4EF9A

Crystal structure of dihydroorotate dehydrogenase from leishmania major in complex with 4-nitrophenyl isothiocyanate
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
SMSLQVNLLNNTFANPFMNAAGVMCTTTEELVAMTESASGSLVSKSCTPALREGNPTPRYQALPLGSINSMGLPNNGFDFYLAYAAEQHDYGKKPLFLSMSGLSMRENVEMCKRLAAVATEKGVILELNLSCPNVPGKPQVAYDFDAMRQCLTAVSEVYPHSFGVKMPPYFDFAHFDAAAEILNEFPKVQFITCINSIGNGLVIDAETESVVIKPKQGFGGLGGRYVLPTALANINAFYRRCPGKLIFGCGGVYTGEDAFLHVLAGASMVQVGTALQEEGPSIFERLTSELLGVMAKKRYQTLDEFRGKVRTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Leishmania major
publication title Target sites for the design of anti-trypanosomatid drugs based on the structure of dihydroorotate dehydrogenase.
pubmed rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase
total genus 108
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.3.1: Transferred entry: 1.3.98.1.
pdb deposition date 2012-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 4ef9A02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ef9A01
1RVGA 5G1YA 3NNTA 2J6XA 3LRKA 3ABOA 2B7OA 4JGDA 1B4EA 2O7SA 4LUJA 4HNVA 1LZOA 4KKXA 4MY8A 1Q45A 1SQ7A 2H8ZA 2A4AA 2TSYA 4JIQA 2NXHA 5HWMA 2RDWA 1OFQA 3GXPA 2TPSA 1TRIA 3UD6A 2PRHA 3VE9A 5AOUA 1PVNA 4AEOA 4JNMA 2B7NA 5MHBA 1OJXA 3P82A 3S5ZA 4FX8A 1K02A 1KM6A 3GXNA 3CLMA 2IQTA 2VXNA 2ATMA 1FWSA 3G8RA 3P81A 4FHAA 3W70A 1O95A 8TIMA 3S42A 3O8AA 1PCKA 1NF0A 3PBVA 4LVBA 2X30A 1QO5A 1B57A 4EF9A 3W2LA 1OX4A 2P1FA 1G4TA 3MHFA 2Y7EA 5C2XA 2YPIA 1HG3A 1BWKA 1TV5A 1H7NA 2A6LA 3MUXA 3L5MA 4JIPA 2V81A 4O8RA 4O13A 3AO0A 2A5HA 2FLIA 2QF7A 4RLIA 3CEPA 4IQLA 3UNDA 4DXVA 3EB2A 1GYNA 3C2RA 3NO5A 4X22A 2H3BA 4X9SA 1EA0A 3BW4A 3ZWTA 5DN1A 3CEUA 1S5VA 5D04C 1R2SA 3LCXA 2W0UA 4TIMA 2CFFA 2VC6A 4JTFA 4O18A 3U6WA 2WSYA 2KZHA 5K2ZA 2E77A 1JUKA 3BPWA 3LTYA 4YLWA 1FCUA 1VS1A 5D33A 4ZQPA 3DFQA 3G1DA 2V82A 3NM1A 4O0KA 5I3IA 2RFGA 3K30A 2Z6IA 2H6RA 1W54A 3LLFA 1P4CA 1KM5A 1KM0A 3DHFA 5DXXA 1TPFA 5LSMA 3D0CA 3WJYA 3LCGA 2FIQA 5EYWA 1K7FA 4LVFA 4ORMA 2JBMA 4U28A 4TX9A 3S1UA 3S8HA 3G1VA 1IIHA 1H1ZA 1VHCA 3C2EA 2AGKA 1Q3NA 3O05A 4UTLA 3TR2A 1HTIA 3UY8A 1DHPA 4UCGA 1MEWA 2J24A 2J9XA 3DXIA 3SECA 3QW4B 3FA5A 1UASA 4HNTA 4IMDA 2V2DA 1OK6A 3P8IA 1YDOA 4JX5A 3I65A 2NZLA 3GK0A 3NQ8A 5EL1A 2R94A 3ZFHA 5A5WA 3Q2DA 4Z0JA 2ZRZA 4OQVA 3KXQA 5HUOA 1O4UA 1W5PA 1K3UA 3IEBA 3TW7A 1GG0A 4I7WA 4JTIA 3NXFA 4AHPA 3ABQA 1W37A 1TSIA 3NL6A 2ZRVA 1KM1A 1N55A 2E68A 1XM3A 2Y6ZA 3JR2A 4JTEA 5DBTA 2NX3A 5BOOA 3EKLA 1DVJA 4TO8A 3DFTA 4R34A 2CWNA 2ZFAA 3F4NA 4LWWA 4WXZA 2QCCA 1VCFA 2FJKA 4N9EA 5AHEA 2ZZ5A 1H7PA 2DZWA 3VI2A 1S5TA 4GUIA 4UFLA 1JVNA 4JX4A 2X1RA 1SFLA 3W9ZA 3FYOA 4JY8A 2P10A 1KFBA 2Q3OA 2W79A 4LS0A 4UFIA 3HPZA 3HBLA 1VPXA 1G4PA 2JGYA 3N34A 2ATSA 2OJPA 3LHWA 1DORA 3ZWSA 4CCCA 4RZ4A 3RLVA 4E38A 2A7NA 4FIQA 3W87A 4LVDA 4BI7A 1G4SA 3P5ZA 1CI1A 5G2HA 5K9CA 1H61A 3JRKA 3LCIA 3F4WA 2H3DA 1MEIA 3MYOA 4DPPA 1TJRA 3W1LA 4JTGA 4DELA 2BSLA 4AXKA 2H90A 2WSQA 1W5MA 4P61A 4XKYB 3FKKA 3QYQA 1ICPA 2YZRA 4MLRA 4IXHA 2ZRUA 3HIJA 4DO5A 5FEPA 1XL9A 4M5PA 3LTPA 3C2FA 1TPUA 2EAWA 2WNNA 2R14A 1OFAA 5C54A 1OK4A 1WOAA 5DBUA 3FYPA 5J5DA 2WV8A 2R8WA 1K8XA 1X1ZA 5AFDA 3A22A 2CLEA 2WNZA 3W1PA 3PB0A 4O14A 1JRCA 2QEZA 2YDAA 2CLKA 2QCNA 3TW6A 1H7OA 2HS8A 4H3DA 1F74A 3W2UA 4IMEA 3QMSA 5BMWA 3LLDA 3QRHA 1XCFA 1YTKA 2CZ5A 4O1AA 1QWGA 5EKYA 4NNCA 1GVOA 3NQVA 4U4MA 3C2OA 1U5JA 1C9DA 3G22A 4LRTA 1TB3A 1NAL1 3C3NA 4UTKA 1OHLA 4HPJA 3I7SA 1NF7A 4XWUA 1YTEA 5AYZA 3DKLA 1VLIA 3DFPA 1E51A 3V75A 2OT1A 3N73A 1OYBA 4AVFA 2CZDA 2OZ0A 4WY0B 4EWND 2HSAA 2I14A 1BTMA 4JX6A 1KBIA 3THQA 3W88A 3AJXA 1A53A 3N14A 1L9WA 3LERA 5K4ZA 4O57A 5KMYA 2Y70A 1K7XA 3TCEA 2BTMA 3G0UA 1F2JA 4JTLA 2ZTKA 2A6NA 4CNNA 3S1VA 3VNDA 1EUAA 4N2YA 1SPQA 3EX2A 1EX5A 5K3VA 5TIMA 1ZALA 1TPEA 4J9JA 1ICSA 1AL8A 1ICQA 3W22A 3L21A 3QQ0A 3G24A 3FOKA 3BGJA 4Y9AA 3BW2A 4MJMA 3L5LA 1N8FA 4NJIA 5EPDA 1UUOA 3FLUA 4EIVA 5F2LA 1KLZA 4POCA 2Y85A 3ZR4A 1M7PA 2ZZ1A 2E5BA 2E6YA 2JKPA 3BARA 2ZA1A 2NXGA 1W1ZA 3EKZA 2XFWA 1IIGA 3PC0A 4S2BA 4UTIA 3NQFA 2EKCA 3P80A 3TROA 5KZMA 4IJBA 3LI1A 4DBEA 4XKYA 2GJLA 1DOSA 1PE1A 1QPOA 2C15A 2ZQ0A 2WPBA 4O1BA 4XTDA 1W0MA 2WKJA 4O15A 1FUYA 4RK8A 3BV4A 3H55A 3S1WA 2C1HA 4MPQA 4PC8A 4D2JA 4NZFA 1AW1A 1SZFA 3G3MA 4UMBA 2E6AA 3S6DA 1H7RA 3LCWA 4EVZA 2G95A 1GTEA 3SSJA 2CLHA 3C52A 2B7QA 1JCNA 1Q6RA 3KVJA 5DLCA 4DEFA 3PBWA 4HT3A 2DP3A 5CGQA 1VC4A 3RK8A 2GPTA 5BMXA 5LNWA 5FESA 3C2VA 1TMHA 2J9ZA 3DKJA 5AN7A 2QR6A 5G5IA 1FXQA 4NNBA 5DELA 1QFEA 1A50A 1KTCA 1G6CA 3VKJA 4NX0A 4IPIA 1LLZA 3YPIA 3KRSA 1JJKA 2YFNA 3GDLA 3M47A 4AF0B 3NQ7A 3GXTA 3FFSA 3LCHA 1EEPA 4DPQA 3KVKA 2B0MA 1LTDA 1FCBA 3TMLA 3STCA 5G2WA 3QZEA 4ZL1A 1FWTA 1F05A 3NQ2A 2NWRA 1O5KA 3FEMA 3BVJA 1LORA 1LRTA 5AHNA 1QMLA 4O1CA 3I7RA 5AHFA 3RLUA 3ATZA 4XBSA 3T44A 1BKSA 1F76A 2Q8ZA 2F7FA 1KLYA 4NZJA 2QKFA 2X16A 1ME7A 2EF9A 3UZ5A 1FDYA 1VRDA 4MY1A 4PODA 3W1UA 3E12A 4N4QA 2NWSA 1H5YA 2Y88A 4JTTA 1VYSX 3FIGA 1L6YA 1ALDA 1VZWA 3IIVA 5D09A 1SUXA 1JQXA 1SW3A 4KFNA 3C61A 1M7OA 4MIMA 4HHPA 2QCMA 4MZ8A 3CHVA 3B06A 3W7EA 5F1VA 1KFKA 4Q4KA 4TU1A 2FB3A 5FI8A 2VFGA 1EUNA 4JDYA 1T8XA 2DZXA 4MJZA 2Q8LA 1OFEA 4MZYA 4IUOA 3PUDA 1EIXA 2WO5A 2WSRA 3W71A 1JQVA 3THAA 4O50A 5K9DA 3W7LA 1X6UA 3TNOA 3GNNA 3TUUA 2BLEA 5EBUA 5D30A 3R12A 2FPYA 1V7YA 2X1TA 1VYPX 3SY5A 1X8FA 4FX7A 3TXZA 5F4XA 4UTUA 3W1TA 3NA8A 3MJYA 4GFSA 3TE9A 1VLWA 1EB3A 3M5ZA 4LTSA 3W2JA 1JUEA 5K9XA 5F2MA 1OF6A 1L2UA 1SZEA 2OX1A 5FEXA 4L4LA 4LNYA 3LV5A 1H7XA 3C56A 4AB4A 3M16A 2QJHA 1RD5A 1UCWA 3KRUA 4XZ9A 4ADTA 3W72A 3PAJA 3PUOA 3PG8A 3KX6A 4G1KA 3W84A 3P5YA 4GE8A 4FXRA 4AF0A 1TREA 2VOMA 4TMCA 3DFOA 5E93A 1LLWA 4ZQRA 3G1AA 5G4WA 3NYZA 3EX4A 4C1LA 2DZVA 1THFD 3H54A 1KV8A 1PL9A 4IX2A 3GYEA 1S5WA 2CLMA 2FTPA 4K8HA 4JTUA 4A29A 4N9BA 4Z1BA 3S9YA 4O4VA 4FXSA 4CCDA 3GKAA 4WQ6A 4M19A 1GYLA 3LDVA 3BLFA 2RDUA 3G1SA 3G1HA 1ZHAA 3QJAA 1V5XA 3TMQA 2OMAA 1KFCA 3LRLA 4RR4A 3GDRA 4CNPA 3HGJA 3Q58A 1MEHA 1WBJA 5I3GA 4CQ9A 1IXQA 4ML9A 4XQ6A 1TTJA 3IIZA 2XN0A 1QNVA 3IIOA 1KW1A 3IGUA 1I45A 2E6DA 1OX5A 2RHGA 5C5YA 3CIWA 3ABSA 3E0IA 4FF7A 2Z1BA 3NQGA 2GJNA 3PUEA 2AAMA 5H2ZA 4OE7A 4RZ6A 3LRMA 1ME9A 1JCMP 5D03A 1NEYA 1H50A 1I2NA 3L67A 4E0CA 4N9CA 4OU1A 2B7PA 3F03K 3GVGA 2W6RA 3GDMA 4JTSA 4LU0A 5I3JA 3DBPA 5IM51 4XTIA 4NXKA 1W56A 1O60A 1SSGA 4AWTA 3IRDA 2OT0A 1LCOA 1IXOA 3NGJA 1TO3A 4JY9A 1JR1A 5D2XA 1GEQA 1J2WA 4UMAA 4K7YA 2V5LA 4Z1AA 3QPZA 1D3GA 1B3OA 4JDBA 4JYDA 2GVJA 4GWEA 5F4WA 3LX9A 2Z6JA 3MBFA 1VCVA 4NU7A 4FEZA 3HMJG 1KM4A 3SGZA 5AHLA 1HL2A 1NVMA 4AAJA 3S1XA 1FCVA 5AYXA 3GB6A 3LXAA 3B0PA 2P0OA 4GC4A 2BZNA 1Z41A 3TU9A 2ISVA 4AHOA 3DFSA 3TA6A 4K39A 5CG7A 2BX7A 3CQ0A 3R89A 4O53A 1IXNA 3TFXA 3P60A 3KAOA 3BLEA 3W2NA 1SSDA 4NVTA 2NUYA 3E96A 3DI0A 4JD4A 3RNDA 1OYAA 3NPXA 5EMUA 3MWAA 3G1FA 1I2PA 3BG9A 2DJLA 4LS1A 1TV8A 3O1NA 5KITA 3JS3A 1KA9F 3DENA 3HOJA 1SZNA 2FB2A 3UWVA 3TK7A 4NNAA 4YXGA 2H8XA 3L2IA 4MFDA 1CX9A 3WJSA 5TBOA 4AHQA 2YR1A 3LM7A 1ZENA 1LOSA 2FFCA 1ZJIA 2QJIA 3ABRA 3BG3A 3LHVA 3UXDA 3EWWA 2HS6A 2C13A 1OABA 4ZVJA 1Q6OA 1D3HA 1KM3A 4FNRA 3CTLA 1W3TA 5LNRA 2V30A 5U4NA 2ZBTA 1VYRA 4RJEA 5D2YA 5T26A 1SZGA 1WBHA 2GQ8A 2UV8G 4GRSA 3EXRA 4KFPA 1I2RA 3L0KA 3STGA 3EWUA 4MY9A 6ALDA 4HKPA 3NQMA 3EWYA 3KFTA 3RFAA 3I68A 2JGQA 3NEVA 1FCQA 4LY8A 1AW2A 1Y0EA 3TXVA 3A5VA 1H1YA 3MP4A 3LGEA 4IWWA 5HNRA 3LHYA 3NR0A 4Q33A 4NJJA 5I3HA 4PTNA 2VEMA 5KZEA 1DKWA 2VFHA 4M6VA 3SI9A 2JKAA 3MMTA 4MZ1A 1C29A 2QDHA 3W1NA 1FDZA 3W1XA 4I7VA 1ZAHA 1W5QA 3W7NA 3N19B 4Q32A 3NPUA 4IX0A 5G4EA 2Z0IA 3PSVA 3G0SA 4AH7A 5E1QA 4MLJA 5L6UA 4PA8A 1QCWA 3SJ3A 4R53A 2V2CA 3M0ZA 3HG2A 4PH6A 4XBKA 1GPWA 1XUZA 5CZ0A 4MOZA 1KM2A 2ABAA 1L6SA 5C55A 2NX9A 4I7UA 2DU2A 5LZLA 3QEZA 3OIXA 4A2SA 1SW7A 3NDOA 1KFLA 3W7GA 1YLVA 2QCLA 3MYPA 5DCEA 4UTHA 1X7FA 2C16A 3O63A 1I2OA 2ZA3A 2NXIA 1U83A 4IOTA 4ZQMA 1TPH1 7TIMA 5H91A 2ZRXA 2AQWA 3NZRA 4X2RA 1S3HA 4IMGA 1TCDA 1XUUA 3NQDA 1LYXA 2FQIA 3FS2A 3T40A 3N9RA 1RPXA 3L0GA 5HR6A 3OHIA 3B0UX 5GVJA 2ZZ4A 1H62A 3VFLA 5CPNA 4YMZA 1DL3A 1TIMA 3IVTA 5HWJA 2QJGA 4N9DA 3UWQA 3DU0A 2G97A 5AHIA 4N4PA 5D2TA 1XBYA 3P74A 5D02A 4K8EA 1JCYA 5G2IA 3UPWA 1NFBA 3TSDA 3L65A 2E5DA 4FIRA 3FJLA 2QAFA 3DI1A 2YCEA 2VEIA 2VFEA 3ELFA 2QAPA 3SFKA 1LP6A 4OT7A 6TIMA 5D37A 3M1ZA 1KTNA 1A5BA 3W7JA 3R5EA 3PS7A 1K03A 2NV2A 2Y89A 2A1YA 3LI0A 4O0ZA 2WQPA 1LM1A 3W7DA 4ZZ9A 3GDKA 3OG3A 3TQ0A 1L6WA 2E09A 4E2DA 3IGSA 4Y96A 2A7PA 3SGUA 3PVFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4GZJ A;  4LAN A;  2J6X A;  2B7O A;  1B4E A;  2O7S A;  2OO0 A;  4C90 A;  3BCF A;  2XGZ A;  3B8S A;  1U22 A;  2NXH A;  3AYS A;  2ACS A;  4HNL A;  4HME A;  1A4M A;  4AEO A;  4I9M A;  3WNN A;  2UY4 A;  1OY0 A;  3GXN A;  1W1P A;  3L4V A;  3WD4 A;  3DHP A;  3IWP A;  3W70 A;  1ONX A;  8TIM A;  1UR8 A;  3R0D A;  3ITY A;  1PCK A;  3R4I A;  3KE0 A;  3RX4 A;  1B57 A;  1RY8 A;  4EF9 A;  1K1D A;  3W2L A;  3SDO A;  1V02 E;  1VFU A;  2DV0 A;  4WJ8 A;  4IT1 A;  2Y7E A;  2YPI A;  1BWK A;  1JDC A;  1Z69 A;  2NQH A;  8A3H A;  3CEP A;  1L6F A;  1KGW A;  3NFU A;  1GYN A;  1UWI A;  3QV6 A;  1L2Q A;  1EA0 A;  3BW4 A;  1EOM A;  4LB4 A;  3A6O A;  3S9I A;  1KCK A;  2W0U A;  2QMJ A;  4JTF A;  4O18 A;  3URN A;  4MNK A;  2JE8 A;  3GHU A;  4QSF A;  3WLO A;  2POZ A;  4P8U A;  3TR9 A;  2PLC A;  4ZQP A;  2BNJ A;  3EB4 A;  3G1D A;  4O0K A;  3PAO A;  5I3I A;  3VUP A;  4V33 A;  1CXF A;  3TC3 A;  4PTX A;  4QX4 A;  1V6T A;  3LPO A;  5LSM A;  3A4W A;  5EYW A;  3SM0 A;  1Z89 A;  4G7E A;  1K7F A;  4ORM A;  4HVX A;  2JBM A;  5HAN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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