4CNNA

High resolution structure of salmonella typhi type i dehydroquinase
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
251
structure length
245
Chain Sequence
KTVTVKNLIIGEGMPKIIVSLMGRDINSVKAEALAYREATFDILEWRVDHFMDIASTQSVLTAARVIRDAMPDIPLLFTFRSAKEGGEQTITTQHYLTLNRAAIDSGLVDMIDLELFTGDADVKATVDYAHAHNVYVVMSNHDFHQTPSAEEMVLRLRKMQALGADIPKIAVMPQSKHDVLTLLTATLEMQQHYADRPVITMSMAKEGVISRLAGEVFGSAATFGAVGQIAVNDLRSVLMILHNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mechanistic Insight Into the Reaction Catalyzed by Type I Dehydroquinase
rcsb
molecule keywords 3-DEHYDROQUINATE DEHYDRATASE
molecule tags Lyase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhi
total genus 97
structure length 245
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2014-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4cnnA00
3W1QA 5AHIA 3BW4A 3S9YA 4A29A 1Y0EA 3GKFA 3BK0A 4K7YA 5TBOA 5KZEA 4RV8A 1SO3A 1JUBA 1K8ZA 1LM1A 4UTWC 3MHUA 1PL9A 3NVTA 4CLMA 1TQXA 5D2XA 2CLKA 4UTJA 1NAL1 1XDMA 5LNVA 4NQ1A 3L9CA 4UFKA 3NPWA 4QNWA 1SR9A 4TO8A 4UTIA 3HJZA 4GNJA 2ZTJA 1DOSA 3G1AA 3M44A 3SECA 5HWNA 3ZR4A 4DF1A 2Y7FA 4XKYB 4AHQA 1KM4A 1C9DA 1B3OA 1VLIA 1WBHA 4TIMA 1H50A 3UD6A 1JUKA 3L68A 3NPVA 3RLVA 2ZTKA 3NL5A 3LV6A 5D2VA 3MYPA 3GDLA 2WJZA 3STFA 1AL7A 3ANYA 2R8WA 2JBMA 2NWRA 2E5DA 3GX9A 3EX3A 3BO9A 5D2WA 3OG3A 3E49A 2TMDA 4O11A 1LORA 1OFPA 3S0CA 3GDMA 2W79A 5KMYA 1KTBA 3IVSA 1HO4A 3VE7A 4DBDA 3ZWTA 1YDOA 4FIQA 3LHYA 1Z48A 3LV5A 3LHUA 6TIMA 4UMAA 4AWSA 1XUUA 3SGUA 3P81A 1QWGA 1ZAIA 4MPQA 3SZ8A 1SO4A 2Z2UA 4O28A 1OYBA 2A0NA 5IM51 4K6AA 2E1DA 5L9FA 1GQNA 4YL2A 3O07A 4FNUA 5FESA 1VR6A 5K4ZA 3I7RA 3EEGA 3KRUA 5LGZA 1XBXA 3C2RA 5DN1A 4ML9A 1GT8A 5G1TA 3IGXA 1OFAA 2WOQA 3G1VA 3SIZA 2V2HA 3N2XA 2ALDA 2ZZ2A 1OJXA 2AAMA 3I65A 4A21A 2OMAA 1X1OA 1N8FA 2VOMA 4LVFA 4YCOA 4EOUA 2ISSA 4HPXA 1FCQA 2ZA1A 6ALDA 4ICNA 2B7QA 3GK0A 5DY2A 4ZQMA 4K8EA 3WJXA 4H6KA 3W7JA 5H91A 4OE7A 1IXPA 3QW4B 4GC4A 2A2IA 4HT3A 4K7VA 4JX4A 2QEZA 3M5ZA 1L9WA 3HGRA 4YCPA 5K4XA 4HSNA 3GXTA 2J24A 1Q6OA 3ZS4A 2PE4A 5SWUA 3W70A 1WBJA 2G5WA 4AVFA 1GOXA 4IPIA 3TKFA 4ZL1A 3NNTA 1KW1A 2Q3RA 1KM3A 3WJSA 3MUXA 5F2MA 1BKSA 1NF0A 3TW6A 3MI2A 4K38A 1MSSA 3HPSA 3RK8A 1MXSA 3PS7A 4O17A 1J4EA 1TB3A 4XTIA 3HPZA 3N14A 1HO1A 3BLIA 3G1DA 3KVLA 1JRCA 4K37A 2TSYA 3W2UA 1XKYA 3P80A 4GRSA 3N73A 4OV9A 4OQVA 4N2YA 2ZFAA 2DZSA 4CQAA 4EWND 1AW2A 1EIXA 1XFBA 3LGEA 4ZQPA 4JIPA 1A5SA 3B8DA 1RR2A 3DI1A 4O4VA 4JTTA 3UWYA 1JVNA 5G5IA 4O8RA 3NQ2A 5L6UA 1FWTA 3N2MA 4HPJA 4DPQA 5HULA 3FEMA 3LLFA 3P5ZA 2Y7EA 1FQ0A 1W56A 2WKJA 1ME7A 4J9JA 4RZ5A 3PSWA 3DHDA 3MI3A 4DO4A 3MWAA 1JCXA 1W3NA 1YPIA 2Z0IA 3GKAA 3IIZA 4FNPA 1H51A 3I7QA 1KBJA 4UMBA 2VC6A 3NQGA 1EUAA 3Q37A 1I2QA 1RQHA 4FXSA 4OV4A 2P1FA 2ZRZA 4NNAA 2DZPA 2ATMA 1GZGA 4AH7A 4HNVA 3HF3A 3NL3A 2QUVA 1EP1A 3K30A 2I1OA 4JNMA 4RXGA 5FF3A 3A24A 3T40A 3B4UA 3A22A 1TPB1 4LV4A 4U28A 5I3JA 1G6CA 1YDVA 3BARA 3S1WA 4I7VA 3OVPA 5F1UA 1FXPA 2HS8A 2C3ZA 4NT0A 1G4SA 2O7SA 4PCFA 3P82A 3LX9A 2YZRA 2ZZ6A 2I14A 3O05A 1Q6RA 4D2JA 2CLLA 8TIMA 3M9YA 1SO6A 3TE9A 2XN1A 5AC7A 3BG3A 3MP5A 3THAA 1JULA 2C16A 3CEUA 5AYXA 3C0JA 3LB0A 4KFNA 2UV8G 1O4UA 2HS6A 3W7IA 3W1PA 1U83A 5FI8A 3LLDA 4WJEA 1LOSA 4X2RA 4MOZA 2C6QA 1R2RA 4DF2A 1BWLA 1G4PA 1W3TA 4MZ8A 5EMUA 4ORMA 1SO5A 5LHFA 2A21A 4OWGA 3E0IA 1VYRA 4IX0A 2BSLA 3W3OA 3WK3A 4WQ6A 3PBUA 4IJBA 3NOEA 4RXFA 4UTLA 3IIVA 5FF7A 1YPFA 3LTYA 2Y61A 5HUPA 1LBLA 1FDZA 1SSGA 5TQLA 3NQEA 3W7LA 4UR7A 4JYEA 3G0XA 3LCLA 2B7NA 1NF7A 5D30A 4S1FA 3L67A 3HIJA 1ZALA 4QM1A 3NM3A 3NQDA 1G7UA 4R7JA 2BX7A 4EF9A 1OYAA 2FTPA 4U4MA 1GYLA 2Y7GA 1QPNA 5LNUA 1B57A 3DFOA 4NNBA 1XBVA 3JR2A 2X30A 5DXYA 3PF3A 3M16A 2C13A 1D9EA 2BXVA 3EWYA 4JS3A 1P1XA 4ZQOA 1HFBA 1JR1A 3BLFA 4P61A 3TFXA 1FUYA 1OVDA 1TREA 3FKKA 1RVGA 2C14A 5DCEA 4UTKA 1R2TA 3CT7A 4HN4A 1UBSA 3W6YA 4BFAA 2ZA3A 3BG5A 2QCNA 3DZ1A 3B05A 5A5WA 2H6RA 5CPOA 1DL3A 1KBIA 4BI5A 1LLZA 4DELA 5BNKA 1O95A 1TPEA 3KOFA 3EKLA 3GAYA 3DFNA 1FWWA 2WO5A 3HGOA 5F2IA 1ICPA 4CCDA 1LLWA 3DKJA 3UWQA 1FDYA 5KZMA 2ZZ3A 5KZDA 3NL6A 4JXCA 3UY8A 2EF9A 4BF9A 1W31A 3LCXA 3NQ8A 3PULA 4GFSA 2Y85A 2FFCA 3GXNA 1DQXA 4DO5A 4OT7A 2PRMA 5HR6A 2DZXA 4LS2A 3G24A 1OFRA 2QUUA 3E9AA 1W54A 4WOZA 1KM6A 3M43A 5FEPA 4UMCA 1QPOA 2NXHA 1OX6A 1OHLA 2FPTA 2V82A 3UPBA 2VFEA 1NFBA 3NG3A 3T44A 1PIIA 5CZSA 2NV2A 2Y63A 3WK0A 2YDAA 1VCVA 2GPTA 3DFSA 3TAOA 4A22A 1IXQA 5G1YA 1LDCA 3LXAA 3EWXA 1K8XA 1SW0A 4QJ1A 2NLIA 4JY9A 4I7UA 3O15A 1RQBA 5K3VA 2V5BA 2V81A 3TH6A 3GR7A 4AB4A 1ZAJA 4IGHA 4L4LA 2QJIA 5AHFA 5KSWA 1TV7A 4RKAA 5AHEA 2ZQ0A 4IWWA 1LCOA 1H7WA 4FHAA 4LU0A 3CM4A 1FX6A 2QCEA 2XFWA 4O10A 3LRMA 2VFHA 1SW3A 5CZ0A 1UASA 2Q3OA 1LYXA 1VCFA 4IMFA 2YYTA 3CWNA 2JK2A 3GXPA 3CU2A 1H5YA 3RU6A 4JTSA 2V9DA 4QQ3A 1Z41A 4JIQA 3I6RA 4XWUA 1P5BA 2G95A 3C4UA 2R14A 3TMQA 4M5PA 4POCA 1IIGA 4O14A 2VEPA 2CLIA 1LRTA 3QM3A 3VE9A 3W7MA 5KITA 2QDHA 3O6CA 4QISA 2W6RA 3G1YA 4HHPA 4M7TA 5D37A 3W2LA 2P0OA 1KFBA 4O1CA 1IF2A 1TQJA 3ZFHA 1M5WA 1WV2A 1YXCA 3KVMA 3LHTA 2DZUA 2YXGA 4NX0A 3L0KA 4MIMA 3Q94A 3EX1A 4JYFA 4LNYA 4WX2A 1FBAA 4CNNA 1D3GA 1JCLA 4NJKA 1X6UA 4UNKA 2H90A 1SPQA 3GNNA 4UFMA 3QC3A 2YX0A 2CFFA 5CG7A 3EB2A 2NUYA 4N4PA 1MEWA 4UTHA 1ML1A 4N9DA 1WXJA 1TPDA 3IIOA 5FF0A 1Z44A 3LCGA 5D38A 3W1UA 4IXXA 5BRBA 1YADA 3U6WA 3NEVA 2GJNA 1S3HA 5EA9A 3C6CA 1XBYA 3TXZA 1H1YA 3NQVA 2NWSA 4WY0A 2WNNA 3ABSA 2RFGA 1OFQA 3QQ1A 4JTEA 3QFEA 2G97A 1YXYA 4MKNA 1OK4A 2E5BA 2OT1A 2E68A 3PB0A 4PL2A 1AG1O 4UCGA 2PRHA 3S5YA 3I7SA 1TRIA 4PODA 1GVQA 3HG5A 5CGQA 1YLVA 3DHFA 4PL1A 5MHBA 2F7FA 1SZEA 2QKFA 3W7PA 1EP2A 5C6MA 2LLEA 3SW6A 4UIOA 3Q58A 4JY8A 4DF0A 3DGRA 2Y6ZA 1XI3A 2F84A 5AC8A 4LS1A 3A21A 3OBKA 3M5YA 1PV8A 3NGJA 1AW1A 2CZDA 5AYYA 1KM0A 4M19A 5G2WA 4JD4A 2WPBA 4GUIA 4XBKA 3OHIA 2WQPA 4AMAA 3MJYA 4B5NA 4EIVA 1WQ5A 5CPMA 1AW5A 1KFCA 2YYUA 5K2ZA 2HSAA 2VXNA 3LCFA 5F1VA 3STEA 3KRSA 5D09A 4XTDA 4JTHA 4TMBA 3G22A 3HMJG 1OF8A 3TR2A 2WSRA 1ZFJA 5LZLA 4E2DA 3W1RA 4S2CA 2R94A 3QYQA 1IXOA 5K9XA 1W0MA 1WOAA 4FF7A 1VQTA 1L6WA 1XC4A 2AQWA 1O5XA 1EA0A 3STGA 1GVOA 3MO7A 4HNNA 5LGXA 4DEFA 3F4NA 1VZWA 2EGZA 1T0OA 3PAJA 1XCFA 3PBVA 3BGGA 5F4WA 3TA6A 1KA9F 2Q8ZA 4MVAA 4Z1CA 3S42A 4FNRA 2VFGA 1EWDA 3G1XA 2NX1A 4UNLA 4RJEA 5EY5A 3IVTA 1TV8A 3FJ6A 3PBYA 3LCHA 3VFLA 1FWRA 2FPVA 2NX3A 2KZHA 3HQ1A 1C8VA 3FYOA 3FIGA 4G1KA 5HMSA 4FNQA 3TFCA 3W07A 3EWUA 2CLEA 4W9TA 2CWNA 2QCFA 1V5XA 3GAKA 5HQEA 3G1SA 2NV1A 1W3IA 5CKSA 1VYSX 5KTLA 3QSRA 5BW6A 1T8XA 3C2EA 5F4SA 2Z1BA 1Q3NA 2B7OA 2TYSA 3M7WA 5D02A 1QCWA 1P4CA 2ZRXA 1JCYA 1SSDA 3SJ3A 2RDTA 5EPDA 3UY7A 3VKJA 3CQ0A 1TCDA 2CLHA 3R12A 3NPXA 1DHPA 1W1ZA 3JRKA 3N34A 1QO5A 4IX2A 1TYGA 1KFEA 1HL2A 1I4NA 3UXDA 3LRLA 4IMGA 1H61A 1L2UA 3RF9A 3P67A 1I2OA 1QMLA 2ZZ7A 4NJIA 3GDRA 3L21A 5DXXA 5J5RA 4O19A 5HUOA 3O16A 1VS1A 3DENA 1UUOA 3MBDA 1G69A 1FCBA 1SUXA 2ZBTA 4N4QA 2Z6JA 2PC4A 2CZEA 3W71A 3CEPA 1DV7A 2X16A 3GYEA 1TPC1 1ONRA 1QOPA 4JTFA 3OA3A 4WXZA 3ABRA 2FQIA 4ALDA 4FNSA 2E6AA 4N6FA 3OVRA 2ABBA 3R89A 2DJLA 3C3NA 3M5XA 4ORIA 3HGJA 4QSHA 1OABA 2YR1A 3M41A 4ZVJA 1ME8A 1A5CA 5I3HA 3RFAA 3W85A 3QMRA 5LSMA 4A2SA 5LNRA 2RDUA 3CIXA 1SZGA 5BOOA 3CHVA 1PE1A 5F4XA 2GVGA 1W5PA 5T26A 4TR9A 1F73A 3M6YA 3STCA 4N9BA 1OFOA 2E6YA 4JTJA 4BI6A 1ME9A 1OX4A 1OFEA 3W1XA 5LHEA 4K36A 3P5YA 4FX7A 4NVTA 3BVJA 5DBTA 3U2OA 1KFKA 1DORA 1LBFA 3QQ0A 2P10A 3NA8A 2D73A 4O0ZA 1QNVA 3MHFA 5HJLA 1GG1A 3O63A 2J9ZA 1SFJA 4ZQCA 3LHWA 2J6XA 4YMZA 1BEUA 4E0CA 2H3BA 3W7KA 2J9YA 4PC8A 1T99A 2E77A 4WY0B 1JQXA 3QEZA 3L5AA 2ZZ4A 1F2JA 3G0SA 4O50A 1UCWA 3W86A 4AF0A 4YLWA 2DZVA 2XN0A 4ZZ9A 3W1NA 1OK6A 1ZY9A 1I2PA 2B4GA 2GUUA 4H4IA 4WOQA 1M7OA 4GWEA 3CIWA 3L2IA 1F6PA 4ADTA 1L6YA 1KM2A 1TJRA 1W5MA 2ZCGA 4NZJA 2Y7DA 1ALDA 3S6DA 3W22A 2YFOA 4GUHA 2DORA 4Q32A 1SU5A 1TJPA 3W1TA 3O1NA 1YXDA 2ISWA 3G3DA 3HO8A 3NZ1A 1CW2A 4AHPA 1JCJA 5I3IA 2EHHA 2GOUA 3WFAA 3DFPA 1AK5A 1YYAA 5DY3A 3W88A 3R5EA 4I9AA 2BZNA 1TTJA 4KFOA 1D3HA 4AXKA 4FX8A 3W76A 5K9DA 3A9IA 3HG2A 3N9SA 4Q4KA 1ADOA 4RCXA 5F2LA 2BLEA 4O53A 3B0UX 1O94A 1RPXA 1XXXA 4KWVA 3W1MA 4HNTA 4O4WA 5FF2A 3FA5A 2ABAA 4WD0A 1VCGA 3FS2A 2Y62A 5LKYA 1Q6QA 2RHGA 4M6QA 4UFLA 2B0MA 3S5NA 1I45A 1YTEA 3NO5A 4R34A 1VRDA 1Z42A 3LI0A 3UXAA 2V30A 1B9BA 2VFDA 5AHNA 1F6KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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