9OA 3FY1A 1HJWA 4TXEA 4M1RA 3KWXA 2GJRA 4BQ2A 2GSJA 2ZUVA 3PZIA 4HP5A 3AIEA 1CENA 1JG9A 5JBFA 1J0YA 4B9YA 1CECA 1HL8A 5DMYA 2X1IA 5D9PA 3L4TA 1V3HA 1XH2A 3W0KA 2TAAA 2XTKA 5EB8A 1J9YA 2DPEA 2J78A 4QCFA 5CQ1A 3VD9A 1IT0A 3CHDA 4AD2A 3UG3A 1UWRA 3MUY1 4V27A 3ZT5A 1EDQA 6TAAA 5A8OA 1V0NA 1B31A 2O92A 3NDZA 3WDHA 3VM7A 2C8NA 4UFLA 3RMEA 2GJPA 1J0JA 1FFRA 4NF7A 5CGTA 3IJ7A 4DWSB 3K8LA 3B9DA 4PTWA 4IM4A 3UETA 4J3TA 1QNQA 3M7SA 4CD6A 1B3VA 4DWSA 3GNOA 4MAZA 1JYVA 3AIRA 5DT5A 4H7VA 5A6KA 4PMQA 5E0CA 3A4AA 3CLWA 1J0ZA 1Q6GA 4WIWA 2CKSA 5I23A 2BNJA 5I2UA 4HMCA 2JIWA 2EJ1A 4RE4A 3OA5A 5A8NA 1J10A 1KXQA 1UWSA 1NP2A 1SMAA 5CGMA 4GQQA 1C8XA 5E6YA 4LYRA 1B3WA 2YA1A 2DH2A 4WKFA 3ZT7A 2O9RA 4H8HA 4GZEA 5GNXA 2XFRA 4J3SA 3B8SA 2CESA 4P8VA 3W28A 1HF6A 2ESCA 3SCQA 1JAEA 5A8MA 1H1NA 2Y5EA 4A4AA 1NARA 1TCMA 1FP8A 4UQAA 2W62A 4JHZA 1TG7A 4M8UA 2EXOA 2WPGA 3EDJA 4FK9A 2VZVA 3MMDA 2E3ZA 4MJ4A 2CCRA 2EPKX 3OB8A 1V02A 1OSEA 4TVUA 3M6DA 4HZ8A 3B9AA 5M5DA 2WANA 4U33A 4PMUA 3RDKA 3ARQA 3A3HA 1Q6EA 1EA9C 2BVTA 2YLAA 4TX6A 3WUFA 2WYSA 3BLKA 3KL3A 2ZXBA 2YDSA 4W5ZA 5I6SA 1KQYA 1UD6A 2D3NA 4XZBA 1EGZA 1DWJM 5DO8A 1E4MM 1H0IA 2CBJA 2D0HA 1CGTA 2HVMA 4JZ5A 4TUFA 1E5NA 3IAPA 1GORA 2VZTA 1HJVA 2E9MA 1GW1A 3VPLA 2PF0A 1AQHA 2WCGA 5EFDA 2PWFA 3DHUA 3CH9A 3POCA 4EANA 3LPPA 2V5DA 1V6UA 4JFVA 4PCSA 1B90A 2Q8XA 4D6GA 9CGTA 3AZSA 1VBRA 5CXPA 1FA2A 2W63A 1B3ZA 4D6DA 2VNCA 4Z2IA 1D2KA 3PZGA 1BHGA 2XJ7A 3SCPA 2Y2WA 4Z2GA 1K9FA 1WE5A 1XD0A 1E0WA 1WP6A 3WF4A 1BYDA 2D0FA 2BFGA 3RM8A 1C8QA 1DWAM 4ACZA 1B1YA 2GDVA 3AQUA 1H11A 3N04A 2YIHA 1BLIA 1JXJA 3CZLA 4OOZA 1GVYA 4HA3A 4C7DA 3WUGA 1SMDA 4NRRA 1CGUA 1EOMA 2V5CA 3MS8A 1HT6A 3BSGA 3F4VA 3VU2A 1M7XA 1UZ4A 1VAHA 4GO8A 1VRXA 4HA4A 1U2YA 4AY1A 4Z2JA 1A47A 3WUBA 4GKLA 3AXHA 1C90A 3OLGA 1NM9A 1W9PA 3SUTA 2G41A 1LLOA 5M17A 4HZ6A 1CXLA 1TE1A 2EBNA 2VZOA 1UA7A 2VT0A 3LMYA 1BF2A 4B9ZA 1J0IA 2DGAA 4U2ZA 2ZUNA 2CNCA 2XYLA 4Q22A 4UOJA 4TX8A 1H3GA 2J7GA 4DM2A 1CTNA 4WKHA 4AMCA 3OZPA 2PWEA 3CZEA 1I1XA 4MTVA 2J25A 3HU7A 1JAKA 2CPUA 2E40A 5A2CA 3VIIA 3NYDA 2VX5A 3WNMA 2WVSA 4UFJA 4CCDA 2WWCA 1JIBA 3CMJA 1OWQA 1DWGM 3NJ3A 3VX0A 1GOOA 3KL5A 1MFVA 3U5UA 2WHLA 4AISA 1KFWA 2QV4A 4AW7A 2ZX7A 2W5FA 5D9MA 2WWDA 4AZHA 1CGXA 5LA0A 4PSRA 2NT1A 1FHDA 2CBUA 3IAQA 5HBFA 4V28A 3N17A 2EPNA 1GHSA 2J7HA 4D6HA 1Q6DA 5JBEA 1FP9A 1W9UA 5KZ6A 1WPCA 4AZCB 4HZ7A 3QGVA 3NDYA 1V6VA 1PJ9A 2DIEA 1B2YA 1Q6CA 1M01A 1JZ3A 4K68A 4W89A 4ATDA 3VD3A 1C7SA 5A8QA 1VFFA 3TOPA 3VGGA 1V3IA 2ZUSA 3MUAA 1SYTA 4AZCA 2ZXAA 3WIJA 2YDRA 1QI2A 5A6JA 1PPIA 4P7RA 3GH7A 4AZ7A 4W93A 1W1PA 2WLYA 2WMGA 4FLRA 3WQ8A 1GCYA 1J0KA 4HTYA 4MB1A 2E9BA 4U3AA 1PZ2A 3RJXA 1ZBKA 4PMXA 3ZJ8A 4N0RA 5HNNA 5I24A 3CGTA 1E6RA 3PZ9A 1Y7VA 4CVWA 3AMLA 2C0HA 1AQ0A 1MFUA 1BG4A 3DYOA 2PBOA 1CXEA 5DF0A 1C8YA 2O9OA 2V3FA 4PMOA 4YHEA 5FOOA 3VKKA 1N82A 3T2PA 1GQKA 1KGXA 4WLCA 2BXYA 1G9HA 1KBBA 3GXMA 4URIA 4MADA 2PC8A 2VCCA 3WQ6A 4ZEPA 2C7FA 4H8UA 3CZKA 3ARYA 1CWYA 3ZIZA 3AMGA 5A69A 3GH4A 3CHFA 3GXIA 1HP5A 2XVPA 4PMZA 5I3DA 1H49A 5I5RA 1XV8A 2WMIA 4P7LA 2VMFA 3O6AA 1AMYA 2WKGA 5D9NA 5A6BD 2G3NA 4HOZA 1V0LA 2W92A 3EDEA 3MSDA 1QPKA 2IUZA 3CUGA 4A3YA 1V6YA 2OYLA 2VURA 3U57A 3ZM8A 3S2CA 2CHNA 4J27A 4AWEA 1HJQA 3WNPA 1UH2A 3BCDA 5ABHA 4P7NA 1Q4NX 1ISZA 1ZBWA 4U3CA 1BYAA 1UKPA 3N18A 1CGWA 3AS2A 3U7BA 3WELA 3HN3A 4UZUA 1BGAA 1ISWA 1MW1A 2ZXQA 4U31A 4NRSA 4PSPA 3T2OA 4AIEA 3TONA 1E9LA 3L2LA 4KRUA 3CHEA 3AJ7A 2QMKA 4PTVA 1WCGA 1VFUA 2E8YA 2WLZA 5CPSA 2NSXA 2Z1KA 4JL2A 7TAAA 1NWTA 4JKMA 4D6EA 1L8NA 1RP9A 1R7OA 5I78A 3WQWA 1CXFA 1BG9A 4H2CA 1UOKA 4X0NA 1XD1A 4KGLA 1EXPA 1QOXA 2JF6A 5BCAA 1OB0A 3THCA 4CD8A 4W86A 1UH3A 1G1YA 3RPMA 4B3LA 1ECEA 4OZOA 3N12A 4UQCA 1HKJA 1UWQA 3BAYA 2A3HA 1EDGA 5FKYA 3PZMA 3VDAA 3BAXA 5AYBA 4LPCA 3WENA 3GXFA 2W61A 8CGTA 4AZ5A 1X6LA 2J77A 1TZ7A 2WC7A 3FW6A 2OYKA 3ZJ7A 2J7DA 4MNJA 3VOCA 2BS9A 3GH5A 4AZGA 1UKTA 4W8LA 2XVKA 8A3HA 5EBAA 3QOMA 1GJUA 3GZAA 5IXEA 5HDRA 1GOMA 4BQ5A 1UH4A 1KXHA 5C8BB 4WSJA 3AYRA 1W2PA 4J3XA 1G01A 3VD5A 3ECQA 2CKRA 3SCTA 1OT2A 1E6QM 1UD5A 4C7GA 2VO5A 2VQUA 5D8WA 5ABGA 1XYFA 4V2XA 5E0FA 3WDRA 1BGGA 3VIMA 4MB3A 1E1EA 1EH9A 1HJXA 2YOCA 4HMEA 1UWUA 1E1FA 1ODZA 2CBIA 2YDQA 4F8XA 1W32A 3VNYA 4AD0A 1Q6FA 4M80A 2WKLA 3HJEA 1FOBA 1WDRA 4JCMA 1MW2A 3AHYA 2XGBA 3ZR6A 3NUKA 1VEOA 2XUCA 3FNDA 2QHAA 5GNZA 3WNOA 2PWGA 1DTUA 5A6LA 2VOTA 2AMGA 5IHSA 3A4WA 1E6SM 1KGUA 1OIFA 4AIUA 2GVYA 4AZ6A 2XPKA 1VIWA 1UQYA 1G0CA 3N15A 4UOZA 2VC9A 4PYSA 3PZVA 4OJYA 2AAAA 3DYMA 3T09A 2EPLX 1V0MA 1IZJA 4MNLA 3K8KA 3OGVA 3OBAA 4CD7A 3WNLA 1CEOA 4MB4A 2D20A 4YPJA 3LPGA 1V6WA 2ZX6A 1E70M 3K4DA 5CZKA 4J7RA 4AD1A 2EEXA 3ALFA 5A3HA 5M03A 3KZSA 3NSMA 1XHGA 2DDXA 3PZNA 1CGVA 2G3IA 2WMJA 2V38A 1E0XA 3RILA 5HXMA 2ZX9A 1PZ3A 2V3GA 4QFUA 3W81A 3K4AA 1KR1A 4AD4A 1K9DA 1ZU8A 1JDCA 1OGGA 4BZYA 3CMGA 1HKIA 1LG1A 5BRQA 1ZS2A 3W24A 3ARVA 2DT1A 3MV11 4QAWA 1QBBA 4P8UA 4JFTA 4DUXA 2Z1SA 3VTRA 5IFTA 4J3UA 2X09A 2F61A 4UTFA 3UCQA 4PCTA 1WO2A 4U5KA 1QHPA 2VZUA 4D6IA 5EMYA 3CZJA 3G6LA 4W7UA 1PX3A 3DC0A 1J12A 3N13A 4W88A 3TTOA 3F5KA 2J7BA 1E3ZA 3VGEA 1V3JA 2OWCA 2VZSA 1ZJBA 2WBKA 1ZBVA 2VRKA 3WDPP 1OD0A 3W26A 1NP0A 1Z32X 2J47A 1QW8A 1CZ1A 2PWDA 3PHAA 1LWHA 1OCQA 3MUIA 2OYMA 2ZX5A 3MMWA 4XZWA 4RE2A 4E8CA 3WDQA 5A6SA 3WD0A 4E8DA 1L0PA 3A4XA 3DYPA 3QR3A 1CLVA 2J62A 4C7FA 1E73M 5BROA 1E3XA 3L2MA 1HL9A 1B9ZA 4H8VA 4BQ3A 3NCOA 3N11A 1YHTA 3AXXA 2WAGA 1KWGA 4F9JA 1JI1A 4FF5A 1JYWA 4UFMA 3WMCA 1NH6A 4XUYA 3CO4A 1V0KA 3VX1A 1ITCA 1W1YA 3WY1A 3APGA 2VTFA 5CJ5A 5BXPA 1E15A 4BS0A 3WKZA 3WMSA 2WCSA 3CPUA 4W8AA 3PZUA 5CSUA 3BAKA 3OG2A 1GOKA 1KCLA 5E9AA 4UQ9A 2B31A 5D4YA 1MXGA 1FH8A 4J3WA 3CHCA 1HVQA 1XYZA 1C92A 3EDKA 2J8FA 1QI5A 2WC4A 4EE9A 2ZWYA 2WVVB 4GI8A 3WQVA 1TMQA 1C3FA 3NSXA 4UFHA 3VUPA 4J3VA 3F5JA 3RCNA 3F5LA 1WKYA 2PWHA 3ZT6A 1W9VA 5TD4A 3TA9A 4BCEA 2CETA 5E70A 1J0HA 1GQJA 2WVVA 3WN6A 3WD1A 1GOWA 1OM0A 1JZ4A 1JDAA 1CIUA 2ZUUA 3SIMA 1UG6A 4PTMA 4MDOA 4AD3A 4HMDA 2XM2A 3VMPA 1BYCA 4GIAA 3L4XA 2BVDA 1NOUA 2WHKA 2VRJA 2X0YA 4CN4A 3RIKA 2QMJA 1C93A 1GPFA 1TA3B 2OSXA 1JI2A 4U2YA 3J7HA 2VVNA 1UD2A 2UY5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1WDS A;  2J7F A;  2CEQ A;  1BQC A;  1QHZ A;  3TTY A;  2WMI B;  4AIO A;  4R5E A;  3WD4 A;  2VI0 A;  4AZB A;  1VJS A;  4D72 A;  1CPU A;  1JGI A;  1OGB A;  3IJ8 A;  3T0D A;  1TVP A;  2J79 A;  3VGF A;  3VIF A;  4JIE A;  3L4U A;  4HA1 A;  1V3L A;  2DSV A;  3CBW A;  4OBR A;  1H5V A;  2UY2 A;  1K6A A;  3IK2 A;  4J28 A;  7CGT A;  1FH9 A;  4PMD A;  4FLO A;  2VR4 A;  4MDP A;  2JIE A;  1JYX A;  3WF3 A;  1V03 A;  4YN5 A;  3TTS A;  1KR0 A;  4MAV A;  1K9T A;  1WDQ A;  3WL0 A;  3WQ4 A;  4L4O A;  1GHR A;  1AVA A;  1VEM A;  1W3J A;  3PZT A;  1VFO A;  2DIJ A;  3GDB A;  1S46 A;  1BFN A;  3TP4 A;  2G8Z A;  3ZMR A;  5A6M A;  3WF2 A;  1EDT A;  3VIJ A;  1DHK A;  3ARO A;  4UQB A;  1JNE A;  4W8B A;  1MVY A;  4DM1 A;  4R27 A;  1WAW A;  4E2O A;  4F79 A;  5BXS A;  3SUR A;  1R7A A;  2D23 A;  3FHA A;  1UZ1 A;  5CLW A;  1J11 A;  4ZXO A;  2QLY A;  1B3X A;  1X6N A;  3PN8 A;  5DT7 A;  1UKO A;  1FFQ A;  2YA2 A;  3I3D A;  2VX7 A;  3EMQ A;  1SR0 A;  2YL5 A;  1GQL A;  1ZL1 A;  2XVL A;  4MNM A;  2WMF A;  1KQZ A;  1TUX A;  1BVN P; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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 1SFS A;  3ART A;  3CUJ A;  4Z2H A;  2GDU A;  4D1J A;  3VO0 A;  4MB5 A;  2X05 A;  3EYP A;  2JFE X;  4GPN A;  1QW9 A;  4Z2L A;  2JEQ A;  1JZ2 A;  4JCL A;  1C7T A;  1IZK A;  3WUE A;  1KXV A;  1E4N A;  2CBV A;  3PTK A;  4CU7 A;  2VUY A;  3WL1 A;  2CIT A;  3BAJ A;  2GK1 A;  3CUI A;  2DH3 A;  2QPU A;  2J8G A;  1V08 A;  1UD4 A;  2CIP A;  5C70 A;  1JXK A;  1PIG A;  3O2L A;  1GOI A;  2QF8 A;  2WVU A;  3WEO A;  2OSY A;  5A6B A;  3T0A A;  2ZID A;  2JEP A;  2RGL A;  5A2B A;  2WHM A;  1E71 M;  1HKK A;  4LX4 A;  4ZXL A;  4PMV A;  1XSK A;  3WDJ A;  2RGM A;  1NOF A;  1LL7 A;  1RD6 A;  4TVC A;  4KWU A;  4P8W A;  1B0I A;  2XVN A;  4LQ1 A;  3EMZ A;  4KH2 A;  1FH7 A;  1JYN A;  2J4G A;  1UQZ A;  3THD A;  1QI0 A;  5CPQ A;  5JUV A;  4ZFM A;  1GVI A;  3VDC A;  4A3H A;  3WSU A;  5D8Z A;  5D9O A;  3FY1 A;  1HJW A;  4TXE A;  4M1R A;  3KWX A;  2GJR A;  4BQ2 A;  2GSJ A;  2ZUV A;  3PZI A;  4HP5 A;  3AIE A;  1CEN A;  1JG9 A;  5JBF A;  1J0Y A;  4B9Y A;  1CEC A;  1HL8 A;  5DMY A;  2X1I A;  5D9P A;  3L4T A;  1V3H A;  1XH2 A; 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