4CD6A

The structure of gh113 beta-mannanase aamana from alicyclobacillus acidocaldarius in complex with manifg
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
315
structure length
315
Chain Sequence
SAFDLGFIRGMTFGFVGQHGTWGTDEARASMRALAEQPFNWVTLAFAGLMEHPGDPAIAYGPPVTVSDDEIASMAELAHALGLKVCLKPTVNCRDGTWRGEIRFEKEHGPDLESWEAWFGSYSDMMAHYAHVAKRTGCEMFCVGCEMTTAEPHEAMWRETIARVRTEYDGLVTYNCNHGREEHVRFWDAVDLISSSAYYPIDRWRDRVPVLREVAEAHEKPLFFMEVGCPSRSGSGACPWDYRHPGAVCLDEQARFYEAMFAAMPDEPWFKGYMLWEWPWKLYPREAASEDGSYCIYGKPAEDVVARAFSAIANR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Combined Inhibitor Free-Energy Landscape and Structural Analysis Reports on the Mannosidase Conformational Coordinate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-BETA-1,4-MANNANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Alicyclobacillus acidocaldarius
total genus 126
structure length 315
sequence length 315
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2013-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4cd6A00
4D72A 3PZ9A 4V2XA 1JIBA 1BGGA 4AZ5A 2ZXBA 2WWDA 1V6WA 2YDSA 4D1JA 3AIRA 4U3CA 4ZFMA 2V3FA 1V3MA 1NQ6A 2QV4A 2J7CA 3N12A 2BY0A 1QBBA 3UR7A 2FDMA 3VMOA 1FP9A 1BVNP 1UD6A 2JE8A 2XM2A 1BVZA 4GKLA 4NI3A 1WE5A 4HOXA 1OD0A 1EDTA 4AY1A 2VZTA 2VTFA 3WKZA 5BYWA 4DWSD 4N0RA 2WNWA 1QVBA 8A3HA 2DIEA 3PHAA 4AYSA 1C7TA 4HOZA 2QMKA 3VD9A 1E1FA 1IV8A 1GOQA 1OGSA 1D7FA 1UWUA 2JIEA 4UQCA 3FAXA 2D1ZA 3TTOA 2XWEA 3EDDA 4JHZA 4HMCA 3OGVA 3LMYA 3NSNA 2BY2A 1NWRA 4AZCA 4GO9A 1V08A 1HX0A 2EBNA 1Q6FA 3S6TA 1UZ1A 4BF7A 4HZ8A 1C3FA 1E55A 5BRQA 4J3UA 2D3NA 5CSYA 1UWTA 4ACZA 3MUZ1 1A47A 1JZ7A 1KFWA 1V3HA 3K4AA 4GI9A 4P7QA 4AZGA 1JD9A 3GXDA 1KBBA 1BAGA 3M7SA 2O9PA 3RDKA 1OM0A 1DWFM 5LYRA 2FHBA 3WBEA 4D1IA 2WVVA 4M24A 1CGYA 1JDDA 2NT0A 2XM1A 4AD5A 1DWHM 4CN6A 1C8QA 2C7FA 1UKOA 3PZTA 4J7RA 3AYRA 1UD3A 3AZTA 1VAHA 4UFHA 2X09A 4TOQA 3UG5A 2J7FA 1XYZA 1HJXA 3AMLA 1CGXA 1UD4A 3AISA 3FXYA 1A3HA 3CHDA 4KH2A 4GO8A 1NH6A 2DPEA 4L4PA 3WMSA 3AHTA 1KR1A 1H4PA 4JFUA 1GHRA 3PN8A 1PIGA 1E3ZA 5CPTA 1LWHA 1UKSA 5I78A 2DSKA 1JYWA 1MW3A 2YOCA 1MQRA 1LF1A 3VNYA 2CBIA 1W91A 2WKGA 4UZUA 1QBAA 4D71A 1PZ3A 3FW6A 1I1WA 1KGWA 2WMFA 2WBKA 1NOWA 2WLYA 1ISYA 3F4VA 3VIGA 3ZMRA 2DT1A 5D9OA 3BAXA 2JIWA 5HXMA 3CMJA 4GPNA 4CVUA 1GOOA 2VR5A 3CUHA 3LPFA 3QHMA 2EPMX 4W5ZA 4B9ZA 4WF7A 4LGXA 1VEPA 4A4AA 2ZE0A 2WMIA 2HVMA 1AVAA 1GHSA 1PPIA 4QCEA 1V0LA 4CN4A 1KGXA 4FLRA 4R27A 1J11A 3SURA 3WDRA 1ISZA 4JAWA 3RPMA 1QHZA 2J25A 2Y4SA 3ARQA 1NARA 1UZ4A 3CHEA 5BROA 1UQYA 2A3HA 1XH2A 2XSBA 3VIPA 1UH3A 1HKKA 1OIMA 1V0KA 4B3KA 4V28A 3FN9A 1XSJA 1W9UA 4JCLA 4BA0A 2OLHA 3VUPA 3ZIZA 3E1F1 1QNRA 2XIIA 4W84A 2G3JA 3EMQA 2BHYA 5I3DA 3N18A 3GM8A 4QDMA 5GNYA 5HBFA 1XSIA 3ALGA 1NP0A 4XX6A 2CXGA 1CZ1A 1F4AA 3WN6A 5CQ1A 5FL1A 1AQMA 3A4AA 4GZJA 4U31A 2YL8A 1JNEA 1H1NA 3BCFA 1KGUA 3W25A 3WY1A 4AD0A 3AHZA 4MJ4A 5FL0A 3WQ6A 3AIQA 3SCUA 4PMXA 4AEFA 3VU2A 1PAMA 2W61A 1UKQA 1W9VA 2XFRA 1ZB5A 4JFWA 1GPFA 1YHTA 1CENA 1TUXA 3OLDA 1E70M 3TOPA 1EO5A 2QPUA 3BAKA 2BVYA 1PX3A 3RM9A 2CEQA 1HJQA 2E4TA 3T2QA 2NT1A 2ZICA 2A3CA 5GPRA 1CLVA 1NP2A 1XYFA 3WD3A 2OSYA 3WF2A 3L4YA 2XIBA 3ZSSA 5ECUA 2VZSA 1E40A 1RH9A 3IAQA 3QR3A 2JF6A 4HMDA 3WQWA 1LL4A 2DH3A 2CYGA 1SMDA 3UESA 3RM4A 5A8PA 2AOSA 1BYBA 1V0MA 1VBRA 4E2OA 3QGVA 5BRPA 1WDRA 2PWHA 5E70A 1E43A 3MMWA 1GOWA 4AZ6A 5TD4A 2CBUA 3LPOA 3ARUA 1EXPA 1L0PA 1E9LA 8CGTA 4IUGA 3PZVA 2VX5A 4H04A 3M07A 5M5DA 1B3XA 3S2CA 5IHSA 1KXQA 5A6BA 1HVXA 1JG9A 2CCRA 3IAPA 3SCPA 3SCWA 1DHKA 2WMHA 5BXSA 4DWSB 1FFQA 3WH8A 1RPKA 2VR4A 1J0HA 4CU7A 5JIWA 1E6NA 1HKMA 2DDXA 1KQZA 2GJPA 3OLGA 1B1YA 1B3ZA 1WP6A 2BY3A 2OWCA 4W7UA 1G01A 5A6SA 3VDAA 1BGAA 3ARRA 2ZX9A 4DWSC 1ODUA 2W67A 4UQEA 1K6AA 1VJZA 5F7UA 3AS1A 1XSKA 5D9PA 1Y7VA 1OGBA 4MB1A 3WIJA 2CNCA 4MNLA 1JFXA 3W4RA 3AIVA 1G9HA 4D6CA 4W7WA 3AIUA 1UOKA 3WF3A 4GZIA 2X2YA 1VENA 2CPUA 4TUFA 4CD4A 1HT6A 3WUGA 2VZUA 3BAJA 1CECA 1C92A 2Q8XA 1UHVA 3U57A 2XVGA 3WH6A 1AQHA 1W1YA 5CLTA 2W4XA 3UCQA 3L4ZA 4MNJA 4DUVA 4ACYA 5M17A 1BG4A 2PWEA 5BCAA 1FOBA 5A3HA 2XPKA 3CUIA 2O92A 2RGMA 2G8ZA 1PBGA 3OZPA 5DT7A 3ZT6A 4LX4A 4UQAA 3BMVA 3N17A 1H0IA 5A6BD 1R7AA 5I23A 1UR1A 1CXFA 3WNNA 3RIKA 2WC3A 4S3JA 4UFKA 1QHPA 4QLKA 4QLJA 1C93A 1K9TA 1WZMA 1UQZA 4WSKA 2E40A 4TVCA 2YDRA 2D0HA 1TR1A 1KCLA 4GIAA 5I77A 1HKJA 4Q22A 3W6LA 2V3GA 3PZIA 3AS3A 1HL9A 4EKJA 2VZOA 4LQ1A 1QI3A 3KE0A 4PBGA 4CKQA 3VIIA 2XUCA 1NOFA 4RL3A 4QLLA 2CHOA 4OOUA 4UOJA 1VFFA 1LWJA 4C7FA 1KXVA 2EPLX 4UOQA 4AZCB 1D2KA 1VFOA 2FHCA 4J27A 1J18A 3MMDA 1ZU8A 1H0GA 2YL9A 1S46A 4TTGA 2ZOXA 4CUCA 4QAWA 1CLXA 1XRVA 1K9EA 3AMDA 1W3LA 4M29A 4ACZB 3VIOA 1ZBCA 3DYPA 3CMGA 1EOKA 4JIEA 5A95A 5JUVA 3I3BA 4WSJA 4PMUA 4W86A 2XGBA 2X05A 4U5KA 4CD6A 1OINA 4W8BA 1SMAA 1E0VA 2OSXA 5DO8A 3AI0A 2WVVB 5A8NA 4P8WA 4FLOA 3UEQA 4AXNA 3SCQA 2VMFA 3GXFA 4J3SA 3UERA 1CGTA 1GQKA 4V27A 2V5CA 1W1VA 2JEPA 2Y5EA 1WCGA 2VT0A 1JYXA 1XGZA 1MW1A 2ZWZA 5E09A 5IFPA 2D0FA 3L4XA 5JBEA 1LG2A 5EB8A 3RCNA 2VQTA 1KXHA 1XD1A 3WQ4A 4ATLA 1G0CA 3DHUA 2PWFA 1QNOA 4MPKA 4B16A 5A6MA 1WZLA 3CZJA 1AQ0A 3WUEA 2W91A 4UR9A 1CGWA 2J77A 2YKKA 1V6VA 2GDUA 1CEOA 1C8XA 3OGSA 1OGGA 2VL4A 1QNPA 3W82A 1JF6A 3PZUA 3U5YA 1K9FA 2IUZA 3VKKA 4GXPA 1TA3B 1DWAM 1JZ8A 1KCKA 1I75A 1UR2A 2GDVA 4WKFA 5AC4A 3UG4A 4F8XA 1UR9A 5AY7A 3WD0A 5A2BA 2WMIB 4CD8A 5HPCA 4AZ7A 1US3A 1FH8A 2C0HA 5EMYA 1ZBVA 3TTSA 2WMGA 1V3JA 3WUBA 1W1TA 2Y8KA 4UZSA 3VPLA 3ZT5A 1E5JA 1XCWA 2IXUA 1K9DA 2E3ZA 4B9YA 2VCCA 4FK9A 1J10A 4HA4A 2YLLA 3B9EA 4JKKA 1JZ2A 2XSAA 2ZXQA 4LPCA 3MSDA 1ISWA 2WMJA 2W63A 2AMGA 2GUYA 2E9MA 1O7AA 2PBOA 1HIZA 4TX6A 4PMNA 3U7BA 1V6YA 1E4MM 1E6XM 3PZGA 1L8NA 2W5FA 2HISA 3K8KA 1AMYA 2TAAA 2OYLA 5GNXA 4F9DA 4U33A 1QNSA 1J0JA 1CWYA 4AISA 1B90A 1FHLA 1Q6DA 1VFUA 5LA2A 3WF0A 2EJ1A 2WZIA 3HJEA 3MV11 2ZX7A 5ABHA 1HKIA 3AXHA 2WHLA 1PX4A 3WMCA 5A8MA 3BSHA 1CXKA 2WPGA 3AIEA 3VIHA 1E3XA 3OB8A 1UWRA 4K68A 4UFJA 1ITCA 3WNMA 1JZ5A 3W37A 2UWFA 1WKYA 3CHFA 3CO4A 2PWGA 4QP0A 1XHGA 3G6LA 3WFLA 3WQ5A 4CD5A 3O9NA 2PBGA 1FHDA 2XFFA 2X1IA 3ZJ7A 3EYPA 3GTNA 4M8UA 2VX6A 3AS2A 5CGTA 4C7GA 5EFDA 3OBAA 3GDBA 1QHOA 2ZUUA 3IJ8A 2YA2A 1WPCA 5JIPA 4BCEA 4PMYA 2FGLA 3MUIA 2CKSA 4BQ4A 1CDGA 1C90A 3VIJA 3AS0A 2WWCA 3PBGA 2WHMA 1GVYA 1PJ9A 5E9AA 1KWGA 1E56A 4ZENA 1E73M 2DQXA 1LL7A 4U2ZA 3GNRA 3ARZA 2VQUA 4HP5A 2VJXA 1GQIA 5CPQA 5D8ZA 3WELA 3T08A 2CETA 4RE2A 1H09A 1EA9C 3W24A 4GI8A 4Q7NA 3VOCA 5I79A 5BWFA 4Z2GA 2UY2A 1FH7A 5CXPA 2WHKA 3NSXA 4JCMA 3WNLA 1OCQA 5ABFA 1US2A 1Q6EA 4JL1A 2NW0A 2DT3A 4Z2IA 1ODZA 4DUWA 1IT0A 1R85A 1KWKA 2CKRA 2WVTA 3WNKA 3SCOA 3IJ7A 1U2YA 1GUVA 3CLWA 4W5UA 3ZJKA 2OSWA 4E8DA 3ALFA 3ZR6A 5BXPA 3F5JA 4HA1A 4UOZA 3BAYA 3SUSA 3VGFA 3WENA 2F2HA 1V02E 1XCXA 1MXGA 1I1XA 4P7NA 4PSRA 1MYRA 3N11A 1Q6GA 4XUYA 1DP0A 3ECQA 3VX1A 3WD1A 4UFIA 2J62A 4CGTA 3T0AA 2DSVA 4TTUA 5I24A 2EQDA 3QHNA 4MJ2A 4WJXA 4UQ9A 4CU8A 4Z2LA 4P8UA 3BSGA 3FHQA 1GZJA 2J7HA 2ZX8A 2CIPA 4DUXA 3OLIA 1E15A 3MANA 3ZJ8A 1J0KA 2WVUA 4CVWA 3POHA 2DSUA 2FH6A 3KL5A 4ZE5A 2WW5A 2JALA 2CERA 1KQYA 3WDIA 3MUAA 2WCSA 1WAWA 1C7SA 1RD6A 3EDEA 4YHGA 2D2OA 2Y2WA 3I3DA 4MAZA 5E6YA 4MTVA 3UR8A 1VFMA 3JUGA 1C91A 1JI1A 1ZJBA 3A47A 4PCSA 3AOFA 4AC1X 3A3HA 5A69A 3CGTA 4PMOA 3RJXA 1U33A 2WAGA 4GINA 1EGZA 4HOWA 1EH9A 1B9ZA 3PZOA 1RP9A 4ZXLA 2VC9A 1VJSA 1VRXA 3OZOA 1V6UA 3THCA 1UR4A 2XTKA 4QFUA 3QOKA 3T0DA 4JFTA 2UY4A 3L4WA 2ZWYA 4HZ7A 3VMPA 1UD5A 3GH5A 3WQ8A 3WD2A 1X1NA 3DECA 1JZ4A 4IPNB 4B15A 1PEZA 3WDQA 4PYSA 2EEXA 1CXEA 4U5IA 1F4HA 3CUFA 3T2OA 3AMGA 1NOUA 4P7LA 3UETA 1Q4NX 1JAKA 2ESCA 5C70A 1CXLA 1C8YA 5E6ZA 1WB0A 3MMUA 2WC4A 2YDQA 1EDQA 2GJRA 3PTKA 3DYOA 3RJYA 3AIWA 4J3TA 3VIKA 1HL8A 1OT2A 2WMKA 3HN3A 4PTMA 4J3VA 4UNIA 3U7VA 2BFGA 2WZEA 4M81A 1OD8A 1GW1A 6A3HA 3DC0A 1W9PA 1UWSA 3VGDA 3GYCA 3TTQA 3KL3A 3SUUA 1H5VA 4D6EA 3VM5A 5IFTA 1HF6A 3ZJ6A 3CZGA 4C7DA 2VCBA 2J7DA 4JFSA 2EXOA 3O2LA 1CXHA 4H8HA 4OIFA 3WL0A 1FA2A 3OLEA 1H2JA 2GK1A 1JDAA 5A6KA 4HPHA 2G3MA 5M03A 4PEEA 4PTVA 1TFVA 5A6JA 4PUDA 1KR0A 1E72M 1EIBA 3EDKA 5HDRA 1WDPA 3GNPA 3LPGA 2VX7A 3VGHA 4WIWA 1HJVA 5A6LA 4F9JA 1E6QM 1JZ6A 3B9AA 1M53A 4U2YA 3OIHA 1EOMA 3VM7A 2ZUWA 4KWUA 4NRRA 4W7VA 3MU7A 2OWWA 3NSMA 3AHYA 5HPOA 4J28A 3SEPA 3AROA 5AYBA 5DFAA 1GVIA 1E0XA 3ARXA 3BAIA 4KMQA 1WNOA 2YJQA 2WXDM 3PZMA 2WC7A 2F8QA 1E6ZA 4X0NA 3L4TA 4OUEA 3THDA 4GZEA 1E6RA 2ZUNA 2OYMA 2QF8A 1CNVA 1J12A 2J79A 2XVLA 4LYPA 2Z1KA 1ISXA 4FLSA 4CU6A 2UY3A 3N04A 4AZBA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4D72 A;  3PZ9 A;  4V2X A;  1JIB A;  1BGG A;  4AZ5 A;  2ZXB A;  2WWD A;  1V6W A;  2YDS A;  4D1J A;  3AIR A;  4U3C A;  4ZFM A;  2V3F A;  1V3M A;  1NQ6 A;  2QV4 A;  2J7C A;  3N12 A;  2BY0 A;  1QBB A;  3UR7 A;  2FDM A;  3VMO A;  1FP9 A;  1BVN P;  1UD6 A;  2JE8 A;  2XM2 A;  1BVZ A;  4GKL A;  4NI3 A;  1WE5 A;  4HOX A;  1OD0 A;  1EDT A;  4AY1 A;  2VZT A;  2VTF A;  3WKZ A;  5BYW A;  4DWS D;  4N0R A;  2WNW A;  1QVB A;  8A3H A;  2DIE A;  3PHA A;  4AYS A;  1C7T A;  4HOZ A;  2QMK A;  3VD9 A;  1E1F A;  1IV8 A;  1GOQ A;  1OGS A;  1D7F A;  1UWU A;  2JIE A;  4UQC A;  3FAX A;  2D1Z A;  3TTO A;  2XWE A;  3EDD A;  4JHZ A;  4HMC A;  3OGV A;  3LMY A;  3NSN A;  2BY2 A;  1NWR A;  4AZC A;  4GO9 A;  1V08 A;  1HX0 A;  2EBN A;  1Q6F A;  3S6T A;  1UZ1 A;  4BF7 A;  4HZ8 A;  1C3F A;  1E55 A;  5BRQ A;  4J3U A;  2D3N A;  5CSY A;  1UWT A;  4ACZ A;  3MUZ 1;  1A47 A;  1JZ7 A;  1KFW A;  1V3H A;  3K4A A;  4GI9 A;  4P7Q A;  4AZG A;  1JD9 A;  3GXD A;  1KBB A;  1BAG A;  3M7S A;  2O9P A;  3RDK A;  1OM0 A;  1DWF M;  5LYR A;  2FHB A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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