4C7F | Genus

Total Genus 187

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	187
sequence length	494
structure length	494
Chain Sequence	AEPTPLDRVIPAPASVEPGGAPYRITRGTHIRVDDSREARRVGDYLADLLRPATGYRLPVTSHGHGGIRLRLAEGPYGDEGYRLDSGREGVTITARKAAGLFHGVQTLRQLLPAAVEKDSAQPGPWLVAGGTIEDTPRYAWRSAMLDVSRHFFSVDEVKRYIDRVALYKYNKLHLHISDDQGWRLAIDSWPRLATYGGSTEVGGGPGGHYTKADYEEIVRYAASRHLEVVPEIDMPGHTNAALASYAELNCDGVAPPLYTGTKVGFSTLCVDKDVTYDFVDDVLGELAALTPGRYLHIGGDEAHSTPQADFVAFMKRVQPIVAKYGKTVVGWHQLAGAEPVEGALVQYWGLDRTSDAEKAQVAAAARNGTGLILSPADRTYLDMKYTKDTPLGLSWAGYVEVRRSYDWDPAAYLPGAPAEAVRGVEAPLWTETLSDPDQLDFMAFPRLPGVAELGWSPASTHDWDTYKVRLAGQAPHWEAMGIDYYRSPQVPWT

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Structure and Activity of the Streptomyces Coelicolor A3(2) Beta-N-Acetylhexosaminidase Provides Further Insight Into Gh20 Family Catalysis and Inhibition. pubmed doi rcsb
molecule keywords	BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
molecule tags	Hydrolase
source organism	Streptomyces coelicolor
total genus	187
structure length	494
sequence length	494
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date	2013-09-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00728	Glyco_hydro_20	Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A	PF02838	Glyco_hydro_20b	Glycosyl hydrolase family 20, domain 2

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4c7fA02
3.30.379.10	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Chitobiase; domain 2	Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like	4c7fA01

4DUXA 1JZ4A 1X1NA 3WD1A 1JL8A 3WQVA 5EFFA 1FH7A 4AW7A 1HVQA 1XHGA 4WK9A 4BCEA 3WDRA 3L2MA 3N1AA 5CJ5A 3WMBA 3GNRA 4HZ6A 4OJYA 3U5UA 1AMYA 2NT1A 1WDQA 4GQRA 3TONA 4FF5A 1UR1A 3HMCA 4PSRA 2OSYA 2WC3A 3OGSA 4TOQA 4AZ6A 1BPLB 4X9YA 4IUGA 4AZCB 4AIUA 3CHDA 4D71A 1E6RA 3VGDA 3CMJA 5A8PA 5IFPA 1JF6A 2YA0A 4ZFMA 1JDDA 4HA3A 4UOJA 4F66A 2D0GA 3WEOA 3SCWA 1FHDA 2VVNA 2E9BA 4HU8A 2D3LA 1BYCA 1BYBA 3K1DA 4HOXA 5A6KA 4OUEA 4D6FA 1XV8A 4W7UA 1HJVA 3ZMRA 1KXHA 2UY5A 1H2JA 4W85A 5IDIA 2QMJA 1UHVA 2FGLA 4OOUA 3WDPP 1C3FA 4AXNA 1N82A 1GONA 5A3HA 3BMVA 1E9LA 1NWSA 1V3JA 1UD4A 1WB0A 4EANA 4CCEA 2GUYA 1X6LA 1C7SA 4YN5A 1GQIA 5KEZA 1HIZA 3ALFA 2VO5A 1UR9A 2JF6A 1QOXA 2PBGA 5JUVA 1V6YA 3ARQA 1XD0A 1W3KA 2Y5EA 2VRJA 1UR2A 1HNYA 1WDSA 3CHCA 3GNPA 1U33A 2JEQA 8CGTA 3VGEA 5ABFB 2CYGA 5BYWA 1V0MA 1UWUA 2D0FA 3AZSA 2X05A 3ZR5A 4EKJA 5E9AA 1QHZA 4PBGA 1HKJA 1J01A 3VUPA 1UD6A 2VR4A 1SR0A 3WNOA 3WQ6A 2J7HA 1NWUA 1NWRA 5HXMA 1QI2A 3T0DA 3PZQA 1SFSA 4HPGA 1GCYA 1M53A 2E9LA 1JZ3A 4D6DA 3VDBA 3ZJ8A 4PCSA 3AIUA 5AYIA 4TX6A 2VJXA 4GO9A 1U2YA 4CD7A 1GPFA 1MQQA 1JXJA 3WF3A 4KWUA 5CPTA 1ZB5A 3ZQ9A 1BGGA 5HBFA 3OGRA 2Y8KA 1E73M 3W38A 4HA1A 4UNIA 3VIPA 2GDVA 1ODUA 1PEZA 2XTKA 1W3HA 3WMSA 3CZLA 4P7OA 3VKKA 5I24A 5CSUA 6A3HA 3I3DA 4NRSA 2ZUWA 1CEOA 1MQRA 3GTNA 4XUYA 1WNOA 1KGXA 2YA1A 3W6MA 3AZRA 2DSWA 3T09A 1WZKA 2CBVA 4AZGA 5IXEA 2O9PA 3VOCA 4ZE4A 2XJ7A 1WE5A 4IM4A 4P7LA 1W3LA 1E43A 3TTSA 3L2LA 2WPGA 3IJ8A 2FHFA 3THCA 4AZ7A 2IXVA 1HKIA 1G9HA 4GZEA 5M5DA 1E6SM 2EPKX 2F61A 1GUVA 4GPNA 3MV01 1UQYA 5DO8A 3ZT7A 3OZPA 4E8DA 3VIHA 2Y4SA 4W87A 3AIEA 4E2OA 1WDRA 3ALGA 2X8RA 4CN6A 4QAWA 4UOZA 1K9DA 3MSDA 4B3LA 1HP5A 1LWHA 5CG0A 3VD5A 5BXTA 4A3YA 4UQ9A 5E0FA 1XH0A 5DT7A 1ZL1A 1C92A 1EDQA 2J75A 4PTWA 3U57A 1EGZA 4OBRA 5I0DA 2ZIDA 1W9DM 1OT1A 5CQ1A 1W32A 3VIOA 1Y7VA 1JYNA 1DWHM 1V0NA 2ESCA 2RGMA 3VM7A 3DHUA 4HMDA 3WIJA 4E4PA 2WMJA 3HN3A 3AROA 2PWGA 3UETA 4CUCA 2J7EA 4BQ2A 1TUXA 3MUAA 1OCQA 4Z2KA 3PTMA 4XB3A 3BAKA 4XZBA 4AZBA 4Z2GA 1GOMA 3W82A 4LX4A 3B9DA 3CH9A 4AZIA 3ARVA 4U31A 1C7TA 2OSWA 3W81A 3T2OA 3FXYA 4P8XA 2W62A 3MMWA 1ODZA 4QLLA 1DWIM 1W1TA 4TX8A 3F5LA 2J62A 3UERA 3ZJ6A 1IV8A 4H8UA 3WH6A 4JKMA 3CMGA 1E4LA 1QBAA 2XG9A 1BVNP 1IZKA 3EYPA 4ACZB 4RL3A 2XM2A 3OA5A 3BAWA 1OT2A 2VQTA 4LQ1A 1CWYA 2GJXA 1I1WA 1AQHA 1GW1A 5CXPA 2PBOA 3AHTA 3VGHA 3OLIA 4QDMA 1E4MM 1P6WA 2ZE0A 2V3FA 4MB4A 4UQBA 4JCLA 3AISA 4ZENA 5I3DA 3U7BA 2YA2A 4F8XA 3VVGA 5E0CA 4M82A 1GVIA 4QCFA 1UD8A 5M03A 1VJSA 5C70A 2PWEA 3SUTA 5E6YA 4D6CA 1BYDA 1B1YA 2PWFA 2GJRA 3ARTA 4M81A 1K6AA 3ZJKA 3GM8A 1WDPA 2XVLA 4MAVA 2XVGA 1LG2A 1GHRA 4CVUA 2UWFA 4GI6A 1H09A 4MDOA 3W0KA 4LXFA 1CGUA 1PZ3A 4U3CA 4TVUA 1EA9C 3AICA 4GKLA 3MANA 5FOOA 2JF7A 2DT0A 4FLQA 2VX4A 3ARWA 3L4YA 4J3TA 1GJWA 1KCLA 5CZKA 1TCMA 1KWGA 2GK1B 2WVTA 1R7AA 3AMLA 3HU7A 3CUIA 2NSXA 4F9DA 2OYMA 1GQKA 3N9KA 2VRKA 4B9ZA 1R85A 4V27A 1PIFA 1CZ1A 2CHNA 2YOCA 4HP5A 4KH2A 1CBGA 2DGAA 2DIEA 1B31A 1VB9A 5BXPA 1B30A 1CGTA 3WL1A 1JFXA 2J7GA 3UEQA 3NSNA 4UZSA 5I5RA 2WCGA 4M1RA 3MKKA 2YLLA 3T0BA 5DEZA 2XFFA 3AYSA 3MO4A 2ZX8A 1KBKA 1RP8A 3CZJA 1QI4A 2A3BA 4LYPA 4J3SA 3UR7A 4JIEA 2XSAA 4AZHA 5JBDA 3W24A 2W4XA 1XH2A 2WMFA 3ARPA 4EAMA 5FCZA 4MTVA 3WH8A 4GIAA 4W7WA 4W86A 1GOWA 2VL4A 1B3VA 3RO8A 3ZSTA 4J27A 5D4YA 2FGZA 2WANA 4FK9A 3RM8A 1JD7A 1EIBA 3VX0A 1FP8A 3W27A 4CN1A 4HU0A 1CXKA 2WC4A 1OSEA 2UY3A 1PIGA 3TA9A 1WAWA 2VZUA 1DEDA 3AIVA 3CZ8A 1XC6A 1OGGA 1BLIA 4J3WA 5CGMA 3CPUA 4PTVA 2V5CA 3GXFA 1SMDA 3GBEA 2O9RA 2CHOA 1FOBA 1QNSA 1S46A 4TVDA 1XSIA 3ARSA 4W88A 3VD4A 3UR8A 3GDBA 1HJXA 2CERA 4QLKA 1DWGM 1CXLA 2VR5A 3G6LA 2DT3A 1JZ2A 1B3XA 3SCNA 4CCCA 4P7QA 1EQCA 1RP9A 3IK2A 2VQUA 3NDZA 1MYRA 4B15A 4D6EA 3N12A 3BLPX 1DWAM 2B31A 2ZUSA 1CXEA 2A3CA 1VENA 1B3WA 3W25A 1E6NA 4MPKA 4W5UA 4PTXA 2ZOXA 2EPNA 2BY1A 1TZ7A 3SUSA 2J77A 3EMCA 5JIWA 5EFDA 2E3ZA 3AFBA 1M7XA 5A95A 4UQCA 2OWWA 1QNPA 2XVKA 3GXMA 3L4VA 2J79A 3N17A 1UQZA 5ABEA 5BRQA 2YBUA 4J3VA 2PWHA 4LGXA 5A6LA 3A6OA 4YHEA 3KL3A 4Q22A 3ARYA 1BYAA 4M8UA 4AD4A 3SEPA 3AMDA 3MU7A 3CZEA 3WF0A 2CNCA 1ZU8A 4DUWA 1OIMA 1W2PA 4KMQA 1KGUA 3WUBA 4AMCA 2VURA 3AYRA 2Q8XA 1H0GA 1Z32X 4AD0A 1C8XA 2O9TA 1HJSA 3EDFA 4UFMA 5E70A 3SURA 1RPKA 4UFLA 1UD2A 1V6VA 4D1IA 1V0LA 1CENA 3VD9A 4PMQA 2CETA 4WIWA 3U7VA 1KXVA 4JL2A 3F4VA 2YDRA 1VEPA 1YHTA 3AXXA 4KGJA 2DH3A 3OIHA 1V6XA 4BZYA 5D8WA 1J0JA 3EMZA 3PHAA 1ZS2A 1CGWA 2ZXAA 2XSBA 3PBGA 5ECUA 5A8MA 1JAEA 1G94A 5CPQA 1UZ4A 1RH9A 2W61A 3N13A 3EMQA 3PZ9A 4KGLA 2D0HA 3WENA 4AZCA 1UH2A 3HJEA 1ZBWA 1IZJA 3AMKA 5HNNA 2WMIA 1VF8A 3N04A 2WZIA 3ZT5A 2X09A 4PMUA 3GZAA 4HPHA 3PZGA 3BC9A 1E55A 3WFLA 2UY2A 1BSIA 2Y24A 4GI9A 1B9ZA 1GQLA 3ZJ7A 4TTUA 2GVYA 3J7HA 4ATDA 1JG9A 2OYKA 1H49A 1H4PA 1MFUA 1FH9A 2ZXQA 3A3HA 1FP9A 3II1A 1DTUA 2EPLX 5A2BA 1EO5A 2UY4A 1W9XA 4CU6A 3A4XA 2YLAA 4MNKA 1VRXA 3VDHA 3MUY1 1NARA 3NSMA 1EOKA 1LJYA 4U33A 2XFYA 3CGTA 3K4DA 2PWDA 1Q4NX 2WHKA 1XSKA 1E6QM 2EQDA 4ZEPA 1MQPA 3OBAA 1J12A 1EDGA 3VM5A 2ZUVA 4JFWA 2CIPA 4GI8A 3ARZA 2D22A 3G6MA 1VEOA 1J0IA 4R5EA 2ZXDA 3VMNA 5ABFA 3MV11 4RE2A 5DMYA 3O2LA 1Q6EA 3IJ7A 2C0HA 4GZJA 5A1AA 4UTFA 3PZMA 3A4WA 2EJ1A 1QHPA 1BGAA 5JBEA 4JHOA 1F4AA 4JAWA 3WDJA 3AHXA 2GSJA 3RM4A 2A3AA 2F8QA 2O9OA 3BSHA 3A47A 5BROA 4W8BA 1XSJA 4IPLA 3VU2A 3THDA 1JIBA 1EQPA 4J7RA 1V3LA 1UKQA 6CGTA 3LPFA 3M6DA 2Y2WA 1YQ2A 5A8NA 1C8YA 3RM9A 3PN8A 1EOMA 5A8OA 2Z1KA 2OLHA 4CKQA 1W9BM 2VZSA 3AHVA 2ZUUA 2WMKA 1LG1A 3DHPA 1MWOA 4B3KA 3OLEA 4J3UA 4H7VA 1ISXA 2WSPA 2W66A 3APGA 3M7SA 1TA3B 1MVYA 1HN1A 3AXIA 4W7VA 4WKFA 3UG5A 4CU8A 5JBFA 1O7AA 3WNMA 1L8NA 4E8CA 1E1EA 1OGBA 1LF1A 4LPCA 2DDXA 1G01A 3IJ9A 4TUFA 3ZO9A 1V02E 2E40A 4ATLA 1QNOA 2X2YA 3L4XA 1MFVA 3UCQA 3WQ8A 1JZ7A 3POHA 3ZSSA 3ARRA 3NIYA 2E8YA 4Z2JA 1ESWA 1JI1A 2G3MA 2ZICA 4H8HA 1JYXA 4BQ5A 9CGTA 1WO2A 1HJWA 4UZUA 4UOQA 1CDGA 3PZIA 2WZHA 5A8QA 4WF7A 1GQJA 5FIPA 1R86A 2BY3A 3RJYA 3VGBA 1KXQA 3VILA 1B3YA 4Y7EA 3E1F1 1NOWA 2WNWA 3WN6A 4UQEA 4B16A 1H5VA 1NOFA 3DC0A 3VIMA 2YL9A 2XVPA 1CNVA 2VNCA 4MNLA 2FHBA 2JALA 1TVNA 2DPEA 1UR4A 4D6HA 1KWKA 1E0WA 1MW1A 3DYOA 3AS1A 2VOTA 1J0YA 1FHLA 5A69A 5ABHA 4CGTA 4JFVA 1LWJA 2DSZA 1HVXA 1X6NA 1UKTA 3BAYA 2G3IA 1GOIA 1CGYA 4JKLA 4W93A 4MJ2A 1CLXA 2BS9A 3S6TA 1GORA 4UQDA 3QHMA 2EXOA 2XPKA 4C7DA 3B9EA 4HMEA 4EK7A 3CUHA 3WQ5A 2WVVA 2YKKA 4PMNA 5AY7A 3VGFA 3FAXA 4FLOA 4U5IA 5EMYA 3VTRA 3WNPA 3TP4A 2YL5A 4GINA 3BCDA 2OWCA 4NSBA 1NQ6A 2XGBA 3GXDA 3AHYA 3GXIA 1E0XA 4CD5A 1A47A 5HOSA 2WYSA 3BMWA 3NSXA 2J7FA 2V3DA 3RPMA 4WKAA 4F79A 1KR1A 1DP0A 2CESA 2ZX5A 2W92A 1UWSA 5E09A 1J0ZA 2CBUA 5BCAA 3AHZA 2EPMX 3QGVA 1AQ0A 2DIJA 2GDUA 3SCVA 1BTCA 1BF2A 2WVSA 3ZM8A 1UA7A 1A3HA 3VMPA 2BV9A 3WY1A 1UH3A 2CPUA 1HF6A 3RMEA 5DFAA 3WH7A 1HX0A 1UOKA 1GOQA 3DECA 4PEEA 4TXEA 4DWSA 4AZ5A 1FFQA 1XH1A 2J8GA 5CLTA 1JF5A 1I75A 1EXPA 3S2CA 3VD3A 1CXIA 1E4IA 4JCMA 3PZOA 3VIJA 1G1YA 2DQXA 4NF7A 3I3BA 4KRUA 3WD2A 5DT5A 2WW5A 3WMCA 1JDCA 4FMVA 1W2VA 4JFUA 1V6WA 3D3AA 2HISA 1DWJM 1R7OA 4H8VA 4OZOA 3L4WA 4URIA 2ZWYA 2WHJA 1QVBA 1KFWA 2WZEA 3QOKA 1GOOA 1RD6A 4JFSA 3MMUA 1HKMA 1PBGA 5BXSA 3O9NA 2WBGA 3TTOA 1PX3A 1XYFA 3BLKA 4AEFA 2VRQA 5D9PA 4P7NA 2GJPA 2WXDM 4UR9A 3BAJA 4NI3A 4MNMA 2J78A 3WUFA 3WKZA 1E0VA 1CPUA 1GVYA 3EDDA 1B0IA 1HJUA 4NRRA 5FL1A 2QPSA 2VX7A 2DSUA 3WD0A 4QFUA 4FLSA 2CKSA 5A94A 2GK1A 4PMRA 1Q6CA 2XWDA 4R27A 1F4HA 4Z2LA 3MSGA 5GNXA 1V02A 1XGZA 1WCGA 3WELA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4UFI A;  3WSU A;  4CU7 A;  1V08 A;  3B8S A;  2VX5 A;  3BAX A;  1US2 A;  2BFG A;  1JYW A;  2VZT A;  2BHU A;  4AD3 A;  1G0C A;  2WVU A;  3GH5 A;  3PTK A;  1K9F A;  1J18 A;  3GH4 A;  4HOZ A;  3OGV A;  5BRP A;  3W53 A;  1E40 A;  2V38 A;  4PMY A;  2JFE X;  2AAA A;  3CLW A;  2BY2 A;  1KCK A;  2XM1 A;  2O92 A;  1D3C A;  1CYG A;  2XWE A;  3VIF A;  2NW0 A;  1FFR A;  4HZ7 A;  1TFV A;  1JNE A;  1CXF A;  3K4A A;  2DSV A;  1LLO A;  3SCR A;  4S3K A;  5I6S A;  4EE9 A;  4UCF A;  2BHZ A;  4YPJ A;  1GHS A;  4KRT A;  1C91 A;  5A6J A;  1XD1 A;  1EDT A;  1UD5 A;  4WSK A;  3FHQ A;  4AIS A;  1XCW A;  5M3W A;  4V2X A;  1PAM A;  2CCR A;  2XUC A;  1MXD A;  2CKR A;  2CBJ A;  2QHA A;  2PF0 A;  2XGI A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5DXY A;  1RQE A;  4K8G A;  1QI2 A;  4KRZ A;  4IMA A;  1GCY A;  1XQK A;  5AYI A;  4TX6 A;  1W1A 1;  5IOB A;  3PJT A;  3RMJ A;  3W07 A;  4OVX A;  2Q6Z A;  3L5M A;  1TIM A;  1BTM A;  1TVL A;  4KWU A;  1I45 A;  1IWA A;  4L1X A;  2Y8K A;  2OT0 A;  5CJM A;  3NQ7 A;  1XLB A;  3W38 A;  1XLJ A;  3ICJ A;  4JEQ A;  2H8Z A;  1ODU A;  1TTQ A;  3WMS A;  3DU0 A;  4P7O A;  3VKK A;  6A3H A;  3WX7 A;  1FDZ A;  4C6L A;  4NXK A;  4I5X A;  3WLP A;  2DZS A;  2PLC A;  3GTN A;  3USB A;  3MWA A;  3RO6 A;  5AYX A;  2YDA A;  3AZR A;  2DSW A;  4AZG A;  2XZ7 A;  2QCN A;  3VOC A;  4ZE4 A;  2XJ7 A;  4F0L A;  3CV7 A;  4BFA A;  4AZ7 A;  3W7Q A;  1E6S M;  2FJU B;  4I9J A;  3QTP A;  1DV7 A;  5HJX A;  2IW0 A;  2FTY A;  5CZS A;  3OZP A;  4BR1 A;  4LC6 A;  4GYK A;  4IJR A;  3GWQ A;  4ZO9 A;  1WXJ A;  3E2V A;  2HSA A;  1LM1 A;  3P61 A;  3QRH A;  1GG0 A;  1PCW A;  5CAK A;  2X8R A;  4ADU A;  1RV8 A;  3PPC A;  1ITQ A;  3R7M A;  2DVT A;  4QAW A;  1ZAH A;  4IID A;  1OCN A;  1Q6O A;  3CNY A;  1YLV A;  4BEU A;  4NL1 A;  1R5Y A;  1KRA C; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4C7FA

Total Genus

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Chain Sequence

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