4DELA

Active site loop dynamics of a class iia fructose 1,6-bisphosphate aldolase from m. tuberculosis
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
345
structure length
345
Chain Sequence
PIATPEVYAEMLGQAKQNSYAFPAINCTSSETVNAAIKGFADAGSDGIIQFSTGGAEFGSGLGVKDMVTGAVALAEFTHVIAAKYPVNVALHTDHCPKDKLDSYVRPLLAISAQRVSKGGNPLFQSHMWDGSAVPIDENLAIAQELLKAAAAAKIILEIEIGVVGGEEDGVANEINEKLYTSPEDFEKTIEALGAGEHGKYLLAATFGNVHGVYKPGNVKLRPDILAQGQQVAAAKLGLPADAKPFDFVFHGGSGSLKSEIEEALRYGVVKMNVDTDTQYAFTRPIAGHMFTNYDGVLKVDGEVGVKKVYDPRSYLKKAEASMSQRVVQACNDLHCAGKSLTHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Active site loop dynamics of a class IIa fructose 1,6-bisphosphate aldolase from Mycobacterium tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
molecule tags Lyase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 138
structure length 345
sequence length 345
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2012-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4delA00
4OT7A 1YXYA 2ATMA 4K7YA 4NXKA 3UY7A 4DELA 3NQGA 4R53A 5FF2A 5I3FA 1MEHA 1G67A 5K3VA 3LXCA 3W1TA 3A5FA 3R2GA 1JCMP 3NQ6A 4LOCA 3NDOA 3TSBA 1L9WA 3W70A 1LDCA 2QCMA 4LVGA 5LNVA 3NGJA 1KV5A 4QAIA 4GXMA 1TPWA 4O13A 1P5BA 4LUIA 3W1LA 5E0KA 2WV8A 3HIJA 3PS7A 5FEWA 1SW3A 3W7OA 2Z6IA 5K9XA 3USBA 4HHPA 3HQ1A 3LCLA 1I2QA 5CGQA 1HO1A 4IOTA 1KTBA 3E12A 2C15A 3NM1A 4NX5A 1GZGA 2G95A 4FF7A 3N2XA 4UTJA 5D2TA 1SZGA 2FPVA 3TV8A 4UFJA 3INPA 4GUHA 2A7RA 2B7PA 3THAA 3LBCA 1QAPA 1TJRA 4RXGA 3LRKA 3C56A 1JRCA 5CSSA 4KFNA 2WPBA 3BG3A 5KSWA 3TU9A 4UTIA 2P10A 2Y61A 3PSVA 2DP3A 4M6QA 1VZWA 2CZDA 3W1UA 4XWUA 3W7HA 2B7NA 2Z1BA 2CLEA 1RVGA 1JVNA 3NQDA 4O1CA 5CZJA 3HB9A 4D2JA 2DZTA 5H2ZA 1ICSA 3I6RA 1B4EA 3GDRA 1DJNA 3RK8A 5AFDA 1F74A 3S1UA 1Q6OA 4FX6M 3MYOA 1P1XA 3LV6A 3GZ3A 1VHCA 3PUOA 5DXXA 3EWWA 1I8JA 4BK9A 4Y8FA 5AC8A 2HS6A 1SZFA 3M9YA 1JCXA 5CZSA 4HIBA 1CX9A 5LNUA 2V9DA 5AOUA 3SSJA 4WXZA 5G4EA 4ZL1A 3L5AA 2V2CA 2VXNA 3JR2A 2A5HA 4ZQOA 3HJZA 3WJZA 1UCWA 2ZZ1A 2H6RA 1D3GA 1FXQA 4FNRA 1U83A 2FB3A 1ML1A 3I7QA 1WYIA 3IGXA 3W1QA 3HGRA 3NPVA 4WY0A 2HMCA 4UFKA 2QCCA 1KM4A 5TIMA 2W0UA 3DHDA 4WY0F 3L66A 3ABSA 3FJLA 2FPTA 5C54A 1T8XA 4YMZA 4Z1DA 3UWYA 5FF4A 4K8EA 1LM1A 4HPXA 5L6UA 3N3MA 3HG5A 3K30A 4MLRA 4GRSA 5LNWA 2NXGA 4HSOA 3LHYA 1EUAA 4DBDA 4JTHA 5HWJA 4O4WA 4U28A 5HWNA 3OIXA 1BWKA 3BLFA 4IX2A 1BKSA 3L65A 5D37A 2CLMA 3CIWA 3C2VA 2E5DA 1TPEA 5AHEA 3U2OA 4R33A 3C0JA 3W88A 1ZCOA 3W22A 4MYXA 1GT8A 3EWYA 1IGSA 1H7RA 4JXCA 1TTQA 1BEUA 3OHIA 3B06A 4O1DA 3AO0A 3BARA 3S1XA 3WK1A 3FOKA 1OFPA 3EKLA 3NPUA 5FEXA 3HOJA 2B7OA 4Q32A 5K7JA 3LTSA 3IGUA 3QJAA 4FNSA 3O6YX 4N9BA 1F7BA 3EXRA 2NX9A 5F4SA 2BXVA 2X16A 3QW4B 4FXSA 5AHIA 2ZRVA 3SGZA 4JY8A 4XKYA 3P8JA 4S1FA 4X2RA 3TQKA 2ZRXA 5I3KA 3IIZA 4RJEA 1KFEA 3W87A 3TFCA 1JQVA 1DV7A 3QMSA 1XBZA 2ISSA 3NPWA 1LOLA 4PA8A 4M5PA 3NNTA 1H1YA 3HG4A 1VH7A 3CLMA 5EYWA 3NQ7A 3R12A 2VEPA 2H90A 1XDMA 4TU1A 3UWVA 3TMLA 4NX0A 3TA6A 2HSAA 4UTTC 3TFXA 3KXQA 3DFQA 2QCNA 1IIHA 4O52A 1TV7A 3HGSA 3RLUA 1F6KA 5DCDA 1G4SA 2B7QA 3H54A 1ONRA 3AJXA 3MP5A 2LLEA 2O7QA 1VQTA 3FIGA 1FDYA 4WOZA 1EWEA 3DZ1A 3KVJA 1JCJA 5F2LA 3SIZA 1OF6A 3NA8A 2YZRA 1S5WA 3QQ1A 1L6SA 2WKJA 3CC1A 4FX7A 3VCRA 4CNOA 1FWWA 2UV8G 4GWEA 2Y62A 3F03K 4NU7A 2FDSA 5EMUA 5KZMA 1XL9A 1FUYA 1TPVA 4O0ZA 4DPPA 1IF2A 4N6EA 3DFOA 5K2ZA 1LROA 3DHFA 2J27A 2OJPA 4JIPA 1I45A 4O50A 4XUGA 2YGYA 4FNPA 3MI2A 5H91A 1IXQA 1OHLA 3O1NA 3G1AA 2A85A 3W7JA 1F6PA 1R46A 1YYAA 2WSYA 3TQVA 2E6AA 5LGZA 5LKYA 1SZEA 1G4PA 1Q6QA 2A0NA 4LS0A 2WQPA 4GUFA 4LV4A 4CQ8A 1H7NA 5F1UA 1YPFA 3W7GA 1PHWA 3W07A 3O05A 3WJWA 5HMSA 5L9FA 2GQ9A 4PL1A 1GEQA 2R14A 2V8ZA 5LHEA 2FJKA 1VRDA 2WSRA 1A5BA 2PRHA 1H50A 3MBDA 4EWND 5KTLA 4BI7A 4ZQNA 2PE4A 3P62A 1OVDA 5D02A 4MY9A 3M5ZA 5AHLA 3F4NA 1KM6A 3GDKA 2ZRWA 5G4WA 4LS1A 5HULA 3OG3A 3ANYA 4JTUA 5G2IA 1RD5A 4FNTA 2C0AA 2DZWA 1VCGA 3TK7A 4YL2A 4IUOA 4POCA 1WQ5A 2A1YA 3DU0A 4M6VA 1SO3A 3L67A 2F7FA 4BWLA 1OX4A 3GKAA 2Y6ZA 5D04C 3PB0A 4O8RA 2KZHA 2AAMA 2DZXA 2JKAA 3UQNA 5HQEA 5D2XA 3NL3A 3RFAA 4Y90A 3THQA 2NXHA 3G24A 4H3DA 4AAJA 1THFD 4CQ9A 1TPDA 3PUDA 3NQVA 2GUUA 5KZEA 4TR9A 1X7FA 3W7EA 3NYZA 3UYCA 4QQ3A 3S5NA 5G5IA 4IGHA 1OYCA 4ADSA 3B0PA 4O18A 1UBSA 1ME8A 1GVRA 1T99A 3GK0A 1P0KA 3O8AA 3MP3A 3QPYA 2HS8A 3W75A 3C2RA 3GXPA 1E51A 5AYZA 4UR8A 1NEYA 3NQCA 5DBUA 1XM3A 2AGKA 3BW3A 4JDYA 3IIXA 1TPFA 1M6JA 2CLIA 3MI6A 1A5CA 1OF8A 1RQHA 4W9TA 1XCFA 2H8ZA 3W71A 3QEZA 3TJLA 1EX5A 4IPJA 2E68A 3ZR4A 1Q6LA 4RZ5A 1G6CA 1LP6A 3NQAA 3S5OA 2DJXA 3SECA 1LBFA 2WO5A 4QIUA 3S5YA 4AF0B 2EHHA 3P84A 3GIYA 5J5DA 1LRNA 3LGEA 1LRQA 2CLHA 5LNSA 5LGXA 1G7UA 3TKFA 4IJBA 1ICPA 1VCFA 2GQAA 1H7XA 1EEPA 3UPWA 3TH6A 1GWJA 3LLFA 4KWVA 3N14A 4IX0A 3VE7A 2JK2A 4MOZA 4ZQMA 1WXJA 5G1TA 2JGYA 3LHTA 2NV2A 3SI9A 3LX9A 1PE1A 1QWGA 3P74A 4DPQA 4JX4A 3W23A 4A2SA 3KRZA 2FPYA 3IV3A 4E38A 3NVTA 1WOAA 1KBIA 5DY2A 5DN1A 4HKPA 1J5TA 4JGDA 4LV9A 2QJHA 5I3HA 3CHVA 3ZWTA 5MHBA 4CCDA 3IRDA 3CT7A 5DLCA 3QQ0A 5EBUA 3RLVA 1WOBA 4EF8A 1LRTA 2WJZA 5IM51 2CLKA 3E0IA 4RR4A 4N4PA 1EPXA 4Q33A 4O11A 3KAOA 2GJLA 2J88A 1L2UA 4LVBA 4O1AA 4JNMA 3GXNA 1AL8A 3WK0A 1EB3A 3GLCA 4QNWA 4HNVA 5HJLA 5F4XA 3IVUA 1DOSA 4PODA 4FIRA 2J6XA 1EP2A 1XBYA 4XBKA 3LCIA 3KVKA 2A7PA 1JJKA 4FNQA 3P61A 1F5ZA 2ZRYA 2J9YA 1EP1A 1MEWA 1N8FA 1B4KA 5T26A 4AHOA 1LOSA 4UMBA 1P4CA 2I14A 4IXXA 3EWXA 3LRLA 4ADUA 2Y7FA 1TPB1 4LRSA 4NT0A 1JCLA 1IXOA 2CLFA 5BOOA 3NZRA 6TIMA 4KWWA 4UFLA 3L2IA 4TMBA 3SZ8A 4RZ6A 3TXVA 2V2DA 4MPQA 5DCBA 4AMAA 1ZAHA 4HSNA 1TIMA 3M16A 2E09A 1UUMA 2OZ0A 3EX4A 3S8HA 2ZZ5A 4HNUA 3MW7A 4JY9A 5F2IA 1QPOA 3NQMA 3IIOA 3PC0A 4UTHA 2Z0IA 3LDVA 2VFIA 4YWIA 3TSMA 2H3BA 1XUUA 1KM0A 1W54A 3P5ZA 3ZS4A 4JYEA 2JGQA 4N2YA 3GNDA 4UTLA 4WQ6A 1HG3A 1PCWA 3QF0A 5C6MA 4XZ9A 2VEMA 2H8XA 4DBEA 3G3DA 2FLIA 2Y7GA 2ZQ0A 4N4QA 3C2OA 4OGZA 5FF3A 4E2DA 3PG8A 4R34A 3GR8A 2FIQA 1GVFA 1K8YA 3CPRA 1I2NA 1GTHA 5AYXA 3HMJG 5AN7A 4UFMA 3MJYA 1VR6A 1W5PA 1J2WA 3BPWA 3E96A 2ZBTA 2RKXA 3TDFA 5IBXC 2QAFA 4JICA 3DFSA 3OVRA 3TX9A 4BI6A 1VPXA 1WBJA 2QDHA 3QMRA 4I9AA 2DORA 5C5YA 4ORIA 3MHGA 4JN6A 4M6PA 3W72A 1W37A 5HNRA 5CZTA 4GUJA 4NJIA 3JRKA 3MWAA 2BWGA 1H60A 5LSMA 4DEFA 3H55A 4IMDA 2A7NA 1LZOA 1J4EA 1VLWA 3TUUA 4KKXA 4DO6A 1NVMA 3LLDA 4LS2A 3G8RA 4MLJA 3HPSA 1PV8A 3GAKA 4GJ1A 3QPZA 3HGJA 4DF1A 4QSHA 1TQXA 2X1SA 4OV4A 5CZ0A 3LTPA 4A2RA 1W8SA 3W7LA 1AL7A 2H3DA 4RKAA 4WD0A 1RZMA 2EGZA 5CSRA 3QRHA 1KFKA 4L4MA 2VELA 4LNYA 2ABBA 4QISA 5D03A 4O16A 5LNRA 3LCWA 3N73A 2TMDA 1W0MA 3TW7A 3W7MA 3NL5A 3C3NA 1GOXA 1F73A 1K8XA 1K7EA 2ZA3A 3S6DA 3B0VC 8TIMA 5AHNA 1RR2A 3KVMA 2EPHA 5D09A 1FBAA 4DQWA 3DI0A 3V1PA 1TPC1 1OFDA 2A6LA 3KHJA 2P1FA 3QC3A 1T96A 2C1HA 3MO7A 4ALDA 3M5VA 2ZFAA 1X1OA 3HG2A 3ABRA 1NFBA 3DKLA 1TTJA 1WDWA 3MP4A 1QCWA 2QCLA 3OBKA 3T40A 4O12A 5F1VA 3BW4A 3LM7A 1LORA 1O95A 1OYBA 3O6DA 1LYXA 1UB3A 1TRIA 4NNAA 3PBYA 2GOUA 4JYDA 5CPLA 1GVOA 1G4TA 2GVJA 3BV4A 4Z1BA 5LZLA 4N6FA 4AH7A 1DVJA 1H61A 3RMJA 1K7FA 2YYUA 3GX9A 1UASA 2NUYA 4YXGA 4UMCA 4TMCA 1JUEA 1KBJA 4C1KA 2ZCGA 4WOQA 1W1ZA 1R2RA 2WSQA 1S3HA 1H51A 1ME7A 1MO0A 3UY8A 3M5XA 1OG0A 4O15A 2VFGA 2XN0A 3WJXA 3TAKA 4XKYB 4EF9A 4MJMA 2WNQA 3M5YA 1ADOA 2ZYFA 3W1XA 5I3IA 2FTPA 3TROA 4LVAA 1SSDA 1L6YA 3C2FA 3NQEA 2G5WA 5AHMA 5F2MA 3W7IA 5DCEA 1W3TA 4LTSA 3UNDA 1O94A 2E6YA 3L9CA 5I3GA 2B0MA 3LHWA 5HINA 2QCDA 3LHVA 3EWUA 3G0XA 3UZ5A 4WZHA 2ATSA 3W3OA 2V0TA 2PRLA 4JIQA 2ISVA 2QJGA 4O53A 3S0CA 1FWNA 2C16A 1VYSX 3LOTA 1KM3A 2TYSA 4BF9A 4NVTA 1W5QA 2F84A 1Q45A 1XDLA 4MKNA 1A50A 1YDOA 5ABTA 5C55A 1YLVA 3TW6A 3H53A 2W79A 1RQBA 3EWZA 2QCGA 4Z0JA 3YPIA 1JUKA 3L0GA 3CWOX 3R89A 3QW3A 3NXFA 5DBTA 1SW7A 1YDNA 1W5NA 1GJPA 3IIPA 1AG1O 1KFCA 4JR5A 2QJIA 5FESA 3PBVA 4UTWC 3LHUA 3G1HA 1KLYA 3ABOA 3UPBA 3UXAA 5D2VA 5HUPA 1OFOA 3MHFA 1SFJA 3W1RA 2BTMA 3LB0A 1LOQA 1DQWA 4LC6A 7TIMA 1SO5A 5TQLA 3HPXA 3G1FA 4NNBA 2CZFA 4EOUA 1ZHAA 3PM6A 3W2NA 3WJSA 2Q8LA 1QPNA 1LLZA 2OCZA 2YXGA 1TV8A 5D38A 1P0NA 1O5KA 1W56A 3LTYA 1CI1A 2NUXA 2YDAA 1L6WA 2ZTJA 2NZLA 2Y89A 4JTJA 2CWNA 4RXFA 3TC6A 1KV8A 4JTLA 1TMHA 1G69A 1GG1A 1OFRA 1PS9A 1TYGA 3NL2A 3UWUA 1M7OA 3C6CA 1OYAA 2NV1A 4JTTA 1AW1A 2GQ8A 2YX0A 2QCEA 3FJ6A 2XFWA 3QSTA 3W84A 1VC4A 3QM3A 5KZDA 1GTEA 1Q3NA 4EIVA 3DGRA 4NJHA 3EX2A 1PIIA 2C6QA 5K9DA 4AWTA 4PH6A 3M6YA 1TQJA 3NPXA 2E1DA 4G1KA 3HF3A 1AW2A 3HGOA 5K4XA 1FCUA 1JRBA 4AHQA 4O4VA 2CLLA 3DFTA 1ME9A 1TJPA 3MI3A 1B57A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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