4EF8A

Crystal structure of dihydroorotate dehydrogenase from leishmania major in complex with phenyl isothiocyanate
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
SMSLQVNLLNNTFANPFMNAAGVMCTTTEELVAMTESASGSLVSKSCTPALREGNPTPRYQALPLGSINSMGLPNNGFDFYLAYAAEQHDYGKKPLFLSMSGLSMRENVEMCKRLAAVATEKGVILELNLSCPNVPGKPQVAYDFDAMRQCLTAVSEVYPHSFGVKMPPYFDFAHFDAAAEILNEFPKVQFITCINSIGNGLVIDAETESVVIKPKQGFGGLGGRYVLPTALANINAFYRRCPGKLIFGCGGVYTGEDAFLHVLAGASMVQVGTALQEEGPSIFERLTSELLGVMAKKRYQTLDEFRGKVRTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Target sites for the design of anti-trypanosomatid drugs based on the structure of dihydroorotate dehydrogenase.
pubmed rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Leishmania major
total genus 111
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.3.1: Transferred entry: 1.3.98.1.
pdb deposition date 2012-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 4ef8A02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ef8A01
1SZGA 3MWAA 1KM5A 1SSDA 4XBKA 3UXAA 3HB9A 2YYTA 3NO5A 4DO5A 1IXOA 1JVNA 2G95A 4M6PA 5CPMA 4UR8A 1P0KA 1YPFA 5AC8A 4O14A 5IM51 1WQ5A 5HWMA 4NUWA 3S1VA 3TQKA 3QH2A 1WYIA 4O28A 5AYYA 1LZOA 3EX3A 5DBUA 3W86A 1DVJA 1YXYA 1UCWA 3LTSA 3GYEA 5FEZA 2J9XA 3S5YA 3DKLA 2R14A 1ICPA 1S5WA 4S2BA 4K39A 1JCJA 4O13A 4LV4A 3RNDA 5C55A 3GNDA 4C1KA 1XDMA 5FEWA 3NM1A 4NQ1A 4LS0A 2A6LA 3P67A 1VYPX 1G6CA 3S6DA 2UV8G 1C8VA 3NQAA 7TIMA 5KITA 5GVJA 3QRHA 3SZ8A 3UWQA 1QPOA 3TSMA 3NQ7A 1GJPA 2B4GA 4O52A 1LTDA 4Z0SA 2WNQA 3S1UA 1V7YA 5EA9A 4JS3A 1TV5A 3PSVA 1VGAA 4IJBA 4AHOA 3EX1A 3ZWSA 3S0CA 2C14A 2X30A 1GTEA 3N9RA 1JUEA 6TIMA 4M6VA 1I2RA 4JTEA 3TC7A 2VFGA 1H7WA 1W3TA 5LNVA 2OZ0A 3NOEA 3P5ZA 5C2XA 4JXCA 3RU6A 4JNMA 1OYCA 1GZGA 4KWVA 3UY8A 2VFFA 4NXSA 1TJRA 1TV8A 2ISVA 5EBUA 1IGSA 1GOXA 1OX6A 2RHGA 2H90A 1H1YA 3DI0A 3NPXA 3HIJA 5LNUA 5I3HA 5D2YA 3IVUA 4XKYB 4DEFA 3C2EA 3IIVA 5LGXA 1IXNA 5LHEA 4JTUA 5FESA 1FUYA 1H7OA 4MFEA 4UFJA 4UUIA 1SFJA 2CZ5A 2E5CA 1DQXA 4CLMA 1G4TA 3UWWA 2GUUA 1GT8A 3OVPA 4WQ6A 3T55A 4JD4A 1H7NA 3H55A 4DBDA 3IRDA 1DHPA 3PAJA 3MYPA 4FNUA 2C0AA 4U4MA 2ZZ2A 1OFDA 3INPA 4MJMA 4O15A 3W7QA 5D38A 1TPB1 5HUOA 1JCLA 3QSTA 2BXVA 3IGXA 3GXNA 3W2KA 4N02A 3IIZA 2VKZG 1F73A 3WK3A 3MBDA 3LX9A 3LGEA 4GE8A 1LRTA 2Z6IA 1F76A 1QPRA 3LTYA 3PULA 1X8FA 4LS2A 1OG0A 3CM4A 5KSWA 2NX1A 3RK8A 1BKSA 1ME7A 4AF0A 5EMUA 4WY0F 4AWTA 3KRSA 2V8ZA 3BG5A 3TX9A 3QMTA 1SO5A 1XDLA 2A21A 4HIBA 5LKYA 4CQAA 5DCBA 5T26A 4S1FA 5DELA 1F2JA 5A8GA 5K3VA 3NR0A 3QZEA 4Z1AA 2I9EA 3NXFA 3Q2DA 2NWRA 3ATYA 1TQJA 4DF1A 1TO3A 1W56A 2CU0A 3FS2A 1SPQA 3B04A 1TRIA 1W5MA 3PBWA 3UNDA 2JKPA 4GRSA 3W7KA 3C2FA 3LXCA 3DZ1A 1TMHA 3W84A 4RXFA 1TV7A 3PB0A 3TFXA 4O1CA 1OF6A 4WY0A 1KTCA 3NQ2A 1YDOA 3STFA 3W7EA 4Q4KA 3STCA 1TYGA 4O0KA 1GWJA 4GUJA 4DELA 3W3OA 2YZRA 2X1TA 3TROA 1SW3A 5DXXA 3QW4B 1PL9A 1MEWA 4TO8A 4X22A 3LXAA 3GDMA 2ATSA 4X3ZA 3GNNA 3EKZA 1O5XA 1FCUA 4BFAA 1WA3A 3HGRA 4GUFA 1OX5A 4PTNA 4N4QA 3DENA 1TTIA 2ABBA 4GUIA 2XN1A 4AVFA 1T96A 1VZWA 2NUWA 1KFBA 3DFNA 2EPHA 4YCOA 3P61A 3I7QA 2QJHA 3W1TA 1SQ7A 1JCNA 1XBZA 4LU0A 2E68A 1AK5A 4UFMA 3STGA 1OF8A 1K8YA 4H6KA 1FDJA 4MIMA 3P8JA 2QCCA 3T78A 3KHJA 2Z6JA 1R46A 2Z1BA 4CNPA 4KFPA 2QCHA 2QKFA 1H7RA 3P80A 3NG3A 2A5HA 3BK0A 4ADTA 1DOSA 1LOSA 3NZ1A 4PL1A 1QMLA 4ONVA 4OWGA 1K8XA 3LB0A 3DKJA 1JCXA 2VC6A 4MYAA 4KFOA 5F4SA 3W2JA 2OX1A 4IPJA 2J9YA 3TK7A 1RPXA 4X2RA 3QPYA 3T7VA 1GQNA 1GEQA 4EF9A 1QPNA 3MP5A 3UPWA 4FNRA 1QAPA 4DBEA 1EP2A 3M41A 4MY1A 3PM6A 3GLCA 3W75A 4EIVA 5K4ZA 1KM0A 2Z0IA 2WJZA 4NJKA 4AMAA 2FIQA 3W7MA 2Y7EA 3L0GA 5LNWA 1ML1A 5CZJA 3GKFA 4AB4A 1HTIA 4K7VA 2ZRVA 2EF9A 5KINA 4R53A 3QFEA 3SGZA 4XZ9A 3W7PA 1BTMA 3TKFA 3ANYA 2OJPA 1VCFA 3BGGA 3NQEA 5CZ0A 4QITA 3C4UA 2DZVA 2G96A 3RLUA 1WXJA 3KRUA 5HWJA 3GXTA 3W1RA 3F4WA 2X1RA 3CEPA 3N19B 3C52A 4MLRA 2B7NA 1KM4A 3CWOX 3W2LA 3W1AA 2BX7A 1YADA 4AHPA 3W7RA 2QCNA 3PG8A 3U2OA 1ICSA 3E9AA 3PY2A 1I2NA 1LDCA 3VFLA 3JR2A 2JGYA 3EB2A 4O1DA 4CCDA 1LOQA 2NUYA 3S8HA 1R2TA 2QDHA 3W7HA 3EX6A 4S2CA 2V2CA 3G1AA 3G1FA 2NZLA 1LBFA 3A21A 4FNPA 4JYDA 1VCGA 1B9BA 4UC5A 5I3FA 1S5TA 3W7NA 2GVJA 5F1VA 3W23A 2RDTA 5DXYA 1I45A 3S5OA 1X1OA 3HGSA 3FYOA 3W7IA 3USBA 5IBXC 4NVTA 1X6UA 2DZWA 3BARA 5K7JA 3LRLA 4A22A 2ZCGA 4Q33A 5D02A 1O5KA 1KBIA 4MZ8A 3UYCA 4WZHA 1JJKA 2VEKA 4BF9A 2Y88A 1KTBA 5AHLA 5CZTA 3NQMA 1GVRA 3QSRA 4Z1CA 4OQVA 5D03A 1XCFA 2FPTA 2ZRYA 2JK2A 1VLIA 1XC4A 2YYUA 5E0KA 3S1WA 3QW3A 1KM1A 1Z41A 3R13A 1TTPA 3TE9A 4GFSA 1KV8A 4LS1A 3EWZA 2Y85A 1B4EA 4E38A 4JIPA 5TIMA 2WV8A 5AC7A 1NAL1 3O6DA 3PWAA 4JDYA 3I6RA 1VPXA 4Y8FA 4RV8A 3G1DA 1UB3A 4FXSA 2OMAA 1N7KA 1CX9A 3I7RA 6ALDA 4JX5A 4EVZA 2WSQA 1EWEA 1TIMA 3MYOA 2Q3OA 1O95A 3W1LA 3C61A 1FBAA 2DJXA 5J5RA 2YFNA 1RQHA 4Y6GA 4JTJA 4G1KA 3P81A 1RR2A 2FJKA 3PF3A 3EWUA 2NX9A 2FLIA 3SECA 2FDSA 3EWYA 4K36A 4JTSA 4M6QA 1K8ZA 3N34A 4FIQA 1JULA 1VQTA 2CLOA 2ISWA 4NJGA 3MUXA 2B7PA 1ME9A 4YLWA 1GVQA 3DFQA 3L0KA 2J27A 3G3MA 4JR5A 1SO4A 2Y89A 1VHCA 3V1PA 3DFTA 1D9EA 1PHWA 4O0ZA 1GVSA 4Z1BA 4UTJA 3UXDA 5F2IA 5F2MA 4NXKA 4DQWA 2TRSA 4JX6A 2HSAA 2ZZ4A 3R5EA 2GQAA 3RLVA 1ZAJA 4LC8A 5H2ZA 3E0IA 4JY9A 5BW6A 4DF0A 4JTKA 3IVTA 2DZUA 3YPIA 1L6YA 4FEZA 3HG3A 3F1QA 3R8RA 4ALDA 4IMEA 1PV8A 1DV7A 2J9ZA 2CZEA 1NVMA 4WUIA 2C18A 4UTTA 4FF7A 3LDVA 5BMWA 4UMCA 3FKKA 3W6YA 2ABAA 4MYXA 4PH6A 3ZS4A 4W9TA 4BI7A 3G1SA 1SW7A 4R34A 3PS7A 4BWLA 5AHIA 5I3JA 2NV2A 4N4PA 4LRTA 5CSRA 1YLVA 1EUNA 3PUOA 2P1FA 4ZVJA 2E09A 4OHQA 2A2IA 2OCZA 1Q45A 1U83A 3W7DA 1H60A 3M47A 2NLIA 4UIOA 2QCFA 2VFDA 1J5TA 3WJSA 4IMFA 1KLZA 3AJXA 3L66A 3OEXA 3SGUA 4OV4A 2GJNA 5F2LA 1XL9A 2DZTA 3MHFA 2QCDA 4N9BA 5DLCA 1SO3A 3QF0A 4K7YA 2W79A 1MEIA 3HOJA 3GR7A 3GR8A 2Y63A 2ZZ6A 3THAA 4NJHA 4RZ4A 1JUBA 4MJZA 4AEOA 4NJIA 5I3KA 2BWGA 4ZQMA 2WQPA 1E51A 3DHFA 4I7WA 2QUTA 3W07A 3H53A 3ABQA 1PCWA 3W2NA 3RFAA 1PVNA 2Y6ZA 3L5LA 4RZ6A 5CZSA 1N55A 3CIXA 3UWZA 4I7VA 4AWUA 1VJIA 2CW6A 2V30A 3KVKA 4IXXA 2OT1A 2ZYFA 3E12A 4YMZA 3D0CA 1MZHA 2WSYA 3NM3A 1K03A 3M1ZA 3FIGA 4UTIA 5D04C 3MP4A 2TPSA 2QAPA 3HQ1A 1A5BA 3L67A 3LCLA 3G0SA 3EKLA 4CCCA 1G4PA 3NQGA 1HUVA 1LLZA 3I68A 5CPOA 2RH9A 3I65A 2E77A 1PHQA 3W7CA 5AC6A 3LV6A 4LVGA 1JRCA 3O6YX 4QNEA 4A21A 4CQ8A 1CI1A 3HBLA 4YL2A 2E6DA 4Y90A 3BO9A 1OK6A 1QR7A 2ZRWA 1QOPA 3BG9A 4H3DA 2A1YA 3SR7A 1OFPA 3NZRA 3LLFA 5HULA 2E1DA 1DJNA 1VHNA 5CPNA 1K3UA 5U4NA 3UZ5A 3M0ZA 4RK8A 2CZDA 1GVFA 3O06A 2HTMA 4A2SA 2TMDA 5D2TA 5LGZA 3A23A 5KTLA 3NQCA 3MJYA 3FLUA 4UFKA 4TX9A 5HJLA 2P10A 5F4WA 3L2IA 1VYRA 3HO8A 2KZHA 3EWXA 2C6QA 4UNLA 4RX0A 2WSRA 4Y96A 4FNQA 2G97A 2WKJA 3MHUA 5DY3A 3EXSA 3C2OA 3QYQA 4NX5A 1YDNA 1ICQA 3TMLA 4MZYA 3B4UA 4MKNA 3C8FA 2PURA 4P61A 1AW2A 1C9DA 1Q3NA 5C5YA 1R2SA 5L9FA 3W1QA 1L2UA 2YW3A 1I2QA 4JEQA 1QDSA 2OT0A 2B7QA 4LTSA 1H51A 1S5VA 1B57A 3G0XA 3GX9A 2NXHA 5D2VA 2QCEA 3QPZA 3FEMA 1FY6A 3MI6A 3O15A 4XKYA 1WBHA 3GK0A 4CCEA 3WJZA 3LRMA 3CC1A 4CNOA 1EIXA 1HL2A 5D2XA 1F5ZA 1WBJA 3UWUA 4ZZ9A 3LCHA 3C0JA 1Z42A 4UCGA 4JGDA 3OVQA 2C13A 4MLJA 1EA0A 5LZLA 2P0OA 5HR7A 3LV5A 1LP6A 3W1PA 2BSLA 4FX6M 3O6CA 1FWWA 1KBJA 1X7FA 3HPSA 2LLEA 2R8WA 1OX4B 4ADUA 3QM3A 1W5OA 3VNDA 4U28A 3S1XA 1GYNA 3MHGA 2GVGA 3GDRA 5TQLA 2NXGA 4PFMA 2V5BA 4CNNA 2ZRZA 2C16A 3ABSA 4O54A 5D32A 2FFCA 3KAOA 1TPUA 3W1XA 1JCYA 3B0VC 3Q58A 4UNKA 1ZNNA 4AWSA 2V9DA 5HNRA 1GPWA 5J5DA 1ZY9A 2Q8LA 4HSOA 2C15A 3R2GA 1JCMP 5LNRA 4IQLA 5I3IA 1I8JA 2Y62A 4GJ1A 4JTLA 3K30A 3NYZA 2QDGA 2NV1A 2V2HA 3JRKA 3FYPA 4AAJA 4JTGA 2CLIA 3UWYA 3TJXA 4WX2A 3NQ6A 4O1BA 5SWUA 1VR6A 3CQ0A 3NDOA 3HGJA 1XFBA 2YR1A 4LVAA 1H5YA 5HUPA 3KOFA 1QOQA 3TFCA 3PB2A 3B0PA 2HMCA 1P1XA 1T0OA 2DJLA 2AAMA 3HG2A 2FQIA 3E49A 1W8SA 1TJPA 2PCQA 1TPH1 4PODA 1A5CA 3G1VA 3KVLA 3WK1A 1IXPA 4JTIA 2ZA1A 1TRDA 2H3DA 4NJJA 4LC6A 3O1NA 2PC4A 3BW3A 1UUMA 1T99A 4MUZA 2V82A 5EYWA 4O57A 3QEZA 4O17A 4ZL1A 3ZFHA 1FXPA 3G0UA 3T4CA 4RR4A 3C2VA 3L68A 4IX0A 2EGZA 1OFRA 1Q6LA 1N8FA 1OHLA 1FCQA 1F6PA 4RCXA 1H63A 3ABOA 4LRSA 3L0NA 3TV8A 3MP3A 4LOCA 3TCEA 3ABRA 4IWWA 1KA9F 1IIHA 1J4EA 1PIIA 4UTMA 4GC4A 2ZZ3A 1I4NA 3W70A 4MY9A 1LRQA 4RZ5A 3PBYA 1WOBA 1YTDA 1TTJA 2B0MA 3TSDA 3LOTA 5FF2A 1K7EA 4ZQPA 1ONRA 4AXKA 4RJEA 4ZMGA 4HNNA 1GYLA 3QC3A 4Y9AA 5FF4A 1DL3A 2QR6A 3PBUA 2E5DA 1LRNA 1W31A 1OFEA 2A4AA 4N9DA 1SUXA 3SFKA 5K9XA 1WDWA 3HG4A 1SSGA 2CLMA 3TQ0A 4ZQCA 3M6YA 1LM1A 5CGQA 2FB2A 5FI8A 1RD5A 3P62A 3MBFA 4OE7A 3CTLA 1M6JA 4DO4A 5F2GA 1IIGA 3GIYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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