4EIVA

1.37 angstrom resolution crystal structure of apo-form of a putative deoxyribose-phosphate aldolase from toxoplasma gondii me49
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
274
structure length
256
Chain Sequence
TIYKQFTSRTLLNFFEVAALTDGETNESVAAVCKIAAKDPAIVGVSVRPAFVRFIRQELVKSAPEVAGIKVCAAVNFPEGTGTPDTVSLEAVGALKDGADEIECLIDWRRMNENVADGESRIRLLVSEVKKVVGPKTLKVVLSGGELQGGDIISRAAVAALEGGADFLQTSSGLGATHATMFTVHLISIALREYMVRCIGIKIEVGDVHMAETADFLMQMIFENGPRSIVRDKFRVGGGFNLLKELRDCYESWDSV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and Functional Divergence of the Aldolase Fold in Toxoplasma gondii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Deoxyribose-phosphate aldolase
molecule tags Lyase
source organism Toxoplasma gondii
total genus 102
structure length 256
sequence length 274
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.4: Deoxyribose-phosphate aldolase.
pdb deposition date 2012-04-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4eivA00
2PURA 2EHHA 2B0MA 2W0UA 3FJLA 2X1RA 4XTIA 1JJKA 4WXYA 4P61A 1JUKA 1G6CA 3UWQA 3A5VA 1AK5A 4NJHA 1BWKA 3S5YA 3PG8A 2ZRYA 3W76A 4N4QA 3HG5A 3W7CA 2QCGA 4Z0SA 3O07A 3B05A 3MYOA 2ZZ6A 4JTEA 3E02A 1SW3A 3IGSA 3NQAA 4NJGA 2GQAA 3UPBA 3LCLA 2G95A 1UUOA 3NEVA 1J5TA 3PSWA 3TJXA 1H5YA 1DV7A 5CZTA 3UD6A 2O7SA 1ZJIA 3LM7A 4Y90A 4QSHA 1ZAHA 5AOUA 2ZZ4A 2Q3RA 4E2DA 2YFNA 1JRBA 4O1AA 3NL5A 2JKEA 3W7JA 3W9ZA 3S6DA 3FIGA 1H60A 3OBKA 3NDOA 3T4CA 1KFKA 2A6NA 1XBXA 2A6LA 2GUUA 4IMGA 4O28A 2OX1A 4DXVA 1F76A 3LLFA 4A2RA 5HQEA 3B0VC 2GVJA 3GDMA 4AVFA 3LGEA 3BK0A 2FPTA 3BLFA 3W23A 3ATYA 4OBTA 2VEMA 1DORA 2G96A 3W83A 3TK7A 4MY8A 5I3JA 4GUIA 1QO5A 2X16A 3INPA 3UNDA 2YXGA 2QJHA 4LTSA 3S5ZA 3TSBA 4WJEA 1FWTA 3FKRA 3LBMA 4IQLA 3BG5A 2WKJA 2XN0A 4XTDA 3TC6A 3C6CA 4O0KA 4YCOA 2Y62A 1TPFA 1LCOA 1XXXA 5D32A 1O5KA 2R14A 4RX0A 4UXDA 4J9JA 2VEIA 4IMDA 4MPQA 1FXQA 4ZVJA 1OFDA 2QF7A 4UMAA 4N4PA 1HO1A 3C2FA 3GKAA 4ZZ9A 3IRDA 1LBLA 1KLZA 3MP3A 1PE1A 2WJZA 4Z1CA 2CLMA 3BLEA 1UBSA 1C9DA 2Y70A 3QRHA 2NUWA 4BI7A 4MFDA 2YCEA 4IMCA 5K9XA 3T78A 3PB2A 4O12A 1PHWA 1W5QA 1A5BA 2NXIA 1QPOA 1H7RA 2QCCA 5LNUA 2CW6A 3OG3A 3DI1A 1JCJA 1L6WA 1SO5A 1YPIA 5K3VA 5AHMA 4AMAA 3P5YA 4UTWC 4R33A 3W3OA 3ABQA 1QPNA 4JTLA 2GQ9A 5L6UA 2ISVA 2WO5A 1JCMP 3NQVA 4CNNA 3STEA 1SSGA 1QOQA 1SZNA 5D09A 1K02A 2YYUA 3O8AA 4MLJA 3LRKA 3P84A 4MZ8A 2AAMA 5TBOA 1FDJA 2NWRA 1FWNA 3CWNA 3G3MA 2VEKA 3NNTA 1TV8A 4GFSA 4M6PA 5FF7A 3HGOA 3QPYA 4NQ1A 1QMLA 3NL6A 1TO3A 1EP2A 1OFRA 1R47A 4S2CA 4JD4A 3HG3A 3ATZA 4O1CA 2C14A 1W5NA 3OA3A 4OGZA 3P62A 4OQVA 3W2MA 4LY8A 4XKYB 1XDLA 3F1QA 5C2XA 2QJIA 4E0CA 4QJ1A 5DELA 1W54A 3JS3A 3M6YA 1YXDA 3GK0A 3L0GA 3CPRA 2V5BA 4IMFA 1BEUA 2B7PA 5C6MA 4X2RA 1YTKA 5D2TA 1J2WA 2OT1A 3IIPA 4LC8A 2QCDB 4UR8A 3MHUA 3QMTA 4U4MA 4I7UA 1GTEA 3BO9A 5AHEA 2VELA 3EXRA 5KZDA 1I2RA 5DLCA 1ZFJA 4UMBA 5MHBA 2PRHA 3L5AA 4NNBA 2C18A 4KFPA 4LS0A 3ABSA 1GVFA 3LOTA 1TPUA 5D2VA 2VFGA 3R12A 3AJXA 1TTPA 1ME9A 3EWWA 1FUYA 4R53A 5KINA 5EPDA 4O1BA 1Q6LA 2YPIA 4ZMGA 5HWJA 4GNJA 3N73A 5H91A 1N8FA 4LT9A 3P5ZA 3OVPA 4UFIA 5H2ZA 4N9CA 1OF6A 5HNRA 4XBSA 1JCLA 3B4UA 1C29A 1W5MA 2YGYA 3QSRA 4OHQA 4O0ZA 3CIXA 1ME8A 2DU2A 3G0SA 4JEQA 5CPLA 4OWGA 3LCHA 4NJJA 1VS1A 4O14A 3SZ8A 2NZLA 4DPPA 1I2PA 1TPVA 1KA9F 4TR9A 3VFLA 4M6VA 3LXCA 3QPZA 4JTJA 4DPQA 5HUOA 2CU0A 3ZR4A 3IV3A 3USBA 2CZEA 4LWWA 1TJRA 3NGJA 2RFGA 1GJPA 4IMEA 3T7VA 1P4CA 2WSRA 5E1QA 1Y0EA 5LZLA 1CI1A 1IXPA 3V1PA 3A23A 4AHQA 4TMCA 2VC6A 4Y96A 1GOXA 1KBIA 1OYAA 1WOAA 5CZ0A 4TU1A 3W84A 1JRCA 3IVSA 5TQLA 3GNNA 3EEGA 4UFHA 1H1ZA 3GDRA 1AW2A 2X2GA 3QQ1A 4UNLA 5F2MA 1TCDA 4O10A 3UY7A 3QJAA 3MYPA 2OCZA 2IQTA 3TJLA 4JX5A 4UUIA 3GR8A 3O1NA 1JCNA 4JDYA 4M6QA 4IXHA 5K4XA 3QW3A 4DF2A 4FIQA 2Y61A 3NA8A 2E68A 4FB7A 3QF0A 4PEKA 1IXQA 4N02A 3F4WA 1I2OA 4O50A 3RFAA 2X30A 4ORMA 2C1HA 4AXKA 4JY9A 4GWEA 4NX5A 4WY0B 4FX6M 4IPJA 3W6YA 3C56A 1F6KA 3M1ZA 3S9YA 4WY0F 3HB9A 3PUEA 4QNEA 1ML1A 5EBUA 2GVGA 4JYDA 4IXXA 1KM1A 3KFTA 4FXRA 4BFAA 3I68A 2VXNA 4RJEA 3QM3A 4O18A 1LBMA 1OYCA 2EGZA 3A5FA 2C6QA 5J5DA 4HPXA 1GEQA 1M5WA 4JR5A 3MI6A 1VYRA 4JN6A 2QCMA 3IGUA 1OJXA 1SZEA 3W7DA 3TXVA 3TMLA 1TB3A 1G69A 5G5IA 3TH6A 3QEZA 1OK4A 4MLRA 3UYCA 1XDMA 3PS7A 1D9EA 1BTMA 1NVMA 1EEPA 2QEZA 2PCQA 3LRMA 1Q6OA 3KVKA 1H7XA 2CLHA 3HJZA 4NT0A 3O6CA 4EIVA 1IGSA 4PODA 2J6XA 1P0KA 5KITA 3BGGA 2J27A 3P80A 3DFSA 4RZ4A 3P8JA 1YXYA 3MWAA 3B8DA 2ZA2A 4Q4KA 2YFOA 3U8GA 1I2NA 3IGXA 4HNNA 5G1YA 3W2LA 3M43A 2Y63A 3NO5A 5CPNA 3HIJA 3WK2A 1SQ7A 3BARA 3M5YA 1M7PA 4UR7A 2YR1A 1LOLA 1RV8A 3N2MA 1OX6A 2ZRVA 1TPEA 3O06A 2E5DA 3ZS4A 1QOPA 3PM6A 1Q45A 3LXBA 3DHDA 3KXQA 5DCDA 4N6EA 3G0XA 2PRLA 2VKZG 1ZNNA 4ZQPA 4UTHA 3NR0A 1O60A 5CZSA 2CLFA 2GVLA 3M44A 3STFA 3BGJA 2ZCGA 4RKAA 3W7RA 2C19A 3EX1A 2V2CA 3NVTA 8TIMA 4FNQA 1G4TA 3NQ8A 3T55A 4UTJA 1K7FA 1SFLA 1R2SA 1X8FA 3W1AA 2I9EA 3QYQA 4H3DA 1ZY9A 4CLMA 4P2VA 2H6RA 5KZMA 3WJZA 1OFQA 2Q8LA 2UV8G 1OX4A 2VFFA 3RLVA 5SWUA 2QCLA 4LVGA 5LHFA 1W0MA 3P60A 3P67A 2QUVA 2J9YA 2Z2UA 3C2EA 1S5TA 4UTWA 5CPOA 5I3KA 1KV5A 3LI0A 4JTIA 3R13A 3MBFA 5KMYA 4FX7A 2E6AA 4WOQA 4XUGA 5FI8A 1EPXA 4M7SA 3QC3A 4M19A 4C1KA 3NZRA 1EB3A 3QMRA 5BW6A 1XBVA 3TSMA 4PCFA 5A5WA 2A1YA 4AF0A 3B0UX 1P5BA 4Q32A 3CLMA 3L2IA 3RMJA 3W7LA 2B7OA 1H62A 4ALDA 2A7RA 1TRIA 2H90A 2C15A 5FEWA 3TIMA 2AQWA 4L4LA 5AYZA 3S8HA 1M6JA 2E5BA 5CKSA 5EKYA 1GVOA 3CU2A 3L67A 3PSVA 3NQ2A 5AYYA 3WJYA 3N2XA 1SFJA 1DJNA 1IXNA 3HOJA 4JTTA 1C8VA 2YW4A 1LTDA 3PC0A 1TRDA 1LROA 2GPTA 2J24A 4GJ1A 3A22A 1EX5A 4K37A 5D33A 2ZA3A 2ZFAA 2ABBA 4X9SA 3DU0A 1OX5A 3F4NA 2A5HA 1VC4A 5CSSA 3B04A 3DHFA 3UZJA 5EYWA 3UY8A 3TDFA 2AGKA 5AHFA 4IX2A 5G2IA 5DCBA 3N19B 3W75A 1LRNA 3W7PA 2B7NA 4ZQOA 1XBYA 2X1TA 3WFAA 2JKPA 1JR1A 1KM5A 1VLWA 4Y9AA 5E93A 1U83A 3IIXA 3W88A 1GVRA 1Q3NA 5KSWA 3MJYA 5IBXC 1TQJA 1U5JA 3BV4A 1B57A 4K39A 2A4AA 4FNUA 4YWIA 4MY1A 1TMHA 1GT8A 3DGRA 5D30A 1OYBA 1QFEA 1N7KA 3LX9A 4FNRA 4AB4A 2DZPA 2VFIA 2QDHA 4YXGA 1I45A 2QCFA 4LU0A 3PBVA 4NZJA 1ONRA 5AC7A 4POCA 5HJLA 4MZYA 5CPMA 3KRSA 3W1LA 4NX0A 3TC7A 5LGZA 3L65A 5EMUA 1BWLA 4DEFA 4CCEA 4X22A 4MY9A 2J88A 4A21A 3RNDA 1A5SA 2ZRWA 3N9SA 2B7QA 2FTPA 2TSYA 5IM51 3S5NA 3NQMA 1H50A 1ZAIA 2FPYA 3IIZA 1W31A 2V5LA 3DFOA 3TE9A 1JCXA 3LRLA 3W1MA 5AHNA 4UMCA 4IJBA 3G1HA 4A29A 1F74A 3W2NA 3CM4A 2C3ZA 3TNOA 2QR6A 1MXSA 1YDOA 5G2HA 3H53A 5CGQA 3GNDA 1H7NA 3LV6A 1AW1A 3ABOA 3I6RA 3HG2A 1X1ZA 3TKFA 3C2RA 4N9EA 2A21A 1XUUA 3IVTA 4LS2A 5LNRA 3C3NA 4OU1A 3TSDA 4S1FA 2V30A 3W7NA 3S5OA 1AL8A 1OG0A 2FQIA 3NQGA 5F2LA 3W22A 3LCFA 1DQXA 2YX0A 2QCNA 3MW7A 5AC8A 3MP5A 1OF8A 1W8SA 5K9CA 4AWUA 3W85A 2DJLA 1FWSA 4TX9A 3FOKA 2VEPA 1TV5A 4O17A 1VZWA 1F5ZA 3O6DA 5D02A 5DN1A 2XFWA 4PL1A 3VI2A 2WQPA 4I9AA 1LLWA 3PBYA 4O15A 3W1XA 1QR7A 1KM4A 4JIQA 3IIVA 3SY5A 2VFHA 1W3IA 3M5ZA 4WZHA 2Q3OA 3ABRA 4RZ6A 1WYIA 1ME7A 1R30A 4YCPA 2DZSA 4NUWA 4MVAA 3FS2A 1H7PA 3L21A 3R89A 3PUOA 5LGXA 3N34A 3BPWA 6ALDA 3G24A 5DBTA 2ZZ1A 4K7YA 3TMQA 4AAJA 1PL9A 2R8WA 2BLEA 4IUOA 2A7PA 1FDYA 3FA5A 1OFPA 3TAOA 4O1DA 1X1OA 1RR2A 4DQWA 1G7VA 3FKKA 1KFBA 3G8RA 3M0ZA 2Z6IA 3TX9A 3TW6A 3KOFA 3NQCA 4UTUA 3KVLA 2DP3A 3GZ3A 5HWMA 1KTCA 5CG7A 1GQNA 5BOOA 3NXFA 1WBHA 4G1KA 4RZ5A 4GC4A 3H54A 3EWBX 2A0NA 2VFDA 2BWGA 4LV9A 2A85A 3C52A 3A9IA 1HL2A 2DZVA 1H61A 3EKLA 1HG3A 4LVBA 1FDZA 4UTTC 2C0AA 1IIHA 3B0PA 3N3MA 4KWWA 3LXAA 4XWUA 2JK2A 3TR2A 3SECA 2DZWA 2DZXA 3UWUA 4PA8A 1FCBA 4PTNA 4ZQMA 4LVAA 5I3FA 1VYSX 1XM3A 3CEUA 3TU9A 2YW3A 2NUYA 2GJNA 4R34A 5L9FA 3HPSA 5HUPA 4JX6A 2J9ZA 3GXPA 4MUZA 3DZ1A 4JTKA 3N14A 1YXCA 3OHIA 4RV8A 3O15A 2FFCA 2G97A 4FNPA 2V81A 1ICPA 2OJPA 2WNNA 3ZFHA 3UPWA 2ZTKA 3UXAA 3WK0A 2PRMA 3THAA 3P61A 2YSWA 3JRKA 1D3GA 2VOMA 2O7QA 4HKPA 2WSQA 4Z0JA 1L6YA 2QJGA 1Z42A 3EX4A 4LUJA 2ALDA 2PE4A 3O6YX 3BLIA 3DKLA 1DQWA 5I3HA 3ZWSA 1TQXA 1ZALA 3P8IA 4WXZA 2CZDA 2HTMA 3B06A 2NX9A 3TQVA 4AEOA 4FF7A 1S5VA 2FB3A 3PG9A 1ALDA 4Z1AA 2PC4A 2E6YA 5FF2A 1IIGA 3UWZA 4B5NA 4ICNA 5LNSA 4DBEA 1RQBA 3C0JA 3VKJA 5TIMA 1TPDA 2FPVA 1TPWA 4XZ9A 4A3UA 3MHFA 4MFEA 2JGYA 4KFNA 3DFNA 1B3OA 3T40A 1QAPA 3PB0A 4MZ1A 1DVJA 4QISA 2QUUA 2X1UA 3LTYA 3NQFA 3NQ7A 3QQ0A 4FEZA 5AHIA 4CNPA 1CX9A 2NV2A 4PL2A 3G1FA 1SR9A 1YTDA 4ZQNA 3TA6A 1JUEA 2G5WA 3FYPA 4GBUA 4Z08A 2TMDA 4GXMA 1VCVA 3KRZA 3P74A 1HTIA 1OHLA 1THFD 3CTLA 4JXCA 3L66A 1JULA 1YDNA 3HO8A 1JUBA 3E49A 3SI9A 3OIXA 1SO4A 3WK1A 2RH9A 2F84A 2CLEA 1ICSA 2CLKA 5G1TA 1OFOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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