4CD4A

The structure of gh26 beta-mannanase cjman26c from cellvibrio japonicus in complex with manifg
Total Genus 145
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
145
sequence length
367
structure length
367
Chain Sequence
LPALIDTQATAETRALYRNLAKLRYKHLLFGHEDSLAYGVHWEGDMDRSDVRDVTGANPAVYGWELGGLELGHTANLDAVNFEKMQHWIKAGYSRGGVITISWHVFNPVSGGNSWDKTPAVHELIPGGARHATLKAYLDTFVAFNEGLADVDAQGNKHYPPIIFRPWHEHNGDWFWWGKGHASEQDYIALWRFTVHYLRDEKKLRNLIYAYSPDRSRIDMANFEAGYLYGYPGDAYVDIIGLDNYWDVGHEANTASADEQKAALTASLKQLVQIARSKGKIAALTETGNNRLTIDNFWTERLLGPISADADASEIAYVMVWRNANLAREKSEQFFAPFPGQATADDFKRFYQSEVVLFEDELPPLYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Combined Inhibitor Free-Energy Landscape and Structural Analysis Reports on the Mannosidase Conformational Coordinate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-BETA MANNANASE, PUTATIVE, MAN26C
molecule tags Hydrolase
source organism Cellvibrio japonicus
total genus 145
structure length 367
sequence length 367
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2013-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02156 Glyco_hydro_26 Glycosyl hydrolase family 26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4cd4A00
2O9TA 3WELA 1OSEA 3BAKA 4KMQA 3LPOA 1E6QM 1ZU8A 2DSUA 2YA0A 1KGUA 2OWWA 4NF7A 2VZTA 1UKTA 1L0PA 3APGA 1ISWA 3MMWA 1JG9A 2PBOA 4W5ZA 4GINA 1CXEA 2ZUWA 2VR4A 1P6WA 2W91A 4BQ4A 5GQBA 1J0IA 4H7VA 3GM8A 3PZMA 3WDPP 1CGUA 2X09A 2X1IA 1BTCA 3AFBA 5BXTA 5I24A 4W7WA 4CU7A 1QBBA 1W9BM 3WL0A 4J3VA 4UQEA 1G5AA 1PIFA 1CLVA 1VENA 3WKZA 1U33A 3SUTA 4JCLA 4UOJA 4HA4A 3GZAA 1UD6A 3VGGA 3AIVA 3RJXA 2G4FA 1E56A 1EIBA 2ZUNA 2ZXQA 5D9MA 2XFFA 2EO7A 1KCKA 2ZXAA 2J8GA 1XH1A 4P7OA 3PZUA 1BF2A 1OGBA 5E6YA 5E0CA 4LYRA 3AHYA 4AD3A 2VX6A 2CBUA 1JIBA 2D3NA 4HOWA 3MUAA 5EBAA 2E9LA 1GPFA 2VCAA 4UFKA 4AIUA 1MFVA 4GQQA 4Z2HA 4MB3A 1QVBA 1YHTA 3F5KA 3BCDA 3NUKA 3CPUA 1ODUA 3K8LA 1DWAM 1GVYA 4XV0A 2J8FA 4JZ5A 1UWUA 4B3LA 3RILA 2DGAA 3VNYA 5BXPA 3RPMA 3GXFA 5ABEA 1EGZA 3HN3A 4V28A 1HL9A 2VT0A 3NJ3A 4DM1A 5I2UA 5A6KA 3WF3A 4BA0A 1BHGA 2OSXA 2YLAA 4UQBA 1RH9A 3WNPA 1QNOA 3WUBA 1GOKA 4QP0A 4JL1A 1C8YA 1KR0A 3MKKA 3ZSSA 1EOKA 2FHCA 1OINA 3CHFA 4CCDA 1EDGA 3A47A 2XVLA 2D22A 1GW1A 1OCQA 1AMYA 1OIFA 5D8WA 4OZOA 4ZFMA 1UWQA 4AEFA 1KFWA 2J7FA 3A4XA 3BMWA 3WENA 3SCUA 3ZSTA 4BQ3A 1ECEA 4OBSA 1JZ2A 2CHOA 3EDFA 2YBTA 3W4RA 4E2OA 1UD2A 2YDSA 2WMJA 2YKKA 1PIGA 1M01A 3L4UA 3WFLA 3TTOA 4U3CA 3VDCA 2WNWA 3W82A 1E0VA 1H5VA 1LWHA 2JF7A 4PBGA 3J7HA 5A6LA 3A4AA 3VGEA 3NCOA 4DWSD 1VBRA 4WKFA 1CGTA 1UKQA 4MJ4A 2W4XA 1NP0A 1V3IA 2DT1A 1CXIA 1JI1A 2VRJA 3QGVA 2VX5A 2GK1A 4UZUA 4E8DA 1WDQA 3M46A 1FP9A 1EDTA 3AI0A 2WVVB 4HP5A 1E4IA 4U2YA 1FOBA 1E0WA 1EDQA 1W3JA 1UZ4A 1ESWA 1UR8A 1XD0A 3DYMA 2EXOA 4GO9A 2ZX9A 5CSUA 3N15A 2AOSA 1JD7A 3CIVA 1MXDA 3VIKA 5BYWA 5A3HA 2VX4A 4JL2A 5E0FA 4NI3A 4TXEA 2XG9A 3GTNA 3CHCA 1FH7A 2GK1B 2GSJA 1JXJA 4B15A 4AD0A 4R5EA 1NWUA 1E72M 5DMYA 4B9YA 3UEQA 1Q6GA 3ARTA 2G3JA 3SIMA 2GDVA 3OA5A 2WVUA 4GZIA 4W86A 1L8NA 2HISA 3AHZA 2DDXA 1WB0A 4QLLA 1M04A 5BRPA 4P8XA 1V3LA 1H09A 1KGWA 3SUUA 3VMNA 3PZQA 3GH4A 1G01A 2B31A 3ARRA 1PX8A 1FH8A 4PMZA 3S2CA 2GJRA 3PZ9A 3VIIA 1W1PA 1W9XA 3L4TA 4CU6A 4N42A 1QHOA 1TVNA 2E3ZA 5ECUA 1M03A 4KGLA 2O9PA 3HJEA 1HJVA 3OG2A 2WCAA 1BAGA 1KCLA 1JAEA 1G9HA 2WWCA 4AWEA 4L4OA 4JKKA 3ZJ6A 2J79A 3VD4A 5CQ1A 1JNEA 3I3EA 2FH8A 3NYDA 1F4AA 3MU7A 1DTUA 4H04A 3WQWA 3FHQA 1WKYA 4HPHA 2PWHA 2WC3A 2WSKA 4FLRA 4P7NA 1HKIA 3QOKA 1AVAA 2D2OA 1W3KA 5BRQA 4A4AA 2VZUA 3PN8A 5E09A 2Y2WA 2VURA 1V6UA 1V6VA 1UKOA 3N17A 3GNRA 3T0DA 3GNPA 3SEPA 4ZE4A 2D20A 1UR4A 3VDHA 4NZCA 1HJSA 2Q8XA 5CSYA 4KH2A 4AY1A 1JZ4A 2D0GA 3QHOA 4RL3A 4HA1A 2YL9A 2CBIA 1CPUA 4U33A 4E4PA 3SCSA 4AXNA 5ABGA 1ZL1A 4J27A 5I6SA 1XV8A 4FLSA 2YA2A 3SCVA 3PZGA 4CD6A 4HU0A 1ZBKA 5A8OA 4AISA 1VJSA 1CECA 2A3HA 2PWGA 1GQIA 3MV11 3SUVA 4K68A 2DH3A 3ZMRA 2DQXA 3CUGA 2J7GA 1HKKA 1CXLA 1PBGA 3AS1A 1J9YA 4GO8A 4QLKA 5IFTA 4JHZA 4TX6A 1EHAA 4JAWA 4PTWA 4UR9A 3ZIZA 4H2CA 2BV9A 3CUFA 3VGHA 3KWXA 3B8SA 3IJ8A 3K4AA 2E9BA 1LF1A 1H2JA 1X6LA 1WO2A 4YPJA 2NW0A 3AXIA 3WIJA 5HPOA 3AS3A 2WMKA 4D6JA 2VCBA 2YOCA 5A6JA 4M8UA 2IUZA 4PTVA 2EQDA 1UR9A 5CPQA 3WNKA 3FNDA 2OSWA 5AC5A 4KGJA 5I79A 4X9YA 4AZGA 3WQ5A 2EBNA 4UFJA 3MSGA 3IJ9A 1MW2A 4AD2A 1TMQA 2EJ1A 1HVXA 4WLCA 2QPUA 4ZE5A 5A69A 3AISA 3PZOA 2WBKA 2DIJA 5D4YA 5CGTA 2F2HA 3WY1A 1VRXA 2CXGA 1QOXA 3WF4A 2WW5A 3ZO9A 2V5DA 3L4YA 2CHNA 4P7QA 1PJ9A 1R8LA 4BF7A 3UESA 2J78A 1X6NA 2YL5A 2OWCA 1JI2A 5DT7A 1EA9C 1RP9A 1GORA 4P8WA 4PUEA 4W5UA 1BYAA 1M7XA 3WBAA 3WF2A 4JKLA 3ZR6A 3ARZA 3BAWA 1WAWA 2PI6A 5I23A 2PWDA 5CLWA 5BWFA 5CPTA 2A3BA 1EO5A 3M7SA 2WMHA 2CKRA 1W9UA 4MNKA 2Z1KA 1BPLB 2UY3A 3WF1A 2G8ZA 2X2YA 1NOFA 1JF6A 4S3KA 1XSIA 2WCGA 4W7VA 5JBEA 1MXGA 1SMDA 1EOMA 1TFVA 4BCEA 3OZOA 3ZT6A 3EDEA 1LL4A 1UOKA 1QW9A 3NSXA 1MWOA 3W38A 2XSAA 1IZJA 3UETA 2OYLA 1TA3B 1H11A 3FY1A 5E6ZA 1J0JA 1CYGA 1E6ZA 2EPKX 1JGIA 3BSHA 1B1YA 2G41A 1C7TA 4Q22A 3GYCA 3KEHA 3VILA 2X0YA 3ARUA 1OBAA 3T0AA 3W25A 4PTMA 3MO4A 4HZ6A 4TX8A 1OGGA 3AIEA 1XD1A 1J0ZA 4L4PA 3BXWA 2XFYA 3AYRA 5BCAA 4W8AA 5GNYA 2J47A 3ARYA 2BY2A 1S46A 2ZE0A 4PSRA 3NIYA 2D0FA 3RDKA 3AZTA 4PYSA 4Q7NA 2XIBA 2J4GA 2DT0A 1Q6DA 5A2AA 3VD5A 1HJWA 3O2LA 4UFLA 3VM5A 4UQ9A 3PBGA 9CGTA 1DEDA 3VUPA 3POCA 2VTFA 2JEQA 3F5JA 3BH4A 1W9VA 2XVGA 1RD6A 2VCCA 1GNXA 1HXJA 2Y24A 4MADA 1H0IA 2ZOXA 3BC9A 1UA7A 3ZR5A 7TAAA 3CMJA 4PRWA 4ZENA 1BGAA 4RE4A 3CZGA 2W66A 5BROA 4TVCA 3VDBA 3CUJA 5GNZA 1W32A 2BNJA 5FOOA 1KXVA 1SR0A 1FA2A 2XFRA 1J0YA 1QI5A 3L4XA 4KRTA 3VIOA 1UQZA 1FP8A 3VIJA 5A8NA 3IAPA 4HMEA 4P7RA 1E0XA 1NOUA 1W2PA 2D1ZA 4QDMA 2XUCA 1UD4A 2UY2A 2V3GA 4TTGA 3WDIA 2WC4A 5BXRA 3WQ8A 1GUVA 5I78A 1CWYA 4XZWA 6A3HA 2O9RA 3CHDA 1V3KA 2ZUTA 2BY1A 1E5NA 2VL4A 2WMIA 3W26A 3UG3A 3E1F1 2WHJA 2XVKA 3AIRA 1K9FA 4D6EA 1JXKA 4AD5A 5E9AA 3OIHA 3WMBA 4MAZA 2FHBA 2W5FA 3CO4A 4W84A 4TTUA 2XWEA 4C7DA 1WPCA 4R27A 1B3XA 2X05A 3K46A 5M5DA 1MW1A 6TAAA 4F8XA 4JFSA 2D24A 1TR1A 3DECA 4S3JA 5HXMA 2CNCA 3ZJ8A 3OB8A 3BMVA 3N04A 3AIQA 3O6AA 2GJPA 2WMIB 2YL6A 1CIUA 1WDPA 1CLXA 1K9EA 2VO5A 3SUWA 4HOXA 1BYDA 1E5JA 1HKMA 1KB3A 2CERA 3CZEA 2J74A 3I3DA 2CYGA 2NSXA 4H41A 4PMXA 3L4WA 3VKKA 3WQVA 2G3MA 3T2PA 4ZXLA 3ZJKA 5LA0A 3N1AA 2VMFA 4UOZA 4BS0A 5LYRA 5GPRA 3LPGA 2EPNA 5CGMA 3WBEA 1FH9A 4TVUA 2WKGA 3WDJA 5ABFB 3MUIA 4PMQA 3BAXA 2WVVA 1JDDA 4JFWA 2JF6A 1E4NA 1Q6EA 1ZBCA 1E73M 3II1A 1HX0A 4UQAA 4PMVA 3VMPA 1NWSA 1LL7A 1N82A 3N13A 2ZICA 4Z2IA 1I75A 1ZJBA 2YL8A 2VQUA 3RM4A 1V03A 3DC0A 3L4VA 4CGTA 4GI8A 1U30A 1NARA 1UWRA 3WD1A 2E4TA 1UD3A 2JEPA 4AZ7A 1WNOA 1GQKA 3CZLA 4ATLA 3SCTA 3VIPA 3OGVA 1DWJM 2QMJA 2FDMA 2PB1A 3WEMA 1QNPA 1E15A 2PC8A 1C91A 2VJXA 5M03A 2WCSA 1KXTA 2RGMA 4WK9A 3GH5A 5M3WA 2Z1SA 4C7FA 4V2XA 3OBAA 1R86A 1UHVA 2J75A 1IZKA 3WEOA 3G6LA 3MV01 1C90A 1CEOA 4U5KA 1XRVA 1GQJA 1X1NA 1GJWA 3W6MA 3PZVA 3WFZA 2XYLA 3AZRA 4UOQA 2ZX7A 4DWSC 4H8VA 4QFUA 1ITXA 1ZBVA 1TE1A 4FF5A 3BLPX 1JNDA 2BHZA 1EO7A 2W92A 4PMDA 1XCWA 3VU2A 1CGWA 2PBGA 1DWGM 1RPKA 3KL3A 8CGTA 2WHLA 4PMRA 2J7CA 3FW6A 2BVDA 1CXHA 3VD3A 4Z2JA 3RCNA 2V3DA 3OLEA 1BVNP 1TUXA 2ZWYA 1K6AA 4LX4A 1JZ6A 1C92A 4Z2KA 2VZOA 1C8QA 3VTRA 3DYOA 3AIWA 4H8UA 1V0NA 4JKMA 3B9AA 1J18A 3KE0A 3AJ7A 2EEXA 4CN1A 1UZ1A 4HZ7A 4HPGA 3PHAA 4MDOA 1UQYA 1W1YA 4AYSA 4D6HA 3LPPA 3DHPA 1UWSA 1ISXA 4W93A 1HN1A 3VIGA 3L2LA 1OT2A 3GBEA 1OD0A 4MB1A 2WB5A 4LQ1A 1H3GA 5TD4A 5JIPA 1UD8A 5FCZA 5C70A 2VI0A 4N0RA 1ISYA 2ZX8A 1JYVA 2Y5EA 4M29A 3D3AA 2DSVA 1D3CA 2DT2A 5IHSA 3WD0A 1KWGA 1UWTA 4J7RA 1J12A 3VGBA 3CZ8A 5DEZA 3A3HA 4GZEA 3T09A 3RM8A 2E8YA 1PEZA 3FHAA 1DWIM 4TOQA 1JDCA 4EANA 3ALFA 1I1XA 5D9NA 2XVPA 1O6IA 1VF8A 4QCEA 3AROA 3MUZ1 4J3UA 4A3HA 4MB5A 2WBGA 2YDQA 1UR0A 7CGTA 1IT0A 1JYXA 1MQQA 4BZYA 1VB9A 1OWQA 1LLOA 4ZXOA 1E1FA 5EB8A 5I3DA 3MANA 2OLHA 3RIKA 4DWSA 4B3KA 1OB0A 3F4VA 3W0KA 3OGRA 3CHEA 3AMGA 4J3TA 5JBDA 1BFNA 3AXHA 3GDBA 5A2BA 4W85A 5A8PA 1NP2A 1R7OA 2XSBA 3SCOA 3VDAA 5LA1A 2DEPA 1KWKA 2C0HA 3AS0A 2E8ZA 4MPKA 4MNLA 3PTKA 3D5HA 1B9ZA 3QHMA 1BVZA 1VJZA 1ISVA 4DWSB 2J7HA 2E40A 2WKLA 5I0DA 2AMGA 1G1YA 2J62A 5AC4A 3BLKA 5EFDA 4J28A 4AIEA 2V5CA 1ODZA 3B9EA 2IXVA 1JZ5A 1GCYA 1MVYA 2WMGA 3AHVA 2CITA 1GOMA 4D6CA 1JL8A 1GQLA 3W29A 1MYRA 1ZJAA 1KBKA 2WANA 3KL0A 3VD9A 1BGGA 1XHGA 5E70A 1GOIA 4D1IA 1QHZA 2J7DA 3K1DA 3WD4A 4W89A 5KZ6A 2YA1A 4FLOA 1E3XA 1E1EA 1HJQA 4ATDA 5CJ5A 1CENA 5F7UA 1E55A 2X0HA 1JYWA 2W62A 2PWFA 1K9DA 4A3YA 5DFAA 3TOPA 1WP6A 3CBWA 5BXSA 1GOOA 3WMCA 3WH8A 1B2YA 1XSJA 1NWRA 1QI4A 1J11A 2D3LA 2AAAA 3CH9A 4GPNA 3ZQ9A 4GQRA 4WIWA 1V6WA 3GXIA 4B9ZA 1UH3A 3ZM8A 1CBGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2O9T A;  3WEL A;  1OSE A;  3BAK A;  4KMQ A;  3LPO A;  1E6Q M;  1ZU8 A;  2DSU A;  2YA0 A;  1KGU A;  2OWW A;  4NF7 A;  2VZT A;  1UKT A;  1L0P A;  3APG A;  1ISW A;  3MMW A;  1JG9 A;  2PBO A;  4W5Z A;  4GIN A;  1CXE A;  2ZUW A;  2VR4 A;  1P6W A;  2W91 A;  4BQ4 A;  5GQB A;  1J0I A;  4H7V A;  3GM8 A;  3PZM A;  3WDP P;  1CGU A;  2X09 A;  2X1I A;  1BTC A;  3AFB A;  5BXT A;  5I24 A;  4W7W A;  4CU7 A;  1QBB A;  1W9B M;  3WL0 A;  4J3V A;  4UQE A;  1G5A A;  1PIF A;  1CLV A;  1VEN A;  3WKZ A;  1U33 A;  3SUT A;  4JCL A;  4UOJ A;  4HA4 A;  3GZA A;  1UD6 A;  3VGG A;  3AIV A;  3RJX A;  2G4F A;  1E56 A;  1EIB A;  2ZUN A;  2ZXQ A;  5D9M A;  2XFF A;  2EO7 A;  1KCK A;  2ZXA A;  2J8G A;  1XH1 A;  4P7O A;  3PZU A;  1BF2 A;  1OGB A;  5E6Y A;  5E0C A;  4LYR A;  3AHY A;  4AD3 A;  2VX6 A;  2CBU A;  1JIB A;  2D3N A;  4HOW A;  3MUA A;  5EBA A;  2E9L A;  1GPF A;  2VCA A;  4UFK A;  4AIU A;  1MFV A;  4GQQ A;  4Z2H A;  4MB3 A;  1QVB A;  1YHT A;  3F5K A;  3BCD A;  3NUK A;  3CPU A;  1ODU A;  3K8L A;  1DWA M;  1GVY A;  4XV0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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