4CQAA

Plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) in complex with idi-6273
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
373
structure length
371
Chain Sequence
FFLYDIFLKFCLKYIDGEICHDLFLLLGKYNILPYDTSNDSIYACTNIKHLDFINPFGVAAGFDKNGVCIDSILKLGFSFIEIGTITPRGQTGNAKPRIFRDVESRSIINSCGFNNMGCDKVTENLILFRKRQEEDKLLSKHIVGVSIGKNKDTVNIVDDLKYCINKIGRYADYIAINVSSPNTPGLRDNQEAGKLKNIILSVKEEIDNLEKNNIMNFLWFNTTKKKPLVFVKLAPDLNQEQKKEIADVLLETNIDGMIISNTTTQINDIKSFENKKGGVSGAKLKDISTKFICEMYNYTNKQIPIIASGGIFSGLDALEKIEAGASVCQLYSCLVFNGMKSAVQIKRELNHLLYQRGYYNLKEAIGRKHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title In Vitro Resistance Selections for Plasmodium Falciparum Dihydroorotate Dehydrogenase Inhibitors Give Mutants with Multiple Point Mutations in the Drug-Binding Site and Altered Growth.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 139
structure length 371
sequence length 373
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2014-02-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4cqaA00
2A85A 1RR2A 4MVAA 4O15A 1QOPA 1GQNA 3N3MA 5EPDA 3GB6A 3R2GA 3TJLA 2W0UA 3MBDA 4Z1CA 5HMSA 1I2RA 1JUBA 3EEGA 3ABOA 4JTKA 5D33A 1FWNA 4JTFA 1TPEA 4JY8A 3KVKA 3TC7A 3S6DA 4BFAA 1A5BA 1TJPA 1Y0EA 2ZBTA 2WNZA 2ZQ0A 1B9BA 4X9SA 4Y96A 1YPIA 5F4SA 3TQ0A 3ZFHA 1TTIA 2B0MA 1JULA 2V8ZA 1IIGA 2V2HA 2ZRVA 5HNRA 4JNMA 3QQ0A 2YSWA 1SW7A 5E1QA 5CZJA 4UTMA 2PRMA 3BGJA 2VOMA 2GUUA 2RDTA 2BZNA 3M43A 1ZJIA 1J2WA 4O28A 4NVTA 1A5SA 2YYTA 4MJZA 3VI2A 4EVZA 3PR2A 5CPOA 2E68A 3NQAA 3W71A 1PCKA 1H7NA 3WK1A 1JUEA 5KITA 4WZHA 3L9CA 3G1FA 5HR6A 3EX6A 4OBTA 2VFIA 1LTDA 2QDHA 4X3ZA 2Y63A 1KLZA 1OF6A 5EMUA 3EKZA 5HWJA 3DKLA 4MIMA 2CLIA 4HHPA 5FF4A 3JR2A 3LXCA 3PB2A 5C2XA 5FF2A 4C1LA 5AHEA 1MO0A 3L0GA 4TR9A 5HWNA 4LS0A 1SO6A 4O19A 1O5XA 3C2RA 3DI0A 4O1BA 2DJXA 1X7FA 3G1DA 3MBFA 3G0UA 5LNWA 3RNDA 2NXIA 2YGYA 4DPQA 1KTCA 3WK0A 2TPSA 1ZAIA 4MZ1A 4RZ4A 3STFA 3TCEA 3W7QA 1VR6A 2NZLA 5DCDA 3O16A 1KM0A 2BTMA 3DFNA 3IVUA 2RFGA 3EXSA 4IMFA 4UFKA 3DGRA 3W73A 1XI3A 2ZRWA 5I3KA 4KWWA 1TV8A 5AB3A 3ZWSA 2QF7A 1Q6RA 4A2RA 5CPMA 4E38A 4ML9A 3QH2A 2E09A 3HPZA 2CLHA 3N14A 3QC3A 5IBXA 3W86A 2E77A 4BK9A 4XTDA 4JTHA 3NZRA 3SECA 3QW3A 1OK6A 4WX2A 2B7OA 4KKXA 3MMTA 1W8SA 2TRSA 4E0CA 5G1YA 4FX6M 4WXZA 2H8XA 4NZFA 4UTUA 2WKJA 3NNTA 1O95A 5H91A 5EA9A 4E2DA 2YW3A 1TJRA 1KFBA 4AB4A 1PCWA 3S8HA 4IX0A 4UTIA 3W1XA 2EKCA 1FCQA 4CNPA 3DU0A 1MEWA 5DCEA 4HNTA 2ZA1A 3RLVA 1TPDA 3PSWA 1FDZA 1MZHA 3GDLA 3N9RA 4IQLA 4UFMA 3W7CA 4UTWC 2DZWA 4QQ3A 5FI8A 2VELA 2PE4A 1P5BA 3KAOA 4LRSA 2Q3OA 4LVAA 1GG0A 2B7PA 5FESA 5TQLA 3QF0A 2VKZG 4UUIA 4K8EA 3HMJG 4M19A 1F5ZA 3EWZA 4EOUA 1KA9F 3TQVA 4EIVA 4ZZ9A 4NNAA 3IIOA 1LOLA 1U83A 4ONVA 4DBEA 1SW3A 1LLZA 3NQVA 3Q2DA 1OFBA 5I3HA 4WY0B 1JJKA 4NJKA 3M47A 1X1OA 2A7RA 4LRTA 2ISVA 3RMJA 5D2WA 4P61A 3FLUA 4FNSA 1WOBA 2NWRA 3HPXA 3N19B 3GR7A 5AFDA 1XC4A 4H4IA 3N9SA 2A2IA 3GYEA 4FF7A 3BW2A 4HNNA 2J9YA 4JS3A 1UASA 2A1YA 4JYFA 4UIOA 2NV2A 1SZNA 3KVJA 4J9JA 2G96A 2H90A 3G1VA 3NQFA 4IPIA 1HUVA 2CU0A 3G1YA 4NJJA 3S5ZA 4ALDA 1TYGA 3D0CA 1ME8A 2WSYA 2OJPA 3WK2A 2ZRYA 4W9TA 1DL3A 3FFSA 3LCWA 2Y88A 1VLWA 1K7XA 1XFBA 2QUVA 3HO8A 2D73A 1H51A 1K8XA 1I8JA 1BWKA 3NYZA 3LTYA 1ZFJA 2QUTA 5HUOA 2DP3A 3NQ7A 3W7RA 2UV8G 1AW1A 3PS7A 3LBCA 1QPRA 3S0CA 3R12A 5F2GA 4N9BA 3TIMA 2HS8A 3W1RA 1K8YA 1SU5A 2XN0A 2B4GA 3W1NA 3G3MA 5A5WA 2A6NA 2FJKA 4MKNA 3M41A 3OEXA 4ZQCA 5DXYA 1KM1A 1WYIA 1YTEA 4LWWA 3UQNA 3T78A 1GVOA 3B8DA 3IEBA 2CZFA 1GVQA 2RH9A 4MFEA 5K9XA 5AHNA 1XUZA 1KBJA 5FEXA 3A9IA 4PTNA 4LW7A 4GBUA 2E5BA 1H7WA 1OX4B 2FQIA 1ICQA 4RZ5A 3Q58A 3C52A 3LTSA 5BOOA 4BF9A 1KFKA 1W56A 2R8WA 1W0MA 4FX7A 2NUYA 3CB8A 3M16A 4A21A 4O8RA 1KM4A 3TAKA 4CCEA 2FFCA 1WX0A 2YR1A 4JTJA 1FWWA 1EPXA 1SSDA 4ORIA 2VFEA 4QM1A 3L0NA 3C3NA 3MI3A 3QSTA 1YXDA 1A5CA 3G1XA 1GJPA 3WJXA 3M5VA 4OWGA 4WUIA 2VXNA 1AL8A 4DF0A 1BEUA 4MJMA 3FS2A 5FEWA 5DXXA 3BO9A 3PUOA 5IM51 1ZAHA 4CCCA 1IXPA 1VJIA 2XN1A 5LNRA 2O7SA 4X2RA 5C6MA 5BRBA 1AMKA 2ZRZA 2QCEA 3CEUA 4NNBA 4L4MA 2X16A 1G4TA 1U5JA 2BSLA 2PURA 3GDMA 3LBMA 5K4ZA 4OU1A 2RKXA 4QIUA 3TNOA 1HTIA 2V2CA 4RZ6A 1QR7A 1KW1A 4DF1A 1PV8A 3QMTA 4BI6A 2HMCA 3C61A 1FCUA 4NJIA 1ME9A 3LCIA 1QO5A 5BNKA 1LP6A 3DHDA 4KFPA 2QCGA 4TO8A 3GNDA 2QAPA 3PB0A 3SW6A 3HG2A 3MHGA 5CZ0A 1THFD 3O63A 1VS1A 4MPQA 3EX2A 4OE7A 2DZUA 3LLFA 4MLRA 3QJAA 2AGKA 2FB2A 4GUGA 3RFAA 3QW4B 4UC5A 2XFWA 3C56A 5D2YA 1SZFA 4JYEA 5D02A 3S5OA 3CEPA 2C1HA 1JUKA 2GQ9A 1SZGA 3A22A 3ATZA 3E9AA 3E96A 3KRSA 4JDBA 2ISWA 5J5RA 4TMCA 4RK8A 2RHGA 5L9FA 1S5VA 1FWTA 3UPWA 1EUAA 5KMYA 3PULA 3UZ5A 1ML1A 1LORA 4HPXA 4JN6A 3SR7A 1VQTA 3I7SA 1C8VA 1X8FA 3P60A 3IRDA 3KX6A 1L2UA 3LHZA 5KZDA 5F1VA 1GVRA 1X1ZA 1RPXA 3TJXA 4LC8A 2ZFAA 4OQVA 4MZYA 3NM1A 2AQWA 1WXJA 1RVGA 5G1TA 5E93A 2X1TA 4QNWA 4LUIA 1ZCOA 1CX9A 4LTSA 3LCXA 2QCHA 3VKJA 4AF0B 2VFFA 2GJLA 2HS6A 2ZTKA 5AYZA 4IOTA 2C14A 2ATMA 5G4WA 1N55A 1ZALA 4UCGA 2PRLA 3UWYA 3EWWA 1L6WA 3P81A 5J5DA 4R53A 3NQ6A 1LOQA 3BVJA 1LDCA 2Q8ZA 4JTGA 5HQEA 3VFLA 3QSRA 4I7VA 3RF9A 4DO5A 4ZQRA 2DZTA 4XKYB 4POCA 3OVPA 1SO5A 1TTPA 3NDOA 3ZWTA 3SFKA 1GYNA 4O57A 2Z6IA 2QJGA 1WBJA 1SSGA 4ICNA 2NUXA 4IUOA 1VCGA 1RD5A 3KHJA 1KV8A 3S5NA 3GDKA 1R47A 2DORA 2R91A 3FEMA 4LOCA 3P82A 3HG3A 3WJWA 1OX6A 4UTJA 1EX5A 2Q8LA 4DO6A 3BLFA 1W5MA 2ZA3A 2CLKA 3HPSA 2A5HA 2G95A 3HF3A 2ZZ3A 3THQA 3A21A 2E1DA 5EL1A 5D38A 3LI0A 3NPXA 2QEZA 2V5LA 3G3DA 3MP3A 4UTWA 4UR8A 2YYUA 3F4WA 1F6KA 4GNJA 2CZDA 3CT7A 5AOUA 3EWBX 4OV4A 4K39A 2J88A 2YXGA 3G24A 4DEFA 4LUJA 5FEPA 1I2QA 3TA6A 4NQ1A 1YDOA 1LRQA 5A8GA 5BMXA 2QKFA 2WNNA 3B0PA 1W54A 1S5TA 1K03A 1WV2A 3HG5A 4PA8A 1A53A 1PE1A 4FNRA 1WQ5A 3TFXA 2ATSA 3A23A 1SPQA 2NWSA 3TC6A 2G5WA 1YYAA 1ICPA 2GVGA 3C4UA 4BI7A 5D2VA 4S2BA 1GYLA 3P61A 1Z41A 3NZ1A 1J5TA 2CLMA 4JR5A 4X22A 2CLLA 3G22A 4O1DA 1MEHA 4N2YA 4IJBA 1VHNA 3NL6A 5LKYA 2C3ZA 5EBUA 7TIMA 3NL2A 4O1AA 1K7EA 5K9CA 5CSRA 1JVNA 1QAPA 3MHUA 2WSRA 6ALDA 1YDNA 1IGSA 3PG9A 3EX4A 5CSSA 2C15A 4AH7A 1IXOA 4XQ6A 1H7PA 1SUXA 4HIBA 5LHFA 1OABA 1KM5A 4R33A 1F05A 2YZRA 1I45A 3L5MA 3NPWA 1F74A 3GVGA 2X30A 3ABRA 4DELA 4NXKA 2AAMA 1G69A 4IMGA 3M1ZA 3NPUA 3W07A 3R13A 1GT8A 3BG5A 3NQGA 1JR1A 5G2IA 4O53A 2ZZ2A 3HGOA 3SGZA 5H2ZA 4QJ1A 3F1QA 4RXGA 3O15A 1UUOA 1XBXA 4UFLA 5LNSA 3W7IA 1XL9A 2QCMA 3WJSA 1DBTA 1PIIA 2QCNA 4JTSA 3UWUA 1K02A 3W9ZA 1MXSA 4Y90A 2WSQA 4E2BA 2H3DA 3G1HA 1VHCA 4O13A 1Z42A 1LBMA 3LHTA 1XDLA 2V81A 2ZZ1A 1EP3A 3FA5A 2JKEA 5G2HA 1KFCA 3GIYA 3UXAA 1IXNA 3C2OA 4FXSA 4ZQPA 5U4NA 2JK2A 2LLEA 1OF8A 1K7FA 1I2OA 1RZMA 4ORMA 4YCPA 3GNNA 1EA0A 3QFEA 5D03A 1VCVA 1F73A 2FDSA 3DXIA 3UWZA 2VEIA 3M7WA 4IXHA 4IMEA 1O94A 1H7OA 2OZ0A 3NGJA 4AHOA 3V1PA 4OHQA 2ALDA 1LM1A 5K2ZA 2QCDA 4MZ8A 3STCA 4HT3A 1XUUA 3B03A 1SQ7A 3EWXA 1W37A 2O7QA 5DLCA 4LVDA 1TPH1 1DVJA 3LRLA 3T40A 1KM3A 3O6CA 3MYPA 3K30A 3C6CA 3W74A 1SO3A 3L67A 1R30A 3C0JA 2Y6ZA 5FF7A 4ZQNA 4PH6A 3S1WA 3GDTA 3T44A 1XBZA 5F2IA 3NM3A 2WQPA 4Q33A 3U8GA 4GFSA 3GKFA 3KXQA 1EB3A 4YMZA 4FEZA 3FKKA 4A2SA 1AL7A 1G4SA 5FEZA 3G1SA 2E5CA 2C13A 4ZVJA 2J9ZA 1N8FA 3QQ1A 2GQ8A 3KVLA 3OVQA 3QYQA 1MSSA 5DELA 5AHLA 3PBUA 5ABTA 1W5NA 3W1LA 2TMDA 2ZZ6A 3A5VA 4NX5A 2DZXA 4FNPA 2WV8A 4Z0JA 1W31A 2QCCA 3R5EA 3CHVA 4UMBA 2ZRXA 1E51A 5CPNA 2GOUA 3GX9A 5LSMA 2VC6A 1ZNNA 3OG3A 2J27A 3GKAA 1DQWA 1OYCA 1OFOA 2VFDA 3CC1A 1VH7A 3O1NA 3QZEA 1K3UA 3IIVA 3LCHA 4GWEA 3O6DA 3W2JA 3M44A 5AYYA 2B7QA 1HO1A 2A21A 4UXDA 1XBYA 4RR4A 3DAQA 2V9DA 3S42A 3MYOA 4LVFA 5I3JA 3UPBA 1TB3A 5G5IA 1TRDA 3UWWA 4ADUA 3HG4A 1AK5A 2EPHA 3OVRA 4BWLC 1G6CA 5SWUA 3W87A 1H61A 3BARA 2PCQA 1KTNA 3UYCA 5I3IA 1DV7A 5G2WA 4DQWA 1KBIA 3FJ6A 5F2LA 3NL3A 1OYBA 1EWEA 1FUYA 1XM3A 4YCOA 1QO2A 3GDRA 3E02A 3CWOX 1N7KA 3W72A 2P0OA 3LLDA 1FBAA 5F4WA 1KFJA 1F76A 5D2TA 2V30A 5K3VA 3BV4A 3DFOA 3TSDA 4M5PA 4AHQA 1A5AA 3L21A 3OBKA 1OYAA 4KFNA 4RXFA 3CM4A 4JD4A 3W1TA 1YTKA 1GWJA 5TBOA 5LNUA 3HQ1A 3EKLA 3NQCA 3GAKA 4A22A 3QRHA 3B0UX 3JRKA 3HB9A 4M7TA 4LS2A 3PC0A 4JTEA 2ABBA 2Y89A 2NX9A 4MUZA 2JKAA 3NQ8A 1O60A 1JCYA 3TKFA 2CFFA 1B57A 1ONRA 2DZVA 2F84A 2W6RA 4JTIA 5EKYA 4UMCA 5DCBA 4Y8FA 3T55A 3LOTA 2Q3RA 3IV3A 1UB3A 4FNQA 5D05A 2A7PA 1QNVA 2P1FA 1M6JA 2TYSA 2X2GA 4EWND 1HL2A 3CLMA 3ZS4A 2Z2UA 4GXMA 1JCMP 2NV1A 1KTBA 1PS9A 1JCXA 2PC4A 4O4VA 3W7PA 3BG3A 1DKWA 4GRSA 3S1XA 1TTJA 2QDGA 1AW5A 1SFJA 4OV9A 2V82A 2ZTJA 3F03K 4MY9A 4UFHA 2OT1A 3E49A 3GXPA 1QPNA 2NX3A 4MY1A 1H50A 2EHHA 3DKJA 1OX5A 3TXVA 4HN4A 4LY8A 1Z48A 4CNOA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1YQ2 A;  1XYB A;  3PHA A;  3OYX A;  3PJT A;  2CIP A;  4UBP C;  1A3W A;  3N3M A;  1XV8 A;  5EPD A;  2BFG A;  3R2G A;  2Y8U A;  5HMS A;  3MVT A;  1JUB A;  3BCF A;  4JTK A;  5D33 A;  3DEC A;  1TA3 A;  1MFV A;  4JTF A;  4RE3 A;  3S6D A;  1A5B A;  1TJP A;  2ZBT A;  2EJA A;  3THC A;  3ZFH A;  1PTD A;  2EPL X;  1JUL A;  2QGH A;  2ZRV A;  3OG2 A;  4KGJ A;  4JNM A;  5E1Q A;  1W32 A;  2VOM A;  1RJR A;  2RGM A;  1B31 A;  2OB3 A;  3RCN A;  3CMJ A;  4D8A A;  2PP1 A;  3KOZ A;  3FY1 A;  3AMG A;  5ABH A;  2E68 A;  3NQA A;  4GYJ A;  1DIE A;  3TYU A;  3A9B A;  1MW3 A;  4D6E A;  5KIT A;  3BAN A;  2OOF A;  3L9C A;  1JG9 A;  3QV7 A;  3EX6 A;  2C1I A;  4P7R A;  4OBT A;  4C6M A;  5KZ6 A;  1LTD A;  2P8C A;  4YNG A;  1E1C B;  3BCJ A;  4KWS A;  3NDY A;  3DKL A;  1SYT A;  3ZQ9 A;  2Y0F A;  4HHP A;  5B7Y A;  1QI0 A;  2PP0 A;  4DWS B;  5FF2 A;  3MKK A;  3BUR A;  2NSX A;  3L0G A;  2XWE A;  5HWN A;  5A94 A;  4FA3 A;  3BL3 A;  4XAP A;  1FRB A;  3G0U A;  3RND A;  2NXI A;  4QS6 A;  2REQ B;  2YGY A;  4DPQ A;  1LLO A;  1PX8 A; 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