4CD5A

The structure of gh26 beta-mannanase cjman26c from cellvibrio japonicus in complex with manmim
Total Genus 146
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
146
sequence length
367
structure length
367
Chain Sequence
LPALIDTQATAETRALYRNLAKLRYKHLLFGHEDSLAYGVHWEGDMDRSDVRDVTGANPAVYGWELGGLELGHTANLDAVNFEKMQHWIKAGYSRGGVITISWHVFNPVSGGNSWDKTPAVHELIPGGARHATLKAYLDTFVAFNEGLADVDAQGNKHYPPIIFRPWHEHNGDWFWWGKGHASEQDYIALWRFTVHYLRDEKKLRNLIYAYSPDRSRIDMANFEAGYLYGYPGDAYVDIIGLDNYWDVGHEANTASADEQKAALTASLKQLVQIARSKGKIAALTETGNNRLTIDNFWTERLLGPISADADASEIAYVMVWRNANLAREKSEQFFAPFPGQATADDFKRFYQSEVVLFEDELPPLYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Combined Inhibitor Free-Energy Landscape and Structural Analysis Reports on the Mannosidase Conformational Coordinate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-BETA MANNANASE, PUTATIVE, MAN26C
molecule tags Hydrolase
source organism Cellvibrio japonicus
total genus 146
structure length 367
sequence length 367
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2013-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02156 Glyco_hydro_26 Glycosyl hydrolase family 26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4cd5A00
1CLVA 3WDRA 4D6IA 3S6TA 3TP4A 1X6LA 1W9DM 1B3WA 3FW6A 4AW7A 1EHNA 1KCKA 3NDYA 1XHGA 1K9EA 4RE2A 4GO9A 2WB5A 3K1DA 4V28A 3S2CA 3SUVA 3AXHA 1WZMA 2ZX6A 2G8ZA 1WZLA 2VX7A 1JFHA 2VZUA 2WCGA 1BQCA 1Q6CA 1JG9A 1QI5A 1CGXA 3B9DA 1LLOA 3PZUA 2CBJA 1V0KA 4PMYA 4DM1A 1UKPA 1OSEA 1Q6DA 3GTNA 4JFVA 1EOKA 5A6LA 3T0BA 5HOSA 1OT2A 2OWXA 5LA2A 2JIWA 3FAWA 4UQBA 1UR2A 5A6SA 1V6VA 1C92A 5JUVA 3PZTA 1WNOA 4UTFA 2V3DA 1VBRA 4W7UA 3WY1A 1GPFA 4B9YA 1XSIA 3WNOA 3D5HA 5CGTA 5BRQA 1JFXA 1Q4NX 3AMGA 1HP4A 1UH2A 3VDHA 3AIQA 1UQZA 1E6NA 4CD4A 1GZJA 1KGWA 1UR9A 1R7AA 3OZOA 2BS9A 1VFUA 4FLRA 3GNOA 5CQ1A 1BAGA 3K8KA 1BGAA 2EPKX 2WK2A 1JD9A 1JAKA 5EFDA 2YJQA 4UQAA 1H3GA 2WHMA 1I1WA 2WZIA 2YOCA 1PIGA 1HVQA 4JHZA 3VMNA 1UH4A 1AVAA 4CU7A 4IM4A 5E0CA 1R7OA 3MUAA 5ABFA 4IPLA 4MB5A 3SUTA 4L4OA 4M29A 2PWFA 2DSZA 2WW5A 4Q7NA 3PZGA 2C0HA 1MW0A 3CUFA 4GZJA 4U3CA 1OIFA 1TUXA 2VX5A 4PMZA 4M1RA 4H04A 3O9NA 5IHRA 1C91A 1LL6A 3IAQA 1K6AA 1E72M 1VF8A 4J27A 3VGDA 2WC4A 1D2KA 1JD7A 2ZXQA 2V5CA 3WEMA 3L2LA 2IXUA 3T08A 1NQ6A 2J7DA 2WC7A 4P8VA 2D0GA 2J62A 3GBDA 3K4DA 3PZ9A 2F2HA 1MQPA 3BLKA 2J47A 2ZUNA 4UNIA 2F8QA 4V2XA 1K9DA 1V3MA 3VVGA 2J7GA 2PWDA 4V27A 2WMJA 3U5UA 5LA0A 2CCRA 3VIPA 3UEQA 2YIHA 3LPOA 3AQUA 1ODZA 5GNYA 2DIEA 4WJXA 3A6OA 4AWEA 3AHXA 1WO2A 4MJ2A 9CGTA 3W27A 4MAVA 1IV8A 3ZMRA 2ZUMA 4WLCA 1WP6A 1W2PA 1EHAA 2QMKA 3DYOA 2XSAA 3WF0A 1V6YA 2ZXAA 4J3UA 4NRRA 3ARPA 5BXPA 3EMCA 3BMWA 3HN3A 4C7GA 3T0DA 4AZ7A 1GOWA 1B30A 5KEZA 1GQKA 4AC1X 5HNNA 1CGVA 3SCQA 5CGMA 3VIKA 2WZHA 1NWSA 4QCEA 5I23A 4GIAA 2XWDA 1OT1A 4D6DA 1B31A 3WQVA 1RP9A 5BXTA 3W6LA 3ARRA 4MTVA 4AMCA 1LG1A 1DP0A 4IPNB 1BTCA 3OG2A 2G4FA 4J28A 1PZ2A 3WD2A 2DQXA 3PZOA 3WELA 3CZEA 1XH2A 1HJSA 4OOUA 3PZIA 3BSHA 3ZR6A 1XSKA 5CLTA 1E6QM 3WFZA 4AD1A 3AZSA 1TE1A 2E3ZA 2GJXB 1KCLA 2NT0A 4JCMA 1F4AA 2BVDA 5I77A 1UA7A 4WSKA 4W8AA 1JI1A 1QBAA 4RE3A 1OGSA 1W3KA 1X1NA 1MXGA 4UCFA 3FY1A 3WF3A 5CZKA 1LWHA 4UFHA 5E09A 4NZCA 3F5LA 1PBGA 1JL8A 1UHVA 4MB4A 2O9OA 4PMRA 2XVGA 3ZM8A 1X6NA 4CCCA 3DC0A 2D23A 3ZOAA 2WHJA 2ZUSA 4R5EA 2E4TA 3VGGA 4MB3A 5KZ6A 1E6RA 2QHAA 2X8RA 4PTMA 3U7BA 4X0VA 3WUEA 1BGGA 2WWCA 3ZT7A 2W67A 1PEZA 3OGSA 1J11A 2J79A 4Z2GA 4S3KA 5I3DA 2WZEA 1UZ1A 1EDTA 4TVDA 4QFUA 1TVNA 3SCNA 4U31A 1CXFA 2PC8A 1BYBA 3GXFA 4WK9A 5CPSA 3LMYA 2VMFA 3IJ9A 2V3FA 3ARQA 7CGTA 3QR3A 3VMOA 2GK1A 4P7OA 5C8BB 1KB3A 3MSDA 4WIWA 4JFUA 4CCEA 4MADA 1J18A 1E3ZA 1E0WA 1PAMA 2OYMA 2MANA 3ZJ8A 1HX0A 2WMGA 4DUXA 3TTQA 3CPUA 2AMGA 1C90A 4DWSA 1JDDA 1B3XA 1CXKA 1HJVA 3AS3A 4D72A 4JKLA 1DWIM 5JBDA 2YA1A 3UETA 2XIBA 4OJYA 5JBEA 3L4ZA 1E4NA 2JEPA 1E6XM 1UWUA 3K8MA 4A3YA 2OSXA 1BSIA 4QCFA 3ZIZA 2BHUA 5I24A 3BAJA 3A47A 3POCA 3QOMA 1AQHA 1V6WA 2YKKA 3AMLA 1M53A 1MVYA 2VL4A 2J7BA 4M24A 3AIWA 1C7TA 2E40A 1CTNA 4BA0A 1VFOA 1AMYA 4D6CA 1TVPA 2OLHA 5E0FA 1DWGM 3WSUA 4MNLA 2XVLA 4A3HA 2XM2A 4ZE5A 1JZ3A 3PHAA 2JF7A 2CXGA 4HZ6A 2EPOA 1WDSA 3CZGA 3OGRA 4H8HA 4GQQA 1CXEA 1I75A 1JI2A 3ZT5A 2QPSA 1UUQA 2XGIA 3ARWA 3M6DA 4P7QA 3QGVA 3VIGA 1DWJM 4J3TA 4TXEA 4BS0A 3OLGA 4WSJA 4TX8A 2A3HA 4PSRA 5A2CA 4IISA 2FDMA 1KXHA 2CNCA 2VOTA 3E1F1 1VEMA 1J9YA 3D3AA 3PZVA 4HMDA 4D6GA 2WMKA 4E2OA 4URIA 1VEPA 1JZ7A 4D6EA 4YPJA 1GOKA 3NJ3A 3BH4A 1KXTA 3W26A 1GJUA 1D7FA 2WANA 4NSBA 1UD5A 4AY1A 1V3HA 5D9NA 1E3XA 2EPNA 2W5FA 3ZT6A 2EEXA 2XVKA 3ARUA 1K9TA 4ZFMA 4GO8A 4AIUA 2V3EA 3L4YA 3O6AA 1ZU8A 3WDJA 1LF1A 2HISA 5DO8A 1JXJA 4HZ7A 1UD3A 1C8QA 3SCUA 6CGTA 4BF7A 2WVVA 3NSXA 2FHFA 1VJSA 1UH3A 2BY1A 3PN8A 3F4VA 3MKKA 4W86A 2DIJA 1E5JA 1GW1A 4P8WA 1OBAA 3FAXA 3AS1A 3RM9A 2FHBA 1XC6A 1ITXA 2CIPA 3TTSA 2F61A 3M07A 4N42A 3WDHA 5IHSA 2Y2WA 2OSYA 2AAAA 1FA2A 5I6SA 3WQ5A 5BXRA 1KWKA 1QNOA 3N12A 1HJUA 4DUVA 3N11A 4FK9A 2DSVA 3OLDA 4NRSA 4D6FA 1JYWA 3G6MA 3WQ8A 4PUEA 2BV9A 1MWOA 1QVBA 1HL8A 2J78A 1WZKA 3WF2A 1JNEA 2WMIB 3AIEA 1HIZA 1UWSA 4AXNA 3VM7A 1W1TA 1JAEA 1FH8A 3A4AA 1Q6FA 4H8VA 3WENA 4CKQA 2QV4A 3VGEA 4F9DA 3AHZA 3W24A 4HOXA 4GI6A 3SCRA 4EE9A 2BY3A 3CMGA 5IDIA 1PX4A 2BVTA 2CETA 4RL3A 1FHLA 3VD3A 3WNPA 4P8UA 1ISVA 1C8YA 3MMUA 3TTYA 3ARVA 4LPCA 5GNXA 4M8UA 3GM8A 1I1XA 4TVCA 3RO8A 3ZJ7A 1OIMA 2VNCA 4UR9A 4TTUA 5DT5A 4JL2A 5D4YA 1GQJA 2YLAA 1V3JA 4J3VA 1DHKA 2E8YA 1MQRA 3POHA 4CD5A 3CZLA 1V02A 3SUUA 1LQ0A 3NUKA 3TOPA 4C7FA 3SUSA 2VR4A 1JGIA 1EO7A 1E6SM 2UY4A 4W5ZA 1BVNP 1JDAA 1FFRA 2G41A 3ZR5A 4JKKA 3EBVA 1XCWA 2VX4A 2ZUTA 5A8QA 2W62A 1JZ6A 2Y4SA 2CBUA 2IUZA 4U3AA 4ATLA 1QNQA 4ATDA 1W9UA 4CUCA 1B0IA 4FLSA 1GNXA 2OWCA 3UR7A 4ACZA 3MMDA 4U5KA 4F9JA 1R87A 1GHRA 1UR1A 4BZYA 1TFVA 1C8XA 1VJZA 3RDKA 4UOQA 3NCOA 3AIBA 1ECEA 3A4XA 1CGWA 1W3LA 2PB1A 4UFKA 4IUGA 1VBUA 4WKFA 1V6UA 2XFRA 4HOZA 4TTGA 1BYCA 4P7LA 2W91A 2ZUVA 5LA1A 1KR0A 1KQYA 4RE4A 4L4PA 1YQ2A 5DF0A 1FH9A 4KRUA 1WAWA 4XX6A 3MU7A 4LGXA 3JUGA 3VINA 2ZOXA 3OA5A 1W2VA 4B16A 2YDRA 5AYBA 5A6BA 3AYSA 3WNKA 4B15A 2VRJA 3NIYA 1MYRA 1QI3A 1UOKA 3M46A 3NDZA 5BROA 4UFLA 8CGTA 2CHNA 5A94A 1HJXA 1PJ9A 4W88A 1UQYA 1V3KA 2XG9A 3AS0A 3GH4A 4JIEA 1WPCA 1GQIA 1MW1A 1UD8A 2XVNA 1AQMA 4DWSC 1B9ZA 3AHYA 3WUGA 1QNSA 3CUJA 5A3HA 4PEEA 3AIVA 2WLYA 4U2YA 4PRWA 3II1A 3BMVA 3W82A 4Z2IA 4TUFA 1WDPA 5CPTA 1QNRA 2DT3A 4XUYA 2X1IA 3N9KA 3W4RA 4J3SA 2GDVA 1KBKA 1QW9A 4PTWA 1GOIA 2D20A 1V0NA 1JYXA 3WD3A 2XUCA 4PMXA 3DHPA 4HPGA 2CPUA 3CZ8A 2Q8XA 3BSGA 1L8NA 2W66A 3WH7A 3B8SA 3WBAA 3WDQA 2VC9A 1RP8A 4R27A 4W5UA 1HJQA 3VDBA 3CHEA 3SIMA 1GHSA 1E56A 1TR1A 1JZ8A 3CTTA 3AXIA 1O7AA 2PBOA 1VFMA 1AQ0A 3U57A 2QPUA 3EMZA 3SCSA 1E40A 5JIPA 3MV11 3UG3A 2CITA 3UCQA 5HXMA 5HBFA 1CDGA 1E1FA 1XV8A 1XH1A 3CMJA 5M03A 2E9LA 3W81A 5A2BA 2X2YA 1B90A 5F7UA 1UA3A 1NOUA 3VX1A 3OGVA 3AHTA 3VX0A 3U5YA 2GVYA 4M81A 1B1YA 4DUWA 1EDQA 3A3HA 1UR4A 3WMCA 5A6JA 2XSBA 4HA4A 3RIKA 2D3LA 2Y8VA 4HA3A 1NP0A 2E9BA 1QOXA 2Y8KA 3WKZA 4N0RA 4FLQA 4E4PA 3VUPA 1W9PA 4GZIA 1DTUA 3F5JA 4HMCA 1HN1A 1B3VA 4KGJA 4LX4A 4W8BA 3AHVA 1XYFA 3OIHA 5EBAA 2DEPA 1G9HA 1OGGA 2YLLA 2JFEX 3NSNA 2HVMA 3GDBA 1JYNA 2JIEA 4LXFA 2X0YA 4LYPA 1TA3B 1WB0A 1EDGA 2X05A 4UZSA 4ATWA 3AZRA 1W9XA 1IZJA 1CNVA 3LPFA 4M56A 4EANA 3EDEA 2FH6A 1KGUA 4AEEA 3K46A 4EKJA 5AC5A 4MNJA 4PN2A 1BPLB 2W4XA 4JFWA 5I5RA 3RM4A 2WAGA 4E8DA 2DSUA 3GNPA 5TD4A 1UYQA 4PMOA 1XCXA 3AIUA 1J01A 5A6KA 1E70M 1G5AA 1V0LA 3UESA 1XYZA 5M17A 4ZE4A 5FOOA 1ISZA 4UOZA 1PIFA 2UWFA 1MQQA 2A3BA 1C93A 1WKYA 1H11A 2WWDA 1IZKA 3VIJA 1W32A 2WNWA 2XHYA 3BCDA 4FMVA 2RGMA 2V38A 3BAIA 5GPRA 3HMCA 1DWHM 3N17A 1XD1A 2X0HA 1J0ZA 2C8NA 2YL6A 1GQLA 1UWTA 1C7SA 4AZCB 1XGZA 1S46A 1ISWA 1ESWA 2O92A 2VZVA 3EMQA 5E9AA 3AMCA 3AYRA 3T09A 4Q22A 1KFWA 2V5DA 3SCPA 5HPCA 4GINA 3TTOA 1ZBVA 4XV0A 3GXDA 3VDCA 1HP5A 1NWTA 5A1AA 3ZJKA 3T2PA 1JF6A 4TX6A 1J12A 1E4LA 3IANA 2UY2A 1JDCA 4GI8A 1QHOA 1W3JA 4PSPA 2XIIA 1DWFM 3OBAA 5I0DA 2ZX7A 1Q6GA 4PMUA 2B31A 2ZE0A 3MO4A 3THDA 1UKOA 1BG4A 3KZSA 4AZBA 3WN6A 2E0PA 1HL9A 3WFLA 2O9TA 5IFTA 4UOJA 1MFUA 4ML4A 1OINA 2D1ZA 4KRTA 2PWEA 4P7RA 2OWWA 3PZNA 3L4WA 4MB1A 2J8GA 5FL0A 2BXZA 3IK2A 5A6AA 4GI9A 4BQ5A 1NOFA 2DSWA 4Z2JA 4QP0A 1MXDA 1P6WA 3OZPA 4UQDA 5DT7A 3WQWA 1UD4A 4JL1A 1EIBA 3RILA 3VIHA 2VX6A 5EMYA 3VTRA 1EA9C 1GUVA 3CZKA 4H8UA 1E9LA 3SURA 2XFFA 5LYRA 6TAAA 5HPOA 3W28A 3W37A 2Z1KA 1ZJAA 2PWGA 2VT0A 1OB0A 4NF7A 1UR0A 4DWSD 4LQ1A 4CVWA 5AC4A 2BY0A 2WKLA 3RMEA 3PZMA 3SCOA 3DYMA 4UQCA 3DECA 4CN4A 1BLIA 1CWYA 2BFGA 2EPLX 3ALFA 3UG5A 1A3HA 4AZ5A 2A3EA 2FGLA 4J7RA 1US2A 3CH9A 3PZQA 1H5VA 2PWHA 2DH2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CLV A;  3WDR A;  4D6I A;  3S6T A;  3TP4 A;  1X6L A;  1W9D M;  1B3W A;  3FW6 A;  4AW7 A;  1EHN A;  1KCK A;  3NDY A;  1XHG A;  1K9E A;  4RE2 A;  4GO9 A;  2WB5 A;  3K1D A;  4V28 A;  3S2C A;  3SUV A;  3AXH A;  1WZM A;  2ZX6 A;  2G8Z A;  1WZL A;  2VX7 A;  1JFH A;  2VZU A;  2WCG A;  1BQC A;  1Q6C A;  1JG9 A;  1QI5 A;  1CGX A;  3B9D A;  1LLO A;  3PZU A;  2CBJ A;  1V0K A;  4PMY A;  4DM1 A;  1UKP A;  1OSE A;  1Q6D A;  3GTN A;  4JFV A;  1EOK A;  5A6L A;  3T0B A;  5HOS A;  1OT2 A;  2OWX A;  5LA2 A;  2JIW A;  3FAW A;  4UQB A;  1UR2 A;  5A6S A;  1V6V A;  1C92 A;  5JUV A;  3PZT A;  1WNO A;  4UTF A;  2V3D A;  1VBR A;  4W7U A;  3WY1 A;  1GPF A;  4B9Y A;  1XSI A;  3WNO A;  3D5H A;  5CGT A;  5BRQ A;  1JFX A;  1Q4N X;  3AMG A;  1HP4 A;  1UH2 A;  3VDH A;  3AIQ A;  1UQZ A;  1E6N A;  4CD4 A;  1GZJ A;  1KGW A;  1UR9 A;  1R7A A;  3OZO A;  2BS9 A;  1VFU A;  4FLR A;  3GNO A;  5CQ1 A;  1BAG A;  3K8K A;  1BGA A;  2EPK X;  2WK2 A;  1JD9 A;  1JAK A;  5EFD A;  2YJQ A;  4UQA A;  1H3G A;  2WHM A;  1I1W A;  2WZI A;  2YOC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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